Filename: d.16.b.D.radiodurans.1.bpseq
Organism: Deinococcus radiodurans
Accession Number: M21413
Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu
1 U 0
2 U 0
3 U 0
4 A 0
5 U 0
6 G 0
7 G 0
8 A 0
9 G 25
10 A 24
11 G 23
12 U 22
13 U 21
14 U 0
15 G 0
16 A 0
17 U 883
18 C 882
19 C 881
20 U 0
21 G 13
22 G 12
23 C 11
24 U 10
25 C 9
26 A 0
27 G 524
28 G 523
29 G 522
30 U 521
31 G 0
32 A 520
33 A 519
34 C 518
35 G 517
36 C 516
37 U 515
38 G 0
39 G 384
40 C 383
41 G 382
42 G 381
43 C 380
44 G 379
45 U 377
46 G 376
47 C 342
48 U 0
49 U 0
50 A 0
51 A 0
52 G 340
53 A 339
54 C 338
55 A 0
56 U 337
57 G 336
58 C 335
59 A 0
60 A 0
61 G 88
62 U 87
63 C 86
64 G 0
65 A 0
66 A 85
67 C 84
68 G 83
69 C 82
70 G 81
71 G 80
72 U 79
73 C 78
74 U 0
75 U 0
76 C 0
77 G 0
78 G 73
79 A 72
80 C 71
81 C 70
82 G 69
83 A 68
84 G 67
85 U 66
86 G 63
87 G 62
88 C 61
89 G 0
90 C 0
91 A 0
92 C 0
93 G 0
94 G 0
95 G 295
96 U 294
97 G 293
98 A 0
99 G 0
100 U 0
101 A 0
102 A 0
103 C 0
104 A 220
105 C 219
106 G 218
107 U 217
108 A 216
109 A 215
110 C 214
111 U 213
112 G 0
113 A 0
114 C 212
115 C 211
116 U 0
117 A 0
118 C 0
119 C 208
120 C 207
121 A 206
122 G 205
123 A 204
124 A 203
125 G 202
126 U 0
127 C 161
128 A 160
129 U 159
130 G 158
131 A 0
132 A 0
133 U 0
134 A 0
135 A 152
136 C 151
137 U 150
138 G 149
139 G 148
140 C 147
141 C 146
142 G 0
143 A 0
144 A 0
145 A 0
146 G 141
147 G 140
148 U 139
149 C 138
150 A 137
151 G 136
152 C 135
153 U 0
154 A 0
155 A 0
156 U 0
157 A 0
158 C 130
159 G 129
160 U 128
161 G 127
162 A 0
163 U 0
164 G 0
165 U 0
166 G 0
167 G 188
168 U 187
169 G 186
170 A 185
171 U 184
172 U 183
173 U 182
174 G 181
175 C 180
176 C 0
177 G 0
178 U 0
179 G 0
180 G 175
181 C 174
182 A 173
183 A 172
184 A 171
185 U 170
186 C 169
187 A 168
188 C 167
189 U 0
190 A 0
191 A 0
192 A 0
193 G 200
194 A 199
195 U 0
196 U 0
197 U 0
198 A 0
199 U 194
200 C 193
201 G 0
202 C 125
203 U 124
204 U 123
205 C 122
206 U 121
207 G 120
208 G 119
209 A 0
210 U 0
211 G 115
212 G 114
213 G 111
214 G 110
215 U 109
216 U 108
217 G 107
218 C 106
219 G 105
220 U 104
221 U 267
222 C 266
223 C 265
224 A 0
225 U 0
226 C 264
227 A 0
228 G 258
229 C 257
230 U 256
231 G 0
232 G 0
233 U 255
234 U 254
235 G 253
236 G 252
237 U 251
238 G 250
239 G 249
240 G 248
241 G 0
242 U 0
243 A 0
244 A 0
245 A 0
246 G 0
247 G 0
248 C 240
249 C 239
250 U 238
251 A 237
252 C 236
253 C 235
254 A 234
255 A 233
256 G 230
257 G 229
258 C 228
259 G 0
260 A 0
261 C 0
262 G 0
