Filename: d.16.b.B.hermsii.bpseq
Organism: Borrelia hermsii
Accession Number: U42292
Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu
1 N 0
2 N 0
3 N 0
4 N 0
5 N 0
6 N 0
7 N 0
8 N 0
9 N 25
10 A 24
11 G 23
12 U 22
13 U 21
14 U 0
15 G 0
16 A 0
17 U 908
18 C 907
19 C 906
20 U 0
21 G 13
22 G 12
23 C 11
24 U 10
25 U 9
26 A 0
27 G 550
28 A 549
29 A 548
30 C 547
31 U 0
32 A 546
33 A 545
34 C 544
35 G 543
36 C 542
37 U 541
38 G 0
39 U 397
40 C 396
41 A 395
42 G 394
43 U 393
44 G 392
45 C 390
46 G 389
47 U 356
48 C 0
49 U 0
50 U 0
51 A 0
52 A 354
53 G 353
54 C 352
55 A 0
56 U 351
57 G 350
58 C 349
59 A 0
60 A 0
61 G 92
62 U 91
63 C 90
64 A 0
65 G 0
66 A 89
67 C 88
68 G 87
69 G 86
70 A 85
71 A 84
72 U 83
73 G 82
74 U 81
75 A 80
76 G 0
77 C 0
78 A 0
79 A 0
80 U 75
81 A 74
82 C 73
83 A 72
84 U 71
85 U 70
86 C 69
87 A 68
88 G 67
89 U 66
90 G 63
91 G 62
92 C 61
93 G 0
94 A 0
95 A 0
96 C 0
97 G 0
98 G 0
99 G 309
100 U 308
101 G 307
102 A 0
103 G 0
104 U 0
105 A 0
106 A 0
107 C 0
108 G 234
109 C 233
110 G 232
111 U 231
112 G 230
113 G 229
114 A 228
115 U 227
116 A 0
117 A 0
118 U 226
119 C 225
120 U 0
121 A 0
122 C 0
123 C 222
124 U 221
125 A 220
126 U 219
127 G 218
128 A 217
129 G 216
130 A 0
131 U 165
132 G 164
133 G 163
134 G 162
135 G 0
136 A 0
137 U 0
138 A 0
139 A 156
140 C 155
141 U 154
142 A 153
143 U 152
144 U 151
145 A 150
146 G 0
147 A 0
148 A 0
149 A 0
150 U 145
151 A 144
152 G 143
153 U 142
154 A 141
155 G 140
156 C 139
157 U 0
158 A 0
159 A 0
160 U 0
161 A 0
162 C 134
163 C 133
164 G 132
165 A 131
166 A 0
167 U 0
168 A 0
169 A 0
170 G 0
171 G 192
172 U 191
173 C 190
174 A 189
175 A 188
176 U 187
177 U 186
178 G 185
179 A 184
180 G 0
181 A 0
182 U 0
183 G 0
184 U 179
185 U 178
186 A 177
187 A 176
188 U 175
189 U 174
190 G 173
191 A 172
192 U 171
193 G 0
194 A 0
195 A 0
196 A 0
197 G 214
198 G 0
199 A 213
200 A 212
201 G 211
202 C 210
203 C 0
204 U 0
205 U 0
206 U 0
207 A 0
208 A 0
209 A 0
210 G 202
211 C 201
212 U 200
213 U 199
214 C 197
215 G 0
216 C 129
217 U 128
218 U 127
219 G 126
220 U 125
221 A 124
222 G 123
223 A 0
224 U 0
225 G 119
226 A 118
227 G 115
228 U 114
229 C 113
230 U 112
231 G 111
232 C 110
233 G 109
234 U 108
235 C 281
236 U 280
237 U 279
238 A 0
239 U 0
240 U 278
241 A 0
242 G 272
243 C 271
244 U 270
245 A 0
246 G 0
247 U 269
248 U 268
249 G 267
250 G 266
251 U 265
252 A 264
253 G 263
254 G 262
255 G 0
256 U 0
257 A 0
258 A 0
259 A 0
260 A 0
261 G 0
262 C 254
263 C 253
264 U 252
265 A 251
266 C 250
267 C 249
268 A 248
269 A 247
270 G 244
