Filename: d.16.b.E.rhusiopathiae.bpseq Organism: Erysipelothrix rhusiopathiae (alpha-P15) Accession Number: M23728 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 A 0 3 A 0 4 A 0 5 U 0 6 G 0 7 G 0 8 A 0 9 G 25 10 A 24 11 G 23 12 U 22 13 U 21 14 U 0 15 G 0 16 A 0 17 U 915 18 C 914 19 C 913 20 U 0 21 G 13 22 G 12 23 C 11 24 U 10 25 C 9 26 A 0 27 G 561 28 G 560 29 A 559 30 U 558 31 N 0 32 A 557 33 A 556 34 C 555 35 G 554 36 C 553 37 U 552 38 G 0 39 G 408 40 C 407 41 G 406 42 G 405 43 C 404 44 G 403 45 U 401 46 G 400 47 C 366 48 C 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 U 364 53 A 363 54 C 362 55 A 0 56 U 361 57 G 360 58 C 359 59 A 0 60 A 0 61 G 104 62 U 103 63 C 102 64 G 0 65 A 0 66 A 101 67 C 100 68 G 99 69 A 98 70 A 97 71 G 96 72 U 95 73 G 0 74 A 0 75 A 0 76 G 91 77 A 90 78 G 89 79 G 88 80 A 87 81 G 86 82 C 0 83 U 0 84 U 0 85 G 0 86 C 81 87 U 80 88 C 79 89 C 78 90 U 77 91 U 76 92 G 0 93 G 0 94 A 0 95 A 72 96 C 71 97 U 70 98 U 69 99 A 68 100 G 67 101 U 66 102 G 63 103 G 62 104 C 61 105 G 0 106 A 0 107 A 0 108 C 0 109 G 0 110 G 0 111 G 319 112 U 318 113 G 317 114 A 0 115 G 0 116 U 0 117 A 0 118 A 0 119 U 0 120 A 244 121 C 243 122 A 242 123 U 241 124 A 240 125 A 239 126 G 238 127 C 237 128 A 0 129 A 0 130 C 236 131 C 235 132 U 0 133 G 0 134 C 0 135 C 232 136 U 231 137 C 230 138 G 229 139 A 228 140 U 227 141 G 226 142 C 0 143 C 177 144 U 176 145 G 175 146 G 174 147 G 0 148 A 0 149 U 0 150 A 0 151 A 168 152 C 167 153 A 166 154 G 165 155 A 164 156 G 163 157 G 162 158 G 0 159 A 0 160 A 0 161 A 0 162 C 157 163 U 156 164 U 155 165 C 154 166 U 153 167 G 152 168 C 151 169 U 0 170 A 0 171 A 0 172 U 0 173 A 0 174 C 146 175 C 145 176 G 144 177 G 143 178 A 0 179 U 0 180 A 0 181 C 0 182 G 207 183 U 206 184 U 205 185 A 204 186 A 203 187 U 202 188 C 201 189 U 200 190 A 199 191 A 198 192 G 197 193 A 0 194 C 0 195 A 0 196 U 0 197 C 192 198 U 191 199 U 190 200 A 189 201 G 188 202 A 187 203 U 186 204 U 185 205 A 184 206 A 183 207 U 182 208 U 0 209 A 0 210 A 0 211 A 0 212 G 224 213 A 223 214 U 222 215 G 221 216 G 0 217 G 0 218 A 0 219 U 0 220 A 0 221 C 215 222 A 214 223 U 213 224 C 212 225 A 0 226 C 141 227 A 140 228 A 139 229 C 138 230 G 137 231 A 136 232 G 135 233 A 0 234 U 0 235 G 131 236 G 130 237 G 127 238 C 126 239 U 125 240 U 124 241 A 123 242 U 122 243 G 121 244 G 120 245 C 291 246 G 290 247 C 289 248 A 0 249 U 0 250 U 288 251 A 0 252 G 282 253 U 281 254 U 280 255 A 0 256 G 0 257 U 279 258 U 278 259 G 277 260 G 276 261 U 275 262 A 274 263 A 273 264 G 272 265 G 0 266 