Filename: d.16.b.M.tuberculosis.2.bpseq Organism: Mycobacterium tuberculosis Accession Number: X52917 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 N 0 3 N 0 4 N 0 5 N 0 6 N 0 7 N 0 8 N 0 9 N 25 10 N 24 11 N 23 12 N 22 13 N 21 14 N 0 15 N 0 16 N 0 17 N 908 18 N 907 19 N 906 20 N 0 21 N 13 22 N 12 23 N 11 24 N 10 25 N 9 26 N 0 27 N 544 28 N 543 29 N 542 30 N 541 31 N 0 32 N 540 33 N 539 34 N 538 35 N 537 36 N 536 37 N 535 38 G 0 39 G 399 40 C 398 41 G 397 42 G 396 43 C 395 44 G 394 45 U 392 46 G 391 47 C 357 48 U 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 C 355 53 A 354 54 C 353 55 A 0 56 U 352 57 G 351 58 C 350 59 A 0 60 A 0 61 G 98 62 U 97 63 C 96 64 G 0 65 A 0 66 A 95 67 C 94 68 G 93 69 G 91 70 A 90 71 A 0 72 A 0 73 G 0 74 G 0 75 U 86 76 C 85 77 U 84 78 C 83 79 U 0 80 U 0 81 C 0 82 G 0 83 G 78 84 A 77 85 G 76 86 A 75 87 U 0 88 A 0 89 C 0 90 U 70 91 C 69 92 G 0 93 A 68 94 G 67 95 U 66 96 G 63 97 G 62 98 C 61 99 G 0 100 A 0 101 A 0 102 C 0 103 G 0 104 G 0 105 G 310 106 U 309 107 G 308 108 A 0 109 G 0 110 U 0 111 A 0 112 A 0 113 C 0 114 A 235 115 C 234 116 G 233 117 U 232 118 G 231 119 G 230 120 G 229 121 U 228 122 G 0 123 A 0 124 U 227 125 C 226 126 U 0 127 G 0 128 C 0 129 C 223 130 C 222 131 U 221 132 G 220 133 C 219 134 A 218 135 C 217 136 U 0 137 U 171 138 C 170 139 G 169 140 G 168 141 G 0 142 A 0 143 U 0 144 A 0 145 A 162 146 G 161 147 C 160 148 C 159 149 U 158 150 G 157 151 G 156 152 G 0 153 A 0 154 A 0 155 A 0 156 C 151 157 U 150 158 G 149 159 G 148 160 G 147 161 U 146 162 C 145 163 U 0 164 A 0 165 A 0 166 U 0 167 A 0 168 C 140 169 C 139 170 G 138 171 G 137 172 A 0 173 U 0 174 A 0 175 G 0 176 G 0 177 A 200 178 C 199 179 C 198 180 A 197 181 C 196 182 G 195 183 G 194 184 G 193 185 A 192 186 U 191 187 G 0 188 C 0 189 A 0 190 U 0 191 G 186 192 U 185 193 C 184 194 U 183 195 U 182 196 G 181 197 U 180 198 G 179 199 G 178 200 U 177 201 G 0 202 G 0 203 A 0 204 A 0 205 A 0 206 G 215 207 C 214 208 G 0 209 C 0 210 U 0 211 U 0 212 U 0 213 A 0 214 G 207 215 C 206 216 G 0 217 G 135 218 U 134 219 G 133 220 U 132 221 G 131 222 G 130 223 G 129 224 A 0 225 U 0 226 G 125 227 A 124 228 G 121 229 C 120 230 C 119 231 C 118 232 G 117 233 C 116 234 G 115 235 G 114 236 C 282 237 C 281 238 U 280 239 A 0 240 U 0 241 C 279 242 A 0 243 G 273 244 C 272 245 U 271 246 U 0 247 G 0 248 U 270 249 U 269 250 G 268 251 G 267 252 U 266 253 G 265 254 G 264 255 G 263 256 G 0 257 U 0 258 G 0 259 A 0 260 C 0 261 G 0 262 G 0 263 C 255 264 C 254 265 U 253 266 A 252 267 C 251 