Filename: a.16.c.P.thurberi.bpseq Organism: Pilostyles thurberi Accession Number: U67741 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 N 0 3 N 0 4 N 0 5 N 0 6 N 0 7 N 0 8 N 0 9 N 0 10 N 26 11 N 25 12 N 24 13 N 23 14 N 22 15 N 0 16 N 0 17 N 0 18 N 961 19 N 960 20 N 959 21 N 0 22 N 14 23 N 13 24 N 12 25 N 11 26 N 10 27 N 0 28 N 468 29 N 467 30 N 466 31 N 465 32 N 0 33 N 464 34 N 463 35 N 462 36 N 461 37 N 460 38 N 459 39 N 0 40 N 353 41 N 352 42 N 351 43 N 350 44 N 349 45 N 348 46 N 346 47 N 345 48 N 0 49 N 0 50 N 0 51 N 0 52 A 0 53 C 306 54 A 305 55 C 304 56 A 0 57 U 303 58 G 302 59 C 301 60 A 0 61 A 0 62 G 120 63 U 119 64 U 118 65 U 0 66 U 0 67 A 115 68 C 114 69 U 113 70 U 112 71 U 111 72 U 103 73 A 102 74 U 101 75 C 100 76 U 0 77 A 97 78 A 96 79 C 95 80 A 94 81 C 93 82 U 92 83 U 0 84 U 0 85 U 0 86 U 0 87 U 0 88 A 0 89 U 0 90 U 0 91 U 0 92 G 82 93 G 81 94 U 80 95 G 79 96 U 78 97 U 77 98 U 0 99 U 0 100 G 75 101 A 74 102 U 73 103 A 72 104 A 0 105 U 0 106 A 0 107 A 0 108 A 0 109 U 0 110 U 0 111 A 71 112 A 70 113 A 69 114 G 68 115 U 67 116 A 0 117 A 0 118 G 64 119 G 63 120 C 62 121 G 0 122 A 0 123 A 0 124 C 0 125 G 0 126 G 0 127 G 257 128 U 256 129 G 255 130 A 0 131 G 0 132 U 0 133 A 0 134 A 0 135 U 0 136 A 183 137 U 182 138 A 181 139 U 180 140 A 179 141 A 178 142 G 177 143 A 176 144 A 0 145 U 175 146 C 174 147 U 0 148 A 0 149 C 0 150 C 171 151 A 170 152 U 169 153 U 168 154 C 0 155 A 167 156 A 166 157 U 165 158 U 0 159 U 0 160 U 0 161 U 0 162 A 0 163 U 0 164 A 0 165 A 157 166 U 156 167 U 155 168 A 153 169 A 152 170 U 151 171 G 150 172 A 0 173 U 0 174 G 146 175 A 145 176 G 143 177 C 142 178 U 141 179 U 140 180 A 139 181 U 138 182 A 137 183 U 136 184 C 229 185 U 228 186 A 227 187 A 0 188 U 0 189 U 226 190 A 0 191 G 220 192 U 219 193 U 218 194 U 0 195 G 0 196 U 217 197 U 216 198 G 215 199 G 214 200 C 213 201 G 212 202 G 211 203 G 210 204 G 0 205 U 0 206 A 0 207 A 0 208 G 0 209 G 0 210 C 203 211 C 202 212 U 201 213 A 200 214 C 199 215 C 198 216 A 197 217 A 196 218 G 193 219 A 192 220 C 191 221 U 0 222 U 0 223 U 0 224 G 0 225 A 0 226 U 189 227 U 186 228 A 185 229 G 184 230 U 0 231 A 0 232 G 254 233 U 253 234 U 252 235 G 251 236 G 247 237 U 246 238 U 245 239 U 244 240 G 0 241 G 0 242 A 0 243 A 0 244 G 239 245 A 238 246 A 237 247 U 236 248 G 0 249 A 0 250 U 0 251 C 235 252 A 234 253 G 233 254 C 232 255 C 129 256 A 128 257 C 127 258 A 0 259 C 280 260 U 279 261 A 278 262 G 277 263 G 276 264 A 275 265 C 0 266 U 0 267 G 0 