Filename: d.16.b.V.parahaemolyticus.bpseq
Organism: Vibrio parahaemolyticus
Accession Number: X56580
Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu
1 A 0
2 A 0
3 A 0
4 U 0
5 U 0
6 G 0
7 A 0
8 A 0
9 G 25
10 A 24
11 G 23
12 U 22
13 U 21
14 U 0
15 G 0
16 A 0
17 U 927
18 C 926
19 A 925
20 U 0
21 G 13
22 G 12
23 C 11
24 U 10
25 C 9
26 A 0
27 G 565
28 A 564
29 U 563
30 U 562
31 G 0
32 A 561
33 A 560
34 C 559
35 G 558
36 C 557
37 U 556
38 G 0
39 G 412
40 C 411
41 G 410
42 G 409
43 C 408
44 A 407
45 G 405
46 G 404
47 C 370
48 C 0
49 U 0
50 A 0
51 A 0
52 C 368
53 A 367
54 C 366
55 A 0
56 U 365
57 G 364
58 C 363
59 A 0
60 A 0
61 G 115
62 U 114
63 C 113
64 G 0
65 A 0
66 G 112
67 C 111
68 G 110
69 G 108
70 A 107
71 A 0
72 A 0
73 C 106
74 G 105
75 A 104
76 G 102
77 U 101
78 U 100
79 A 99
80 U 98
81 C 97
82 U 95
83 G 94
84 A 93
85 A 92
86 C 91
87 U 0
88 U 0
89 C 0
90 G 0
91 G 86
92 G 85
93 G 84
94 A 83
95 A 82
96 C 0
97 G 81
98 A 80
99 U 79
100 A 78
101 A 77
102 C 76
103 G 0
104 G 75
105 C 74
106 G 73
107 U 70
108 C 69
109 G 0
110 A 68
111 G 67
112 C 66
113 G 63
114 G 62
115 C 61
116 G 0
117 G 0
118 A 0
119 C 0
120 G 0
121 G 0
122 G 323
123 U 322
124 G 321
125 A 0
126 G 0
127 U 0
128 A 0
129 A 0
130 U 0
131 G 248
132 C 247
133 C 246
134 U 245
135 A 244
136 G 243
137 G 242
138 A 241
139 A 0
140 A 240
141 U 239
142 U 0
143 G 0
144 C 0
145 C 236
146 C 235
147 U 234
148 G 233
149 A 232
150 U 231
151 G 230
152 U 0
153 G 187
154 G 186
155 G 185
156 G 184
157 G 0
158 A 0
159 U 0
160 A 0
161 A 178
162 C 177
163 C 176
164 A 175
165 U 174
166 U 173
167 G 172
168 G 0
169 A 0
170 A 0
171 A 0
172 C 167
173 G 166
174 A 165
175 U 164
176 G 163
177 G 162
178 C 161
179 U 0
180 A 0
181 A 0
182 U 0
183 A 0
184 C 156
185 C 155
186 G 154
187 C 153
188 A 0
189 U 0
190 G 0
191 A 0
192 U 0
193 A 202
194 G 201
195 C 200
196 U 0
197 U 0
198 C 0
199 G 0
200 G 195
201 C 194
202 U 193
203 U 0
204 A 0
205 A 0
206 A 0
207 G 228
208 A 227
209 G 226
210 G 225
211 G 224
212 G 223
213 G 0
214 A 0
215 C 222
216 C 221
217 U 0
218 U 0
219 U 0
220 G 0
221 G 216
222 G 215
223 C 212
224 C 211
225 U 210
226 C 209
227 U 208
228 C 207
229 G 0
230 C 151
231 G 150
232 U 149
233 C 148
234 A 147
235 G 146
236 G 145
237 A 0
238 U 0
239 A 141
240 U 140
241 G 138
242 C 137
243 C 136
244 C 135
245 A 134
246 G 133
247 G 132
248 U 131
249 G 295
250 G 294
251 G 293
252 A 0
253 U 0
254 U 292
255 A 0
256 G 286
257 C 285
258 U 284
259 N 0
260 G 0
261 U 283
262 U 282
263 G 281
264 G 280
265 U 279
266 G 278
267 A 277
268 G 276
269 G 0
270 U 0
