Filename: d.16.b.P.shigelloides.bpseq
Organism: Plesiomonas shigelloides
Accession Number: X74688
Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu
1 N 0
2 N 0
3 A 0
4 U 0
5 U 0
6 G 0
7 A 0
8 A 0
9 G 25
10 A 24
11 G 23
12 U 22
13 U 21
14 U 0
15 G 0
16 A 0
17 U 918
18 C 917
19 A 916
20 U 0
21 G 13
22 G 12
23 C 11
24 U 10
25 C 9
26 A 0
27 G 556
28 A 555
29 U 554
30 U 553
31 G 0
32 A 552
33 A 551
34 C 550
35 G 549
36 C 548
37 U 547
38 G 0
39 G 403
40 C 402
41 G 401
42 G 400
43 C 399
44 A 398
45 G 396
46 G 395
47 C 361
48 C 0
49 U 0
50 A 0
51 A 0
52 C 359
53 A 358
54 C 357
55 A 0
56 U 356
57 G 355
58 C 354
59 A 0
60 A 0
61 G 106
62 U 105
63 C 104
64 G 0
65 A 0
66 G 103
67 C 102
68 G 101
69 G 99
70 U 98
71 A 0
72 A 0
73 C 97
74 A 96
75 C 95
76 A 93
77 G 92
78 A 91
79 G 90
80 G 89
81 A 88
82 G 87
83 C 0
84 U 0
85 U 0
86 G 0
87 C 82
88 U 81
89 C 80
90 C 79
91 U 78
92 U 77
93 G 76
94 G 0
95 G 75
96 U 74
97 G 73
98 A 70
99 C 69
100 G 0
101 A 68
102 G 67
103 C 66
104 G 63
105 G 62
106 C 61
107 G 0
108 G 0
109 A 0
110 C 0
111 G 0
112 G 0
113 G 314
114 U 313
115 G 312
116 A 0
117 G 0
118 U 0
119 A 0
120 A 0
121 U 0
122 G 239
123 C 238
124 C 237
125 U 236
126 G 235
127 G 234
128 G 233
129 G 232
130 A 0
131 U 231
132 C 230
133 U 0
134 G 0
135 C 0
136 C 227
137 C 226
138 G 225
139 A 224
140 U 223
141 A 222
142 G 221
143 A 0
144 G 178
145 G 177
146 G 176
147 G 175
148 G 0
149 A 0
150 U 0
151 A 0
152 A 169
153 C 168
154 U 167
155 A 166
156 C 165
157 G 164
158 G 163
159 G 0
160 A 0
161 A 0
162 A 0
163 C 158
164 U 157
165 G 156
166 U 155
167 A 154
168 G 153
169 C 152
170 U 0
171 A 0
172 A 0
173 U 0
174 A 0
175 C 147
176 C 146
177 G 145
178 C 144
179 A 0
180 U 0
181 A 0
182 A 0
183 U 0
184 G 193
185 U 192
186 C 191
187 U 0
188 A 0
189 C 0
190 G 0
191 G 186
192 A 185
193 C 184
194 C 0
195 A 0
196 A 0
197 A 0
198 G 219
199 U 218
200 G 217
201 G 216
202 G 215
203 G 214
204 G 0
205 C 0
206 U 213
207 C 212
208 U 0
209 U 0
210 C 0
211 G 0
212 G 207
213 A 206
214 C 203
215 C 202
216 U 201
217 C 200
218 A 199
219 U 198
220 G 0
221 C 142
222 U 141
223 A 140
224 U 139
225 C 138
226 G 137
227 G 136
228 A 0
229 U 0
230 G 132
231 A 131
232 A 129
233 C 128
234 C 127
235 C 126
236 A 125
237 G 124
238 G 123
239 U 122
240 G 286
241 G 285
242 G 284
243 A 0
244 U 0
245 U 283
246 A 0
247 G 277
248 C 276
249 U 275
250 A 0
251 G 0
252 U 274
253 U 273
254 G 272
255 G 271
256 U 270
257 G 269
258 A 268
259 G 267
260 G 0
261 U 0
262 A 0
263 A 0
264 U 0
265 G 0
266 G 0
267 C 259
268 U 258
269 C 257
270 A 256
