Filename: d.16.b.U.urealyticum.GEN.bpseq Organism: Ureaplasma urealyticum Accession Number: AE002112 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 G 0 2 U 0 3 C 0 4 A 0 5 A 0 6 U 0 7 U 0 8 U 0 9 U 0 10 A 0 11 A 0 12 A 0 13 G 29 14 A 28 15 G 27 16 U 26 17 U 25 18 U 0 19 G 0 20 A 0 21 U 917 22 C 916 23 C 915 24 U 0 25 G 17 26 G 16 27 C 15 28 U 14 29 C 13 30 A 0 31 G 558 32 G 557 33 A 556 34 U 555 35 U 0 36 A 554 37 A 553 38 C 552 39 G 551 40 C 550 41 U 549 42 G 0 43 G 404 44 C 403 45 G 402 46 G 401 47 C 400 48 A 399 49 U 397 50 G 396 51 C 362 52 C 0 53 U 0 54 A 0 55 A 0 56 U 360 57 A 359 58 C 358 59 A 0 60 U 357 61 G 356 62 C 355 63 A 0 64 A 0 65 A 93 66 U 92 67 C 91 68 G 0 69 A 0 70 A 90 71 C 89 72 G 88 73 A 87 74 A 86 75 G 85 76 C 84 77 C 83 78 U 82 79 U 0 80 U 0 81 U 0 82 A 78 83 G 77 84 G 76 85 C 75 86 U 74 87 U 73 88 A 72 89 G 71 90 U 70 91 G 67 92 G 66 93 U 65 94 G 0 95 A 0 96 A 0 97 C 0 98 G 0 99 G 0 100 G 315 101 U 314 102 G 313 103 A 0 104 G 0 105 U 0 106 A 0 107 A 0 108 C 0 109 A 240 110 C 239 111 G 238 112 U 237 113 A 236 114 U 235 115 C 234 116 C 233 117 A 0 118 A 0 119 U 232 120 C 231 121 U 0 122 A 0 123 C 0 124 C 228 125 C 227 126 U 226 127 U 225 128 A 224 129 A 223 130 G 222 131 U 0 132 U 166 133 G 165 134 G 164 135 G 163 136 G 0 137 A 0 138 U 0 139 A 0 140 A 157 141 C 156 142 U 155 143 A 154 144 G 153 145 U 152 146 C 151 147 G 0 148 A 0 149 A 0 150 A 0 151 G 146 152 A 145 153 U 144 154 U 143 155 A 142 156 G 141 157 C 140 158 U 0 159 A 0 160 A 0 161 U 0 162 A 0 163 C 135 164 C 134 165 G 133 166 A 132 167 A 0 168 U 0 169 A 0 170 A 0 171 U 0 172 A 198 173 A 197 174 C 196 175 A 195 176 U 194 177 C 193 178 A 0 179 A 0 180 U 191 181 A 190 182 U 189 183 C 188 184 G 0 185 C 0 186 A 0 187 U 0 188 G 183 189 A 182 190 G 181 191 A 180 192 A 0 193 G 177 194 A 176 195 U 175 196 G 174 197 U 173 198 A 172 199 G 0 200 A 0 201 A 0 202 A 0 203 G 220 204 U 219 205 C 218 206 G 217 207 C 216 208 U 215 209 C 0 210 U 0 211 U 0 212 U 0 213 G 0 214 U 0 215 G 208 216 G 207 217 C 206 218 G 205 219 A 204 220 C 203 221 G 0 222 C 130 223 U 129 224 U 128 225 U 127 226 U 126 227 G 125 228 G 124 229 A 0 230 U 0 231 G 120 232 A 119 233 G 116 234 G 115 235 G 114 236 U 113 237 G 112 238 C 111 239 G 110 240 A 109 241 C 287 242 G 286 243 U 285 244 A 0 245 U 0 246 C 284 247 A 0 248 G 278 249 A 277 250 U 276 251 A 0 252 G 0 253 U 275 254 U 274 255 G 273 256 G 272 257 U 271 258 G 270 259 A 269 260 G 268 261 G 0 262 U 0 263 A 0 264 A 0 265 U 0 266 G 0 267 G 0 268 C 260 269 U 259 270 C 258 