Filename: d.16.b.Y.pestis.bpseq Organism: Yersinia pestis Accession Number: L37604 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 N 0 3 N 0 4 N 0 5 N 0 6 N 0 7 N 0 8 N 24 9 N 23 10 N 22 11 N 21 12 N 20 13 N 0 14 N 0 15 N 0 16 N 917 17 N 916 18 N 915 19 N 0 20 G 12 21 G 11 22 C 10 23 U 9 24 C 8 25 A 0 26 G 555 27 A 554 28 U 553 29 U 552 30 G 0 31 A 551 32 A 550 33 C 549 34 G 548 35 C 547 36 U 546 37 G 0 38 G 402 39 C 401 40 G 400 41 G 399 42 C 398 43 A 397 44 G 395 45 G 394 46 C 360 47 C 0 48 U 0 49 A 0 50 A 0 51 C 358 52 A 357 53 C 356 54 A 0 55 U 355 56 G 354 57 C 353 58 A 0 59 A 0 60 G 105 61 U 104 62 C 103 63 G 0 64 A 0 65 G 102 66 C 101 67 G 100 68 G 98 69 C 97 70 A 0 71 G 0 72 C 96 73 G 95 74 G 94 75 G 92 76 A 91 77 A 90 78 G 89 79 U 88 80 A 87 81 G 86 82 U 0 83 U 0 84 U 0 85 A 0 86 C 81 87 U 80 88 A 79 89 C 78 90 U 77 91 U 76 92 U 75 93 G 0 94 C 74 95 C 73 96 G 72 97 G 69 98 C 68 99 G 0 100 A 67 101 G 66 102 C 65 103 G 62 104 G 61 105 C 60 106 G 0 107 G 0 108 A 0 109 C 0 110 G 0 111 G 0 112 G 313 113 U 312 114 G 311 115 A 0 116 G 0 117 U 0 118 A 0 119 A 0 120 U 0 121 G 238 122 U 237 123 C 236 124 U 235 125 G 234 126 G 233 127 G 232 128 G 231 129 A 0 130 U 230 131 C 229 132 U 0 133 G 0 134 C 0 135 C 226 136 U 225 137 G 224 138 A 223 139 U 222 140 G 221 141 G 220 142 A 0 143 G 177 144 G 176 145 G 175 146 G 174 147 G 0 148 A 0 149 U 0 150 A 0 151 A 168 152 C 167 153 U 166 154 A 165 155 C 164 156 U 163 157 G 162 158 G 0 159 A 0 160 A 0 161 A 0 162 C 157 163 G 156 164 G 155 165 U 154 166 A 153 167 G 152 168 C 151 169 U 0 170 A 0 171 A 0 172 U 0 173 A 0 174 C 146 175 C 145 176 G 144 177 C 143 178 A 0 179 U 0 180 G 0 181 A 0 182 C 0 183 C 192 184 U 191 185 C 190 186 G 0 187 C 0 188 A 0 189 A 0 190 G 185 191 A 184 192 G 183 193 C 0 194 A 0 195 A 0 196 A 0 197 G 218 198 U 217 199 G 216 200 G 215 201 G 214 202 G 213 203 G 0 204 A 0 205 C 212 206 C 211 207 U 0 208 U 0 209 A 0 210 G 0 211 G 206 212 G 205 213 C 202 214 C 201 215 U 200 216 C 199 217 A 198 218 C 197 219 G 0 220 C 141 221 C 140 222 A 139 223 U 138 224 C 137 225 G 136 226 G 135 227 A 0 228 U 0 229 G 131 230 A 130 231 A 128 232 C 127 233 C 126 234 C 125 235 A 124 236 G 123 237 A 122 238 U 121 239 G 285 240 G 284 241 G 283 242 A 0 243 U 0 244 U 282 245 A 0 246 G 276 247 C 275 248 U 274 249 A 0 250 G 0 251 U 273 252 A 272 253 G 271 254 G 270 255 U 269 256 G 268 257 G 267 258 G 266 259 G 0 260 U 0 261 A 0 262 A 0 263 U 0 264 G 0 265 G 0 266 C 258 267 U 257 268 C 256 269 A 255 270 C 254 271 C 253 272 U 