Filename: d.16.b.C.burnetii.bpseq
Organism: Coxiella burnetii
Accession Number: M21291
Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu
1 N 0
2 A 0
3 U 0
4 U 0
5 G 0
6 A 0
7 A 0
8 G 24
9 A 23
10 G 22
11 U 21
12 U 20
13 U 0
14 G 0
15 A 0
16 U 916
17 U 915
18 C 914
19 U 0
20 G 12
21 G 11
22 C 10
23 U 9
24 C 8
25 A 0
26 G 555
27 A 554
28 U 553
29 U 552
30 G 0
31 A 551
32 A 550
33 C 549
34 G 548
35 C 547
36 U 546
37 A 0
38 G 402
39 C 401
40 G 400
41 G 399
42 C 398
43 A 397
44 U 395
45 G 394
46 C 360
47 U 0
48 U 0
49 A 0
50 A 0
51 C 358
52 A 357
53 C 356
54 A 0
55 U 355
56 G 354
57 C 353
58 A 0
59 A 0
60 G 105
61 U 104
62 C 103
63 G 0
64 A 0
65 A 102
66 C 101
67 G 100
68 G 96
69 C 95
70 A 0
71 G 0
72 C 94
73 G 93
74 C 92
75 A 90
76 G 89
77 G 88
78 G 0
79 A 87
80 G 86
81 N 0
82 C 0
83 U 0
84 U 0
85 N 0
86 C 80
87 U 79
88 C 77
89 C 76
90 U 75
91 G 0
92 G 74
93 C 73
94 G 72
95 G 69
96 C 68
97 G 0
98 A 0
99 G 0
100 A 67
101 G 66
102 U 65
103 G 62
104 G 61
105 C 60
106 G 0
107 G 0
108 A 0
109 C 0
110 G 0
111 G 0
112 G 313
113 U 312
114 G 311
115 A 0
116 G 0
117 U 0
118 A 0
119 A 0
120 U 0
121 G 238
122 C 237
123 G 236
124 U 235
125 A 234
126 G 233
127 G 232
128 A 231
129 A 0
130 U 230
131 C 229
132 U 0
133 A 0
134 C 0
135 C 226
136 U 225
137 U 224
138 G 223
139 U 222
140 A 221
141 G 220
142 U 0
143 G 177
144 G 176
145 G 175
146 G 174
147 G 0
148 A 0
149 U 0
150 A 0
151 A 168
152 C 167
153 C 166
154 U 165
155 G 164
156 G 163
157 G 162
158 G 0
159 A 0
160 A 0
161 A 0
162 C 157
163 U 156
164 C 155
165 G 154
166 G 153
167 G 152
168 C 151
169 U 0
170 A 0
171 A 0
172 U 0
173 A 0
174 C 146
175 C 145
176 G 144
177 U 143
178 A 0
179 U 0
180 A 0
181 A 0
182 U 0
183 C 192
184 U 191
185 C 190
186 U 0
187 U 0
188 U 0
189 G 0
190 G 185
191 A 184
192 G 183
193 C 0
194 A 0
195 A 0
196 A 0
197 G 218
198 C 217
199 G 216
200 G 215
201 G 214
202 G 213
203 G 0
204 A 0
205 U 212
206 C 211
207 U 0
208 U 0
209 C 0
210 G 0
211 G 206
212 A 205
213 C 202
214 C 201
215 U 200
216 C 199
217 G 198
218 U 197
219 G 0
220 C 141
221 U 140
222 A 139
223 U 138
224 A 137
225 A 136
226 G 135
227 A 0
228 U 0
229 G 131
230 A 130
231 G 128
232 C 127
233 C 126
234 U 125
235 A 124
236 C 123
237 G 122
238 U 121
239 C 285
240 G 284
241 G 283
242 A 0
243 U 0
244 U 282
245 A 0
246 G 276
247 C 275
248 U 274
249 U 0
250 G 0
251 U 273
252 U 272
253 G 271
254 G 270
255 U 269
256 G 268
257 G 267
258 G 266
259 G 0
260 U 0
261 A 0
262 A 0
263 U 0
264 G 0
265 G 0
266 C 258
267 C 257
268 U 256
269 A 255
270 C 254
271 C 253