268 A 0 269 A 0 270 A 0 271 C 0 272 A 0 273 A 0 274 G 0 275 G 264 276 C 263 277 C 262 278 U 261 279 A 260 280 G 259 281 A 0 282 C 297 283 U 296 284 A 295 285 A 294 286 U 293 287 U 292 288 U 0 289 U 0 290 U 0 291 U 0 292 A 287 293 A 286 294 U 285 295 U 284 296 A 283 297 G 282 298 U 0 299 C 0 300 A 0 301 G 59 302 C 58 303 A 57 304 G 55 305 U 54 306 G 53 307 G 0 308 G 0 309 G 0 310 G 0 311 A 0 312 U 0 313 A 0 314 U 343 315 U 0 316 C 342 317 U 341 318 G 340 319 C 0 320 A 0 321 A 0 322 U 338 323 G 337 324 G 336 325 G 335 326 C 334 327 A 333 328 A 0 329 U 0 330 A 0 331 A 0 332 G 0 333 U 327 334 G 326 335 C 325 336 C 324 337 U 323 338 G 322 339 A 0 340 C 318 341 A 317 342 G 316 343 A 314 344 G 0 345 U 47 346 A 46 347 A 0 348 U 45 349 A 44 350 U 43 351 C 42 352 G 41 353 A 40 354 G 0 355 U 0 356 U 372 357 A 371 358 A 370 359 C 368 360 U 367 361 C 366 362 A 0 363 A 0 364 A 0 365 U 0 366 G 361 367 A 360 368 G 359 369 U 0 370 U 358 371 U 357 372 A 356 373 U 0 374 U 408 375 U 0 376 C 0 377 U 405 378 U 404 379 A 403 380 A 402 381 A 401 382 A 400 383 G 0 384 A 0 385 U 0 386 U 395 387 A 0 388 A 0 389 U 0 390 U 0 391 A 0 392 A 0 393 G 0 394 A 0 395 A 386 396 G 0 397 G 0 398 U 0 399 A 0 400 U 382 401 U 381 402 U 380 403 U 379 404 A 378 405 A 377 406 G 0 407 A 0 408 A 374 409 A 0 410 A 0 411 G 457 412 U 456 413 A 455 414 U 454 415 U 453 416 G 0 417 G 0 418 C 0 419 U 0 420 A 0 421 A 0 422 C 452 423 U 451 424 C 0 425 C 450 426 U 449 427 G 448 428 U 0 429 G 0 430 C 0 431 C 0 432 A 0 433 G 0 434 C 0 435 A 0 436 G 0 437 C 0 438 C 0 439 G 0 440 C 0 441 G 0 442 G 0 443 U 0 444 A 0 445 A 0 446 U 0 447 A 0 448 C 427 449 A 426 450 G 425 451 G 423 452 G 422 453 A 415 454 A 414 455 U 413 456 G 412 457 C 411 458 A 0 459 A 38 460 G 37 461 C 36 462 G 35 463 U 34 464 U 33 465 A 31 466 U 30 467 U 29 468 C 28 469 G 0 470 G 0 471 U 0 472 U 0 473 U 0 474 A 0 475 A 0 476 U 0 477 U 0 478 A 0 479 G 926 480 G 925 481 U 924 482 G 0 483 U 0 484 A 0 485 A 0 486 A 0 487 A 0 488 G 0 489 G 712 490 U 711 491 U 710 492 G 709 493 U 0 494 U 0 495 A 0 496 G 704 497 G 703 498 C 702 499 U 701 500 U 594 501 U 593 502 U 592 503 C 591 504 G 590 505 U 589 506 U 588 507 A 0 508 A 587 509 G 586 510 U 583 511 G 582 512 U 0 513 U 0 514 U 0 515 U 0 516 G 0 517 U 0 518 U 0 519 A 0 520 A 0 521 A 0 522 G 0 523 U 573 524 C 572 525 C 571 526 A 570 527 A 569 528 A 568 529 A 567 530 U 0 531 U 0 532 A 0 533 U 0 534 U 0 535 U 0 536 A 0 537 A 0 538 C 0 539 C 0 540 A 0 541 U 0 542 U 0 543 C 