271 A 257 272 C 256 273 C 255 274 A 254 275 A 253 276 G 250 277 U 249 278 C 248 279 A 0 280 A 0 281 U 0 282 G 0 283 A 0 284 C 246 285 G 243 286 C 242 287 G 241 288 U 0 289 A 0 290 G 312 291 C 311 292 U 310 293 G 309 294 U 305 295 A 304 296 C 303 297 U 302 298 G 0 299 A 0 300 G 0 301 A 0 302 G 297 303 G 296 304 U 295 305 A 294 306 G 0 307 A 0 308 A 0 309 C 293 310 A 292 311 G 291 312 C 290 313 C 102 314 A 101 315 C 100 316 A 0 317 A 338 318 U 337 319 G 336 320 G 335 321 G 334 322 A 333 323 C 0 324 U 0 325 G 0 326 A 0 327 G 0 328 A 0 329 C 0 330 A 0 331 C 0 332 G 0 333 G 322 334 C 321 335 C 320 336 C 319 337 A 318 338 U 317 339 A 0 340 C 351 341 U 350 342 C 349 343 C 348 344 U 0 345 A 0 346 C 0 347 G 0 348 G 343 349 G 342 350 A 341 351 G 340 352 G 0 353 C 0 354 A 0 355 G 62 356 C 61 357 A 60 358 G 58 359 U 57 360 A 56 361 G 0 362 G 51 363 G 0 364 A 0 365 A 0 366 U 0 367 U 0 368 U 394 369 U 0 370 U 393 371 C 392 372 A 391 373 C 0 374 A 0 375 A 0 376 U 389 377 G 388 378 G 387 379 G 386 380 C 385 381 G 0 382 C 0 383 A 0 384 A 0 385 G 380 386 C 379 387 C 378 388 U 377 389 U 376 390 A 0 391 U 372 392 G 371 393 A 370 394 A 368 395 G 0 396 C 50 397 A 49 398 A 0 399 U 48 400 G 47 401 C 46 402 C 45 403 G 44 404 C 43 405 G 0 406 U 0 407 G 438 408 A 437 409 A 436 410 C 435 411 G 0 412 A 0 413 U 0 414 G 0 415 A 0 416 A 0 417 G 429 418 G 428 419 U 427 420 C 426 421 U 425 422 U 0 423 A 0 424 U 0 425 A 421 426 G 420 427 A 419 428 U 418 429 U 417 430 G 0 431 U 0 432 A 0 433 A 0 434 A 0 435 G 410 436 U 409 437 U 408 438 C 407 439 U 0 440 U 498 441 U 0 442 U 499 443 A 495 444 U 494 445 A 493 446 U 492 447 G 491 448 G 490 449 G 0 450 A 0 451 A 0 452 G 485 453 A 0 454 A 0 455 A 0 456 C 0 457 G 0 458 C 479 459 U 478 460 A 477 461 A 476 462 A 475 463 A 474 464 U 473 465 A 472 466 G 471 467 G 0 468 A 0 469 A 0 470 A 0 471 U 466 472 G 465 473 A 464 474 U 463 475 U 462 476 U 461 477 U 460 478 A 459 479 G 458 480 U 0 481 U 0 482 U 0 483 G 0 484 A 0 485 C 452 486 U 0 487 G 0 488 U 0 489 A 0 490 C 448 491 C 447 492 A 446 493 U 445 494 U 444 495 U 443 496 G 0 497 A 0 498 A 440 499 U 442 500 A 0 501 A 0 502 G 547 503 U 546 504 A 545 505 U 544 506 C 543 507 G 528 508 G 527 509 C 526 510 U 0 511 A 0 512 A 0 513 C 542 514 U 541 515 A 540 516 U 539 517 G 538 518 U 0 519 G 0 520 C 0 521 C 0 522 A 0 523 G 530 524 C 529 525 A 0 526 G 509 527 C 508 528 C 507 529 G 524 530 C 523 531 G 0 532 G 0 533 U 0 534 A 0 535 A 0 536 U 0 537 A 0 538 C 517 539 A 516 540 U 515 541 A 514 542 G 513 543 G 506 544 A 505 545 