Filename: d.16.e.G.stephani.bpseq Organism: Glugea stephani Accession Number: AF056015 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 N 0 3 N 0 4 N 20 5 N 19 6 N 18 7 N 17 8 N 16 9 N 0 10 N 0 11 N 0 12 N 784 13 N 783 14 N 781 15 N 0 16 N 8 17 N 7 18 N 6 19 N 5 20 N 4 21 N 0 22 N 430 23 N 429 24 N 428 25 N 427 26 N 426 27 N 425 28 N 424 29 N 423 30 N 422 31 N 421 32 N 0 33 N 336 34 N 335 35 N 334 36 N 333 37 N 332 38 N 331 39 N 329 40 N 328 41 N 294 42 N 0 43 N 0 44 N 0 45 N 0 46 N 0 47 N 292 48 N 291 49 N 290 50 N 0 51 N 289 52 N 288 53 N 287 54 N 0 55 N 0 56 N 74 57 N 73 58 N 72 59 N 71 60 N 70 61 N 69 62 N 0 63 N 0 64 N 0 65 N 0 66 N 0 67 N 0 68 N 0 69 N 61 70 N 60 71 N 59 72 N 58 73 N 57 74 N 56 75 N 0 76 N 0 77 N 0 78 N 0 79 N 0 80 N 0 81 N 247 82 N 246 83 N 245 84 N 0 85 N 0 86 N 0 87 N 0 88 N 0 89 N 0 90 N 172 91 N 171 92 N 170 93 N 169 94 N 168 95 N 167 96 N 166 97 N 165 98 N 0 99 N 0 100 N 164 101 N 163 102 N 0 103 N 0 104 N 0 105 N 160 106 N 159 107 N 158 108 N 157 109 N 156 110 N 0 111 N 0 112 N 0 113 N 0 114 N 0 115 N 0 116 N 0 117 N 146 118 N 145 119 N 0 120 N 0 121 N 0 122 N 139 123 N 138 124 N 137 125 N 136 126 N 135 127 N 134 128 N 133 129 N 0 130 N 0 131 N 0 132 N 0 133 N 128 134 N 127 135 N 126 136 N 125 137 N 124 138 N 123 139 N 122 140 N 0 141 N 0 142 N 0 143 N 0 144 N 0 145 N 118 146 N 117 147 A 0 148 A 0 149 U 0 150 A 0 151 G 0 152 U 0 153 G 0 154 U 0 155 A 0 156 G 109 157 G 108 158 A 107 159 G 106 160 A 105 161 G 0 162 U 0 163 A 101 164 A 100 165 G 97 166 A 96 167 A 95 168 G 94 169 C 93 170 C 92 171 A 91 172 U 90 173 C 219 174 C 218 175 C 217 176 A 0 177 U 0 178 C 216 179 A 0 180 G 210 181 U 209 182 U 208 183 A 0 184 G 0 185 U 207 186 A 206 187 A 205 188 G 204 189 U 203 190 A 202 191 G 201 192 G 200 193 G 0 194 U 0 195 A 0 196 A 0 197 G 0 198 G 0 199 G 0 200 C 192 201 C 191 202 U 190 203 A 189 204 C 188 205 U 187 206 U 186 207 A 185 208 G 182 209 A 181 210 C 180 211 G 0 212 A 0 213 A 0 214 G 0 215 A 0 216 C 178 217 G 175 218 G 174 219 G 173 220 U 0 221 A 0 222 C 244 223 G 243 224 G 242 225 G 241 226 G 237 227 A 236 228 A 235 229 U 234 230 U 0 231 A 0 232 U 0 233 C 0 234 G 229 235 U 228 236 U 227 237 U 226 238 G 0 239 A 0 240 U 0 241 U 225 242 C 224 243 C 223 244 G 222 245 G 83 246 A 82 247 G 81 248 A 0 249 G 270 250 G 269 251 G 268 252 A 267 253 G 266 254 C 265 255 C 0 256 U 0 257 G 0 258 A 0 259 G 0 260 A 0 261 G 0 262 A 0 263 C 0 264 G 0 265 G 254 266 C 253 267 U 252 268 A 251 269 C 250 270 C 249 271 A 0 272 G 283 273 G 282 274 U 