Filename: a.16.c.G.nostochinearum.bpseq Organism: Glaucocystis nostochinearum Accession Number: X82496 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 G 0 2 U 0 3 G 0 4 C 0 5 U 0 6 G 0 7 C 0 8 A 0 9 G 0 10 A 0 11 G 27 12 A 26 13 G 25 14 U 24 15 U 23 16 U 0 17 G 0 18 A 0 19 U 895 20 C 894 21 C 893 22 U 0 23 G 15 24 G 14 25 C 13 26 U 12 27 C 11 28 A 0 29 G 532 30 G 531 31 A 530 32 U 529 33 G 0 34 A 528 35 A 527 36 C 526 37 G 525 38 C 524 39 U 523 40 G 0 41 G 402 42 C 401 43 G 400 44 G 399 45 U 398 46 A 397 47 U 395 48 G 394 49 C 0 50 U 0 51 U 0 52 A 0 53 A 0 54 C 359 55 A 358 56 C 357 57 A 0 58 U 356 59 G 355 60 C 354 61 A 0 62 A 0 63 G 92 64 U 91 65 C 90 66 G 0 67 A 0 68 A 89 69 C 88 70 G 87 71 G 86 72 A 85 73 G 84 74 A 83 75 U 82 76 C 81 77 G 0 78 A 0 79 A 0 80 A 0 81 G 76 82 A 75 83 U 74 84 C 73 85 U 72 86 U 71 87 A 70 88 G 69 89 U 68 90 G 65 91 G 64 92 C 63 93 G 0 94 G 0 95 A 0 96 C 0 97 G 0 98 G 0 99 G 314 100 U 313 101 G 312 102 A 0 103 G 0 104 U 0 105 A 0 106 A 0 107 C 0 108 G 239 109 C 238 110 G 237 111 U 236 112 G 235 113 A 234 114 G 233 115 A 232 116 A 0 117 N 231 118 C 230 119 U 0 120 G 0 121 C 0 122 C 227 123 U 226 124 C 225 125 U 224 126 A 223 127 G 222 128 G 221 129 A 0 130 G 188 131 G 187 132 G 186 133 G 185 134 G 184 135 A 0 136 C 0 137 A 0 138 A 179 139 C 178 140 A 177 141 G 176 142 G 0 143 A 162 144 A 161 145 G 160 146 A 159 147 G 158 148 A 0 149 A 0 150 C 0 151 A 0 152 A 0 153 U 0 154 A 0 155 G 0 156 G 0 157 A 0 158 C 147 159 U 146 160 C 145 161 U 144 162 U 143 163 U 0 164 U 0 165 C 0 166 G 175 167 C 174 168 C 173 169 G 0 170 A 0 171 A 0 172 A 0 173 G 168 174 G 167 175 U 166 176 C 141 177 U 140 178 G 139 179 C 138 180 U 0 181 A 0 182 A 0 183 U 0 184 A 134 185 C 133 186 C 132 187 C 131 188 C 130 189 A 0 190 U 0 191 A 0 192 U 0 193 G 202 194 C 201 195 C 200 196 G 0 197 U 0 198 A 0 199 A 0 200 G 195 201 G 194 202 U 193 203 G 0 204 A 0 205 A 0 206 A 0 207 G 219 208 G 218 209 A 217 210 U 216 211 U 215 212 U 0 213 C 0 214 U 0 215 A 211 216 A 210 217 U 209 218 C 208 219 U 207 220 G 0 221 C 128 222 C 127 223 U 126 224 G 125 225 G 124 226 A 123 227 G 122 228 A 0 229 A 0 230 G 118 231 A 117 232 G 115 233 C 114 234 U 113 235 C 112 236 G 111 237 C 110 238 G 109 239 U 108 240 C 286 241 U 285 242 G 284 243 A 0 244 U 0 245 U 283 246 A 0 247 G 277 248 C 276 249 U 275 250 A 0 251 G 0 252 U 274 253 U 273 254 G 272 255 G 271 256 U 270 257 A 269 258 A 268 259 G 267 260 G 0 261 U 0 262 A 0 263 A 0 264 C 0 265 G 0 266 G 0 267 