U 504 546 G 503 547 C 502 548 A 0 549 A 41 550 G 40 551 C 39 552 G 38 553 U 37 554 U 36 555 A 34 556 U 33 557 C 32 558 C 31 559 G 0 560 G 0 561 A 0 562 U 0 563 U 0 564 U 0 565 A 0 566 C 0 567 U 0 568 G 0 569 G 881 570 G 880 571 C 879 572 G 864 573 U 863 574 A 0 575 A 0 576 A 0 577 A 878 578 C 0 579 G 765 580 A 764 581 G 763 582 C 762 583 G 0 584 C 759 585 A 0 586 G 758 587 G 757 588 C 756 589 G 0 590 G 652 591 G 651 592 U 650 593 U 649 594 U 648 595 G 647 596 U 646 597 A 0 598 A 645 599 G 644 600 U 641 601 U 640 602 U 639 603 G 638 604 G 637 605 U 636 606 A 635 607 U 634 608 U 633 609 A 0 610 A 0 611 A 0 612 U 0 613 C 631 614 U 630 615 A 629 616 G 628 617 A 627 618 U 626 619 G 625 620 C 0 621 U 0 622 U 0 623 A 0 624 A 0 625 C 619 626 G 618 627 U 617 628 C 616 629 U 615 630 A 614 631 G 613 632 C 0 633 U 608 634 G 607 635 U 606 636 A 605 637 U 604 638 C 603 639 A 602 640 A 601 641 A 600 642 A 0 643 A 0 644 C 599 645 U 598 646 G 596 647 U 595 648 A 594 649 A 593 650 A 592 651 C 591 652 C 590 653 U 0 654 A 0 655 G 0 656 A 752 657 G 751 658 U 750 659 G 748 660 U 747 661 A 746 662 G 745 663 U 744 664 A 743 665 G 0 666 G 0 667 G 741 668 A 740 669 G 739 670 U 738 671 U 737 672 G 736 673 G 735 674 G 718 675 G 717 676 A 0 677 A 0 678 C 714 679 U 713 680 C 712 681 C 711 682 A 710 683 U 709 684 G 708 685 U 707 686 G 0 687 G 0 688 A 0 689 G 700 690 C 699 691 G 698 692 G 0 693 U 0 694 A 0 695 A 0 696 A 0 697 A 0 698 U 691 699 G 690 700 C 689 701 G 0 702 U 0 703 A 0 704 G 0 705 A 0 706 U 0 707 A 685 708 U 684 709 A 683 710 U 682 711 G 681 712 G 680 713 A 679 714 A 678 715 G 0 716 A 0 717 A 675 718 C 674 719 A 0 720 C 0 721 C 0 722 G 0 723 G 734 724 U 0 725 G 0 726 G 733 727 C 732 728 G 0 729 A 0 730 A 0 731 G 0 732 G 727 733 C 726 734 G 723 735 C 673 736 C 672 737 A 671 738 A 670 739 C 669 740 U 668 741 U 667 742 G 0 743 G 664 744 A 663 745 C 662 746 U 661 747 A 660 748 U 659 749 C 0 750 A 658 751 C 657 752 U 656 753 G 0 754 A 0 755 C 0 756 G 588 757 C 587 758 U 586 759 U 584 760 A 0 761 G 0 762 G 582 763 C 581 764 U 580 765 C 579 766 G 0 767 A 0 768 A 0 769 A 0 770 G 811 771 U 810 772 G 809 773 U 808 774 G 807 775 G 806 776 G 0 777 G 0 778 A 0 779 G 805 780 C 804 781 A 0 782 A 0 783 A 0 784 U 800 785 A 799 786 G 798 787 G 797 788 A 0 789 U 0 790 U 0 791 A 0 792 G 0 793 A 0 794 U 0 795 A 0 796 C 0 797 C 787 798 C 786 799 U 785 800 A 784 801 G 0 802 U 0 803 A 0 804 G 780 805 U 779 806 C 775 807 C 774 808 A 773 809 C 772 810 A 771 811 C 770 812 C 0 813 G 0 814 U 0 815 A 0 816 A 0 817 A 