Filename: d.16.b.N.meningitidis.MD58.GEN.bpseq Organism: Neisseria meningitidis Accession Number: AE002364 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 U 0 2 G 0 3 A 0 4 A 0 5 C 0 6 A 0 7 U 0 8 A 0 9 A 0 10 G 26 11 A 25 12 G 24 13 U 23 14 U 22 15 U 0 16 G 0 17 A 0 18 U 919 19 C 918 20 C 917 21 U 0 22 G 14 23 G 13 24 C 12 25 U 11 26 C 10 27 A 0 28 G 557 29 A 556 30 U 555 31 U 554 32 G 0 33 A 553 34 A 552 35 C 551 36 G 550 37 C 549 38 U 548 39 G 0 40 G 404 41 C 403 42 G 402 43 G 401 44 C 400 45 A 399 46 U 397 47 G 396 48 C 362 49 U 0 50 U 0 51 U 0 52 A 0 53 C 360 54 A 359 55 C 358 56 A 0 57 U 357 58 G 356 59 C 355 60 A 0 61 A 0 62 G 107 63 U 106 64 C 105 65 G 0 66 G 0 67 A 104 68 C 103 69 G 102 70 G 100 71 C 99 72 A 0 73 G 0 74 C 98 75 A 97 76 C 96 77 A 94 78 G 93 79 A 92 80 G 91 81 A 90 82 A 89 83 G 88 84 C 0 85 U 0 86 U 0 87 G 0 88 C 83 89 U 82 90 U 81 91 C 80 92 U 79 93 C 78 94 G 77 95 G 0 96 G 76 97 U 75 98 G 74 99 G 71 100 C 70 101 G 0 102 A 69 103 G 68 104 U 67 105 G 64 106 G 63 107 C 62 108 G 0 109 A 0 110 A 0 111 C 0 112 G 0 113 G 0 114 G 315 115 U 314 116 G 313 117 A 0 118 G 0 119 U 0 120 A 0 121 A 0 122 C 0 123 A 240 124 U 239 125 A 238 126 U 237 127 C 236 128 G 235 129 G 234 130 A 233 131 A 0 132 C 232 133 G 231 134 U 0 135 A 0 136 C 0 137 C 228 138 G 227 139 A 226 140 G 225 141 U 224 142 A 223 143 G 222 144 U 0 145 G 179 146 G 178 147 G 177 148 G 176 149 G 0 150 A 0 151 U 0 152 A 0 153 A 170 154 C 169 155 U 168 156 G 167 157 A 166 158 U 165 159 C 164 160 G 0 161 A 0 162 A 0 163 A 0 164 G 159 165 A 158 166 U 157 167 C 156 168 A 155 169 G 154 170 C 153 171 U 0 172 A 0 173 A 0 174 U 0 175 A 0 176 C 148 177 C 147 178 G 146 179 C 145 180 A 0 181 U 0 182 A 0 183 C 0 184 G 0 185 U 194 186 C 193 187 U 192 188 U 0 189 G 0 190 A 0 191 G 0 192 A 187 193 G 186 194 A 185 195 G 0 196 A 0 197 A 0 198 A 0 199 G 220 200 C 219 201 A 218 202 G 217 203 G 216 204 G 215 205 G 0 206 A 0 207 C 214 208 C 213 209 U 0 210 U 0 211 C 0 212 G 0 213 G 208 214 G 207 215 C 204 216 C 203 217 U 202 218 U 201 219 G 200 220 C 199 221 G 0 222 C 143 223 U 142 224 A 141 225 U 140 226 U 139 227 C 138 228 G 137 229 A 0 230 G 0 231 C 133 232 G 132 233 G 130 234 C 129 235 C 128 236 G 127 237 A 126 238 U 125 239 A 124 240 U 123 241 C 287 242 U 286 243 G 285 244 A 0 245 U 0 246 U 284 247 A 0 248 G 278 249 C 277 250 U 276 251 A 0 252 G 0 253 U 275 254 U 274 255 G 273 256 G 272 257 U 271 258 G 270 259 G 269 260 G 268 261 G 0 262 U 0 263 A 0 264 A 0 265 A 0 266 G 0 267 G 0 268 C 260 269 C 259 270 U 