Filename: d.16.b.P.pacificensis.bpseq Organism: Psychrobacter pacificensis Accession Number: AB016054 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 A 0 2 G 18 3 A 17 4 G 16 5 U 15 6 U 14 7 U 0 8 G 0 9 A 0 10 U 907 11 C 906 12 A 905 13 U 0 14 G 6 15 G 5 16 C 4 17 U 3 18 C 2 19 A 0 20 G 545 21 A 544 22 U 543 23 U 542 24 G 0 25 A 541 26 U 540 27 C 539 28 G 538 29 C 537 30 U 536 31 G 0 32 G 392 33 C 391 34 G 390 35 G 389 36 C 388 37 A 387 38 G 385 39 G 384 40 C 351 41 U 0 42 U 0 43 A 0 44 A 0 45 C 349 46 A 348 47 C 347 48 A 0 49 U 346 50 G 345 51 C 344 52 A 0 53 A 0 54 G 96 55 U 95 56 C 94 57 G 0 58 A 0 59 G 93 60 C 92 61 G 91 62 G 89 63 A 88 64 A 0 65 C 87 66 G 86 67 A 0 68 U 0 69 G 0 70 A 81 71 U 80 72 A 79 73 G 78 74 C 0 75 U 0 76 U 0 77 G 0 78 C 73 79 U 72 80 A 71 81 U 70 82 C 0 83 A 0 84 G 0 85 G 0 86 C 66 87 G 65 88 U 63 89 C 62 90 G 0 91 A 61 92 G 60 93 C 59 94 G 56 95 G 55 96 C 54 97 G 0 98 G 0 99 A 0 100 C 0 101 G 0 102 G 0 103 G 304 104 U 303 105 G 302 106 A 0 107 G 0 108 U 0 109 A 0 110 A 0 111 U 0 112 A 229 113 C 228 114 U 227 115 U 226 116 A 225 117 G 224 118 G 223 119 A 222 120 A 0 121 U 221 122 C 220 123 U 0 124 A 0 125 C 0 126 C 217 127 U 216 128 A 215 129 G 214 130 U 213 131 A 212 132 G 211 133 U 0 134 G 168 135 G 167 136 G 166 137 G 165 138 G 0 139 A 0 140 U 0 141 A 0 142 G 159 143 C 158 144 U 157 145 C 156 146 G 155 147 G 154 148 G 153 149 G 0 150 A 0 151 A 0 152 A 0 153 C 148 154 U 147 155 C 146 156 G 145 157 A 144 158 A 143 159 U 142 160 U 0 161 A 0 162 A 0 163 U 0 164 A 0 165 C 137 166 C 136 167 G 135 168 C 134 169 A 0 170 U 0 171 A 0 172 C 0 173 G 0 174 U 183 175 C 182 176 C 181 177 U 0 178 A 0 179 C 0 180 G 0 181 G 176 182 G 175 183 A 174 184 G 0 185 A 0 186 A 0 187 A 0 188 G 209 189 C 208 190 A 207 191 G 206 192 G 205 193 G 204 194 G 0 195 A 0 196 U 203 197 C 202 198 A 0 199 U 0 200 U 0 201 A 0 202 G 197 203 A 196 204 C 193 205 C 192 206 U 191 207 U 190 208 G 189 209 C 188 210 G 0 211 C 132 212 U 131 213 A 130 214 U 129 215 U 128 216 A 127 217 G 126 218 A 0 219 U 0 220 G 122 221 A 121 222 G 119 223 C 118 224 C 117 225 U 116 226 A 115 227 A 114 228 G 113 229 U 112 230 C 276 231 G 275 232 G 274 233 A 0 234 U 0 235 U 273 236 A 0 237 G 267 238 C 266 239 U 265 240 A 0 241 G 0 242 A 264 243 U 263 244 G 262 245 G 261 246 U 260 247 G 259 248 G 258 249 G 257 250 G 0 251 U 0 252 A 0 253 A 0 254 A 0 255 G 0 256 G 0 257 C 249 258 C 248 259 U 247 260 A 246 261 C 245 262 C 244 263 A 243 264 U 242 265 G 239 266 G 238 267 C 237 268 G 0 269 A 0 