272 A 252
273 A 251
274 G 248
275 G 247
276 C 246
277 G 0
278 A 0
279 C 0
280 G 0
281 A 0
282 U 244
283 C 241
284 C 240
285 G 239
286 U 0
287 A 0
288 G 310
289 C 309
290 U 308
291 G 307
292 G 303
293 U 302
294 C 301
295 U 300
296 G 0
297 A 0
298 G 0
299 A 0
300 G 295
301 G 294
302 A 293
303 C 292
304 G 0
305 A 0
306 U 0
307 C 291
308 A 290
309 G 289
310 C 288
311 C 114
312 A 113
313 C 112
314 A 0
315 C 336
316 U 335
317 G 334
318 G 333
319 G 332
320 A 331
321 C 0
322 U 0
323 G 0
324 A 0
325 G 0
326 A 0
327 C 0
328 N 0
329 C 0
330 G 0
331 G 320
332 C 319
333 C 318
334 C 317
335 A 316
336 G 315
337 A 0
338 C 349
339 U 348
340 C 347
341 C 346
342 U 0
343 A 0
344 C 0
345 G 0
346 G 341
347 G 340
348 A 339
349 G 338
350 G 0
351 C 0
352 A 0
353 G 57
354 C 56
355 A 55
356 G 53
357 U 52
358 G 51
359 G 0
360 G 46
361 G 0
362 A 0
363 A 0
364 U 0
365 A 0
366 U 392
367 U 0
368 G 391
369 G 390
370 A 389
371 C 0
372 A 0
373 A 0
374 U 387
375 G 386
376 G 385
377 G 384
378 G 383
379 G 0
380 A 0
381 A 0
382 A 0
383 C 378
384 C 377
385 C 376
386 U 375
387 G 374
388 A 0
389 U 370
390 C 369
391 C 368
392 A 366
393 G 0
394 C 45
395 A 44
396 A 0
397 U 43
398 G 42
399 C 41
400 C 40
401 G 39
402 C 38
403 G 0
404 U 0
405 G 435
406 U 434
407 G 433
408 U 432
409 G 0
410 A 0
411 A 0
412 G 0
413 A 0
414 A 0
415 G 426
416 G 425
417 C 424
418 C 423
419 U 0
420 U 0
421 C 0
422 G 0
423 G 418
424 G 417
425 U 416
426 U 415
427 G 0
428 U 0
429 A 0
430 A 0
431 A 0
432 G 408
433 C 407
434 A 406
435 C 405
436 U 0
437 U 495
438 U 0
439 C 0
440 G 492
441 G 491
442 U 490
443 G 489
444 G 488
445 G 487
446 G 0
447 A 0
448 A 0
449 G 482
450 A 0
451 A 0
452 A 0
453 U 0
454 U 476
455 C 475
456 U 474
457 C 473
458 A 472
459 A 471
460 G 470
461 G 469
462 G 0
463 U 0
464 A 0
465 A 0
466 U 0
467 A 0
468 U 0
469 C 461
470 C 460
471 U 459
472 N 458
473 G 457
474 G 456
475 G 455
476 C 454
477 G 0
478 U 0
479 U 0
480 G 0
481 A 0
482 C 449
483 G 0
484 U 0
485 U 0
486 A 0
487 C 445
488 C 444
489 C 443
490 A 442
491 C 441
492 A 440
493 G 0
494 A 0
495 A 437
496 G 0
497 A 0
498 A 0
499 G 544
500 C 543
501 A 542
502 C 541
503 U 540
504 G 0
505 G 0
506 C 0
507 U 0
508 A 0
509 A 0
510 C 539
511 U 538
512 C 537
513 U 536
514 G 535
515 U 0
516 G 0
517 C 0
518 C 0
519 A 0
520 G 527
521 C 526
522 A 0
523 G 0
524 C 0
525 C 0
526 G 521
527 C 520
528 G 0
529 G 0
530 U 0
531 A 0
532 A 0
533 U 0
534 A 0
535 C 514
536 A 513
537 G 512
538 A 511
539 G 510
540 A 503
541 G 502
542 U 501
543 G 500
544 C 499
545 A 0
546 A 36
547 G 35
548 C 34