271 C 255
272 C 254
273 A 253
274 A 252
275 G 249
276 G 248
277 C 247
278 G 0
279 A 0
280 C 0
281 G 0
282 A 0
283 U 245
284 C 242
285 U 241
286 C 240
287 U 0
288 A 0
289 A 311
290 C 310
291 U 309
292 G 308
293 G 304
294 U 303
295 U 302
296 U 301
297 G 0
298 A 0
299 G 0
300 A 0
301 G 296
302 A 295
303 A 294
304 U 293
305 G 0
306 A 0
307 C 0
308 C 292
309 A 291
310 G 290
311 U 289
312 C 115
313 A 114
314 C 113
315 A 0
316 C 337
317 U 336
318 G 335
319 G 334
320 A 333
321 A 332
322 C 0
323 U 0
324 G 0
325 A 0
326 G 0
327 A 0
328 C 0
329 A 0
330 C 0
331 G 0
332 G 321
333 U 320
334 C 319
335 C 318
336 A 317
337 G 316
338 A 0
339 C 350
340 U 349
341 C 348
342 C 347
343 U 0
344 A 0
345 C 0
346 G 0
347 G 342
348 G 341
349 A 340
350 G 339
351 G 0
352 C 0
353 A 0
354 G 58
355 C 57
356 A 56
357 G 54
358 U 53
359 G 52
360 G 0
361 G 47
362 G 0
363 A 0
364 A 0
365 U 0
366 A 0
367 U 393
368 U 0
369 G 392
370 C 391
371 A 390
372 C 0
373 A 0
374 A 0
375 U 388
376 G 387
377 G 386
378 G 385
379 C 384
380 G 0
381 C 0
382 A 0
383 A 0
384 G 379
385 C 378
386 C 377
387 U 376
388 G 375
389 A 0
390 U 371
391 G 370
392 C 369
393 A 367
394 G 0
395 C 46
396 C 45
397 A 0
398 U 44
399 G 43
400 C 42
401 C 41
402 G 40
403 C 39
404 G 0
405 U 0
406 G 436
407 U 435
408 G 434
409 U 433
410 G 0
411 A 0
412 A 0
413 G 0
414 A 0
415 A 0
416 G 427
417 G 426
418 C 425
419 C 424
420 U 0
421 U 0
422 C 0
423 G 0
424 G 419
425 G 418
426 U 417
427 U 416
428 G 0
429 U 0
430 A 0
431 A 0
432 A 0
433 G 409
434 C 408
435 A 407
436 C 406
437 U 0
438 U 496
439 U 0
440 C 497
441 A 493
442 G 492
443 C 491
444 G 490
445 G 489
446 G 488
447 G 0
448 A 0
449 G 0
450 G 483
451 A 0
452 A 0
453 G 0
454 G 0
455 G 477
456 U 476
457 C 475
458 A 474
459 C 473
460 U 472
461 A 471
462 G 470
463 U 0
464 U 0
465 A 0
466 A 0
467 U 0
468 A 0
469 C 0
470 C 462
471 U 461
472 A 460
473 G 459
474 U 458
475 G 457
476 G 456
477 C 455
478 A 0
479 U 0
480 U 0
481 G 0
482 A 0
483 C 450
484 G 0
485 U 0
486 U 0
487 A 0
488 C 446
489 U 445
490 C 444
491 G 443
492 C 442
493 A 441
494 G 0
495 A 0
496 A 438
497 G 440
498 A 0
499 A 0
500 G 545
501 C 544
502 A 543
503 C 542
504 C 541
505 G 526
506 G 525
507 C 524
508 U 0
509 A 0
510 A 0
511 C 540
512 U 539
513 C 538
514 C 537
515 G 536
516 U 0
517 G 0
518 C 0
519 C 0
520 A 0
521 G 528
522 C 527
523 A 0
524 G 507
525 C 506
526 C 505
527 G 522
528 C 521
529 G 0
530 G 0
531 U 0
532 A 0
533 A 0
534 U 0
535 A 0
536 C 515
537 G 514
538 G 513
539 A 512
540 G 511
541 G 504
542 G 503
543 U 502
544 G 501
545 C 500
546 A 0