271 A 0
272 A 0
273 G 0
274 G 0
275 G 0
276 C 268
277 U 267
278 C 266
279 A 265
280 C 264
281 U 263
282 A 262
283 A 261
284 G 258
285 G 257
286 C 256
287 G 0
288 A 0
289 C 0
290 G 0
291 A 0
292 U 254
293 C 251
294 C 250
295 C 249
296 U 0
297 A 0
298 G 320
299 C 319
300 U 318
301 U 317
302 G 313
303 U 312
304 C 311
305 U 310
306 G 0
307 A 0
308 G 0
309 A 0
310 G 305
311 G 304
312 A 303
313 U 302
314 G 0
315 A 0
316 U 0
317 C 301
318 A 300
319 G 299
320 C 298
321 C 124
322 A 123
323 C 122
324 A 0
325 C 346
326 U 345
327 G 344
328 G 343
329 A 342
330 A 341
331 C 0
332 U 0
333 G 0
334 A 0
335 G 0
336 A 0
337 C 0
338 A 0
339 C 0
340 G 0
341 G 330
342 U 329
343 C 328
344 C 327
345 A 326
346 G 325
347 A 0
348 C 359
349 U 358
350 C 357
351 C 356
352 U 0
353 A 0
354 C 0
355 G 0
356 G 351
357 G 350
358 A 349
359 G 348
360 G 0
361 C 0
362 A 0
363 G 58
364 C 57
365 A 56
366 G 54
367 U 53
368 G 52
369 G 0
370 G 47
371 G 0
372 A 0
373 A 0
374 U 0
375 A 0
376 U 402
377 U 0
378 G 401
379 C 400
380 A 399
381 C 0
382 A 0
383 A 0
384 U 397
385 G 396
386 G 395
387 G 394
388 C 393
389 G 0
390 C 0
391 A 0
392 A 0
393 G 388
394 C 387
395 C 386
396 U 385
397 G 384
398 A 0
399 U 380
400 G 379
401 C 378
402 A 376
403 G 0
404 C 46
405 C 45
406 A 0
407 U 44
408 G 43
409 C 42
410 C 41
411 G 40
412 C 39
413 G 0
414 U 0
415 G 445
416 U 444
417 G 443
418 U 442
419 G 0
420 A 0
421 A 0
422 G 0
423 A 0
424 A 0
425 G 436
426 G 435
427 C 434
428 C 433
429 U 0
430 U 0
431 C 0
432 G 0
433 G 428
434 G 427
435 U 426
436 U 425
437 G 0
438 U 0
439 A 0
440 A 0
441 A 0
442 G 418
443 C 417
444 A 416
445 C 415
446 U 0
447 U 505
448 U 0
449 C 506
450 A 502
451 G 501
452 C 500
453 C 499
454 G 498
455 U 497
456 G 0
457 A 0
458 G 0
459 G 492
460 A 0
461 A 0
462 G 0
463 G 0
464 U 486
465 G 485
466 G 484
467 C 483
468 A 482
469 G 481
470 U 480
471 G 479
472 U 0
473 U 0
474 A 0
475 A 0
476 U 0
477 A 0
478 G 0
479 C 471
480 A 470
481 C 469
482 C 468
483 A 467
484 U 466
485 C 465
486 A 464
487 U 0
488 U 0
489 U 0
490 G 0
491 A 0
492 C 459
493 G 0
494 U 0
495 U 0
496 A 0
497 G 455
498 C 454
499 G 453
500 C 452
501 C 451
502 A 450
503 G 0
504 A 0
505 A 447
506 G 449
507 A 0
508 A 0
509 G 554
510 C 553
511 A 552
512 C 551
513 C 550
514 G 535
515 G 534
516 C 533
517 U 0
518 A 0
519 A 0
520 C 549
521 U 548
522 C 547
523 C 546
524 G 545
525 U 0
526 G 0
527 C 0
528 C 0
529 A 0
530 G 537
531 C 536
532 A 0
533 G 516
534 C 515
535 C 514
536 G 531
537 C 530
538 G 0
539 G 0
540 U 0
541 A 0
542 A 0
543 U 0
544 A 0
545 C 524
546 G 523
547 G 522
548 A 521