281 275 C 280 276 C 0 277 A 0 278 A 0 279 G 0 280 G 275 281 A 274 282 C 273 283 A 272 284 G 0 285 C 0 286 A 0 287 G 53 288 C 52 289 A 51 290 G 49 291 G 48 292 C 47 293 G 0 294 C 41 295 G 0 296 A 0 297 A 0 298 A 0 299 A 0 300 U 326 301 U 0 302 A 325 303 C 324 304 C 323 305 G 0 306 C 0 307 A 0 308 G 321 309 C 320 310 C 319 311 U 318 312 G 317 313 C 0 314 G 0 315 U 0 316 U 0 317 C 312 318 A 311 319 G 310 320 G 309 321 G 308 322 C 0 323 G 304 324 G 303 325 U 302 326 A 300 327 G 0 328 U 40 329 A 39 330 A 0 331 G 38 332 G 37 333 A 36 334 G 35 335 A 34 336 C 33 337 G 0 338 U 0 339 G 0 340 A 0 341 A 0 342 A 0 343 A 0 344 C 0 345 A 0 346 A 0 347 U 0 348 G 366 349 U 365 350 G 364 351 C 363 352 G 362 353 G 361 354 G 0 355 C 0 356 A 0 357 A 0 358 A 0 359 A 0 360 A 0 361 A 353 362 C 352 363 G 351 364 C 350 365 A 349 366 C 348 367 U 0 368 A 0 369 G 0 370 A 0 371 U 0 372 A 0 373 C 419 374 A 418 375 G 417 376 G 416 377 A 415 378 G 414 379 G 400 380 A 399 381 C 398 382 A 0 383 A 0 384 G 0 385 A 0 386 C 413 387 U 412 388 G 411 389 G 410 390 U 0 391 G 0 392 C 0 393 C 0 394 A 0 395 G 402 396 C 401 397 A 0 398 C 381 399 C 380 400 C 379 401 G 396 402 C 395 403 G 0 404 G 0 405 U 0 406 A 0 407 A 0 408 U 0 409 A 0 410 C 389 411 C 388 412 A 387 413 G 386 414 C 378 415 U 377 416 C 376 417 C 375 418 U 374 419 G 373 420 G 0 421 A 31 422 G 30 423 U 29 424 G 28 425 U 27 426 C 26 427 U 25 428 A 24 429 U 23 430 G 22 431 A 0 432 U 0 433 G 0 434 A 0 435 U 0 436 U 0 437 G 0 438 C 0 439 U 0 440 G 0 441 C 748 442 A 747 443 G 746 444 U 733 445 U 732 446 A 0 447 A 0 448 A 0 449 G 0 450 A 0 451 G 638 452 U 637 453 U 636 454 C 635 455 G 0 456 U 0 457 A 0 458 G 631 459 U 630 460 C 629 461 G 0 462 A 0 463 A 0 464 G 521 465 U 520 466 G 519 467 G 518 468 U 0 469 U 0 470 A 0 471 U 0 472 A 0 473 A 513 474 C 512 475 G 511 476 G 510 477 U 509 478 G 508 479 U 507 480 A 0 481 A 0 482 C 0 483 A 0 484 G 504 485 G 503 486 C 502 487 C 501 488 U 500 489 U 499 490 C 498 491 U 497 492 C 0 493 U 0 494 C 0 495 A 0 496 A 0 497 G 491 498 G 490 499 A 489 500 G 488 501 G 487 502 G 486 503 U 485 504 U 484 505 A 0 506 U 0 507 G 479 508 C 478 509 G 477 510 C 476 511 C 475 512 G 474 513 U 473 514 G 0 515 A 0 516 U 0 517 U 0 518 C 467 519 C 466 520 A 465 521 U 464 522 G 0 523 G 0 524 A 0 525 A 0 526 U 0 527 A 0 528 A 0 529 G 625 530 G 624 531 A 623 532 G 0 533 C 0 534 G 619 535 U 618 536 U 617 537 U 616 538 A 0 539 G 0 540 G 614 541 G 613 542 G 612 543 C 611 544 C 610 545 A 609 546 G 608 547 G 591 548 U 590 549 U 0 550 A 0 551 