258 271 A 257 272 C 256 273 C 255 274 A 254 275 A 253 276 G 250 277 G 249 278 C 248 279 G 0 280 A 0 281 C 0 282 G 0 283 A 0 284 U 246 285 C 243 286 A 242 287 G 241 288 U 0 289 A 0 290 G 312 291 C 311 292 G 310 293 G 309 294 G 305 295 U 304 296 C 303 297 U 302 298 G 0 299 A 0 300 G 0 301 A 0 302 G 297 303 G 296 304 A 295 305 U 294 306 G 0 307 A 0 308 U 0 309 C 293 310 C 292 311 G 291 312 C 290 313 C 116 314 A 115 315 C 114 316 A 0 317 C 338 318 U 337 319 G 336 320 G 335 321 G 334 322 A 333 323 C 0 324 U 0 325 G 0 326 A 0 327 G 0 328 A 0 329 C 0 330 A 0 331 C 0 332 G 0 333 G 322 334 C 321 335 C 320 336 C 319 337 A 318 338 G 317 339 A 0 340 C 351 341 U 350 342 C 349 343 C 348 344 U 0 345 A 0 346 C 0 347 G 0 348 G 343 349 G 342 350 A 341 351 G 340 352 G 0 353 C 0 354 A 0 355 G 59 356 C 58 357 A 57 358 G 55 359 U 54 360 G 53 361 G 0 362 G 48 363 G 0 364 A 0 365 A 0 366 U 0 367 U 0 368 U 394 369 U 0 370 G 393 371 G 392 372 A 391 373 C 0 374 A 0 375 A 0 376 U 389 377 G 388 378 G 387 379 G 386 380 C 385 381 G 0 382 C 0 383 A 0 384 A 0 385 G 380 386 C 379 387 C 378 388 U 377 389 G 376 390 A 0 391 U 372 392 C 371 393 C 370 394 A 368 395 G 0 396 C 47 397 C 46 398 A 0 399 U 45 400 G 44 401 C 43 402 C 42 403 G 41 404 C 40 405 G 0 406 U 0 407 G 437 408 U 436 409 C 435 410 U 434 411 G 0 412 A 0 413 A 0 414 G 0 415 A 0 416 A 0 417 G 428 418 G 427 419 C 426 420 C 425 421 U 0 422 U 0 423 C 0 424 G 0 425 G 420 426 G 419 427 U 418 428 U 417 429 G 0 430 U 0 431 A 0 432 A 0 433 A 0 434 G 410 435 G 409 436 A 408 437 C 407 438 U 0 439 U 497 440 U 0 441 U 0 442 G 494 443 U 493 444 C 492 445 A 491 446 G 490 447 G 489 448 G 0 449 A 0 450 A 0 451 G 484 452 A 0 453 A 0 454 A 0 455 A 0 456 G 478 457 G 477 458 C 476 459 U 475 460 G 474 461 U 473 462 U 472 463 G 471 464 C 0 465 U 0 466 A 0 467 A 0 468 U 0 469 A 0 470 U 0 471 C 463 472 A 462 473 G 461 474 C 460 475 G 459 476 G 458 477 C 457 478 U 456 479 G 0 480 A 0 481 U 0 482 G 0 483 A 0 484 C 451 485 G 0 486 G 0 487 U 0 488 A 0 489 C 447 490 C 446 491 U 445 492 G 444 493 A 443 494 A 442 495 G 0 496 A 0 497 A 439 498 U 0 499 A 0 500 A 0 501 G 546 502 C 545 503 A 544 504 C 543 505 C 542 506 G 0 507 G 0 508 C 0 509 U 0 510 A 0 511 A 0 512 C 541 513 U 540 514 A 539 515 C 538 516 G 537 517 U 0 518 G 0 519 C 0 520 C 0 521 A 0 522 G 529 523 C 528 524 A 0 525 G 0 526 C 0 527 C 0 528 G 523 529 C 522 530 G 0 531 G 0 532 U 0 533 A 0 534 A 0 535 U 0 536 A 0 537 C 516 538 G 515 539 U 514 540 A 513 541 G 512 542 G 505 543 G 504 544 U 503 545 G 502 546 C 501 547 