Filename: d.16.b.P.multocida.bpseq Organism: Pasteurella multocida Accession Number: M35018 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 A 0 3 A 0 4 U 0 5 U 0 6 G 0 7 A 0 8 A 0 9 G 25 10 A 24 11 G 23 12 U 22 13 U 21 14 U 0 15 G 0 16 A 0 17 U 918 18 C 917 19 A 916 20 U 0 21 G 13 22 G 12 23 C 11 24 U 10 25 C 9 26 A 0 27 G 558 28 A 557 29 U 556 30 U 555 31 G 0 32 A 554 33 A 553 34 C 552 35 G 551 36 C 550 37 U 549 38 G 0 39 G 405 40 C 404 41 G 403 42 G 402 43 C 401 44 A 400 45 G 398 46 G 397 47 C 363 48 U 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 C 361 53 A 360 54 C 359 55 A 0 56 U 358 57 G 357 58 C 356 59 A 0 60 A 0 61 G 108 62 U 107 63 C 106 64 G 0 65 A 0 66 A 105 67 C 104 68 G 103 69 G 101 70 U 100 71 A 0 72 G 0 73 C 99 74 A 98 75 G 97 76 G 95 77 A 94 78 A 93 79 G 92 80 A 91 81 A 90 82 A 89 83 G 88 84 C 0 85 U 0 86 U 0 87 G 0 88 C 83 89 U 82 90 U 81 91 U 80 92 C 79 93 U 78 94 U 77 95 U 76 96 G 0 97 C 75 98 U 74 99 G 73 100 A 70 101 C 69 102 G 0 103 A 68 104 G 67 105 U 66 106 G 63 107 G 62 108 C 61 109 G 0 110 G 0 111 A 0 112 C 0 113 G 0 114 G 0 115 G 316 116 U 315 117 G 314 118 A 0 119 G 0 120 U 0 121 A 0 122 A 0 123 U 0 124 G 241 125 C 240 126 U 239 127 U 238 128 G 237 129 G 236 130 G 235 131 A 234 132 A 0 133 U 233 134 C 232 135 U 0 136 G 0 137 G 0 138 C 229 139 U 228 140 U 227 141 A 226 142 U 225 143 G 224 144 G 223 145 A 0 146 G 180 147 G 179 148 G 178 149 G 177 150 G 0 151 A 0 152 U 0 153 A 0 154 A 171 155 C 170 156 U 169 157 G 168 158 U 167 159 G 166 160 G 165 161 G 0 162 A 0 163 A 0 164 A 0 165 C 160 166 U 159 167 G 158 168 C 157 169 A 156 170 G 155 171 C 154 172 U 0 173 A 0 174 A 0 175 U 0 176 A 0 177 C 149 178 C 148 179 G 147 180 C 146 181 G 0 182 U 0 183 A 0 184 U 0 185 U 0 186 C 195 187 U 194 188 C 193 189 U 0 190 G 0 191 A 0 192 G 0 193 G 188 194 A 187 195 G 186 196 G 0 197 A 0 198 A 0 199 A 0 200 G 221 201 G 220 202 G 219 203 U 218 204 G 217 205 G 216 206 G 0 207 A 0 208 C 215 209 C 214 210 U 0 211 U 0 212 A 0 213 G 0 214 G 209 215 G 208 216 C 205 217 C 204 218 A 203 219 C 202 220 C 201 221 U 200 222 G 0 223 C 144 224 C 143 225 A 142 226 U 141 227 A 140 228 A 139 229 G 138 230 A 0 231 U 0 232 G 134 233 A 133 234 G 131 235 C 130 236 C 129 237 C 128 238 A 127 239 A 126 240 G 125 241 U 124 242 G 288 243 G 287 244 G 286 245 A 0 246 U 0 247 U 285 248 A 0 249 G 279 250 G 278 251 U 277 252 A 0 253 G 0 254 U 276 255 U 275 256 G 274 257 G 273 258 U 272 259 G 271 260 G 270 261 G 269 262 G 0 263 U 0 264 A 0 265 A 0 266 A 0 267 G 0 268 G 0 269 C 261 270 