C 259 268 U 258 269 U 257 270 A 256 271 C 255 272 C 254 273 A 253 274 A 252 275 G 249 276 G 248 277 C 247 278 G 0 279 A 0 280 C 0 281 G 0 282 A 0 283 U 245 284 C 242 285 A 241 286 G 240 287 U 0 288 A 0 289 G 311 290 C 310 291 U 309 292 G 308 293 G 304 294 U 303 295 C 302 296 U 301 297 G 0 298 A 0 299 G 0 300 A 0 301 G 296 302 G 295 303 A 294 304 U 293 305 G 0 306 A 0 307 C 0 308 C 292 309 A 291 310 G 290 311 C 289 312 C 101 313 A 100 314 C 99 315 A 0 316 C 337 317 U 336 318 G 335 319 G 334 320 G 333 321 A 332 322 C 0 323 U 0 324 G 0 325 A 0 326 G 0 327 A 0 328 U 0 329 A 0 330 C 0 331 G 0 332 G 321 333 C 320 334 C 319 335 C 318 336 A 317 337 G 316 338 A 0 339 C 350 340 U 349 341 C 348 342 C 347 343 U 0 344 A 0 345 C 0 346 G 0 347 G 342 348 G 341 349 A 340 350 G 339 351 G 0 352 C 0 353 A 0 354 G 60 355 C 59 356 A 58 357 G 56 358 U 55 359 G 54 360 G 0 361 G 0 362 G 0 363 A 0 364 A 0 365 U 0 366 U 0 367 U 0 368 U 0 369 C 391 370 C 390 371 G 389 372 C 0 373 A 0 374 A 0 375 U 387 376 G 386 377 G 385 378 G 0 379 C 384 380 G 0 381 A 0 382 A 0 383 A 0 384 G 379 385 C 377 386 U 376 387 G 375 388 A 0 389 C 371 390 G 370 391 G 369 392 A 0 393 G 0 394 C 48 395 A 47 396 A 0 397 U 46 398 A 45 399 C 44 400 C 43 401 G 42 402 C 41 403 G 0 404 U 0 405 G 435 406 A 434 407 G 433 408 G 432 409 G 0 410 A 0 411 A 0 412 G 0 413 A 0 414 A 0 415 G 426 416 G 425 417 C 424 418 C 423 419 U 0 420 G 0 421 U 0 422 G 0 423 G 418 424 G 417 425 U 416 426 U 415 427 G 0 428 U 0 429 A 0 430 A 0 431 A 0 432 C 408 433 C 407 434 U 406 435 C 405 436 U 0 437 U 0 438 U 0 439 U 0 440 C 469 441 U 468 442 C 467 443 A 466 444 G 465 445 G 464 446 G 0 447 A 0 448 A 0 449 G 459 450 A 0 451 A 0 452 G 0 453 A 0 454 U 0 455 A 0 456 U 0 457 G 0 458 A 0 459 C 449 460 G 0 461 G 0 462 U 0 463 A 0 464 C 445 465 C 444 466 U 443 467 G 442 468 A 441 469 G 440 470 G 0 471 A 0 472 A 0 473 U 0 474 A 0 475 A 0 476 G 521 477 C 520 478 A 519 479 U 518 480 C 517 481 G 0 482 G 0 483 C 0 484 U 0 485 A 0 486 A 0 487 C 516 488 U 515 489 C 514 490 C 513 491 G 512 492 U 0 493 G 0 494 C 0 495 C 0 496 A 0 497 G 0 498 C 0 499 A 0 500 G 0 501 C 0 502 C 0 503 G 0 504 C 0 505 G 0 506 G 0 507 U 0 508 A 0 509 A 0 510 U 0 511 A 0 512 C 491 513 G 490 514 G 489 515 A 488 516 G 487 517 G 480 518 A 479 519 U 478 520 G 477 521 C 476 522 A 0 523 A 39 524 G 38 525 C 37 526 G 36 527 U 35 528 U 34 529 A 32 530 U 31 531 C 30 532 C 29 533 G 0 534 G 0 535 A 0 536 A 0 537 U 0 538 U 0 539 A 0 540 U 0 541 U 0 542 G 0 543 G 