252 273 A 251 274 G 248 275 G 247 276 C 246 277 G 0 278 A 0 279 C 0 280 G 0 281 A 0 282 U 244 283 C 241 284 C 240 285 C 239 286 U 0 287 A 0 288 G 310 289 C 309 290 U 308 291 G 307 292 G 303 293 U 302 294 C 301 295 U 300 296 G 0 297 A 0 298 G 0 299 A 0 300 G 295 301 G 294 302 A 293 303 U 292 304 G 0 305 A 0 306 C 0 307 C 291 308 A 290 309 G 289 310 C 288 311 C 114 312 A 113 313 C 112 314 A 0 315 C 336 316 U 335 317 G 334 318 G 333 319 A 332 320 A 331 321 C 0 322 U 0 323 G 0 324 A 0 325 G 0 326 A 0 327 C 0 328 A 0 329 C 0 330 G 0 331 G 320 332 U 319 333 C 318 334 C 317 335 A 316 336 G 315 337 A 0 338 C 349 339 U 348 340 C 347 341 C 346 342 U 0 343 A 0 344 C 0 345 G 0 346 G 341 347 G 340 348 A 339 349 G 338 350 G 0 351 C 0 352 A 0 353 G 57 354 C 56 355 A 55 356 G 53 357 U 52 358 G 51 359 G 0 360 G 46 361 G 0 362 A 0 363 A 0 364 U 0 365 A 0 366 U 392 367 U 0 368 G 391 369 C 390 370 A 389 371 C 0 372 A 0 373 A 0 374 U 387 375 G 386 376 G 385 377 G 384 378 C 383 379 G 0 380 C 0 381 A 0 382 A 0 383 G 378 384 C 377 385 C 376 386 U 375 387 G 374 388 A 0 389 U 370 390 G 369 391 C 368 392 A 366 393 G 0 394 C 45 395 C 44 396 A 0 397 U 43 398 G 42 399 C 41 400 C 40 401 G 39 402 C 38 403 G 0 404 U 0 405 G 435 406 U 434 407 G 433 408 U 432 409 G 0 410 A 0 411 A 0 412 G 0 413 A 0 414 A 0 415 G 426 416 G 425 417 C 424 418 C 423 419 U 0 420 U 0 421 C 0 422 G 0 423 G 418 424 G 417 425 U 416 426 U 415 427 G 0 428 U 0 429 A 0 430 A 0 431 A 0 432 G 408 433 C 407 434 A 406 435 C 405 436 U 0 437 U 495 438 U 0 439 C 0 440 A 492 441 G 491 442 C 490 443 G 489 444 A 488 445 G 487 446 G 0 447 A 0 448 G 0 449 G 482 450 A 0 451 A 0 452 G 0 453 G 0 454 G 476 455 G 475 456 U 474 457 U 473 458 G 472 459 A 471 460 G 470 461 U 469 462 U 0 463 U 0 464 A 0 465 A 0 466 U 0 467 A 0 468 C 0 469 G 461 470 C 460 471 U 459 472 C 458 473 A 457 474 A 456 475 U 455 476 C 454 477 A 0 478 U 0 479 U 0 480 G 0 481 A 0 482 C 449 483 G 0 484 U 0 485 U 0 486 A 0 487 C 445 488 U 444 489 C 443 490 G 442 491 C 441 492 A 440 493 G 0 494 A 0 495 A 437 496 G 0 497 A 0 498 A 0 499 G 544 500 C 543 501 A 542 502 C 541 503 C 540 504 G 0 505 G 0 506 C 0 507 U 0 508 A 0 509 A 0 510 C 539 511 U 538 512 C 537 513 C 536 514 G 535 515 U 0 516 G 0 517 C 0 518 C 0 519 A 0 520 G 527 521 C 526 522 A 0 523 G 0 524 C 0 525 C 0 526 G 521 527 C 520 528 G 0 529 G 0 530 U 0 531 A 0 532 A 0 533 U 0 534 A 0 535 C 514 536 G 513 537 G 512 538 A 511 539 G 510 540 G 503 541 G 502 542 U 501 543 G 500 544 C 499 545 A 0 546 A 36 547 G 35 548 C 34 549 