U 0 267 A 0 268 A 0 269 C 0 270 G 0 271 G 0 272 C 264 273 U 263 274 U 262 275 A 261 276 C 260 277 C 259 278 A 258 279 A 257 280 G 254 281 A 253 282 C 252 283 G 0 284 A 0 285 U 0 286 G 0 287 A 0 288 U 250 289 G 247 290 C 246 291 G 245 292 U 0 293 A 0 294 G 316 295 C 315 296 C 314 297 G 313 298 A 309 299 C 308 300 C 307 301 U 306 302 G 0 303 A 0 304 G 0 305 A 0 306 G 301 307 G 300 308 G 299 309 U 298 310 G 0 311 A 0 312 C 0 313 C 297 314 G 296 315 G 295 316 C 294 317 C 113 318 A 112 319 C 111 320 A 0 321 C 342 322 U 341 323 G 340 324 G 339 325 G 338 326 A 337 327 C 0 328 U 0 329 G 0 330 A 0 331 G 0 332 A 0 333 C 0 334 A 0 335 C 0 336 G 0 337 G 326 338 C 325 339 C 324 340 C 323 341 A 322 342 G 321 343 A 0 344 C 355 345 U 354 346 C 353 347 C 352 348 U 0 349 A 0 350 C 0 351 G 0 352 G 347 353 G 346 354 A 345 355 G 344 356 G 0 357 C 0 358 A 0 359 G 58 360 C 57 361 A 56 362 G 54 363 U 53 364 A 52 365 G 0 366 G 47 367 G 0 368 A 0 369 A 0 370 U 0 371 U 0 372 U 398 373 U 0 374 C 397 375 G 396 376 G 395 377 C 0 378 A 0 379 A 0 380 U 393 381 G 392 382 G 391 383 G 390 384 G 389 385 G 0 386 A 0 387 A 0 388 A 0 389 C 384 390 C 383 391 C 382 392 U 381 393 G 380 394 A 0 395 C 376 396 C 375 397 G 374 398 A 372 399 G 0 400 C 46 401 A 45 402 A 0 403 C 44 404 G 43 405 C 42 406 C 41 407 G 40 408 C 39 409 G 0 410 U 0 411 G 441 412 A 440 413 G 439 414 U 438 415 G 0 416 A 0 417 A 0 418 G 0 419 A 0 420 C 0 421 G 432 422 G 431 423 C 430 424 C 429 425 U 0 426 U 0 427 C 0 428 G 0 429 G 424 430 G 423 431 U 422 432 U 421 433 G 0 434 U 0 435 A 0 436 A 0 437 A 0 438 G 414 439 C 413 440 U 412 441 C 411 442 U 0 443 G 501 444 U 0 445 U 502 446 G 498 447 U 497 448 A 496 449 A 495 450 G 494 451 G 493 452 G 0 453 A 0 454 A 0 455 G 488 456 A 0 457 A 0 458 C 0 459 G 0 460 A 0 461 U 482 462 A 481 463 G 480 464 G 479 465 A 478 466 A 477 467 G 476 468 A 475 469 G 0 470 G 0 471 G 0 472 A 0 473 A 0 474 U 0 475 G 468 476 C 467 477 U 466 478 U 465 479 C 464 480 U 463 481 U 462 482 A 461 483 U 0 484 A 0 485 U 0 486 G 0 487 A 0 488 C 455 489 G 0 490 G 0 491 U 0 492 A 0 493 C 451 494 C 450 495 U 449 496 U 448 497 A 447 498 C 446 499 C 0 500 A 0 501 G 443 502 A 445 503 A 0 504 A 0 505 G 550 506 C 549 507 C 548 508 A 547 509 C 546 510 G 531 511 G 530 512 C 529 513 U 0 514 A 0 515 A 0 516 C 545 517 U 544 518 A 543 519 C 542 520 G 541 521 U 0 522 G 0 523 C 0 524 C 0 525 A 0 526 G 533 527 C 532 528 A 0 529 G 512 530 C 511 531 C 510 532 G 527 533 C 526 534 G 0 535 G 0 536 U 0 537 A 0 538 A 0 539 U 0 540 A 0 541 C 520 542 G 519 