Filename: d.16.b.Epulopiscium.sp.bpseq Organism: Epulopiscium sp. (strain A1) Accession Number: M99572 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 N 0 3 N 0 4 N 0 5 N 0 6 N 0 7 N 0 8 N 0 9 N 25 10 N 24 11 N 23 12 N 22 13 N 21 14 N 0 15 N 0 16 N 0 17 N 882 18 N 881 19 N 880 20 N 0 21 N 13 22 N 12 23 N 11 24 N 10 25 N 9 26 N 0 27 N 521 28 G 520 29 A 519 30 U 518 31 G 0 32 A 517 33 A 516 34 C 515 35 G 514 36 C 513 37 U 512 38 G 0 39 G 390 40 C 389 41 G 388 42 G 387 43 C 386 44 G 385 45 U 383 46 G 382 47 C 348 48 U 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 C 346 53 A 345 54 C 344 55 A 0 56 U 343 57 G 342 58 C 341 59 A 0 60 A 0 61 G 90 62 U 89 63 C 88 64 G 0 65 A 0 66 A 87 67 C 86 68 G 85 69 G 84 70 A 83 71 C 82 72 U 81 73 A 80 74 C 79 75 U 0 76 U 0 77 C 0 78 G 0 79 G 74 80 U 73 81 A 72 82 G 71 83 U 70 84 U 69 85 A 68 86 G 67 87 U 66 88 G 63 89 G 62 90 C 61 91 G 0 92 G 0 93 A 0 94 C 0 95 G 0 96 G 0 97 G 301 98 U 300 99 G 299 100 A 0 101 G 0 102 U 0 103 A 0 104 A 0 105 C 0 106 A 226 107 C 225 108 G 224 109 U 223 110 G 222 111 G 221 112 G 220 113 U 219 114 A 0 115 A 0 116 C 218 117 C 217 118 U 0 119 A 0 120 C 0 121 C 214 122 U 213 123 U 212 124 A 211 125 U 210 126 A 209 127 C 208 128 U 0 129 G 163 130 U 162 131 G 161 132 G 160 133 A 0 134 A 0 135 U 0 136 A 0 137 A 154 138 C 153 139 G 152 140 U 151 141 U 150 142 U 149 143 G 148 144 G 0 145 A 0 146 A 0 147 A 0 148 C 143 149 A 142 150 A 141 151 A 140 152 C 139 153 G 138 154 C 137 155 U 0 156 A 0 157 A 0 158 U 0 159 A 0 160 C 132 161 C 131 162 G 130 163 C 129 164 A 0 165 U 0 166 A 0 167 A 0 168 U 0 169 C 194 170 C 193 171 A 192 172 U 191 173 U 190 174 U 189 175 U 188 176 C 187 177 U 186 178 U 185 179 C 184 180 G 0 181 C 0 182 A 0 183 U 0 184 G 179 185 G 178 186 G 177 187 G 176 188 A 175 189 G 174 190 A 173 191 A 172 192 U 171 193 G 170 194 G 169 195 C 0 196 A 0 197 A 0 198 A 0 199 G 206 200 A 205 201 U 0 202 U 0 203 U 0 204 A 0 205 U 200 206 C 199 207 G 0 208 G 127 209 U 126 210 G 125 211 U 124 212 A 123 213 A 122 214 G 121 215 A 0 216 U 0 217 G 117 218 G 116 219 A 113 220 C 112 221 C 111 222 U 110 223 G 109 224 C 108 225 G 107 226 G 106 227 A 273 228 A 272 229 G 271 230 A 0 231 U 0 232 U 270 233 A 0 234 G 264 235 C 263 236 U 262 237 A 0 238 G 0 239 U 261 240 U 260 241 G 259 242 G 258 243 U 257 244 G 256 245 A 255 246 G 254 247 A 0 248 U 0 249 A 0 250 A 0 251 A 0 252 A 0 253 G 0 254 C 246 255 U 245 256 C 244 257 A 243 258 C 242 259 C 241 260 A 240 261 A 239 262 G 236 263 G 235 264 C 234 265 G 0 266 A 0 267 C 