268 C 250 269 A 249 270 A 248 271 G 245 272 G 244 273 C 243 274 G 0 275 A 0 276 C 0 277 G 0 278 A 0 279 C 241 280 G 238 281 G 237 282 G 236 283 U 0 284 A 0 285 G 307 286 C 306 287 C 305 288 G 304 289 G 300 290 C 299 291 C 298 292 U 297 293 G 0 294 A 0 295 G 0 296 A 0 297 G 292 298 G 291 299 G 290 300 U 289 301 G 0 302 U 0 303 C 0 304 C 288 305 G 287 306 G 286 307 C 285 308 C 107 309 A 106 310 C 105 311 A 0 312 C 333 313 U 332 314 G 331 315 G 330 316 G 329 317 A 328 318 C 0 319 U 0 320 G 0 321 A 0 322 G 0 323 A 0 324 U 0 325 A 0 326 C 0 327 G 0 328 G 317 329 C 316 330 C 315 331 C 314 332 A 313 333 G 312 334 A 0 335 C 346 336 U 345 337 C 344 338 C 343 339 U 0 340 A 0 341 C 0 342 G 0 343 G 338 344 G 337 345 A 336 346 G 335 347 G 0 348 C 0 349 A 0 350 G 58 351 C 57 352 A 56 353 G 54 354 U 53 355 G 52 356 G 0 357 G 47 358 G 0 359 A 0 360 A 0 361 U 0 362 A 0 363 U 389 364 U 0 365 G 388 366 C 387 367 A 386 368 C 0 369 A 0 370 A 0 371 U 384 372 G 383 373 G 382 374 G 381 375 C 380 376 G 0 377 C 0 378 A 0 379 A 0 380 G 375 381 C 374 382 C 373 383 U 372 384 G 371 385 A 0 386 U 367 387 G 366 388 C 365 389 A 363 390 G 0 391 C 46 392 G 45 393 A 0 394 C 44 395 G 43 396 C 42 397 C 41 398 G 40 399 C 39 400 G 0 401 U 0 402 G 432 403 G 431 404 G 430 405 G 429 406 G 0 407 A 0 408 U 0 409 G 0 410 A 0 411 C 0 412 G 423 413 G 422 414 C 421 415 C 420 416 U 0 417 U 0 418 C 0 419 G 0 420 G 415 421 G 414 422 U 413 423 U 412 424 G 0 425 U 0 426 A 0 427 A 0 428 A 0 429 C 405 430 C 404 431 U 403 432 C 402 433 U 0 434 U 484 435 U 0 436 C 485 437 A 481 438 C 480 439 C 479 440 A 478 441 U 477 442 C 476 443 G 0 444 A 0 445 C 0 446 G 471 447 A 0 448 A 0 449 G 0 450 G 0 451 U 0 452 C 465 453 C 464 454 G 463 455 G 462 456 G 461 457 U 0 458 U 0 459 C 0 460 U 0 461 C 456 462 U 455 463 C 454 464 G 453 465 G 452 466 A 0 467 U 0 468 U 0 469 G 0 470 A 0 471 C 446 472 G 0 473 G 0 474 U 0 475 A 0 476 G 442 477 G 441 478 U 440 479 G 439 480 G 438 481 A 437 482 G 0 483 A 0 484 A 434 485 G 436 486 A 0 487 A 0 488 G 533 489 C 532 490 A 531 491 C 530 492 C 529 493 G 514 494 G 513 495 C 512 496 C 0 497 A 0 498 A 0 499 C 528 500 U 527 501 A 526 502 C 525 503 G 524 504 U 0 505 G 0 506 C 0 507 C 0 508 A 0 509 G 516 510 C 515 511 A 0 512 G 495 513 C 494 514 C 493 515 G 510 516 C 509 517 G 0 518 G 0 519 U 0 520 A 0 521 A 0 522 U 0 523 A 0 524 C 503 525 G 502 526 U 501 527 A 500 528 G 499 529 G 492 530 G 491 531 U 490 532 G 489 533 C 488 534 G 0 535 A 37 536 G 36 537 C 35 538 G 34 539 U 33 540 U 32 541 G 30 542 U 