Filename: d.16.b.D.nodosus.bpseq Organism: Dichelobacter nodosus Accession Number: M35016 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 A 0 3 A 0 4 C 0 5 U 0 6 G 0 7 A 0 8 A 0 9 G 25 10 A 24 11 G 23 12 U 22 13 U 21 14 U 0 15 G 0 16 A 0 17 U 908 18 U 907 19 C 906 20 U 0 21 G 13 22 G 12 23 C 11 24 U 10 25 C 9 26 A 0 27 G 549 28 A 548 29 U 547 30 U 546 31 G 0 32 A 545 33 A 544 34 C 543 35 G 542 36 C 541 37 U 540 38 G 0 39 G 397 40 C 396 41 G 395 42 G 394 43 C 393 44 A 392 45 U 390 46 G 389 47 C 355 48 U 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 C 353 53 A 352 54 C 351 55 A 0 56 U 350 57 G 349 58 C 348 59 A 0 60 A 0 61 G 100 62 U 99 63 C 98 64 G 0 65 A 0 66 A 97 67 C 96 68 G 95 69 G 94 70 G 93 71 G 92 72 U 91 73 U 90 74 A 89 75 U 88 76 G 87 77 U 86 78 A 85 79 G 84 80 C 0 81 U 0 82 U 0 83 G 0 84 C 79 85 U 78 86 A 77 87 U 76 88 G 75 89 U 74 90 A 73 91 A 72 92 C 71 93 C 70 94 U 69 95 A 68 96 G 67 97 U 66 98 G 63 99 G 62 100 C 61 101 G 0 102 G 0 103 A 0 104 C 0 105 G 0 106 G 0 107 G 308 108 U 307 109 G 306 110 A 0 111 G 0 112 U 0 113 A 0 114 A 0 115 U 0 116 A 233 117 U 232 118 A 231 119 U 230 120 A 229 121 G 228 122 G 227 123 A 226 124 A 0 125 U 225 126 C 224 127 U 0 128 G 0 129 C 0 130 C 221 131 U 220 132 U 219 133 A 218 134 U 217 135 G 216 136 G 215 137 U 0 138 G 172 139 G 171 140 G 170 141 G 169 142 G 0 143 A 0 144 C 0 145 A 0 146 A 163 147 C 162 148 G 161 149 U 160 150 A 159 151 U 158 152 G 157 153 G 0 154 A 0 155 A 0 156 A 0 157 C 152 158 G 151 159 U 150 160 A 149 161 C 148 162 G 147 163 C 146 164 U 0 165 A 0 166 A 0 167 U 0 168 A 0 169 C 141 170 C 140 171 G 139 172 C 138 173 A 0 174 U 0 175 A 0 176 A 0 177 G 0 178 A 187 179 U 186 180 U 185 181 G 0 182 A 0 183 A 0 184 G 0 185 A 180 186 A 179 187 U 178 188 G 0 189 A 0 190 A 0 191 A 0 192 G 213 193 C 212 194 G 211 195 G 210 196 G 209 197 G 208 198 G 0 199 C 0 200 U 207 201 C 206 202 G 0 203 A 0 204 A 0 205 A 0 206 G 201 207 A 200 208 C 197 209 C 196 210 U 195 211 C 194 212 G 193 213 C 192 214 G 0 215 C 136 216 C 135 217 G 134 218 U 133 219 A 132 220 A 131 221 G 130 222 A 0 223 U 0 224 G 126 225 A 125 226 G 123 227 C 122 228 C 121 229 U 120 230 A 119 231 U 118 232 A 117 233 U 116 234 C 280 235 G 279 236 G 278 237 A 0 238 U 0 239 U 277 240 A 0 241 G 271 242 C 270 243 U 269 244 A 0 245 G 0 246 U 268 247 U 267 248 G 266 249 G 265 250 U 264 251 G 263 252 G 262 253 G 261 254 G 0 255 U 0 256 A 0 257 A 0 258 G 0 259 A 0 260 G 0 261 C 253 262 C 252 263 U 251 264 A 250 265 C 249 266 C 248 267 A 247 268 