0 544 C 0 545 U 0 546 U 0 547 A 0 548 A 0 549 U 0 550 U 0 551 A 0 552 U 0 553 A 0 554 A 0 555 A 0 556 U 0 557 U 0 558 U 0 559 U 0 560 A 0 561 U 0 562 A 0 563 G 0 564 U 0 565 U 0 566 U 0 567 U 529 568 U 528 569 U 527 570 U 526 571 G 525 572 G 524 573 G 523 574 G 0 575 U 0 576 G 0 577 C 0 578 A 0 579 U 0 580 U 0 581 U 0 582 C 511 583 A 510 584 U 0 585 A 0 586 C 509 587 U 508 588 A 506 589 A 505 590 C 504 591 A 503 592 G 502 593 A 501 594 A 500 595 U 0 596 G 0 597 G 0 598 A 698 599 G 697 600 U 696 601 A 695 602 U 693 603 U 692 604 A 691 605 A 690 606 A 689 607 C 0 608 A 0 609 C 0 610 A 0 611 A 0 612 A 0 613 A 688 614 G 687 615 A 686 616 U 685 617 A 684 618 G 683 619 A 682 620 U 681 621 A 664 622 G 663 623 A 662 624 A 661 625 C 660 626 C 659 627 U 658 628 U 657 629 A 656 630 U 655 631 G 654 632 A 0 633 U 653 634 G 0 635 A 0 636 A 0 637 C 646 638 A 645 639 A 0 640 U 0 641 U 0 642 A 0 643 A 0 644 A 0 645 U 638 646 G 637 647 U 0 648 U 0 649 U 0 650 U 0 651 A 0 652 A 0 653 A 633 654 U 631 655 A 630 656 U 629 657 A 628 658 A 627 659 G 626 660 G 625 661 G 624 662 A 623 663 C 622 664 U 621 665 G 0 666 C 0 667 C 0 668 A 0 669 A 680 670 U 0 671 G 0 672 G 679 673 U 678 674 G 0 675 A 0 676 A 0 677 G 0 678 A 673 679 C 672 680 A 669 681 A 620 682 U 619 683 C 618 684 U 617 685 A 616 686 U 615 687 U 614 688 A 613 689 U 606 690 G 605 691 U 604 692 U 603 693 A 602 694 A 0 695 U 601 696 A 600 697 C 599 698 U 598 699 G 0 700 A 0 701 C 499 702 G 498 703 C 497 704 U 496 705 G 0 706 A 0 707 G 0 708 U 0 709 C 492 710 A 491 711 A 490 712 C 489 713 G 0 714 A 0 715 A 0 716 A 0 717 G 758 718 C 757 719 A 754 720 C 753 721 G 752 722 G 751 723 G 0 724 A 0 725 G 0 726 A 0 727 A 0 728 A 0 729 U 746 730 G 745 731 G 744 732 G 743 733 A 0 734 U 0 735 U 0 736 U 0 737 A 0 738 G 0 739 A 0 740 G 0 741 A 0 742 C 0 743 C 732 744 C 731 745 C 730 746 A 729 747 G 0 748 U 0 749 A 0 750 A 0 751 U 722 752 C 721 753 G 720 754 U 719 755 A 0 756 U 0 757 G 718 758 C 717 759 U 0 760 G 0 761 U 0 762 A 0 763 A 0 764 A 0 765 U 0 766 U 0 767 U 0 768 U 0 769 G 922 770 A 921 771 A 920 772 U 919 773 A 918 774 C 917 775 U 0 776 A 0 777 G 899 778 G 898 779 C 897 780 U 896 781 A 895 782 U 894 783 A 893 784 A 892 785 A 891 786 C 0 787 A 855 788 A 854 789 A 853 790 A 852 791 G 851 792 A 850 793 A 849 794 G 848 795 A 847 796 C 0 797 U 0 798 U 0 799 U 0 800 A 819 801 C 818 802 U 817 803 G 816 804 G 814 805 U 813 806 U 812 807 C 0 808 C 0 809 A 0 810 U 0 811 U 0 812 A 806 813 A 805 814 