Filename: b.16.m.D.discoideum.bpseq Organism: Dictyostelium discoideum Accession Number: D16466 AB000109 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 A 0 2 A 0 3 G 0 4 A 0 5 A 0 6 A 0 7 A 0 8 A 0 9 A 0 10 A 0 11 U 0 12 G 28 13 A 27 14 G 26 15 U 25 16 U 24 17 U 0 18 G 0 19 A 0 20 U 851 21 U 850 22 C 849 23 U 0 24 G 16 25 G 15 26 C 14 27 U 13 28 C 12 29 C 0 30 G 496 31 A 495 32 A 494 33 U 493 34 G 0 35 A 492 36 A 491 37 U 490 38 G 489 39 C 488 40 U 487 41 A 0 42 U 373 43 C 372 44 A 371 45 G 370 46 U 369 47 G 368 48 G 366 49 G 365 50 C 0 51 U 0 52 U 0 53 U 0 54 A 0 55 U 329 56 A 328 57 C 327 58 A 0 59 U 326 60 G 325 61 C 324 62 A 0 63 A 0 64 G 91 65 U 90 66 U 89 67 G 0 68 A 0 69 A 88 70 C 87 71 G 86 72 C 85 73 U 84 74 A 83 75 U 82 76 U 81 77 G 0 78 A 0 79 A 0 80 A 0 81 A 76 82 A 75 83 U 74 84 A 73 85 G 72 86 A 71 87 G 70 88 U 69 89 A 66 90 G 65 91 C 64 92 A 0 93 A 0 94 A 0 95 A 0 96 A 0 97 G 0 98 G 286 99 U 285 100 G 284 101 A 0 102 G 0 103 U 0 104 A 0 105 A 0 106 U 0 107 G 211 108 C 210 109 A 209 110 U 208 111 A 207 112 U 206 113 G 205 114 A 0 115 A 0 116 U 203 117 U 202 118 U 0 119 U 0 120 A 0 121 A 199 122 U 198 123 A 197 124 A 196 125 U 195 126 A 194 127 A 193 128 U 0 129 U 154 130 U 153 131 U 152 132 G 151 133 G 150 134 G 149 135 A 0 136 A 0 137 U 0 138 A 0 139 A 0 140 A 0 141 A 0 142 G 0 143 A 0 144 A 0 145 G 0 146 A 0 147 A 0 148 A 0 149 U 134 150 C 133 151 C 132 152 A 131 153 G 130 154 A 129 155 A 0 156 U 0 157 A 0 158 A 0 159 A 0 160 A 0 161 A 0 162 G 0 163 A 0 164 A 0 165 A 0 166 G 0 167 A 0 168 G 0 169 G 0 170 A 0 171 A 0 172 C 0 173 U 0 174 U 0 175 G 0 176 A 0 177 A 0 178 A 0 179 A 0 180 A 0 181 C 0 182 A 0 183 G 0 184 U 0 185 A 0 186 A 0 187 G 0 188 A 0 189 C 0 190 U 0 191 C 0 192 G 0 193 U 127 194 U 126 195 A 125 196 U 124 197 U 123 198 A 122 199 U 121 200 A 0 201 A 0 202 A 117 203 A 116 204 G 0 205 C 113 206 G 112 207 U 111 208 A 110 209 U 109 210 G 108 211 U 107 212 C 258 213 G 257 214 A 256 215 A 0 216 U 0 217 U 255 218 A 0 219 G 249 220 G 248 221 C 247 222 A 0 223 G 0 224 U 246 225 U 245 226 G 244 227 G 243 228 U 242 229 G 241 230 G 240 231 G 239 232 G 0 233 U 0 234 A 0 235 A 0 236 A 0 237 G 0 238 G 0 239 C 231 240 U 230 241 U 229 242 A 228 243 C 227 244 C 226 245 A 225 246 A 224 247 A 221 248 C 220 249 C 219 250 U 0 251 G 0 252 A 0 253 G 0 254 A 0 255 U 217 256 U 214 257 C 213 258 G 212 259 U 0 260 A 0 261 G 283 262 G 282 263 U 281 264 G 280 265 G 276 266 U 275 267 U 274 268 C 273 269 G 0 