Filename: d.16.b.S.mashuensis.bpseq Organism: Streptomyces mashuensis Accession Number: X79323 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 N 0 3 N 0 4 N 0 5 N 0 6 N 0 7 N 0 8 A 0 9 G 25 10 A 24 11 G 23 12 U 22 13 U 21 14 U 0 15 G 0 16 A 0 17 U 895 18 C 894 19 C 893 20 U 0 21 G 13 22 G 12 23 C 11 24 U 10 25 C 9 26 A 0 27 G 531 28 G 530 29 A 529 30 C 528 31 G 0 32 A 527 33 A 526 34 C 525 35 G 524 36 C 523 37 U 522 38 G 0 39 G 398 40 C 397 41 G 396 42 G 395 43 C 394 44 G 393 45 U 391 46 G 390 47 C 356 48 U 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 C 354 53 A 353 54 C 352 55 A 0 56 U 351 57 G 350 58 C 349 59 A 0 60 A 0 61 G 98 62 U 97 63 C 96 64 G 0 65 A 0 66 A 95 67 C 94 68 G 93 69 A 91 70 U 90 71 G 0 72 A 0 73 A 0 74 C 0 75 C 86 76 U 85 77 C 84 78 C 83 79 U 0 80 U 0 81 C 0 82 G 0 83 G 78 84 G 77 85 A 76 86 G 75 87 G 0 88 G 0 89 G 0 90 A 70 91 U 69 92 U 0 93 A 68 94 G 67 95 U 66 96 G 63 97 G 62 98 C 61 99 G 0 100 A 0 101 A 0 102 C 0 103 G 0 104 G 0 105 G 309 106 U 308 107 G 307 108 A 0 109 G 0 110 U 0 111 A 0 112 A 0 113 C 0 114 A 234 115 C 233 116 G 232 117 U 231 118 G 230 119 G 229 120 G 228 121 C 227 122 A 0 123 A 0 124 U 226 125 C 225 126 U 0 127 G 0 128 C 0 129 C 222 130 C 221 131 U 220 132 G 219 133 C 218 134 A 217 135 C 216 136 U 0 137 C 171 138 U 170 139 G 169 140 G 168 141 G 0 142 A 0 143 C 0 144 A 0 145 A 162 146 G 161 147 C 160 148 C 159 149 C 158 150 U 157 151 G 156 152 G 0 153 A 0 154 A 0 155 A 0 156 C 151 157 G 150 158 G 149 159 G 148 160 G 147 161 U 146 162 C 145 163 U 0 164 A 0 165 A 0 166 U 0 167 A 0 168 C 140 169 C 139 170 G 138 171 G 137 172 A 0 173 U 0 174 A 0 175 C 0 176 G 0 177 A 201 178 C 200 179 A 199 180 C 198 181 G 197 182 C 196 183 G 195 184 A 193 185 C 192 186 C 191 187 G 0 188 C 0 189 A 0 190 U 0 191 G 186 192 G 185 193 U 184 194 C 0 195 C 183 196 G 182 197 C 181 198 G 180 199 U 179 200 G 178 201 U 177 202 G 0 203 G 0 204 A 0 205 A 0 206 A 0 207 G 214 208 C 213 209 U 0 210 C 0 211 C 0 212 G 0 213 G 208 214 C 207 215 G 0 216 G 135 217 U 134 218 G 133 219 C 132 220 A 131 221 G 130 222 G 129 223 A 0 224 U 0 225 G 125 226 A 124 227 G 121 228 C 120 229 C 119 230 C 118 231 G 117 232 C 116 233 G 115 234 G 114 235 C 281 236 C 280 237 U 279 238 A 0 239 U 0 240 C 278 241 A 0 242 G 272 243 C 271 244 U 270 245 U 0 246 G 0 247 U 269 248 U 268 249 G 267 250 G 266 251 U 265 252 G 264 253 A 263 254 G 262 255 G 0 256 U 0 257 A 0 258 A 0 259 U 0 260 G 0 261 G 0 262 C 254 263 U 253 264 C 252 265 A 251 266 C 250 267 