Filename: d.16.b.S.scabiei.bpseq Organism: Streptomyces scabiei Accession Number: D63862 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 C 0 2 A 0 3 U 0 4 U 0 5 C 0 6 A 0 7 C 0 8 G 0 9 G 0 10 A 0 11 G 27 12 A 26 13 G 25 14 U 24 15 U 23 16 U 0 17 G 0 18 A 0 19 U 895 20 C 894 21 C 893 22 U 0 23 G 15 24 G 14 25 C 13 26 U 12 27 C 11 28 A 0 29 G 531 30 G 530 31 A 529 32 C 528 33 G 0 34 A 527 35 A 526 36 C 525 37 G 524 38 C 523 39 U 522 40 G 0 41 G 398 42 C 397 43 G 396 44 G 395 45 C 394 46 G 393 47 U 391 48 G 390 49 C 356 50 U 0 51 U 0 52 A 0 53 A 0 54 C 354 55 A 353 56 C 352 57 A 0 58 U 351 59 G 350 60 C 349 61 A 0 62 A 0 63 G 98 64 U 97 65 C 96 66 G 0 67 A 0 68 A 95 69 C 94 70 G 93 71 A 91 72 U 90 73 G 0 74 A 89 75 A 88 76 C 87 77 C 86 78 A 85 79 C 84 80 U 0 81 U 0 82 C 0 83 G 0 84 G 79 85 U 78 86 G 77 87 G 76 88 G 75 89 G 74 90 A 72 91 U 71 92 U 0 93 A 70 94 G 69 95 U 68 96 G 65 97 G 64 98 C 63 99 G 0 100 A 0 101 A 0 102 C 0 103 G 0 104 G 0 105 G 309 106 U 308 107 G 307 108 A 0 109 G 0 110 U 0 111 A 0 112 A 0 113 C 0 114 A 234 115 C 233 116 G 232 117 U 231 118 G 230 119 G 229 120 G 228 121 C 227 122 A 0 123 A 0 124 U 226 125 C 225 126 U 0 127 G 0 128 C 0 129 C 222 130 C 221 131 U 220 132 U 219 133 C 218 134 A 217 135 C 216 136 U 0 137 C 171 138 U 170 139 G 169 140 G 168 141 G 0 142 A 0 143 C 0 144 A 0 145 A 162 146 G 161 147 C 160 148 C 159 149 C 158 150 U 157 151 G 156 152 G 0 153 A 0 154 A 0 155 A 0 156 C 151 157 G 150 158 G 149 159 G 148 160 G 147 161 U 146 162 C 145 163 U 0 164 A 0 165 A 0 166 U 0 167 A 0 168 C 140 169 C 139 170 G 138 171 G 137 172 A 0 173 U 0 174 A 0 175 C 0 176 G 0 177 A 201 178 C 200 179 A 199 180 C 198 181 U 197 182 C 196 183 U 194 184 C 193 185 G 192 186 G 191 187 G 0 188 C 0 189 A 0 190 U 0 191 C 186 192 C 185 193 G 184 194 A 183 195 U 0 196 G 182 197 A 181 198 G 180 199 U 179 200 G 178 201 U 177 202 G 0 203 G 0 204 A 0 205 A 0 206 A 0 207 G 214 208 C 213 209 U 0 210 C 0 211 C 0 212 G 0 213 G 208 214 C 207 215 G 0 216 G 135 217 U 134 218 G 133 219 A 132 220 A 131 221 G 130 222 G 129 223 A 0 224 U 0 225 G 125 226 A 124 227 G 121 228 C 120 229 C 119 230 C 118 231 G 117 232 C 116 233 G 115 234 G 114 235 C 281 236 C 280 237 U 279 238 A 0 239 U 0 240 C 278 241 A 0 242 G 272 243 C 271 244 U 270 245 U 0 246 G 0 247 U 269 248 U 268 249 G 267 250 G 266 251 U 265 252 G 264 253 A 263 254 G 262 255 G 0 256 U 0 257 A 0 258 A 0 259 C 0 260 G 0 261 G 0 262 C 254 263 U 253 264 C 252 265 A 251 266 C 250 267 C 249 268 A 248 269 A 247 