549 G 33
550 U 32
551 U 31
552 A 29
553 A 28
554 U 27
555 C 26
556 G 0
557 G 0
558 A 0
559 A 0
560 U 0
561 C 0
562 A 0
563 C 0
564 U 0
565 G 0
566 G 881
567 G 880
568 C 879
569 G 0
570 U 0
571 A 0
572 A 0
573 A 0
574 G 0
575 C 0
576 G 763
577 C 762
578 G 761
579 C 760
580 G 0
581 U 757
582 A 0
583 G 756
584 G 755
585 U 754
586 G 0
587 G 650
588 A 649
589 U 648
590 A 647
591 U 646
592 U 645
593 U 644
594 A 0
595 A 643
596 G 642
597 U 639
598 C 638
599 G 637
600 G 636
601 A 635
602 U 634
603 G 633
604 U 632
605 G 631
606 A 0
607 A 0
608 A 0
609 G 0
610 C 628
611 C 627
612 C 626
613 U 625
614 G 624
615 G 623
616 G 622
617 C 0
618 U 0
619 N 0
620 N 0
621 N 0
622 C 616
623 C 615
624 U 614
625 G 613
626 G 612
627 G 611
628 A 610
629 A 0
630 U 0
631 U 605
632 G 604
633 C 603
634 A 602
635 C 601
636 C 600
637 C 599
638 G 598
639 A 597
640 U 0
641 A 0
642 C 596
643 U 595
644 G 593
645 G 592
646 G 591
647 U 590
648 A 589
649 U 588
650 C 587
651 U 0
652 U 0
653 G 0
654 A 750
655 G 749
656 U 748
657 A 747
658 U 746
659 G 744
660 G 743
661 U 742
662 A 741
663 G 0
664 A 0
665 G 739
666 G 738
667 G 737
668 A 736
669 A 735
670 N 734
671 U 733
672 G 716
673 G 715
674 A 0
675 A 0
676 U 712
677 U 711
678 U 710
679 C 709
680 C 708
681 G 707
682 G 706
683 U 705
684 G 0
685 U 0
686 A 0
687 G 698
688 C 697
689 G 696
690 G 0
691 U 0
692 G 0
693 A 0
694 A 0
695 A 0
696 U 689
697 G 688
698 C 687
699 G 0
700 U 0
701 A 0
702 G 0
703 A 0
704 U 0
705 A 683
706 U 682
707 C 681
708 G 680
709 G 679
710 A 678
711 A 677
712 A 676
713 G 0
714 A 0
715 A 673
716 C 672
717 A 0
718 C 0
719 C 0
720 A 0
721 G 732
722 U 0
723 G 0
724 G 731
725 C 730
726 G 0
727 A 0
728 A 0
729 G 0
730 G 725
731 C 724
732 G 721
733 A 671
734 C 670
735 U 669
736 U 668
737 C 667
738 C 666
739 U 665
740 G 0
741 G 662
742 A 661
743 C 660
744 C 659
745 A 0
746 A 658
747 U 657
748 A 656
749 C 655
750 U 654
751 G 0
752 A 0
753 C 0
754 A 585
755 C 584
756 U 583
757 G 581
758 A 0
759 G 0
760 G 579
761 C 578
762 G 577
763 C 576
764 G 0
765 A 0
766 A 0
767 A 0
768 G 809
769 C 808
770 G 807
771 U 806
772 G 805
773 G 804
774 G 0
775 G 0
776 A 0
777 G 803
778 C 802
779 A 0
780 A 0
781 A 0
782 C 798
783 A 797
784 G 796
785 G 795
786 A 0
787 U 0
788 U 0
789 A 0
790 G 0
791 A 0
792 G 0
793 A 0
794 C 0
795 C 785
796 C 784
797 U 783
798 G 782
799 G 0
800 U 0
801 A 0
802 G 778
803 U 777
804 C 773
805 C 772
806 A 771
807 C 770
808 G 769
809 C 768
810 N 0
811 G 0
812 U 0
813 C 0
814 A 0
815 A 0
816 C 0
817 G 0
818 A 0
819 U 0
820 G 877