270 C 0 271 G 0 272 A 0 273 U 235 274 C 232 275 A 231 276 G 230 277 U 0 278 A 0 279 G 301 280 C 300 281 U 299 282 G 298 283 G 294 284 U 293 285 C 292 286 U 291 287 G 0 288 A 0 289 G 0 290 A 0 291 G 286 292 G 285 293 A 284 294 U 283 295 G 0 296 A 0 297 U 0 298 C 282 299 A 281 300 G 280 301 C 279 302 C 105 303 A 104 304 C 103 305 A 0 306 C 327 307 C 326 308 G 325 309 G 324 310 G 323 311 A 322 312 C 0 313 U 0 314 G 0 315 A 0 316 G 0 317 A 0 318 C 0 319 A 0 320 C 0 321 G 0 322 G 311 323 C 310 324 C 309 325 C 308 326 G 307 327 G 306 328 A 0 329 C 340 330 U 339 331 C 338 332 C 337 333 U 0 334 A 0 335 C 0 336 G 0 337 G 332 338 G 331 339 A 330 340 G 329 341 G 0 342 C 0 343 A 0 344 G 51 345 C 50 346 A 49 347 G 47 348 U 46 349 G 45 350 G 0 351 G 40 352 G 0 353 A 0 354 A 0 355 U 0 356 A 0 357 U 382 358 U 0 359 G 381 360 G 380 361 A 379 362 C 0 363 A 0 364 A 0 365 U 377 366 G 376 367 G 375 368 G 374 369 G 0 370 G 0 371 G 0 372 A 0 373 A 0 374 C 368 375 C 367 376 U 366 377 G 365 378 A 0 379 U 361 380 C 360 381 C 359 382 A 357 383 G 0 384 C 39 385 C 38 386 A 0 387 U 37 388 G 36 389 C 35 390 C 34 391 G 33 392 C 32 393 G 0 394 U 0 395 G 425 396 U 424 397 G 423 398 U 422 399 G 0 400 A 0 401 A 0 402 G 0 403 A 0 404 A 0 405 G 416 406 G 415 407 C 414 408 C 413 409 U 0 410 U 0 411 U 0 412 U 0 413 G 408 414 G 407 415 U 406 416 U 405 417 G 0 418 U 0 419 A 0 420 A 0 421 A 0 422 G 398 423 C 397 424 A 396 425 C 395 426 U 0 427 U 485 428 U 0 429 A 486 430 A 482 431 G 481 432 C 480 433 A 479 434 G 478 435 U 477 436 G 0 437 A 0 438 A 0 439 G 472 440 A 0 441 A 0 442 G 469 443 A 468 444 C 467 445 U 465 446 C 464 447 U 463 448 U 462 449 C 461 450 G 460 451 G 459 452 U 0 453 U 0 454 A 0 455 A 0 456 U 0 457 A 0 458 C 0 459 C 451 460 C 450 461 G 449 462 G 448 463 G 447 464 G 446 465 A 445 466 C 0 467 G 444 468 A 443 469 U 442 470 G 0 471 A 0 472 C 439 473 A 0 474 U 0 475 U 0 476 A 0 477 G 435 478 C 434 479 U 433 480 G 432 481 C 431 482 A 430 483 G 0 484 A 0 485 A 427 486 U 429 487 A 0 488 A 0 489 G 534 490 C 533 491 A 532 492 C 531 493 C 530 494 G 515 495 G 514 496 C 513 497 U 0 498 A 0 499 A 0 500 C 529 501 U 528 502 C 527 503 U 526 504 G 525 505 U 0 506 G 0 507 C 0 508 C 0 509 A 0 510 G 517 511 C 516 512 A 0 513 G 496 514 C 495 515 C 494 516 G 511 517 C 510 518 G 0 519 G 0 520 U 0 521 A 0 522 A 0 523 U 0 524 A 0 525 C 504 526 A 503 527 G 502 528 A 501 529 G 500 530 G 493 531 G 492 532 U 491 533 G 490 534 C 489 535 A 0 536 A 30 537 G 29 538 C 28 539 G 27 540 U 26 541 U 25 542 A 23 543 A 22 544 