C 249 268 A 248 269 A 247 270 G 244 271 G 243 272 C 242 273 G 0 274 A 0 275 C 0 276 G 0 277 A 0 278 C 240 279 G 237 280 G 236 281 G 235 282 U 0 283 A 0 284 G 306 285 C 305 286 C 304 287 G 303 288 G 299 289 C 298 290 C 297 291 U 296 292 G 0 293 A 0 294 G 0 295 A 0 296 G 291 297 G 290 298 G 289 299 C 288 300 G 0 301 A 0 302 C 0 303 C 287 304 G 286 305 G 285 306 C 284 307 C 107 308 A 106 309 C 105 310 A 0 311 C 332 312 U 331 313 G 330 314 G 329 315 G 328 316 A 327 317 C 0 318 U 0 319 G 0 320 A 0 321 G 0 322 A 0 323 C 0 324 A 0 325 C 0 326 G 0 327 G 316 328 C 315 329 C 314 330 C 313 331 A 312 332 G 311 333 A 0 334 C 345 335 U 344 336 C 343 337 C 342 338 U 0 339 A 0 340 C 0 341 G 0 342 G 337 343 G 336 344 A 335 345 G 334 346 G 0 347 C 0 348 A 0 349 G 58 350 C 57 351 A 56 352 G 54 353 U 53 354 G 52 355 G 0 356 G 47 357 G 0 358 A 0 359 A 0 360 U 0 361 A 0 362 U 388 363 U 0 364 G 387 365 C 386 366 A 385 367 C 0 368 A 0 369 A 0 370 U 383 371 G 382 372 G 381 373 G 380 374 C 379 375 G 0 376 A 0 377 A 0 378 A 0 379 G 374 380 C 373 381 C 372 382 U 371 383 G 370 384 A 0 385 U 366 386 G 365 387 C 364 388 A 362 389 G 0 390 C 46 391 G 45 392 A 0 393 C 44 394 G 43 395 C 42 396 C 41 397 G 40 398 C 39 399 G 0 400 U 0 401 G 431 402 A 430 403 G 429 404 G 428 405 G 0 406 A 0 407 U 0 408 G 0 409 A 0 410 C 0 411 G 422 412 G 421 413 C 420 414 C 419 415 U 0 416 U 0 417 C 0 418 G 0 419 G 414 420 G 413 421 U 412 422 U 411 423 G 0 424 U 0 425 A 0 426 A 0 427 A 0 428 C 404 429 C 403 430 U 402 431 C 401 432 U 0 433 U 471 434 U 0 435 C 472 436 A 468 437 G 467 438 C 466 439 A 465 440 G 464 441 G 463 442 G 0 443 A 0 444 A 0 445 G 458 446 A 0 447 A 0 448 G 0 449 C 0 450 G 0 451 A 0 452 A 0 453 A 0 454 G 0 455 U 0 456 G 0 457 A 0 458 C 445 459 G 0 460 G 0 461 U 0 462 A 0 463 C 441 464 C 440 465 U 439 466 G 438 467 C 437 468 A 436 469 G 0 470 A 0 471 A 433 472 G 435 473 A 0 474 A 0 475 G 520 476 C 519 477 G 518 478 C 517 479 C 516 480 G 501 481 G 500 482 C 499 483 U 0 484 A 0 485 A 0 486 C 515 487 U 514 488 A 513 489 C 512 490 G 511 491 U 0 492 G 0 493 C 0 494 C 0 495 A 0 496 G 503 497 C 502 498 A 0 499 G 482 500 C 481 501 C 480 502 G 497 503 C 496 504 G 0 505 G 0 506 U 0 507 A 0 508 A 0 509 U 0 510 A 0 511 C 490 512 G 489 513 U 488 514 A 487 515 G 486 516 G 479 517 G 478 518 C 477 519 G 476 520 C 475 521 A 0 522 A 37 523 G 36 524 C 35 525 G 34 526 U 33 527 U 32 528 G 30 529 U 29 530 C 28 531 C 27 532 G 0 533 G 0 534 A 0 535 A 0 536 U 0 537 U 0 538 A 0 539 U 0 540 U 0 541 G 0 