G 0 548 A 38 549 G 37 550 C 36 551 G 35 552 U 34 553 U 33 554 A 31 555 A 30 556 U 29 557 C 28 558 G 0 559 G 0 560 A 0 561 A 0 562 U 0 563 U 0 564 A 0 565 C 0 566 U 0 567 G 0 568 G 884 569 G 883 570 C 882 571 G 0 572 U 0 573 A 0 574 A 0 575 A 0 576 G 0 577 C 0 578 G 765 579 G 764 580 G 763 581 C 762 582 G 0 583 C 759 584 A 0 585 G 758 586 A 757 587 C 756 588 G 0 589 G 652 590 U 651 591 U 650 592 A 649 593 C 648 594 U 647 595 U 646 596 A 0 597 A 645 598 G 644 599 C 641 600 A 640 601 G 639 602 G 638 603 A 637 604 U 636 605 G 635 606 U 634 607 G 633 608 A 0 609 A 0 610 A 0 611 U 0 612 C 630 613 C 629 614 C 628 615 C 627 616 G 626 617 G 625 618 G 624 619 C 0 620 U 0 621 C 0 622 A 0 623 A 0 624 C 618 625 C 617 626 C 616 627 G 615 628 G 614 629 G 613 630 A 612 631 A 0 632 C 0 633 U 607 634 G 606 635 C 605 636 G 604 637 U 603 638 U 602 639 C 601 640 U 600 641 G 599 642 A 0 643 A 0 644 C 598 645 U 597 646 G 595 647 G 594 648 G 593 649 U 592 650 G 591 651 A 590 652 C 589 653 U 0 654 C 0 655 G 0 656 A 752 657 G 751 658 U 750 659 G 749 660 U 748 661 G 746 662 U 745 663 C 744 664 A 743 665 G 0 666 A 0 667 G 741 668 G 740 669 G 739 670 A 738 671 G 737 672 G 736 673 U 735 674 A 718 675 G 717 676 A 0 677 A 0 678 U 714 679 U 713 680 C 712 681 C 711 682 A 710 683 C 709 684 G 708 685 U 707 686 G 0 687 U 0 688 A 0 689 G 700 690 C 699 691 A 698 692 G 0 693 U 0 694 G 0 695 A 0 696 A 0 697 A 0 698 U 691 699 G 690 700 C 689 701 G 0 702 U 0 703 A 0 704 G 0 705 A 0 706 G 0 707 A 685 708 U 684 709 G 683 710 U 682 711 G 681 712 G 680 713 A 679 714 G 678 715 G 0 716 A 0 717 A 675 718 U 674 719 A 0 720 C 0 721 C 0 722 G 0 723 A 734 724 U 0 725 G 0 726 G 733 727 C 732 728 G 0 729 A 0 730 A 0 731 G 0 732 G 727 733 C 726 734 A 723 735 G 673 736 C 672 737 C 671 738 U 670 739 C 669 740 C 668 741 U 667 742 G 0 743 G 664 744 G 663 745 A 662 746 C 661 747 A 0 748 A 660 749 C 659 750 A 658 751 C 657 752 U 656 753 G 0 754 A 0 755 C 0 756 G 587 757 U 586 758 U 585 759 C 583 760 A 0 761 U 0 762 G 581 763 C 580 764 C 579 765 C 578 766 G 0 767 A 0 768 A 0 769 A 0 770 G 811 771 C 810 772 G 809 773 U 808 774 G 807 775 G 806 776 G 0 777 U 0 778 A 0 779 G 805 780 C 804 781 A 0 782 A 0 783 A 0 784 C 800 785 A 799 786 G 798 787 G 797 788 A 0 789 U 0 790 U 0 791 A 0 792 G 0 793 A 0 794 U 0 795 A 0 796 C 0 797 C 787 798 C 786 799 U 785 800 G 784 801 G 0 802 U 0 803 A 0 804 G 780 805 U 779 806 C 775 807 C 774 808 A 773 809 C 772 810 G 771 811 C 770 812 C 0 813 C 0 814 U 0 815 A 0 816 A 0 817 A 0 818 C 0 819 G 0 820 A 0 821 