549 G 520
550 G 513
551 G 512
552 U 511
553 G 510
554 C 509
555 G 0
556 A 37
557 G 36
558 C 35
559 G 34
560 U 33
561 U 32
562 A 30
563 A 29
564 U 28
565 C 27
566 G 0
567 G 0
568 A 0
569 A 0
570 U 0
571 U 0
572 A 0
573 C 0
574 U 0
575 G 0
576 G 892
577 G 891
578 C 890
579 G 875
580 U 874
581 A 0
582 A 0
583 A 0
584 G 889
585 C 0
586 G 773
587 C 772
588 A 771
589 U 770
590 G 0
591 C 767
592 A 0
593 G 766
594 G 765
595 U 764
596 G 0
597 G 660
598 U 659
599 U 658
600 U 657
601 G 656
602 U 655
603 U 654
604 A 0
605 A 653
606 G 652
607 U 649
608 C 648
609 A 647
610 G 646
611 A 645
612 U 644
613 G 643
614 U 642
615 G 641
616 A 0
617 A 0
618 A 0
619 G 0
620 C 638
621 C 637
622 C 636
623 G 635
624 G 634
625 G 633
626 G 632
627 C 0
628 U 0
629 C 0
630 A 0
631 A 0
632 C 626
633 C 625
634 U 624
635 C 623
636 G 622
637 G 621
638 A 620
639 A 0
640 U 0
641 U 615
642 G 614
643 C 613
644 A 612
645 U 611
646 U 610
647 U 609
648 G 608
649 A 607
650 A 0
651 A 0
652 C 606
653 U 605
654 G 603
655 G 602
656 C 601
657 A 600
658 G 599
659 A 598
660 C 597
661 U 0
662 A 0
663 G 0
664 A 760
665 G 759
666 U 758
667 A 757
668 C 755
669 U 754
670 G 753
671 U 752
672 A 751
673 G 0
674 A 0
675 G 749
676 G 748
677 G 747
678 G 746
679 G 745
680 G 744
681 U 743
682 A 726
683 G 725
684 A 0
685 A 0
686 U 722
687 U 721
688 U 720
689 C 719
690 A 718
691 G 717
692 G 716
693 U 715
694 G 0
695 U 0
696 A 0
697 G 708
698 C 707
699 G 706
700 G 0
701 A 0
702 G 0
703 A 0
704 A 0
705 A 0
706 U 699
707 G 698
708 C 697
709 G 0
710 U 0
711 A 0
712 G 0
713 A 0
714 G 0
715 A 693
716 U 692
717 C 691
718 U 690
719 G 689
720 A 688
721 A 687
722 G 686
723 G 0
724 A 0
725 A 683
726 U 682
727 A 0
728 C 0
729 C 0
730 G 0
731 G 742
732 U 0
733 G 0
734 G 741
735 C 740
736 G 0
737 A 0
738 A 0
739 G 0
740 G 735
741 C 734
742 G 731
743 G 681
744 C 680
745 C 679
746 C 678
747 C 677
748 C 676
749 U 675
750 G 0
751 G 672
752 A 671
753 C 670
754 A 669
755 G 668
756 A 0
757 U 667
758 A 666
759 C 665
760 U 664
761 G 0
762 A 0
763 C 0
764 A 595
765 C 594
766 U 593
767 C 591
768 A 0
769 G 0
770 A 589
771 U 588
772 G 587
773 C 586
774 G 0
775 A 0
776 A 0
777 A 0
778 G 819
779 C 818
780 G 817
781 U 816
782 G 815
783 G 814
784 G 0
785 G 0
786 A 0
787 G 813
788 C 812
789 A 0
790 A 0
791 A 0
792 C 808
793 A 807
794 G 806
795 G 805
796 A 0
797 U 0
798 U 0
799 A 0
800 G 0
801 A 0
802 U 0
803 A 0
804 C 0
805 C 795
806 C 794
807 U 793
808 N 792
809 G 0
810 U 0
811 C 0
812 G 788
813 U 787
814 C 783
815 C 782
816 A 781
817 C 780
818 G 779
819 C 778
820 C 0