542 G 860 543 G 859 544 C 858 545 G 843 546 U 842 547 A 0 548 A 0 549 A 0 550 G 857 551 A 0 552 G 739 553 C 738 554 U 737 555 C 736 556 G 0 557 U 733 558 A 0 559 G 732 560 G 731 561 C 730 562 G 0 563 G 626 564 C 625 565 U 624 566 U 623 567 G 622 568 U 621 569 C 620 570 G 0 571 C 619 572 G 618 573 U 615 574 C 614 575 G 613 576 G 612 577 A 611 578 U 610 579 G 609 580 U 608 581 G 607 582 A 0 583 A 0 584 A 0 585 G 0 586 C 604 587 C 603 588 C 602 589 G 601 590 G 600 591 G 599 592 G 598 593 C 0 594 U 0 595 U 0 596 A 0 597 A 0 598 C 592 599 C 591 600 C 590 601 C 589 602 G 588 603 G 587 604 G 586 605 U 0 606 C 0 607 U 581 608 G 580 609 C 579 610 A 578 611 U 577 612 U 576 613 C 575 614 G 574 615 A 573 616 U 0 617 A 0 618 C 572 619 G 571 620 G 569 621 G 568 622 C 567 623 A 566 624 G 565 625 G 564 626 C 563 627 U 0 628 A 0 629 G 0 630 A 726 631 G 725 632 U 724 633 U 722 634 C 721 635 G 720 636 G 719 637 U 718 638 A 717 639 G 0 640 G 0 641 G 715 642 G 714 643 A 713 644 G 712 645 A 711 646 U 710 647 C 709 648 G 692 649 G 691 650 A 0 651 A 0 652 U 688 653 U 687 654 C 686 655 C 685 656 U 684 657 G 683 658 G 682 659 U 681 660 G 0 661 U 0 662 A 0 663 G 674 664 C 673 665 G 672 666 G 0 667 U 0 668 G 0 669 A 0 670 A 0 671 A 0 672 U 665 673 G 664 674 C 663 675 G 0 676 C 0 677 A 0 678 G 0 679 A 0 680 U 0 681 A 659 682 U 658 683 C 657 684 A 656 685 G 655 686 G 654 687 A 653 688 G 652 689 G 0 690 A 0 691 A 649 692 C 648 693 A 0 694 C 0 695 C 0 696 G 0 697 G 708 698 U 0 699 G 0 700 G 707 701 C 706 702 G 0 703 A 0 704 A 0 705 G 0 706 G 701 707 C 700 708 G 697 709 G 647 710 A 646 711 U 645 712 C 644 713 U 643 714 C 642 715 U 641 716 G 0 717 G 638 718 G 637 719 C 636 720 C 635 721 G 634 722 A 633 723 U 0 724 A 632 725 C 631 726 U 630 727 G 0 728 A 0 729 C 0 730 G 561 731 C 560 732 U 559 733 G 557 734 A 0 735 G 0 736 G 555 737 A 554 738 G 553 739 C 552 740 G 0 741 A 0 742 A 0 743 A 0 744 G 785 745 C 784 746 G 783 747 U 782 748 G 781 749 G 780 750 G 0 751 G 0 752 A 0 753 G 779 754 C 778 755 G 0 756 A 0 757 A 0 758 C 774 759 A 773 760 G 772 761 G 771 762 A 0 763 U 0 764 U 0 765 A 0 766 G 0 767 A 0 768 U 0 769 A 0 770 C 0 771 C 761 772 C 760 773 U 759 774 G 758 775 G 0 776 U 0 777 A 0 778 G 754 779 U 753 780 C 749 781 C 748 782 A 747 783 C 746 784 G 745 785 C 744 786 C 0 787 G 0 788 U 0 789 A 0 790 A 0 791 A 0 792 C 0 793 G 0 794 U 0 795 U 0 796 G 856 797 G 855 798 G 854 799 C 853 800 A 852 801 C 851 802 U 0 803 A 0 804 G 834 805 G 833 806 U 832 807 G 831 808 U 830 809 G 829 