Filename: a.16.c.C.ruber.bpseq Organism: Cytinus ruber Accession Number: U47845 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 U 0 2 C 0 3 U 0 4 C 0 5 A 0 6 U 0 7 G 0 8 G 0 9 A 0 10 G 26 11 A 25 12 G 24 13 U 23 14 U 22 15 C 0 16 G 0 17 A 0 18 U 869 19 C 868 20 C 867 21 U 0 22 G 14 23 G 13 24 C 12 25 U 11 26 C 10 27 A 0 28 G 505 29 G 504 30 A 503 31 U 502 32 G 0 33 A 501 34 A 500 35 C 499 36 G 498 37 C 497 38 U 496 39 G 0 40 G 374 41 U 373 42 G 372 43 G 371 44 C 370 45 A 369 46 U 367 47 G 366 48 C 0 49 U 0 50 U 0 51 A 0 52 A 0 53 C 331 54 A 330 55 C 329 56 A 0 57 U 328 58 G 327 59 C 326 60 A 0 61 A 0 62 G 90 63 U 89 64 U 88 65 G 0 66 A 0 67 A 87 68 C 86 69 G 85 70 U 84 71 A 83 72 A 82 73 A 81 74 A 80 75 U 0 76 G 0 77 G 0 78 U 0 79 C 0 80 U 74 81 U 73 82 U 72 83 U 71 84 A 70 85 A 69 86 G 68 87 U 67 88 G 64 89 G 63 90 C 62 91 G 0 92 A 0 93 A 0 94 C 0 95 G 0 96 G 0 97 G 286 98 U 285 99 G 284 100 A 0 101 G 0 102 U 0 103 A 0 104 A 0 105 C 0 106 G 211 107 C 210 108 G 209 109 U 208 110 A 207 111 A 206 112 G 205 113 A 204 114 A 0 115 U 203 116 C 202 117 U 0 118 G 0 119 U 0 120 C 199 121 C 198 122 U 197 123 U 196 124 G 195 125 G 194 126 G 193 127 A 0 128 G 162 129 G 161 130 G 160 131 G 159 132 A 158 133 A 0 134 C 0 135 A 0 136 A 153 137 C 152 138 A 151 139 G 150 140 U 149 141 U 148 142 G 147 143 G 0 144 A 0 145 A 0 146 A 0 147 C 142 148 G 141 149 U 140 150 C 139 151 U 138 152 G 137 153 C 136 154 U 0 155 A 0 156 A 0 157 U 0 158 A 132 159 C 131 160 C 130 161 C 129 162 C 128 163 A 0 164 U 0 165 A 0 166 G 0 167 A 176 168 C 175 169 U 174 170 G 0 171 A 0 172 G 0 173 G 0 174 A 169 175 G 168 176 U 167 177 A 0 178 A 0 179 A 0 180 A 0 181 G 191 182 G 190 183 A 189 184 G 0 185 G 0 186 A 0 187 A 0 188 A 0 189 U 183 190 C 182 191 C 181 192 G 0 193 C 126 194 C 125 195 C 124 196 A 123 197 A 122 198 G 121 199 U 120 200 A 0 201 G 0 202 G 116 203 A 115 204 G 113 205 C 112 206 U 111 207 U 110 208 G 109 209 C 108 210 G 107 211 U 106 212 C 258 213 U 257 214 G 256 215 A 0 216 U 0 217 U 255 218 A 0 219 G 249 220 C 248 221 U 247 222 A 0 223 G 0 224 U 246 225 U 245 226 G 244 227 G 243 228 U 242 229 G 241 230 A 240 231 G 239 232 G 0 233 A 0 234 A 0 235 A 0 236 U 0 237 A 0 238 G 0 239 C 231 240 U 230 241 U 229 242 A 228 243 C 227 244 C 226 245 A 225 246 A 224 247 G 221 248 G 220 249 C 219 250 A 0 251 A 0 252 U 0 253 A 0 254 A 0 255 U 217 256 C 214 257 A 213 258 G 212 259 U 0 260 A 0 261 G 283 262 C 282 263 U 281 