270 A 0 271 G 0 272 A 0 273 G 268 274 A 267 275 A 266 276 U 265 277 G 0 278 A 0 279 U 0 280 C 264 281 A 263 282 U 262 283 C 261 284 C 100 285 A 99 286 C 98 287 A 0 288 U 309 289 U 308 290 G 307 291 G 306 292 U 305 293 A 304 294 U 303 295 U 0 296 G 0 297 A 0 298 A 0 299 A 0 300 G 0 301 A 0 302 A 0 303 C 294 304 G 293 305 A 292 306 C 291 307 C 290 308 A 289 309 A 288 310 A 0 311 C 320 312 U 319 313 C 318 314 U 0 315 G 0 316 A 0 317 A 0 318 G 313 319 A 312 320 G 311 321 G 0 322 C 0 323 U 0 324 G 61 325 C 60 326 A 59 327 G 57 328 U 56 329 A 55 330 A 0 331 G 0 332 G 0 333 A 0 334 A 0 335 U 0 336 A 0 337 U 363 338 U 0 339 G 362 340 G 361 341 A 360 342 C 0 343 A 0 344 A 0 345 U 358 346 G 357 347 A 356 348 G 355 349 C 354 350 G 0 351 C 0 352 A 0 353 A 0 354 G 349 355 C 348 356 U 347 357 U 346 358 G 345 359 A 0 360 U 341 361 C 340 362 C 339 363 A 337 364 G 0 365 C 49 366 U 48 367 A 0 368 C 47 369 A 46 370 C 45 371 U 44 372 G 43 373 A 42 374 G 0 375 U 0 376 G 401 377 A 400 378 G 399 379 G 398 380 G 0 381 A 0 382 A 0 383 G 0 384 A 0 385 A 0 386 G 392 387 U 391 388 A 0 389 A 0 390 A 0 391 G 387 392 C 386 393 G 0 394 U 0 395 A 0 396 A 0 397 A 0 398 C 379 399 C 378 400 U 377 401 C 376 402 U 0 403 U 436 404 U 0 405 U 0 406 A 0 407 A 0 408 U 431 409 A 430 410 A 429 411 G 428 412 G 0 413 A 0 414 A 0 415 G 423 416 A 0 417 U 0 418 A 0 419 A 0 420 U 0 421 G 0 422 A 0 423 C 415 424 A 0 425 A 0 426 A 0 427 A 0 428 A 411 429 U 410 430 U 409 431 A 408 432 A 0 433 A 0 434 G 0 435 A 0 436 A 403 437 G 0 438 A 0 439 A 0 440 G 485 441 U 484 442 C 483 443 C 482 444 C 481 445 G 0 446 G 0 447 C 0 448 U 0 449 A 0 450 A 0 451 U 480 452 U 479 453 U 478 454 C 477 455 G 476 456 U 0 457 G 0 458 C 0 459 C 0 460 A 0 461 G 0 462 C 0 463 C 0 464 G 0 465 C 0 466 C 0 467 G 0 468 C 0 469 G 0 470 G 0 471 U 0 472 A 0 473 A 0 474 U 0 475 A 0 476 C 455 477 G 454 478 G 453 479 A 452 480 G 451 481 G 444 482 G 443 483 G 442 484 G 441 485 C 440 486 A 0 487 A 40 488 G 39 489 C 38 490 A 37 491 U 36 492 U 35 493 A 33 494 U 32 495 U 31 496 C 30 497 G 0 498 U 0 499 A 0 500 A 0 501 G 0 502 G 0 503 A 0 504 U 0 505 U 0 506 G 0 507 G 816 508 G 815 509 C 814 510 G 0 511 U 0 512 A 0 513 A 0 514 A 0 515 G 0 516 G 0 517 G 708 518 U 707 519 G 706 520 C 705 521 G 0 522 U 0 523 A 0 524 G 701 525 G 700 526 C 699 527 U 698 528 G 595 529 G 594 530 U 593 531 U 591 532 C 590 533 U 589 534 C 588 535 A 0 536 A 0 537 A 584 538 G 583 539 G 582 540 U 581 541 A 580 542 U 579 543 U 578 544 A 