Filename: d.16.b.P.aeruginosa.bpseq Organism: Pseudomonas aeruginosa Accession Number: M34133 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 U 0 3 A 0 4 C 0 5 U 0 6 G 0 7 A 0 8 A 0 9 G 25 10 A 24 11 G 23 12 U 22 13 U 21 14 U 0 15 G 0 16 A 0 17 U 912 18 C 911 19 A 910 20 U 0 21 G 13 22 G 12 23 C 11 24 U 10 25 C 9 26 A 0 27 G 550 28 A 549 29 U 548 30 U 547 31 G 0 32 A 546 33 A 545 34 C 544 35 G 543 36 C 542 37 U 541 38 G 0 39 G 397 40 C 396 41 G 395 42 G 394 43 C 393 44 A 392 45 G 390 46 G 389 47 C 355 48 C 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 C 353 53 A 352 54 C 351 55 A 0 56 U 350 57 G 349 58 C 348 59 A 0 60 A 0 61 G 100 62 U 99 63 C 98 64 G 0 65 A 0 66 G 97 67 C 96 68 G 95 69 G 94 70 A 93 71 U 0 72 G 0 73 A 0 74 A 0 75 G 88 76 G 87 77 G 86 78 A 85 79 G 84 80 C 0 81 U 0 82 U 0 83 G 0 84 C 79 85 U 78 86 C 77 87 C 76 88 U 75 89 G 0 90 G 0 91 A 0 92 U 0 93 U 70 94 C 69 95 A 68 96 G 67 97 C 66 98 G 63 99 G 62 100 C 61 101 G 0 102 G 0 103 A 0 104 C 0 105 G 0 106 G 0 107 G 308 108 U 307 109 G 306 110 A 0 111 G 0 112 U 0 113 A 0 114 A 0 115 U 0 116 G 233 117 C 232 118 C 231 119 U 230 120 A 229 121 G 228 122 G 227 123 A 226 124 A 0 125 U 225 126 C 224 127 U 0 128 G 0 129 C 0 130 C 221 131 U 220 132 G 219 133 A 218 134 U 217 135 A 216 136 G 215 137 U 0 138 G 172 139 G 171 140 G 170 141 G 169 142 G 0 143 A 0 144 U 0 145 A 0 146 A 163 147 C 162 148 G 161 149 U 160 150 C 159 151 C 158 152 G 157 153 G 0 154 A 0 155 A 0 156 A 0 157 C 152 158 G 151 159 G 150 160 G 149 161 C 148 162 G 147 163 C 146 164 U 0 165 A 0 166 A 0 167 U 0 168 A 0 169 C 141 170 C 140 171 G 139 172 C 138 173 A 0 174 U 0 175 A 0 176 C 0 177 G 0 178 U 187 179 C 186 180 C 185 181 U 0 182 G 0 183 A 0 184 G 0 185 G 180 186 G 179 187 A 178 188 G 0 189 A 0 190 A 0 191 A 0 192 G 213 193 G 212 194 G 211 195 G 210 196 G 209 197 G 208 198 G 0 199 A 0 200 U 207 201 C 206 202 C 0 203 U 0 204 C 0 205 G 0 206 G 201 207 A 200 208 C 197 209 C 196 210 U 195 211 C 194 212 A 193 213 C 192 214 G 0 215 C 136 216 U 135 217 A 134 218 U 133 219 C 132 220 N 131 221 G 130 222 A 0 223 U 0 224 G 126 225 A 125 226 G 123 227 C 122 228 C 121 229 U 120 230 A 119 231 G 118 232 G 117 233 U 116 234 C 280 235 G 279 236 G 278 237 A 0 238 U 0 239 U 277 240 A 0 241 G 271 242 C 270 243 U 269 244 A 0 245 G 0 246 U 268 247 U 267 248 G 266 249 G 265 250 U 264 251 G 263 252 G 262 253 G 261 254 G 0 255 U 0 256 A 0 257 A 0 258 A 0 259 G 0 260 G 0 261 C 253 262 C 252 263 U 251 264 A 250 265 C 249 266 C 248 267 A 247 268 A 246 269 