Filename: d.16.b.C.perfringens.bpseq
Organism: Clostridium perfringens
Accession Number: M69264
Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu
1 N 0
2 A 0
3 A 0
4 A 0
5 U 0
6 U 0
7 G 0
8 A 0
9 G 25
10 A 24
11 G 23
12 U 22
13 U 21
14 U 0
15 G 0
16 A 0
17 U 892
18 C 891
19 C 890
20 U 0
21 G 13
22 G 12
23 C 11
24 U 10
25 C 9
26 A 0
27 G 531
28 G 530
29 A 529
30 U 528
31 G 0
32 A 527
33 A 526
34 C 525
35 G 524
36 C 523
37 U 522
38 G 0
39 G 403
40 C 402
41 G 401
42 G 400
43 C 399
44 G 398
45 U 396
46 G 395
47 C 361
48 U 0
49 U 0
50 A 0
51 A 0
52 C 359
53 A 358
54 C 357
55 A 0
56 U 356
57 G 355
58 C 354
59 A 0
60 A 0
61 G 100
62 U 99
63 C 98
64 G 0
65 A 0
66 G 97
67 C 96
68 G 95
69 A 93
70 U 92
71 G 0
72 A 0
73 A 0
74 G 89
75 U 88
76 U 87
77 U 86
78 C 85
79 C 84
80 U 0
81 U 0
82 C 0
83 G 0
84 G 79
85 G 78
86 A 77
87 A 76
88 A 75
89 C 74
90 G 0
91 G 0
92 A 70
93 U 69
94 U 0
95 A 68
96 G 67
97 C 66
98 G 63
99 G 62
100 C 61
101 G 0
102 G 0
103 G 0
104 A 0
105 C 0
106 G 0
107 G 0
108 G 314
109 U 313
110 G 312
111 A 0
112 G 0
113 U 0
114 A 0
115 A 0
116 C 0
117 A 239
118 C 238
119 G 237
120 U 236
121 G 235
122 G 234
123 G 233
124 U 232
125 A 0
126 A 0
127 C 231
128 C 230
129 U 0
130 G 0
131 C 0
132 C 227
133 U 226
134 C 225
135 A 224
136 U 223
137 A 222
138 G 221
139 A 0
140 G 174
141 U 173
142 G 172
143 G 171
144 A 0
145 A 0
146 U 0
147 A 0
148 G 165
149 C 164
150 C 163
151 U 162
152 U 161
153 C 160
154 C 159
155 G 0
156 A 0
157 A 0
158 A 0
159 G 154
160 G 153
161 A 152
162 A 151
163 G 150
164 A 149
165 U 148
166 U 0
167 A 0
168 A 0
169 U 0
170 A 0
171 C 143
172 C 142
173 U 141
174 C 140
175 A 0
176 U 0
177 A 0
178 A 0
179 U 0
180 G 205
181 U 204
182 U 203
183 G 202
184 A 201
185 A 200
186 A 199
187 G 198
188 A 197
189 U 196
190 G 195
191 G 0
192 C 0
193 A 0
194 U 0
195 C 190
196 A 189
197 U 188
198 C 187
199 A 186
200 U 185
201 U 184
202 C 183
203 A 182
204 A 181
205 C 180
206 C 0
207 A 0
208 A 0
209 A 0
210 G 219
211 G 218
212 A 217
213 G 0
214 C 0
215 A 0
216 A 0
217 U 212
218 C 211
219 C 210
220 G 0
221 C 138
222 U 137
223 A 136
224 U 135
225 G 134
226 A 133
227 G 132
228 A 0
229 U 0
230 G 128
231 G 127
232 A 124
233 C 123
234 C 122
235 C 121
236 G 120
237 C 119
238 G 118
239 G 117
240 C 286
241 G 285
242 C 284
243 A 0
244 U 0
245 U 283
246 A 0
247 G 277
248 C 276
249 U 275
250 A 0
251 G 0
252 U 274
253 U 273
254 G 272
255 G 271
256 U 270
257 G 269
258 G 268
259 G 267
260 G 0
261 U 0
262 A 0
263 A 0
264 C 0
265 G 0