271 G 243
272 C 242
273 U 0
274 G 0
275 U 0
276 G 0
277 A 0
278 U 240
279 A 237
280 A 236
281 G 235
282 U 0
283 A 0
284 A 306
285 C 305
286 C 304
287 G 303
288 G 299
289 C 298
290 C 297
291 U 296
292 G 0
293 A 0
294 G 0
295 A 0
296 G 291
297 G 290
298 G 289
299 U 288
300 G 0
301 A 0
302 A 0
303 C 287
304 G 286
305 G 285
306 U 284
307 C 101
308 A 100
309 C 99
310 A 0
311 C 332
312 U 331
313 G 330
314 G 329
315 A 328
316 A 327
317 C 0
318 U 0
319 G 0
320 A 0
321 G 0
322 A 0
323 U 0
324 A 0
325 C 0
326 G 0
327 G 316
328 U 315
329 C 314
330 C 313
331 A 312
332 G 311
333 A 0
334 C 345
335 U 344
336 C 343
337 C 342
338 U 0
339 A 0
340 C 0
341 G 0
342 G 337
343 G 336
344 A 335
345 G 334
346 G 0
347 C 0
348 A 0
349 G 58
350 C 57
351 A 56
352 G 54
353 C 53
354 U 52
355 A 0
356 A 47
357 G 0
358 A 0
359 A 0
360 U 0
361 C 0
362 U 387
363 U 0
364 C 386
365 C 385
366 G 384
367 C 0
368 A 0
369 A 0
370 U 382
371 G 381
372 G 0
373 G 380
374 C 379
375 G 0
376 A 0
377 A 0
378 A 0
379 G 374
380 C 373
381 U 371
382 G 370
383 A 0
384 C 366
385 G 365
386 G 364
387 A 362
388 G 0
389 C 46
390 G 45
391 A 0
392 C 44
393 A 43
394 C 42
395 U 41
396 G 40
397 C 39
398 G 0
399 U 0
400 G 430
401 A 429
402 A 428
403 C 427
404 G 0
405 A 0
406 A 0
407 G 0
408 A 0
409 A 0
410 G 421
411 G 420
412 U 419
413 C 418
414 G 0
415 A 0
416 A 0
417 A 0
418 G 413
419 A 412
420 U 411
421 U 410
422 G 0
423 U 0
424 A 0
425 A 0
426 A 0
427 G 403
428 U 402
429 U 401
430 C 400
431 U 0
432 U 490
433 U 0
434 U 491
435 A 487
436 U 486
437 A 485
438 A 484
439 A 483
440 U 482
441 G 0
442 A 0
443 G 0
444 G 477
445 A 0
446 A 0
447 U 0
448 A 0
449 A 0
450 G 471
451 C 470
452 U 469
453 U 468
454 U 467
455 G 466
456 U 465
457 A 464
458 G 463
459 G 0
460 A 0
461 A 0
462 A 0
463 U 458
464 G 457
465 A 456
466 C 455
467 A 454
468 A 453
469 A 452
470 G 451
471 U 450
472 G 0
473 A 0
474 U 0
475 G 0
476 A 0
477 C 444
478 G 0
479 U 0
480 U 0
481 A 0
482 A 440
483 U 439
484 U 438
485 U 437
486 A 436
487 U 435
488 G 0
489 A 0
490 A 432
491 U 434
492 A 0
493 A 0
494 G 539
495 C 538
496 C 537
497 C 536
498 C 535
499 G 520
500 G 519
501 C 518
502 U 0
503 A 0
504 A 0
505 U 534
506 U 533
507 A 532
508 C 531
509 G 530
510 U 0
511 G 0
512 C 0
513 C 0
514 A 0
515 G 522
516 C 521
517 A 0
518 G 501
519 C 500
520 C 499
521 G 516
522 C 515
523 G 0
524 G 0
525 U 0
526 A 0
527 A 0
528 U 0
529 A 0
530 C 509
531 G 508
532 U 507
533 A 506
534 A 505
535 G 498
536 G 497
537 G 496
538 G 495
539 C 494
540 G 0
541 A 37
542 G 36
543 C 35
544 G 34
545 U 33