547 A 37
548 G 36
549 C 35
550 G 34
551 U 33
552 U 32
553 A 30
554 A 29
555 U 28
556 C 27
557 G 0
558 G 0
559 A 0
560 A 0
561 U 0
562 U 0
563 A 0
564 C 0
565 U 0
566 G 0
567 G 883
568 G 882
569 C 881
570 G 866
571 U 865
572 A 0
573 A 0
574 A 0
575 G 880
576 C 0
577 G 764
578 C 763
579 A 762
580 C 761
581 G 0
582 C 758
583 A 0
584 G 757
585 G 756
586 C 755
587 G 0
588 G 651
589 U 650
590 U 649
591 U 648
592 G 647
593 U 646
594 U 645
595 A 0
596 A 644
597 G 643
598 U 640
599 C 639
600 A 638
601 G 637
602 A 636
603 U 635
604 G 634
605 U 633
606 G 632
607 A 0
608 A 0
609 A 0
610 U 0
611 C 629
612 C 628
613 C 627
614 C 626
615 G 625
616 A 624
617 G 623
618 C 0
619 U 0
620 C 0
621 A 0
622 A 0
623 C 617
624 U 616
625 U 615
626 G 614
627 G 613
628 G 612
629 A 611
630 A 0
631 C 0
632 U 606
633 G 605
634 C 604
635 A 603
636 U 602
637 U 601
638 U 600
639 G 599
640 A 598
641 A 0
642 A 0
643 C 597
644 U 596
645 G 594
646 G 593
647 C 592
648 A 591
649 A 590
650 G 589
651 C 588
652 U 0
653 A 0
654 G 0
655 A 751
656 G 750
657 U 749
658 C 748
659 U 746
660 U 745
661 G 744
662 U 743
663 A 742
664 G 0
665 A 0
666 G 740
667 G 739
668 G 738
669 G 737
670 G 736
671 G 735
672 U 734
673 A 717
674 G 716
675 A 0
676 A 0
677 U 713
678 U 712
679 C 711
680 C 710
681 A 709
682 G 708
683 G 707
684 U 706
685 G 0
686 U 0
687 A 0
688 G 699
689 C 698
690 G 697
691 G 0
692 U 0
693 G 0
694 A 0
695 A 0
696 A 0
697 U 690
698 G 689
699 C 688
700 G 0
701 U 0
702 A 0
703 G 0
704 A 0
705 G 0
706 A 684
707 U 683
708 C 682
709 U 681
710 G 680
711 G 679
712 A 678
713 G 677
714 G 0
715 A 0
716 A 674
717 U 673
718 A 0
719 C 0
720 C 0
721 G 0
722 G 733
723 U 0
724 G 0
725 G 732
726 C 731
727 G 0
728 A 0
729 A 0
730 G 0
731 G 726
732 C 725
733 G 722
734 G 672
735 C 671
736 C 670
737 C 669
738 C 668
739 C 667
740 U 666
741 G 0
742 G 663
743 A 662
744 C 661
745 A 660
746 A 659
747 A 0
748 G 658
749 A 657
750 C 656
751 U 655
752 G 0
753 A 0
754 C 0
755 G 586
756 C 585
757 U 584
758 C 582
759 A 0
760 G 0
761 G 580
762 U 579
763 G 578
764 C 577
765 G 0
766 A 0
767 A 0
768 A 0
769 G 810
770 C 809
771 G 808
772 U 807
773 G 806
774 G 805
775 G 0
776 G 0
777 A 0
778 G 804
779 C 803
780 A 0
781 A 0
782 A 0
783 C 799
784 A 798
785 G 797
786 G 796
787 A 0
788 U 0
789 U 0
790 A 0
791 G 0
792 A 0
793 U 0
794 A 0
795 C 0
796 C 786
797 C 785
798 U 784
799 G 783
800 G 0
801 U 0
802 A 0
803 G 779
804 U 778
805 C 774
806 C 773
807 A 772
808 C 771
809 G 770
810 C 769
811 U 0
812 G 0
813 U 0
814 A 0
815 A 0
816 A 0
817 C 0
818 G 0
819 A 0
820 U 0