577 545 U 576 546 A 575 547 U 574 548 G 0 549 A 0 550 A 0 551 A 0 552 A 0 553 A 571 554 C 570 555 A 569 556 C 568 557 U 567 558 G 0 559 A 0 560 A 0 561 A 0 562 A 0 563 A 0 564 A 0 565 G 0 566 A 0 567 G 557 568 G 556 569 U 555 570 G 554 571 U 553 572 G 0 573 G 0 574 G 547 575 U 546 576 A 545 577 U 544 578 A 543 579 A 542 580 A 541 581 A 540 582 A 539 583 C 538 584 A 537 585 A 0 586 A 0 587 C 0 588 A 534 589 A 533 590 A 532 591 G 531 592 A 0 593 A 530 594 C 529 595 C 528 596 U 0 597 A 0 598 G 0 599 A 695 600 G 694 601 U 693 602 A 692 603 A 691 604 A 690 605 G 689 606 A 688 607 U 0 608 G 0 609 A 0 610 U 686 611 G 685 612 U 684 613 A 683 614 U 682 615 U 681 616 U 680 617 A 662 618 G 661 619 A 660 620 A 659 621 G 658 622 A 657 623 A 656 624 C 655 625 U 654 626 A 653 627 A 652 628 U 651 629 C 0 630 U 0 631 A 0 632 G 643 633 A 642 634 G 641 635 G 0 636 U 0 637 A 0 638 A 0 639 A 0 640 A 0 641 U 634 642 U 633 643 C 632 644 A 0 645 A 0 646 U 0 647 U 0 648 U 0 649 A 0 650 G 0 651 A 628 652 U 627 653 U 626 654 A 625 655 G 624 656 U 623 657 U 622 658 U 621 659 G 620 660 A 619 661 C 618 662 U 617 663 G 0 664 A 0 665 C 0 666 A 0 667 G 0 668 U 679 669 U 0 670 G 0 671 G 678 672 C 677 673 G 0 674 A 0 675 A 0 676 G 0 677 G 672 678 C 671 679 A 668 680 A 616 681 A 615 682 A 614 683 U 613 684 A 612 685 C 611 686 A 610 687 A 0 688 G 606 689 C 605 690 A 604 691 A 603 692 U 602 693 A 601 694 C 600 695 U 599 696 G 0 697 A 0 698 C 527 699 G 526 700 C 525 701 U 524 702 A 0 703 A 0 704 A 0 705 G 520 706 C 519 707 A 518 708 C 517 709 G 0 710 A 0 711 A 0 712 G 0 713 G 754 714 U 753 715 U 752 716 C 751 717 A 750 718 G 749 719 G 748 720 G 0 721 A 0 722 G 0 723 C 747 724 A 0 725 A 0 726 A 0 727 U 743 728 C 742 729 G 741 730 G 740 731 A 0 732 U 0 733 U 0 734 A 0 735 G 0 736 A 0 737 G 0 738 A 0 739 C 0 740 C 730 741 C 729 742 G 728 743 A 727 744 G 0 745 U 0 746 A 0 747 G 723 748 U 719 749 C 718 750 U 717 751 G 716 752 A 715 753 A 714 754 C 713 755 A 0 756 G 0 757 U 0 758 A 0 759 A 0 760 A 0 761 C 0 762 G 0 763 A 0 764 U 0 765 G 812 766 A 811 767 G 810 768 U 809 769 G 808 770 U 807 771 U 806 772 C 0 773 A 0 774 A 0 775 U 788 776 A 787 777 U 786 778 U 785 779 C 0 780 U 0 781 A 0 782 A 0 783 A 0 784 A 0 785 A 778 786 G 777 787 U 776 788 A 775 789 U 0 790 U 0 791 U 0 792 G 0 793 A 0 794 G 801 795 U 800 796 U 0 797 A 0 798 A 0 799 C 0 800 A 795 801 C 794 802 G 0 803 U 0 804 U 0 805 A 0 806 A 771 807 A 770 808 C 769 809 A 768 810 C 767 811 U 766 812 C 765 