U 0 822 G 880 823 U 879 824 C 878 825 A 877 826 A 876 827 U 875 828 U 0 829 A 0 830 G 858 831 C 857 832 U 856 833 G 855 834 U 854 835 U 853 836 G 852 837 G 851 838 G 850 839 C 849 840 A 848 841 A 847 842 C 0 843 C 0 844 U 0 845 G 0 846 A 0 847 U 841 848 U 840 849 G 839 850 C 838 851 U 837 852 U 836 853 G 835 854 G 834 855 U 833 856 A 832 857 G 831 858 C 830 859 G 0 860 U 0 861 A 0 862 G 869 863 C 868 864 U 0 865 A 0 866 A 0 867 C 0 868 G 863 869 C 862 870 G 0 871 U 0 872 G 0 873 A 0 874 A 0 875 A 827 876 U 826 877 U 825 878 G 824 879 A 823 880 C 822 881 C 0 882 G 570 883 C 569 884 C 568 885 U 0 886 G 913 887 G 912 888 G 911 889 G 0 890 A 0 891 G 0 892 U 0 893 A 0 894 C 0 895 G 906 896 G 905 897 U 904 898 C 903 899 G 0 900 C 0 901 A 0 902 A 0 903 G 898 904 A 897 905 U 896 906 U 895 907 A 0 908 A 0 909 A 0 910 A 0 911 C 888 912 U 887 913 C 886 914 A 0 915 A 0 916 A 0 917 G 20 918 G 19 919 A 18 920 A 0 921 U 0 922 U 1396 923 G 1395 924 A 1393 925 C 1392 926 G 1391 927 G 0 928 G 1390 929 G 1389 930 A 1388 931 C 1387 932 C 1386 933 C 1385 934 G 1384 935 C 0 936 A 1380 937 C 1379 938 A 0 939 A 0 940 G 1344 941 C 1343 942 G 1342 943 G 1341 944 U 1340 945 G 1237 946 G 1236 947 A 1235 948 U 1234 949 G 1233 950 A 1232 951 U 1231 952 G 1230 953 U 1229 954 G 1228 955 G 1226 956 A 1225 957 U 0 958 U 0 959 A 0 960 A 0 961 U 976 962 U 975 963 C 974 964 G 973 965 A 0 966 U 0 967 G 0 968 C 0 969 A 0 970 A 0 971 C 0 972 G 0 973 C 964 974 G 963 975 A 962 976 A 961 977 G 0 978 A 0 979 A 0 980 C 0 981 C 0 982 U 0 983 U 0 984 A 0 985 C 1221 986 C 1220 987 U 1219 988 G 1218 989 G 1217 990 U 1216 991 C 1215 992 U 0 993 U 0 994 G 0 995 A 0 996 C 0 997 A 1046 998 U 1045 999 G 1044 1000 U 1042 1001 A 1041 1002 C 1040 1003 G 1039 1004 G 1038 1005 A 0 1006 A 0 1007 U 1024 1008 C 1023 1009 C 1022 1010 U 1021 1011 C 1020 1012 C 1019 1013 G 1018 1014 G 0 1015 A 0 1016 G 0 1017 A 0 1018 C 1013 1019 G 1012 1020 G 1011 1021 A 1010 1022 G 1009 1023 G 1008 1024 A 1007 1025 G 0 1026 U 1037 1027 G 1036 1028 C 1035 1029 C 1034 1030 U 0 1031 U 0 1032 C 0 1033 G 0 1034 G 1029 1035 G 1028 1036 A 1027 1037 G 1026 1038 C 1004 1039 C 1003 1040 G 1002 1041 U 1001 1042 A 1000 1043 A 0 1044 C 999 1045 A 998 1046 C 997 1047 A 0 1048 G 1210 1049 G 1209 1050 U 0 1051 G 1208 1052 C 1207 1053 U 1206 1054 G 1205 1055 C 0 1056 A 0 1057 U 1204 1058 G 1203 1059 G 1199 1060 C 1198 1061 U 1197 1062 G 1195 1063 U 1194 1064 C 1193 1065 G 1192 1066 U 0 1067 C 0 1068 A 0 1069 G 1108 1070 C 1107 1071 U 1106 1072 C 1105 1073 G 1104 