C 260 271 U 259 272 A 258 273 C 257 274 C 256 275 A 255 276 A 254 277 G 251 278 C 250 279 C 249 280 U 0 281 N 0 282 C 0 283 G 0 284 A 0 285 U 247 286 C 244 287 U 243 288 C 242 289 U 0 290 A 0 291 G 313 292 C 312 293 U 311 294 G 310 295 G 306 296 U 305 297 C 304 298 U 303 299 G 0 300 A 0 301 G 0 302 A 0 303 G 298 304 G 297 305 A 296 306 U 295 307 G 0 308 A 0 309 C 0 310 C 294 311 A 293 312 G 292 313 C 291 314 C 117 315 A 116 316 C 115 317 A 0 318 C 339 319 U 338 320 G 337 321 G 336 322 A 335 323 A 334 324 C 0 325 U 0 326 G 0 327 A 0 328 G 0 329 A 0 330 C 0 331 A 0 332 C 0 333 G 0 334 G 323 335 U 322 336 C 321 337 C 320 338 A 319 339 G 318 340 A 0 341 C 352 342 U 351 343 C 350 344 C 349 345 U 0 346 A 0 347 C 0 348 G 0 349 G 344 350 G 343 351 A 342 352 G 341 353 G 0 354 C 0 355 A 0 356 G 58 357 C 57 358 A 56 359 G 54 360 U 53 361 G 52 362 G 0 363 G 47 364 G 0 365 A 0 366 A 0 367 U 0 368 A 0 369 U 395 370 U 0 371 G 394 372 C 393 373 G 392 374 C 0 375 A 0 376 A 0 377 U 390 378 G 389 379 G 388 380 G 387 381 G 386 382 G 0 383 G 0 384 A 0 385 A 0 386 C 381 387 C 380 388 C 379 389 U 378 390 G 377 391 A 0 392 C 373 393 G 372 394 C 371 395 A 369 396 G 0 397 C 46 398 C 45 399 A 0 400 U 44 401 G 43 402 C 42 403 C 41 404 G 40 405 C 39 406 G 0 407 U 0 408 G 438 409 A 437 410 A 436 411 U 435 412 G 0 413 A 0 414 A 0 415 G 0 416 A 0 417 A 0 418 G 429 419 G 428 420 C 427 421 C 426 422 U 0 423 U 0 424 C 0 425 G 0 426 G 421 427 G 420 428 U 419 429 U 418 430 G 0 431 U 0 432 A 0 433 A 0 434 A 0 435 G 411 436 U 410 437 U 409 438 C 408 439 U 0 440 U 498 441 U 0 442 C 499 443 G 495 444 G 494 445 U 493 446 A 492 447 A 491 448 U 490 449 G 0 450 A 0 451 G 0 452 G 485 453 A 0 454 A 0 455 G 0 456 G 0 457 G 479 458 A 478 459 U 477 460 G 476 461 U 475 462 U 474 463 G 473 464 U 472 465 U 0 466 A 0 467 A 0 468 A 0 469 U 0 470 A 0 471 G 0 472 A 464 473 U 463 474 A 462 475 G 461 476 C 460 477 A 459 478 U 458 479 C 457 480 A 0 481 U 0 482 U 0 483 G 0 484 A 0 485 C 452 486 G 0 487 U 0 488 U 0 489 A 0 490 A 448 491 U 447 492 U 446 493 A 445 494 C 444 495 A 443 496 G 0 497 A 0 498 A 440 499 G 442 500 A 0 501 A 0 502 G 547 503 C 546 504 A 545 505 C 544 506 C 543 507 G 528 508 G 527 509 C 526 510 U 0 511 A 0 512 A 0 513 C 542 514 U 541 515 C 540 516 C 539 517 G 538 518 U 0 519 G 0 520 C 0 521 C 0 522 A 0 523 G 530 524 C 529 525 A 0 526 G 509 527 C 508 528 C 507 529 G 524 530 C 523 531 G 0 532 G 0 533 U 0 534 A 0 535 A 0 536 U 0 537 A 0 538 C 517 539 G 516 540 G 515 541 A 514 542 G 513 543 G 506 544 G 505 545 U 504 