U 587 552 U 586 553 A 585 554 A 584 555 G 583 556 C 582 557 G 581 558 A 580 559 G 0 560 C 0 561 A 0 562 G 573 563 G 572 564 G 571 565 G 0 566 U 0 567 G 0 568 A 0 569 A 0 570 A 0 571 U 564 572 C 563 573 U 562 574 G 0 575 G 0 576 U 0 577 G 0 578 A 0 579 C 0 580 U 558 581 C 557 582 G 556 583 C 555 584 U 554 585 U 553 586 A 552 587 G 551 588 G 0 589 A 0 590 G 548 591 C 547 592 A 0 593 A 0 594 C 0 595 A 0 596 G 607 597 A 0 598 G 0 599 G 606 600 C 605 601 G 0 602 A 0 603 A 0 604 A 0 605 G 600 606 C 599 607 G 596 608 C 546 609 U 545 610 G 544 611 G 543 612 C 542 613 C 541 614 A 540 615 G 0 616 G 537 617 A 536 618 G 535 619 C 534 620 G 0 621 A 0 622 A 0 623 U 531 624 C 530 625 C 529 626 G 0 627 A 0 628 U 0 629 G 460 630 A 459 631 U 458 632 A 0 633 A 0 634 A 0 635 G 454 636 G 453 637 A 452 638 C 451 639 G 0 640 U 0 641 A 0 642 G 0 643 G 684 644 C 683 645 U 682 646 A 681 647 G 680 648 A 679 649 G 0 650 G 0 651 A 0 652 U 678 653 C 677 654 G 0 655 A 0 656 A 0 657 G 673 658 A 672 659 C 671 660 G 670 661 A 0 662 U 0 663 U 0 664 A 0 665 G 0 666 A 0 667 G 0 668 A 0 669 C 0 670 C 660 671 G 659 672 U 658 673 U 657 674 G 0 675 U 0 676 A 0 677 G 653 678 U 652 679 U 648 680 C 647 681 U 646 682 A 645 683 G 644 684 C 643 685 A 0 686 G 0 687 U 0 688 A 0 689 A 0 690 A 0 691 C 0 692 G 0 693 A 0 694 U 0 695 G 744 696 C 743 697 C 742 698 G 740 699 A 739 700 U 738 701 A 0 702 C 0 703 C 724 704 G 723 705 U 722 706 G 721 707 G 720 708 U 719 709 G 718 710 C 717 711 G 716 712 G 0 713 A 0 714 U 0 715 A 0 716 C 711 717 G 710 718 C 709 719 G 708 720 A 707 721 C 706 722 G 705 723 C 704 724 G 703 725 G 0 726 A 0 727 A 0 728 G 735 729 A 734 730 G 0 731 A 0 732 A 445 733 A 444 734 U 729 735 C 728 736 G 0 737 A 0 738 G 700 739 U 699 740 A 698 741 G 0 742 G 697 743 G 696 744 C 695 745 C 0 746 C 443 747 U 442 748 G 441 749 G 0 750 G 777 751 G 776 752 A 775 753 G 0 754 A 0 755 G 0 756 U 0 757 A 0 758 C 0 759 A 770 760 C 769 761 G 768 762 C 767 763 G 0 764 C 0 765 A 0 766 A 0 767 G 762 768 C 761 769 G 760 770 A 759 771 G 0 772 A 0 773 A 0 774 A 0 775 U 752 776 U 751 777 U 750 778 A 0 779 A 0 780 A 0 781 G 14 782 G 0 783 A 13 784 A 12 785 A 0 786 U 0 787 U 1190 788 G 1189 789 A 1187 790 C 1186 791 G 1185 792 G 0 793 A 1184 794 A 1183 795 G 1182 796 A 1181 797 A 1180 798 C 1179 799 A 1178 800 C 0 801 C 0 802 A 1174 803 C 1173 804 A 0 805 A 0 806 G 1137 807 G 1136 808 A 1135 809 G 1134 810 U 1133 811 G 1054 812 G 1053 813 A 1052 814 G 1051 815 U 1050 816 G 1049 817 U 1048 818 G 1047 819 C 1046 820 G 1045 821 