813 C 0 814 G 509 815 C 508 816 C 507 817 U 0 818 G 845 819 A 844 820 G 843 821 U 0 822 A 0 823 G 0 824 U 0 825 A 0 826 C 0 827 G 838 828 A 837 829 U 836 830 C 835 831 G 0 832 C 0 833 A 0 834 A 0 835 G 830 836 A 829 837 U 828 838 U 827 839 G 0 840 A 0 841 A 0 842 A 0 843 C 820 844 U 819 845 C 818 846 A 0 847 A 0 848 G 0 849 G 22 850 U 21 851 A 20 852 A 0 853 U 0 854 U 1353 855 G 1352 856 A 1350 857 C 1349 858 G 1348 859 G 0 860 A 1347 861 A 1346 862 C 1345 863 U 1344 864 U 1343 865 U 1342 866 G 1341 867 C 0 868 G 0 869 C 0 870 A 0 871 A 1303 872 G 1302 873 C 1301 874 A 1300 875 G 1299 876 U 1298 877 G 0 878 G 1195 879 A 1194 880 U 1193 881 U 1192 882 A 1191 883 U 1190 884 G 1189 885 U 1188 886 U 1187 887 C 1185 888 A 1184 889 U 0 890 U 0 891 A 0 892 A 0 893 U 908 894 U 907 895 U 906 896 G 905 897 A 0 898 U 0 899 A 0 900 C 0 901 A 0 902 A 0 903 C 0 904 A 0 905 C 896 906 G 895 907 A 894 908 A 893 909 A 0 910 A 0 911 A 0 912 U 0 913 C 0 914 U 0 915 U 0 916 A 0 917 C 1180 918 C 1179 919 C 1178 920 U 1177 921 C 1176 922 C 1175 923 A 1174 924 U 0 925 U 0 926 G 0 927 A 0 928 A 0 929 U 997 930 G 996 931 A 995 932 C 994 933 A 993 934 U 992 935 A 0 936 U 0 937 A 0 938 U 0 939 A 0 940 A 0 941 A 0 942 A 0 943 C 0 944 A 0 945 U 0 946 G 0 947 A 0 948 A 0 949 A 0 950 C 0 951 A 0 952 A 0 953 A 0 954 U 0 955 G 0 956 U 0 957 G 0 958 A 0 959 A 0 960 G 0 961 A 0 962 A 0 963 U 0 964 A 0 965 G 0 966 A 0 967 A 0 968 G 0 969 C 0 970 A 0 971 G 0 972 A 0 973 C 0 974 A 0 975 A 0 976 G 0 977 G 0 978 U 0 979 U 0 980 C 0 981 U 0 982 A 0 983 U 0 984 U 0 985 A 0 986 A 0 987 A 0 988 A 0 989 U 0 990 A 0 991 A 0 992 A 934 993 U 933 994 G 932 995 U 931 996 C 930 997 U 929 998 A 0 999 A 0 1000 C 0 1001 A 1170 1002 G 1169 1003 G 1168 1004 U 0 1005 G 1167 1006 U 1166 1007 U 1165 1008 G 0 1009 C 0 1010 A 1164 1011 U 1163 1012 G 1162 1013 G 1158 1014 C 1157 1015 U 1156 1016 G 1154 1017 U 1153 1018 C 1152 1019 G 1151 1020 U 1150 1021 C 0 1022 A 0 1023 G 1062 1024 U 1061 1025 U 1060 1026 C 1059 1027 G 1058 1028 U 1057 1029 G 1038 1030 C 1037 1031 U 1036 1032 G 0 1033 U 0 1034 G 0 1035 A 0 1036 G 1031 1037 G 1030 1038 U 1029 1039 G 0 1040 U 0 1041 A 0 1042 A 1053 1043 C 1052 1044 A 1051 1045 U 0 1046 U 0 1047 A 0 1048 A 0 1049 G 0 1050 U 0 1051 U 1044 1052 G 1043 1053 U 1042 1054 G 0 1055 A 0 1056 A 0 1057 A 1028 1058 C 1027 1059 G 1026 1060 A 1025 1061 A 1024 1062 C 1023 1063 G 0 1064 A 0 1065 A 0 1066 A 0 1067 U 0 1068 C 1146 1069 C 1145 1070 U 1144 1071 