Filename: d.16.b.E.brachy.bpseq Organism: Eubacterium brachy Accession Number: Z36272 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 G 0 2 U 0 3 G 0 4 C 0 5 U 0 6 G 0 7 C 0 8 A 0 9 G 0 10 A 0 11 G 0 12 A 0 13 A 0 14 G 30 15 A 29 16 G 28 17 U 27 18 U 26 19 U 0 20 G 0 21 A 0 22 U 911 23 C 910 24 C 909 25 U 0 26 G 18 27 G 17 28 C 16 29 U 15 30 C 14 31 A 0 32 G 551 33 G 550 34 A 549 35 U 548 36 G 0 37 A 547 38 A 546 39 C 545 40 G 544 41 C 543 42 U 542 43 G 0 44 G 421 45 C 420 46 G 419 47 G 418 48 C 417 49 G 416 50 U 414 51 G 413 52 C 379 53 U 0 54 U 0 55 A 0 56 A 0 57 C 377 58 A 376 59 C 375 60 A 0 61 U 374 62 G 373 63 C 372 64 A 0 65 A 0 66 G 121 67 U 120 68 C 119 69 G 0 70 A 0 71 G 118 72 C 117 73 G 116 74 A 0 75 G 0 76 A 0 77 A 0 78 G 111 79 U 110 80 U 109 81 U 108 82 U 107 83 G 106 84 A 105 85 A 104 86 A 0 87 A 0 88 G 0 89 A 0 90 U 0 91 U 98 92 C 97 93 U 0 94 U 0 95 C 0 96 G 0 97 G 92 98 A 91 99 U 0 100 G 0 101 A 0 102 A 0 103 A 0 104 U 85 105 U 84 106 U 83 107 A 82 108 A 81 109 A 80 110 A 79 111 U 78 112 G 0 113 G 0 114 A 0 115 A 0 116 A 73 117 G 72 118 C 71 119 G 68 120 G 67 121 C 66 122 G 0 123 G 0 124 A 0 125 C 0 126 G 0 127 G 0 128 G 332 129 U 331 130 G 330 131 A 0 132 G 0 133 U 0 134 A 0 135 A 0 136 C 0 137 G 251 138 C 250 139 G 249 140 U 248 141 A 247 142 G 246 143 G 245 144 C 244 145 A 0 146 A 0 147 C 243 148 C 242 149 A 0 150 U 235 151 A 234 152 C 233 153 A 0 154 A 188 155 A 187 156 G 186 157 G 185 158 G 0 159 A 0 160 U 0 161 A 0 162 G 179 163 C 178 164 A 177 165 U 176 166 U 175 167 U 174 168 G 173 169 G 0 170 A 0 171 A 0 172 A 0 173 C 168 174 G 167 175 A 166 176 A 165 177 U 164 178 A 163 179 U 162 180 U 0 181 A 0 182 A 0 183 U 0 184 A 0 185 C 157 186 C 156 187 U 155 188 U 154 189 A 0 190 U 0 191 G 0 192 A 0 193 A 0 194 A 219 195 C 218 196 U 217 197 U 216 198 A 215 199 A 214 200 C 213 201 U 212 202 A 211 203 G 210 204 U 209 205 G 0 206 C 0 207 A 0 208 U 0 209 G 204 210 C 203 211 U 202 212 A 201 213 G 200 214 G 199 215 U 198 216 A 197 217 G 196 218 G 195 219 U 194 220 C 0 221 A 0 222 A 0 223 A 0 224 G 231 225 A 230 226 U 0 227 U 0 228 U 0 229 A 0 230 U 225 231 C 224 232 G 0 233 G 152 234 U 151 235 A 150 236 U 0 237 G 0 238 G 0 239 G 0 240 A 0 241 U 0 242 G 148 243 G 147 244 G 144 245 C 143 246 C 142 247 U 141 248 G 140 249 C 139 250 G 138 251 U 137 252 C 304 253 U 303 254 G 302 255 A 0 256 C 0 257 U 301 258 G 0 259 C 0 260 C 0 261 C 0 262 U 0 263 U 0 264 A 0 265 G 295 266 C 294 267 U 293 268 A 0 269 G 0 270 U 