G 33 550 U 32 551 U 31 552 A 29 553 A 28 554 U 27 555 C 26 556 G 0 557 G 0 558 A 0 559 A 0 560 U 0 561 U 0 562 A 0 563 C 0 564 U 0 565 G 0 566 G 882 567 G 881 568 C 880 569 G 0 570 U 0 571 A 0 572 A 0 573 A 0 574 G 0 575 C 0 576 G 763 577 C 762 578 A 761 579 C 760 580 G 0 581 C 757 582 A 0 583 G 756 584 G 755 585 C 754 586 G 0 587 G 650 588 U 649 589 U 648 590 U 647 591 G 646 592 U 645 593 U 644 594 A 0 595 A 643 596 G 642 597 U 639 598 C 638 599 A 637 600 G 636 601 A 635 602 U 634 603 G 633 604 U 632 605 G 631 606 A 0 607 A 0 608 A 0 609 U 0 610 C 628 611 C 627 612 C 626 613 C 625 614 G 624 615 C 623 616 G 622 617 C 0 618 U 0 619 U 0 620 A 0 621 A 0 622 C 616 623 G 615 624 U 614 625 G 613 626 G 612 627 G 611 628 A 610 629 A 0 630 C 0 631 U 605 632 G 604 633 C 603 634 A 602 635 U 601 636 U 600 637 U 599 638 G 598 639 A 597 640 A 0 641 A 0 642 C 596 643 U 595 644 G 593 645 G 592 646 C 591 647 A 590 648 A 589 649 G 588 650 C 587 651 U 0 652 A 0 653 G 0 654 A 750 655 G 749 656 U 748 657 C 747 658 U 746 659 U 744 660 G 743 661 U 742 662 A 741 663 G 0 664 A 0 665 G 739 666 G 738 667 G 737 668 G 736 669 G 735 670 G 734 671 U 733 672 A 716 673 G 715 674 A 0 675 A 0 676 U 712 677 U 711 678 C 710 679 C 709 680 A 708 681 G 707 682 G 706 683 U 705 684 G 0 685 U 0 686 A 0 687 G 698 688 C 697 689 G 696 690 G 0 691 U 0 692 G 0 693 A 0 694 A 0 695 A 0 696 U 689 697 G 688 698 C 687 699 G 0 700 U 0 701 A 0 702 G 0 703 A 0 704 G 0 705 A 683 706 U 682 707 C 681 708 U 680 709 G 679 710 G 678 711 A 677 712 G 676 713 G 0 714 A 0 715 A 673 716 U 672 717 A 0 718 C 0 719 C 0 720 G 0 721 G 732 722 U 0 723 G 0 724 G 731 725 C 730 726 G 0 727 A 0 728 A 0 729 G 0 730 G 725 731 C 724 732 G 721 733 G 671 734 C 670 735 C 669 736 C 668 737 C 667 738 C 666 739 U 665 740 G 0 741 G 662 742 A 661 743 C 660 744 A 659 745 A 0 746 A 658 747 G 657 748 A 656 749 C 655 750 U 654 751 G 0 752 A 0 753 C 0 754 G 585 755 C 584 756 U 583 757 C 581 758 A 0 759 G 0 760 G 579 761 U 578 762 G 577 763 C 576 764 G 0 765 A 0 766 A 0 767 A 0 768 G 809 769 C 808 770 G 807 771 U 806 772 G 805 773 G 804 774 G 0 775 G 0 776 A 0 777 G 803 778 C 802 779 A 0 780 A 0 781 A 0 782 C 798 783 A 797 784 G 796 785 G 795 786 A 0 787 U 0 788 U 0 789 A 0 790 G 0 791 A 0 792 U 0 793 A 0 794 C 0 795 C 785 796 C 784 797 U 783 798 G 782 799 G 0 800 U 0 801 A 0 802 G 778 803 U 777 804 C 773 805 C 772 806 A 771 807 C 770 808 G 769 809 C 768 810 U 0 811 G 0 812 U 0 813 A 0 814 A 0 815 A 0 816 C 0 817 G 0 818 A 0 819 U 0 820 G 878 821 U 877 822 