821 G 0
822 U 0
823 A 0
824 A 0
825 A 0
826 C 0
827 G 0
828 A 0
829 U 0
830 G 888
831 U 887
832 G 886
833 U 885
834 A 884
835 C 883
836 U 0
837 U 0
838 G 866
839 G 865
840 A 864
841 G 863
842 G 862
843 U 861
844 U 860
845 G 859
846 U 858
847 G 857
848 G 856
849 C 855
850 C 0
851 U 0
852 U 0
853 G 0
854 A 0
855 G 849
856 C 848
857 C 847
858 G 846
859 U 845
860 G 844
861 G 843
862 C 842
863 U 841
864 U 840
865 U 839
866 C 838
867 G 0
868 G 0
869 A 0
870 G 877
871 C 876
872 U 0
873 A 0
874 A 580
875 C 579
876 G 871
877 C 870
878 G 0
879 U 0
880 U 0
881 A 0
882 A 0
883 G 835
884 U 834
885 A 833
886 C 832
887 A 831
888 C 830
889 C 584
890 G 578
891 C 577
892 C 576
893 U 0
894 G 921
895 G 920
896 G 919
897 G 0
898 A 0
899 G 0
900 U 0
901 A 0
902 C 0
903 G 914
904 G 913
905 U 912
906 C 911
907 G 0
908 C 0
909 A 0
910 A 0
911 G 906
912 A 905
913 U 904
914 U 903
915 A 0
916 A 0
917 A 0
918 A 0
919 C 896
920 U 895
921 C 894
922 A 0
923 A 0
924 A 0
925 U 19
926 G 18
927 A 17
928 A 0
929 U 0
930 U 1402
931 G 1401
932 A 1399
933 C 1398
934 G 1397
935 G 0
936 G 1396
937 G 1395
938 G 1394
939 C 1393
940 C 1392
941 C 1391
942 G 1390
943 C 0
944 A 1386
945 C 1385
946 A 0
947 A 0
948 G 1350
949 C 1349
950 G 1348
951 G 1347
952 U 1346
953 G 1245
954 G 1244
955 A 1243
956 G 1242
957 C 1241
958 A 1240
959 U 1239
960 G 1238
961 U 1237
962 G 1236
963 G 1234
964 U 1233
965 U 0
966 U 0
967 A 0
968 A 0
969 U 984
970 U 983
971 C 982
972 G 981
973 A 0
974 G 0
975 G 0
976 C 0
977 A 0
978 A 0
979 C 0
980 G 0
981 C 972
982 G 971
983 A 970
984 A 969
985 G 0
986 A 0
987 A 0
988 C 0
989 C 0
990 U 0
991 U 0
992 A 0
993 C 1229
994 C 1228
995 U 1227
996 A 1226
997 C 1225
998 U 1224
999 C 1223
1000 U 0
1001 U 0
1002 G 0
1003 A 0
1004 C 0
1005 A 1052
1006 U 1051
1007 C 1050
1008 C 1048
1009 A 1047
1010 G 1046
1011 A 1045
1012 G 1044
1013 A 0
1014 A 0
1015 C 1032
1016 U 1031
1017 U 1030
1018 U 1029
1019 C 1028
1020 C 1027
1021 A 1026
1022 G 0
1023 A 0
1024 G 0
1025 A 0
1026 U 1021
1027 G 1020
1028 A 1019
1029 U 1018
1030 U 1017
1031 G 1016
1032 G 1015
1033 U 1043
1034 G 1042
1035 C 1041
1036 U 0
1037 U 0
1038 C 0
1039 G 0
1040 G 0
1041 G 1035
1042 A 1034
1043 A 1033
1044 C 1012
1045 U 1011
1046 C 1010
1047 U 1009
1048 G 1008
1049 A 0
1050 G 1007
1051 A 1006
1052 C 1005
1053 A 0
1054 G 1218
1055 G 1217
1056 U 0
1057 G 1216
1058 C 1215
1059 U 1214
1060 G 1213
1061 C 0
1062 A 0
1063 U 1212
1064 G 1211
1065 G 1207
1066 C 1206
1067 U 1205
1068 G 1203
1069 U 1202
1070 C 1201
1071 G 1200
1072 U 0
1073 C 0
1074 A 0
1075 G 1114