292 271 U 291 272 G 290 273 G 289 274 U 288 275 G 287 276 A 286 277 G 285 278 G 0 279 U 0 280 A 0 281 A 0 282 C 0 283 G 0 284 G 0 285 C 277 286 U 276 287 C 275 288 A 274 289 C 273 290 C 272 291 A 271 292 A 270 293 G 267 294 G 266 295 C 265 296 G 0 297 A 0 298 C 0 299 G 0 300 A 0 301 U 257 302 C 254 303 A 253 304 G 252 305 U 0 306 A 0 307 G 329 308 C 328 309 C 327 310 G 326 311 A 322 312 C 321 313 C 320 314 U 319 315 G 0 316 A 0 317 G 0 318 A 0 319 G 314 320 G 313 321 G 312 322 U 311 323 G 0 324 A 0 325 A 0 326 C 310 327 G 309 328 G 308 329 C 307 330 C 130 331 A 129 332 C 128 333 A 0 334 U 355 335 U 354 336 G 353 337 G 352 338 A 351 339 A 350 340 C 0 341 U 0 342 G 0 343 A 0 344 G 0 345 A 0 346 C 0 347 A 0 348 C 0 349 G 0 350 G 339 351 U 338 352 C 337 353 C 336 354 A 335 355 A 334 356 A 0 357 C 368 358 U 367 359 C 366 360 C 365 361 U 0 362 A 0 363 C 0 364 G 0 365 G 360 366 G 359 367 A 358 368 G 357 369 G 0 370 C 0 371 A 0 372 G 63 373 C 62 374 A 61 375 G 59 376 U 58 377 G 57 378 G 0 379 G 52 380 G 0 381 A 0 382 A 0 383 U 0 384 A 0 385 U 411 386 U 0 387 G 410 388 C 409 389 A 408 390 C 0 391 A 0 392 A 0 393 U 406 394 G 405 395 G 404 396 G 403 397 G 402 398 G 0 399 A 0 400 A 0 401 A 0 402 C 397 403 C 396 404 C 395 405 U 394 406 G 393 407 A 0 408 U 389 409 G 388 410 C 387 411 A 385 412 G 0 413 C 51 414 A 50 415 A 0 416 C 49 417 G 48 418 C 47 419 C 46 420 G 45 421 C 44 422 G 0 423 U 0 424 G 454 425 A 453 426 A 452 427 C 451 428 G 0 429 A 0 430 U 0 431 G 0 432 A 0 433 A 0 434 G 445 435 G 444 436 C 443 437 C 442 438 U 0 439 U 0 440 U 0 441 G 0 442 G 437 443 G 436 444 U 435 445 C 434 446 G 0 447 U 0 448 A 0 449 A 0 450 A 0 451 G 427 452 U 426 453 U 425 454 C 424 455 U 0 456 G 490 457 U 0 458 U 491 459 C 487 460 U 486 461 A 485 462 G 484 463 G 483 464 U 482 465 G 0 466 A 0 467 U 0 468 G 477 469 A 0 470 A 0 471 A 0 472 A 0 473 C 0 474 U 0 475 G 0 476 A 0 477 C 468 478 A 0 479 G 0 480 U 0 481 A 0 482 A 464 483 C 463 484 C 462 485 U 461 486 A 460 487 G 459 488 G 0 489 A 0 490 G 456 491 A 458 492 A 0 493 A 0 494 G 540 495 C 539 496 C 538 497 C 537 498 C 536 499 G 520 500 G 519 501 C 518 502 U 0 503 A 0 504 A 0 505 C 535 506 U 534 507 C 533 508 C 532 509 G 531 510 U 0 511 G 0 512 C 0 513 C 0 514 A 0 515 G 522 516 C 521 517 A 0 518 G 501 519 C 500 520 C 499 521 G 516 522 C 515 523 G 0 524 G 0 525 U 0 526 A 0 527 A 0 528 U 0 529 A 0 530 C 0 531 U 509 532 G 508 533 G 507 534 A 506 535 G 505 536 G 498 537 G 497 538 G 496 539 G 495 540 C 494 