A 246 269 G 243 270 G 242 271 C 241 272 G 0 273 A 0 274 C 0 275 G 0 276 A 0 277 U 239 278 C 236 279 C 235 280 G 234 281 U 0 282 A 0 283 G 305 284 C 304 285 U 303 286 G 302 287 G 298 288 U 297 289 U 296 290 U 295 291 G 0 292 A 0 293 G 0 294 A 0 295 G 290 296 A 289 297 A 288 298 U 287 299 G 0 300 A 0 301 U 0 302 C 286 303 A 285 304 G 284 305 C 283 306 C 109 307 A 108 308 C 107 309 A 0 310 U 331 311 C 330 312 G 329 313 G 328 314 G 327 315 A 326 316 C 0 317 U 0 318 G 0 319 A 0 320 G 0 321 A 0 322 C 0 323 A 0 324 C 0 325 G 0 326 G 315 327 C 314 328 C 313 329 C 312 330 N 311 331 A 310 332 A 0 333 C 344 334 U 343 335 C 342 336 C 341 337 U 0 338 A 0 339 C 0 340 G 0 341 G 336 342 G 335 343 A 334 344 G 333 345 G 0 346 C 0 347 A 0 348 G 58 349 C 57 350 A 56 351 G 54 352 U 53 353 G 52 354 G 0 355 G 47 356 G 0 357 A 0 358 A 0 359 U 0 360 A 0 361 U 387 362 U 0 363 G 386 364 G 385 365 A 384 366 C 0 367 N 0 368 A 0 369 U 382 370 G 381 371 G 380 372 G 379 373 G 378 374 G 0 375 G 0 376 A 0 377 A 0 378 C 373 379 C 372 380 C 371 381 U 370 382 G 369 383 A 0 384 U 365 385 C 364 386 C 363 387 A 361 388 G 0 389 C 46 390 A 45 391 A 0 392 U 44 393 G 43 394 C 42 395 C 41 396 G 40 397 C 39 398 G 0 399 U 0 400 G 430 401 U 429 402 G 428 403 U 427 404 G 0 405 A 0 406 A 0 407 G 0 408 A 0 409 A 0 410 G 421 411 G 420 412 C 419 413 C 418 414 U 0 415 U 0 416 C 0 417 G 0 418 G 413 419 G 412 420 U 411 421 U 410 422 G 0 423 U 0 424 A 0 425 A 0 426 A 0 427 G 403 428 C 402 429 A 401 430 C 400 431 U 0 432 U 489 433 U 0 434 U 490 435 A 486 436 U 485 437 U 484 438 A 483 439 G 482 440 U 481 441 G 0 442 A 0 443 A 0 444 G 476 445 A 0 446 A 0 447 C 0 448 G 0 449 G 0 450 U 470 451 G 469 452 C 468 453 A 467 454 U 466 455 G 465 456 G 464 457 U 463 458 U 0 459 A 0 460 A 0 461 U 0 462 A 0 463 C 457 464 C 456 465 C 455 466 A 454 467 U 453 468 G 452 469 C 451 470 A 450 471 A 0 472 U 0 473 U 0 474 G 0 475 A 0 476 C 444 477 A 0 478 U 0 479 U 0 480 A 0 481 G 440 482 C 439 483 U 438 484 A 437 485 A 436 486 G 435 487 G 0 488 A 0 489 A 432 490 A 434 491 A 0 492 A 0 493 G 538 494 C 537 495 A 536 496 C 535 497 C 534 498 G 519 499 G 518 500 C 517 501 U 0 502 N 0 503 A 0 504 C 533 505 U 532 506 C 531 507 C 530 508 G 529 509 U 0 510 G 0 511 C 0 512 C 0 513 A 0 514 G 521 515 C 520 516 A 0 517 G 500 518 C 499 519 C 498 520 G 515 521 C 514 522 G 0 523 G 0 524 U 0 525 A 0 526 A 0 527 U 0 528 A 0 529 C 508 530 G 507 531 G 506 532 A 505 533 G 504 534 G 497 535 G 496 536 U 495 537 G 494 538 C 493 539 A 0 540 A 37 541 G 36 542 C 