543 U 518 544 A 517 545 G 516 546 G 509 547 U 508 548 G 507 549 G 506 550 C 505 551 A 0 552 A 37 553 G 36 554 C 35 555 G 34 556 U 33 557 U 32 558 A 30 559 U 29 560 C 28 561 C 27 562 G 0 563 G 0 564 A 0 565 A 0 566 U 0 567 U 0 568 A 0 569 U 0 570 U 0 571 G 0 572 G 880 573 G 879 574 C 878 575 G 863 576 U 862 577 A 0 578 A 0 579 A 0 580 G 877 581 G 0 582 G 768 583 A 767 584 G 766 585 C 765 586 G 0 587 C 762 588 A 0 589 G 761 590 G 760 591 C 759 592 G 0 593 G 655 594 U 654 595 U 653 596 U 652 597 A 651 598 U 650 599 C 649 600 A 0 601 A 648 602 G 647 603 U 644 604 U 643 605 U 642 606 A 641 607 U 640 608 G 639 609 G 638 610 U 637 611 U 636 612 A 0 613 A 0 614 A 0 615 G 0 616 U 634 617 U 633 618 C 632 619 G 631 620 G 630 621 G 629 622 G 628 623 C 0 624 U 0 625 U 0 626 A 0 627 A 0 628 C 622 629 C 621 630 C 620 631 C 619 632 G 618 633 N 617 634 G 616 635 A 0 636 U 611 637 G 610 638 C 609 639 C 608 640 A 607 641 U 606 642 A 605 643 G 604 644 A 603 645 A 0 646 A 0 647 C 602 648 U 601 649 G 599 650 G 598 651 U 597 652 A 596 653 G 595 654 A 594 655 C 593 656 U 0 657 A 0 658 G 0 659 A 755 660 G 754 661 U 753 662 G 751 663 C 750 664 A 749 665 G 748 666 G 747 667 A 746 668 G 0 669 A 0 670 G 744 671 G 743 672 U 742 673 U 741 674 A 740 675 G 739 676 U 738 677 G 721 678 G 720 679 A 0 680 A 0 681 U 717 682 U 716 683 C 715 684 C 714 685 A 713 686 U 712 687 G 711 688 U 710 689 G 0 690 U 0 691 A 0 692 G 703 693 C 702 694 G 701 695 G 0 696 U 0 697 A 0 698 A 0 699 A 0 700 A 0 701 U 694 702 G 693 703 C 692 704 G 0 705 U 0 706 A 0 707 G 0 708 A 0 709 U 0 710 A 688 711 U 687 712 A 686 713 U 685 714 G 684 715 G 683 716 A 682 717 G 681 718 G 0 719 A 0 720 A 678 721 C 677 722 A 0 723 C 0 724 C 0 725 A 0 726 G 737 727 U 0 728 G 0 729 G 736 730 C 735 731 G 0 732 A 0 733 A 0 734 G 0 735 G 730 736 C 729 737 G 726 738 G 676 739 C 675 740 U 674 741 A 673 742 A 672 743 C 671 744 U 670 745 G 0 746 G 667 747 C 666 748 C 665 749 U 664 750 G 663 751 U 662 752 A 0 753 A 661 754 C 660 755 U 659 756 G 0 757 A 0 758 C 0 759 G 591 760 C 590 761 U 589 762 G 587 763 A 0 764 G 0 765 G 585 766 C 584 767 U 583 768 C 582 769 G 0 770 A 0 771 A 0 772 A 0 773 G 814 774 C 813 775 G 812 776 U 811 777 G 810 778 G 809 779 G 0 780 G 0 781 A 0 782 G 808 783 C 807 784 A 0 785 A 0 786 A 0 787 U 803 788 A 802 789 G 801 790 G 800 791 A 0 792 U 0 793 U 0 794 A 0 795 G 0 796 A 0 797 U 0 798 A 0 799 C 0 800 C 790 801 C 789 802 U 788 803 A 787 804 G 0 805 U 0 806 A 0 807 G 783 808 U 782 809 C 778 810 C 777 811 A 776 812 C 775 813 G 774 814 