C 876 823 G 875 824 A 874 825 C 873 826 U 0 827 U 0 828 G 856 829 G 855 830 A 854 831 G 853 832 G 852 833 U 851 834 U 850 835 G 849 836 U 848 837 G 847 838 C 846 839 C 845 840 C 0 841 U 0 842 U 0 843 G 0 844 A 0 845 G 839 846 G 838 847 C 837 848 G 836 849 U 835 850 G 834 851 G 833 852 C 832 853 U 831 854 U 830 855 C 829 856 C 828 857 G 0 858 G 0 859 A 0 860 G 867 861 C 866 862 U 0 863 A 0 864 A 0 865 C 0 866 G 861 867 C 860 868 G 0 869 U 0 870 U 0 871 A 0 872 A 0 873 G 825 874 U 824 875 C 823 876 G 822 877 A 821 878 C 820 879 C 0 880 G 568 881 C 567 882 C 566 883 U 0 884 G 911 885 G 910 886 G 909 887 G 0 888 A 0 889 G 0 890 U 0 891 A 0 892 C 0 893 G 904 894 G 903 895 C 902 896 C 901 897 G 0 898 C 0 899 A 0 900 A 0 901 G 896 902 G 895 903 U 894 904 U 893 905 A 0 906 A 0 907 A 0 908 A 0 909 C 886 910 U 885 911 C 884 912 A 0 913 A 0 914 A 0 915 U 18 916 U 17 917 A 16 918 A 0 919 U 0 920 U 1396 921 G 1395 922 A 1393 923 C 1392 924 G 1391 925 G 0 926 G 1390 927 G 1389 928 G 1388 929 C 1387 930 C 1386 931 C 1385 932 G 1384 933 C 0 934 A 1380 935 C 1379 936 A 0 937 A 0 938 G 1344 939 C 1343 940 G 1342 941 G 1341 942 U 1340 943 G 1237 944 G 1236 945 A 1235 946 G 1234 947 C 1233 948 A 1232 949 U 1231 950 G 1230 951 U 1229 952 G 1228 953 G 1226 954 U 1225 955 U 0 956 U 0 957 A 0 958 A 0 959 U 974 960 U 973 961 C 972 962 G 971 963 A 0 964 U 0 965 G 0 966 C 0 967 A 0 968 A 0 969 C 0 970 G 0 971 C 962 972 G 961 973 A 960 974 A 959 975 G 0 976 A 0 977 A 0 978 C 0 979 C 0 980 U 0 981 U 0 982 A 0 983 C 1221 984 C 1220 985 U 1219 986 A 1218 987 C 1217 988 U 1216 989 C 1215 990 U 0 991 U 0 992 G 0 993 A 0 994 C 0 995 A 1044 996 U 1043 997 C 1042 998 C 1040 999 A 1039 1000 C 1038 1001 A 1037 1002 G 1036 1003 A 0 1004 A 0 1005 U 1022 1006 U 1021 1007 U 1020 1008 G 1019 1009 G 1018 1010 C 1017 1011 A 1016 1012 G 0 1013 A 0 1014 G 0 1015 A 0 1016 U 1011 1017 G 1010 1018 C 1009 1019 U 1008 1020 A 1007 1021 A 1006 1022 A 1005 1023 G 0 1024 U 1035 1025 G 1034 1026 C 1033 1027 C 1032 1028 U 0 1029 U 0 1030 C 0 1031 G 0 1032 G 1027 1033 G 1026 1034 A 1025 1035 A 1024 1036 C 1002 1037 U 1001 1038 G 1000 1039 U 999 1040 G 998 1041 A 0 1042 G 997 1043 A 996 1044 C 995 1045 A 0 1046 G 1210 1047 G 1209 1048 U 0 1049 G 1208 1050 C 1207 1051 U 1206 1052 G 1205 1053 C 0 1054 A 0 1055 U 1204 1056 G 1203 1057 G 1199 1058 C 1198 1059 U 1197 1060 G 1195 1061 U 1194 1062 C 1193 1063 G 1192 1064 U 0 1065 C 0 1066 A 0 1067 G 1106 1068 C 1105 1069 U 1104 1070 C 1103 1071 G 1102 1072 U 1101 1073 G 1082 