270 G 244 271 G 243 272 C 242 273 G 0 274 A 0 275 C 0 276 G 0 277 A 0 278 C 240 279 G 237 280 G 236 281 G 235 282 U 0 283 A 0 284 G 306 285 C 305 286 C 304 287 G 303 288 G 299 289 C 298 290 C 297 291 U 296 292 G 0 293 A 0 294 G 0 295 A 0 296 G 291 297 G 290 298 G 289 299 C 288 300 G 0 301 A 0 302 C 0 303 C 287 304 G 286 305 G 285 306 C 284 307 C 107 308 A 106 309 C 105 310 A 0 311 C 332 312 U 331 313 G 330 314 G 329 315 G 328 316 A 327 317 C 0 318 U 0 319 G 0 320 A 0 321 G 0 322 A 0 323 C 0 324 A 0 325 C 0 326 G 0 327 G 316 328 C 315 329 C 314 330 C 313 331 A 312 332 G 311 333 A 0 334 C 345 335 U 344 336 C 343 337 C 342 338 U 0 339 A 0 340 C 0 341 G 0 342 G 337 343 G 336 344 A 335 345 G 334 346 G 0 347 C 0 348 A 0 349 G 60 350 C 59 351 A 58 352 G 56 353 U 55 354 G 54 355 G 0 356 G 49 357 G 0 358 A 0 359 A 0 360 U 0 361 A 0 362 U 388 363 U 0 364 G 387 365 C 386 366 A 385 367 C 0 368 A 0 369 A 0 370 U 383 371 G 382 372 G 381 373 G 380 374 C 379 375 G 0 376 A 0 377 A 0 378 A 0 379 G 374 380 C 373 381 C 372 382 U 371 383 G 370 384 A 0 385 U 366 386 G 365 387 C 364 388 A 362 389 G 0 390 C 48 391 G 47 392 A 0 393 C 46 394 G 45 395 C 44 396 C 43 397 G 42 398 C 41 399 G 0 400 U 0 401 G 431 402 A 430 403 G 429 404 G 428 405 G 0 406 A 0 407 U 0 408 G 0 409 A 0 410 C 0 411 G 422 412 G 421 413 C 420 414 C 419 415 U 0 416 U 0 417 C 0 418 G 0 419 G 414 420 G 413 421 U 412 422 U 411 423 G 0 424 U 0 425 A 0 426 A 0 427 A 0 428 C 404 429 C 403 430 U 402 431 C 401 432 U 0 433 U 471 434 U 0 435 C 472 436 A 468 437 G 467 438 C 466 439 A 465 440 G 464 441 G 463 442 G 0 443 A 0 444 A 0 445 G 458 446 A 457 447 A 456 448 G 455 449 C 454 450 G 0 451 A 0 452 A 0 453 A 0 454 G 449 455 U 448 456 G 447 457 A 446 458 C 445 459 G 0 460 G 0 461 U 0 462 A 0 463 C 441 464 C 440 465 U 439 466 G 438 467 C 437 468 A 436 469 G 0 470 A 0 471 A 433 472 G 435 473 A 0 474 A 0 475 G 520 476 C 519 477 G 518 478 C 517 479 C 516 480 G 501 481 G 500 482 C 499 483 U 0 484 A 0 485 A 0 486 C 515 487 U 514 488 A 513 489 C 512 490 G 511 491 U 0 492 G 0 493 C 0 494 C 0 495 A 0 496 G 503 497 C 502 498 A 0 499 G 482 500 C 481 501 C 480 502 G 497 503 C 496 504 G 0 505 G 0 506 U 0 507 A 0 508 A 0 509 U 0 510 A 0 511 C 490 512 G 489 513 U 488 514 A 487 515 G 486 516 G 479 517 G 478 518 C 477 519 G 476 520 C 475 521 G 0 522 A 39 523 G 38 524 C 37 525 G 36 526 U 35 527 U 34 528 G 32 529 U 31 530 C 30 531 C 29 532 G 0 533 G 0 534 A 0 535 A 0 536 U 0 537 U 0 538 A 0 539 U 0 540 U 0 541 G 0 542 G 860 543 G 859 