C 773 815 C 0 816 G 0 817 U 0 818 A 0 819 A 0 820 A 0 821 C 0 822 G 0 823 A 0 824 U 0 825 G 876 826 G 875 827 A 874 828 U 873 829 A 872 830 C 871 831 U 0 832 A 0 833 A 854 834 G 853 835 U 852 836 G 851 837 U 850 838 U 849 839 G 848 840 G 847 841 A 846 842 G 0 843 A 0 844 A 0 845 A 0 846 U 841 847 U 840 848 C 839 849 A 838 850 G 837 851 U 836 852 G 835 853 C 834 854 U 833 855 G 0 856 U 0 857 A 0 858 G 865 859 U 864 860 U 0 861 A 0 862 A 576 863 C 575 864 G 859 865 C 858 866 A 0 867 A 0 868 U 0 869 A 0 870 A 0 871 G 830 872 U 829 873 A 828 874 U 827 875 C 826 876 C 825 877 C 580 878 G 574 879 C 573 880 C 572 881 U 0 882 G 909 883 G 908 884 G 907 885 G 0 886 A 0 887 G 0 888 U 0 889 A 0 890 U 0 891 G 902 892 C 901 893 G 900 894 C 899 895 G 0 896 C 0 897 A 0 898 A 0 899 G 894 900 C 893 901 G 892 902 U 891 903 A 0 904 A 0 905 A 0 906 A 0 907 C 884 908 U 883 909 C 882 910 A 0 911 A 0 912 A 0 913 G 19 914 G 18 915 A 17 916 A 0 917 U 0 918 U 1387 919 G 1386 920 A 1384 921 C 1383 922 G 1382 923 G 0 924 G 1381 925 G 1380 926 G 1379 927 C 1378 928 C 1377 929 N 1376 930 G 1375 931 C 0 932 A 1371 933 C 1370 934 A 0 935 A 0 936 G 1335 937 C 1334 938 G 1333 939 G 1332 940 U 1331 941 G 1228 942 G 1227 943 A 1226 944 G 1225 945 U 1224 946 A 1223 947 U 1222 948 G 1221 949 U 1220 950 G 1219 951 G 1217 952 U 1216 953 U 0 954 U 0 955 A 0 956 A 0 957 U 972 958 U 971 959 C 970 960 G 969 961 A 0 962 A 0 963 N 0 964 C 0 965 A 0 966 A 0 967 C 0 968 G 0 969 C 960 970 G 959 971 A 958 972 A 957 973 G 0 974 A 0 975 A 0 976 C 0 977 C 0 978 U 0 979 U 0 980 A 0 981 C 1212 982 C 1211 983 A 1210 984 G 1209 985 G 1208 986 U 1207 987 C 1206 988 U 0 989 U 0 990 G 0 991 A 0 992 C 0 993 A 1037 994 U 1036 995 A 1035 996 C 1033 997 C 1032 998 G 1031 999 C 1030 1000 G 0 1001 C 0 1002 A 0 1003 A 0 1004 A 0 1005 A 0 1006 G 1019 1007 C 1018 1008 A 1017 1009 C 1016 1010 A 1015 1011 G 0 1012 A 0 1013 G 0 1014 A 0 1015 U 1010 1016 G 1009 1017 U 1008 1018 G 1007 1019 U 1006 1020 A 0 1021 A 1028 1022 U 1027 1023 A 0 1024 G 0 1025 U 0 1026 U 0 1027 A 1022 1028 U 1021 1029 G 0 1030 G 999 1031 C 998 1032 G 997 1033 G 996 1034 A 0 1035 U 995 1036 A 994 1037 C 993 1038 A 0 1039 G 1201 1040 G 1200 1041 U 0 1042 G 1199 1043 G 1198 1044 U 1197 1045 G 1196 1046 C 0 1047 A 0 1048 U 1195 1049 G 1194 1050 G 1190 1051 U 1189 1052 U 1188 1053 G 1186 1054 U 1185 1055 C 1184 1056 G 1183 1057 U 0 1058 C 0 1059 A 0 1060 G 1099 1061 C 1098 1062 U 1097 1063 C 1096 1064 G 1095 1065 U 1094 1066 G 1075 1067 U 1074 1068 C 1073 1069 G 0 1070 U 