546 G 503 547 C 502 548 G 0 549 A 37 550 G 36 551 C 35 552 G 34 553 U 33 554 U 32 555 A 30 556 A 29 557 U 28 558 C 27 559 G 0 560 G 0 561 A 0 562 A 0 563 U 0 564 A 0 565 A 0 566 C 0 567 U 0 568 G 0 569 G 883 570 G 882 571 C 881 572 G 866 573 U 865 574 A 0 575 A 0 576 A 0 577 G 880 578 G 0 579 G 766 580 C 765 581 A 764 582 C 763 583 G 0 584 C 760 585 A 0 586 G 759 587 G 758 588 C 757 589 G 0 590 G 653 591 A 652 592 C 651 593 U 650 594 U 649 595 U 648 596 U 647 597 A 0 598 A 646 599 G 645 600 U 642 601 G 641 602 A 640 603 G 639 604 A 638 605 U 637 606 G 636 607 U 635 608 G 634 609 A 0 610 A 0 611 A 0 612 U 0 613 C 631 614 C 630 615 C 629 616 C 628 617 G 627 618 A 626 619 G 625 620 C 0 621 U 0 622 U 0 623 A 0 624 A 0 625 C 619 626 U 618 627 U 617 628 G 616 629 G 615 630 G 614 631 A 613 632 A 0 633 C 0 634 U 608 635 G 607 636 C 606 637 A 605 638 U 604 639 U 603 640 U 602 641 C 601 642 A 600 643 G 0 644 A 0 645 C 599 646 U 598 647 G 596 648 G 595 649 G 594 650 A 593 651 G 592 652 U 591 653 C 590 654 U 0 655 A 0 656 G 0 657 A 753 658 G 752 659 U 751 660 A 750 661 C 749 662 U 747 663 U 746 664 U 745 665 A 744 666 G 0 667 G 0 668 G 742 669 A 741 670 G 740 671 G 739 672 G 738 673 N 737 674 U 736 675 A 719 676 G 718 677 A 0 678 A 0 679 U 715 680 U 714 681 C 713 682 C 712 683 A 711 684 C 710 685 G 709 686 U 708 687 G 0 688 U 0 689 A 0 690 G 701 691 C 700 692 G 699 693 G 0 694 U 0 695 G 0 696 A 0 697 A 0 698 A 0 699 U 692 700 G 691 701 C 690 702 G 0 703 U 0 704 A 0 705 G 0 706 A 0 707 G 0 708 A 686 709 U 685 710 G 684 711 U 683 712 G 682 713 N 681 714 A 680 715 G 679 716 G 0 717 A 0 718 A 676 719 U 675 720 A 0 721 C 0 722 C 0 723 G 0 724 A 735 725 A 0 726 G 0 727 G 734 728 C 733 729 G 0 730 A 0 731 A 0 732 G 0 733 G 728 734 C 727 735 A 724 736 G 674 737 C 673 738 C 672 739 C 671 740 C 670 741 U 669 742 U 668 743 G 0 744 G 665 745 G 664 746 A 663 747 A 662 748 U 0 749 G 661 750 U 660 751 A 659 752 C 658 753 U 657 754 G 0 755 A 0 756 C 0 757 G 588 758 C 587 759 U 586 760 C 584 761 A 0 762 U 0 763 G 582 764 U 581 765 G 580 766 C 579 767 N 0 768 A 0 769 A 0 770 A 0 771 G 812 772 C 811 773 G 810 774 U 809 775 G 808 776 G 807 777 G 0 778 G 0 779 A 0 780 G 806 781 C 805 782 A 0 783 A 0 784 A 0 785 C 801 786 A 800 787 G 799 788 G 798 789 A 0 790 U 0 791 U 0 792 A 0 793 G 0 794 A 0 795 U 0 796 A 0 797 C 0 798 C 788 799 C 787 800 U 786 801 G 785 802 G 0 803 U 0 804 A 0 805 G 781 806 U 780 807 C 776 808 C 775 809 A 774 810 C 773 811 G 772 812 C 771 813 U 0 814 G 0 815 U 0 816 A 0 817 A 0 818 A 0 