29 543 C 28 544 C 27 545 G 0 546 G 0 547 A 0 548 A 0 549 U 0 550 U 0 551 A 0 552 C 0 553 U 0 554 G 0 555 G 873 556 G 872 557 C 871 558 G 856 559 U 855 560 A 0 561 A 0 562 A 0 563 G 870 564 A 0 565 G 752 566 C 751 567 U 750 568 C 749 569 G 0 570 U 746 571 A 0 572 G 745 573 G 744 574 U 743 575 G 0 576 G 639 577 U 638 578 U 637 579 U 636 580 G 635 581 U 634 582 C 633 583 G 0 584 C 632 585 G 631 586 U 628 587 U 627 588 G 626 589 U 625 590 U 624 591 C 623 592 G 622 593 U 621 594 G 620 595 A 0 596 A 0 597 A 0 598 U 0 599 C 617 600 U 616 601 C 615 602 A 614 603 C 613 604 G 612 605 G 611 606 C 0 607 U 0 608 U 0 609 A 0 610 A 0 611 C 605 612 U 604 613 G 603 614 U 602 615 G 601 616 A 600 617 G 599 618 C 0 619 G 0 620 U 594 621 G 593 622 C 592 623 G 591 624 G 590 625 G 589 626 C 588 627 G 587 628 A 586 629 U 0 630 A 0 631 C 585 632 G 584 633 G 582 634 G 581 635 C 580 636 A 579 637 G 578 638 A 577 639 C 576 640 U 0 641 A 0 642 G 0 643 A 739 644 G 738 645 U 737 646 A 735 647 C 734 648 U 733 649 G 732 650 C 731 651 A 730 652 G 0 653 G 0 654 G 728 655 G 727 656 A 726 657 G 725 658 A 724 659 C 723 660 U 722 661 G 705 662 G 704 663 A 0 664 A 0 665 U 701 666 U 700 667 C 699 668 C 698 669 U 697 670 G 696 671 G 695 672 U 694 673 G 0 674 U 0 675 A 0 676 G 687 677 C 686 678 G 685 679 G 0 680 U 0 681 G 0 682 G 0 683 A 0 684 A 0 685 U 678 686 G 677 687 C 676 688 G 0 689 C 0 690 A 0 691 G 0 692 A 0 693 U 0 694 A 672 695 U 671 696 C 670 697 A 669 698 G 668 699 G 667 700 A 666 701 G 665 702 G 0 703 A 0 704 A 662 705 C 661 706 A 0 707 C 0 708 C 0 709 G 0 710 G 721 711 U 0 712 G 0 713 G 720 714 C 719 715 G 0 716 A 0 717 A 0 718 G 0 719 G 714 720 C 713 721 G 710 722 G 660 723 G 659 724 U 658 725 C 657 726 U 656 727 C 655 728 U 654 729 G 0 730 G 651 731 G 650 732 C 649 733 A 648 734 G 647 735 U 646 736 A 0 737 A 645 738 C 644 739 U 643 740 G 0 741 A 0 742 C 0 743 G 574 744 C 573 745 U 572 746 G 570 747 A 0 748 G 0 749 G 568 750 A 567 751 G 566 752 C 565 753 G 0 754 A 0 755 A 0 756 A 0 757 G 798 758 C 797 759 G 796 760 U 795 761 G 794 762 G 793 763 G 0 764 G 0 765 A 0 766 G 792 767 C 791 768 G 0 769 A 0 770 A 0 771 C 787 772 A 786 773 G 785 774 G 784 775 A 0 776 U 0 777 U 0 778 A 0 779 G 0 780 A 0 781 U 0 782 A 0 783 C 0 784 C 774 785 C 773 786 U 772 787 G 771 788 G 0 789 U 0 790 A 0 791 G 767 792 U 766 793 C 762 794 C 761 795 A 760 796 C 759 797 G 758 798 C 757 799 C 0 800 G 0 801 U 0 802 A 0 803 A 0 804 A 0 805 C 0 806 G 0 807 G 0 808 U 0 809 G 869 810 G 868 811 G 867 812 U 866 813 A 