264 G 280 265 G 276 266 U 275 267 C 274 268 C 273 269 G 0 270 A 0 271 G 0 272 A 0 273 G 268 274 G 267 275 A 266 276 U 265 277 G 0 278 A 0 279 U 0 280 C 264 281 A 263 282 G 262 283 C 261 284 C 99 285 A 98 286 C 97 287 A 0 288 C 309 289 U 308 290 G 307 291 G 306 292 G 305 293 A 304 294 C 0 295 U 0 296 G 0 297 A 0 298 G 0 299 A 0 300 C 0 301 A 0 302 C 0 303 G 0 304 G 293 305 C 292 306 C 291 307 C 290 308 A 289 309 G 288 310 A 0 311 C 322 312 U 321 313 C 320 314 U 319 315 U 0 316 A 0 317 C 0 318 G 0 319 G 314 320 G 313 321 A 312 322 G 311 323 G 0 324 C 0 325 A 0 326 G 59 327 C 58 328 A 57 329 G 55 330 U 54 331 G 53 332 G 0 333 G 0 334 G 0 335 A 0 336 A 0 337 U 0 338 U 0 339 U 364 340 U 0 341 C 363 342 C 362 343 G 361 344 C 0 345 A 0 346 A 0 347 U 359 348 G 358 349 G 357 350 G 0 351 C 356 352 U 0 353 A 0 354 A 0 355 A 0 356 G 351 357 C 349 358 U 348 359 G 347 360 A 0 361 C 343 362 G 342 363 G 341 364 A 339 365 G 0 366 C 47 367 A 46 368 A 0 369 U 45 370 G 44 371 C 43 372 C 42 373 A 41 374 C 40 375 G 0 376 U 0 377 G 407 378 A 406 379 A 405 380 G 404 381 G 0 382 U 0 383 A 0 384 A 0 385 A 0 386 A 0 387 G 398 388 G 397 389 C 396 390 C 395 391 C 0 392 C 0 393 U 0 394 G 0 395 G 390 396 G 389 397 U 388 398 C 387 399 A 0 400 U 0 401 G 0 402 A 0 403 A 0 404 C 380 405 U 379 406 U 378 407 C 377 408 U 0 409 U 445 410 U 0 411 U 0 412 A 442 413 C 441 414 C 440 415 A 439 416 G 438 417 A 437 418 G 0 419 A 0 420 A 0 421 U 432 422 A 0 423 A 0 424 A 0 425 G 0 426 C 0 427 A 0 428 A 0 429 U 0 430 G 0 431 A 0 432 C 421 433 G 0 434 G 0 435 U 0 436 A 0 437 U 417 438 C 416 439 U 415 440 G 414 441 G 413 442 U 412 443 G 0 444 A 0 445 A 409 446 U 0 447 A 0 448 A 0 449 G 494 450 C 493 451 A 492 452 U 491 453 C 490 454 G 0 455 G 0 456 C 0 457 U 0 458 A 0 459 A 0 460 C 489 461 U 488 462 C 487 463 U 486 464 G 485 465 U 0 466 G 0 467 C 0 468 C 0 469 A 0 470 G 0 471 C 0 472 A 0 473 G 0 474 C 0 475 C 0 476 G 0 477 C 0 478 G 0 479 G 0 480 A 0 481 A 0 482 A 0 483 U 0 484 A 0 485 C 464 486 A 463 487 G 462 488 A 461 489 G 460 490 G 453 491 A 452 492 U 451 493 G 450 494 C 449 495 A 0 496 A 38 497 G 37 498 C 36 499 G 35 500 U 34 501 U 33 502 A 31 503 U 30 504 C 29 505 C 28 506 G 0 507 G 0 508 A 0 509 A 0 510 U 0 511 U 0 512 A 0 513 U 0 514 U 0 515 G 0 516 G 834 517 G 833 518 C 832 519 G 0 520 U 0 521 A 0 522 A 0 523 A 0 524 G 0 525 C 0 526 G 714 527 U 713 528 C 712 529 U 711 530 G 0 531 U 0 532 A 0 533 G 707 534 A 706 535 U 705 