541 A 0 542 A 42 543 G 41 544 C 40 545 G 39 546 U 38 547 U 37 548 A 35 549 U 34 550 C 33 551 C 32 552 G 0 553 G 0 554 A 0 555 A 0 556 U 0 557 U 0 558 A 0 559 U 0 560 U 0 561 G 0 562 G 876 563 G 875 564 C 874 565 G 859 566 U 858 567 A 0 568 A 0 569 A 0 570 G 873 571 G 0 572 G 758 573 U 757 574 A 756 575 C 755 576 G 0 577 U 752 578 A 0 579 G 751 580 G 750 581 U 749 582 G 0 583 G 645 584 C 644 585 C 643 586 U 642 587 U 641 588 U 640 589 U 639 590 A 0 591 A 638 592 G 637 593 C 634 594 G 633 595 U 632 596 A 631 597 G 630 598 G 629 599 G 628 600 U 627 601 A 626 602 U 0 603 A 0 604 A 0 605 G 0 606 G 624 607 C 623 608 A 622 609 A 621 610 U 620 611 G 619 612 G 618 613 C 0 614 U 0 615 C 0 616 A 0 617 A 0 618 C 612 619 C 611 620 A 610 621 U 609 622 U 608 623 G 607 624 U 606 625 U 0 626 C 601 627 G 600 628 C 599 629 C 598 630 C 597 631 U 596 632 A 595 633 U 594 634 G 593 635 A 0 636 A 0 637 C 592 638 U 591 639 G 589 640 G 588 641 A 587 642 A 586 643 G 585 644 G 584 645 C 583 646 U 0 647 U 0 648 G 0 649 A 745 650 G 744 651 U 743 652 G 741 653 C 740 654 A 739 655 G 738 656 G 737 657 A 736 658 G 0 659 A 0 660 G 734 661 G 733 662 A 732 663 A 731 664 A 730 665 G 729 666 C 728 667 G 711 668 G 710 669 A 0 670 A 0 671 U 707 672 U 706 673 C 705 674 C 704 675 U 703 676 A 702 677 G 701 678 U 700 679 G 0 680 U 0 681 A 0 682 G 693 683 C 692 684 G 691 685 G 0 686 U 0 687 G 0 688 G 0 689 A 0 690 A 0 691 U 684 692 G 683 693 C 682 694 A 0 695 U 0 696 A 0 697 G 0 698 A 0 699 U 0 700 A 678 701 U 677 702 U 676 703 A 675 704 G 674 705 G 673 706 A 672 707 G 671 708 G 0 709 A 0 710 A 668 711 C 667 712 A 0 713 U 0 714 C 0 715 A 0 716 G 727 717 C 0 718 G 0 719 G 726 720 C 725 721 G 0 722 A 0 723 A 0 724 G 0 725 G 720 726 C 719 727 G 716 728 G 666 729 C 665 730 U 664 731 U 663 732 U 662 733 C 661 734 U 660 735 G 0 736 G 657 737 A 656 738 C 655 739 U 654 740 G 653 741 C 652 742 A 0 743 A 651 744 C 650 745 U 649 746 G 0 747 A 0 748 C 0 749 A 581 750 C 580 751 U 579 752 G 577 753 A 0 754 G 0 755 G 575 756 U 574 757 A 573 758 C 572 759 G 0 760 A 0 761 A 0 762 A 0 763 G 804 764 C 803 765 G 802 766 U 801 767 G 800 768 G 799 769 G 0 770 G 0 771 A 0 772 G 798 773 C 797 774 A 0 775 A 0 776 A 0 777 C 793 778 A 792 779 G 791 780 G 790 781 A 0 782 U 0 783 U 0 784 A 0 785 G 0 786 A 0 787 U 0 788 A 0 789 C 0 790 C 780 791 C 779 792 U 778 793 G 777 794 G 0 795 U 0 796 A 0 797 G 773 798 U 772 799 C 768 800 C 767 801 A 766 802 C 765 803 G 764 804 C 763 805 C 0 806 G 0 807 U 0 808 