821 A 876
822 G 875
823 A 874
824 A 873
825 C 872
826 U 0
827 A 0
828 G 855
829 C 854
830 U 853
831 G 852
832 U 851
833 U 850
834 G 849
835 G 848
836 G 847
837 A 846
838 A 845
839 G 844
840 U 0
841 U 0
842 C 0
843 C 0
844 C 839
845 U 838
846 U 837
847 C 836
848 U 835
849 U 834
850 A 833
851 G 832
852 U 831
853 A 830
854 G 829
855 C 828
856 G 0
857 A 0
858 A 0
859 G 866
860 C 865
861 U 0
862 A 0
863 A 0
864 C 0
865 G 860
866 C 859
867 G 0
868 U 0
869 U 0
870 A 0
871 A 0
872 G 825
873 U 824
874 U 823
875 C 822
876 U 821
877 C 820
878 C 0
879 G 568
880 C 567
881 C 566
882 U 0
883 G 910
884 G 909
885 G 908
886 G 0
887 A 0
888 G 0
889 U 0
890 A 0
891 C 0
892 G 903
893 G 902
894 C 901
895 C 900
896 G 0
897 C 0
898 A 0
899 A 0
900 G 895
901 G 894
902 U 893
903 U 892
904 A 0
905 A 0
906 A 0
907 A 0
908 C 885
909 U 884
910 C 883
911 A 0
912 A 0
913 A 0
914 G 18
915 A 17
916 A 16
917 A 0
918 U 0
919 U 1395
920 G 1394
921 A 1392
922 C 1391
923 G 1390
924 G 0
925 G 1389
926 G 1388
927 G 1387
928 C 1386
929 N 1385
930 C 1384
931 G 1383
932 C 0
933 A 1379
934 C 1378
935 A 0
936 A 0
937 G 1343
938 C 1342
939 G 1341
940 G 1340
941 U 1339
942 G 1236
943 G 1235
944 A 1234
945 G 1233
946 C 1232
947 A 1231
948 U 1230
949 G 1229
950 U 1228
951 G 1227
952 G 1225
953 U 1224
954 U 0
955 U 0
956 A 0
957 A 0
958 U 973
959 U 972
960 C 971
961 G 970
962 A 0
963 U 0
964 G 0
965 C 0
966 A 0
967 A 0
968 C 0
969 G 0
970 C 961
971 G 960
972 A 959
973 A 958
974 A 0
975 A 0
976 A 0
977 C 0
978 C 0
979 U 0
980 U 0
981 A 0
982 C 1220
983 C 1219
984 U 1218
985 A 1217
986 C 1216
987 C 1215
988 C 1214
989 U 0
990 U 0
991 G 0
992 A 0
993 C 0
994 A 1043
995 U 1042
996 C 1041
997 C 1039
998 U 1038
999 C 1037
1000 G 1036
1001 G 1035
1002 A 0
1003 A 0
1004 C 1021
1005 U 1020
1006 U 1019
1007 G 1018
1008 U 1017
1009 C 1016
1010 A 1015
1011 G 0
1012 A 0
1013 G 0
1014 A 0
1015 U 1010
1016 G 1009
1017 A 1008
1018 U 1007
1019 U 1006
1020 U 1005
1021 G 1004
1022 G 0
1023 U 1034
1024 G 1033
1025 C 1032
1026 C 1031
1027 U 0
1028 U 0
1029 C 0
1030 G 0
1031 G 1026
1032 G 1025
1033 A 1024
1034 A 1023
1035 C 1001
1036 C 1000
1037 G 999
1038 A 998
1039 G 997
1040 U 0
1041 G 996
1042 A 995
1043 C 994
1044 A 0
1045 G 1209
1046 G 1208
1047 U 0
1048 G 1207
1049 C 1206
1050 U 1205
1051 G 1204
1052 C 0
1053 A 0
1054 U 1203
1055 G 1202
1056 G 1198
1057 C 1197
1058 U 1196
1059 G 1194
1060 U 1193
1061 C 1192
1062 G 1191
1063 U 0
1064 C 0
1065 A 0
1066 G 1105
1067 C 1104
1068 U 1103
1069 C 1102
1070 G 1101
1071 U 1100
1072 G 1081