0 268 G 0 269 A 0 270 U 232 271 C 229 272 U 228 273 A 227 274 U 0 275 A 0 276 G 298 277 C 297 278 C 296 279 G 295 280 G 291 281 C 290 282 C 289 283 U 288 284 G 0 285 A 0 286 G 0 287 A 0 288 G 283 289 G 282 290 G 281 291 U 280 292 G 0 293 A 0 294 A 0 295 C 279 296 G 278 297 G 277 298 C 276 299 C 99 300 A 98 301 C 97 302 A 0 303 C 324 304 U 323 305 G 322 306 G 321 307 G 320 308 A 319 309 C 0 310 U 0 311 G 0 312 A 0 313 G 0 314 A 0 315 C 0 316 A 0 317 C 0 318 G 0 319 G 308 320 C 307 321 C 306 322 C 305 323 A 304 324 G 303 325 A 0 326 C 337 327 U 336 328 C 335 329 C 334 330 U 0 331 A 0 332 C 0 333 G 0 334 G 329 335 G 328 336 A 327 337 G 326 338 G 0 339 C 0 340 A 0 341 G 58 342 C 57 343 A 56 344 G 54 345 U 53 346 G 52 347 G 0 348 G 47 349 G 0 350 A 0 351 A 0 352 U 0 353 A 0 354 U 380 355 U 0 356 G 379 357 C 378 358 A 377 359 C 0 360 A 0 361 A 0 362 U 375 363 G 374 364 G 373 365 G 372 366 C 371 367 G 0 368 A 0 369 A 0 370 A 0 371 G 366 372 C 365 373 C 364 374 U 363 375 G 362 376 A 0 377 U 358 378 G 357 379 C 356 380 A 354 381 G 0 382 C 46 383 G 45 384 A 0 385 C 44 386 G 43 387 C 42 388 C 41 389 G 40 390 C 39 391 G 0 392 U 0 393 G 423 394 A 422 395 U 421 396 U 420 397 G 0 398 A 0 399 U 0 400 G 0 401 A 0 402 A 0 403 G 414 404 G 413 405 C 412 406 U 411 407 U 0 408 U 0 409 C 0 410 G 0 411 A 406 412 G 405 413 U 404 414 C 403 415 G 0 416 U 0 417 A 0 418 A 0 419 A 0 420 G 396 421 A 395 422 U 394 423 C 393 424 U 0 425 A 461 426 G 0 427 C 462 428 A 458 429 G 457 430 C 456 431 A 455 432 G 454 433 G 453 434 G 0 435 A 0 436 A 0 437 G 448 438 A 0 439 A 0 440 A 445 441 G 0 442 A 0 443 A 0 444 A 0 445 U 440 446 G 0 447 A 0 448 C 437 449 G 0 450 G 0 451 U 0 452 A 0 453 C 433 454 C 432 455 U 431 456 G 430 457 A 429 458 A 428 459 U 0 460 A 0 461 A 425 462 G 427 463 A 0 464 A 0 465 G 510 466 C 509 467 C 508 468 C 507 469 C 506 470 G 491 471 G 490 472 C 489 473 U 0 474 A 0 475 A 0 476 U 505 477 U 504 478 A 503 479 C 502 480 G 501 481 U 0 482 G 0 483 C 0 484 C 0 485 A 0 486 G 493 487 C 492 488 A 0 489 G 472 490 C 471 491 C 470 492 G 487 493 C 486 494 G 0 495 G 0 496 U 0 497 A 0 498 A 0 499 U 0 500 A 0 501 C 480 502 G 479 503 U 478 504 A 477 505 A 476 506 G 469 507 G 468 508 G 467 509 G 466 510 C 465 511 G 0 512 A 37 513 G 36 514 C 35 515 G 34 516 U 33 517 U 32 518 A 30 519 U 29 520 C 28 521 C 27 522 G 0 523 G 0 524 A 0 525 U 0 526 U 0 527 U 0 528 A 0 529 C 0 530 U 0 531 G 0 532 G 847 533 G 846 534 U 845 535 G 830 536 U 829 537 A 0 538 A 0 539 A 0 540 G 844 541 G 0 542 G 729 543 U 728 544 G 727 545 