860 544 G 859 545 C 858 546 G 0 547 U 0 548 A 0 549 A 0 550 A 0 551 G 0 552 A 0 553 G 740 554 U 739 555 U 738 556 C 737 557 G 0 558 U 0 559 A 0 560 G 733 561 G 732 562 U 731 563 G 730 564 G 627 565 U 626 566 U 625 567 U 624 568 A 623 569 A 622 570 U 621 571 A 0 572 A 620 573 G 619 574 U 616 575 C 615 576 U 614 577 G 613 578 U 612 579 U 611 580 G 610 581 U 609 582 U 608 583 A 0 584 A 0 585 A 0 586 G 0 587 A 0 588 U 604 589 U 603 590 G 602 591 G 601 592 G 600 593 G 599 594 C 0 595 U 0 596 U 0 597 A 0 598 A 0 599 C 593 600 C 592 601 C 591 602 C 590 603 A 589 604 A 588 605 A 0 606 C 0 607 A 0 608 G 582 609 G 581 610 C 580 611 A 579 612 A 578 613 U 577 614 G 576 615 G 575 616 A 574 617 A 0 618 A 0 619 C 573 620 U 572 621 G 570 622 U 569 623 U 568 624 A 567 625 G 566 626 G 565 627 C 564 628 U 0 629 U 0 630 G 0 631 A 727 632 G 726 633 U 725 634 A 724 635 C 722 636 G 721 637 G 720 638 U 719 639 A 718 640 G 0 641 G 717 642 G 716 643 G 715 644 U 714 645 A 713 646 G 712 647 A 711 648 G 710 649 G 693 650 G 692 651 A 691 652 A 690 653 U 689 654 U 688 655 C 687 656 C 686 657 C 685 658 G 684 659 G 683 660 U 682 661 G 0 662 U 0 663 A 0 664 G 675 665 C 674 666 G 673 667 G 0 668 U 0 669 G 0 670 A 0 671 A 0 672 A 0 673 U 666 674 G 665 675 C 664 676 G 0 677 U 0 678 A 0 679 G 0 680 A 0 681 U 0 682 A 660 683 U 659 684 C 658 685 G 657 686 G 656 687 G 655 688 A 654 689 A 653 690 G 652 691 A 651 692 A 650 693 C 649 694 A 0 695 C 0 696 C 0 697 A 0 698 A 709 699 U 0 700 G 0 701 G 708 702 C 707 703 G 0 704 A 0 705 A 0 706 A 0 707 G 702 708 C 701 709 A 698 710 C 648 711 U 647 712 C 646 713 U 645 714 G 644 715 C 643 716 U 642 717 G 641 718 G 639 719 G 638 720 C 637 721 C 636 722 G 635 723 U 0 724 U 634 725 A 633 726 C 632 727 U 631 728 G 0 729 A 0 730 C 563 731 A 562 732 C 561 733 U 560 734 G 0 735 A 0 736 G 0 737 G 556 738 A 555 739 A 554 740 C 553 741 G 0 742 A 0 743 A 0 744 A 0 745 G 786 746 C 785 747 U 784 748 A 783 749 G 782 750 G 781 751 G 780 752 G 0 753 A 0 754 G 0 755 C 779 756 A 0 757 A 0 758 A 0 759 U 775 760 G 774 761 G 773 762 G 772 763 A 0 764 U 0 765 U 0 766 A 0 767 G 0 768 A 0 769 U 0 770 A 0 771 C 0 772 C 762 773 C 761 774 C 760 775 A 759 776 G 0 777 U 0 778 A 0 779 G 755 780 U 751 781 C 750 782 C 749 783 U 748 784 A 747 785 G 746 786 C 745 787 U 0 788 G 0 789 U 0 790 A 0 791 A 0 792 A 0 793 C 0 794 G 0 795 A 0 796 U 0 797 G 856 798 G 855 799 A 854 800 U 853 801 A 852 802 C 851 803 U 850 804 A 0 805 G 834 806 G 833 807 U 832 808 G 831 809 U 