1076 C 1113
1077 U 1112
1078 C 1111
1079 G 1110
1080 U 1109
1081 G 1090
1082 U 1089
1083 U 1088
1084 G 0
1085 U 0
1086 G 0
1087 A 0
1088 A 1083
1089 A 1082
1090 U 1081
1091 G 0
1092 U 0
1093 U 1106
1094 G 1105
1095 G 1104
1096 G 1103
1097 U 0
1098 U 0
1099 A 0
1100 A 0
1101 G 0
1102 U 0
1103 C 1096
1104 C 1095
1105 C 1094
1106 G 1093
1107 C 0
1108 A 0
1109 A 1080
1110 C 1079
1111 G 1078
1112 A 1077
1113 G 1076
1114 C 1075
1115 G 0
1116 C 0
1117 A 0
1118 A 0
1119 C 0
1120 C 1195
1121 C 1194
1122 U 1193
1123 U 1192
1124 A 0
1125 U 1163
1126 C 1162
1127 C 1161
1128 U 1160
1129 U 1159
1130 G 1158
1131 U 1157
1132 U 0
1133 U 0
1134 G 0
1135 C 1152
1136 C 1151
1137 A 0
1138 G 0
1139 C 1150
1140 G 1149
1141 A 1148
1142 G 0
1143 U 0
1144 A 0
1145 A 0
1146 U 0
1147 G 0
1148 U 1141
1149 C 1140
1150 G 1139
1151 G 1136
1152 G 1135
1153 A 0
1154 A 0
1155 C 0
1156 U 0
1157 C 1131
1158 C 1130
1159 A 1129
1160 G 1128
1161 G 1127
1162 G 1126
1163 A 1125
1164 G 0
1165 A 0
1166 C 1186
1167 U 1185
1168 G 1184
1169 C 1183
1170 C 1182
1171 G 1181
1172 G 1180
1173 U 1179
1174 G 0
1175 A 0
1176 U 0
1177 A 0
1178 A 0
1179 A 1173
1180 C 1172
1181 C 1171
1182 G 1170
1183 G 1169
1184 A 1168
1185 G 1167
1186 G 1166
1187 A 0
1188 A 0
1189 G 0
1190 G 0
1191 U 0
1192 G 1123
1193 G 1122
1194 G 1121
1195 G 1120
1196 A 0
1197 C 0
1198 G 0
1199 A 0
1200 C 1071
1201 G 1070
1202 U 1069
1203 C 1068
1204 A 0
1205 A 1067
1206 G 1066
1207 U 1065
1208 C 0
1209 A 0
1210 U 0
1211 C 1064
1212 A 1063
1213 U 1060
1214 G 1059
1215 G 1058
1216 C 1057
1217 C 1055
1218 C 1054
1219 U 0
1220 U 0
1221 A 0
1222 C 0
1223 G 999
1224 A 998
1225 G 997
1226 U 996
1227 A 995
1228 G 994
1229 G 993
1230 G 0
1231 C 0
1232 U 0
1233 A 964
1234 C 963
1235 A 0
1236 C 962
1237 A 961
1238 C 960
1239 G 959
1240 U 958
1241 G 957
1242 C 956
1243 U 955
1244 A 954
1245 C 953
1246 A 0
1247 A 0
1248 U 0
1249 G 1304
1250 G 1303
1251 C 1302
1252 G 1301
1253 C 1300
1254 A 1299
1255 U 1298
1256 A 0
1257 C 0
1258 A 0
1259 G 0
1260 A 0
1261 G 1292
1262 G 1291
1263 G 1290
1264 C 0
1265 A 0
1266 G 1285
1267 C 1284
1268 C 0
1269 A 0
1270 A 0
1271 C 1280
1272 A 1279
1273 A 1278
1274 G 0
1275 C 0
1276 G 0
1277 A 0
1278 A 1273
1279 A 1272
1280 G 1271
1281 U 0
1282 G 0
1283 A 0
1284 G 1267
1285 C 1266
1286 G 0
1287 A 0
1288 A 0
1289 U 0
1290 C 1263
1291 C 1262
1292 C 1261
1293 A 0
1294 A 0
1295 A 0
1296 A 0
1297 A 0
1298 G 1255
1299 U 1254
1300 G 1253
1301 C 1252
1302 G 1251
1303 U 1250
1304 C 1249
1305 G 0
1306 U 0
1307 A 0
1308 G 0
1309 U 0
1310 C 0
1311 C 1340
1312 A 0