536 G 704 537 G 601 538 C 599 539 U 598 540 U 597 541 U 596 542 U 595 543 U 594 544 A 0 545 A 593 546 G 592 547 U 589 548 C 588 549 U 587 550 G 586 551 C 585 552 C 584 553 A 583 554 U 582 555 A 581 556 A 0 557 A 0 558 A 0 559 U 0 560 C 0 561 C 577 562 C 576 563 A 575 564 G 574 565 G 573 566 G 572 567 C 571 568 U 0 569 C 0 570 A 0 571 A 567 572 C 566 573 C 565 574 C 564 575 U 563 576 G 562 577 U 561 578 A 0 579 C 0 580 A 0 581 G 555 582 G 554 583 U 553 584 G 552 585 G 551 586 U 550 587 A 549 588 G 548 589 A 547 590 A 0 591 A 0 592 C 546 593 U 545 594 A 543 595 U 542 596 A 541 597 A 540 598 A 539 599 G 538 600 A 0 601 C 537 602 U 0 603 U 0 604 G 0 605 A 701 606 G 700 607 U 699 608 U 697 609 U 696 610 G 695 611 G 694 612 U 693 613 A 692 614 G 0 615 G 691 616 G 690 617 G 689 618 C 688 619 A 687 620 G 686 621 A 685 622 G 684 623 G 667 624 G 666 625 A 665 626 A 664 627 U 663 628 U 662 629 U 661 630 U 660 631 C 659 632 G 658 633 G 657 634 U 656 635 G 0 636 G 0 637 A 0 638 G 649 639 C 648 640 G 647 641 A 0 642 U 0 643 A 0 644 A 0 645 A 0 646 A 0 647 U 640 648 G 639 649 C 638 650 A 0 651 U 0 652 A 0 653 G 0 654 A 0 655 G 0 656 A 634 657 U 633 658 C 632 659 G 631 660 G 630 661 A 629 662 A 628 663 A 627 664 G 626 665 A 625 666 A 624 667 C 623 668 A 0 669 C 0 670 C 0 671 A 0 672 A 683 673 U 0 674 G 0 675 G 682 676 C 681 677 G 0 678 A 0 679 A 0 680 G 0 681 G 676 682 C 675 683 A 672 684 C 622 685 U 621 686 C 620 687 U 619 688 G 618 689 C 617 690 U 616 691 G 615 692 G 613 693 G 612 694 C 611 695 C 610 696 A 609 697 A 608 698 U 0 699 A 607 700 C 606 701 U 605 702 G 0 703 A 0 704 C 536 705 A 535 706 U 534 707 U 533 708 G 0 709 A 0 710 G 0 711 A 529 712 G 528 713 A 527 714 C 526 715 U 0 716 A 0 717 A 0 718 A 0 719 G 760 720 C 759 721 U 758 722 A 757 723 G 756 724 G 755 725 G 754 726 G 0 727 A 0 728 G 0 729 C 753 730 A 0 731 A 0 732 A 0 733 U 749 734 G 748 735 G 747 736 G 746 737 A 0 738 U 0 739 U 0 740 A 0 741 G 0 742 G 0 743 U 0 744 A 0 745 C 0 746 C 736 747 C 735 748 C 734 749 A 733 750 G 0 751 U 0 752 A 0 753 G 729 754 U 725 755 C 724 756 C 723 757 U 722 758 A 721 759 G 720 760 C 719 761 C 0 762 A 0 763 U 0 764 A 0 765 A 0 766 A 0 767 C 0 768 G 0 769 A 0 770 U 0 771 G 830 772 G 829 773 A 828 774 U 827 775 A 826 776 C 825 777 C 0 778 A 0 779 A 808 780 G 807 781 U 806 782 G 805 783 C 804 784 U 803 785 G 802 786 U 801 787 G 800 788 U 799 789 G 798 790 A 0 791 A 0 792 U 0 793 C 0 794 G 0 795 A 0 796 