G 243 270 G 242 271 C 241 272 G 0 273 A 0 274 C 0 275 G 0 276 A 0 277 U 239 278 C 236 279 C 235 280 G 234 281 U 0 282 A 0 283 A 305 284 C 304 285 U 303 286 G 302 287 G 298 288 U 297 289 C 296 290 U 295 291 G 0 292 A 0 293 G 0 294 A 0 295 G 290 296 G 289 297 A 288 298 C 287 299 G 0 300 A 0 301 U 0 302 C 286 303 A 285 304 G 284 305 U 283 306 C 109 307 A 108 308 C 107 309 A 0 310 C 331 311 U 330 312 G 329 313 G 328 314 A 327 315 A 326 316 C 0 317 U 0 318 G 0 319 A 0 320 G 0 321 A 0 322 C 0 323 A 0 324 C 0 325 G 0 326 G 315 327 U 314 328 C 313 329 C 312 330 A 311 331 G 310 332 A 0 333 C 344 334 U 343 335 C 342 336 C 341 337 U 0 338 A 0 339 C 0 340 G 0 341 G 336 342 G 335 343 A 334 344 G 333 345 G 0 346 C 0 347 A 0 348 G 58 349 C 57 350 A 56 351 G 54 352 U 53 353 G 52 354 G 0 355 G 47 356 G 0 357 A 0 358 A 0 359 U 0 360 A 0 361 U 387 362 U 0 363 G 386 364 G 385 365 A 384 366 C 0 367 A 0 368 A 0 369 U 382 370 G 381 371 G 380 372 G 379 373 C 378 374 G 0 375 A 0 376 A 0 377 A 0 378 G 373 379 C 372 380 C 371 381 N 370 382 G 369 383 A 0 384 U 365 385 C 364 386 C 363 387 A 361 388 G 0 389 C 46 390 C 45 391 A 0 392 U 44 393 G 43 394 C 42 395 C 41 396 G 40 397 C 39 398 G 0 399 U 0 400 G 430 401 U 429 402 G 428 403 U 427 404 G 0 405 A 0 406 A 0 407 G 0 408 A 0 409 A 0 410 G 421 411 G 420 412 U 419 413 C 418 414 U 0 415 U 0 416 C 0 417 G 0 418 G 413 419 A 412 420 U 411 421 U 410 422 G 0 423 U 0 424 A 0 425 A 0 426 A 0 427 G 403 428 C 402 429 A 401 430 C 400 431 U 0 432 U 490 433 U 0 434 A 491 435 A 487 436 G 486 437 U 485 438 U 484 439 G 483 440 G 482 441 G 0 442 A 0 443 G 0 444 G 477 445 A 0 446 A 0 447 G 0 448 G 0 449 G 471 450 C 470 451 A 469 452 G 468 453 U 467 454 A 466 455 A 465 456 G 464 457 U 0 458 U 0 459 A 0 460 A 0 461 U 0 462 A 0 463 C 0 464 C 456 465 U 455 466 U 454 467 G 453 468 C 452 469 U 451 470 G 450 471 U 449 472 U 0 473 U 0 474 U 0 475 G 0 476 A 0 477 C 444 478 G 0 479 U 0 480 U 0 481 A 0 482 C 440 483 C 439 484 A 438 485 A 437 486 C 436 487 A 435 488 G 0 489 A 0 490 A 432 491 U 434 492 A 0 493 A 0 494 G 539 495 C 538 496 A 537 497 C 536 498 C 535 499 G 520 500 G 519 501 C 518 502 U 0 503 A 0 504 A 0 505 C 534 506 U 533 507 U 532 508 C 531 509 G 530 510 U 0 511 G 0 512 C 0 513 C 0 514 A 0 515 G 522 516 C 521 517 A 0 518 G 501 519 C 500 520 C 499 521 G 516 522 C 515 523 G 0 524 G 0 525 U 0 526 A 0 527 A 0 528 U 0 529 A 0 530 C 509 531 G 508 532 A 507 533 A 506 534 G 505 535 G 498 536 G 497 537 U 496 538 G 495 539 C 494 540 G 0 541 A 37 542 G 36 543 C 35 544 