A 0 809 A 0 810 A 0 811 C 0 812 G 0 813 A 0 814 U 0 815 G 872 816 A 871 817 G 870 818 C 869 819 A 868 820 C 867 821 U 0 822 A 0 823 G 850 824 G 849 825 U 848 826 G 847 827 U 846 828 C 845 829 G 844 830 G 843 831 G 842 832 G 841 833 U 840 834 C 839 835 G 0 836 U 0 837 A 0 838 A 0 839 G 834 840 G 833 841 C 832 842 U 831 843 U 830 844 C 829 845 G 828 846 G 827 847 U 826 848 G 825 849 C 824 850 C 823 851 G 0 852 U 0 853 A 0 854 G 861 855 U 860 856 U 0 857 A 0 858 A 566 859 C 565 860 G 855 861 C 854 862 A 0 863 U 0 864 U 0 865 A 0 866 A 0 867 G 820 868 U 819 869 G 818 870 C 817 871 U 816 872 C 815 873 C 570 874 G 564 875 C 563 876 C 562 877 U 0 878 G 905 879 G 904 880 G 903 881 G 0 882 A 0 883 G 0 884 U 0 885 A 0 886 C 0 887 G 898 888 C 897 889 A 896 890 C 895 891 G 0 892 C 0 893 A 0 894 A 0 895 G 890 896 U 889 897 G 888 898 U 887 899 G 0 900 A 0 901 A 0 902 A 0 903 C 880 904 U 879 905 C 878 906 A 0 907 A 0 908 A 0 909 G 24 910 G 23 911 A 22 912 A 0 913 U 0 914 U 1384 915 G 1383 916 A 1381 917 C 1380 918 G 1379 919 G 0 920 G 1378 921 G 1377 922 A 1376 923 C 1375 924 C 1374 925 C 1373 926 G 1372 927 C 0 928 A 1368 929 C 1367 930 A 0 931 A 0 932 G 1332 933 C 1331 934 A 1330 935 G 1329 936 C 1328 937 G 1226 938 G 1225 939 A 1224 940 G 1223 941 C 1222 942 A 1221 943 U 1220 944 G 1219 945 U 1218 946 G 1217 947 G 1215 948 U 1214 949 U 0 950 U 0 951 A 0 952 A 0 953 U 0 954 U 967 955 C 966 956 G 965 957 A 0 958 A 0 959 G 0 960 C 0 961 A 0 962 A 0 963 C 0 964 G 0 965 C 956 966 G 955 967 A 954 968 G 0 969 A 0 970 A 0 971 C 0 972 C 0 973 U 0 974 U 0 975 A 0 976 C 1210 977 C 1209 978 A 1208 979 G 1207 980 G 1206 981 A 1205 982 C 1204 983 U 0 984 U 0 985 G 0 986 A 0 987 C 0 988 A 1035 989 U 1034 990 C 1033 991 C 1031 992 U 1030 993 U 1029 994 C 1028 995 U 1027 996 G 0 997 A 0 998 C 0 999 C 1016 1000 G 1015 1001 G 1014 1002 U 1013 1003 C 1012 1004 U 1011 1005 U 1010 1006 U 0 1007 A 0 1008 A 0 1009 U 0 1010 A 1005 1011 G 1004 1012 G 1003 1013 A 1002 1014 C 1001 1015 C 1000 1016 U 999 1017 U 0 1018 U 1025 1019 C 1024 1020 U 0 1021 U 0 1022 U 0 1023 U 0 1024 G 1019 1025 A 1018 1026 C 0 1027 A 995 1028 G 994 1029 A 993 1030 A 992 1031 G 991 1032 A 0 1033 G 990 1034 A 989 1035 C 988 1036 A 0 1037 G 1199 1038 G 1198 1039 U 0 1040 G 1197 1041 G 1196 1042 U 1195 1043 G 1194 1044 C 0 1045 A 0 1046 U 1193 1047 G 1192 1048 G 1188 1049 U 1187 1050 U 1186 1051 G 1184 1052 U 1183 1053 C 1182 1054 G 1181 1055 U 0 1056 C 0 1057 A 0 1058 G 1097 1059 C 1096 