1074 U 1103 1075 G 1084 1076 U 1083 1077 C 1082 1078 G 0 1079 U 0 1080 G 0 1081 A 0 1082 G 1077 1083 A 1076 1084 U 1075 1085 G 0 1086 U 0 1087 U 1100 1088 G 1099 1089 G 1098 1090 G 1097 1091 U 0 1092 U 0 1093 A 0 1094 A 0 1095 G 0 1096 U 0 1097 C 1090 1098 C 1089 1099 C 1088 1100 G 1087 1101 C 0 1102 A 0 1103 A 1074 1104 C 1073 1105 G 1072 1106 A 1071 1107 G 1070 1108 C 1069 1109 G 0 1110 C 0 1111 A 0 1112 A 0 1113 C 0 1114 C 1187 1115 C 1186 1116 U 1185 1117 U 1184 1118 G 0 1119 U 1155 1120 C 1154 1121 A 1153 1122 U 1152 1123 U 1151 1124 A 1150 1125 G 1149 1126 U 0 1127 U 0 1128 G 0 1129 C 1144 1130 C 1143 1131 A 0 1132 U 0 1133 C 1142 1134 A 1141 1135 U 0 1136 U 0 1137 C 0 1138 A 0 1139 G 0 1140 U 0 1141 U 1134 1142 G 1133 1143 G 1130 1144 G 1129 1145 C 0 1146 A 0 1147 C 0 1148 U 0 1149 C 1125 1150 U 1124 1151 A 1123 1152 A 1122 1153 U 1121 1154 G 1120 1155 A 1119 1156 G 0 1157 A 0 1158 C 1178 1159 U 1177 1160 G 1176 1161 C 1175 1162 C 1174 1163 G 1173 1164 G 1172 1165 U 1171 1166 G 0 1167 A 0 1168 C 0 1169 A 0 1170 A 0 1171 G 1165 1172 C 1164 1173 C 1163 1174 G 1162 1175 G 1161 1176 A 1160 1177 G 1159 1178 G 1158 1179 A 0 1180 A 0 1181 G 0 1182 G 0 1183 U 0 1184 G 1117 1185 G 1116 1186 G 1115 1187 G 1114 1188 A 0 1189 U 0 1190 G 0 1191 A 0 1192 C 1065 1193 G 1064 1194 U 1063 1195 C 1062 1196 A 0 1197 A 1061 1198 G 1060 1199 U 1059 1200 C 0 1201 C 0 1202 U 0 1203 C 1058 1204 A 1057 1205 U 1054 1206 G 1053 1207 G 1052 1208 C 1051 1209 C 1049 1210 C 1048 1211 U 0 1212 U 0 1213 A 0 1214 U 0 1215 G 991 1216 A 990 1217 C 989 1218 C 988 1219 A 987 1220 G 986 1221 G 985 1222 G 0 1223 C 0 1224 U 0 1225 U 956 1226 C 955 1227 A 0 1228 C 954 1229 A 953 1230 C 952 1231 G 951 1232 U 950 1233 C 949 1234 A 948 1235 U 947 1236 A 946 1237 C 945 1238 A 0 1239 A 0 1240 U 0 1241 G 1296 1242 G 1295 1243 U 1294 1244 C 1293 1245 G 1292 1246 G 1291 1247 U 1290 1248 A 0 1249 C 0 1250 A 0 1251 G 0 1252 A 0 1253 G 1284 1254 G 1283 1255 G 1282 1256 U 0 1257 A 0 1258 G 1277 1259 C 1276 1260 C 0 1261 A 0 1262 A 0 1263 G 1272 1264 C 1271 1265 C 1270 1266 G 0 1267 C 0 1268 G 0 1269 A 0 1270 G 1265 1271 G 1264 1272 C 1263 1273 G 0 1274 G 0 1275 A 0 1276 G 1259 1277 C 1258 1278 C 0 1279 A 0 1280 A 0 1281 U 0 1282 C 1255 1283 U 1254 1284 C 1253 1285 A 0 1286 C 0 1287 A 0 1288 A 0 1289 A 0 1290 A 1247 1291 C 1246 1292 C 1245 1293 G 1244 1294 A 1243 1295 U 1242 1296 C 1241 1297 G 0 1298 U 0 1299 A 0 1300 G 0 1301 U 0 1302 C 0 1303 C 1334 1304 G 0 1305 G 0 1306 A 0 1307 U 1330 1308 U 1329 1309 G 1328 1310 