821 G 879
822 U 878
823 C 877
824 G 876
825 A 875
826 U 874
827 U 0
828 U 0
829 G 857
830 G 856
831 A 855
832 G 854
833 G 853
834 U 852
835 U 851
836 G 850
837 U 849
838 G 848
839 C 847
840 C 846
841 C 0
842 U 0
843 U 0
844 G 0
845 A 0
846 G 840
847 G 839
848 C 838
849 G 837
850 U 836
851 G 835
852 G 834
853 C 833
854 U 832
855 U 831
856 C 830
857 C 829
858 G 0
859 G 0
860 A 0
861 G 868
862 C 867
863 U 0
864 A 0
865 A 571
866 C 570
867 G 862
868 C 861
869 G 0
870 U 0
871 U 0
872 A 0
873 A 0
874 A 826
875 U 825
876 C 824
877 G 823
878 A 822
879 C 821
880 C 575
881 G 569
882 C 568
883 C 567
884 U 0
885 G 912
886 G 911
887 G 910
888 G 0
889 A 0
890 G 0
891 U 0
892 A 0
893 C 0
894 G 905
895 G 904
896 C 903
897 C 902
898 G 0
899 C 0
900 A 0
901 A 0
902 G 897
903 G 896
904 U 895
905 U 894
906 A 0
907 A 0
908 A 0
909 A 0
910 C 887
911 U 886
912 C 885
913 A 0
914 A 0
915 A 0
916 U 19
917 G 18
918 A 17
919 A 0
920 U 0
921 U 1396
922 G 1395
923 A 1393
924 C 1392
925 G 1391
926 G 0
927 G 1390
928 G 1389
929 G 1388
930 N 1387
931 C 1386
932 C 1385
933 G 1384
934 C 0
935 A 1380
936 C 1379
937 A 0
938 A 0
939 G 1344
940 C 1343
941 G 1342
942 G 1341
943 U 1340
944 G 1237
945 G 1236
946 A 1235
947 G 1234
948 C 1233
949 A 1232
950 U 1231
951 G 1230
952 U 1229
953 G 1228
954 G 1226
955 U 1225
956 U 0
957 U 0
958 A 0
959 A 0
960 U 975
961 U 974
962 C 973
963 G 972
964 A 0
965 U 0
966 G 0
967 C 0
968 A 0
969 N 0
970 C 0
971 G 0
972 C 963
973 G 962
974 A 961
975 A 960
976 G 0
977 A 0
978 A 0
979 C 0
980 C 0
981 U 0
982 U 0
983 A 0
984 C 1221
985 C 1220
986 U 1219
987 A 1218
988 C 1217
989 U 1216
990 C 1215
991 U 0
992 U 0
993 G 0
994 A 0
995 C 0
996 A 1045
997 U 1044
998 C 1043
999 C 1041
1000 A 1040
1001 C 1039
1002 A 1038
1003 G 1037
1004 A 0
1005 A 0
1006 C 1023
1007 N 1022
1008 U 1021
1009 U 1020
1010 C 1019
1011 C 1018
1012 A 1017
1013 G 0
1014 A 0
1015 G 0
1016 A 0
1017 U 1012
1018 G 1011
1019 G 1010
1020 A 1009
1021 U 1008
1022 U 1007
1023 G 1006
1024 G 0
1025 U 1036
1026 G 1035
1027 C 1034
1028 C 1033
1029 U 0
1030 U 0
1031 C 0
1032 G 0
1033 G 1028
1034 G 1027
1035 A 1026
1036 A 1025
1037 C 1003
1038 U 1002
1039 C 1001
1040 U 1000
1041 G 999
1042 A 0
1043 G 998
1044 A 997
1045 C 996
1046 A 0
1047 G 1210
1048 G 1209
1049 U 0
1050 G 1208
1051 C 1207
1052 U 1206
1053 G 1205
1054 C 0
1055 A 0
1056 U 1204
1057 G 1203
1058 G 1199
1059 C 1198
1060 U 1197
1061 G 1195
1062 U 1194
1063 C 1193
1064 G 1192
1065 U 0
1066 C 0
1067 A 0
1068 G 1107
1069 C 1106
1070 U 1105
1071 C 1104
1072 G 1103