0 818 C 0 819 G 0 820 A 0 821 U 0 822 C 877 823 A 876 824 U 875 825 C 874 826 A 873 827 U 872 828 U 0 829 A 0 830 A 855 831 A 854 832 U 853 833 G 852 834 U 851 835 C 850 836 G 849 837 G 848 838 C 847 839 C 846 840 C 845 841 G 0 842 A 0 843 A 0 844 U 0 845 G 840 846 G 839 847 G 838 848 U 837 849 C 836 850 G 835 851 G 834 852 U 833 853 G 832 854 U 831 855 U 830 856 G 0 857 U 0 858 A 0 859 G 866 860 C 865 861 U 0 862 A 0 863 A 573 864 C 572 865 G 860 866 C 859 867 A 0 868 U 0 869 U 0 870 A 0 871 A 0 872 A 827 873 U 826 874 G 825 875 A 824 876 U 823 877 G 822 878 U 577 879 G 571 880 C 570 881 C 569 882 U 0 883 G 910 884 G 909 885 G 908 886 U 0 887 A 0 888 G 0 889 U 0 890 A 0 891 C 0 892 A 903 893 U 902 894 U 901 895 C 900 896 G 0 897 C 0 898 A 0 899 A 0 900 G 895 901 A 894 902 A 893 903 U 892 904 G 0 905 A 0 906 A 0 907 A 0 908 C 885 909 U 884 910 C 883 911 A 0 912 A 0 913 A 0 914 C 0 915 G 23 916 G 22 917 A 21 918 A 0 919 U 0 920 U 1375 921 G 1374 922 A 1372 923 C 1371 924 G 1370 925 G 0 926 G 1369 927 G 1368 928 A 1367 929 C 1366 930 C 1365 931 C 1364 932 G 1363 933 C 0 934 A 1359 935 C 1358 936 A 0 937 A 0 938 G 1322 939 U 1321 940 G 1320 941 G 1319 942 U 1318 943 G 1215 944 G 1214 945 A 1213 946 G 1212 947 C 1211 948 A 1210 949 U 1209 950 G 1208 951 U 1207 952 U 1206 953 G 1204 954 C 1203 955 U 0 956 U 0 957 A 0 958 A 0 959 U 974 960 U 973 961 U 972 962 G 971 963 A 0 964 C 0 965 A 0 966 A 0 967 U 0 968 A 0 969 C 0 970 A 0 971 C 962 972 G 961 973 U 960 974 A 959 975 G 0 976 A 0 977 A 0 978 C 0 979 C 0 980 U 0 981 U 0 982 A 0 983 C 1199 984 C 1198 985 U 1197 986 A 1196 987 G 1195 988 G 1194 989 U 1193 990 U 0 991 U 0 992 G 0 993 A 0 994 C 0 995 A 1040 996 U 1039 997 C 1038 998 U 1036 999 A 1035 1000 U 1034 1001 U 1033 1002 G 1032 1003 C 0 1004 G 0 1005 A 0 1006 U 1023 1007 G 1022 1008 C 1021 1009 U 1020 1010 A 1019 1011 U 1018 1012 A 1017 1013 G 0 1014 A 0 1015 A 0 1016 A 0 1017 U 1012 1018 A 1011 1019 U 1010 1020 A 1009 1021 G 1008 1022 U 1007 1023 U 1006 1024 G 0 1025 A 0 1026 G 0 1027 G 0 1028 U 0 1029 U 0 1030 A 0 1031 A 0 1032 C 1002 1033 A 1001 1034 A 1000 1035 U 999 1036 A 998 1037 U 0 1038 G 997 1039 A 996 1040 C 995 1041 A 0 1042 G 1188 1043 G 1187 1044 U 0 1045 G 1186 1046 G 1185 1047 U 1184 1048 G 1183 1049 C 0 1050 A 0 1051 U 1182 1052 G 1181 1053 G 1177 1054 U 1176 1055 U 1175 1056 G 1173 1057 U 1172 1058 C 1171 1059 G 1170 1060 U 0 1061 C 0 1062 A 0 1063 G 1102 1064 C 1101 1065 U 1100 1066 C 1099 1067 G 1098 1068 U 1097 1069 G 1078 1070 U 1077 1071 C 1076 