0 1071 G 0 1072 A 0 1073 G 1068 1074 A 1067 1075 U 1066 1076 G 0 1077 U 0 1078 U 1091 1079 G 1090 1080 G 1089 1081 G 1088 1082 U 0 1083 U 0 1084 A 0 1085 A 0 1086 G 0 1087 U 0 1088 C 1081 1089 C 1080 1090 C 1079 1091 G 1078 1092 C 0 1093 A 0 1094 A 1065 1095 C 1064 1096 G 1063 1097 A 1062 1098 G 1061 1099 C 1060 1100 G 0 1101 C 0 1102 A 0 1103 A 0 1104 C 0 1105 C 1178 1106 C 1177 1107 U 1176 1108 U 1175 1109 G 0 1110 U 1146 1111 C 1145 1112 U 1144 1113 U 1143 1114 U 1142 1115 A 1141 1116 G 1140 1117 U 0 1118 U 0 1119 A 0 1120 C 1135 1121 C 1134 1122 A 0 1123 G 0 1124 C 1133 1125 A 1132 1126 U 0 1127 U 0 1128 A 0 1129 A 0 1130 G 0 1131 U 0 1132 U 1125 1133 G 1124 1134 G 1121 1135 G 1120 1136 G 0 1137 A 0 1138 C 0 1139 U 0 1140 C 1116 1141 U 1115 1142 A 1114 1143 A 1113 1144 A 1112 1145 G 1111 1146 A 1110 1147 G 0 1148 A 0 1149 C 1169 1150 U 1168 1151 G 1167 1152 C 1166 1153 C 1165 1154 G 1164 1155 G 1163 1156 U 1162 1157 G 0 1158 A 0 1159 U 0 1160 A 0 1161 A 0 1162 A 1156 1163 C 1155 1164 C 1154 1165 G 1153 1166 G 1152 1167 A 1151 1168 G 1150 1169 G 1149 1170 A 0 1171 A 0 1172 G 0 1173 G 0 1174 U 0 1175 G 1108 1176 G 1107 1177 G 1106 1178 G 1105 1179 A 0 1180 U 0 1181 G 0 1182 A 0 1183 C 1056 1184 G 1055 1185 U 1054 1186 C 1053 1187 A 0 1188 A 1052 1189 A 1051 1190 U 1050 1191 C 0 1192 A 0 1193 U 0 1194 C 1049 1195 A 1048 1196 U 1045 1197 G 1044 1198 C 1043 1199 C 1042 1200 C 1040 1201 C 1039 1202 U 0 1203 U 0 1204 A 0 1205 U 0 1206 G 987 1207 A 986 1208 U 985 1209 C 984 1210 U 983 1211 G 982 1212 G 981 1213 G 0 1214 C 0 1215 U 0 1216 A 952 1217 C 951 1218 A 0 1219 C 950 1220 A 949 1221 C 948 1222 G 947 1223 U 946 1224 A 945 1225 C 944 1226 U 943 1227 A 942 1228 C 941 1229 A 0 1230 A 0 1231 U 0 1232 G 1287 1233 G 1286 1234 C 1285 1235 G 1284 1236 U 1283 1237 A 1282 1238 U 1281 1239 A 0 1240 C 0 1241 A 0 1242 G 0 1243 A 0 1244 G 1275 1245 G 1274 1246 G 1273 1247 C 0 1248 A 0 1249 G 1268 1250 C 1267 1251 G 0 1252 A 0 1253 A 0 1254 G 1263 1255 C 1262 1256 A 1261 1257 G 0 1258 C 0 1259 G 0 1260 A 0 1261 U 1256 1262 G 1255 1263 C 1254 1264 G 0 1265 G 0 1266 A 0 1267 G 1250 1268 C 1249 1269 G 0 1270 A 0 1271 A 0 1272 U 0 1273 C 1246 1274 U 1245 1275 C 1244 1276 A 0 1277 G 0 1278 A 0 1279 A 0 1280 A 0 1281 G 1238 1282 U 1237 1283 A 1236 1284 C 1235 1285 G 1234 1286 U 1233 1287 C 1232 1288 U 0 1289 C 0 1290 A 0 1291 G 0 1292 U 0 1293 U 0 1294 C 1325 1295 G 0 1296 G 0 1297 A 0 1298 U 1321 1299 U 1320 1300 G 1319 1301 G 1318 1302 A 1317 1303 G 1316 1304 U 1315 1305 C 1314 1306 U 0 