263 A 0
264 C 226
265 G 223
266 G 222
267 A 221
268 U 0
269 A 0
270 G 292
271 C 291
272 C 290
273 G 289
274 G 285
275 C 284
276 C 283
277 U 282
278 G 0
279 A 0
280 G 0
281 A 0
282 G 277
283 G 276
284 G 275
285 U 274
286 G 0
287 G 0
288 C 0
289 C 273
290 G 272
291 G 271
292 C 270
293 C 97
294 A 96
295 C 95
296 A 0
297 G 318
298 G 317
299 G 316
300 G 315
301 C 314
302 A 313
303 C 0
304 U 0
305 G 0
306 A 0
307 G 0
308 A 0
309 C 0
310 A 0
311 C 0
312 G 0
313 G 302
314 G 301
315 U 300
316 C 299
317 C 298
318 C 297
319 A 0
320 C 331
321 U 330
322 C 329
323 C 328
324 U 0
325 A 0
326 C 0
327 G 0
328 G 323
329 G 322
330 A 321
331 G 320
332 G 0
333 C 0
334 A 0
335 G 58
336 C 57
337 A 56
338 G 54
339 U 53
340 U 52
341 A 0
342 G 47
343 G 0
344 A 0
345 A 0
346 U 0
347 C 0
348 U 374
349 U 0
350 C 373
351 C 372
352 A 371
353 C 0
354 A 0
355 A 0
356 U 369
357 G 368
358 G 367
359 G 366
360 C 365
361 G 0
362 C 0
363 A 0
364 A 0
365 G 360
366 C 359
367 C 358
368 U 357
369 G 356
370 A 0
371 U 352
372 G 351
373 G 350
374 A 348
375 G 0
376 C 46
377 G 45
378 A 0
379 C 44
380 G 43
381 C 42
382 C 41
383 G 40
384 C 39
385 G 0
386 U 0
387 G 417
388 A 416
389 G 415
390 G 414
391 G 0
392 A 0
393 U 0
394 G 0
395 A 0
396 A 0
397 G 408
398 G 407
399 U 406
400 U 405
401 U 0
402 U 0
403 C 0
404 G 0
405 G 400
406 A 399
407 U 398
408 C 397
409 G 0
410 U 0
411 A 0
412 A 0
413 A 0
414 C 390
415 C 389
416 U 388
417 C 387
418 U 0
419 G 465
420 A 0
421 A 466
422 U 461
423 C 460
424 U 459
425 G 458
426 G 457
427 G 0
428 A 0
429 C 0
430 G 452
431 A 0
432 A 0
433 A 0
434 G 0
435 A 446
436 G 445
437 C 444
438 C 443
439 U 0
440 U 0
441 C 0
442 G 0
443 G 438
444 G 437
445 C 436
446 A 435
447 G 0
448 A 0
449 U 0
450 G 0
451 A 0
452 C 430
453 G 0
454 G 0
455 U 0
456 A 0
457 C 426
458 C 425
459 A 424
460 G 423
461 A 422
462 G 0
463 U 0
464 A 0
465 A 419
466 U 421
467 A 0
468 G 513
469 C 512
470 A 511
471 C 510
472 C 509
473 G 494
474 G 493
475 C 492
476 U 0
477 A 0
478 A 0
479 C 508
480 U 507
481 C 506
482 C 505
483 G 504
484 U 0
485 G 0
486 C 0
487 C 0
488 A 0
489 G 496
490 C 495
491 A 0
492 G 475
493 C 474
494 C 473
495 G 490
496 C 489
497 G 0
498 G 0
499 U 0
500 A 0
501 A 0
502 U 0
503 A 0
504 C 483
505 G 482
506 G 481
507 A 480
508 G 479
509 G 472
510 G 471
511 U 470
512 G 469
513 C 468
514 A 0
515 A 37
516 G 36
517 C 35
518 G 34
519 U 33
520 U 32
521 A 30
522 C 29
523 C 28
524 C 27
525 G 0
526 G 0
527 A 0
528 A 0
529 U 0
530 C 0
531 A 0
532 C 0
533 U 0