546 U 32
547 G 30
548 U 29
549 U 28
550 C 27
551 G 0
552 G 0
553 G 0
554 A 0
555 U 0
556 U 0
557 A 0
558 U 0
559 U 0
560 G 0
561 G 873
562 C 872
563 C 871
564 G 856
565 U 855
566 A 0
567 A 0
568 A 0
569 G 870
570 G 0
571 G 759
572 U 758
573 G 757
574 A 756
575 G 0
576 U 753
577 A 0
578 G 752
579 G 751
580 C 750
581 G 0
582 G 646
583 A 645
584 U 644
585 A 643
586 U 642
587 G 641
588 C 640
589 A 0
590 A 639
591 G 638
592 U 635
593 C 634
594 U 633
595 A 632
596 U 0
597 G 631
598 C 630
599 G 629
600 U 628
601 A 627
602 A 0
603 A 0
604 A 0
605 U 0
606 A 624
607 C 623
608 C 622
609 A 621
610 C 620
611 A 619
612 G 618
613 C 0
614 U 0
615 C 0
616 A 0
617 A 0
618 C 612
619 U 611
620 G 610
621 U 609
622 G 608
623 G 607
624 G 606
625 A 0
626 A 0
627 U 601
628 A 600
629 U 599
630 G 598
631 C 597
632 U 595
633 G 594
634 G 593
635 A 592
636 A 0
637 A 0
638 C 591
639 U 590
640 G 588
641 C 587
642 A 586
643 U 585
644 G 584
645 A 583
646 C 582
647 U 0
648 A 0
649 G 0
650 A 746
651 G 745
652 U 744
653 C 743
654 U 741
655 G 740
656 A 739
657 U 738
658 A 737
659 G 0
660 G 0
661 G 735
662 G 734
663 A 733
664 A 732
665 G 731
666 U 730
667 U 729
668 A 712
669 G 711
670 A 0
671 A 0
672 U 708
673 U 707
674 C 706
675 C 705
676 U 704
677 G 703
678 G 702
679 U 701
680 G 0
681 U 0
682 A 0
683 A 694
684 G 693
685 G 692
686 G 0
687 U 0
688 G 0
689 G 0
690 A 0
691 A 0
692 U 685
693 C 684
694 U 683
695 G 0
696 U 0
697 U 0
698 G 0
699 A 0
700 U 0
701 A 679
702 U 678
703 C 677
704 A 676
705 G 675
706 G 674
707 A 673
708 A 672
709 G 0
710 A 0
711 A 669
712 U 668
713 A 0
714 C 0
715 C 0
716 A 0
717 G 728
718 A 0
719 G 0
720 G 727
721 C 726
722 G 0
723 A 0
724 A 0
725 G 0
726 G 721
727 C 720
728 G 717
729 A 667
730 A 666
731 C 665
732 U 664
733 U 663
734 C 662
735 U 661
736 A 0
737 G 658
738 G 657
739 U 656
740 C 655
741 A 654
742 A 0
743 G 653
744 A 652
745 C 651
746 U 650
747 G 0
748 A 0
749 C 0
750 G 580
751 C 579
752 U 578
753 G 576
754 A 0
755 G 0
756 U 574
757 C 573
758 A 572
759 C 571
760 G 0
761 A 0
762 A 0
763 A 0
764 G 805
765 C 804
766 G 803
767 U 802
768 A 801
769 G 800
770 G 0
771 G 0
772 A 0
773 G 799
774 C 798
775 A 0
776 A 0
777 A 0
778 C 794
779 A 793
780 G 792
781 G 791
782 A 0
783 U 0
784 U 0
785 A 0
786 G 0
787 A 0
788 U 0
789 A 0
790 C 0
791 C 781
792 C 780
793 U 779
794 G 778
795 G 0
796 U 0
797 A 0
798 G 774
799 U 773
800 C 769
801 U 768
802 A 767
803 C 766
804 G 765
805 C 764
806 U 0
807 G 0
808 U 0
809 A 0
810 A 0
811 A 0
812 C 0
813 G 0
814 A 0
815 U 0
816 G 869