544 C 858 545 G 843 546 U 842 547 A 0 548 A 0 549 A 0 550 G 857 551 A 0 552 G 739 553 C 738 554 U 737 555 C 736 556 G 0 557 U 733 558 A 0 559 G 732 560 G 731 561 C 730 562 G 0 563 G 626 564 U 625 565 C 624 566 U 623 567 G 622 568 U 621 569 C 620 570 G 0 571 C 619 572 G 618 573 U 615 574 C 614 575 G 613 576 G 612 577 A 611 578 U 610 579 G 609 580 U 608 581 G 607 582 A 0 583 A 0 584 A 0 585 G 0 586 C 604 587 C 603 588 C 602 589 G 601 590 G 600 591 G 599 592 G 598 593 C 0 594 U 0 595 U 0 596 A 0 597 A 0 598 C 592 599 C 591 600 C 590 601 C 589 602 G 588 603 G 587 604 G 586 605 U 0 606 C 0 607 U 581 608 G 580 609 C 579 610 A 578 611 U 577 612 U 576 613 C 575 614 G 574 615 A 573 616 U 0 617 A 0 618 C 572 619 G 571 620 G 569 621 G 568 622 C 567 623 A 566 624 G 565 625 A 564 626 C 563 627 U 0 628 A 0 629 G 0 630 A 726 631 G 725 632 U 724 633 G 722 634 U 721 635 G 720 636 G 719 637 U 718 638 A 717 639 G 0 640 G 0 641 G 715 642 G 714 643 A 713 644 G 712 645 A 711 646 U 710 647 C 709 648 G 692 649 G 691 650 A 0 651 A 0 652 U 688 653 U 687 654 C 686 655 C 685 656 U 684 657 G 683 658 G 682 659 U 681 660 G 0 661 U 0 662 A 0 663 G 674 664 C 673 665 G 672 666 G 0 667 U 0 668 G 0 669 A 0 670 A 0 671 A 0 672 U 665 673 G 664 674 C 663 675 G 0 676 C 0 677 A 0 678 G 0 679 A 0 680 U 0 681 A 659 682 U 658 683 C 657 684 A 656 685 G 655 686 G 654 687 A 653 688 G 652 689 G 0 690 A 0 691 A 649 692 C 648 693 A 0 694 C 0 695 C 0 696 G 0 697 G 708 698 U 0 699 G 0 700 G 707 701 C 706 702 G 0 703 A 0 704 A 0 705 G 0 706 G 701 707 C 700 708 G 697 709 G 647 710 A 646 711 U 645 712 C 644 713 U 643 714 C 642 715 U 641 716 G 0 717 G 638 718 G 637 719 C 636 720 C 635 721 A 634 722 U 633 723 U 0 724 A 632 725 C 631 726 U 630 727 G 0 728 A 0 729 C 0 730 G 561 731 C 560 732 U 559 733 G 557 734 A 0 735 G 0 736 G 555 737 A 554 738 G 553 739 C 552 740 G 0 741 A 0 742 A 0 743 A 0 744 G 785 745 C 784 746 G 783 747 U 782 748 G 781 749 G 780 750 G 0 751 G 0 752 A 0 753 G 779 754 C 778 755 G 0 756 A 0 757 A 0 758 C 774 759 A 773 760 G 772 761 G 771 762 A 0 763 U 0 764 U 0 765 A 0 766 G 0 767 A 0 768 U 0 769 A 0 770 C 0 771 C 761 772 C 760 773 U 759 774 G 758 775 G 0 776 U 0 777 A 0 778 G 754 779 U 753 780 C 749 781 C 748 782 A 747 783 C 746 784 G 745 785 C 744 786 C 0 787 G 0 788 U 0 789 A 0 790 A 0 791 A 0 792 C 0 793 G 0 794 G 0 795 U 0 796 G 856 797 G 855 798 G 854 799 A 853 800 A 852 801 C 851 802 U 0 803 A 0 804 G 834 805 G 833 806 U 832 807 G 831 808 U 830 809 U 829 810 G 828 811 G 827 812 C 