266 G 0
267 C 259
268 C 258
269 U 257
270 A 256
271 C 255
272 C 254
273 A 253
274 A 252
275 G 249
276 G 248
277 C 247
278 G 0
279 A 0
280 C 0
281 G 0
282 A 0
283 U 245
284 G 242
285 C 241
286 G 240
287 U 0
288 A 0
289 G 311
290 C 310
291 C 309
292 G 308
293 A 304
294 C 303
295 C 302
296 U 301
297 G 0
298 A 0
299 G 0
300 A 0
301 G 296
302 G 295
303 G 294
304 U 293
305 G 0
306 A 0
307 U 0
308 C 292
309 G 291
310 G 290
311 C 289
312 C 110
313 A 109
314 C 108
315 A 0
316 U 337
317 U 336
318 G 335
319 G 334
320 G 333
321 A 332
322 C 0
323 U 0
324 G 0
325 A 0
326 G 0
327 A 0
328 C 0
329 A 0
330 C 0
331 G 0
332 G 321
333 C 320
334 C 319
335 C 318
336 A 317
337 G 316
338 A 0
339 C 350
340 U 349
341 C 348
342 C 347
343 U 0
344 A 0
345 C 0
346 G 0
347 G 342
348 G 341
349 A 340
350 G 339
351 G 0
352 C 0
353 A 0
354 G 58
355 C 57
356 A 56
357 G 54
358 U 53
359 G 52
360 G 0
361 G 47
362 G 0
363 A 0
364 A 0
365 U 0
366 A 0
367 U 393
368 U 0
369 G 392
370 C 391
371 A 390
372 C 0
373 A 0
374 A 0
375 U 388
376 G 387
377 G 386
378 G 385
379 G 384
380 G 0
381 A 0
382 A 0
383 A 0
384 C 379
385 C 378
386 C 377
387 U 376
388 G 375
389 A 0
390 U 371
391 G 370
392 C 369
393 A 367
394 G 0
395 C 46
396 A 45
397 A 0
398 C 44
399 G 43
400 C 42
401 C 41
402 G 40
403 C 39
404 G 0
405 U 0
406 G 436
407 A 435
408 G 434
409 U 433
410 G 0
411 A 0
412 U 0
413 G 0
414 A 0
415 A 0
416 G 427
417 G 426
418 U 425
419 U 424
420 U 0
421 U 0
422 C 0
423 G 0
424 G 419
425 A 418
426 U 417
427 C 416
428 G 0
429 U 0
430 A 0
431 A 0
432 A 0
433 G 409
434 C 408
435 U 407
436 C 406
437 U 0
438 G 471
439 U 0
440 C 472
441 U 468
442 U 467
443 U 466
444 G 465
445 G 464
446 G 463
447 G 0
448 A 0
449 A 0
450 G 458
451 A 0
452 U 0
453 A 0
454 A 0
455 U 0
456 G 0
457 A 0
458 C 450
459 G 0
460 G 0
461 U 0
462 A 0
463 C 446
464 C 445
465 C 444
466 A 443
467 A 442
468 G 441
469 G 0
470 A 0
471 G 438
472 G 440
473 A 0
474 A 0
475 G 520
476 C 519
477 C 518
478 A 517
479 C 516
480 G 501
481 G 500
482 C 499
483 U 0
484 A 0
485 A 0
486 C 515
487 U 514
488 A 513
489 C 512
490 G 511
491 U 0
492 G 0
493 C 0
494 C 0
495 A 0
496 G 503
497 C 502
498 A 0
499 G 482
500 C 481
501 C 480
502 G 497
503 C 496
504 G 0
505 G 0
506 U 0
507 A 0
508 A 0
509 U 0
510 A 0
511 C 490
512 G 489
513 U 488
514 A 487
515 G 486
516 G 479
517 U 478
518 G 477
519 G 476
520 C 475
521 G 0
522 A 37
523 G 36
524 C 35
525 G 34
526 U 33
527 U 32
528 A 30
529 U 29
530 C 28
531 C 27
532 G 0
533 G 0
534 A 0
535 U 0
536 U 0