35 543 G 34 544 U 33 545 U 32 546 A 30 547 U 29 548 U 28 549 C 27 550 G 0 551 G 0 552 A 0 553 A 0 554 U 0 555 G 0 556 A 0 557 C 0 558 U 0 559 G 0 560 G 873 561 G 872 562 C 871 563 G 856 564 U 855 565 A 0 566 A 0 567 A 0 568 G 870 569 C 0 570 G 757 571 C 756 572 A 755 573 C 754 574 G 0 575 C 751 576 A 0 577 G 750 578 G 749 579 U 748 580 G 0 581 G 644 582 U 643 583 U 642 584 U 641 585 U 640 586 A 639 587 U 638 588 A 0 589 A 637 590 G 636 591 U 633 592 C 632 593 A 631 594 G 630 595 G 629 596 U 628 597 G 627 598 U 626 599 G 625 600 A 0 601 A 0 602 A 0 603 U 0 604 C 622 605 C 621 606 C 620 607 U 619 608 G 618 609 G 617 610 G 616 611 C 0 612 U 0 613 C 0 614 A 0 615 A 0 616 C 610 617 C 609 618 U 608 619 A 607 620 G 606 621 G 605 622 A 604 623 A 0 624 U 0 625 U 599 626 G 598 627 C 597 628 A 596 629 U 595 630 U 594 631 U 593 632 G 592 633 A 591 634 A 0 635 A 0 636 C 590 637 C 589 638 G 587 639 U 586 640 A 585 641 A 584 642 G 583 643 A 582 644 C 581 645 U 0 646 A 0 647 G 0 648 A 744 649 G 743 650 U 742 651 A 741 652 U 739 653 G 738 654 U 737 655 C 736 656 A 735 657 G 0 658 A 0 659 G 733 660 G 732 661 A 731 662 A 730 663 G 729 664 G 728 665 C 727 666 G 710 667 G 709 668 A 0 669 A 0 670 U 706 671 U 705 672 U 704 673 C 703 674 C 702 675 A 701 676 G 700 677 U 699 678 G 0 679 U 0 680 A 0 681 G 692 682 C 691 683 A 690 684 G 0 685 U 0 686 G 0 687 A 0 688 A 0 689 A 0 690 U 683 691 G 682 692 C 681 693 G 0 694 U 0 695 A 0 696 G 0 697 A 0 698 U 0 699 A 677 700 U 676 701 U 675 702 G 674 703 G 673 704 A 672 705 A 671 706 G 670 707 G 0 708 A 0 709 A 667 710 C 666 711 A 0 712 C 0 713 C 0 714 G 0 715 A 726 716 U 0 717 G 0 718 G 725 719 C 724 720 G 0 721 A 0 722 A 0 723 G 0 724 G 719 725 C 718 726 A 715 727 G 665 728 C 664 729 C 663 730 U 662 731 U 661 732 C 660 733 U 659 734 G 0 735 G 656 736 G 655 737 G 654 738 C 653 739 A 652 740 A 0 741 U 651 742 A 650 743 C 649 744 U 648 745 G 0 746 A 0 747 C 0 748 A 579 749 C 578 750 U 577 751 C 575 752 A 0 753 U 0 754 G 573 755 U 572 756 G 571 757 C 570 758 G 0 759 A 0 760 A 0 761 A 0 762 G 803 763 C 802 764 G 801 765 U 800 766 G 799 767 G 798 768 G 0 769 U 0 770 A 0 771 G 797 772 C 796 773 A 0 774 A 0 775 A 0 776 C 792 777 A 791 778 G 790 779 G 789 780 A 0 781 U 0 782 U 0 783 A 0 784 G 0 785 A 0 786 U 0 787 A 0 788 C 0 789 C 779 790 C 778 791 U 777 792 G 776 793 G 0 794 U 0 795 A 0 796 G 772 797 U 771 798 C 767 799 C 766 800 A 765 801 C 764 802 G 763 803 C 762 804 C 0 805 C 0 806 U 0 807 A 0 808 A 0 809 A 0 810 C 0 811 G 0 812 A 0 813 U 0 814 