1073 U 1080
1074 C 1079
1075 G 0
1076 U 0
1077 G 0
1078 A 0
1079 G 1074
1080 A 1073
1081 U 1072
1082 G 0
1083 U 0
1084 U 1097
1085 G 1096
1086 G 1095
1087 G 1094
1088 U 0
1089 U 0
1090 A 0
1091 A 0
1092 G 0
1093 U 0
1094 C 1087
1095 C 1086
1096 C 1085
1097 G 1084
1098 U 0
1099 A 0
1100 A 1071
1101 C 1070
1102 G 1069
1103 A 1068
1104 G 1067
1105 C 1066
1106 G 0
1107 C 0
1108 A 0
1109 A 0
1110 C 0
1111 C 1186
1112 C 1185
1113 U 1184
1114 C 1183
1115 G 0
1116 U 1154
1117 C 1153
1118 C 1152
1119 U 1151
1120 U 1150
1121 A 1149
1122 G 1148
1123 U 0
1124 U 0
1125 G 0
1126 C 1143
1127 C 1142
1128 A 0
1129 G 0
1130 C 1141
1131 G 1140
1132 A 1139
1133 G 0
1134 U 0
1135 C 0
1136 A 0
1137 A 0
1138 G 0
1139 U 1132
1140 C 1131
1141 G 1130
1142 G 1127
1143 G 1126
1144 A 0
1145 A 0
1146 C 0
1147 U 0
1148 C 1122
1149 U 1121
1150 A 1120
1151 A 1119
1152 G 1118
1153 G 1117
1154 A 1116
1155 G 0
1156 A 0
1157 C 1177
1158 U 1176
1159 G 1175
1160 C 1174
1161 C 1173
1162 G 1172
1163 G 1171
1164 U 1170
1165 G 0
1166 A 0
1167 U 0
1168 A 0
1169 A 0
1170 A 1164
1171 C 1163
1172 C 1162
1173 G 1161
1174 G 1160
1175 A 1159
1176 G 1158
1177 G 1157
1178 A 0
1179 A 0
1180 G 0
1181 G 0
1182 U 0
1183 G 1114
1184 G 1113
1185 G 1112
1186 G 1111
1187 A 0
1188 U 0
1189 G 0
1190 A 0
1191 U 1062
1192 G 1061
1193 U 1060
1194 C 1059
1195 A 0
1196 A 1058
1197 G 1057
1198 U 1056
1199 C 0
1200 A 0
1201 U 0
1202 C 1055
1203 A 1054
1204 U 1051
1205 G 1050
1206 G 1049
1207 C 1048
1208 C 1046
1209 C 1045
1210 U 0
1211 U 0
1212 A 0
1213 C 0
1214 G 988
1215 G 987
1216 G 986
1217 U 985
1218 A 984
1219 G 983
1220 G 982
1221 G 0
1222 C 0
1223 U 0
1224 A 953
1225 C 952
1226 A 0
1227 C 951
1228 A 950
1229 C 949
1230 G 948
1231 U 947
1232 G 946
1233 C 945
1234 U 944
1235 A 943
1236 C 942
1237 A 0
1238 A 0
1239 U 0
1240 G 1295
1241 G 1294
1242 G 1293
1243 C 1292
1244 A 1291
1245 G 1290
1246 U 1289
1247 A 0
1248 C 0
1249 A 0
1250 A 0
1251 A 0
1252 G 1283
1253 G 1282
1254 G 1281
1255 U 0
1256 U 0
1257 G 1276
1258 C 1275
1259 C 0
1260 A 0
1261 A 0
1262 G 1271
1263 C 1270
1264 C 1269
1265 G 0
1266 C 0
1267 G 0
1268 A 0
1269 G 1264
1270 G 1263
1271 U 1262
1272 G 0
1273 G 0
1274 A 0
1275 G 1258
1276 C 1257
1277 U 0
1278 A 0
1279 A 0
1280 U 0
1281 C 1254
1282 C 1253
1283 C 1252
1284 A 0
1285 G 0
1286 A 0
1287 A 0
1288 A 0
1289 A 1246
1290 C 1245
1291 U 1244
1292 G 1243
1293 C 1242
1294 U 1241
1295 C 1240
1296 G 0
1297 U 0
1298 A 0
1299 G 0
1300 U 0
1301 C 0
1302 C 1333
1303 G 0
1304 G 0
1305 A 0
1306 U 1329
1307 U 1328
1308 G 1327