810 G 828 811 G 827 812 C 826 813 A 825 814 A 824 815 C 823 816 A 0 817 U 0 818 U 0 819 C 0 820 C 0 821 A 0 822 C 0 823 G 815 824 U 814 825 U 813 826 G 812 827 U 811 828 C 810 829 C 809 830 G 808 831 U 807 832 G 806 833 C 805 834 C 804 835 G 0 836 C 0 837 A 0 838 G 845 839 C 844 840 U 0 841 A 0 842 A 546 843 C 545 844 G 839 845 C 838 846 A 0 847 U 0 848 U 0 849 A 0 850 A 0 851 G 801 852 U 800 853 G 799 854 C 798 855 C 797 856 C 796 857 C 550 858 G 544 859 C 543 860 C 542 861 U 0 862 G 889 863 G 888 864 G 887 865 G 0 866 A 0 867 G 0 868 U 0 869 A 0 870 C 0 871 G 882 872 G 881 873 C 880 874 C 879 875 G 0 876 C 0 877 A 0 878 A 0 879 G 874 880 G 873 881 C 872 882 U 871 883 A 0 884 A 0 885 A 0 886 A 0 887 C 864 888 U 863 889 C 862 890 A 0 891 A 0 892 A 0 893 G 19 894 G 18 895 A 17 896 A 0 897 U 0 898 U 1379 899 G 1378 900 A 1376 901 C 1375 902 G 1374 903 G 0 904 G 1373 905 G 1372 906 G 1371 907 C 1370 908 C 1369 909 C 1368 910 G 1367 911 C 0 912 A 1363 913 C 1362 914 A 0 915 A 0 916 G 1326 917 C 1325 918 A 1324 919 G 1323 920 C 1322 921 G 1219 922 G 1218 923 A 1217 924 G 1216 925 C 1215 926 A 1214 927 U 1213 928 G 1212 929 U 1211 930 G 1210 931 G 1208 932 C 1207 933 U 0 934 U 0 935 A 0 936 A 0 937 U 952 938 U 951 939 C 950 940 G 949 941 A 0 942 C 0 943 G 0 944 C 0 945 A 0 946 A 0 947 C 0 948 G 0 949 C 940 950 G 939 951 A 938 952 A 937 953 G 0 954 A 0 955 A 0 956 C 0 957 C 0 958 U 0 959 U 0 960 A 0 961 C 1203 962 C 1202 963 A 1201 964 A 1200 965 G 1199 966 G 1198 967 C 1197 968 U 0 969 U 0 970 G 0 971 A 0 972 C 0 973 A 1019 974 U 1018 975 A 1017 976 C 1016 977 A 1015 978 C 1014 979 C 1013 980 G 1012 981 G 1011 982 A 0 983 A 0 984 A 1000 985 C 999 986 A 998 987 C 997 988 U 996 989 C 0 990 A 995 991 G 0 992 A 0 993 G 0 994 A 0 995 U 990 996 G 988 997 G 987 998 U 986 999 G 985 1000 C 984 1001 C 0 1002 C 1010 1003 C 1009 1004 C 0 1005 U 0 1006 U 0 1007 G 0 1008 U 0 1009 G 1003 1010 G 1002 1011 U 981 1012 C 980 1013 G 979 1014 G 978 1015 U 977 1016 G 976 1017 U 975 1018 A 974 1019 C 973 1020 A 0 1021 G 1192 1022 G 1191 1023 U 0 1024 G 1190 1025 G 1189 1026 U 1188 1027 G 1187 1028 C 0 1029 A 0 1030 U 1186 1031 G 1185 1032 G 1181 1033 C 1180 1034 U 1179 1035 G 1177 1036 U 1176 1037 C 1175 1038 G 1174 1039 U 0 1040 C 0 1041 A 0 1042 G 1081 1043 C 1080 1044 U 1079 1045 C 1078 1046 G 1077 1047 U 1076 1048 G 1057 1049 U 1056 1050 C 1055 1051 G 0 1052 U 0 1053 G 0 1054 A 0 1055 G 1050 1056 A 1049 1057 U 1048 1058 G 0 1059 U 0 1060 U 1073 1061 G 1072 1062 G 1071 