G 869 815 U 868 816 C 867 817 A 866 818 A 865 819 C 864 820 U 0 821 A 0 822 G 847 823 G 846 824 U 845 825 G 844 826 U 843 827 U 842 828 G 841 829 G 840 830 G 839 831 U 838 832 A 837 833 G 0 834 A 0 835 A 0 836 A 0 837 U 832 838 A 831 839 C 830 840 U 829 841 C 828 842 G 827 843 G 826 844 U 825 845 A 824 846 C 823 847 C 822 848 G 0 849 A 0 850 A 0 851 G 858 852 C 857 853 U 0 854 A 0 855 A 564 856 C 563 857 G 852 858 C 851 859 A 0 860 A 0 861 U 0 862 A 0 863 A 0 864 G 819 865 U 818 866 U 817 867 G 816 868 A 815 869 C 814 870 C 568 871 G 562 872 C 561 873 C 560 874 U 0 875 G 902 876 G 901 877 G 900 878 G 0 879 A 0 880 G 0 881 U 0 882 A 0 883 C 0 884 G 895 885 G 894 886 C 893 887 C 892 888 G 0 889 C 0 890 A 0 891 A 0 892 G 887 893 G 886 894 U 885 895 U 884 896 G 0 897 A 0 898 A 0 899 A 0 900 C 877 901 U 876 902 C 875 903 A 0 904 A 0 905 A 0 906 G 19 907 A 18 908 A 17 909 A 0 910 U 0 911 U 1387 912 G 1386 913 A 1384 914 C 1383 915 G 1382 916 G 0 917 G 1381 918 G 1380 919 A 1379 920 C 1378 921 C 1377 922 C 1376 923 G 1375 924 C 0 925 A 1371 926 C 1370 927 A 0 928 A 0 929 G 1335 930 C 1334 931 G 1333 932 G 1332 933 U 1331 934 G 1228 935 G 1227 936 A 1226 937 G 1225 938 C 1224 939 A 1223 940 U 1222 941 G 1221 942 U 1220 943 G 1219 944 G 1217 945 U 1216 946 U 0 947 U 0 948 A 0 949 A 0 950 U 965 951 U 964 952 C 963 953 G 962 954 A 0 955 U 0 956 G 0 957 C 0 958 A 0 959 A 0 960 C 0 961 G 0 962 C 953 963 G 952 964 A 951 965 A 950 966 G 0 967 A 0 968 A 0 969 C 0 970 C 0 971 U 0 972 U 0 973 A 0 974 C 1212 975 C 1211 976 A 1210 977 G 1209 978 G 1208 979 C 1207 980 U 1206 981 U 0 982 U 0 983 G 0 984 A 0 985 C 0 986 A 1035 987 U 1034 988 C 1033 989 C 1031 990 A 1030 991 G 1029 992 A 1028 993 G 1027 994 A 0 995 A 0 996 U 1013 997 U 1012 998 C 1011 999 U 1010 1000 A 1009 1001 C 1008 1002 A 1007 1003 G 0 1004 A 0 1005 G 0 1006 A 0 1007 U 1002 1008 G 1001 1009 U 1000 1010 G 999 1011 G 998 1012 G 997 1013 A 996 1014 G 0 1015 U 1026 1016 G 1025 1017 C 1024 1018 C 1023 1019 U 0 1020 U 0 1021 C 0 1022 G 0 1023 G 1018 1024 G 1017 1025 A 1016 1026 A 1015 1027 C 993 1028 U 992 1029 C 991 1030 U 990 1031 G 989 1032 A 0 1033 G 988 1034 A 987 1035 C 986 1036 A 0 1037 G 1201 1038 G 1200 1039 U 0 1040 G 1199 1041 U 1198 1042 U 1197 1043 G 1196 1044 C 0 1045 A 0 1046 U 1195 1047 G 1194 1048 G 1190 1049 C 1189 1050 U 1188 1051 G 1186 1052 U 1185 1053 C 1184 1054 G 1183 1055 U 0 1056 C 0 1057 A 0 1058 G 1097 1059 C 1096 1060 U 1095 1061 C 1094 1062 G 1093 1063 U 1092 1064 G 1073 1065 U 1072 