C 804 815 U 0 816 C 803 817 A 802 818 G 801 819 U 800 820 U 0 821 U 0 822 A 0 823 U 0 824 U 0 825 G 845 826 G 844 827 A 843 828 A 842 829 U 0 830 G 0 831 C 0 832 A 841 833 A 840 834 G 839 835 U 0 836 U 0 837 U 0 838 U 0 839 C 834 840 U 833 841 U 832 842 U 828 843 U 827 844 C 826 845 C 825 846 U 0 847 U 795 848 U 794 849 U 793 850 U 792 851 U 791 852 U 790 853 U 789 854 U 788 855 U 787 856 A 889 857 A 888 858 U 887 859 A 886 860 U 885 861 A 884 862 U 883 863 A 882 864 U 881 865 U 880 866 A 879 867 A 877 868 U 876 869 A 875 870 U 874 871 U 0 872 U 0 873 U 0 874 A 870 875 U 869 876 A 868 877 U 867 878 A 0 879 U 866 880 A 865 881 G 864 882 U 863 883 A 862 884 U 861 885 A 860 886 U 859 887 A 858 888 U 857 889 U 856 890 U 0 891 U 785 892 U 784 893 U 783 894 G 782 895 U 781 896 G 780 897 G 779 898 C 778 899 C 777 900 A 0 901 C 0 902 A 0 903 G 910 904 U 909 905 U 0 906 A 0 907 A 0 908 C 0 909 A 904 910 C 903 911 G 0 912 U 0 913 U 0 914 U 0 915 A 0 916 A 0 917 G 774 918 U 773 919 A 772 920 U 771 921 U 770 922 G 769 923 U 0 924 A 481 925 C 480 926 C 479 927 U 0 928 G 955 929 G 954 930 A 953 931 A 0 932 A 0 933 G 0 934 U 0 935 A 0 936 C 0 937 G 948 938 U 947 939 C 946 940 C 945 941 G 0 942 C 0 943 A 0 944 A 0 945 G 940 946 G 939 947 A 938 948 U 937 949 G 0 950 A 0 951 A 0 952 A 0 953 U 930 954 U 929 955 C 928 956 A 0 957 A 0 958 A 0 959 G 20 960 G 19 961 A 18 962 A 0 963 U 0 964 U 1398 965 G 1397 966 G 1395 967 C 1394 968 G 1393 969 U 0 970 G 1392 971 A 1391 972 A 1390 973 U 1389 974 C 1388 975 U 1387 976 U 1386 977 U 0 978 A 0 979 C 0 980 A 0 981 U 0 982 U 0 983 U 0 984 U 0 985 U 0 986 A 0 987 C 0 988 A 1320 989 A 1319 990 C 1318 991 G 1317 992 A 1316 993 U 1315 994 G 0 995 G 1231 996 A 1230 997 G 1229 998 C 1228 999 A 1227 1000 U 1226 1001 G 1225 1002 U 1224 1003 G 1223 1004 G 1221 1005 U 1220 1006 U 0 1007 U 0 1008 A 0 1009 A 0 1010 U 1025 1011 U 1024 1012 C 1023 1013 G 1022 1014 A 0 1015 C 0 1016 A 0 1017 A 0 1018 A 0 1019 G 0 1020 A 0 1021 G 0 1022 C 1013 1023 G 1012 1024 A 1011 1025 A 1010 1026 A 0 1027 A 0 1028 A 0 1029 C 0 1030 A 0 1031 U 0 1032 U 0 1033 A 0 1034 U 1216 1035 C 1215 1036 A 1214 1037 A 1213 1038 G 1212 1039 G 1211 1040 U 1210 1041 U 0 1042 U 0 1043 A 0 1044 A 0 1045 C 0 1046 G 1206 1047 G 1205 1048 U 0 1049 G 1204 1050 G 1203 1051 U 1202 1052 G 1201 1053 C 0 1054 A 0 1055 U 1200 1056 G 1199 1057 G 1195 1058 C 1194 1059 U 1193 1060 G 1191 1061 U 1190 1062 U 0 1063 A 0 1064 U 1099 1065 C 1098 1066 G 1097 1067 