819 C 0 820 G 0 821 C 0 822 U 0 823 G 879 824 U 878 825 C 877 826 G 876 827 A 875 828 U 874 829 U 0 830 U 0 831 G 857 832 G 856 833 G 855 834 G 854 835 A 853 836 U 852 837 U 851 838 G 850 839 G 849 840 G 848 841 C 847 842 U 0 843 A 0 844 U 0 845 A 0 846 U 0 847 G 841 848 C 840 849 U 839 850 U 838 851 G 837 852 G 836 853 U 835 854 G 834 855 C 833 856 C 832 857 C 831 858 G 0 859 A 0 860 A 0 861 G 868 862 C 867 863 U 0 864 A 0 865 A 573 866 C 572 867 G 862 868 U 861 869 G 0 870 A 0 871 U 0 872 A 0 873 A 0 874 A 828 875 U 827 876 C 826 877 G 825 878 A 824 879 C 823 880 C 577 881 G 571 882 C 570 883 C 569 884 U 0 885 G 912 886 G 911 887 G 910 888 G 0 889 A 0 890 G 0 891 U 0 892 A 0 893 C 0 894 G 905 895 G 904 896 C 903 897 C 902 898 G 0 899 C 0 900 A 0 901 A 0 902 G 897 903 G 896 904 U 895 905 U 894 906 A 0 907 A 0 908 A 0 909 A 0 910 C 887 911 U 886 912 C 885 913 A 0 914 A 0 915 A 0 916 U 19 917 G 18 918 A 17 919 A 0 920 U 0 921 U 1396 922 G 1395 923 N 1393 924 C 1392 925 G 1391 926 G 0 927 G 1390 928 G 1389 929 G 1388 930 C 1387 931 C 1386 932 N 1385 933 G 1384 934 C 0 935 A 1380 936 C 1379 937 A 0 938 A 0 939 G 1344 940 C 1343 941 G 1342 942 G 1341 943 U 1340 944 G 1237 945 G 1236 946 A 1235 947 G 1234 948 C 1233 949 A 1232 950 U 1231 951 G 1230 952 U 1229 953 G 1228 954 G 1226 955 U 1225 956 U 0 957 U 0 958 A 0 959 A 0 960 U 975 961 U 974 962 C 973 963 G 972 964 A 0 965 U 0 966 G 0 967 C 0 968 A 0 969 A 0 970 C 0 971 G 0 972 C 963 973 G 962 974 A 961 975 A 960 976 G 0 977 A 0 978 A 0 979 C 0 980 C 0 981 U 0 982 U 0 983 A 0 984 C 1221 985 C 1220 986 U 1219 987 A 1218 988 C 1217 989 U 1216 990 C 1215 991 U 0 992 U 0 993 G 0 994 A 0 995 C 0 996 A 1045 997 U 1044 998 C 1043 999 C 1041 1000 U 1040 1001 A 1039 1002 A 1038 1003 G 1037 1004 A 0 1005 A 0 1006 G 1023 1007 A 1022 1008 G 1021 1009 C 1020 1010 U 1019 1011 C 1018 1012 A 1017 1013 G 0 1014 A 0 1015 G 0 1016 A 0 1017 U 1012 1018 G 1011 1019 A 1010 1020 G 1009 1021 C 1008 1022 U 1007 1023 U 1006 1024 G 0 1025 U 1036 1026 G 1035 1027 C 1034 1028 C 1033 1029 U 0 1030 U 0 1031 C 0 1032 G 0 1033 G 1028 1034 G 1027 1035 A 1026 1036 A 1025 1037 C 1003 1038 U 1002 1039 U 1001 1040 A 1000 1041 G 999 1042 A 0 1043 G 998 1044 A 997 1045 C 996 1046 A 0 1047 G 1210 1048 G 1209 1049 U 0 1050 G 1208 1051 C 1207 1052 U 1206 1053 G 1205 1054 C 0 1055 A 0 1056 U 1204 1057 G 1203 1058 G 1199 1059 C 1198 1060 U 1197 1061 G 1195 1062 U 1194 1063 C 1193 1064 G 1192 1065 U 0 1066 C 0 1067 A 0 1068 G 1107 1069 C 1106 1070 U 1105 1071 C 1104 1072 G 