817 C 868
818 A 867
819 C 866
820 A 865
821 C 864
822 U 0
823 U 0
824 G 847
825 G 846
826 U 845
827 G 844
828 U 843
829 U 842
830 A 841
831 A 840
832 U 839
833 C 838
834 G 0
835 A 0
836 A 0
837 A 0
838 G 833
839 G 832
840 U 831
841 U 830
842 A 829
843 G 828
844 U 827
845 A 826
846 C 825
847 C 824
848 G 0
849 A 0
850 A 0
851 G 858
852 C 857
853 U 0
854 A 0
855 A 565
856 C 564
857 G 852
858 U 851
859 G 0
860 U 0
861 U 0
862 A 0
863 A 0
864 G 821
865 U 820
866 G 819
867 U 818
868 G 817
869 C 816
870 C 569
871 G 563
872 C 562
873 C 561
874 U 0
875 G 902
876 G 901
877 G 900
878 G 0
879 A 0
880 G 0
881 U 0
882 A 0
883 U 0
884 G 895
885 C 894
886 U 893
887 C 892
888 G 0
889 C 0
890 A 0
891 A 0
892 G 887
893 A 886
894 G 885
895 U 884
896 G 0
897 A 0
898 A 0
899 A 0
900 C 877
901 U 876
902 C 875
903 A 0
904 A 0
905 A 0
906 G 19
907 G 18
908 A 17
909 A 0
910 U 0
911 U 1388
912 G 1387
913 A 1385
914 C 1384
915 G 1383
916 G 0
917 G 1382
918 G 1381
919 G 1380
920 C 1379
921 C 1378
922 C 1377
923 G 1376
924 C 0
925 A 1372
926 C 1371
927 A 0
928 A 0
929 G 1336
930 C 1335
931 G 1334
932 G 1333
933 U 1332
934 G 1229
935 G 1228
936 A 1227
937 G 1226
938 C 1225
939 A 1224
940 U 1223
941 G 1222
942 U 1221
943 G 1220
944 G 1218
945 U 1217
946 U 0
947 U 0
948 A 0
949 A 0
950 U 965
951 U 964
952 C 963
953 G 962
954 A 0
955 U 0
956 G 0
957 A 0
958 U 0
959 A 0
960 C 0
961 G 0
962 C 953
963 G 952
964 A 951
965 G 950
966 G 0
967 A 0
968 A 0
969 C 0
970 C 0
971 U 0
972 U 0
973 A 0
974 C 1213
975 C 1212
976 A 1211
977 G 1210
978 G 1209
979 G 1208
980 C 1207
981 U 0
982 U 0
983 G 0
984 A 0
985 C 0
986 A 1036
987 U 1035
988 A 1034
989 U 1033
990 A 1032
991 C 1031
992 A 1030
993 G 1029
994 G 1028
995 A 0
996 U 0
997 G 1014
998 U 1013
999 A 1012
1000 G 1011
1001 U 1010
1002 U 1009
1003 A 1008
1004 G 0
1005 A 0
1006 G 0
1007 A 0
1008 U 1003
1009 A 1002
1010 A 1001
1011 C 1000
1012 U 999
1013 A 998
1014 U 997
1015 U 0
1016 C 1027
1017 C 1026
1018 C 1025
1019 C 1024
1020 G 0
1021 U 0
1022 U 0
1023 U 0
1024 G 1019
1025 G 1018
1026 G 1017
1027 G 1016
1028 U 994
1029 C 993
1030 U 992
1031 G 991
1032 U 990
1033 A 989
1034 U 988
1035 A 987
1036 C 986
1037 A 0
1038 G 1202
1039 G 1201
1040 U 0
1041 G 1200
1042 C 1199
1043 U 1198
1044 G 1197
1045 C 0
1046 A 0
1047 U 1196
1048 G 1195
1049 G 1191
1050 U 1190
1051 U 1189
1052 G 1187
1053 U 1186
1054 C 1185
1055 G 1184
1056 U 0
1057 C 0
1058 A 0
1059 G 1098
1060 C 1097
1061 U 1096
1062 C 1095
1063 G 1094
1064 U 1093
1065 G 1074
1066 C 1073
1067 U 1072
1068 G 0