1309 G 1326
1310 A 1325
1311 G 1324
1312 U 1323
1313 C 1322
1314 U 0
1315 G 0
1316 C 0
1317 A 0
1318 A 0
1319 C 0
1320 U 0
1321 C 0
1322 G 1313
1323 A 1312
1324 C 1311
1325 U 1310
1326 C 1309
1327 C 1308
1328 A 1307
1329 U 1306
1330 G 0
1331 A 0
1332 A 0
1333 G 1302
1334 U 0
1335 U 0
1336 G 0
1337 G 0
1338 A 0
1339 A 941
1340 U 940
1341 C 939
1342 G 938
1343 C 937
1344 U 0
1345 A 0
1346 G 0
1347 U 0
1348 A 0
1349 A 1371
1350 U 1370
1351 C 1369
1352 G 1368
1353 C 1367
1354 G 1366
1355 A 1365
1356 A 1364
1357 U 0
1358 C 0
1359 A 0
1360 G 0
1361 C 0
1362 A 0
1363 U 0
1364 G 1356
1365 U 1355
1366 C 1354
1367 G 1353
1368 C 1352
1369 G 1351
1370 G 1350
1371 U 1349
1372 G 0
1373 A 0
1374 A 0
1375 U 0
1376 A 0
1377 C 0
1378 G 934
1379 U 933
1380 U 0
1381 C 0
1382 U 0
1383 C 931
1384 G 930
1385 G 929
1386 G 928
1387 C 927
1388 C 926
1389 U 925
1390 U 923
1391 G 922
1392 U 921
1393 A 0
1394 C 920
1395 A 919
1396 C 0
1397 A 0
1398 C 0
1399 C 0
1400 G 1500
1401 C 1499
1402 C 0
1403 C 1496
1404 G 1495
1405 U 0
1406 C 1493
1407 A 0
1408 C 1490
1409 A 1489
1410 C 1488
1411 C 1487
1412 A 1486
1413 U 1485
1414 G 1484
1415 G 1483
1416 G 0
1417 A 0
1418 G 1480
1419 U 1479
1420 G 1478
1421 A 1477
1422 A 1476
1423 U 1475
1424 U 1474
1425 G 1473
1426 U 1472
1427 A 1471
1428 C 1470
1429 C 1469
1430 A 0
1431 G 0
1432 A 0
1433 A 0
1434 G 1465
1435 C 1464
1436 G 1463
1437 G 1462
1438 G 1461
1439 U 1460
1440 A 0
1441 G 1459
1442 G 1458
1443 C 1457
1444 U 1456
1445 A 0
1446 A 0
1447 C 1454
1448 C 1453
1449 U 0
1450 U 0
1451 C 0
1452 G 0
1453 G 1448
1454 G 1447
1455 A 0
1456 G 1444
1457 G 1443
1458 C 1442
1459 C 1441
1460 G 1439
1461 C 1438
1462 U 1437
1463 C 1436
1464 A 1435
1465 C 1434
1466 C 0
1467 A 0
1468 C 0
1469 G 1429
1470 G 1428
1471 U 1427
1472 A 1426
1473 U 1425
1474 G 1424
1475 A 1423
1476 U 1422
1477 C 1421
1478 C 1420
1479 A 1419
1480 N 1418
1481 G 0
1482 A 0
1483 C 1415
1484 N 1414
1485 N 1413
1486 N 1412
1487 N 1411
1488 N 1410
1489 N 1409
1490 N 1408
1491 N 0
1492 N 0
1493 N 1406
1494 N 0
1495 N 1404
1496 N 1403
1497 N 0
1498 N 0
1499 N 1401
1500 N 1400
1501 N 0
1502 N 0
1503 N 0
1504 N 0
1505 N 1528
1506 N 1527
1507 N 1526
1508 N 1525
1509 N 1524
1510 N 1523
1511 N 1522
1512 N 1521
1513 N 1520
1514 N 1519
1515 N 0
1516 N 0
1517 N 0
1518 N 0
1519 N 1514
1520 N 1513
1521 N 1512
1522 N 1511
1523 N 1510
1524 N 1509
1525 N 1508
1526 N 1507
1527 N 1506
1528 N 1505
1529 N 0
1530 N 0
1531 N 0
1532 N 0
1533 N 0
1534 N 0
1535 N 0
1536 N 0
1537 N 0
1538 N 0
1539 N 0
1540 N 0
1541 N 0