1103 1073 U 1102 1074 G 1083 1075 U 1082 1076 U 1081 1077 G 0 1078 U 0 1079 G 0 1080 A 0 1081 A 1076 1082 A 1075 1083 U 1074 1084 G 0 1085 U 0 1086 U 1099 1087 G 1098 1088 G 1097 1089 G 1096 1090 U 0 1091 U 0 1092 A 0 1093 A 0 1094 G 0 1095 U 0 1096 C 1089 1097 C 1088 1098 C 1087 1099 G 1086 1100 C 0 1101 A 0 1102 A 1073 1103 C 1072 1104 G 1071 1105 A 1070 1106 G 1069 1107 C 1068 1108 G 0 1109 C 0 1110 A 0 1111 A 0 1112 C 0 1113 C 1187 1114 C 1186 1115 U 1185 1116 U 1184 1117 A 0 1118 U 1155 1119 C 1154 1120 C 1153 1121 U 1152 1122 U 1151 1123 U 1150 1124 G 1149 1125 U 0 1126 U 0 1127 G 0 1128 C 1144 1129 C 1143 1130 A 0 1131 G 0 1132 C 1142 1133 G 1141 1134 A 1140 1135 U 0 1136 U 0 1137 C 0 1138 G 0 1139 G 0 1140 U 1134 1141 C 1133 1142 G 1132 1143 G 1129 1144 G 1128 1145 A 0 1146 A 0 1147 C 0 1148 U 0 1149 C 1124 1150 A 1123 1151 A 1122 1152 A 1121 1153 G 1120 1154 G 1119 1155 A 1118 1156 G 0 1157 A 0 1158 C 1178 1159 U 1177 1160 G 1176 1161 C 1175 1162 C 1174 1163 A 1173 1164 G 1172 1165 U 1171 1166 G 0 1167 A 0 1168 C 0 1169 A 0 1170 A 0 1171 A 1165 1172 C 1164 1173 U 1163 1174 G 1162 1175 G 1161 1176 A 1160 1177 G 1159 1178 G 1158 1179 A 0 1180 A 0 1181 G 0 1182 G 0 1183 N 0 1184 G 1116 1185 G 1115 1186 G 1114 1187 G 1113 1188 A 0 1189 U 0 1190 G 0 1191 A 0 1192 C 1064 1193 G 1063 1194 U 1062 1195 C 1061 1196 A 0 1197 A 1060 1198 G 1059 1199 U 1058 1200 C 0 1201 A 0 1202 U 0 1203 C 1057 1204 A 1056 1205 U 1053 1206 G 1052 1207 G 1051 1208 C 1050 1209 C 1048 1210 C 1047 1211 U 0 1212 U 0 1213 A 0 1214 C 0 1215 G 990 1216 A 989 1217 G 988 1218 U 987 1219 A 986 1220 G 985 1221 G 984 1222 G 0 1223 C 0 1224 U 0 1225 A 955 1226 C 954 1227 A 0 1228 C 953 1229 A 952 1230 C 951 1231 G 950 1232 U 949 1233 G 948 1234 C 947 1235 U 946 1236 A 945 1237 C 944 1238 A 0 1239 A 0 1240 U 0 1241 G 1296 1242 G 1295 1243 U 1294 1244 G 1293 1245 C 1292 1246 A 1291 1247 U 1290 1248 A 0 1249 C 0 1250 A 0 1251 G 0 1252 A 0 1253 G 1284 1254 G 1283 1255 G 1282 1256 C 0 1257 A 0 1258 G 1277 1259 C 1276 1260 G 0 1261 A 0 1262 G 0 1263 A 1272 1264 G 1271 1265 U 1270 1266 G 0 1267 C 0 1268 G 0 1269 A 0 1270 G 1265 1271 C 1264 1272 U 1263 1273 U 0 1274 G 0 1275 A 0 1276 G 1259 1277 C 1258 1278 G 0 1279 A 0 1280 A 0 1281 U 0 1282 C 1255 1283 U 1254 1284 C 1253 1285 A 0 1286 G 0 1287 A 0 1288 A 0 1289 A 0 1290 G 1247 1291 U 1246 1292 G 1245 1293 C 1244 1294 A 1243 1295 U 1242 1296 C 1241 1297 U 0 1298 A 0 1299 A 0 1300 G 0 1301 U 0 1302 C 0 1303 C 1334 1304 G 0 1305 G 0 1306 A 0 1307 U 1330 1308 U 1329 