1066 C 1071 1067 G 0 1068 U 0 1069 G 0 1070 A 0 1071 G 1066 1072 A 1065 1073 U 1064 1074 G 0 1075 U 0 1076 U 1089 1077 G 1088 1078 G 1087 1079 G 1086 1080 U 0 1081 U 0 1082 A 0 1083 A 0 1084 G 0 1085 U 0 1086 C 1079 1087 C 1078 1088 C 1077 1089 G 1076 1090 C 0 1091 A 0 1092 A 1063 1093 C 1062 1094 G 1061 1095 A 1060 1096 G 1059 1097 C 1058 1098 G 0 1099 C 0 1100 A 0 1101 A 0 1102 C 0 1103 C 1178 1104 C 1177 1105 U 1176 1106 U 1175 1107 A 0 1108 U 1146 1109 C 1145 1110 C 1144 1111 U 1143 1112 U 1142 1113 A 1141 1114 C 1140 1115 U 0 1116 U 0 1117 G 0 1118 C 1135 1119 C 1134 1120 A 0 1121 G 0 1122 C 1133 1123 A 1132 1124 C 1131 1125 G 0 1126 U 0 1127 A 0 1128 A 0 1129 A 0 1130 G 0 1131 G 1124 1132 U 1123 1133 G 1122 1134 G 1119 1135 G 1118 1136 A 0 1137 A 0 1138 C 0 1139 U 0 1140 A 1114 1141 U 1113 1142 A 1112 1143 A 1111 1144 G 1110 1145 G 1109 1146 A 1108 1147 G 0 1148 A 0 1149 C 1169 1150 U 1168 1151 G 1167 1152 C 1166 1153 C 1165 1154 G 1164 1155 G 1163 1156 U 1162 1157 G 0 1158 A 0 1159 C 0 1160 A 0 1161 A 0 1162 A 1156 1163 C 1155 1164 C 1154 1165 G 1153 1166 G 1152 1167 A 1151 1168 G 1150 1169 G 1149 1170 A 0 1171 A 0 1172 G 0 1173 G 0 1174 U 0 1175 G 1106 1176 G 1105 1177 G 1104 1178 G 1103 1179 A 0 1180 U 0 1181 G 0 1182 A 0 1183 C 1054 1184 G 1053 1185 U 1052 1186 C 1051 1187 A 0 1188 A 1050 1189 G 1049 1190 U 1048 1191 C 0 1192 A 0 1193 U 0 1194 C 1047 1195 A 1046 1196 U 1043 1197 G 1042 1198 G 1041 1199 C 1040 1200 C 1038 1201 C 1037 1202 U 0 1203 U 0 1204 A 0 1205 C 0 1206 A 980 1207 G 979 1208 C 978 1209 C 977 1210 U 976 1211 G 975 1212 G 974 1213 G 0 1214 C 0 1215 U 0 1216 A 945 1217 C 944 1218 A 0 1219 C 943 1220 A 942 1221 C 941 1222 G 940 1223 U 939 1224 G 938 1225 C 937 1226 U 936 1227 A 935 1228 C 934 1229 A 0 1230 A 0 1231 U 0 1232 G 1287 1233 G 1286 1234 G 1285 1235 C 1284 1236 G 1283 1237 G 1282 1238 U 1281 1239 A 0 1240 C 0 1241 A 0 1242 G 0 1243 A 0 1244 C 1275 1245 G 1274 1246 G 1273 1247 U 0 1248 A 0 1249 G 1268 1250 C 1267 1251 C 0 1252 A 0 1253 A 0 1254 C 1263 1255 C 1262 1256 C 1261 1257 G 0 1258 C 0 1259 G 0 1260 A 0 1261 G 1256 1262 G 1255 1263 G 1254 1264 G 0 1265 G 0 1266 A 0 1267 G 1250 1268 C 1249 1269 C 0 1270 A 0 1271 A 0 1272 U 0 1273 C 1246 1274 U 1245 1275 G 1244 1276 A 0 1277 G 0 1278 A 0 1279 A 0 1280 A 0 1281 A 1238 1282 C 1237 1283 C 1236 1284 G 1235 1285 U 1234 1286 U 1233 1287 C 1232 1288 G 0 1289 U 0 1290 A 0 1291 G 0 1292 U 0 1293 C 0 1294 C 1325 1295 G 0 1296 G 0 1297 A 0 1298 U 1321 1299 U 1320 1300 G 1319 1301 