826 813 G 825 814 A 824 815 C 823 816 A 0 817 U 0 818 U 0 819 C 0 820 C 0 821 A 0 822 C 0 823 G 815 824 U 814 825 C 813 826 G 812 827 U 811 828 C 810 829 G 809 830 G 808 831 U 807 832 G 806 833 C 805 834 C 804 835 G 0 836 C 0 837 A 0 838 G 845 839 C 844 840 U 0 841 A 0 842 A 546 843 C 545 844 G 839 845 C 838 846 A 0 847 U 0 848 U 0 849 A 0 850 A 0 851 G 801 852 U 800 853 U 799 854 C 798 855 C 797 856 C 796 857 C 550 858 G 544 859 C 543 860 C 542 861 U 0 862 G 889 863 G 888 864 G 887 865 G 0 866 A 0 867 G 0 868 U 0 869 A 0 870 C 0 871 G 882 872 G 881 873 C 880 874 C 879 875 G 0 876 C 0 877 A 0 878 A 0 879 G 874 880 G 873 881 C 872 882 U 871 883 A 0 884 A 0 885 A 0 886 A 0 887 C 864 888 U 863 889 C 862 890 A 0 891 A 0 892 A 0 893 G 21 894 G 20 895 A 19 896 A 0 897 U 0 898 U 1380 899 G 1379 900 A 1377 901 C 1376 902 G 1375 903 G 0 904 G 1374 905 G 1373 906 G 1372 907 C 1371 908 C 1370 909 C 1369 910 G 1368 911 C 0 912 A 1364 913 C 1363 914 A 0 915 A 0 916 G 1327 917 C 1326 918 A 1325 919 G 1324 920 C 1323 921 G 1220 922 G 1219 923 A 1218 924 G 1217 925 C 1216 926 A 1215 927 U 1214 928 G 1213 929 U 1212 930 G 1211 931 G 1209 932 C 1208 933 U 0 934 U 0 935 A 0 936 A 0 937 U 952 938 U 951 939 C 950 940 G 949 941 A 0 942 C 0 943 G 0 944 C 0 945 A 0 946 A 0 947 C 0 948 G 0 949 C 940 950 G 939 951 A 938 952 A 937 953 G 0 954 A 0 955 A 0 956 C 0 957 C 0 958 U 0 959 U 0 960 A 0 961 C 1204 962 C 1203 963 A 1202 964 A 1201 965 G 1200 966 G 1199 967 C 1198 968 U 0 969 U 0 970 G 0 971 A 0 972 C 0 973 A 1020 974 U 1019 975 A 1018 976 C 1017 977 A 1016 978 C 1015 979 C 1014 980 G 1013 981 G 1012 982 A 0 983 A 0 984 A 1001 985 C 1000 986 G 999 987 G 998 988 C 997 989 C 996 990 A 995 991 G 0 992 A 0 993 G 0 994 A 0 995 U 990 996 G 989 997 G 988 998 U 987 999 C 986 1000 G 985 1001 C 984 1002 C 0 1003 C 1011 1004 C 1010 1005 C 0 1006 U 0 1007 U 0 1008 G 0 1009 U 0 1010 G 1004 1011 G 1003 1012 U 981 1013 C 980 1014 G 979 1015 G 978 1016 U 977 1017 G 976 1018 U 975 1019 A 974 1020 C 973 1021 A 0 1022 G 1193 1023 G 1192 1024 U 0 1025 G 1191 1026 G 1190 1027 U 1189 1028 G 1188 1029 C 0 1030 A 0 1031 U 1187 1032 G 1186 1033 G 1182 1034 C 1181 1035 U 1180 1036 G 1178 1037 U 1177 1038 C 1176 1039 G 1175 1040 U 0 1041 C 0 1042 A 0 1043 G 1082 1044 C 1081 1045 U 1080 1046 C 1079 1047 G 1078 1048 U 1077 1049 G 1058 1050 U 1057 1051 C 1056 1052 G 0 1053 U 0 1054 G 0 1055 A 0 1056 G 1051 1057 A 1050 1058 U 1049 1059 G 0 1060 U 0 1061 U 1074 1062 G 1073 1063 G 1072 1064 G 1071 1065 