U 21 545 C 20 546 G 0 547 G 0 548 A 0 549 A 0 550 U 0 551 U 0 552 A 0 553 C 0 554 U 0 555 G 0 556 G 872 557 G 871 558 C 870 559 G 855 560 U 854 561 A 0 562 A 0 563 A 0 564 G 869 565 C 0 566 G 753 567 A 752 568 G 751 569 C 750 570 G 0 571 U 747 572 A 0 573 G 746 574 G 745 575 U 744 576 G 0 577 G 640 578 C 639 579 U 638 580 U 637 581 G 636 582 A 635 583 U 634 584 A 0 585 A 633 586 G 632 587 U 629 588 C 628 589 A 627 590 G 626 591 A 625 592 U 624 593 G 623 594 U 622 595 G 621 596 A 0 597 A 0 598 A 0 599 U 0 600 C 618 601 C 617 602 C 616 603 C 615 604 G 614 605 G 613 606 G 612 607 C 0 608 U 0 609 U 0 610 A 0 611 A 0 612 C 606 613 C 605 614 U 604 615 G 603 616 G 602 617 G 601 618 A 600 619 A 0 620 C 0 621 U 595 622 G 594 623 C 593 624 A 592 625 U 591 626 C 590 627 U 589 628 G 588 629 A 587 630 A 0 631 A 0 632 C 586 633 U 585 634 G 583 635 U 582 636 U 581 637 A 580 638 G 579 639 G 578 640 C 577 641 U 0 642 A 0 643 G 0 644 A 740 645 G 739 646 U 738 647 A 737 648 G 735 649 G 734 650 U 733 651 G 732 652 A 731 653 G 0 654 A 0 655 G 729 656 G 728 657 G 727 658 A 726 659 A 725 660 G 724 661 U 723 662 A 706 663 G 705 664 A 0 665 A 0 666 U 702 667 U 701 668 U 700 669 C 699 670 A 698 671 G 697 672 G 696 673 U 695 674 G 0 675 U 0 676 A 0 677 G 688 678 C 687 679 G 686 680 G 0 681 U 0 682 G 0 683 A 0 684 A 0 685 A 0 686 U 679 687 G 678 688 C 677 689 G 0 690 U 0 691 A 0 692 G 0 693 A 0 694 G 0 695 A 673 696 U 672 697 C 671 698 U 670 699 G 669 700 A 668 701 A 667 702 G 666 703 G 0 704 A 0 705 A 663 706 U 662 707 A 0 708 C 0 709 C 0 710 G 0 711 A 722 712 U 0 713 G 0 714 G 721 715 C 720 716 G 0 717 A 0 718 A 0 719 G 0 720 G 715 721 C 714 722 A 711 723 G 661 724 C 660 725 U 659 726 U 658 727 C 657 728 C 656 729 U 655 730 G 0 731 G 652 732 C 651 733 A 650 734 U 649 735 C 648 736 A 0 737 U 647 738 A 646 739 C 645 740 U 644 741 G 0 742 A 0 743 C 0 744 A 575 745 C 574 746 U 573 747 G 571 748 A 0 749 G 0 750 G 569 751 C 568 752 U 567 753 C 566 754 G 0 755 A 0 756 A 0 757 A 0 758 G 799 759 C 798 760 G 797 761 U 796 762 G 795 763 G 794 764 G 0 765 U 0 766 A 0 767 G 793 768 C 792 769 A 0 770 A 0 771 A 0 772 C 788 773 A 787 774 G 786 775 G 785 776 A 0 777 U 0 778 U 0 779 A 0 780 G 0 781 A 0 782 U 0 783 A 0 784 C 0 785 C 775 786 C 774 787 U 773 788 G 772 789 G 0 790 U 0 791 A 0 792 G 768 793 U 767 794 C 763 795 C 762 796 A 761 797 C 760 798 G 759 799 C 758 800 C 0 801 G 0 802 U 0 803 A 0 804 A 0 805 A 0 806 C 0 807 G 0 808 A 0 809 U 0 810 G 868 811 U 867 812 C 866 813 U 865 814 A 864 815 