534 G 0
535 G 848
536 G 847
537 C 846
538 G 831
539 U 830
540 A 0
541 A 0
542 A 0
543 G 845
544 G 0
545 G 732
546 C 731
547 G 730
548 U 729
549 G 0
550 U 726
551 A 0
552 G 725
553 G 724
554 C 723
555 G 0
556 G 619
557 A 618
558 U 617
559 A 616
560 U 615
561 U 614
562 U 613
563 A 0
564 A 612
565 G 611
566 U 608
567 C 607
568 U 606
569 G 605
570 G 604
571 U 603
572 U 602
573 U 601
574 U 600
575 A 0
576 A 0
577 A 0
578 G 0
579 A 597
580 C 596
581 C 595
582 G 594
583 A 593
584 G 592
585 G 591
586 C 0
587 U 0
588 C 0
589 A 0
590 A 0
591 C 585
592 C 584
593 U 583
594 C 582
595 G 581
596 G 580
597 G 579
598 A 0
599 G 0
600 U 574
601 G 573
602 G 572
603 A 571
604 C 570
605 U 569
606 G 568
607 G 567
608 A 566
609 U 0
610 A 0
611 C 565
612 U 564
613 G 562
614 G 561
615 A 560
616 U 559
617 G 558
618 U 557
619 C 556
620 U 0
621 U 0
622 G 0
623 A 719
624 C 718
625 C 717
626 U 716
627 C 714
628 U 713
629 G 712
630 G 711
631 A 710
632 G 0
633 A 0
634 G 708
635 G 707
636 U 706
637 A 705
638 A 704
639 C 703
640 U 702
641 G 685
642 G 684
643 A 0
644 A 0
645 U 681
646 U 680
647 C 679
648 C 678
649 U 677
650 G 676
651 G 675
652 U 674
653 G 0
654 U 0
655 A 0
656 G 667
657 C 666
658 G 665
659 G 0
660 U 0
661 G 0
662 G 0
663 A 0
664 A 0
665 U 658
666 G 657
667 C 656
668 G 0
669 U 0
670 A 0
671 G 0
672 A 0
673 U 0
674 A 652
675 C 651
676 C 650
677 A 649
678 G 648
679 G 647
680 A 646
681 G 645
682 G 0
683 A 0
684 A 642
685 C 641
686 A 0
687 C 0
688 C 0
689 A 0
690 A 701
691 U 0
692 G 0
693 G 700
694 C 699
695 G 0
696 A 0
697 A 0
698 G 0
699 G 694
700 C 693
701 A 690
702 A 640
703 G 639
704 U 638
705 U 637
706 A 636
707 C 635
708 U 634
709 G 0
710 G 631
711 A 630
712 C 629
713 A 628
714 G 627
715 A 0
716 A 626
717 G 625
718 G 624
719 U 623
720 G 0
721 A 0
722 C 0
723 G 554
724 C 553
725 U 552
726 G 550
727 A 0
728 G 0
729 G 548
730 C 547
731 G 546
732 C 545
733 G 0
734 A 0
735 A 0
736 A 0
737 G 778
738 U 777
739 G 776
740 U 775
741 G 774
742 G 773
743 G 0
744 G 0
745 A 0
746 G 772
747 C 771
748 A 0
749 A 0
750 A 0
751 C 767
752 C 766
753 G 765
754 G 764
755 A 0
756 U 0
757 U 0
758 A 0
759 G 0
760 A 0
761 U 0
762 A 0
763 C 0
764 C 754
765 C 753
766 G 752
767 G 751
768 G 0
769 U 0
770 A 0
771 G 747
772 U 746
773 C 742
774 C 741
775 A 740
776 C 739
777 A 738
778 C 737
779 C 0
780 C 0
781 U 0
782 A 0
783 A 0
784 A 0
785 C 0
786 G 0
787 A 0
788 U 0
789 G 844
790 U 843
791 A 842
792 C 841
793 G 840
794 U 839
795 U 0
796 G 0
797 G 822