C 1327 1311 A 1326 1312 C 1325 1313 U 1324 1314 C 1323 1315 U 0 1316 G 0 1317 C 0 1318 A 0 1319 A 0 1320 C 0 1321 U 0 1322 C 0 1323 G 1314 1324 A 1313 1325 G 1312 1326 U 1311 1327 G 1310 1328 C 1309 1329 A 1308 1330 U 1307 1331 G 0 1332 A 0 1333 A 0 1334 G 1303 1335 U 0 1336 C 0 1337 G 0 1338 G 0 1339 A 0 1340 A 944 1341 U 943 1342 C 942 1343 G 941 1344 C 940 1345 U 0 1346 A 0 1347 G 0 1348 U 0 1349 A 0 1350 A 1372 1351 U 1371 1352 C 1370 1353 G 1369 1354 C 1368 1355 A 1367 1356 G 1366 1357 G 1365 1358 U 0 1359 C 0 1360 A 0 1361 G 0 1362 C 0 1363 A 0 1364 U 0 1365 A 1357 1366 C 1356 1367 U 1355 1368 G 1354 1369 C 1353 1370 G 1352 1371 G 1351 1372 U 1350 1373 G 0 1374 A 0 1375 A 0 1376 U 0 1377 A 0 1378 C 0 1379 G 937 1380 U 936 1381 U 0 1382 C 0 1383 C 0 1384 C 934 1385 G 933 1386 G 932 1387 G 931 1388 U 930 1389 C 929 1390 U 928 1391 U 926 1392 G 925 1393 U 924 1394 A 0 1395 C 923 1396 A 922 1397 C 0 1398 A 0 1399 C 0 1400 C 0 1401 G 1501 1402 C 1500 1403 C 0 1404 C 1497 1405 G 1496 1406 U 0 1407 C 0 1408 A 0 1409 C 1491 1410 A 1490 1411 C 1489 1412 C 1488 1413 A 1487 1414 U 1486 1415 G 1485 1416 G 1484 1417 G 0 1418 A 0 1419 G 1481 1420 U 1480 1421 G 1479 1422 G 1478 1423 G 1477 1424 G 1476 1425 G 1475 1426 A 1474 1427 U 1473 1428 A 1472 1429 C 1471 1430 C 1470 1431 A 0 1432 G 0 1433 A 0 1434 A 0 1435 G 1466 1436 U 1465 1437 A 1464 1438 G 1463 1439 G 1462 1440 U 1461 1441 A 0 1442 G 1460 1443 G 1459 1444 A 1458 1445 U 1457 1446 A 0 1447 A 0 1448 C 1455 1449 C 1454 1450 A 0 1451 C 0 1452 A 0 1453 A 0 1454 G 1449 1455 G 1448 1456 A 0 1457 G 1445 1458 U 1444 1459 C 1443 1460 C 1442 1461 G 1440 1462 C 1439 1463 U 1438 1464 U 1437 1465 A 1436 1466 C 1435 1467 C 0 1468 A 0 1469 C 0 1470 G 1430 1471 G 1429 1472 U 1428 1473 A 1427 1474 U 1426 1475 G 1425 1476 C 1424 1477 U 1423 1478 U 1422 1479 C 1421 1480 A 1420 1481 U 1419 1482 G 0 1483 A 0 1484 C 1416 1485 U 1415 1486 G 1414 1487 G 1413 1488 G 1412 1489 G 1411 1490 U 1410 1491 G 1409 1492 A 0 1493 A 0 1494 G 0 1495 U 0 1496 C 1405 1497 G 1404 1498 U 0 1499 A 0 1500 A 1402 1501 C 1401 1502 A 0 1503 A 0 1504 G 0 1505 G 0 1506 U 1529 1507 A 1528 1508 G 1527 1509 C 1526 1510 C 1525 1511 G 1524 1512 U 1523 1513 A 1522 1514 G 1521 1515 G 1520 1516 G 0 1517 G 0 1518 A 0 1519 A 0 1520 C 1515 1521 C 1514 1522 U 1513 1523 G 1512 1524 C 1511 1525 G 1510 1526 G 1509 1527 C 1508 1528 U 1507 1529 G 1506 1530 G 0 1531 A 0 1532 U 0 1533 C 0 1534 A 0 1535 C 0 1536 C 0 1537 U 0 1538 C 0 1539 C 0 1540 U 0 1541 U 0 1542 U 0 1543 C 0 1544 U 0