U 1143 1072 A 1142 1073 A 0 1074 G 1105 1075 U 1104 1076 U 1103 1077 C 1102 1078 A 1101 1079 A 0 1080 U 0 1081 U 0 1082 A 0 1083 C 1095 1084 G 1094 1085 A 1093 1086 U 1092 1087 A 0 1088 U 0 1089 A 0 1090 U 0 1091 A 0 1092 A 1086 1093 U 1085 1094 C 1084 1095 G 1083 1096 A 0 1097 G 0 1098 A 0 1099 A 0 1100 A 0 1101 U 1078 1102 G 1077 1103 G 1076 1104 A 1075 1105 C 1074 1106 A 0 1107 G 0 1108 A 0 1109 A 0 1110 G 0 1111 A 1135 1112 G 1134 1113 U 1133 1114 G 1132 1115 U 1131 1116 G 1130 1117 A 1129 1118 C 0 1119 A 0 1120 U 0 1121 A 0 1122 A 0 1123 A 0 1124 U 0 1125 U 0 1126 A 0 1127 A 0 1128 A 0 1129 U 1117 1130 C 1116 1131 A 1115 1132 C 1114 1133 A 1113 1134 U 1112 1135 U 1111 1136 G 0 1137 G 0 1138 U 0 1139 A 0 1140 G 0 1141 U 0 1142 U 1072 1143 G 1071 1144 A 1070 1145 G 1069 1146 G 1068 1147 A 0 1148 A 0 1149 G 0 1150 A 1020 1151 U 1019 1152 G 1018 1153 U 1017 1154 C 1016 1155 A 0 1156 A 1015 1157 G 1014 1158 U 1013 1159 C 0 1160 A 0 1161 G 0 1162 U 1012 1163 A 1011 1164 U 1010 1165 G 1007 1166 G 1006 1167 C 1005 1168 C 1003 1169 C 1002 1170 U 1001 1171 U 0 1172 A 0 1173 U 0 1174 A 923 1175 G 922 1176 G 921 1177 A 920 1178 G 919 1179 G 918 1180 G 917 1181 G 0 1182 C 0 1183 U 0 1184 U 888 1185 G 887 1186 A 0 1187 A 886 1188 A 885 1189 U 884 1190 G 883 1191 U 882 1192 A 881 1193 A 880 1194 U 879 1195 A 878 1196 C 0 1197 A 0 1198 A 0 1199 U 0 1200 G 1254 1201 G 1253 1202 U 1252 1203 U 1251 1204 U 1250 1205 C 1249 1206 U 1248 1207 A 0 1208 C 0 1209 A 0 1210 A 0 1211 A 0 1212 A 1243 1213 G 1242 1214 G 1241 1215 A 0 1216 A 0 1217 G 1236 1218 C 1235 1219 G 0 1220 A 0 1221 A 0 1222 A 1231 1223 G 1230 1224 U 1229 1225 G 0 1226 C 0 1227 A 0 1228 A 0 1229 G 1224 1230 C 1223 1231 U 1222 1232 G 0 1233 G 0 1234 A 0 1235 G 1218 1236 C 1217 1237 A 0 1238 A 0 1239 A 0 1240 A 0 1241 C 1214 1242 C 1213 1243 U 1212 1244 A 0 1245 A 0 1246 A 0 1247 A 0 1248 A 1206 1249 G 1205 1250 A 1204 1251 A 1203 1252 A 1202 1253 U 1201 1254 C 1200 1255 U 0 1256 U 0 1257 A 0 1258 G 0 1259 U 0 1260 U 0 1261 U 1292 1262 G 1291 1263 G 1290 1264 A 1289 1265 U 1288 1266 U 1287 1267 U 1286 1268 A 1285 1269 U 1284 1270 U 1283 1271 U 1282 1272 C 1281 1273 U 0 1274 G 0 1275 C 0 1276 A 0 1277 A 0 1278 C 0 1279 U 0 1280 C 0 1281 G 1272 1282 A 1271 1283 A 1270 1284 A 1269 1285 U 1268 1286 A 1267 1287 A 1266 1288 U 1265 1289 G 1264 1290 A 1263 1291 A 1262 1292 A 1261 1293 G 0 1294 C 0 1295 G 0 1296 G 0 1297 A 0 1298 A 876 1299 U 875 1300 U 874 1301 G 873 1302 C 