U 0 797 C 0 798 C 789 799 A 788 800 U 787 801 G 786 802 C 785 803 A 784 804 G 783 805 U 782 806 G 781 807 C 780 808 U 779 809 C 0 810 U 0 811 A 0 812 G 819 813 C 818 814 A 0 815 A 0 816 A 0 817 C 0 818 G 813 819 C 812 820 G 0 821 U 0 822 U 0 823 A 0 824 A 0 825 G 776 826 U 775 827 A 774 828 U 773 829 C 772 830 C 771 831 C 0 832 G 518 833 C 517 834 C 516 835 U 0 836 G 863 837 G 862 838 G 861 839 G 0 840 A 0 841 G 0 842 U 0 843 A 0 844 C 0 845 G 856 846 U 855 847 U 854 848 C 853 849 G 0 850 C 0 851 A 0 852 A 0 853 G 848 854 A 847 855 A 846 856 U 845 857 G 0 858 A 0 859 A 0 860 A 0 861 C 838 862 U 837 863 C 836 864 A 0 865 A 0 866 A 0 867 G 20 868 G 19 869 A 18 870 A 0 871 U 0 872 U 1347 873 G 1346 874 A 1344 875 C 1343 876 G 1342 877 U 0 878 G 1341 879 G 1340 880 G 1339 881 C 1338 882 C 1337 883 C 1336 884 G 1335 885 C 0 886 A 0 887 C 0 888 A 0 889 A 1295 890 G 1294 891 C 1293 892 G 1292 893 A 1291 894 U 1290 895 G 0 896 G 1186 897 A 1185 898 G 1184 899 C 1183 900 A 1182 901 U 1181 902 G 1180 903 U 1179 904 C 1178 905 G 1176 906 U 1175 907 U 0 908 U 0 909 A 0 910 A 0 911 U 926 912 U 925 913 C 924 914 G 923 915 A 0 916 U 0 917 G 0 918 C 0 919 A 0 920 A 0 921 A 0 922 G 0 923 C 914 924 G 913 925 A 912 926 A 911 927 G 0 928 A 0 929 A 0 930 C 0 931 C 0 932 U 0 933 U 0 934 A 0 935 C 1171 936 C 1170 937 A 1169 938 G 1168 939 G 1167 940 G 1166 941 C 1165 942 U 0 943 U 0 944 G 0 945 U 0 946 U 0 947 A 996 948 U 995 949 G 994 950 C 992 951 C 991 952 G 990 953 C 989 954 G 988 955 A 0 956 A 0 957 U 974 958 A 973 959 C 972 960 U 971 961 C 970 962 U 969 963 U 968 964 G 0 965 A 0 966 A 0 967 A 0 968 G 963 969 A 962 970 G 961 971 A 960 972 G 959 973 G 958 974 A 957 975 G 0 976 U 987 977 G 986 978 C 985 979 C 984 980 C 0 981 U 0 982 A 0 983 G 0 984 G 979 985 G 978 986 A 977 987 A 976 988 C 954 989 G 953 990 C 952 991 G 951 992 G 950 993 A 0 994 C 949 995 A 948 996 C 947 997 A 0 998 G 1160 999 G 1159 1000 U 0 1001 G 1158 1002 G 1157 1003 U 1156 1004 G 1155 1005 C 0 1006 A 0 1007 U 1154 1008 G 1153 1009 G 1149 1010 C 1148 1011 U 1147 1012 G 1145 1013 U 1144 1014 C 1143 1015 G 1142 1016 U 0 1017 C 0 1018 A 0 1019 G 1058 1020 C 1057 1021 U 1056 1022 C 1055 1023 G 1054 1024 U 1053 1025 G 1034 1026 C 1033 1027 C 1032 1028 G 0 1029 U 0 1030 A 0 1031 A 0 1032 G 1027 1033 G 1026 1034 U 1025 1035 G 0 1036 U 0 1037 U 1050 1038 G 1049 1039 G 1048 1040 G 1047 1041 U 0 1042 U 0 1043 A 0 1044 A 0 1045 G 0 1046 U 0 