1069 U 0
1070 G 0
1071 A 0
1072 G 1067
1073 G 1066
1074 U 1065
1075 G 0
1076 U 0
1077 U 1090
1078 G 1089
1079 G 1088
1080 G 1087
1081 U 0
1082 U 0
1083 A 0
1084 A 0
1085 G 0
1086 U 0
1087 C 1080
1088 C 1079
1089 C 1078
1090 G 1077
1091 C 0
1092 A 0
1093 A 1064
1094 C 1063
1095 G 1062
1096 A 1061
1097 G 1060
1098 C 1059
1099 G 0
1100 C 0
1101 A 0
1102 A 0
1103 C 0
1104 C 1179
1105 C 1178
1106 U 1177
1107 U 1176
1108 A 0
1109 U 1147
1110 U 1146
1111 G 1145
1112 U 1144
1113 C 1143
1114 U 1142
1115 G 1141
1116 U 0
1117 U 0
1118 A 0
1119 C 1136
1120 C 1135
1121 A 0
1122 G 0
1123 C 1134
1124 A 1133
1125 U 1132
1126 G 0
1127 U 0
1128 A 0
1129 A 0
1130 A 0
1131 G 0
1132 A 1125
1133 U 1124
1134 G 1123
1135 G 1120
1136 G 1119
1137 G 0
1138 A 0
1139 C 0
1140 U 0
1141 C 1115
1142 A 1114
1143 G 1113
1144 A 1112
1145 C 1111
1146 G 1110
1147 A 1109
1148 G 0
1149 A 0
1150 C 1170
1151 U 1169
1152 G 1168
1153 C 1167
1154 C 1166
1155 G 1165
1156 G 1164
1157 U 1163
1158 G 0
1159 A 0
1160 U 0
1161 A 0
1162 A 0
1163 G 1157
1164 C 1156
1165 C 1155
1166 G 1154
1167 G 1153
1168 A 1152
1169 G 1151
1170 G 1150
1171 A 0
1172 A 0
1173 G 0
1174 G 0
1175 U 0
1176 G 1107
1177 A 1106
1178 G 1105
1179 G 1104
1180 A 0
1181 U 0
1182 G 0
1183 A 0
1184 C 1055
1185 G 1054
1186 U 1053
1187 C 1052
1188 A 0
1189 A 1051
1190 A 1050
1191 U 1049
1192 C 0
1193 A 0
1194 U 0
1195 C 1048
1196 A 1047
1197 U 1044
1198 G 1043
1199 G 1042
1200 C 1041
1201 C 1039
1202 C 1038
1203 U 0
1204 U 0
1205 A 0
1206 U 0
1207 G 980
1208 U 979
1209 C 978
1210 C 977
1211 U 976
1212 G 975
1213 G 974
1214 G 0
1215 C 0
1216 U 0
1217 A 945
1218 C 944
1219 A 0
1220 C 943
1221 A 942
1222 C 941
1223 G 940
1224 U 939
1225 G 938
1226 C 937
1227 U 936
1228 A 935
1229 C 934
1230 A 0
1231 A 0
1232 U 0
1233 G 1288
1234 G 1287
1235 C 1286
1236 C 1285
1237 U 1284
1238 G 1283
1239 U 1282
1240 A 0
1241 C 0
1242 A 0
1243 A 0
1244 A 0
1245 G 1276
1246 C 1275
1247 G 1274
1248 A 0
1249 U 0
1250 G 1269
1251 C 1268
1252 G 0
1253 A 0
1254 A 0
1255 A 1264
1256 C 1263
1257 A 1262
1258 G 0
1259 U 0
1260 G 0
1261 A 0
1262 U 1257
1263 G 1256
1264 U 1255
1265 G 0
1266 A 0
1267 A 0
1268 G 1251
1269 C 1250
1270 A 0
1271 A 0
1272 A 0
1273 A 0
1274 C 1247
1275 G 1246
1276 C 1245
1277 A 0
1278 U 0
1279 A 0
1280 A 0
1281 A 0
1282 G 1239
1283 C 1238
1284 A 1237
1285 G 1236
1286 G 1235
1287 U 1234
1288 C 1233
1289 U 0
1290 C 0
1291 A 0
1292 G 0
1293 U 0
1294 C 0
1295 C 1326
1296 A 0
1297 G 0
1298 A 0
1299 U 1322
1300 U 1321
1301 G 1320
1302 A 1319
1303 A 1318