C 863 816 U 0 817 A 0 818 G 846 819 U 845 820 C 844 821 G 843 822 U 842 823 U 841 824 G 840 825 G 839 826 G 838 827 U 837 828 C 836 829 C 835 830 C 0 831 U 0 832 U 0 833 G 0 834 A 0 835 G 829 836 G 828 837 A 827 838 C 826 839 U 825 840 U 824 841 A 823 842 G 822 843 U 821 844 G 820 845 A 819 846 U 818 847 G 0 848 C 0 849 A 0 850 G 857 851 C 856 852 U 0 853 A 0 854 A 560 855 C 559 856 G 851 857 C 850 858 A 0 859 A 0 860 U 0 861 A 0 862 A 0 863 G 815 864 U 814 865 A 813 866 G 812 867 A 811 868 C 810 869 C 564 870 G 558 871 C 557 872 C 556 873 U 0 874 G 901 875 G 900 876 G 899 877 G 0 878 A 0 879 G 0 880 U 0 881 A 0 882 C 0 883 G 894 884 G 893 885 C 892 886 C 891 887 G 0 888 C 0 889 A 0 890 A 0 891 G 886 892 G 885 893 U 884 894 U 883 895 A 0 896 A 0 897 A 0 898 A 0 899 C 876 900 U 875 901 C 874 902 A 0 903 A 0 904 A 0 905 U 12 906 G 11 907 A 10 908 A 0 909 U 0 910 U 1386 911 G 1385 912 A 1383 913 C 1382 914 G 1381 915 G 0 916 G 1380 917 G 1379 918 G 1378 919 C 1377 920 C 1376 921 C 1375 922 G 1374 923 C 0 924 A 1370 925 C 1369 926 A 0 927 A 0 928 G 1334 929 C 1333 930 G 1332 931 G 1331 932 U 1330 933 G 1227 934 G 1226 935 A 1225 936 G 1224 937 C 1223 938 A 1222 939 U 1221 940 G 1220 941 U 1219 942 G 1218 943 G 1216 944 U 1215 945 U 0 946 U 0 947 A 0 948 A 0 949 U 964 950 U 963 951 C 962 952 G 961 953 A 0 954 U 0 955 G 0 956 C 0 957 A 0 958 A 0 959 C 0 960 G 0 961 C 952 962 G 951 963 A 950 964 A 949 965 G 0 966 A 0 967 A 0 968 C 0 969 C 0 970 U 0 971 U 0 972 A 0 973 C 1211 974 C 1210 975 C 1209 976 G 1208 977 G 1207 978 U 1206 979 C 1205 980 U 0 981 U 0 982 G 0 983 A 0 984 C 0 985 A 1034 986 U 1033 987 A 1032 988 C 1030 989 A 1029 990 C 1028 991 A 1027 992 G 1026 993 A 0 994 A 0 995 U 1012 996 C 1011 997 U 1010 998 U 1009 999 G 1008 1000 U 1007 1001 A 1006 1002 G 0 1003 A 0 1004 G 0 1005 A 0 1006 U 1001 1007 A 1000 1008 C 999 1009 G 998 1010 A 997 1011 G 996 1012 A 995 1013 G 0 1014 U 1025 1015 G 1024 1016 C 1023 1017 C 1022 1018 U 0 1019 U 0 1020 C 0 1021 G 0 1022 G 1017 1023 G 1016 1024 A 1015 1025 A 1014 1026 U 992 1027 U 991 1028 G 990 1029 U 989 1030 G 988 1031 A 0 1032 U 987 1033 A 986 1034 C 985 1035 A 0 1036 G 1200 1037 G 1199 1038 U 0 1039 G 1198 1040 C 1197 1041 U 1196 1042 G 1195 1043 C 0 1044 A 0 1045 U 1194 1046 G 1193 1047 G 1189 1048 C 1188 1049 U 1187 1050 G 1185 1051 U 1184 1052 C 1183 1053 G 1182 1054 U 0 1055 C 0 1056 A 0 1057 G 1096 1058 C 1095 1059 U 1094 1060 C 1093 1061 G 1092 1062 U 1091 1063 G 1072 1064 U 1071 1065 C 1070 1066 G 0 1067 U 0 