1047 C 1040 1048 C 1039 1049 C 1038 1050 A 1037 1051 U 0 1052 A 0 1053 A 1024 1054 C 1023 1055 G 1022 1056 A 1021 1057 G 1020 1058 C 1019 1059 G 0 1060 C 0 1061 A 0 1062 A 0 1063 C 0 1064 C 1137 1065 C 1136 1066 U 1135 1067 C 1134 1068 G 1133 1069 U 1105 1070 G 1104 1071 U 1103 1072 U 1102 1073 U 1101 1074 A 1100 1075 G 1099 1076 U 0 1077 U 0 1078 G 1095 1079 C 1094 1080 C 1093 1081 A 1092 1082 A 1091 1083 U 0 1084 A 1090 1085 C 1089 1086 U 0 1087 U 0 1088 A 0 1089 G 1085 1090 U 1084 1091 U 1082 1092 U 1081 1093 G 1080 1094 G 1079 1095 A 1078 1096 A 0 1097 C 0 1098 U 0 1099 C 1075 1100 U 1074 1101 A 1073 1102 A 1072 1103 A 1071 1104 C 1070 1105 A 1069 1106 U 0 1107 A 0 1108 C 0 1109 U 0 1110 G 0 1111 C 1125 1112 C 1124 1113 G 1123 1114 G 1122 1115 U 1121 1116 G 0 1117 U 0 1118 U 0 1119 A 0 1120 A 0 1121 G 1115 1122 U 1114 1123 C 1113 1124 G 1112 1125 G 1111 1126 A 0 1127 G 0 1128 G 0 1129 A 0 1130 A 0 1131 G 0 1132 G 0 1133 U 1068 1134 G 1067 1135 A 1066 1136 G 1065 1137 G 1064 1138 A 0 1139 U 0 1140 G 0 1141 A 0 1142 C 1015 1143 G 1014 1144 U 1013 1145 C 1012 1146 A 0 1147 A 1011 1148 G 1010 1149 U 1009 1150 C 0 1151 A 0 1152 U 0 1153 C 1008 1154 A 1007 1155 U 1004 1156 G 1003 1157 C 1002 1158 C 1001 1159 C 999 1160 C 998 1161 U 0 1162 U 0 1163 A 0 1164 U 0 1165 G 941 1166 C 940 1167 C 939 1168 C 938 1169 U 937 1170 G 936 1171 G 935 1172 G 0 1173 C 0 1174 U 0 1175 A 906 1176 C 905 1177 A 0 1178 C 904 1179 A 903 1180 C 902 1181 A 901 1182 U 900 1183 G 899 1184 C 898 1185 U 897 1186 A 896 1187 C 0 1188 A 0 1189 A 0 1190 U 0 1191 G 1246 1192 G 1245 1193 A 1244 1194 C 1243 1195 A 1242 1196 G 1241 1197 G 1240 1198 A 0 1199 C 0 1200 A 0 1201 A 0 1202 A 0 1203 G 1234 1204 G 1233 1205 A 1232 1206 U 0 1207 U 0 1208 G 1227 1209 U 1226 1210 A 0 1211 A 0 1212 G 0 1213 U 1222 1214 C 1221 1215 C 1220 1216 G 0 1217 C 0 1218 G 0 1219 A 0 1220 G 1215 1221 G 1214 1222 U 1213 1223 U 0 1224 U 0 1225 A 0 1226 G 1209 1227 A 1208 1228 U 0 1229 A 0 1230 A 0 1231 C 0 1232 U 1205 1233 C 1204 1234 C 1203 1235 A 0 1236 A 0 1237 A 0 1238 A 0 1239 A 0 1240 C 1197 1241 C 1196 1242 U 1195 1243 G 1194 1244 U 1193 1245 C 1192 1246 C 1191 1247 U 0 1248 C 0 1249 A 0 1250 G 0 1251 U 0 1252 U 0 1253 C 1284 1254 G 1283 1255 G 1282 1256 A 1281 1257 U 1280 1258 U 1279 1259 G 1278 1260 C 1277 1261 A 1276 1262 G 1275 1263 G 1274 1264 C 1273 1265 U 0 1266 G 0 1267 C 0 1268 A 0 1269 A 0 1270 C 0 1271 U 0 1272 C 0 1273 G 1264 