U 726 546 G 0 547 U 723 548 A 0 549 G 722 550 G 721 551 C 720 552 G 0 553 G 616 554 U 615 555 A 614 556 U 613 557 G 612 558 G 611 559 U 610 560 A 0 561 A 609 562 G 608 563 U 605 564 C 604 565 A 603 566 G 602 567 U 601 568 U 600 569 G 599 570 U 598 571 G 597 572 A 0 573 A 0 574 A 0 575 G 0 576 A 594 577 U 593 578 U 592 579 A 591 580 A 590 581 A 589 582 G 588 583 C 0 584 U 0 585 C 0 586 A 0 587 A 0 588 C 582 589 U 581 590 U 580 591 U 579 592 A 578 593 A 577 594 A 576 595 A 0 596 U 0 597 U 571 598 G 570 599 C 569 600 A 568 601 A 567 602 C 566 603 U 565 604 G 564 605 A 563 606 A 0 607 A 0 608 C 562 609 U 561 610 A 559 611 U 558 612 C 557 613 A 556 614 A 555 615 A 554 616 C 553 617 U 0 618 A 0 619 G 0 620 A 716 621 G 715 622 U 714 623 G 712 624 C 711 625 A 710 626 G 709 627 G 708 628 A 707 629 G 0 630 A 0 631 G 705 632 G 704 633 A 703 634 A 702 635 A 701 636 G 700 637 U 699 638 G 682 639 G 681 640 A 0 641 A 0 642 U 678 643 U 677 644 C 676 645 C 675 646 A 674 647 A 673 648 G 672 649 U 671 650 G 0 651 U 0 652 A 0 653 G 664 654 C 663 655 G 662 656 G 0 657 U 0 658 G 0 659 A 0 660 A 0 661 A 0 662 U 655 663 G 654 664 C 653 665 G 0 666 U 0 667 A 0 668 G 0 669 A 0 670 G 0 671 A 649 672 U 648 673 U 647 674 U 646 675 G 645 676 G 644 677 A 643 678 G 642 679 G 0 680 A 0 681 A 639 682 C 638 683 A 0 684 C 0 685 C 0 686 A 0 687 G 698 688 U 0 689 A 0 690 G 697 691 C 696 692 G 0 693 A 0 694 A 0 695 G 0 696 G 691 697 C 690 698 G 687 699 A 637 700 C 636 701 U 635 702 U 634 703 U 633 704 C 632 705 U 631 706 G 0 707 G 628 708 A 627 709 C 626 710 U 625 711 G 624 712 U 623 713 A 0 714 A 622 715 C 621 716 U 620 717 G 0 718 A 0 719 C 0 720 G 551 721 C 550 722 U 549 723 G 547 724 A 0 725 G 0 726 A 545 727 C 544 728 A 543 729 C 542 730 G 0 731 A 0 732 A 0 733 A 0 734 G 775 735 C 774 736 G 773 737 U 772 738 G 771 739 G 770 740 G 0 741 G 0 742 A 0 743 G 769 744 C 768 745 G 0 746 A 0 747 A 0 748 C 764 749 A 763 750 G 762 751 G 761 752 A 0 753 U 0 754 U 0 755 A 0 756 G 0 757 A 0 758 U 0 759 A 0 760 C 0 761 C 751 762 C 750 763 U 749 764 G 748 765 G 0 766 U 0 767 A 0 768 G 744 769 U 743 770 C 739 771 C 738 772 A 737 773 C 736 774 G 735 775 C 734 776 U 0 777 G 0 778 U 0 779 A 0 780 A 0 781 A 0 782 C 0 783 G 0 784 A 0 785 U 0 786 G 843 787 A 842 788 A 841 789 U 840 790 A 839 791 C 838 792 U 0 793 A 0 794 G 821 795 G 820 796 U 819 797 G 818 798 U 817 799 U 816 800 G 815 801 G 814 802 G 813 803 G 812 804 C 811 805 U 810 806 U 0 807 A 0 808 C 0 809 G 0 810 G 805 811 G 804 812 U 803 813 C 802 814 U 801 815 C 800 