865 814 C 864 815 U 0 816 A 0 817 G 847 818 G 846 819 U 845 820 G 844 821 U 843 822 G 842 823 G 841 824 G 840 825 U 839 826 U 838 827 U 837 828 C 836 829 C 0 830 U 0 831 U 0 832 C 0 833 C 0 834 U 0 835 U 0 836 G 828 837 G 827 838 G 826 839 A 825 840 U 824 841 C 823 842 C 822 843 G 821 844 U 820 845 G 819 846 C 818 847 C 817 848 G 0 849 U 0 850 A 0 851 G 858 852 C 857 853 U 0 854 A 0 855 A 559 856 C 558 857 G 852 858 C 851 859 A 0 860 U 0 861 U 0 862 A 0 863 A 0 864 G 814 865 U 813 866 A 812 867 C 811 868 C 810 869 C 809 870 C 563 871 G 557 872 C 556 873 C 555 874 U 0 875 G 902 876 G 901 877 G 900 878 G 0 879 A 0 880 G 0 881 U 0 882 A 0 883 C 0 884 G 895 885 G 894 886 C 893 887 C 892 888 G 0 889 C 0 890 A 0 891 A 0 892 G 887 893 G 886 894 C 885 895 U 884 896 A 0 897 A 0 898 A 0 899 A 0 900 C 877 901 U 876 902 C 875 903 A 0 904 A 0 905 A 0 906 G 19 907 G 18 908 A 17 909 A 0 910 U 0 911 U 1386 912 G 1385 913 A 1383 914 C 1382 915 G 1381 916 G 0 917 G 1380 918 G 1379 919 G 1378 920 C 1377 921 C 1376 922 C 1375 923 G 1374 924 C 0 925 A 1370 926 C 1369 927 A 0 928 A 0 929 G 1333 930 C 1332 931 G 1331 932 G 1330 933 C 1329 934 G 1226 935 G 1225 936 A 1224 937 G 1223 938 C 1222 939 A 1221 940 U 1220 941 G 1219 942 U 1218 943 G 1217 944 G 1215 945 A 1214 946 U 0 947 U 0 948 A 0 949 A 0 950 U 965 951 U 964 952 C 963 953 G 962 954 A 0 955 U 0 956 G 0 957 C 0 958 A 0 959 A 0 960 C 0 961 G 0 962 C 953 963 G 952 964 A 951 965 A 950 966 G 0 967 A 0 968 A 0 969 C 0 970 C 0 971 U 0 972 U 0 973 A 0 974 C 1210 975 C 1209 976 U 1208 977 G 1207 978 G 1206 979 G 1205 980 U 1204 981 U 0 982 U 0 983 G 0 984 A 0 985 C 0 986 A 1033 987 U 1032 988 G 1031 989 C 1030 990 A 1029 991 C 1028 992 A 1027 993 G 1026 994 G 1025 995 A 0 996 C 0 997 G 1014 998 C 1013 999 G 1012 1000 U 1011 1001 C 1010 1002 U 1009 1003 A 1008 1004 G 0 1005 A 0 1006 G 0 1007 A 0 1008 U 1003 1009 A 1002 1010 G 1001 1011 G 1000 1012 C 999 1013 G 998 1014 U 997 1015 U 0 1016 C 1024 1017 C 1023 1018 C 0 1019 U 0 1020 U 0 1021 G 0 1022 U 0 1023 G 1017 1024 G 1016 1025 C 994 1026 C 993 1027 U 992 1028 G 991 1029 U 990 1030 G 989 1031 U 988 1032 G 987 1033 C 986 1034 A 0 1035 G 1199 1036 G 1198 1037 U 0 1038 G 1197 1039 G 1196 1040 U 1195 1041 G 1194 1042 C 0 1043 A 0 1044 U 1193 1045 G 1192 1046 G 1188 1047 C 1187 1048 U 1186 1049 G 1184 1050 U 1183 1051 C 1182 1052 G 1181 1053 U 0 1054 C 0 1055 A 0 1056 G 1095 1057 C 1094 1058 U 1093 1059 C 1092 1060 G 1091 1061 U 1090 1062 G 1071 1063 U 1070 1064 C 1069 1065 G 0 1066 