872 1303 U 871 1304 A 0 1305 G 0 1306 U 0 1307 A 0 1308 A 1330 1309 U 1329 1310 C 1328 1311 G 1327 1312 U 1326 1313 A 1325 1314 G 1324 1315 A 1323 1316 U 0 1317 C 0 1318 A 0 1319 U 0 1320 A 0 1321 A 0 1322 G 0 1323 G 1315 1324 C 1314 1325 U 1313 1326 U 1312 1327 C 1311 1328 G 1310 1329 G 1309 1330 U 1308 1331 G 0 1332 A 0 1333 A 0 1334 U 0 1335 A 0 1336 G 0 1337 U 0 1338 U 0 1339 G 0 1340 U 0 1341 C 866 1342 A 865 1343 A 864 1344 A 863 1345 G 862 1346 U 861 1347 U 860 1348 A 858 1349 G 857 1350 U 856 1351 A 0 1352 C 855 1353 A 854 1354 U 0 1355 A 0 1356 C 0 1357 C 0 1358 G 1517 1359 C 1516 1360 C 0 1361 C 1513 1362 G 1512 1363 U 0 1364 C 1510 1365 A 0 1366 C 1507 1367 A 1506 1368 C 1505 1369 C 1504 1370 A 1503 1371 C 1502 1372 G 1501 1373 G 1500 1374 A 0 1375 A 0 1376 A 0 1377 U 0 1378 C 0 1379 A 0 1380 A 0 1381 U 0 1382 C 0 1383 U 0 1384 U 0 1385 U 0 1386 U 0 1387 U 0 1388 C 0 1389 A 0 1390 G 0 1391 A 0 1392 U 0 1393 A 0 1394 C 0 1395 A 0 1396 U 0 1397 U 0 1398 A 0 1399 U 0 1400 U 0 1401 A 0 1402 U 0 1403 G 0 1404 U 0 1405 U 0 1406 A 0 1407 A 0 1408 U 0 1409 U 0 1410 A 0 1411 U 0 1412 C 0 1413 U 0 1414 A 0 1415 A 0 1416 A 0 1417 G 0 1418 U 0 1419 U 0 1420 C 0 1421 U 0 1422 U 0 1423 A 0 1424 G 0 1425 G 0 1426 G 0 1427 U 0 1428 A 0 1429 U 0 1430 A 0 1431 A 0 1432 C 0 1433 A 0 1434 G 0 1435 U 0 1436 C 0 1437 U 0 1438 C 0 1439 U 0 1440 U 0 1441 U 0 1442 U 0 1443 G 0 1444 A 0 1445 A 0 1446 G 0 1447 A 0 1448 G 0 1449 C 0 1450 A 0 1451 A 0 1452 U 0 1453 U 0 1454 A 0 1455 G 0 1456 A 0 1457 A 0 1458 U 0 1459 G 0 1460 G 0 1461 A 0 1462 G 0 1463 G 0 1464 A 0 1465 G 0 1466 G 0 1467 U 0 1468 U 0 1469 A 0 1470 A 0 1471 U 0 1472 U 0 1473 G 0 1474 U 0 1475 U 0 1476 A 0 1477 A 0 1478 U 0 1479 U 0 1480 A 0 1481 U 0 1482 C 0 1483 G 0 1484 A 0 1485 A 0 1486 C 0 1487 A 0 1488 A 0 1489 U 0 1490 A 0 1491 G 0 1492 A 0 1493 G 0 1494 G 0 1495 G 0 1496 G 0 1497 U 0 1498 A 0 1499 A 0 1500 C 1373 1501 U 1372 1502 G 1371 1503 G 1370 1504 G 1369 1505 G 1368 1506 U 1367 1507 A 1366 1508 A 0 1509 A 0 1510 G 1364 1511 U 0 1512 C 1362 1513 G 1361 1514 U 0 1515 A 0 1516 A 1359 1517 C 1358 1518 A 0 1519 C 0 1520 G 0 1521 G 0 1522 U 1545 1523 A 1544 1524 G 1543 1525 C 1542 1526 U 1541 1527 G 1540 1528 U 1539 1529 U 1538 1530 G 1537 1531 G 1536 1532 G 0 1533 G 0 1534 A 0 1535 A 0 1536 C 1531 1537 C 1530 1538 A 1529 1539 G 1528 1540 U 1527 1541 A 1526 1542 G 1525 1543 C 1524 1544 U 1523 1545 G 1522 1546 G 0 1547 A 0 1548 A 0 1549 G 0 1550 U 0 1551 A 0