537 U 0
538 A 0
539 C 0
540 U 0
541 G 0
542 G 857
543 G 856
544 C 855
545 G 840
546 U 839
547 A 0
548 A 0
549 A 0
550 G 854
551 G 0
552 G 739
553 A 738
554 G 737
555 C 736
556 G 0
557 U 733
558 A 0
559 G 732
560 G 731
561 C 730
562 G 0
563 G 626
564 A 625
565 U 624
566 G 623
567 A 622
568 U 621
569 U 620
570 A 0
571 A 619
572 G 618
573 U 615
574 G 614
575 G 613
576 G 612
577 A 611
578 U 610
579 G 609
580 U 608
581 G 607
582 A 0
583 A 0
584 A 0
585 U 0
586 A 604
587 C 603
588 C 602
589 C 601
590 G 600
591 G 599
592 G 598
593 C 0
594 U 0
595 C 0
596 A 0
597 A 0
598 C 592
599 U 591
600 U 590
601 G 589
602 G 588
603 G 587
604 U 586
605 G 0
606 C 0
607 U 581
608 G 580
609 C 579
610 A 578
611 U 577
612 U 576
613 C 575
614 C 574
615 A 573
616 A 0
617 A 0
618 C 572
619 U 571
620 G 569
621 G 568
622 U 567
623 U 566
624 A 565
625 U 564
626 C 563
627 U 0
628 A 0
629 G 0
630 A 726
631 G 725
632 U 724
633 G 722
634 C 721
635 A 720
636 G 719
637 G 718
638 A 717
639 G 0
640 A 0
641 G 715
642 G 714
643 A 713
644 G 712
645 A 711
646 G 710
647 U 709
648 G 692
649 G 691
650 A 0
651 A 0
652 U 688
653 U 687
654 C 686
655 C 685
656 U 684
657 A 683
658 G 682
659 U 681
660 G 0
661 U 0
662 A 0
663 G 674
664 C 673
665 G 672
666 G 0
667 U 0
668 G 0
669 A 0
670 A 0
671 A 0
672 U 665
673 G 664
674 C 663
675 G 0
676 U 0
677 A 0
678 G 0
679 A 0
680 G 0
681 A 659
682 U 658
683 U 657
684 A 656
685 G 655
686 G 654
687 A 653
688 A 652
689 G 0
690 A 0
691 A 649
692 C 648
693 A 0
694 C 0
695 C 0
696 A 0
697 G 708
698 U 0
699 G 0
700 G 707
701 C 706
702 G 0
703 A 0
704 A 0
705 G 0
706 G 701
707 C 700
708 G 697
709 A 647
710 C 646
711 U 645
712 C 644
713 U 643
714 C 642
715 U 641
716 G 0
717 G 638
718 A 637
719 C 636
720 U 635
721 G 634
722 U 633
723 A 0
724 A 632
725 C 631
726 U 630
727 G 0
728 A 0
729 C 0
730 G 561
731 C 560
732 U 559
733 G 557
734 A 0
735 G 0
736 G 555
737 C 554
738 U 553
739 C 552
740 G 0
741 A 0
742 A 0
743 A 0
744 G 785
745 C 784
746 G 783
747 U 782
748 G 781
749 G 780
750 G 0
751 G 0
752 A 0
753 G 779
754 C 778
755 A 0
756 A 0
757 A 0
758 C 774
759 A 773
760 G 772
761 G 771
762 A 0
763 U 0
764 U 0
765 A 0
766 G 0
767 A 0
768 U 0
769 A 0
770 C 0
771 C 761
772 C 760
773 U 759
774 G 758
775 G 0
776 U 0
777 A 0
778 G 754
779 U 753
780 C 749
781 C 748
782 A 747
783 C 746
784 G 745
785 C 744
786 C 0
787 G 0
788 U 0
789 A 0
790 A 0
791 A 0
792 C 0
793 G 0
794 A 0
795 U 0
796 G 853
797 A 852
798 A 851
799 U 850
800 A 849
801 C 848
802 U 0