1309 G 1328 1310 G 1327 1311 A 1326 1312 G 1325 1313 U 1324 1314 C 1323 1315 U 0 1316 G 0 1317 C 0 1318 A 0 1319 A 0 1320 C 0 1321 U 0 1322 C 0 1323 G 1314 1324 A 1313 1325 C 1312 1326 U 1311 1327 C 1310 1328 C 1309 1329 A 1308 1330 U 1307 1331 G 0 1332 A 0 1333 A 0 1334 G 1303 1335 U 0 1336 C 0 1337 G 0 1338 G 0 1339 A 0 1340 A 943 1341 U 942 1342 C 941 1343 G 940 1344 C 939 1345 U 0 1346 A 0 1347 G 0 1348 U 0 1349 A 0 1350 A 1372 1351 U 1371 1352 C 1370 1353 G 1369 1354 C 1368 1355 A 1367 1356 A 1366 1357 A 1365 1358 U 0 1359 C 0 1360 A 0 1361 G 0 1362 A 0 1363 A 0 1364 U 0 1365 G 1357 1366 U 1356 1367 U 1355 1368 G 1354 1369 C 1353 1370 G 1352 1371 G 1351 1372 U 1350 1373 G 0 1374 A 0 1375 A 0 1376 U 0 1377 A 0 1378 C 0 1379 G 936 1380 U 935 1381 U 0 1382 C 0 1383 C 0 1384 C 933 1385 G 932 1386 G 931 1387 G 930 1388 C 929 1389 C 928 1390 U 927 1391 U 925 1392 G 924 1393 U 923 1394 A 0 1395 C 922 1396 A 921 1397 C 0 1398 A 0 1399 C 1504 1400 C 0 1401 G 1501 1402 C 1500 1403 C 0 1404 C 0 1405 G 1496 1406 U 0 1407 C 1494 1408 A 0 1409 C 1491 1410 A 1490 1411 C 1489 1412 C 1488 1413 A 1487 1414 U 1486 1415 G 1485 1416 G 1484 1417 G 0 1418 A 0 1419 G 1481 1420 U 1480 1421 G 1479 1422 G 1478 1423 G 1477 1424 U 1476 1425 U 1475 1426 G 1474 1427 U 1473 1428 A 1472 1429 C 1471 1430 C 1470 1431 A 0 1432 G 0 1433 A 0 1434 A 0 1435 G 1466 1436 U 1465 1437 A 1464 1438 G 1463 1439 A 1462 1440 U 1461 1441 A 0 1442 G 1460 1443 C 1459 1444 U 1458 1445 U 1457 1446 A 0 1447 A 0 1448 C 1455 1449 C 1454 1450 U 0 1451 U 0 1452 C 0 1453 G 0 1454 G 1449 1455 G 1448 1456 G 0 1457 G 1445 1458 G 1444 1459 G 1443 1460 C 1442 1461 G 1440 1462 U 1439 1463 U 1438 1464 U 1437 1465 A 1436 1466 C 1435 1467 C 0 1468 A 0 1469 C 0 1470 G 1430 1471 G 1429 1472 U 1428 1473 A 1427 1474 U 1426 1475 G 1425 1476 A 1424 1477 U 1423 1478 U 1422 1479 C 1421 1480 A 1420 1481 U 1419 1482 G 0 1483 A 0 1484 C 1416 1485 N 1415 1486 N 1414 1487 G 1413 1488 G 1412 1489 G 1411 1490 N 1410 1491 N 1409 1492 N 0 1493 N 0 1494 N 1407 1495 N 0 1496 N 1405 1497 G 0 1498 U 0 1499 A 0 1500 A 1402 1501 C 1401 1502 A 0 1503 A 0 1504 G 1399 1505 N 0 1506 N 1529 1507 N 1528 1508 N 1527 1509 N 1526 1510 N 1525 1511 N 1524 1512 N 1523 1513 N 1522 1514 N 1521 1515 N 1520 1516 N 0 1517 N 0 1518 N 0 1519 N 0 1520 N 1515 1521 N 1514 1522 N 1513 1523 N 1512 1524 N 1511 1525 N 1510 1526 N 1509 1527 N 1508 1528 N 1507 1529 N 1506 1530 G 0 1531 A 0 1532 U 0 1533 C 0 1534 A 0 1535 C 0 1536 C 0 1537 U 0 1538 C 0 1539 C 0 1540 U 0 1541 U 0 1542 A 0