G 1043 822 C 1042 823 U 0 824 U 0 825 A 0 826 A 0 827 U 842 828 U 841 829 U 840 830 G 839 831 A 0 832 C 0 833 U 0 834 C 0 835 A 0 836 A 0 837 C 0 838 G 0 839 C 830 840 G 829 841 G 828 842 G 827 843 A 0 844 C 0 845 A 0 846 G 0 847 C 0 848 U 0 849 U 0 850 A 0 851 C 1038 852 C 1037 853 A 1036 854 G 1035 855 G 1034 856 C 1033 857 C 1032 858 C 0 859 G 0 860 A 0 861 C 891 862 G 890 863 G 889 864 C 888 865 C 887 866 G 0 867 G 0 868 A 0 869 C 0 870 G 0 871 A 0 872 G 882 873 U 881 874 G 880 875 U 879 876 U 0 877 G 0 878 U 0 879 A 875 880 C 874 881 A 873 882 C 872 883 G 0 884 A 0 885 U 0 886 A 0 887 G 865 888 G 864 889 U 863 890 C 862 891 G 861 892 A 0 893 A 0 894 G 0 895 A 1026 896 G 1025 897 U 0 898 G 1024 899 G 1023 900 U 1022 901 G 1021 902 C 0 903 A 0 904 U 1020 905 G 1018 906 G 1014 907 C 1013 908 C 1012 909 G 1010 910 U 1009 911 U 1008 912 A 1007 913 A 0 914 C 0 915 G 0 916 A 954 917 C 953 918 G 952 919 A 951 920 G 950 921 U 949 922 G 931 923 A 930 924 G 929 925 G 0 926 U 0 927 G 0 928 A 0 929 C 924 930 U 923 931 U 922 932 U 0 933 U 946 934 G 945 935 G 944 936 G 943 937 U 0 938 U 0 939 A 0 940 A 0 941 A 0 942 U 0 943 C 936 944 C 935 945 G 934 946 G 933 947 G 0 948 A 0 949 A 921 950 G 920 951 U 919 952 A 918 953 G 917 954 U 916 955 G 0 956 A 0 957 G 0 958 A 0 959 C 0 960 C 1002 961 C 1001 962 C 1000 963 U 999 964 A 0 965 C 972 966 C 971 967 G 0 968 A 0 969 A 0 970 A 0 971 G 966 972 G 965 973 G 0 974 A 0 975 C 993 976 A 992 977 G 991 978 G 990 979 U 989 980 G 988 981 C 987 982 C 0 983 G 0 984 A 0 985 A 0 986 A 0 987 G 981 988 C 980 989 A 979 990 C 978 991 A 977 992 G 976 993 G 975 994 A 0 995 A 0 996 G 0 997 G 0 998 A 0 999 A 963 1000 G 962 1001 G 961 1002 G 960 1003 U 0 1004 C 0 1005 A 0 1006 A 0 1007 G 912 1008 A 911 1009 A 910 1010 C 909 1011 A 0 1012 G 908 1013 G 907 1014 U 906 1015 C 0 1016 A 0 1017 G 0 1018 U 905 1019 G 0 1020 A 904 1021 U 901 1022 G 900 1023 C 899 1024 C 898 1025 C 896 1026 U 895 1027 C 0 1028 A 0 1029 G 0 1030 A 0 1031 U 0 1032 G 857 1033 G 856 1034 U 855 1035 C 854 1036 U 853 1037 G 852 1038 G 851 1039 G 0 1040 C 0 1041 U 0 1042 G 822 1043 C 821 1044 A 0 1045 C 820 1046 G 819 1047 C 818 1048 G 817 1049 C 816 1050 A 815 1051 C 814 1052 U 813 1053 A 812 1054 C 811 1055 A 0 1056 G 0 1057 U 0 1058 G 1093 1059 G 1092 1060 U 1091 1061 C 1090 1062 A 1089 1063 U 1088 1064 A 0 1065 G 0 1066 A 0 1067 A 1083 1068 A 1082 1069 U 1081 1070 G 0 1071 A 0 1072 A 0 1073 A 0 1074 C 0 1075 G 0 1076 A 0 1077 U 0 1078 A 0 1079 G 0 1080 A 0 1081 A 1069 1082 U 