1304 G 1317
1305 U 1316
1306 C 1315
1307 U 0
1308 G 0
1309 A 0
1310 A 0
1311 A 0
1312 C 0
1313 U 0
1314 C 0
1315 G 1306
1316 A 1305
1317 C 1304
1318 U 1303
1319 U 1302
1320 C 1301
1321 A 1300
1322 U 1299
1323 G 0
1324 A 0
1325 A 0
1326 G 1295
1327 U 0
1328 U 0
1329 G 0
1330 G 0
1331 A 0
1332 A 933
1333 U 932
1334 C 931
1335 G 930
1336 C 929
1337 U 0
1338 A 0
1339 G 0
1340 U 0
1341 A 0
1342 A 1364
1343 U 1363
1344 C 1362
1345 G 1361
1346 U 1360
1347 A 1359
1348 U 1358
1349 A 1357
1350 U 0
1351 C 0
1352 A 0
1353 G 0
1354 A 0
1355 A 0
1356 U 0
1357 G 1349
1358 A 1348
1359 U 1347
1360 A 1346
1361 C 1345
1362 G 1344
1363 G 1343
1364 U 1342
1365 G 0
1366 A 0
1367 A 0
1368 U 0
1369 A 0
1370 C 0
1371 G 926
1372 U 925
1373 U 0
1374 C 0
1375 U 0
1376 C 923
1377 G 922
1378 G 921
1379 G 920
1380 C 919
1381 C 918
1382 U 917
1383 U 915
1384 G 914
1385 U 913
1386 A 0
1387 C 912
1388 A 911
1389 C 0
1390 A 0
1391 C 1498
1392 C 0
1393 G 1495
1394 C 1494
1395 C 0
1396 C 1491
1397 G 1490
1398 U 0
1399 C 0
1400 A 0
1401 C 1485
1402 A 1484
1403 C 1483
1404 C 1482
1405 A 1481
1406 C 1480
1407 C 1479
1408 C 1478
1409 G 0
1410 A 0
1411 G 1475
1412 U 1474
1413 U 1473
1414 G 1472
1415 A 1471
1416 G 1470
1417 G 1469
1418 A 1468
1419 U 1467
1420 A 1466
1421 C 1465
1422 C 1464
1423 C 0
1424 G 0
1425 A 0
1426 A 0
1427 G 1460
1428 C 1459
1429 U 1458
1430 A 1457
1431 U 1456
1432 U 1455
1433 A 0
1434 U 1454
1435 U 1453
1436 C 1452
1437 U 1451
1438 A 0
1439 A 0
1440 C 1449
1441 C 1448
1442 C 1447
1443 G 0
1444 C 0
1445 A 0
1446 A 0
1447 G 1442
1448 G 1441
1449 G 1440
1450 A 0
1451 G 1437
1452 G 1436
1453 A 1435
1454 A 1434
1455 G 1432
1456 G 1431
1457 U 1430
1458 A 1429
1459 U 1428
1460 C 1427
1461 U 0
1462 A 0
1463 A 0
1464 G 1422
1465 G 1421
1466 U 1420
1467 A 1419
1468 U 1418
1469 G 1417
1470 U 1416
1471 U 1415
1472 U 1414
1473 A 1413
1474 G 1412
1475 U 1411
1476 G 0
1477 A 0
1478 G 1408
1479 G 1407
1480 G 1406
1481 G 1405
1482 G 1404
1483 G 1403
1484 U 1402
1485 G 1401
1486 A 0
1487 A 0
1488 G 0
1489 U 0
1490 C 1397
1491 G 1396
1492 U 0
1493 A 0
1494 A 1394
1495 C 1393
1496 A 0
1497 A 0
1498 G 1391
1499 G 0
1500 U 1523
1501 A 1522
1502 G 1521
1503 C 1520
1504 C 1519
1505 G 1518
1506 U 1517
1507 A 1516
1508 C 1515
1509 U 1514
1510 G 0
1511 G 0
1512 A 0
1513 A 0
1514 A 1509
1515 G 1508
1516 U 1507
1517 G 1506
1518 U 1505
1519 G 1504
1520 G 1503
1521 C 1502
1522 U 1501
1523 G 1500
1524 G 0
1525 A 0
1526 U 0
1527 C 0
1528 A 0
1529 C 0
1530 C 0
1531 U 0
1532 C 0
1533 N 0
1534 N 0
1535 N 0
1536 N 0