830 810 U 829 811 G 828 812 U 827 813 A 826 814 C 825 815 G 824 816 U 0 817 A 0 818 U 0 819 C 0 820 G 0 821 A 0 822 C 0 823 C 0 824 C 815 825 G 814 826 U 813 827 A 812 828 C 811 829 A 810 830 G 809 831 U 808 832 A 807 833 C 806 834 U 805 835 G 0 836 U 0 837 A 847 838 C 846 839 G 845 840 U 0 841 A 0 842 A 0 843 C 0 844 G 0 845 C 839 846 G 838 847 U 837 848 U 0 849 A 0 850 A 803 851 G 802 852 U 801 853 A 800 854 U 799 855 C 798 856 C 797 857 C 0 858 G 545 859 C 544 860 C 543 861 U 0 862 G 889 863 G 888 864 G 887 865 G 0 866 A 0 867 G 0 868 U 0 869 A 0 870 C 0 871 G 882 872 C 881 873 U 880 874 C 879 875 G 0 876 C 0 877 A 0 878 A 0 879 G 874 880 A 873 881 G 872 882 U 871 883 G 0 884 A 0 885 A 0 886 A 0 887 C 864 888 U 863 889 C 862 890 A 0 891 A 0 892 A 0 893 G 21 894 G 20 895 A 19 896 A 0 897 U 0 898 U 1373 899 G 1372 900 A 1370 901 C 1369 902 G 1368 903 G 0 904 G 1367 905 G 1366 906 G 1365 907 C 1364 908 C 1363 909 C 1362 910 G 1361 911 C 0 912 A 0 913 C 0 914 A 0 915 A 1321 916 G 1320 917 C 1319 918 G 1318 919 G 1317 920 U 1316 921 G 0 922 G 1212 923 A 1211 924 G 1210 925 C 1209 926 A 1208 927 U 1207 928 G 1206 929 U 1205 930 G 1204 931 G 1202 932 U 1201 933 U 0 934 U 0 935 A 0 936 A 0 937 U 952 938 U 951 939 C 950 940 G 949 941 A 0 942 U 0 943 G 0 944 C 0 945 A 0 946 A 0 947 C 0 948 G 0 949 C 940 950 G 939 951 A 938 952 A 937 953 G 0 954 A 0 955 A 0 956 C 0 957 C 0 958 U 0 959 U 0 960 A 0 961 C 1197 962 C 1196 963 A 1195 964 G 1194 965 G 1193 966 A 1192 967 U 1191 968 U 0 969 U 0 970 G 0 971 A 0 972 C 0 973 A 1022 974 U 1021 975 G 1020 976 U 1018 977 C 1017 978 G 1016 979 C 1015 980 G 1014 981 A 0 982 A 0 983 U 1000 984 U 999 985 U 998 986 U 997 987 C 996 988 U 995 989 U 994 990 G 0 991 A 0 992 A 0 993 A 0 994 A 989 995 A 988 996 G 987 997 A 986 998 A 985 999 A 984 1000 A 983 1001 G 0 1002 U 1013 1003 G 1012 1004 C 1011 1005 C 1010 1006 U 0 1007 U 0 1008 C 0 1009 G 0 1010 G 1005 1011 G 1004 1012 A 1003 1013 G 1002 1014 C 980 1015 G 979 1016 C 978 1017 G 977 1018 A 976 1019 A 0 1020 C 975 1021 A 974 1022 C 973 1023 A 0 1024 G 1186 1025 G 1185 1026 U 0 1027 G 1184 1028 G 1183 1029 U 1182 1030 G 1181 1031 C 0 1032 A 0 1033 U 1180 1034 G 1179 1035 G 1175 1036 C 1174 1037 U 1173 1038 G 1171 1039 U 1170 1040 C 1169 1041 G 1168 1042 U 1167 1043 C 0 1044 A 0 1045 G 1084 1046 C 1083 1047 U 1082 1048 C 1081 1049 G 1080 1050 U 1079 1051 G 1060 1052 U 1059 1053 C 1058 1054 G 0 1055 U 0 1056 G 0 1057 A 0 1058 G 1053 1059 A 1052 1060 U 1051 