1074 U 1081 1075 U 1080 1076 G 0 1077 U 0 1078 G 0 1079 A 0 1080 A 1075 1081 A 1074 1082 U 1073 1083 G 0 1084 U 0 1085 U 1098 1086 G 1097 1087 G 1096 1088 G 1095 1089 U 0 1090 U 0 1091 A 0 1092 A 0 1093 G 0 1094 U 0 1095 C 1088 1096 C 1087 1097 C 1086 1098 G 1085 1099 C 0 1100 A 0 1101 A 1072 1102 C 1071 1103 G 1070 1104 A 1069 1105 G 1068 1106 C 1067 1107 G 0 1108 C 0 1109 A 0 1110 A 0 1111 C 0 1112 C 1187 1113 C 1186 1114 U 1185 1115 U 1184 1116 A 0 1117 U 1155 1118 C 1154 1119 C 1153 1120 U 1152 1121 U 1151 1122 U 1150 1123 G 1149 1124 U 0 1125 U 0 1126 G 0 1127 C 1144 1128 C 1143 1129 A 0 1130 G 0 1131 C 1142 1132 A 1141 1133 C 1140 1134 G 0 1135 U 0 1136 A 0 1137 A 0 1138 U 0 1139 G 0 1140 G 1133 1141 U 1132 1142 G 1131 1143 G 1128 1144 G 1127 1145 A 0 1146 A 0 1147 C 0 1148 U 0 1149 C 1123 1150 A 1122 1151 A 1121 1152 G 1120 1153 G 1119 1154 G 1118 1155 A 1117 1156 G 0 1157 A 0 1158 C 1178 1159 U 1177 1160 G 1176 1161 C 1175 1162 C 1174 1163 G 1173 1164 G 1172 1165 U 1171 1166 G 0 1167 A 0 1168 C 0 1169 A 0 1170 A 0 1171 A 1165 1172 C 1164 1173 C 1163 1174 G 1162 1175 G 1161 1176 A 1160 1177 G 1159 1178 G 1158 1179 A 0 1180 A 0 1181 G 0 1182 G 0 1183 U 0 1184 G 1115 1185 G 1114 1186 G 1113 1187 G 1112 1188 A 0 1189 U 0 1190 G 0 1191 A 0 1192 C 1063 1193 G 1062 1194 U 1061 1195 C 1060 1196 A 0 1197 A 1059 1198 G 1058 1199 U 1057 1200 C 0 1201 A 0 1202 U 0 1203 C 1056 1204 A 1055 1205 U 1052 1206 G 1051 1207 G 1050 1208 C 1049 1209 C 1047 1210 C 1046 1211 U 0 1212 U 0 1213 A 0 1214 C 0 1215 G 989 1216 A 988 1217 G 987 1218 U 986 1219 A 985 1220 G 984 1221 G 983 1222 G 0 1223 C 0 1224 U 0 1225 A 954 1226 C 953 1227 A 0 1228 C 952 1229 A 951 1230 C 950 1231 G 949 1232 U 948 1233 G 947 1234 C 946 1235 U 945 1236 A 944 1237 C 943 1238 A 0 1239 A 0 1240 U 0 1241 G 1296 1242 G 1295 1243 C 1294 1244 A 1293 1245 G 1292 1246 A 1291 1247 U 1290 1248 A 0 1249 C 0 1250 A 0 1251 A 0 1252 A 0 1253 G 1284 1254 U 1283 1255 G 1282 1256 A 0 1257 A 0 1258 G 1277 1259 C 1276 1260 G 0 1261 A 0 1262 A 0 1263 C 1272 1264 U 1271 1265 C 1270 1266 G 0 1267 C 0 1268 G 0 1269 A 0 1270 G 1265 1271 A 1264 1272 G 1263 1273 C 0 1274 C 0 1275 A 0 1276 G 1259 1277 C 1258 1278 G 0 1279 G 0 1280 A 0 1281 C 0 1282 C 1255 1283 A 1254 1284 C 1253 1285 A 0 1286 U 0 1287 A 0 1288 A 0 1289 A 0 1290 G 1247 1291 U 1246 1292 C 1245 1293 U 1244 1294 G 1243 1295 U 1242 1296 C 1241 1297 G 0 1298 U 0 1299 A 0 1300 G 0 1301 U 0 1302 C 0 1303 C 1334 1304 G 0 1305 G 0 1306 A 0 1307 U 1330 1308 U 1329 1309 G 1328 