U 0 1066 U 0 1067 A 0 1068 A 0 1069 G 0 1070 U 0 1071 C 1064 1072 C 1063 1073 C 1062 1074 G 1061 1075 C 0 1076 A 0 1077 A 1048 1078 C 1047 1079 G 1046 1080 A 1045 1081 G 1044 1082 C 1043 1083 G 0 1084 C 0 1085 A 0 1086 A 0 1087 C 0 1088 C 1170 1089 C 1169 1090 U 1168 1091 U 1167 1092 G 0 1093 U 1138 1094 U 1137 1095 C 1136 1096 U 1135 1097 G 1134 1098 U 1133 1099 G 1132 1100 U 0 1101 U 0 1102 G 0 1103 C 1127 1104 C 1126 1105 A 0 1106 G 0 1107 C 1125 1108 A 1124 1109 U 1123 1110 G 1121 1111 C 1120 1112 C 1119 1113 C 1118 1114 U 0 1115 U 0 1116 C 0 1117 G 0 1118 G 1113 1119 G 1112 1120 G 1111 1121 U 1110 1122 G 0 1123 A 1109 1124 U 1108 1125 G 1107 1126 G 1104 1127 G 1103 1128 G 0 1129 A 0 1130 C 0 1131 U 0 1132 C 1099 1133 A 1098 1134 C 1097 1135 A 1096 1136 G 1095 1137 G 1094 1138 A 1093 1139 G 0 1140 A 0 1141 C 1161 1142 U 1160 1143 G 1159 1144 C 1158 1145 C 1157 1146 G 1156 1147 G 1155 1148 G 1154 1149 G 0 1150 U 0 1151 C 0 1152 A 0 1153 A 0 1154 C 1148 1155 U 1147 1156 C 1146 1157 G 1145 1158 G 1144 1159 A 1143 1160 G 1142 1161 G 1141 1162 A 0 1163 A 0 1164 G 0 1165 G 0 1166 U 0 1167 G 1091 1168 G 1090 1169 G 1089 1170 G 1088 1171 A 0 1172 C 0 1173 G 0 1174 A 0 1175 C 1039 1176 G 1038 1177 U 1037 1178 C 1036 1179 A 0 1180 A 1035 1181 G 1034 1182 U 1033 1183 C 0 1184 A 0 1185 U 0 1186 C 1032 1187 A 1031 1188 U 1028 1189 G 1027 1190 C 1026 1191 C 1025 1192 C 1023 1193 C 1022 1194 U 0 1195 U 0 1196 A 0 1197 U 0 1198 G 967 1199 U 966 1200 C 965 1201 U 964 1202 U 963 1203 G 962 1204 G 961 1205 G 0 1206 C 0 1207 U 0 1208 G 932 1209 C 931 1210 A 0 1211 C 930 1212 A 929 1213 C 928 1214 G 927 1215 U 926 1216 G 925 1217 C 924 1218 U 923 1219 A 922 1220 C 921 1221 A 0 1222 A 0 1223 U 0 1224 G 1279 1225 G 1278 1226 C 1277 1227 A 1276 1228 G 1275 1229 G 1274 1230 U 1273 1231 A 0 1232 C 0 1233 A 0 1234 A 0 1235 U 0 1236 G 1267 1237 A 1266 1238 G 1265 1239 C 0 1240 U 0 1241 G 1260 1242 C 1259 1243 G 0 1244 A 0 1245 A 0 1246 G 1255 1247 C 1254 1248 C 1253 1249 G 0 1250 U 0 1251 G 0 1252 A 0 1253 G 1248 1254 G 1247 1255 C 1246 1256 G 0 1257 G 0 1258 A 0 1259 G 1242 1260 C 1241 1261 G 0 1262 A 0 1263 A 0 1264 U 0 1265 C 1238 1266 U 1237 1267 C 1236 1268 A 0 1269 A 0 1270 A 0 1271 A 0 1272 A 0 1273 G 1230 1274 C 1229 1275 C 1228 1276 U 1227 1277 G 1226 1278 U 1225 1279 C 1224 1280 U 0 1281 C 0 1282 A 0 1283 G 0 1284 U 0 1285 U 0 1286 C 1317 1287 G 0 1288 G 0 1289 A 0 1290 U 1313 1291 U 1312 1292 G 1311 1293 G 1310 1294 G 1309 1295 G 1308 1296 U 1307 1297 C 1306 1298 