1060 U 1095 1061 C 1094 1062 G 1093 1063 U 1092 1064 G 1073 1065 U 1072 1066 C 1071 1067 G 0 1068 U 0 1069 G 0 1070 A 0 1071 G 1066 1072 A 1065 1073 U 1064 1074 G 0 1075 U 0 1076 U 1089 1077 G 1088 1078 G 1087 1079 G 1086 1080 U 0 1081 U 0 1082 A 0 1083 A 0 1084 G 0 1085 U 0 1086 C 1079 1087 C 1078 1088 C 1077 1089 G 1076 1090 C 0 1091 A 0 1092 A 1063 1093 C 1062 1094 G 1061 1095 A 1060 1096 G 1059 1097 C 1058 1098 G 0 1099 C 0 1100 A 0 1101 A 0 1102 C 0 1103 C 1176 1104 C 1175 1105 U 1174 1106 U 1173 1107 G 0 1108 U 1144 1109 C 1143 1110 A 1142 1111 U 1141 1112 U 1140 1113 A 1139 1114 G 1138 1115 U 0 1116 U 0 1117 G 0 1118 C 1133 1119 C 1132 1120 A 0 1121 U 0 1122 C 1131 1123 A 1130 1124 U 0 1125 U 0 1126 A 0 1127 A 0 1128 G 0 1129 U 0 1130 U 1123 1131 G 1122 1132 G 1119 1133 G 1118 1134 C 0 1135 A 0 1136 C 0 1137 U 0 1138 C 1114 1139 U 1113 1140 A 1112 1141 G 1111 1142 U 1110 1143 G 1109 1144 A 1108 1145 G 0 1146 A 0 1147 C 1167 1148 U 1166 1149 G 1165 1150 C 1164 1151 C 1163 1152 G 1162 1153 G 1161 1154 G 1160 1155 G 0 1156 A 0 1157 C 0 1158 A 0 1159 A 0 1160 C 1154 1161 U 1153 1162 C 1152 1163 G 1151 1164 G 1150 1165 A 1149 1166 G 1148 1167 G 1147 1168 A 0 1169 A 0 1170 G 0 1171 G 0 1172 U 0 1173 G 1106 1174 G 1105 1175 G 1104 1176 G 1103 1177 A 0 1178 U 0 1179 G 0 1180 A 0 1181 C 1054 1182 G 1053 1183 U 1052 1184 C 1051 1185 A 0 1186 A 1050 1187 A 1049 1188 U 1048 1189 C 0 1190 A 0 1191 U 0 1192 C 1047 1193 A 1046 1194 U 1043 1195 G 1042 1196 C 1041 1197 C 1040 1198 C 1038 1199 C 1037 1200 U 0 1201 U 0 1202 A 0 1203 U 0 1204 G 982 1205 U 981 1206 U 980 1207 C 979 1208 U 978 1209 G 977 1210 G 976 1211 G 0 1212 C 0 1213 U 0 1214 A 948 1215 C 947 1216 A 0 1217 C 946 1218 A 945 1219 C 944 1220 G 943 1221 U 942 1222 G 941 1223 C 940 1224 U 939 1225 A 938 1226 C 937 1227 A 0 1228 A 0 1229 U 0 1230 G 1284 1231 G 1283 1232 C 1282 1233 U 1281 1234 G 1280 1235 G 1279 1236 U 1278 1237 A 0 1238 C 0 1239 A 0 1240 A 0 1241 A 0 1242 G 1273 1243 A 1272 1244 G 1271 1245 A 0 1246 A 0 1247 G 1266 1248 C 1265 1249 A 0 1250 A 0 1251 G 0 1252 A 1261 1253 C 1260 1254 C 1259 1255 G 0 1256 C 0 1257 A 0 1258 A 0 1259 G 1254 1260 G 1253 1261 U 1252 1262 G 0 1263 G 0 1264 A 0 1265 G 1248 1266 C 1247 1267 A 0 1268 A 0 1269 A 0 1270 G 0 1271 C 1244 1272 U 1243 1273 C 1242 1274 A 0 1275 A 0 1276 A 0 1277 A 0 1278 A 1236 1279 C 1235 1280 C 1234 1281 A 1233 1282 G 1232 1283 C 1231 1284 C 1230 1285 C 0 1286 C 0 1287 A 0 1288 G 0 1289 U 0 1290 U 0 1291 