U 1096 1068 G 1077 1069 C 1076 1070 U 1075 1071 G 0 1072 U 0 1073 G 0 1074 A 0 1075 A 1070 1076 G 1069 1077 U 1068 1078 G 0 1079 U 0 1080 C 1093 1081 A 1092 1082 G 1091 1083 G 1090 1084 U 0 1085 U 0 1086 A 0 1087 A 0 1088 G 0 1089 U 0 1090 C 1083 1091 C 1082 1092 U 1081 1093 G 1080 1094 U 0 1095 A 0 1096 A 1067 1097 C 1066 1098 G 1065 1099 A 1064 1100 G 0 1101 C 0 1102 G 0 1103 C 0 1104 A 0 1105 A 0 1106 C 0 1107 C 1183 1108 C 1182 1109 U 1181 1110 U 1180 1111 A 0 1112 G 1149 1113 U 1148 1114 A 1147 1115 A 1146 1116 U 1145 1117 U 1144 1118 U 0 1119 G 0 1120 U 0 1121 U 0 1122 G 1140 1123 U 1139 1124 U 1138 1125 U 1137 1126 A 1136 1127 A 1135 1128 U 1134 1129 U 1133 1130 A 0 1131 U 0 1132 A 0 1133 A 1129 1134 A 1128 1135 U 1127 1136 A 1126 1137 A 1125 1138 A 1124 1139 G 1123 1140 A 1122 1141 A 0 1142 C 0 1143 U 0 1144 A 1117 1145 A 1116 1146 U 1115 1147 U 1114 1148 A 1113 1149 U 1112 1150 G 0 1151 A 0 1152 C 0 1153 U 0 1154 U 0 1155 C 1173 1156 U 1172 1157 U 1171 1158 A 0 1159 A 0 1160 U 0 1161 A 0 1162 A 0 1163 U 0 1164 A 0 1165 C 0 1166 A 0 1167 U 0 1168 A 0 1169 A 0 1170 A 0 1171 A 1157 1172 A 1156 1173 G 1155 1174 A 0 1175 G 0 1176 G 0 1177 A 0 1178 A 0 1179 G 0 1180 A 1110 1181 A 1109 1182 G 1108 1183 G 1107 1184 A 0 1185 C 0 1186 A 0 1187 A 0 1188 A 0 1189 A 0 1190 A 1061 1191 C 1060 1192 A 0 1193 A 1059 1194 G 1058 1195 U 1057 1196 A 0 1197 A 0 1198 A 0 1199 C 1056 1200 U 1055 1201 U 1052 1202 G 1051 1203 C 1050 1204 C 1049 1205 C 1047 1206 C 1046 1207 U 0 1208 A 0 1209 U 0 1210 A 1040 1211 C 1039 1212 U 1038 1213 U 1037 1214 U 1036 1215 G 1035 1216 A 1034 1217 G 0 1218 C 0 1219 A 0 1220 A 1005 1221 C 1004 1222 A 0 1223 C 1003 1224 G 1002 1225 C 1001 1226 G 1000 1227 U 999 1228 G 998 1229 C 997 1230 U 996 1231 A 995 1232 C 0 1233 A 0 1234 A 0 1235 U 0 1236 G 1269 1237 G 1268 1238 A 1267 1239 A 0 1240 A 1266 1241 A 1265 1242 U 1264 1243 A 1263 1244 A 0 1245 C 0 1246 A 0 1247 A 0 1248 A 1258 1249 G 1257 1250 U 0 1251 U 0 1252 U 0 1253 U 0 1254 A 0 1255 U 0 1256 U 0 1257 C 1249 1258 U 1248 1259 U 0 1260 A 0 1261 A 0 1262 A 0 1263 U 1243 1264 A 1242 1265 U 1241 1266 U 1240 1267 U 1238 1268 C 1237 1269 C 1236 1270 U 0 1271 C 0 1272 A 0 1273 G 0 1274 U 0 1275 U 0 1276 C 1309 1277 G 0 1278 G 0 1279 A 0 1280 U 1305 1281 U 1304 1282 G 1303 1283 U 1302 1284 A 1301 1285 U 1300 1286 A 1299 1287 U 1298 1288 G 0 1289 G 0 1290 A 0 1291 U 0 1292 U 0 1293 A 0 1294 A 0 1295 A 0 1296 A 0 1297 U 0 1298 G 1287 1299 C 1286 1300 C 