1313 U 1336
1314 U 1335
1315 G 1334
1316 G 1333
1317 A 1332
1318 G 1331
1319 U 1330
1320 C 1329
1321 U 0
1322 G 0
1323 C 0
1324 A 0
1325 A 0
1326 C 0
1327 U 0
1328 C 0
1329 G 1320
1330 A 1319
1331 C 1318
1332 U 1317
1333 C 1316
1334 C 1315
1335 A 1314
1336 U 1313
1337 G 0
1338 A 0
1339 A 0
1340 G 1311
1341 U 0
1342 C 0
1343 G 0
1344 G 0
1345 A 0
1346 A 952
1347 U 951
1348 C 950
1349 G 949
1350 C 948
1351 U 0
1352 A 0
1353 G 0
1354 U 0
1355 A 0
1356 A 1378
1357 U 1377
1358 C 1376
1359 G 1375
1360 U 1374
1361 G 1373
1362 G 1372
1363 A 1371
1364 U 0
1365 C 0
1366 A 0
1367 G 0
1368 A 0
1369 A 0
1370 U 0
1371 G 1363
1372 C 1362
1373 C 1361
1374 A 1360
1375 C 1359
1376 G 1358
1377 G 1357
1378 U 1356
1379 G 0
1380 A 0
1381 A 0
1382 U 0
1383 A 0
1384 C 0
1385 G 945
1386 U 944
1387 U 0
1388 C 0
1389 C 0
1390 C 942
1391 G 941
1392 G 940
1393 G 939
1394 C 938
1395 C 937
1396 U 936
1397 U 934
1398 G 933
1399 U 932
1400 A 0
1401 C 931
1402 A 930
1403 C 0
1404 A 0
1405 C 1508
1406 C 0
1407 G 1505
1408 C 1504
1409 C 0
1410 C 1501
1411 G 1500
1412 U 0
1413 C 1498
1414 A 0
1415 C 1495
1416 A 1494
1417 C 1493
1418 C 1492
1419 A 1491
1420 U 1490
1421 G 1489
1422 G 1488
1423 G 0
1424 A 0
1425 G 1485
1426 U 1484
1427 G 1483
1428 G 1482
1429 G 1481
1430 C 1480
1431 U 1479
1432 G 1478
1433 C 1477
1434 A 1476
1435 A 1475
1436 A 1474
1437 A 0
1438 G 0
1439 A 0
1440 A 0
1441 G 1471
1442 U 1470
1443 A 1469
1444 G 1468
1445 G 1467
1446 U 1466
1447 A 0
1448 G 1465
1449 U 1464
1450 U 1463
1451 U 1462
1452 A 0
1453 A 0
1454 C 1460
1455 U 0
1456 G 0
1457 C 0
1458 G 0
1459 G 0
1460 G 1454
1461 G 0
1462 G 1451
1463 G 1450
1464 A 1449
1465 C 1448
1466 G 1446
1467 C 1445
1468 U 1444
1469 U 1443
1470 A 1442
1471 C 1441
1472 A 0
1473 C 0
1474 U 1436
1475 U 1435
1476 U 1434
1477 G 1433
1478 U 1432
1479 G 1431
1480 G 1430
1481 U 1429
1482 N 1428
1483 N 1427
1484 N 1426
1485 N 1425
1486 N 0
1487 N 0
1488 N 1422
1489 N 1421
1490 N 1420
1491 N 1419
1492 N 1418
1493 N 1417
1494 N 1416
1495 N 1415
1496 N 0
1497 N 0
1498 N 1413
1499 N 0
1500 N 1411
1501 N 1410
1502 N 0
1503 N 0
1504 N 1408
1505 N 1407
1506 N 0
1507 N 0
1508 N 1405
1509 N 0
1510 N 1533
1511 N 1532
1512 N 1531
1513 N 1530
1514 N 1529
1515 N 1528
1516 N 1527
1517 N 1526
1518 N 1525
1519 N 1524
1520 N 0
1521 N 0
1522 N 0
1523 N 0
1524 N 1519
1525 N 1518
1526 N 1517
1527 N 1516
1528 N 1515
1529 N 1514
1530 N 1513
1531 N 1512
1532 N 1511
1533 N 1510
1534 N 0
1535 N 0
1536 N 0
1537 N 0
1538 N 0
1539 N 0
1540 N 0
1541 N 0
1542 N 0
1543 N 0
1544 N 0
1545 N 0
1546 N 0