G 34 545 U 33 546 U 32 547 A 30 548 A 29 549 U 28 550 C 27 551 G 0 552 G 0 553 A 0 554 A 0 555 U 0 556 U 0 557 A 0 558 C 0 559 U 0 560 G 0 561 G 877 562 G 876 563 C 875 564 G 860 565 U 859 566 A 0 567 A 0 568 A 0 569 G 874 570 C 0 571 G 758 572 C 757 573 G 756 574 C 755 575 G 0 576 U 752 577 A 0 578 G 751 579 G 750 580 U 749 581 G 0 582 G 645 583 U 644 584 U 643 585 C 642 586 A 641 587 G 640 588 C 639 589 A 0 590 A 638 591 G 637 592 U 634 593 U 633 594 G 632 595 G 631 596 A 630 597 U 629 598 G 628 599 U 627 600 G 626 601 A 0 602 A 0 603 A 0 604 U 0 605 C 623 606 C 622 607 C 621 608 C 620 609 G 619 610 G 618 611 G 617 612 C 0 613 U 0 614 C 0 615 A 0 616 A 0 617 C 611 618 C 610 619 U 609 620 G 608 621 G 607 622 G 606 623 A 605 624 A 0 625 C 0 626 U 600 627 G 599 628 C 598 629 A 597 630 U 596 631 C 595 632 C 594 633 N 593 634 A 592 635 A 0 636 A 0 637 C 591 638 U 590 639 A 588 640 C 587 641 U 586 642 G 585 643 A 584 644 G 583 645 C 582 646 U 0 647 A 0 648 G 0 649 A 745 650 G 744 651 U 743 652 A 742 653 C 740 654 G 739 655 G 738 656 U 737 657 A 736 658 G 0 659 A 0 660 G 734 661 G 733 662 G 732 663 U 731 664 G 730 665 G 729 666 U 728 667 G 711 668 G 710 669 A 0 670 A 0 671 U 707 672 U 706 673 U 705 674 C 704 675 C 703 676 U 702 677 G 701 678 U 700 679 G 0 680 U 0 681 A 0 682 G 693 683 C 692 684 G 691 685 G 0 686 U 0 687 G 0 688 A 0 689 A 0 690 A 0 691 U 684 692 G 683 693 C 682 694 G 0 695 U 0 696 A 0 697 G 0 698 A 0 699 U 0 700 A 678 701 U 677 702 A 676 703 G 675 704 G 674 705 A 673 706 A 672 707 G 671 708 G 0 709 A 0 710 A 668 711 C 667 712 A 0 713 C 0 714 C 0 715 A 0 716 G 727 717 U 0 718 G 0 719 G 726 720 C 725 721 G 0 722 A 0 723 A 0 724 G 0 725 G 720 726 C 719 727 G 716 728 A 666 729 C 665 730 C 664 731 A 663 732 C 662 733 C 661 734 U 660 735 G 0 736 G 657 737 A 656 738 C 655 739 U 654 740 G 653 741 A 0 742 U 652 743 A 651 744 C 650 745 U 649 746 G 0 747 A 0 748 C 0 749 A 580 750 C 579 751 U 578 752 G 576 753 A 0 754 G 0 755 G 574 756 U 573 757 G 572 758 C 571 759 G 0 760 A 0 761 A 0 762 A 0 763 G 804 764 C 803 765 G 802 766 U 801 767 G 800 768 G 799 769 G 0 770 G 0 771 A 0 772 G 798 773 C 797 774 A 0 775 A 0 776 A 0 777 C 793 778 A 792 779 G 791 780 G 790 781 A 0 782 U 0 783 U 0 784 A 0 785 G 0 786 A 0 787 U 0 788 A 0 789 C 0 790 C 780 791 C 779 792 U 778 793 G 777 794 G 0 795 U 0 796 A 0 797 G 773 798 U 772 799 C 768 800 C 767 801 A 766 802 C 765 803 G 764 804 C 763 805 C 0 806 G 0 807 U 0 808 A 0 809 A 0 810 A 0 811 C 0 812 G 0 813 A 0 814 U 0 815 G 873 816 U 