1073 U 1102
1074 G 1083
1075 U 1082
1076 U 1081
1077 G 0
1078 U 0
1079 G 0
1080 A 0
1081 A 1076
1082 A 1075
1083 U 1074
1084 G 0
1085 U 0
1086 U 1099
1087 G 1098
1088 G 1097
1089 G 1096
1090 U 0
1091 U 0
1092 A 0
1093 A 0
1094 G 0
1095 U 0
1096 C 1089
1097 C 1088
1098 C 1087
1099 G 1086
1100 C 0
1101 A 0
1102 A 1073
1103 C 1072
1104 G 1071
1105 A 1070
1106 G 1069
1107 C 1068
1108 G 0
1109 C 0
1110 A 0
1111 A 0
1112 C 0
1113 C 1187
1114 C 1186
1115 U 1185
1116 U 1184
1117 A 0
1118 U 1155
1119 C 1154
1120 C 1153
1121 U 1152
1122 U 1151
1123 U 1150
1124 G 1149
1125 U 0
1126 U 0
1127 G 0
1128 C 1144
1129 C 1143
1130 A 0
1131 G 0
1132 C 1142
1133 G 1141
1134 A 1140
1135 U 0
1136 U 0
1137 C 0
1138 G 0
1139 G 0
1140 U 1134
1141 C 1133
1142 G 1132
1143 G 1129
1144 G 1128
1145 A 0
1146 A 0
1147 C 0
1148 U 0
1149 C 1124
1150 A 1123
1151 A 1122
1152 A 1121
1153 G 1120
1154 G 1119
1155 A 1118
1156 G 0
1157 A 0
1158 C 1178
1159 U 1177
1160 G 1176
1161 C 1175
1162 C 1174
1163 G 1173
1164 G 1172
1165 U 1171
1166 G 0
1167 A 0
1168 U 0
1169 A 0
1170 A 0
1171 A 1165
1172 C 1164
1173 C 1163
1174 G 1162
1175 G 1161
1176 A 1160
1177 G 1159
1178 G 1158
1179 A 0
1180 A 0
1181 G 0
1182 G 0
1183 U 0
1184 G 1116
1185 G 1115
1186 G 1114
1187 G 1113
1188 A 0
1189 U 0
1190 G 0
1191 A 0
1192 C 1064
1193 G 1063
1194 U 1062
1195 C 1061
1196 A 0
1197 A 1060
1198 G 1059
1199 U 1058
1200 C 0
1201 A 0
1202 U 0
1203 C 1057
1204 A 1056
1205 U 1053
1206 G 1052
1207 G 1051
1208 C 1050
1209 C 1048
1210 C 1047
1211 U 0
1212 U 0
1213 A 0
1214 C 0
1215 G 990
1216 A 989
1217 G 988
1218 U 987
1219 A 986
1220 G 985
1221 G 984
1222 G 0
1223 C 0
1224 U 0
1225 A 955
1226 C 954
1227 A 0
1228 C 953
1229 A 952
1230 C 951
1231 G 950
1232 U 949
1233 G 948
1234 C 947
1235 U 946
1236 A 945
1237 C 944
1238 A 0
1239 A 0
1240 U 0
1241 G 1296
1242 G 1295
1243 C 1294
1244 A 1293
1245 U 1292
1246 A 1291
1247 U 1290
1248 A 0
1249 C 0
1250 A 0
1251 A 0
1252 A 0
1253 G 1284
1254 G 1283
1255 G 1282
1256 C 0
1257 G 0
1258 G 1277
1259 C 1276
1260 A 0
1261 A 0
1262 G 0
1263 C 1272
1264 U 1271
1265 A 1270
1266 G 0
1267 C 0
1268 G 0
1269 A 0
1270 U 1265
1271 A 1264
1272 G 1263
1273 U 0
1274 G 0
1275 A 0
1276 G 1259
1277 C 1258
1278 G 0
1279 A 0
1280 A 0
1281 U 0
1282 C 1255
1283 C 1254
1284 C 1253
1285 A 0
1286 U 0
1287 A 0
1288 A 0
1289 A 0
1290 G 1247
1291 U 1246
1292 A 1245
1293 U 1244
1294 G 1243
1295 U 1242
1296 C 1241
1297 G 0
1298 U 0
1299 A 0
1300 G 0
1301 U 0
1302 C 0
1303 C 1334
1304 G 0
1305 G 0
1306 A 0
1307 U 1330
1308 U 1329
1309 G 1328