U 0 1299 G 0 1300 C 0 1301 A 0 1302 A 0 1303 C 0 1304 U 0 1305 C 0 1306 G 1297 1307 A 1296 1308 C 1295 1309 C 1294 1310 C 1293 1311 C 1292 1312 A 1291 1313 U 1290 1314 G 0 1315 A 0 1316 A 0 1317 G 1286 1318 U 0 1319 C 0 1320 G 0 1321 G 0 1322 A 0 1323 G 920 1324 U 919 1325 U 918 1326 G 917 1327 C 916 1328 U 0 1329 A 0 1330 G 0 1331 U 0 1332 A 0 1333 A 1356 1334 U 1355 1335 C 1354 1336 G 1353 1337 C 1352 1338 A 1351 1339 G 1350 1340 A 1349 1341 U 0 1342 C 0 1343 A 0 1344 G 0 1345 C 0 1346 A 0 1347 U 0 1348 U 0 1349 G 1340 1350 C 1339 1351 U 1338 1352 G 1337 1353 C 1336 1354 G 1335 1355 G 1334 1356 U 1333 1357 G 0 1358 A 0 1359 A 0 1360 U 0 1361 A 0 1362 C 0 1363 G 913 1364 U 912 1365 U 0 1366 C 0 1367 C 0 1368 C 910 1369 G 909 1370 G 908 1371 G 907 1372 C 906 1373 C 905 1374 U 904 1375 U 902 1376 G 901 1377 U 900 1378 A 0 1379 C 899 1380 A 898 1381 C 0 1382 A 0 1383 C 1490 1384 C 0 1385 G 1487 1386 C 1486 1387 C 0 1388 C 1483 1389 G 1482 1390 U 0 1391 C 0 1392 A 0 1393 C 1477 1394 G 1476 1395 U 1475 1396 C 1474 1397 A 1473 1398 C 1472 1399 G 1471 1400 A 1470 1401 A 0 1402 A 0 1403 G 1467 1404 U 1466 1405 C 1465 1406 G 1464 1407 G 1463 1408 U 1462 1409 A 1461 1410 A 1460 1411 C 1459 1412 A 1458 1413 C 1457 1414 C 1456 1415 C 0 1416 G 0 1417 A 0 1418 A 0 1419 G 1452 1420 C 1451 1421 C 1450 1422 G 1449 1423 G 1448 1424 U 1447 1425 G 0 1426 G 1446 1427 C 1445 1428 C 1444 1429 U 1443 1430 A 0 1431 A 0 1432 C 1441 1433 C 1440 1434 C 1439 1435 G 0 1436 U 0 1437 A 0 1438 A 0 1439 G 1434 1440 G 1433 1441 G 1432 1442 A 0 1443 G 1429 1444 G 1428 1445 G 1427 1446 A 1426 1447 G 1424 1448 C 1423 1449 U 1422 1450 G 1421 1451 U 1420 1452 C 1419 1453 G 0 1454 A 0 1455 A 0 1456 G 1414 1457 G 1413 1458 U 1412 1459 G 1411 1460 G 1410 1461 G 1409 1462 A 1408 1463 C 1407 1464 U 1406 1465 G 1405 1466 G 1404 1467 C 1403 1468 G 0 1469 A 0 1470 U 1400 1471 U 1399 1472 G 1398 1473 G 1397 1474 G 1396 1475 A 1395 1476 C 1394 1477 G 1393 1478 A 0 1479 A 0 1480 G 0 1481 U 0 1482 C 1389 1483 G 1388 1484 U 0 1485 A 0 1486 A 1386 1487 C 1385 1488 A 0 1489 A 0 1490 G 1383 1491 G 0 1492 U 1515 1493 A 1514 1494 G 1513 1495 C 1512 1496 C 1511 1497 G 1510 1498 U 1509 1499 A 1508 1500 C 1507 1501 C 1506 1502 G 0 1503 G 0 1504 A 0 1505 A 0 1506 G 1501 1507 G 1500 1508 U 1499 1509 G 1498 1510 C 1497 1511 G 1496 1512 G 1495 1513 C 1494 1514 U 1493 1515 G 1492 1516 G 0 1517 A 0 1518 U 0 1519 C 0 1520 A 0 1521 C 0 1522 C 0 1523 U 0 1524 C 0 1525 C 0 1526 U 0 1527 U 0 1528 U 0 1529 C 0 1530 U 0