803 A 0
804 G 831
805 G 830
806 U 829
807 G 828
808 U 827
809 G 826
810 G 825
811 G 824
812 G 823
813 G 822
814 U 821
815 U 0
816 U 0
817 C 0
818 A 0
819 A 0
820 C 0
821 A 814
822 C 813
823 C 812
824 U 811
825 C 810
826 C 809
827 G 808
828 U 807
829 G 806
830 C 805
831 C 804
832 G 0
833 C 0
834 C 0
835 G 842
836 C 841
837 U 0
838 A 0
839 A 546
840 C 545
841 G 836
842 C 835
843 A 0
844 U 0
845 U 0
846 A 0
847 A 0
848 G 801
849 U 800
850 A 799
851 U 798
852 U 797
853 C 796
854 C 550
855 G 544
856 C 543
857 C 542
858 U 0
859 G 886
860 G 885
861 G 884
862 G 0
863 A 0
864 G 0
865 U 0
866 A 0
867 C 0
868 G 879
869 G 878
870 U 877
871 C 876
872 G 0
873 C 0
874 A 0
875 A 0
876 G 871
877 A 870
878 U 869
879 U 868
880 A 0
881 A 0
882 A 0
883 A 0
884 C 861
885 U 860
886 C 859
887 A 0
888 A 0
889 A 0
890 G 19
891 G 18
892 A 17
893 A 0
894 U 0
895 U 1367
896 G 1366
897 A 1364
898 C 1363
899 G 1362
900 G 0
901 G 1361
902 G 1360
903 A 1359
904 C 1358
905 C 1357
906 C 1356
907 G 1355
908 C 0
909 A 1351
910 C 1350
911 A 0
912 A 0
913 G 1315
914 U 1314
915 A 1313
916 G 1312
917 C 1311
918 G 1209
919 G 1208
920 A 1207
921 G 1206
922 C 1205
923 A 1204
924 U 1203
925 G 1202
926 U 1201
927 G 1200
928 G 1198
929 U 1197
930 U 0
931 U 0
932 A 0
933 A 0
934 U 949
935 U 948
936 C 947
937 G 946
938 A 0
939 A 0
940 G 0
941 C 0
942 A 0
943 A 0
944 C 0
945 G 0
946 C 937
947 G 936
948 A 935
949 A 934
950 G 0
951 A 0
952 A 0
953 C 0
954 C 0
955 U 0
956 U 0
957 A 0
958 C 1193
959 C 1192
960 U 1191
961 A 1190
962 C 1189
963 A 1188
964 C 1187
965 U 0
966 U 0
967 G 0
968 A 0
969 C 0
970 A 1018
971 U 1017
972 C 1016
973 C 1014
974 C 1013
975 U 1012
976 U 1011
977 G 1010
978 C 0
979 A 0
980 U 997
981 U 996
982 A 995
983 C 994
984 U 993
985 C 992
986 U 991
987 U 0
988 A 0
989 A 0
990 U 0
991 C 986
992 G 985
993 A 984
994 G 983
995 G 982
996 A 981
997 A 980
998 A 0
999 U 1008
1000 C 1007
1001 C 1006
1002 U 0
1003 U 0
1004 C 0
1005 G 0
1006 G 1001
1007 G 1000
1008 G 999
1009 A 0
1010 C 977
1011 A 976
1012 A 975
1013 G 974
1014 G 973
1015 U 0
1016 G 972
1017 A 971
1018 C 970
1019 A 0
1020 G 1182
1021 G 1181
1022 U 0
1023 G 1180
1024 G 1179
1025 U 1178
1026 G 1177
1027 C 0
1028 A 0
1029 U 1176
1030 G 1175
1031 G 1171
1032 U 1170
1033 U 1169
1034 G 1167
1035 U 1166
1036 C 1165
1037 G 1164
1038 U 0
1039 C 0
1040 A 0
1041 G 1080
1042 C 1079
1043 U 1078
1044 C 1077
1045 G 1076
1046 U 1075
1047 G 1056
1048 U 1055
1049 C 1054
1050 G 0
1051 U 0
1052 G 0
1053 A 0
1054 G 1049