872 817 C 871 818 G 870 819 A 869 820 C 868 821 U 0 822 A 0 823 G 851 824 C 850 825 C 849 826 G 848 827 U 847 828 U 846 829 G 845 830 G 844 831 G 843 832 A 842 833 U 841 834 C 840 835 C 0 836 U 0 837 U 0 838 G 0 839 A 0 840 G 834 841 A 833 842 U 832 843 C 831 844 U 830 845 U 829 846 A 828 847 G 827 848 U 826 849 G 825 850 G 824 851 C 823 852 G 0 853 C 0 854 A 0 855 G 862 856 C 861 857 U 0 858 A 0 859 A 565 860 C 564 861 G 856 862 C 855 863 G 0 864 A 0 865 U 0 866 A 0 867 A 0 868 G 820 869 U 819 870 C 818 871 G 817 872 A 816 873 C 815 874 C 569 875 G 563 876 C 562 877 C 561 878 U 0 879 G 906 880 G 905 881 G 904 882 G 0 883 A 0 884 G 0 885 U 0 886 A 0 887 C 0 888 G 899 889 G 898 890 C 897 891 C 896 892 G 0 893 C 0 894 A 0 895 A 0 896 G 891 897 G 890 898 U 889 899 U 888 900 A 0 901 A 0 902 A 0 903 A 0 904 C 881 905 U 880 906 C 879 907 A 0 908 A 0 909 A 0 910 U 19 911 G 18 912 A 17 913 A 0 914 U 0 915 U 1390 916 G 1389 917 A 1387 918 C 1386 919 G 1385 920 G 0 921 G 1384 922 G 1383 923 G 1382 924 C 1381 925 N 1380 926 N 1379 927 G 1378 928 C 0 929 A 1374 930 C 1373 931 A 0 932 A 0 933 G 1338 934 C 1337 935 G 1336 936 G 1335 937 U 1334 938 G 1231 939 G 1230 940 A 1229 941 G 1228 942 C 1227 943 A 1226 944 U 1225 945 G 1224 946 U 1223 947 G 1222 948 G 1220 949 U 1219 950 U 0 951 U 0 952 A 0 953 A 0 954 U 969 955 U 968 956 C 967 957 G 966 958 A 0 959 A 0 960 G 0 961 C 0 962 A 0 963 A 0 964 C 0 965 G 0 966 C 957 967 G 956 968 A 955 969 A 954 970 G 0 971 A 0 972 A 0 973 C 0 974 C 0 975 U 0 976 U 0 977 A 0 978 C 1215 979 C 1214 980 U 1213 981 G 1212 982 G 1211 983 C 1210 984 C 1209 985 U 0 986 U 0 987 G 0 988 A 0 989 C 0 990 A 1039 991 U 1038 992 G 1037 993 C 1035 994 U 1034 995 G 1033 996 A 1032 997 G 1031 998 A 0 999 A 0 1000 C 1017 1001 U 1016 1002 U 1015 1003 U 1014 1004 C 1013 1005 C 1012 1006 A 1011 1007 G 0 1008 A 0 1009 G 0 1010 A 0 1011 U 1006 1012 G 1005 1013 G 1004 1014 A 1003 1015 U 1002 1016 U 1001 1017 G 1000 1018 G 0 1019 U 1030 1020 G 1029 1021 C 1028 1022 C 1027 1023 U 0 1024 U 0 1025 C 0 1026 G 0 1027 G 1022 1028 G 1021 1029 A 1020 1030 A 1019 1031 C 997 1032 U 996 1033 C 995 1034 A 994 1035 G 993 1036 A 0 1037 C 992 1038 A 991 1039 C 990 1040 A 0 1041 G 1204 1042 G 1203 1043 U 0 1044 G 1202 1045 C 1201 1046 U 1200 1047 G 1199 1048 C 0 1049 A 0 1050 U 1198 1051 G 1197 1052 G 1193 1053 C 1192 1054 U 1191 1055 G 1189 1056 U 1188 1057 C 1187 1058 G 1186 1059 U 0 1060 C 0 1061 A 0 1062 G 1101 1063 C 1100 1064 U 1099 1065 C 1098 1066 G 1097 1067 U 1096 1068 G 1077 