1274 C 1263 1275 C 1262 1276 U 1261 1277 G 1260 1278 C 1259 1279 A 1258 1280 U 1257 1281 G 1256 1282 A 1255 1283 A 1254 1284 G 1253 1285 C 0 1286 C 0 1287 G 0 1288 G 0 1289 A 0 1290 A 894 1291 U 893 1292 C 892 1293 G 891 1294 C 890 1295 U 889 1296 A 0 1297 G 0 1298 U 0 1299 A 0 1300 A 1323 1301 U 1322 1302 C 1321 1303 G 1320 1304 C 1319 1305 C 1318 1306 G 1317 1307 G 1316 1308 U 0 1309 C 0 1310 A 0 1311 G 0 1312 C 0 1313 C 0 1314 A 0 1315 U 0 1316 A 1307 1317 C 1306 1318 G 1305 1319 G 1304 1320 C 1303 1321 G 1302 1322 G 1301 1323 U 1300 1324 G 0 1325 A 0 1326 A 0 1327 U 0 1328 U 0 1329 A 0 1330 G 0 1331 U 0 1332 U 0 1333 C 0 1334 U 0 1335 C 884 1336 G 883 1337 G 882 1338 G 881 1339 C 880 1340 C 879 1341 U 878 1342 U 876 1343 G 875 1344 U 874 1345 A 0 1346 C 873 1347 A 872 1348 C 0 1349 A 0 1350 C 0 1351 C 0 1352 G 1456 1353 C 1455 1354 C 0 1355 C 1452 1356 G 1451 1357 U 0 1358 C 1449 1359 A 0 1360 C 1446 1361 A 1445 1362 C 1444 1363 U 1443 1364 A 1442 1365 A 1441 1366 A 1440 1367 A 1439 1368 G 1438 1369 A 1437 1370 G 1436 1371 C 1435 1372 U 1434 1373 G 1433 1374 G 1432 1375 C 1431 1376 U 1430 1377 U 1429 1378 U 1428 1379 G 1427 1380 U 1426 1381 C 1425 1382 C 0 1383 U 0 1384 A 0 1385 A 0 1386 G 1421 1387 U 1420 1388 C 1419 1389 A 1418 1390 U 1417 1391 U 1416 1392 U 0 1393 U 0 1394 U 0 1395 A 0 1396 C 1415 1397 C 1414 1398 U 1413 1399 U 1412 1400 A 0 1401 A 0 1402 C 1410 1403 C 1409 1404 A 0 1405 C 0 1406 A 0 1407 A 0 1408 A 0 1409 G 1403 1410 G 1402 1411 A 0 1412 G 1399 1413 G 1398 1414 G 1397 1415 G 1396 1416 G 1391 1417 A 1390 1418 U 1389 1419 G 1388 1420 C 1387 1421 C 1386 1422 A 0 1423 A 0 1424 A 0 1425 G 1381 1426 G 1380 1427 C 1379 1428 A 1378 1429 G 1377 1430 G 1376 1431 G 1375 1432 C 1374 1433 U 1373 1434 A 1372 1435 G 1371 1436 U 1370 1437 G 1369 1438 A 1368 1439 U 1367 1440 U 1366 1441 G 1365 1442 G 1364 1443 A 1363 1444 G 1362 1445 U 1361 1446 G 1360 1447 A 0 1448 A 0 1449 G 1358 1450 U 0 1451 C 1356 1452 G 1355 1453 U 0 1454 A 0 1455 A 1353 1456 C 1352 1457 A 0 1458 A 0 1459 G 0 1460 G 0 1461 U 1484 1462 A 1483 1463 G 1482 1464 C 1481 1465 C 1480 1466 G 1479 1467 U 1478 1468 A 1477 1469 C 1476 1470 U 1475 1471 G 0 1472 G 0 1473 A 0 1474 A 0 1475 G 1470 1476 G 1469 1477 U 1468 1478 G 1467 1479 C 1466 1480 G 1465 1481 G 1464 1482 C 1463 1483 U 1462 1484 G 1461 1485 G 0 1486 A 0 1487 U 0 1488 C 0 1489 A 0 1490 C 0 1491 C 0 1492 U 0 1493 C 0 1494 C 0 1495 U 0 1496 U 0 1497 U 0