1063 G 1070 1064 U 0 1065 U 0 1066 A 0 1067 A 0 1068 G 0 1069 U 0 1070 C 1063 1071 C 1062 1072 C 1061 1073 G 1060 1074 C 0 1075 A 0 1076 A 1047 1077 C 1046 1078 G 1045 1079 A 1044 1080 G 1043 1081 C 1042 1082 G 0 1083 C 0 1084 A 0 1085 A 0 1086 C 0 1087 C 1169 1088 C 1168 1089 U 1167 1090 U 1166 1091 G 0 1092 U 1137 1093 U 1136 1094 C 1135 1095 U 1134 1096 G 1133 1097 U 1132 1098 G 1131 1099 U 0 1100 U 0 1101 G 0 1102 C 1126 1103 C 1125 1104 A 0 1105 G 0 1106 C 1124 1107 A 1123 1108 A 1122 1109 U 1120 1110 C 1119 1111 G 1118 1112 C 1117 1113 U 0 1114 U 0 1115 C 0 1116 G 0 1117 G 1112 1118 G 1111 1119 G 1110 1120 U 1109 1121 G 0 1122 A 1108 1123 U 1107 1124 G 1106 1125 G 1103 1126 G 1102 1127 G 0 1128 A 0 1129 C 0 1130 U 0 1131 C 1098 1132 A 1097 1133 C 1096 1134 A 1095 1135 G 1094 1136 G 1093 1137 A 1092 1138 G 0 1139 A 0 1140 C 1160 1141 U 1159 1142 G 1158 1143 C 1157 1144 C 1156 1145 G 1155 1146 G 1154 1147 G 1153 1148 G 0 1149 U 0 1150 C 0 1151 A 0 1152 A 0 1153 C 1147 1154 U 1146 1155 C 1145 1156 G 1144 1157 G 1143 1158 A 1142 1159 G 1141 1160 G 1140 1161 A 0 1162 A 0 1163 G 0 1164 G 0 1165 U 0 1166 G 1090 1167 G 1089 1168 G 1088 1169 G 1087 1170 A 0 1171 C 0 1172 G 0 1173 A 0 1174 C 1038 1175 G 1037 1176 U 1036 1177 C 1035 1178 A 0 1179 A 1034 1180 G 1033 1181 U 1032 1182 C 0 1183 A 0 1184 U 0 1185 C 1031 1186 A 1030 1187 U 1027 1188 G 1026 1189 C 1025 1190 C 1024 1191 C 1022 1192 C 1021 1193 U 0 1194 U 0 1195 A 0 1196 U 0 1197 G 967 1198 U 966 1199 C 965 1200 U 964 1201 U 963 1202 G 962 1203 G 961 1204 G 0 1205 C 0 1206 U 0 1207 G 932 1208 C 931 1209 A 0 1210 C 930 1211 A 929 1212 C 928 1213 G 927 1214 U 926 1215 G 925 1216 C 924 1217 U 923 1218 A 922 1219 C 921 1220 A 0 1221 A 0 1222 U 0 1223 G 1278 1224 G 1277 1225 C 1276 1226 C 1275 1227 G 1274 1228 G 1273 1229 U 1272 1230 A 0 1231 C 0 1232 A 0 1233 A 0 1234 U 0 1235 G 1266 1236 A 1265 1237 G 1264 1238 C 0 1239 U 0 1240 G 1259 1241 C 1258 1242 G 0 1243 A 0 1244 U 0 1245 A 1254 1246 C 1253 1247 C 1252 1248 G 0 1249 C 0 1250 G 0 1251 A 0 1252 G 1247 1253 G 1246 1254 U 1245 1255 G 0 1256 G 0 1257 A 0 1258 G 1241 1259 C 1240 1260 G 0 1261 A 0 1262 A 0 1263 U 0 1264 C 1237 1265 U 1236 1266 C 1235 1267 A 0 1268 A 0 1269 A 0 1270 A 0 1271 A 0 1272 G 1229 1273 C 1228 1274 C 1227 1275 G 1226 1276 G 1225 1277 U 1224 1278 C 1223 1279 U 0 1280 C 0 1281 A 0 1282 G 0 1283 U 0 1284 U 0 1285 C 1316 1286 G 0 1287 G 0 1288 A 0 1289 U 1312 1290 U 1311 1291 G 1310 1292 G 1309 1293 G 1308 1294 G 1307 