1069 U 1076 1070 C 1075 1071 G 0 1072 U 0 1073 G 0 1074 A 0 1075 G 1070 1076 A 1069 1077 U 1068 1078 G 0 1079 U 0 1080 U 1093 1081 G 1092 1082 G 1091 1083 G 1090 1084 U 0 1085 U 0 1086 A 0 1087 A 0 1088 G 0 1089 U 0 1090 C 1083 1091 C 1082 1092 C 1081 1093 G 1080 1094 U 0 1095 A 0 1096 A 1067 1097 C 1066 1098 G 1065 1099 A 1064 1100 G 1063 1101 C 1062 1102 G 0 1103 C 0 1104 A 0 1105 A 0 1106 C 0 1107 C 1181 1108 C 1180 1109 U 1179 1110 U 1178 1111 G 0 1112 U 1149 1113 C 1148 1114 C 1147 1115 U 1146 1116 U 1145 1117 A 1144 1118 G 1143 1119 U 0 1120 U 0 1121 A 0 1122 C 1138 1123 C 1137 1124 A 0 1125 G 0 1126 C 1136 1127 A 1135 1128 C 1134 1129 C 0 1130 U 0 1131 C 0 1132 G 0 1133 G 0 1134 G 1128 1135 U 1127 1136 G 1126 1137 G 1123 1138 G 1122 1139 C 0 1140 A 0 1141 C 0 1142 U 0 1143 C 1118 1144 U 1117 1145 A 1116 1146 A 1115 1147 G 1114 1148 G 1113 1149 A 1112 1150 G 0 1151 A 0 1152 C 1172 1153 U 1171 1154 G 1170 1155 C 1169 1156 C 1168 1157 G 1167 1158 G 1166 1159 U 1165 1160 G 0 1161 A 0 1162 C 0 1163 A 0 1164 A 0 1165 A 1159 1166 C 1158 1167 C 1157 1168 G 1156 1169 G 1155 1170 A 1154 1171 G 1153 1172 G 1152 1173 A 0 1174 A 0 1175 G 0 1176 G 0 1177 U 0 1178 G 1110 1179 G 1109 1180 G 1108 1181 G 1107 1182 A 0 1183 U 0 1184 G 0 1185 A 0 1186 C 1058 1187 G 1057 1188 U 1056 1189 C 1055 1190 A 0 1191 A 1054 1192 G 1053 1193 U 1052 1194 C 0 1195 A 0 1196 U 0 1197 C 1051 1198 A 1050 1199 U 1047 1200 G 1046 1201 G 1045 1202 C 1044 1203 C 1042 1204 C 1041 1205 U 0 1206 U 0 1207 A 0 1208 C 0 1209 G 984 1210 G 983 1211 C 982 1212 N 981 1213 A 980 1214 G 979 1215 G 978 1216 G 0 1217 C 0 1218 U 0 1219 A 949 1220 C 948 1221 A 0 1222 C 947 1223 A 946 1224 C 945 1225 G 944 1226 U 943 1227 G 942 1228 C 941 1229 U 940 1230 A 939 1231 C 938 1232 A 0 1233 A 0 1234 U 0 1235 G 1290 1236 G 1289 1237 U 1288 1238 C 1287 1239 G 1286 1240 G 1285 1241 U 1284 1242 A 0 1243 C 0 1244 A 0 1245 A 0 1246 A 0 1247 G 1278 1248 G 1277 1249 G 1276 1250 U 0 1251 U 0 1252 G 1271 1253 C 1270 1254 G 0 1255 A 0 1256 A 0 1257 G 1266 1258 C 1265 1259 C 1264 1260 G 0 1261 C 0 1262 G 0 1263 A 0 1264 G 1259 1265 G 1258 1266 U 1257 1267 G 0 1268 G 0 1269 A 0 1270 G 1253 1271 C 1252 1272 U 0 1273 A 0 1274 A 0 1275 U 0 1276 C 1249 1277 C 1248 1278 C 1247 1279 A 0 1280 U 0 1281 A 0 1282 A 0 1283 A 0 1284 A 1241 1285 C 1240 1286 C 1239 1287 G 1238 1288 A 1237 1289 U 1236 1290 C 1235 1291 G 0 1292 U 0 1293 A 0 1294 G 0 1295 U 0 1296 C 0 1297 C 1328 1298 G 0 1299 G 0 1300 A 0 1301 U 1324 1302 C 1323 1303 G 1322 1304 