1068 G 0 1069 A 0 1070 G 1065 1071 A 1064 1072 U 1063 1073 G 0 1074 U 0 1075 U 1088 1076 G 1087 1077 G 1086 1078 G 1085 1079 U 0 1080 U 0 1081 A 0 1082 A 0 1083 G 0 1084 U 0 1085 C 1078 1086 C 1077 1087 C 1076 1088 G 1075 1089 C 0 1090 A 0 1091 A 1062 1092 C 1061 1093 G 1060 1094 A 1059 1095 G 1058 1096 C 1057 1097 G 0 1098 C 0 1099 A 0 1100 A 0 1101 C 0 1102 C 1177 1103 C 1176 1104 U 1175 1105 U 1174 1106 G 0 1107 U 1145 1108 C 1144 1109 C 1143 1110 U 1142 1111 U 1141 1112 A 1140 1113 G 1139 1114 U 0 1115 U 0 1116 A 0 1117 C 1134 1118 C 1133 1119 A 0 1120 G 0 1121 C 1132 1122 G 1131 1123 G 1130 1124 G 0 1125 U 0 1126 U 0 1127 A 0 1128 A 0 1129 G 0 1130 C 1123 1131 C 1122 1132 G 1121 1133 G 1118 1134 G 1117 1135 A 0 1136 A 0 1137 C 0 1138 U 0 1139 C 1113 1140 U 1112 1141 A 1111 1142 A 1110 1143 G 1109 1144 G 1108 1145 A 1107 1146 U 0 1147 A 0 1148 C 1168 1149 U 1167 1150 G 1166 1151 C 1165 1152 C 1164 1153 A 1163 1154 G 1162 1155 U 1161 1156 G 0 1157 A 0 1158 C 0 1159 A 0 1160 A 0 1161 A 1155 1162 C 1154 1163 U 1153 1164 G 1152 1165 G 1151 1166 A 1150 1167 G 1149 1168 G 1148 1169 A 0 1170 A 0 1171 G 0 1172 G 0 1173 C 0 1174 G 1105 1175 G 1104 1176 G 1103 1177 G 1102 1178 A 0 1179 C 0 1180 C 0 1181 A 0 1182 C 1053 1183 G 1052 1184 U 1051 1185 C 1050 1186 A 0 1187 A 1049 1188 G 1048 1189 U 1047 1190 C 0 1191 A 0 1192 U 0 1193 C 1046 1194 A 1045 1195 U 1042 1196 G 1041 1197 G 1040 1198 C 1039 1199 C 1037 1200 C 1036 1201 U 0 1202 U 0 1203 A 0 1204 C 0 1205 G 979 1206 A 978 1207 C 977 1208 C 976 1209 A 975 1210 G 974 1211 G 973 1212 G 0 1213 C 0 1214 U 0 1215 A 944 1216 C 943 1217 A 0 1218 C 942 1219 A 941 1220 C 940 1221 G 939 1222 U 938 1223 G 937 1224 C 936 1225 U 935 1226 A 934 1227 C 933 1228 A 0 1229 A 0 1230 U 0 1231 G 1286 1232 G 1285 1233 U 1284 1234 A 1283 1235 G 1282 1236 G 1281 1237 U 1280 1238 A 0 1239 C 0 1240 A 0 1241 G 0 1242 A 0 1243 G 1274 1244 G 1273 1245 G 1272 1246 C 0 1247 A 0 1248 G 1267 1249 C 1266 1250 U 0 1251 A 0 1252 C 0 1253 A 1262 1254 C 1261 1255 A 1260 1256 G 0 1257 C 0 1258 G 0 1259 A 0 1260 U 1255 1261 G 1254 1262 U 1253 1263 G 0 1264 A 0 1265 U 0 1266 G 1249 1267 C 1248 1268 G 0 1269 A 0 1270 A 0 1271 U 0 1272 C 1245 1273 U 1244 1274 C 1243 1275 A 0 1276 A 0 1277 A 0 1278 A 0 1279 A 0 1280 G 1237 1281 C 1236 1282 C 1235 1283 U 1234 1284 A 1233 1285 U 1232 1286 C 1231 1287 G 0 1288 U 0 1289 A 0 1290 G 0 1291 U 0 1292 C 0 1293 C 1324 1294 A 0 1295 G 0 1296 A 0 1297 U 1320 1298 U 1319 1299 G 1318 1300 G 1317 1301 A 1316 1302 G 1315 