1072 G 0 1073 U 0 1074 G 0 1075 A 0 1076 G 1071 1077 A 1070 1078 U 1069 1079 G 0 1080 U 0 1081 U 1094 1082 G 1093 1083 G 1092 1084 G 1091 1085 U 0 1086 U 0 1087 A 0 1088 A 0 1089 G 0 1090 U 0 1091 C 1084 1092 C 1083 1093 C 1082 1094 G 1081 1095 C 0 1096 A 0 1097 A 1068 1098 C 1067 1099 G 1066 1100 A 1065 1101 G 1064 1102 C 1063 1103 G 0 1104 C 0 1105 A 0 1106 A 0 1107 C 0 1108 C 1165 1109 C 1164 1110 C 1163 1111 U 1162 1112 U 0 1113 U 1134 1114 C 1133 1115 G 1132 1116 U 1131 1117 U 1130 1118 A 1129 1119 G 1128 1120 U 0 1121 U 0 1122 A 0 1123 C 0 1124 U 0 1125 U 0 1126 U 0 1127 U 0 1128 C 1119 1129 U 1118 1130 A 1117 1131 G 1116 1132 C 1115 1133 G 1114 1134 A 1113 1135 U 0 1136 A 0 1137 C 1156 1138 U 1155 1139 G 1154 1140 C 1153 1141 U 1152 1142 A 1151 1143 C 1150 1144 C 1149 1145 G 0 1146 C 0 1147 A 0 1148 A 0 1149 G 1144 1150 G 1143 1151 U 1142 1152 A 1141 1153 G 1140 1154 A 1139 1155 G 1138 1156 G 1137 1157 A 0 1158 A 0 1159 G 0 1160 G 0 1161 U 0 1162 G 1111 1163 G 1110 1164 G 1109 1165 G 1108 1166 A 0 1167 U 0 1168 G 0 1169 A 0 1170 C 1059 1171 G 1058 1172 U 1057 1173 C 1056 1174 A 0 1175 A 1055 1176 A 1054 1177 U 1053 1178 C 0 1179 A 0 1180 U 0 1181 C 1052 1182 A 1051 1183 U 1048 1184 G 1047 1185 C 1046 1186 C 1045 1187 C 1043 1188 C 1042 1189 U 0 1190 U 0 1191 A 0 1192 U 0 1193 A 989 1194 U 988 1195 C 987 1196 U 986 1197 A 985 1198 G 984 1199 G 983 1200 G 0 1201 C 0 1202 U 0 1203 G 954 1204 C 953 1205 A 0 1206 A 952 1207 A 951 1208 C 950 1209 G 949 1210 U 948 1211 G 947 1212 C 946 1213 U 945 1214 A 944 1215 C 943 1216 A 0 1217 A 0 1218 U 0 1219 G 1274 1220 G 1273 1221 C 1272 1222 U 1271 1223 A 1270 1224 A 1269 1225 U 1268 1226 A 0 1227 C 0 1228 A 0 1229 A 0 1230 A 0 1231 C 1262 1232 U 1261 1233 G 1260 1234 C 0 1235 U 0 1236 G 1255 1237 C 1254 1238 A 0 1239 A 0 1240 A 0 1241 A 1250 1242 U 1249 1243 C 1248 1244 G 0 1245 U 0 1246 A 0 1247 A 0 1248 G 1243 1249 A 1242 1250 U 1241 1251 G 0 1252 A 0 1253 A 0 1254 G 1237 1255 C 1236 1256 G 0 1257 A 0 1258 A 0 1259 A 0 1260 C 1233 1261 A 1232 1262 G 1231 1263 A 0 1264 A 0 1265 A 0 1266 A 0 1267 A 0 1268 G 1225 1269 U 1224 1270 U 1223 1271 A 1222 1272 G 1221 1273 U 1220 1274 C 1219 1275 U 0 1276 C 0 1277 A 0 1278 G 0 1279 U 0 1280 U 0 1281 C 1312 1282 G 0 1283 G 0 1284 A 0 1285 U 1308 1286 A 1307 1287 G 1306 1288 A 1305 1289 G 1304 1290 G 1303 1291 G 1302 1292 C 1301 1293 U 0 1294 G 0 1295 C 0 1296 A 0 1297 A 0 1298 U 0 1299 U 0 1300 C 0 1301 G 1292 1302 U 1291 1303 C 1290 1304 C 1289 1305 U 1288 1306 C 1287 1307 U 1286 