1068 1083 U 1067 1084 A 0 1085 A 0 1086 A 0 1087 G 0 1088 A 1063 1089 U 1062 1090 G 1061 1091 A 1060 1092 U 1059 1093 C 1058 1094 G 0 1095 A 0 1096 G 0 1097 A 0 1098 G 0 1099 G 1127 1100 G 0 1101 A 0 1102 A 0 1103 U 1122 1104 G 1121 1105 A 1120 1106 G 1119 1107 C 1118 1108 U 1117 1109 U 1116 1110 U 0 1111 G 0 1112 U 0 1113 A 0 1114 A 0 1115 G 0 1116 A 1109 1117 G 1108 1118 G 1107 1119 C 1106 1120 U 1105 1121 C 1104 1122 A 1103 1123 G 0 1124 G 0 1125 A 0 1126 A 0 1127 C 1099 1128 G 0 1129 A 0 1130 G 0 1131 G 0 1132 A 0 1133 A 810 1134 U 809 1135 U 808 1136 G 807 1137 C 806 1138 U 0 1139 A 0 1140 G 0 1141 U 0 1142 A 0 1143 A 1166 1144 U 1165 1145 C 1164 1146 G 1163 1147 C 1162 1148 G 1161 1149 G 1160 1150 A 1159 1151 C 0 1152 U 0 1153 C 0 1154 A 0 1155 U 0 1156 U 0 1157 A 0 1158 A 0 1159 G 1150 1160 A 1149 1161 C 1148 1162 G 1147 1163 C 1146 1164 G 1145 1165 A 1144 1166 U 1143 1167 G 0 1168 A 0 1169 A 0 1170 U 0 1171 A 0 1172 C 0 1173 G 803 1174 U 802 1175 C 0 1176 C 0 1177 C 0 1178 U 799 1179 G 798 1180 U 797 1181 U 796 1182 C 795 1183 U 794 1184 U 793 1185 U 791 1186 G 790 1187 U 789 1188 A 0 1189 C 788 1190 A 787 1191 C 0 1192 A 0 1193 C 0 1194 C 0 1195 G 1278 1196 C 1277 1197 C 0 1198 C 1274 1199 G 1273 1200 U 0 1201 C 0 1202 G 0 1203 U 1268 1204 U 1267 1205 A 1266 1206 U 1265 1207 C 1264 1208 G 1263 1209 A 1262 1210 A 1261 1211 G 0 1212 A 0 1213 U 1258 1214 G 1257 1215 G 1256 1216 A 1255 1217 G 1254 1218 U 1253 1219 C 1252 1220 A 1251 1221 G 1250 1222 G 1249 1223 C 1248 1224 G 1247 1225 C 1246 1226 G 1245 1227 A 1244 1228 A 1243 1229 C 1242 1230 A 1241 1231 A 1240 1232 G 1239 1233 C 1238 1234 G 0 1235 A 0 1236 G 0 1237 A 0 1238 G 1233 1239 C 1232 1240 G 1231 1241 A 1230 1242 G 1229 1243 U 1228 1244 G 1227 1245 A 1226 1246 G 1225 1247 U 1224 1248 G 1223 1249 C 1222 1250 A 1221 1251 G 1220 1252 G 1219 1253 A 1218 1254 U 1217 1255 U 1216 1256 C 1215 1257 U 1214 1258 A 1213 1259 G 0 1260 A 0 1261 U 1210 1262 G 1209 1263 U 1208 1264 G 1207 1265 A 1206 1266 U 1205 1267 A 1204 1268 C 1203 1269 A 0 1270 A 0 1271 G 0 1272 U 0 1273 C 1199 1274 G 1198 1275 U 0 1276 A 0 1277 A 1196 1278 C 1195 1279 A 0 1280 A 0 1281 G 0 1282 G 0 1283 U 1306 1284 A 1305 1285 G 1304 1286 C 1303 1287 U 1302 1288 G 1301 1289 U 1300 1290 A 1299 1291 G 1298 1292 G 1297 1293 A 0 1294 G 0 1295 A 0 1296 A 0 1297 C 1292 1298 C 1291 1299 U 1290 1300 G 1289 1301 U 1288 1302 A 1287 1303 G 1286 1304 C 1285 1305 U 1284 1306 G 1283 1307 G 0 1308 A 0 1309 U 0 1310 C 0 1311 A 0 1312 N 0 1313 N 0 1314 N 0