1303 U 1314 1304 C 1313 1305 U 0 1306 G 0 1307 C 0 1308 A 0 1309 A 0 1310 C 0 1311 U 0 1312 C 0 1313 G 1304 1314 A 1303 1315 C 1302 1316 U 1301 1317 C 1300 1318 C 1299 1319 A 1298 1320 U 1297 1321 G 0 1322 A 0 1323 A 0 1324 G 1293 1325 U 0 1326 A 0 1327 G 0 1328 G 0 1329 A 0 1330 A 932 1331 U 931 1332 C 930 1333 G 929 1334 C 928 1335 U 0 1336 A 0 1337 G 0 1338 U 0 1339 A 0 1340 A 1362 1341 U 1361 1342 C 1360 1343 G 1359 1344 C 1358 1345 G 1357 1346 G 1356 1347 A 1355 1348 U 0 1349 C 0 1350 A 0 1351 G 0 1352 A 0 1353 A 0 1354 U 0 1355 G 1347 1356 C 1346 1357 C 1345 1358 G 1344 1359 C 1343 1360 G 1342 1361 G 1341 1362 U 1340 1363 G 0 1364 A 0 1365 A 0 1366 U 0 1367 A 0 1368 C 0 1369 G 925 1370 U 924 1371 U 0 1372 C 0 1373 C 0 1374 C 922 1375 G 921 1376 G 920 1377 G 919 1378 C 918 1379 C 917 1380 U 916 1381 U 914 1382 G 913 1383 U 912 1384 A 0 1385 C 911 1386 A 910 1387 C 0 1388 A 0 1389 C 1493 1390 C 0 1391 G 1490 1392 C 1489 1393 C 0 1394 C 1486 1395 G 1485 1396 U 0 1397 C 0 1398 A 0 1399 C 1480 1400 A 1479 1401 C 1478 1402 C 1477 1403 A 1476 1404 U 1475 1405 G 1474 1406 G 1473 1407 G 0 1408 A 0 1409 G 1470 1410 U 1469 1411 U 1468 1412 G 1467 1413 A 1466 1414 U 1465 1415 U 1464 1416 G 1463 1417 C 1462 1418 A 1461 1419 C 1460 1420 C 1459 1421 A 0 1422 G 0 1423 A 0 1424 A 0 1425 G 1455 1426 U 1454 1427 G 1453 1428 G 1452 1429 U 1451 1430 U 1450 1431 A 0 1432 G 1449 1433 C 1448 1434 C 1447 1435 U 1446 1436 A 0 1437 A 0 1438 C 1444 1439 U 0 1440 U 0 1441 A 0 1442 G 0 1443 U 0 1444 G 1438 1445 A 0 1446 G 1435 1447 G 1434 1448 G 1433 1449 C 1432 1450 G 1430 1451 A 1429 1452 U 1428 1453 C 1427 1454 A 1426 1455 C 1425 1456 C 0 1457 A 0 1458 C 0 1459 G 1420 1460 G 1419 1461 U 1418 1462 G 1417 1463 U 1416 1464 G 1415 1465 G 1414 1466 U 1413 1467 C 1412 1468 G 1411 1469 A 1410 1470 U 1409 1471 G 0 1472 A 0 1473 C 1406 1474 U 1405 1475 G 1404 1476 G 1403 1477 G 1402 1478 G 1401 1479 U 1400 1480 G 1399 1481 A 0 1482 A 0 1483 G 0 1484 U 0 1485 C 1395 1486 G 1394 1487 U 0 1488 A 0 1489 A 1392 1490 C 1391 1491 A 0 1492 A 0 1493 G 1389 1494 G 0 1495 U 1520 1496 A 1519 1497 G 1518 1498 C 1517 1499 C 1516 1500 C 0 1501 G 1515 1502 U 1514 1503 A 1513 1504 G 1512 1505 G 1511 1506 G 0 1507 G 0 1508 A 0 1509 A 0 1510 A 0 1511 C 1505 1512 C 1504 1513 U 1503 1514 G 1502 1515 C 1501 1516 G 1499 1517 G 1498 1518 C 1497 1519 G 1496 1520 G 1495 1521 U 0 1522 U 0 1523 G 0 1524 G 0 1525 A 0 1526 U 0 1527 C 0 1528 A 0 1529 C 0 1530 C 0 1531 U 0 1532 C 0 1533 C 0 1534 U 0 1535 U 0 1536 A 0