1285 1301 U 1284 1302 A 1283 1303 C 1282 1304 A 1281 1305 U 1280 1306 G 0 1307 A 0 1308 A 0 1309 G 1276 1310 U 0 1311 U 0 1312 G 0 1313 A 0 1314 A 0 1315 A 993 1316 U 992 1317 C 991 1318 G 990 1319 U 989 1320 A 988 1321 U 0 1322 U 0 1323 U 0 1324 U 0 1325 G 0 1326 A 0 1327 A 0 1328 G 0 1329 U 0 1330 A 0 1331 A 1352 1332 U 1351 1333 C 1350 1334 G 1349 1335 U 1348 1336 A 1347 1337 A 1346 1338 A 0 1339 A 0 1340 A 0 1341 G 0 1342 G 0 1343 U 0 1344 C 0 1345 C 0 1346 U 1337 1347 U 1336 1348 A 1335 1349 C 1334 1350 G 1333 1351 G 1332 1352 U 1331 1353 G 0 1354 A 0 1355 A 0 1356 G 0 1357 A 0 1358 U 0 1359 U 0 1360 U 0 1361 G 0 1362 U 0 1363 U 0 1364 U 0 1365 U 0 1366 A 1381 1367 A 1380 1368 A 1379 1369 U 1378 1370 U 0 1371 U 0 1372 U 0 1373 U 0 1374 U 0 1375 U 0 1376 U 0 1377 U 0 1378 A 1369 1379 U 1368 1380 U 1367 1381 U 1366 1382 C 0 1383 G 0 1384 U 0 1385 A 0 1386 A 976 1387 A 975 1388 G 974 1389 G 973 1390 U 972 1391 U 971 1392 U 970 1393 C 968 1394 G 967 1395 U 966 1396 A 0 1397 C 965 1398 A 964 1399 U 0 1400 A 0 1401 C 0 1402 U 0 1403 G 1490 1404 C 1489 1405 C 0 1406 C 1486 1407 G 1485 1408 U 0 1409 C 1483 1410 A 0 1411 C 1480 1412 G 1479 1413 U 1478 1414 U 1477 1415 C 1476 1416 C 1475 1417 G 1474 1418 A 1473 1419 U 1472 1420 G 1471 1421 A 1470 1422 U 1469 1423 U 0 1424 A 0 1425 C 0 1426 G 1467 1427 U 1466 1428 U 1465 1429 U 1464 1430 U 1463 1431 A 1462 1432 C 1461 1433 U 0 1434 U 0 1435 A 0 1436 A 0 1437 A 1457 1438 G 1456 1439 U 1455 1440 U 1454 1441 U 1453 1442 U 1452 1443 U 1451 1444 C 1450 1445 C 1449 1446 U 0 1447 A 0 1448 A 0 1449 G 1445 1450 G 1444 1451 A 1443 1452 A 1442 1453 A 1441 1454 G 1440 1455 A 1439 1456 U 1438 1457 G 1437 1458 A 0 1459 A 0 1460 U 0 1461 G 1432 1462 U 1431 1463 A 1430 1464 A 1429 1465 A 1428 1466 A 1427 1467 U 1426 1468 U 0 1469 G 1422 1470 U 1421 1471 C 1420 1472 A 1419 1473 U 1418 1474 U 1417 1475 G 1416 1476 U 1415 1477 A 1414 1478 A 1413 1479 U 1412 1480 G 1411 1481 A 0 1482 A 0 1483 G 1409 1484 U 0 1485 C 1407 1486 G 1406 1487 U 0 1488 A 0 1489 A 1404 1490 C 1403 1491 A 0 1492 A 0 1493 G 0 1494 G 0 1495 U 1518 1496 A 1517 1497 G 1516 1498 C 1515 1499 U 1514 1500 G 1513 1501 U 1512 1502 G 1511 1503 U 1510 1504 C 1509 1505 G 0 1506 G 0 1507 A 0 1508 A 0 1509 G 1504 1510 G 1503 1511 U 1502 1512 G 1501 1513 C 1500 1514 G 1499 1515 G 1498 1516 N 1497 1517 N 1496 1518 N 1495 1519 N 0 1520 N 0 1521 N 0 1522 N 0 1523 N 0 1524 N 0 1525 N 0 1526 N 0 1527 N 0 1528 N 0 1529 N 0 1530 N 0 1531 N 0