C 1318 1302 A 1317 1303 G 1316 1304 U 1315 1305 C 1314 1306 U 0 1307 G 0 1308 C 0 1309 A 0 1310 A 0 1311 C 0 1312 U 0 1313 C 0 1314 G 1305 1315 A 1304 1316 C 1303 1317 U 1302 1318 G 1301 1319 C 1300 1320 A 1299 1321 U 1298 1322 G 0 1323 A 0 1324 A 0 1325 G 1294 1326 U 0 1327 C 0 1328 G 0 1329 G 0 1330 A 0 1331 A 933 1332 U 932 1333 C 931 1334 G 930 1335 C 929 1336 U 0 1337 A 0 1338 G 0 1339 U 0 1340 A 0 1341 A 1363 1342 U 1362 1343 C 1361 1344 G 1360 1345 C 1359 1346 G 1358 1347 A 1357 1348 A 1356 1349 U 0 1350 C 0 1351 A 0 1352 G 0 1353 C 0 1354 A 0 1355 C 0 1356 G 1348 1357 U 1347 1358 C 1346 1359 G 1345 1360 C 1344 1361 G 1343 1362 G 1342 1363 U 1341 1364 G 0 1365 A 0 1366 A 0 1367 U 0 1368 A 0 1369 C 0 1370 G 926 1371 U 925 1372 U 0 1373 C 0 1374 C 0 1375 C 923 1376 G 922 1377 G 921 1378 G 920 1379 U 919 1380 C 918 1381 U 917 1382 U 915 1383 G 914 1384 U 913 1385 A 0 1386 C 912 1387 A 911 1388 C 0 1389 A 0 1390 C 1495 1391 U 0 1392 G 1492 1393 C 1491 1394 C 0 1395 C 1488 1396 G 1487 1397 U 0 1398 C 0 1399 A 0 1400 C 1482 1401 A 1481 1402 C 1480 1403 C 1479 1404 A 1478 1405 U 1477 1406 G 1476 1407 G 1475 1408 G 0 1409 A 0 1410 G 1472 1411 U 1471 1412 U 1470 1413 U 1469 1414 G 1468 1415 U 1467 1416 U 1466 1417 G 1465 1418 C 1464 1419 A 1463 1420 C 1462 1421 C 1461 1422 A 0 1423 G 0 1424 A 0 1425 A 0 1426 G 1457 1427 U 1456 1428 A 1455 1429 G 1454 1430 G 1453 1431 U 1452 1432 A 0 1433 G 1451 1434 C 1450 1435 U 1449 1436 U 1448 1437 A 0 1438 A 0 1439 C 1446 1440 C 1445 1441 G 0 1442 U 0 1443 A 0 1444 A 0 1445 G 1440 1446 G 1439 1447 A 0 1448 G 1436 1449 G 1435 1450 G 1434 1451 C 1433 1452 G 1431 1453 C 1430 1454 U 1429 1455 U 1428 1456 A 1427 1457 C 1426 1458 C 0 1459 A 0 1460 C 0 1461 G 1421 1462 G 1420 1463 U 1419 1464 G 1418 1465 U 1417 1466 G 1416 1467 G 1415 1468 C 1414 1469 C 1413 1470 G 1412 1471 A 1411 1472 U 1410 1473 G 0 1474 A 0 1475 C 1407 1476 U 1406 1477 G 1405 1478 G 1404 1479 G 1403 1480 G 1402 1481 U 1401 1482 G 1400 1483 A 0 1484 A 0 1485 G 0 1486 U 0 1487 C 1396 1488 G 1395 1489 U 0 1490 A 0 1491 A 1393 1492 C 1392 1493 A 0 1494 A 0 1495 G 1390 1496 G 0 1497 U 1520 1498 A 1519 1499 A 1518 1500 C 1517 1501 C 1516 1502 G 1515 1503 U 1514 1504 A 1513 1505 G 1512 1506 G 1511 1507 G 0 1508 G 0 1509 A 0 1510 A 0 1511 C 1506 1512 C 1505 1513 U 1504 1514 G 1503 1515 C 1502 1516 G 1501 1517 G 1500 1518 U 1499 1519 U 1498 1520 G 1497 1521 G 0 1522 A 0 1523 U 0 1524 C 0 1525 A 0 1526 C 0 1527 C 0 1528 U 0 1529 C 0 1530 C 0 1531 U 0 1532 U 0 1533 U 0