798 C 821
799 U 820
800 A 819
801 A 818
802 G 817
803 C 816
804 G 815
805 C 814
806 A 813
807 G 812
808 G 0
809 A 0
810 U 0
811 G 0
812 C 807
813 U 806
814 G 805
815 U 804
816 G 803
817 C 802
818 U 801
819 U 800
820 G 799
821 G 798
822 C 797
823 G 0
824 A 0
825 A 0
826 G 833
827 C 832
828 U 0
829 A 0
830 A 539
831 C 538
832 G 827
833 C 826
834 G 0
835 A 0
836 U 0
837 A 0
838 A 0
839 A 794
840 C 793
841 G 792
842 U 791
843 A 790
844 C 789
845 C 543
846 G 537
847 C 536
848 C 535
849 U 0
850 G 877
851 G 876
852 G 875
853 A 0
854 A 0
855 G 0
856 U 0
857 A 0
858 C 0
859 G 870
860 G 869
861 C 868
862 C 867
863 G 0
864 C 0
865 A 0
866 A 0
867 G 862
868 G 861
869 U 860
870 U 859
871 G 0
872 A 0
873 A 0
874 A 0
875 C 852
876 U 851
877 C 850
878 A 0
879 A 0
880 A 0
881 G 19
882 G 18
883 A 17
884 A 0
885 U 0
886 U 1361
887 G 1360
888 A 1358
889 C 1357
890 G 1356
891 G 0
892 G 1355
893 G 1354
894 G 1353
895 C 1352
896 C 1351
897 C 1350
898 G 1349
899 C 0
900 A 1345
901 C 1344
902 A 0
903 A 0
904 G 1309
905 C 1308
906 G 1307
907 G 1306
908 U 1305
909 G 1202
910 G 1201
911 A 1200
912 G 1199
913 C 1198
914 A 1197
915 U 1196
916 G 1195
917 U 1194
918 G 1193
919 G 1191
920 U 1190
921 U 0
922 U 0
923 A 0
924 A 0
925 U 940
926 U 939
927 C 938
928 G 937
929 A 0
930 A 0
931 G 0
932 C 0
933 A 0
934 A 0
935 C 0
936 G 0
937 C 928
938 G 927
939 A 926
940 A 925
941 G 0
942 A 0
943 A 0
944 C 0
945 C 0
946 U 0
947 U 0
948 A 0
949 C 1186
950 C 1185
951 A 1184
952 G 1183
953 G 1182
954 U 1181
955 C 1180
956 U 0
957 U 0
958 G 0
959 A 0
960 C 0
961 A 1012
962 U 1011
963 G 1010
964 C 1008
965 U 1007
966 A 1006
967 G 1005
968 G 1004
969 A 0
970 A 0
971 G 988
972 G 987
973 C 986
974 G 985
975 C 984
976 U 983
977 G 982
978 G 0
979 A 0
980 G 0
981 A 0
982 C 977
983 A 976
984 G 975
985 C 974
986 G 973
987 C 972
988 C 971
989 G 0
990 U 1003
991 G 1002
992 C 1001
993 C 1000
994 C 999
995 U 0
996 U 0
997 C 0
998 G 0
999 G 994
1000 G 993
1001 G 992
1002 A 991
1003 A 990
1004 C 968
1005 C 967
1006 U 966
1007 A 965
1008 G 964
1009 A 0
1010 C 963
1011 A 962
1012 C 961
1013 A 0
1014 G 1175
1015 G 1174
1016 U 0
1017 G 1173
1018 C 1172
1019 U 1171
1020 G 1170
1021 C 0
1022 A 0
1023 U 1169
1024 G 1168
1025 G 1164
1026 C 1163
1027 U 1162
1028 G 1160
1029 U 1159
1030 C 1158
1031 G 1157
1032 U 0
1033 C 0
1034 A 0
1035 G 1074
1036 C 1073
1037 U 1072
1038 C 1071
1039 G 1070
1040 U 1069
1041 G 1050
1042 U 1049
1043 C 1048
1044 G 0
1045 U 0
1046 G 0