1061 G 0 1062 U 0 1063 U 1076 1064 G 1075 1065 G 1074 1066 G 1073 1067 U 0 1068 U 0 1069 A 0 1070 A 0 1071 G 0 1072 U 0 1073 C 1066 1074 C 1065 1075 C 1064 1076 G 1063 1077 C 0 1078 A 0 1079 A 1050 1080 C 1049 1081 G 1048 1082 A 1047 1083 G 1046 1084 C 1045 1085 G 0 1086 C 0 1087 A 0 1088 A 0 1089 C 0 1090 C 1163 1091 C 1162 1092 U 1161 1093 U 1160 1094 G 1159 1095 U 1131 1096 U 1130 1097 U 1129 1098 U 1128 1099 U 1127 1100 A 1126 1101 G 1125 1102 U 0 1103 U 1122 1104 G 1121 1105 C 1120 1106 C 1119 1107 A 1117 1108 G 1116 1109 C 1115 1110 A 0 1111 U 0 1112 U 0 1113 C 0 1114 A 0 1115 G 1109 1116 U 1108 1117 U 1107 1118 G 0 1119 G 1106 1120 G 1105 1121 U 1104 1122 A 1103 1123 C 0 1124 U 0 1125 C 1101 1126 U 1100 1127 A 1099 1128 A 1098 1129 A 1097 1130 G 1096 1131 A 1095 1132 A 0 1133 A 0 1134 C 0 1135 U 0 1136 G 0 1137 C 1151 1138 C 1150 1139 G 1149 1140 G 1148 1141 U 1147 1142 G 0 1143 A 0 1144 C 0 1145 A 0 1146 A 0 1147 G 1141 1148 C 1140 1149 C 1139 1150 G 1138 1151 G 1137 1152 A 0 1153 G 0 1154 G 0 1155 A 0 1156 A 0 1157 G 0 1158 G 0 1159 G 1094 1160 A 1093 1161 G 1092 1162 G 1091 1163 G 1090 1164 A 0 1165 U 0 1166 G 0 1167 A 1042 1168 C 1041 1169 G 1040 1170 U 1039 1171 C 1038 1172 A 0 1173 A 1037 1174 G 1036 1175 U 1035 1176 C 0 1177 A 0 1178 G 0 1179 C 1034 1180 A 1033 1181 U 1030 1182 G 1029 1183 C 1028 1184 C 1027 1185 C 1025 1186 C 1024 1187 U 0 1188 U 0 1189 A 0 1190 U 0 1191 A 967 1192 U 966 1193 C 965 1194 C 964 1195 U 963 1196 G 962 1197 G 961 1198 G 0 1199 C 0 1200 U 0 1201 A 932 1202 C 931 1203 A 0 1204 C 930 1205 A 929 1206 C 928 1207 G 927 1208 U 926 1209 G 925 1210 C 924 1211 U 923 1212 A 922 1213 C 0 1214 A 0 1215 A 0 1216 U 0 1217 G 1272 1218 G 1271 1219 C 1270 1220 C 1269 1221 G 1268 1222 G 1267 1223 G 1266 1224 A 0 1225 C 0 1226 A 0 1227 A 0 1228 A 0 1229 A 1260 1230 G 1259 1231 G 1258 1232 U 0 1233 C 0 1234 G 1253 1235 C 1252 1236 G 0 1237 A 0 1238 A 0 1239 C 1248 1240 U 1247 1241 U 1246 1242 G 0 1243 U 0 1244 G 0 1245 A 0 1246 A 1241 1247 A 1240 1248 G 1239 1249 U 0 1250 A 0 1251 A 0 1252 G 1235 1253 C 1234 1254 C 0 1255 A 0 1256 A 0 1257 U 0 1258 C 1231 1259 C 1230 1260 U 1229 1261 A 0 1262 U 0 1263 A 0 1264 A 0 1265 A 0 1266 C 1223 1267 C 1222 1268 C 1221 1269 G 1220 1270 G 1219 1271 U 1218 1272 C 1217 1273 U 0 1274 C 0 1275 A 0 1276 G 0 1277 U 0 1278 U 0 1279 C 1310 1280 G 1309 1281 G 1308 1282 A 1307 1283 U 1306 1284 U 1305 1285 G 1304 1286 C 1303 1287 A 1302 1288 G 1301 1289 G 1300 1290 C 1299 1291 