C 1321 1305 A 1320 1306 G 1319 1307 U 1318 1308 C 1317 1309 U 0 1310 G 0 1311 C 0 1312 A 0 1313 A 0 1314 C 0 1315 U 0 1316 C 0 1317 G 1308 1318 A 1307 1319 C 1306 1320 U 1305 1321 G 1304 1322 C 1303 1323 G 1302 1324 U 1301 1325 G 0 1326 A 0 1327 A 0 1328 G 1297 1329 U 0 1330 C 0 1331 G 0 1332 G 0 1333 A 0 1334 A 937 1335 U 936 1336 C 935 1337 G 934 1338 C 933 1339 U 0 1340 A 0 1341 G 0 1342 U 0 1343 A 0 1344 A 1366 1345 U 1365 1346 C 1364 1347 G 1363 1348 U 1362 1349 G 1361 1350 A 1360 1351 A 1359 1352 U 0 1353 C 0 1354 A 0 1355 G 0 1356 A 0 1357 A 0 1358 U 0 1359 G 1351 1360 U 1350 1361 C 1349 1362 A 1348 1363 C 1347 1364 G 1346 1365 G 1345 1366 U 1344 1367 G 0 1368 A 0 1369 A 0 1370 U 0 1371 A 0 1372 C 0 1373 G 930 1374 U 929 1375 U 0 1376 C 0 1377 C 0 1378 C 927 1379 G 926 1380 G 925 1381 G 924 1382 C 923 1383 C 922 1384 U 921 1385 U 919 1386 G 918 1387 U 917 1388 A 0 1389 C 916 1390 A 915 1391 C 0 1392 A 0 1393 C 1498 1394 C 0 1395 G 1495 1396 C 1494 1397 C 0 1398 C 1491 1399 G 1490 1400 U 0 1401 C 1488 1402 A 0 1403 C 1485 1404 A 1484 1405 C 1483 1406 C 1482 1407 A 1481 1408 U 1480 1409 G 1479 1410 G 1478 1411 G 0 1412 A 0 1413 G 1475 1414 U 1474 1415 G 1473 1416 G 1472 1417 G 1471 1418 U 1470 1419 U 1469 1420 G 1468 1421 C 1467 1422 U 1466 1423 C 1465 1424 C 1464 1425 A 0 1426 G 0 1427 A 0 1428 A 0 1429 G 1460 1430 U 1459 1431 A 1458 1432 G 1457 1433 C 1456 1434 U 1455 1435 A 0 1436 G 1454 1437 U 1453 1438 C 1452 1439 U 1451 1440 A 0 1441 A 0 1442 C 1449 1443 C 1448 1444 G 0 1445 C 0 1446 A 0 1447 A 0 1448 G 1443 1449 G 1442 1450 G 0 1451 G 1439 1452 G 1438 1453 A 1437 1454 C 1436 1455 G 1434 1456 G 1433 1457 U 1432 1458 U 1431 1459 A 1430 1460 C 1429 1461 C 0 1462 A 0 1463 C 0 1464 G 1424 1465 G 1423 1466 A 1422 1467 G 1421 1468 U 1420 1469 G 1419 1470 A 1418 1471 U 1417 1472 U 1416 1473 C 1415 1474 A 1414 1475 U 1413 1476 G 0 1477 N 0 1478 N 1410 1479 N 1409 1480 N 1408 1481 N 1407 1482 N 1406 1483 N 1405 1484 N 1404 1485 N 1403 1486 N 0 1487 N 0 1488 N 1401 1489 N 0 1490 N 1399 1491 G 1398 1492 U 0 1493 A 0 1494 A 1396 1495 C 1395 1496 A 0 1497 A 0 1498 G 1393 1499 N 0 1500 N 1523 1501 N 1522 1502 N 1521 1503 N 1520 1504 N 1519 1505 N 1518 1506 N 1517 1507 N 1516 1508 N 1515 1509 N 1514 1510 N 0 1511 G 0 1512 A 0 1513 A 0 1514 C 1509 1515 C 1508 1516 U 1507 1517 G 1506 1518 N 1505 1519 N 1504 1520 N 1503 1521 N 1502 1522 N 1501 1523 N 1500 1524 N 0 1525 N 0 1526 N 0 1527 N 0 1528 N 0 1529 N 0 1530 N 0 1531 N 0 1532 N 0 1533 N 0 1534 N 0 1535 N 0 1536 N 0