1047 A 0
1048 G 1043
1049 A 1042
1050 U 1041
1051 G 0
1052 U 0
1053 U 1066
1054 G 1065
1055 G 1064
1056 G 1063
1057 U 0
1058 U 0
1059 A 0
1060 A 0
1061 G 0
1062 U 0
1063 C 1056
1064 C 1055
1065 C 1054
1066 G 1053
1067 C 0
1068 A 0
1069 A 1040
1070 C 1039
1071 G 1038
1072 A 1037
1073 G 1036
1074 C 1035
1075 G 0
1076 C 0
1077 A 0
1078 A 0
1079 C 0
1080 C 1152
1081 C 1151
1082 U 1150
1083 U 1149
1084 G 0
1085 C 1121
1086 U 1120
1087 U 1119
1088 C 1118
1089 C 1117
1090 A 1116
1091 G 1115
1092 U 0
1093 U 0
1094 G 0
1095 C 1110
1096 C 1109
1097 A 0
1098 G 0
1099 C 1108
1100 A 1107
1101 U 0
1102 U 0
1103 C 0
1104 A 0
1105 G 0
1106 U 0
1107 U 1100
1108 G 1099
1109 G 1096
1110 G 1095
1111 C 0
1112 A 0
1113 C 0
1114 U 0
1115 C 1091
1116 U 1090
1117 G 1089
1118 G 1088
1119 A 1087
1120 G 1086
1121 G 1085
1122 G 0
1123 A 0
1124 C 1143
1125 U 1142
1126 G 1141
1127 C 1140
1128 C 1139
1129 U 1138
1130 G 1137
1131 U 1136
1132 G 0
1133 A 0
1134 A 0
1135 A 0
1136 G 1131
1137 C 1130
1138 A 1129
1139 G 1128
1140 G 1127
1141 A 1126
1142 G 1125
1143 G 1124
1144 A 0
1145 A 0
1146 G 0
1147 G 0
1148 C 0
1149 G 1083
1150 G 1082
1151 G 1081
1152 G 1080
1153 A 0
1154 U 0
1155 G 0
1156 A 0
1157 C 1031
1158 G 1030
1159 U 1029
1160 C 1028
1161 U 0
1162 A 1027
1163 G 1026
1164 U 1025
1165 C 0
1166 A 0
1167 G 0
1168 C 1024
1169 A 1023
1170 U 1020
1171 G 1019
1172 G 1018
1173 U 1017
1174 C 1015
1175 C 1014
1176 U 0
1177 U 0
1178 A 0
1179 C 0
1180 G 955
1181 U 954
1182 C 953
1183 C 952
1184 U 951
1185 G 950
1186 G 949
1187 G 0
1188 C 0
1189 U 0
1190 A 920
1191 C 919
1192 A 0
1193 C 918
1194 A 917
1195 C 916
1196 G 915
1197 U 914
1198 G 913
1199 C 912
1200 U 911
1201 A 910
1202 C 909
1203 A 0
1204 A 0
1205 U 0
1206 G 1261
1207 G 1260
1208 A 1259
1209 U 1258
1210 A 1257
1211 G 1256
1212 G 1255
1213 A 0
1214 C 0
1215 A 0
1216 A 0
1217 C 0
1218 G 1249
1219 C 1248
1220 G 1247
1221 C 0
1222 A 0
1223 G 1242
1224 C 1241
1225 A 0
1226 A 0
1227 A 0
1228 C 1237
1229 A 1236
1230 U 1235
1231 G 0
1232 U 0
1233 G 0
1234 A 0
1235 G 1230
1236 U 1229
1237 G 1228
1238 U 0
1239 A 0
1240 A 0
1241 G 1224
1242 C 1223
1243 G 0
1244 A 0
1245 A 0
1246 U 0
1247 C 1220
1248 G 1219
1249 C 1218
1250 U 0
1251 G 0
1252 A 0
1253 A 0
1254 A 0
1255 C 1212
1256 C 1211
1257 U 1210
1258 A 1209
1259 U 1208
1260 C 1207
1261 C 1206
1262 C 0
1263 C 0
1264 A 0
1265 G 0
1266 U 0
1267 U 0
1268 C 1299
1269 A 0
1270 G 0
1271 A 0
1272 U 1295
1273 C 1294
1274 G 1293
1275 G 1292
1276 A 1291