1310 G 1327 1311 A 1326 1312 G 1325 1313 U 1324 1314 C 1323 1315 U 0 1316 G 0 1317 C 0 1318 A 0 1319 A 0 1320 C 0 1321 U 0 1322 C 0 1323 G 1314 1324 A 1313 1325 C 1312 1326 U 1311 1327 C 1310 1328 C 1309 1329 A 1308 1330 U 1307 1331 G 0 1332 A 0 1333 A 0 1334 G 1303 1335 U 0 1336 C 0 1337 G 0 1338 G 0 1339 A 0 1340 A 942 1341 U 941 1342 C 940 1343 G 939 1344 C 938 1345 U 0 1346 A 0 1347 G 0 1348 U 0 1349 A 0 1350 A 1372 1351 U 1371 1352 C 1370 1353 G 1369 1354 U 1368 1355 A 1367 1356 G 1366 1357 A 1365 1358 U 0 1359 C 0 1360 A 0 1361 G 0 1362 A 0 1363 A 0 1364 U 0 1365 G 1357 1366 C 1356 1367 U 1355 1368 A 1354 1369 C 1353 1370 G 1352 1371 G 1351 1372 U 1350 1373 G 0 1374 A 0 1375 A 0 1376 U 0 1377 A 0 1378 C 0 1379 G 935 1380 U 934 1381 U 0 1382 C 0 1383 C 0 1384 C 932 1385 G 931 1386 G 930 1387 G 929 1388 C 928 1389 C 927 1390 U 926 1391 U 924 1392 G 923 1393 U 922 1394 A 0 1395 C 921 1396 A 920 1397 C 0 1398 A 0 1399 C 0 1400 C 0 1401 G 1501 1402 C 1500 1403 C 0 1404 C 1497 1405 G 1496 1406 U 0 1407 C 1494 1408 A 0 1409 C 1491 1410 A 1490 1411 C 1489 1412 C 1488 1413 A 1487 1414 U 1486 1415 G 1485 1416 G 1484 1417 G 0 1418 A 0 1419 G 1481 1420 U 1480 1421 G 1479 1422 G 1478 1423 G 1477 1424 U 1476 1425 U 1475 1426 G 1474 1427 C 1473 1428 A 1472 1429 A 1471 1430 A 1470 1431 A 0 1432 G 0 1433 A 0 1434 A 0 1435 G 1466 1436 U 1465 1437 A 1464 1438 G 1463 1439 G 1462 1440 U 1461 1441 A 0 1442 G 1460 1443 C 1459 1444 U 1458 1445 U 1457 1446 A 0 1447 A 0 1448 C 1455 1449 C 1454 1450 U 0 1451 U 0 1452 C 0 1453 G 0 1454 G 1449 1455 G 1448 1456 A 0 1457 G 1445 1458 G 1444 1459 G 1443 1460 C 1442 1461 G 1440 1462 C 1439 1463 U 1438 1464 U 1437 1465 A 1436 1466 C 1435 1467 C 0 1468 A 0 1469 C 0 1470 U 1430 1471 U 1429 1472 U 1428 1473 G 1427 1474 U 1426 1475 G 1425 1476 A 1424 1477 U 1423 1478 U 1422 1479 C 1421 1480 A 1420 1481 U 1419 1482 G 0 1483 A 0 1484 C 1416 1485 U 1415 1486 G 1414 1487 N 1413 1488 N 1412 1489 N 1411 1490 N 1410 1491 N 1409 1492 N 0 1493 N 0 1494 N 1407 1495 N 0 1496 N 1405 1497 N 1404 1498 N 0 1499 N 0 1500 N 1402 1501 N 1401 1502 N 0 1503 N 0 1504 N 0 1505 N 0 1506 N 1529 1507 N 1528 1508 N 1527 1509 N 1526 1510 N 1525 1511 N 1524 1512 N 1523 1513 N 1522 1514 N 1521 1515 N 1520 1516 N 0 1517 N 0 1518 N 0 1519 N 0 1520 N 1515 1521 N 1514 1522 N 1513 1523 N 1512 1524 N 1511 1525 N 1510 1526 N 1509 1527 N 1508 1528 N 1507 1529 N 1506 1530 N 0 1531 N 0 1532 N 0 1533 N 0 1534 N 0 1535 N 0 1536 N 0 1537 N 0 1538 N 0 1539 N 0 1540 N 0 1541 N 0 1542 N 0