1308 U 1285 1309 G 0 1310 A 0 1311 A 0 1312 G 1281 1313 U 0 1314 U 0 1315 G 0 1316 G 0 1317 A 0 1318 A 942 1319 U 941 1320 C 940 1321 A 939 1322 C 938 1323 U 0 1324 A 0 1325 G 0 1326 U 0 1327 A 0 1328 A 1351 1329 U 1350 1330 C 1349 1331 G 1348 1332 C 1347 1333 G 1346 1334 A 1345 1335 A 1344 1336 U 0 1337 C 0 1338 A 0 1339 G 0 1340 A 0 1341 C 0 1342 A 0 1343 U 0 1344 G 1335 1345 U 1334 1346 C 1333 1347 G 1332 1348 C 1331 1349 G 1330 1350 G 1329 1351 U 1328 1352 G 0 1353 A 0 1354 A 0 1355 U 0 1356 A 0 1357 C 0 1358 G 935 1359 U 934 1360 U 0 1361 C 0 1362 U 0 1363 C 932 1364 G 931 1365 G 930 1366 G 929 1367 U 928 1368 C 927 1369 U 926 1370 U 924 1371 G 923 1372 U 922 1373 A 0 1374 C 921 1375 A 920 1376 C 0 1377 A 0 1378 C 1483 1379 C 0 1380 G 1480 1381 C 1479 1382 C 0 1383 C 1476 1384 G 1475 1385 U 0 1386 C 0 1387 A 0 1388 A 1470 1389 A 1469 1390 C 1468 1391 U 1467 1392 A 1466 1393 U 1465 1394 G 1464 1395 G 1463 1396 G 0 1397 A 0 1398 G 1460 1399 C 1459 1400 U 1458 1401 G 1457 1402 G 1456 1403 U 1455 1404 A 1454 1405 A 1453 1406 U 1452 1407 A 1451 1408 U 1450 1409 C 1449 1410 U 0 1411 A 0 1412 A 0 1413 A 0 1414 A 1445 1415 C 1444 1416 C 1443 1417 G 1442 1418 C 1441 1419 A 1440 1420 A 0 1421 A 1439 1422 G 1438 1423 C 1437 1424 U 1436 1425 A 0 1426 A 0 1427 C 1434 1428 C 1433 1429 U 0 1430 U 0 1431 U 0 1432 U 0 1433 G 1428 1434 G 1427 1435 A 0 1436 G 1424 1437 G 1423 1438 C 1422 1439 A 1421 1440 U 1419 1441 G 1418 1442 C 1417 1443 G 1416 1444 U 1415 1445 C 1414 1446 U 0 1447 A 0 1448 G 0 1449 G 1409 1450 G 1408 1451 U 1407 1452 A 1406 1453 G 1405 1454 G 1404 1455 A 1403 1456 U 1402 1457 C 1401 1458 G 1400 1459 G 1399 1460 U 1398 1461 G 0 1462 A 0 1463 C 1395 1464 U 1394 1465 G 1393 1466 G 1392 1467 A 1391 1468 G 1390 1469 U 1389 1470 U 1388 1471 A 0 1472 A 0 1473 G 0 1474 U 0 1475 C 1384 1476 G 1383 1477 U 0 1478 A 0 1479 A 1381 1480 C 1380 1481 A 0 1482 A 0 1483 G 1378 1484 G 0 1485 U 1508 1486 A 1507 1487 U 1506 1488 C 1505 1489 C 1504 1490 C 1503 1491 U 1502 1492 A 1501 1493 C 1500 1494 G 1499 1495 A 0 1496 G 0 1497 A 0 1498 A 0 1499 C 1494 1500 G 1493 1501 U 1492 1502 G 1491 1503 G 1490 1504 G 1489 1505 G 1488 1506 A 1487 1507 U 1486 1508 G 1485 1509 G 0 1510 A 0 1511 U 0 1512 C 0 1513 A 0 1514 C 0 1515 C 0 1516 U 0 1517 C 0 1518 C 0 1519 U 0 1520 U 0 1521 U 0 1522 C 0 1523 U 0 1524 U 0 1525 C 0 1526 G 0 1527 G 0 1528 A 0 1529 G 0 1530 U 0 1531 A 0 1532 A 0 1533 A 0 1534 U 0 1535 U 0 1536 U 0 1537 U 0 1538 U 0 1539 A 0 1540 A 0 1541 U 0 1542 U 0 1543 U 0 1544 A 0 1545 C 0