816 G 799 817 G 798 818 U 797 819 G 796 820 C 795 821 C 794 822 G 0 823 C 0 824 A 0 825 G 832 826 C 831 827 U 0 828 A 0 829 A 536 830 C 535 831 A 826 832 C 825 833 A 0 834 A 0 835 U 0 836 A 0 837 A 0 838 G 791 839 U 790 840 A 789 841 U 788 842 U 787 843 C 786 844 C 540 845 A 534 846 C 533 847 C 532 848 U 0 849 G 876 850 G 875 851 G 874 852 A 0 853 A 0 854 G 0 855 U 0 856 A 0 857 C 0 858 G 869 859 A 868 860 C 867 861 C 866 862 G 0 863 C 0 864 A 0 865 A 0 866 G 861 867 G 860 868 U 859 869 U 858 870 G 0 871 A 0 872 A 0 873 A 0 874 C 851 875 U 850 876 C 849 877 A 0 878 A 0 879 A 0 880 G 19 881 G 18 882 A 17 883 A 0 884 U 0 885 U 1365 886 G 1364 887 A 1362 888 C 1361 889 G 1360 890 G 0 891 G 1359 892 G 1358 893 A 1357 894 C 1356 895 C 1355 896 C 1354 897 G 1353 898 C 0 899 A 1349 900 C 1348 901 A 0 902 A 0 903 G 1313 904 C 1312 905 G 1311 906 G 1310 907 U 1309 908 G 1206 909 G 1205 910 A 1204 911 G 1203 912 C 1202 913 A 1201 914 U 1200 915 G 1199 916 U 1198 917 G 1197 918 G 1195 919 U 1194 920 U 0 921 U 0 922 A 0 923 A 0 924 U 939 925 U 938 926 C 937 927 G 936 928 A 0 929 A 0 930 G 0 931 C 0 932 A 0 933 A 0 934 C 0 935 G 0 936 C 927 937 G 926 938 A 925 939 A 924 940 G 0 941 A 0 942 A 0 943 C 0 944 C 0 945 U 0 946 U 0 947 A 0 948 C 1190 949 C 1189 950 U 1188 951 A 1187 952 A 1186 953 A 1185 954 C 1184 955 U 0 956 U 0 957 G 0 958 A 0 959 C 0 960 A 1015 961 U 1014 962 C 1013 963 C 1011 964 C 1010 965 U 1009 966 A 1008 967 U 1007 968 G 0 969 A 0 970 C 0 971 A 988 972 G 987 973 G 986 974 G 985 975 G 984 976 G 983 977 G 0 978 U 0 979 A 0 980 A 0 981 U 0 982 G 0 983 C 976 984 C 975 985 C 974 986 C 973 987 U 972 988 U 971 989 U 0 990 U 1005 991 U 1004 992 C 1003 993 U 1002 994 A 1001 995 C 1000 996 U 0 997 U 0 998 C 0 999 G 0 1000 G 995 1001 U 994 1002 A 993 1003 G 992 1004 G 991 1005 A 990 1006 C 0 1007 A 967 1008 U 966 1009 A 965 1010 G 964 1011 G 963 1012 U 0 1013 G 962 1014 A 961 1015 C 960 1016 A 0 1017 G 1179 1018 G 1178 1019 U 0 1020 G 1177 1021 G 1176 1022 U 1175 1023 G 1174 1024 C 0 1025 A 0 1026 U 1173 1027 G 1172 1028 G 1168 1029 U 1167 1030 U 1166 1031 G 1164 1032 U 1163 1033 C 1162 1034 G 1161 1035 U 0 1036 C 0 1037 A 0 1038 G 1077 1039 C 1076 1040 U 1075 1041 C 1074 1042 G 1073 1043 U 1072 1044 G 1053 1045 U 1052 1046 C 1051 1047 G 0 1048 U 0 1049 G 0 1050 A 0 1051 G 1046 1052 A 1045 1053 U 1044 1054 G 0 1055 U 0 1056 U 1069 1057 G 1068 1058 G 1067 1059 G 1066 1060 U 0 1061 U 0 1062 A 0 1063 A 0 1064 G 0 1065 U 0 1066 C 1059 1067 C 1058 1068 C 1057 1069 G 1056 1070 C 0 