1055 A 1048
1056 U 1047
1057 G 0
1058 U 0
1059 U 1072
1060 G 1071
1061 G 1070
1062 G 1069
1063 U 0
1064 U 0
1065 A 0
1066 A 0
1067 G 0
1068 U 0
1069 C 1062
1070 C 1061
1071 C 1060
1072 G 1059
1073 C 0
1074 A 0
1075 A 1046
1076 C 1045
1077 G 1044
1078 A 1043
1079 G 1042
1080 C 1041
1081 G 0
1082 C 0
1083 A 0
1084 A 0
1085 C 0
1086 C 1159
1087 C 1158
1088 U 1157
1089 U 1156
1090 G 0
1091 U 1127
1092 C 1126
1093 G 1125
1094 U 1124
1095 U 1123
1096 A 1122
1097 G 1121
1098 U 0
1099 U 0
1100 A 0
1101 C 1116
1102 U 1115
1103 A 0
1104 C 0
1105 C 1114
1106 A 1113
1107 U 0
1108 U 0
1109 A 0
1110 A 0
1111 G 0
1112 U 0
1113 U 1106
1114 G 1105
1115 A 1102
1116 G 1101
1117 G 0
1118 A 0
1119 C 0
1120 U 0
1121 C 1097
1122 U 1096
1123 A 1095
1124 G 1094
1125 C 1093
1126 G 1092
1127 A 1091
1128 G 0
1129 A 0
1130 C 1150
1131 U 1149
1132 G 1148
1133 C 1147
1134 C 1146
1135 U 1145
1136 G 1144
1137 G 1143
1138 G 0
1139 U 0
1140 U 0
1141 A 0
1142 A 0
1143 C 1137
1144 C 1136
1145 A 1135
1146 G 1134
1147 G 1133
1148 A 1132
1149 G 1131
1150 G 1130
1151 A 0
1152 A 0
1153 G 0
1154 G 0
1155 U 0
1156 G 1089
1157 G 1088
1158 G 1087
1159 G 1086
1160 A 0
1161 U 0
1162 G 0
1163 A 0
1164 C 1037
1165 G 1036
1166 U 1035
1167 C 1034
1168 A 0
1169 A 1033
1170 A 1032
1171 U 1031
1172 C 0
1173 A 0
1174 U 0
1175 C 1030
1176 A 1029
1177 U 1026
1178 G 1025
1179 C 1024
1180 C 1023
1181 C 1021
1182 C 1020
1183 U 0
1184 U 0
1185 A 0
1186 U 0
1187 G 964
1188 U 963
1189 G 962
1190 U 961
1191 A 960
1192 G 959
1193 G 958
1194 G 0
1195 C 0
1196 U 0
1197 A 929
1198 C 928
1199 A 0
1200 C 927
1201 A 926
1202 C 925
1203 G 924
1204 U 923
1205 G 922
1206 C 921
1207 U 920
1208 A 919
1209 C 918
1210 A 0
1211 A 0
1212 U 0
1213 G 1267
1214 G 1266
1215 C 1265
1216 U 1264
1217 G 1263
1218 G 1262
1219 U 1261
1220 A 0
1221 C 0
1222 A 0
1223 G 0
1224 A 0
1225 G 1256
1226 A 1255
1227 G 1254
1228 A 0
1229 U 0
1230 G 1249
1231 C 1248
1232 A 0
1233 A 0
1234 U 0
1235 A 1244
1236 C 1243
1237 C 1242
1238 G 0
1239 C 0
1240 G 0
1241 A 0
1242 G 1237
1243 G 1236
1244 U 1235
1245 G 0
1246 G 0
1247 A 0
1248 G 1231
1249 C 1230
1250 C 0
1251 A 0
1252 A 0
1253 A 0
1254 C 1227
1255 U 1226
1256 U 1225
1257 A 0
1258 A 0
1259 A 0
1260 A 0
1261 A 1219
1262 C 1218
1263 C 1217
1264 A 1216
1265 G 1215
1266 U 1214
1267 C 1213
1268 U 0
1269 C 0
1270 A 0
1271 G 0
1272 U 0
1273 U 0
1274 C 1305
1275 G 0
1276 G 0
1277 A 0
1278 U 1301
1279 U 1300
1280 G 1299
1281 U 1298
1282 A 1297
1283 G 1296
1284 G 1295