1307 G 0 1308 C 0 1309 A 0 1310 A 0 1311 C 0 1312 U 0 1313 C 0 1314 G 1305 1315 A 1304 1316 C 1303 1317 U 1302 1318 C 1301 1319 C 1300 1320 A 1299 1321 U 1298 1322 G 0 1323 A 0 1324 A 0 1325 G 1294 1326 U 0 1327 C 0 1328 G 0 1329 G 0 1330 A 0 1331 A 940 1332 U 939 1333 C 938 1334 G 937 1335 C 936 1336 U 0 1337 A 0 1338 G 0 1339 U 0 1340 A 0 1341 A 1363 1342 U 1362 1343 C 1361 1344 G 1360 1345 C 1359 1346 G 1358 1347 G 1357 1348 A 1356 1349 U 0 1350 C 0 1351 A 0 1352 G 0 1353 A 0 1354 A 0 1355 U 0 1356 G 1348 1357 C 1347 1358 C 1346 1359 G 1345 1360 C 1344 1361 G 1343 1362 G 1342 1363 U 1341 1364 G 0 1365 A 0 1366 A 0 1367 U 0 1368 A 0 1369 C 0 1370 G 933 1371 U 932 1372 U 0 1373 C 0 1374 U 0 1375 C 930 1376 G 929 1377 G 928 1378 G 927 1379 C 926 1380 N 925 1381 U 924 1382 U 922 1383 G 921 1384 U 920 1385 A 0 1386 C 919 1387 A 918 1388 C 0 1389 A 0 1390 C 1501 1391 C 0 1392 G 1498 1393 C 1497 1394 C 0 1395 C 1494 1396 G 1493 1397 U 0 1398 C 1491 1399 A 0 1400 A 1488 1401 A 1487 1402 C 1486 1403 C 1485 1404 A 1484 1405 U 1483 1406 G 1482 1407 A 1481 1408 G 0 1409 A 0 1410 G 1478 1411 U 1477 1412 U 1476 1413 G 1475 1414 G 1474 1415 U 1473 1416 A 1472 1417 A 1471 1418 U 1470 1419 A 1469 1420 C 1468 1421 C 1467 1422 C 0 1423 G 0 1424 A 0 1425 A 0 1426 G 1463 1427 C 1462 1428 C 1461 1429 G 1460 1430 G 1459 1431 U 1458 1432 G 0 1433 G 1457 1434 C 1456 1435 C 1455 1436 U 1454 1437 A 0 1438 A 0 1439 C 1452 1440 C 1451 1441 U 1450 1442 A 1449 1443 G 1448 1444 U 0 1445 U 0 1446 U 0 1447 A 0 1448 C 1443 1449 U 1442 1450 A 1441 1451 G 1440 1452 G 1439 1453 A 0 1454 G 1436 1455 G 1435 1456 G 1434 1457 A 1433 1458 G 1431 1459 C 1430 1460 C 1429 1461 G 1428 1462 U 1427 1463 C 1426 1464 G 0 1465 A 0 1466 A 0 1467 G 1421 1468 G 1420 1469 U 1419 1470 A 1418 1471 G 1417 1472 G 1416 1473 A 1415 1474 U 1414 1475 C 1413 1476 G 1412 1477 A 1411 1478 U 1410 1479 G 0 1480 A 0 1481 U 1407 1482 U 1406 1483 G 1405 1484 G 1404 1485 G 1403 1486 G 1402 1487 N 1401 1488 N 1400 1489 N 0 1490 N 0 1491 N 1398 1492 N 0 1493 N 1396 1494 N 1395 1495 N 0 1496 N 0 1497 N 1393 1498 N 1392 1499 N 0 1500 N 0 1501 N 1390 1502 N 0 1503 N 1526 1504 N 1525 1505 N 1524 1506 N 1523 1507 N 1522 1508 N 1521 1509 N 1520 1510 N 1519 1511 N 1518 1512 N 1517 1513 N 0 1514 N 0 1515 N 0 1516 N 0 1517 N 1512 1518 N 1511 1519 N 1510 1520 N 1509 1521 N 1508 1522 N 1507 1523 N 1506 1524 N 1505 1525 N 1504 1526 N 1503 1527 N 0 1528 N 0 1529 N 0 1530 N 0 1531 N 0 1532 N 0 1533 N 0 1534 N 0 1535 N 0 1536 N 0 1537 N 0 1538 N 0 1539 N 0