C 1322 1292 G 0 1293 G 0 1294 A 0 1295 U 1318 1296 U 1317 1297 G 1316 1298 U 1315 1299 A 1314 1300 G 1313 1301 G 1312 1302 C 1311 1303 U 0 1304 G 0 1305 A 0 1306 A 0 1307 A 0 1308 C 0 1309 U 0 1310 C 0 1311 G 1302 1312 C 1301 1313 C 1300 1314 U 1299 1315 A 1298 1316 C 1297 1317 A 1296 1318 U 1295 1319 G 0 1320 A 0 1321 A 0 1322 G 1291 1323 U 0 1324 C 0 1325 G 0 1326 G 0 1327 A 0 1328 G 936 1329 U 935 1330 U 934 1331 G 933 1332 C 932 1333 U 0 1334 A 0 1335 G 0 1336 U 0 1337 A 0 1338 A 1360 1339 U 1359 1340 C 1358 1341 G 1357 1342 C 1356 1343 A 1355 1344 G 1354 1345 A 1353 1346 U 0 1347 C 0 1348 A 0 1349 G 0 1350 A 0 1351 A 0 1352 U 0 1353 G 1345 1354 C 1344 1355 U 1343 1356 G 1342 1357 C 1341 1358 G 1340 1359 G 1339 1360 U 1338 1361 G 0 1362 A 0 1363 A 0 1364 U 0 1365 G 0 1366 C 0 1367 G 929 1368 U 928 1369 U 0 1370 C 0 1371 C 0 1372 C 926 1373 G 925 1374 G 924 1375 G 923 1376 U 922 1377 C 921 1378 U 920 1379 U 918 1380 G 917 1381 U 916 1382 A 0 1383 C 915 1384 A 914 1385 C 0 1386 A 0 1387 C 1482 1388 C 0 1389 G 1479 1390 C 1478 1391 C 0 1392 C 1475 1393 G 1474 1394 U 0 1395 C 0 1396 A 0 1397 C 1469 1398 A 1468 1399 C 1467 1400 C 1466 1401 A 1465 1402 U 1464 1403 G 1463 1404 G 1462 1405 A 0 1406 A 0 1407 G 1459 1408 U 1458 1409 U 1457 1410 G 1456 1411 G 1455 1412 G 1454 1413 G 1453 1414 G 1452 1415 C 1451 1416 G 1450 1417 C 1449 1418 C 1448 1419 C 0 1420 A 0 1421 A 0 1422 A 0 1423 G 1444 1424 U 1443 1425 U 1442 1426 G 1441 1427 G 1440 1428 C 1439 1429 A 1438 1430 G 1437 1431 A 1436 1432 U 0 1433 A 0 1434 A 0 1435 A 0 1436 U 1431 1437 A 1430 1438 U 1429 1439 G 1428 1440 C 1427 1441 U 1426 1442 A 1425 1443 C 1424 1444 C 1423 1445 U 0 1446 A 0 1447 A 0 1448 G 1418 1449 G 1417 1450 U 1416 1451 G 1415 1452 A 1414 1453 A 1413 1454 A 1412 1455 C 1411 1456 C 1410 1457 A 1409 1458 A 1408 1459 U 1407 1460 G 0 1461 A 0 1462 C 1404 1463 U 1403 1464 G 1402 1465 G 1401 1466 G 1400 1467 G 1399 1468 U 1398 1469 G 1397 1470 A 0 1471 A 0 1472 G 0 1473 U 0 1474 C 1393 1475 G 1392 1476 U 0 1477 A 0 1478 A 1390 1479 C 1389 1480 A 0 1481 A 0 1482 G 1387 1483 G 0 1484 U 1507 1485 A 1506 1486 C 1505 1487 C 1504 1488 C 1503 1489 G 1502 1490 U 1501 1491 A 1500 1492 G 1499 1493 G 1498 1494 A 0 1495 U 0 1496 C 0 1497 C 0 1498 C 1493 1499 U 1492 1500 G 1491 1501 N 1490 1502 N 1489 1503 N 1488 1504 N 1487 1505 N 1486 1506 N 1485 1507 N 1484 1508 N 0 1509 N 0 1510 N 0 1511 N 0 1512 N 0 1513 N 0 1514 N 0 1515 N 0 1516 N 0 1517 N 0 1518 N 0 1519 N 0 1520 N 0