1285 C 1294
1286 U 0
1287 G 0
1288 A 0
1289 A 0
1290 A 0
1291 C 0
1292 U 0
1293 C 0
1294 G 1285
1295 C 1284
1296 C 1283
1297 U 1282
1298 A 1281
1299 C 1280
1300 A 1279
1301 U 1278
1302 G 0
1303 A 0
1304 A 0
1305 G 1274
1306 C 0
1307 U 0
1308 G 0
1309 G 0
1310 A 0
1311 G 917
1312 U 916
1313 U 915
1314 A 914
1315 C 913
1316 U 0
1317 A 0
1318 G 0
1319 U 0
1320 A 0
1321 A 1343
1322 U 1342
1323 C 1341
1324 G 1340
1325 C 1339
1326 G 1338
1327 A 1337
1328 A 1336
1329 U 0
1330 C 0
1331 A 0
1332 G 0
1333 A 0
1334 A 0
1335 U 0
1336 G 1328
1337 U 1327
1338 C 1326
1339 G 1325
1340 C 1324
1341 G 1323
1342 G 1322
1343 U 1321
1344 G 0
1345 A 0
1346 A 0
1347 U 0
1348 A 0
1349 C 0
1350 G 910
1351 U 909
1352 U 0
1353 C 0
1354 C 0
1355 C 907
1356 G 906
1357 G 905
1358 G 904
1359 U 903
1360 C 902
1361 U 901
1362 U 899
1363 G 898
1364 U 897
1365 A 0
1366 C 896
1367 A 895
1368 C 0
1369 A 0
1370 C 1474
1371 C 0
1372 G 1471
1373 C 1470
1374 C 0
1375 C 1467
1376 G 1466
1377 U 0
1378 C 0
1379 A 0
1380 C 1461
1381 A 1460
1382 C 1459
1383 C 1458
1384 A 1457
1385 U 1456
1386 G 1455
1387 A 1454
1388 G 0
1389 A 0
1390 G 1451
1391 U 1450
1392 U 1449
1393 G 1448
1394 G 1447
1395 C 1446
1396 A 1445
1397 A 1444
1398 U 1443
1399 A 1442
1400 C 1441
1401 C 1440
1402 C 0
1403 G 0
1404 A 0
1405 A 0
1406 G 1437
1407 U 1436
1408 C 1435
1409 C 1434
1410 G 1433
1411 U 1432
1412 G 0
1413 A 1431
1414 G 1430
1415 C 1429
1416 U 1428
1417 A 0
1418 A 0
1419 C 1426
1420 C 1425
1421 G 0
1422 C 0
1423 A 0
1424 A 0
1425 G 1420
1426 G 1419
1427 A 0
1428 G 1416
1429 G 1415
1430 C 1414
1431 A 1413
1432 G 1411
1433 C 1410
1434 G 1409
1435 G 1408
1436 C 1407
1437 C 1406
1438 G 0
1439 A 0
1440 A 1401
1441 G 1400
1442 U 1399
1443 A 1398
1444 G 1397
1445 G 1396
1446 G 1395
1447 U 1394
1448 C 1393
1449 A 1392
1450 G 1391
1451 C 1390
1452 G 0
1453 A 0
1454 U 1387
1455 U 1386
1456 G 1385
1457 G 1384
1458 G 1383
1459 G 1382
1460 U 1381
1461 G 1380
1462 A 0
1463 A 0
1464 G 0
1465 U 0
1466 C 1376
1467 G 1375
1468 U 0
1469 A 0
1470 A 1373
1471 C 1372
1472 A 0
1473 A 0
1474 G 1370
1475 G 0
1476 U 1499
1477 A 1498
1478 G 1497
1479 C 1496
1480 C 1495
1481 G 1494
1482 U 1493
1483 A 1492
1484 G 1491
1485 G 1490
1486 A 0
1487 G 0
1488 A 0
1489 A 0
1490 C 1485
1491 C 1484
1492 U 1483
1493 G 1482
1494 C 1481
1495 G 1480
1496 G 1479
1497 C 1478
1498 U 1477
1499 G 1476
1500 G 0
1501 A 0
1502 U 0
1503 C 0
1504 A 0
1505 C 0
1506 C 0
1507 U 0
1508 C 0
1509 C 0
1510 U 0
1511 U 0
1512 U 0
1513 C 0
1514 U 0