U 0 1067 G 0 1068 A 0 1069 G 1064 1070 A 1063 1071 U 1062 1072 G 0 1073 U 0 1074 U 1087 1075 G 1086 1076 G 1085 1077 G 1084 1078 U 0 1079 U 0 1080 A 0 1081 A 0 1082 G 0 1083 U 0 1084 C 1077 1085 C 1076 1086 C 1075 1087 G 1074 1088 C 0 1089 A 0 1090 A 1061 1091 C 1060 1092 G 1059 1093 A 1058 1094 G 1057 1095 C 1056 1096 G 0 1097 C 0 1098 A 0 1099 A 0 1100 C 0 1101 C 1176 1102 C 1175 1103 U 1174 1104 U 1173 1105 G 0 1106 U 1144 1107 C 1143 1108 U 1142 1109 C 1141 1110 A 1140 1111 U 0 1112 G 1138 1113 U 0 1114 U 0 1115 G 0 1116 C 1133 1117 C 1132 1118 A 0 1119 G 0 1120 C 1131 1121 A 1130 1122 C 1129 1123 G 0 1124 U 0 1125 A 0 1126 A 0 1127 U 0 1128 G 0 1129 G 1122 1130 U 1121 1131 G 1120 1132 G 1117 1133 G 1116 1134 G 0 1135 A 0 1136 C 0 1137 U 0 1138 C 1112 1139 G 0 1140 U 1110 1141 G 1109 1142 A 1108 1143 G 1107 1144 A 1106 1145 G 0 1146 A 0 1147 C 1167 1148 U 1166 1149 G 1165 1150 C 1164 1151 C 1163 1152 G 1162 1153 G 1161 1154 G 1160 1155 G 0 1156 U 0 1157 C 0 1158 A 0 1159 A 0 1160 C 1154 1161 U 1153 1162 C 1152 1163 G 1151 1164 G 1150 1165 A 1149 1166 G 1148 1167 G 1147 1168 A 0 1169 A 0 1170 G 0 1171 G 0 1172 U 0 1173 G 1104 1174 G 1103 1175 G 1102 1176 G 1101 1177 A 0 1178 U 0 1179 G 0 1180 A 0 1181 C 1052 1182 G 1051 1183 U 1050 1184 C 1049 1185 A 0 1186 A 1048 1187 G 1047 1188 U 1046 1189 C 0 1190 A 0 1191 U 0 1192 C 1045 1193 A 1044 1194 U 1041 1195 G 1040 1196 C 1039 1197 C 1038 1198 C 1036 1199 C 1035 1200 U 0 1201 U 0 1202 A 0 1203 U 0 1204 G 980 1205 U 979 1206 C 978 1207 C 977 1208 A 976 1209 G 975 1210 G 974 1211 G 0 1212 C 0 1213 U 0 1214 U 945 1215 C 944 1216 A 0 1217 C 943 1218 A 942 1219 C 941 1220 A 940 1221 U 939 1222 G 938 1223 C 937 1224 U 936 1225 A 935 1226 C 934 1227 A 0 1228 A 0 1229 U 0 1230 G 1285 1231 G 1284 1232 C 1283 1233 C 1282 1234 G 1281 1235 G 1280 1236 U 1279 1237 A 0 1238 C 0 1239 A 0 1240 A 0 1241 A 0 1242 G 1273 1243 G 1272 1244 G 1271 1245 C 0 1246 U 0 1247 G 1266 1248 C 1265 1249 G 0 1250 A 0 1251 U 0 1252 G 1261 1253 C 1260 1254 C 1259 1255 G 0 1256 C 0 1257 G 0 1258 A 0 1259 G 1254 1260 G 1253 1261 U 1252 1262 U 0 1263 A 0 1264 A 0 1265 G 1248 1266 C 1247 1267 G 0 1268 A 0 1269 A 0 1270 U 0 1271 C 1244 1272 C 1243 1273 U 1242 1274 U 0 1275 A 0 1276 A 0 1277 A 0 1278 A 0 1279 G 1236 1280 C 1235 1281 C 1234 1282 G 1233 1283 G 1232 1284 U 1231 1285 C 1230 1286 U 0 1287 C 0 1288 A 0 1289 G 0 1290 U 0 1291 U 0 1292 C 1323 1293 G 0 1294 G 0 1295 A 0 1296 U 1319 1297 C 1318 1298 G 1317 1299 G 1316 1300 G 1315 1301 G 