1277 G 1290
1278 U 1289
1279 C 1288
1280 U 0
1281 G 0
1282 C 0
1283 A 0
1284 A 0
1285 C 0
1286 U 0
1287 C 0
1288 G 1279
1289 A 1278
1290 C 1277
1291 U 1276
1292 C 1275
1293 C 1274
1294 G 1273
1295 U 1272
1296 G 0
1297 A 0
1298 A 0
1299 G 1268
1300 U 0
1301 U 0
1302 G 0
1303 G 0
1304 A 0
1305 A 908
1306 U 907
1307 C 906
1308 G 905
1309 C 904
1310 U 0
1311 A 0
1312 G 0
1313 U 0
1314 A 0
1315 A 1337
1316 U 1336
1317 C 1335
1318 G 1334
1319 C 1333
1320 G 1332
1321 G 1331
1322 G 1330
1323 U 0
1324 C 0
1325 A 0
1326 G 0
1327 C 0
1328 A 0
1329 U 0
1330 A 1322
1331 C 1321
1332 C 1320
1333 G 1319
1334 C 1318
1335 G 1317
1336 G 1316
1337 U 1315
1338 G 0
1339 A 0
1340 A 0
1341 U 0
1342 A 0
1343 C 0
1344 G 901
1345 U 900
1346 U 0
1347 C 0
1348 C 0
1349 C 898
1350 G 897
1351 G 896
1352 G 895
1353 C 894
1354 C 893
1355 U 892
1356 U 890
1357 G 889
1358 U 888
1359 A 0
1360 C 887
1361 A 886
1362 C 0
1363 A 0
1364 C 1464
1365 C 0
1366 G 1461
1367 C 1460
1368 C 0
1369 C 1457
1370 G 1456
1371 U 0
1372 C 0
1373 A 0
1374 C 1451
1375 A 1450
1376 C 1449
1377 C 1448
1378 A 1447
1379 U 1446
1380 G 1445
1381 G 1444
1382 G 0
1383 A 0
1384 G 1441
1385 U 1440
1386 A 1439
1387 G 1438
1388 A 1437
1389 U 1436
1390 U 1435
1391 G 1434
1392 C 1433
1393 A 1432
1394 G 1431
1395 U 1430
1396 U 0
1397 G 0
1398 A 0
1399 A 0
1400 A 1426
1401 C 1425
1402 C 1424
1403 G 1423
1404 C 1422
1405 C 1421
1406 G 0
1407 G 1420
1408 G 1419
1409 A 0
1410 G 0
1411 C 1418
1412 C 1417
1413 U 0
1414 C 0
1415 A 0
1416 C 0
1417 G 1412
1418 G 1411
1419 C 1408
1420 A 1407
1421 G 1405
1422 G 1404
1423 C 1403
1424 G 1402
1425 U 1401
1426 C 1400
1427 U 0
1428 A 0
1429 G 0
1430 A 1395
1431 C 1394
1432 U 1393
1433 G 1392
1434 U 1391
1435 G 1390
1436 G 1389
1437 U 1388
1438 U 1387
1439 U 1386
1440 A 1385
1441 U 1384
1442 G 0
1443 A 0
1444 C 1381
1445 U 1380
1446 G 1379
1447 G 1378
1448 G 1377
1449 G 1376
1450 U 1375
1451 G 1374
1452 A 0
1453 A 0
1454 G 0
1455 U 0
1456 C 1370
1457 G 1369
1458 U 0
1459 A 0
1460 A 1367
1461 C 1366
1462 A 0
1463 A 0
1464 G 1364
1465 G 0
1466 U 1489
1467 A 1488
1468 A 1487
1469 C 1486
1470 U 1485
1471 G 1484
1472 U 1483
1473 A 1482
1474 C 1481
1475 C 1480
1476 G 0
1477 G 0
1478 A 0
1479 A 0
1480 G 1475
1481 G 1474
1482 U 1473
1483 G 1472
1484 C 1471
1485 G 1470
1486 G 1469
1487 U 1468
1488 U 1467
1489 G 1466
1490 G 0
1491 A 0
1492 U 0
1493 C 0
1494 A 0
1495 C 0
1496 C 0
1497 U 0
1498 C 0
1499 C 0
1500 U 0
1501 U 0
1502 U 0
1503 N 0
1504 N 0