1295 U 1306 1296 C 1305 1297 U 0 1298 G 0 1299 C 0 1300 A 0 1301 A 0 1302 C 0 1303 U 0 1304 C 0 1305 G 1296 1306 A 1295 1307 C 1294 1308 C 1293 1309 C 1292 1310 C 1291 1311 A 1290 1312 U 1289 1313 G 0 1314 A 0 1315 A 0 1316 G 1285 1317 U 0 1318 U 0 1319 G 0 1320 G 0 1321 A 0 1322 G 920 1323 U 919 1324 U 918 1325 G 917 1326 C 916 1327 U 0 1328 A 0 1329 G 0 1330 U 0 1331 A 0 1332 A 1355 1333 U 1354 1334 C 1353 1335 G 1352 1336 C 1351 1337 A 1350 1338 G 1349 1339 A 1348 1340 U 0 1341 C 0 1342 A 0 1343 G 0 1344 C 0 1345 A 0 1346 U 0 1347 U 0 1348 G 1339 1349 C 1338 1350 U 1337 1351 G 1336 1352 C 1335 1353 G 1334 1354 G 1333 1355 U 1332 1356 G 0 1357 A 0 1358 A 0 1359 U 0 1360 A 0 1361 C 0 1362 G 913 1363 U 912 1364 U 0 1365 C 0 1366 C 0 1367 C 910 1368 G 909 1369 G 908 1370 G 907 1371 C 906 1372 C 905 1373 U 904 1374 U 902 1375 G 901 1376 U 900 1377 A 0 1378 C 899 1379 A 898 1380 C 0 1381 A 0 1382 C 1488 1383 C 0 1384 G 1485 1385 C 1484 1386 C 0 1387 C 1481 1388 G 1480 1389 U 0 1390 C 0 1391 A 0 1392 C 1475 1393 G 1474 1394 U 1473 1395 C 1472 1396 A 1471 1397 C 1470 1398 G 1469 1399 A 1468 1400 A 0 1401 A 0 1402 G 1465 1403 U 1464 1404 C 1463 1405 G 1462 1406 G 1461 1407 U 1460 1408 A 1459 1409 A 1458 1410 C 1457 1411 A 1456 1412 C 1455 1413 C 1454 1414 C 0 1415 G 0 1416 A 0 1417 A 0 1418 G 1450 1419 C 1449 1420 C 1448 1421 G 1447 1422 G 1446 1423 U 1445 1424 G 0 1425 G 1444 1426 C 1443 1427 C 1442 1428 C 1441 1429 A 0 1430 A 0 1431 C 1439 1432 C 1438 1433 C 0 1434 U 0 1435 U 0 1436 G 0 1437 U 0 1438 G 1432 1439 G 1431 1440 A 0 1441 G 1428 1442 G 1427 1443 G 1426 1444 A 1425 1445 G 1423 1446 C 1422 1447 C 1421 1448 G 1420 1449 U 1419 1450 C 1418 1451 G 0 1452 A 0 1453 A 0 1454 G 1413 1455 G 1412 1456 U 1411 1457 G 1410 1458 G 1409 1459 G 1408 1460 A 1407 1461 C 1406 1462 U 1405 1463 G 1404 1464 G 1403 1465 C 1402 1466 G 0 1467 A 0 1468 U 1399 1469 U 1398 1470 G 1397 1471 G 1396 1472 G 1395 1473 A 1394 1474 C 1393 1475 G 1392 1476 A 0 1477 A 0 1478 G 0 1479 U 0 1480 C 1388 1481 G 1387 1482 U 0 1483 A 0 1484 A 1385 1485 C 1384 1486 A 0 1487 A 0 1488 G 1382 1489 G 0 1490 U 1513 1491 A 1512 1492 G 1511 1493 C 1510 1494 C 1509 1495 G 1508 1496 U 1507 1497 A 1506 1498 C 1505 1499 C 1504 1500 G 0 1501 G 0 1502 A 0 1503 A 0 1504 G 1499 1505 G 1498 1506 U 1497 1507 G 1496 1508 C 1495 1509 G 1494 1510 G 1493 1511 C 1492 1512 U 1491 1513 G 1490 1514 G 0 1515 A 0 1516 U 0 1517 C 0 1518 A 0 1519 C 0 1520 C 0 1521 U 0 1522 C 0 1523 C 0 1524 U 0 1525 U 0 1526 N 0