1314 1302 U 1313 1303 C 1312 1304 U 0 1305 G 0 1306 C 0 1307 A 0 1308 A 0 1309 C 0 1310 U 0 1311 C 0 1312 G 1303 1313 A 1302 1314 C 1301 1315 C 1300 1316 C 1299 1317 C 1298 1318 G 1297 1319 U 1296 1320 G 0 1321 A 0 1322 A 0 1323 G 1292 1324 U 0 1325 C 0 1326 G 0 1327 G 0 1328 A 0 1329 G 933 1330 U 932 1331 C 931 1332 G 930 1333 C 929 1334 U 0 1335 A 0 1336 G 0 1337 U 0 1338 A 0 1339 A 1362 1340 U 1361 1341 C 1360 1342 G 1359 1343 C 1358 1344 A 1357 1345 G 1356 1346 A 1355 1347 U 0 1348 C 0 1349 A 0 1350 G 0 1351 C 0 1352 A 0 1353 A 0 1354 C 0 1355 G 1346 1356 C 1345 1357 U 1344 1358 G 1343 1359 C 1342 1360 G 1341 1361 G 1340 1362 U 1339 1363 G 0 1364 A 0 1365 A 0 1366 U 0 1367 A 0 1368 C 0 1369 G 926 1370 U 925 1371 U 0 1372 C 0 1373 C 0 1374 C 923 1375 G 922 1376 G 921 1377 G 920 1378 C 919 1379 C 918 1380 U 917 1381 U 915 1382 G 914 1383 U 913 1384 A 0 1385 C 912 1386 A 911 1387 C 0 1388 A 0 1389 C 1494 1390 C 0 1391 G 1491 1392 C 1490 1393 C 0 1394 C 1487 1395 G 1486 1396 U 0 1397 C 0 1398 A 0 1399 C 1481 1400 G 1480 1401 U 1479 1402 C 1478 1403 A 1477 1404 U 1476 1405 G 1475 1406 A 1474 1407 A 0 1408 A 0 1409 G 1471 1410 U 1470 1411 C 1469 1412 G 1468 1413 G 1467 1414 U 1466 1415 A 1465 1416 A 1464 1417 C 1463 1418 A 1462 1419 C 1461 1420 C 1460 1421 C 0 1422 G 0 1423 A 0 1424 A 0 1425 G 1456 1426 C 1455 1427 C 1454 1428 A 1453 1429 G 1452 1430 U 1451 1431 G 0 1432 G 1450 1433 C 1449 1434 C 1448 1435 U 1447 1436 A 0 1437 A 0 1438 C 1445 1439 C 1444 1440 C 0 1441 U 0 1442 C 0 1443 G 0 1444 G 1439 1445 G 1438 1446 A 0 1447 G 1435 1448 G 1434 1449 G 1433 1450 A 1432 1451 G 1430 1452 C 1429 1453 U 1428 1454 G 1427 1455 U 1426 1456 C 1425 1457 G 0 1458 A 0 1459 A 0 1460 G 1420 1461 G 1419 1462 U 1418 1463 G 1417 1464 G 1416 1465 G 1415 1466 A 1414 1467 U 1413 1468 C 1412 1469 G 1411 1470 G 1410 1471 C 1409 1472 G 0 1473 A 0 1474 U 1406 1475 U 1405 1476 G 1404 1477 G 1403 1478 G 1402 1479 A 1401 1480 C 1400 1481 G 1399 1482 A 0 1483 A 0 1484 G 0 1485 U 0 1486 C 1395 1487 G 1394 1488 U 0 1489 A 0 1490 A 1392 1491 C 1391 1492 A 0 1493 A 0 1494 G 1389 1495 G 0 1496 U 1519 1497 A 1518 1498 G 1517 1499 C 1516 1500 C 1515 1501 G 1514 1502 N 1513 1503 N 1512 1504 N 1511 1505 N 1510 1506 N 0 1507 N 0 1508 N 0 1509 N 0 1510 N 1505 1511 N 1504 1512 N 1503 1513 N 1502 1514 N 1501 1515 N 1500 1516 N 1499 1517 N 1498 1518 N 1497 1519 N 1496 1520 N 0 1521 N 0 1522 N 0 1523 N 0 1524 N 0 1525 N 0 1526 N 0 1527 N 0 1528 N 0 1529 N 0 1530 N 0 1531 N 0 1532 N 0 1533 N 0 1534 N 0