U 0 1292 G 0 1293 C 0 1294 A 0 1295 A 0 1296 C 0 1297 U 0 1298 C 0 1299 G 1290 1300 C 1289 1301 C 1288 1302 U 1287 1303 G 1286 1304 C 1285 1305 A 1284 1306 U 1283 1307 G 1282 1308 A 1281 1309 A 1280 1310 G 1279 1311 G 0 1312 U 0 1313 G 0 1314 G 0 1315 A 0 1316 A 920 1317 U 919 1318 C 918 1319 G 917 1320 C 916 1321 U 915 1322 A 0 1323 G 0 1324 U 0 1325 A 0 1326 A 1349 1327 U 1348 1328 C 1347 1329 G 1346 1330 C 1345 1331 C 1344 1332 G 1343 1333 G 1342 1334 U 0 1335 C 0 1336 A 0 1337 G 0 1338 C 0 1339 U 0 1340 A 0 1341 U 0 1342 A 1333 1343 C 1332 1344 G 1331 1345 G 1330 1346 C 1329 1347 G 1328 1348 G 1327 1349 U 1326 1350 G 0 1351 A 0 1352 A 0 1353 U 0 1354 C 0 1355 C 0 1356 G 0 1357 U 0 1358 U 0 1359 C 0 1360 C 0 1361 C 910 1362 G 909 1363 G 908 1364 G 907 1365 C 906 1366 C 905 1367 U 904 1368 U 902 1369 G 901 1370 U 900 1371 A 0 1372 C 899 1373 A 898 1374 C 0 1375 A 0 1376 C 0 1377 C 0 1378 G 1478 1379 C 1477 1380 C 0 1381 C 1474 1382 G 1473 1383 U 0 1384 C 1471 1385 A 0 1386 C 1468 1387 A 1467 1388 C 1466 1389 C 1465 1390 A 1464 1391 U 1463 1392 G 1462 1393 G 1461 1394 G 1460 1395 A 1459 1396 G 1458 1397 U 1457 1398 U 1456 1399 G 1455 1400 G 1454 1401 C 1453 1402 C 1452 1403 A 1451 1404 C 1450 1405 G 1449 1406 C 1448 1407 C 1447 1408 G 0 1409 A 0 1410 A 0 1411 G 1443 1412 U 1442 1413 C 1441 1414 G 1440 1415 U 1439 1416 U 1438 1417 A 0 1418 C 1437 1419 C 1436 1420 C 1435 1421 U 1434 1422 A 0 1423 A 0 1424 C 1432 1425 U 1431 1426 U 0 1427 U 0 1428 U 0 1429 U 0 1430 U 0 1431 A 1425 1432 G 1424 1433 A 0 1434 G 1421 1435 G 1420 1436 G 1419 1437 G 1418 1438 G 1416 1439 A 1415 1440 C 1414 1441 G 1413 1442 C 1412 1443 C 1411 1444 G 0 1445 N 0 1446 N 0 1447 N 1407 1448 N 1406 1449 N 1405 1450 N 1404 1451 G 1403 1452 G 1402 1453 G 1401 1454 C 1400 1455 U 1399 1456 G 1398 1457 G 1397 1458 U 1396 1459 G 1395 1460 A 1394 1461 C 1393 1462 U 1392 1463 G 1391 1464 G 1390 1465 G 1389 1466 G 1388 1467 U 1387 1468 G 1386 1469 A 0 1470 A 0 1471 G 1384 1472 U 0 1473 C 1382 1474 G 1381 1475 U 0 1476 A 0 1477 A 1379 1478 C 1378 1479 A 0 1480 A 0 1481 G 0 1482 G 0 1483 U 1506 1484 A 1505 1485 G 1504 1486 C 1503 1487 C 1502 1488 G 1501 1489 U 1500 1490 A 1499 1491 C 1498 1492 U 1497 1493 G 0 1494 G 0 1495 A 0 1496 A 0 1497 G 1492 1498 G 1491 1499 U 1490 1500 G 1489 1501 U 1488 1502 G 1487 1503 G 1486 1504 U 1485 1505 U 1484 1506 G 1483 1507 G 0 1508 A 0 1509 U 0 1510 C 0 1511 A 0 1512 C 0 1513 C 0 1514 U 0 1515 C 0 1516 C 0 1517 U 0 1518 U 0 1519 G 0