1310 G 1327
1311 A 1326
1312 G 1325
1313 U 1324
1314 C 1323
1315 U 0
1316 G 0
1317 C 0
1318 A 0
1319 A 0
1320 C 0
1321 U 0
1322 C 0
1323 G 1314
1324 A 1313
1325 C 1312
1326 U 1311
1327 C 1310
1328 C 1309
1329 A 1308
1330 U 1307
1331 G 0
1332 A 0
1333 A 0
1334 G 1303
1335 U 0
1336 C 0
1337 G 0
1338 G 0
1339 A 0
1340 A 943
1341 U 942
1342 C 941
1343 G 940
1344 C 939
1345 U 0
1346 A 0
1347 G 0
1348 U 0
1349 A 0
1350 A 1372
1351 U 1371
1352 C 1370
1353 G 1369
1354 C 1368
1355 G 1367
1356 G 1366
1357 A 1365
1358 U 0
1359 C 0
1360 A 0
1361 G 0
1362 A 0
1363 A 0
1364 U 0
1365 G 1357
1366 C 1356
1367 C 1355
1368 G 1354
1369 C 1353
1370 G 1352
1371 G 1351
1372 U 1350
1373 G 0
1374 A 0
1375 A 0
1376 U 0
1377 A 0
1378 C 0
1379 G 936
1380 U 935
1381 U 0
1382 C 0
1383 C 0
1384 C 933
1385 G 932
1386 G 931
1387 G 930
1388 C 929
1389 C 928
1390 U 927
1391 U 925
1392 G 924
1393 U 923
1394 A 0
1395 C 922
1396 A 921
1397 C 0
1398 A 0
1399 C 1504
1400 C 0
1401 G 1501
1402 C 1500
1403 C 0
1404 C 1497
1405 G 1496
1406 U 0
1407 C 1494
1408 A 0
1409 C 1491
1410 A 1490
1411 C 1489
1412 C 1488
1413 A 1487
1414 U 1486
1415 G 1485
1416 G 1484
1417 G 0
1418 A 0
1419 G 1481
1420 U 1480
1421 G 1479
1422 G 1478
1423 G 1477
1424 U 1476
1425 U 1475
1426 G 1474
1427 C 1473
1428 A 1472
1429 A 1471
1430 A 1470
1431 A 0
1432 G 0
1433 A 0
1434 A 0
1435 G 1466
1436 U 1465
1437 A 1464
1438 G 1463
1439 G 1462
1440 U 1461
1441 A 0
1442 G 1460
1443 C 1459
1444 U 1458
1445 U 1457
1446 A 0
1447 A 0
1448 C 1455
1449 C 1454
1450 U 0
1451 U 0
1452 C 0
1453 G 0
1454 G 1449
1455 G 1448
1456 A 0
1457 G 1445
1458 G 1444
1459 G 1443
1460 N 1442
1461 N 1440
1462 N 1439
1463 N 1438
1464 N 1437
1465 N 1436
1466 N 1435
1467 N 0
1468 N 0
1469 N 0
1470 N 1430
1471 N 1429
1472 N 1428
1473 N 1427
1474 N 1426
1475 N 1425
1476 N 1424
1477 N 1423
1478 N 1422
1479 N 1421
1480 N 1420
1481 N 1419
1482 N 0
1483 N 0
1484 N 1416
1485 N 1415
1486 N 1414
1487 N 1413
1488 N 1412
1489 N 1411
1490 N 1410
1491 N 1409
1492 N 0
1493 N 0
1494 N 1407
1495 N 0
1496 N 1405
1497 N 1404
1498 N 0
1499 N 0
1500 N 1402
1501 N 1401
1502 N 0
1503 N 0
1504 N 1399
1505 N 0
1506 N 1529
1507 N 1528
1508 N 1527
1509 N 1526
1510 N 1525
1511 N 1524
1512 N 1523
1513 N 1522
1514 N 1521
1515 N 1520
1516 N 0
1517 N 0
1518 N 0
1519 N 0
1520 N 1515
1521 N 1514
1522 N 1513
1523 N 1512
1524 N 1511
1525 N 1510
1526 N 1509
1527 N 1508
1528 N 1507
1529 N 1506
1530 N 0
1531 N 0
1532 N 0
1533 N 0
1534 N 0
1535 N 0
1536 N 0
1537 N 0
1538 N 0
1539 N 0
1540 N 0
1541 N 0
1542 N 0