1071 A 0 1072 A 1043 1073 C 1042 1074 G 1041 1075 A 1040 1076 G 1039 1077 C 1038 1078 G 0 1079 C 0 1080 A 0 1081 A 0 1082 C 0 1083 C 1156 1084 C 1155 1085 U 1154 1086 U 1153 1087 A 0 1088 U 1124 1089 C 1123 1090 U 1122 1091 U 1121 1092 U 1120 1093 A 1119 1094 G 1118 1095 U 0 1096 A 0 1097 G 0 1098 C 1113 1099 C 1112 1100 A 0 1101 G 0 1102 C 1111 1103 A 1110 1104 U 0 1105 U 0 1106 A 0 1107 A 0 1108 G 0 1109 U 0 1110 U 1103 1111 G 1102 1112 G 1099 1113 G 1098 1114 C 0 1115 A 0 1116 C 0 1117 U 0 1118 C 1094 1119 U 1093 1120 G 1092 1121 G 1091 1122 A 1090 1123 G 1089 1124 A 1088 1125 G 0 1126 A 0 1127 C 1147 1128 U 1146 1129 G 1145 1130 C 1144 1131 C 1143 1132 A 1142 1133 A 1141 1134 G 1140 1135 G 0 1136 A 0 1137 U 0 1138 A 0 1139 A 0 1140 C 1134 1141 U 1133 1142 U 1132 1143 G 1131 1144 G 1130 1145 A 1129 1146 G 1128 1147 G 1127 1148 A 0 1149 A 0 1150 G 0 1151 G 0 1152 U 0 1153 G 1086 1154 G 1085 1155 G 1084 1156 G 1083 1157 A 0 1158 C 0 1159 G 0 1160 A 0 1161 C 1034 1162 G 1033 1163 U 1032 1164 C 1031 1165 A 0 1166 A 1030 1167 A 1029 1168 U 1028 1169 C 0 1170 A 0 1171 U 0 1172 C 1027 1173 A 1026 1174 U 1023 1175 G 1022 1176 C 1021 1177 C 1020 1178 C 1018 1179 C 1017 1180 U 0 1181 U 0 1182 A 0 1183 U 0 1184 G 954 1185 U 953 1186 U 952 1187 U 951 1188 A 950 1189 G 949 1190 G 948 1191 G 0 1192 C 0 1193 U 0 1194 A 919 1195 C 918 1196 A 0 1197 C 917 1198 A 916 1199 C 915 1200 G 914 1201 U 913 1202 G 912 1203 C 911 1204 U 910 1205 A 909 1206 C 908 1207 A 0 1208 A 0 1209 U 0 1210 G 1265 1211 G 1264 1212 C 1263 1213 U 1262 1214 A 1261 1215 C 1260 1216 U 1259 1217 A 0 1218 C 0 1219 A 0 1220 A 0 1221 A 0 1222 G 1253 1223 G 1252 1224 G 1251 1225 A 0 1226 G 0 1227 G 1246 1228 C 1245 1229 A 0 1230 A 0 1231 A 0 1232 G 1241 1233 C 1240 1234 U 1239 1235 G 0 1236 U 0 1237 G 0 1238 A 0 1239 A 1234 1240 G 1233 1241 U 1232 1242 G 0 1243 G 0 1244 A 0 1245 G 1228 1246 C 1227 1247 A 0 1248 A 0 1249 A 0 1250 C 0 1251 C 1224 1252 C 1223 1253 C 1222 1254 A 0 1255 A 0 1256 A 0 1257 A 0 1258 A 0 1259 G 1216 1260 G 1215 1261 U 1214 1262 A 1213 1263 G 1212 1264 U 1211 1265 C 1210 1266 C 0 1267 C 0 1268 A 0 1269 G 0 1270 U 0 1271 U 0 1272 C 1303 1273 G 0 1274 G 0 1275 A 0 1276 U 1299 1277 U 1298 1278 G 1297 1279 U 1296 1280 A 1295 1281 G 1294 1282 U 1293 1283 C 1292 1284 U 0 1285 G 0 1286 C 0 1287 A 0 1288 A 0 1289 C 0 1290 U 0 1291 C 0 1292 G 1283 1293 A 1282 1294 C 1281 1295 U 1280 1296 A 1279 1297 C 1278 1298 A 1277 1299 U 1276 1300 G 0 1301 A 0 1302 A 0 1303 G 1272 1304 A 0 1305 U 0 1306 G 0 1307 G 0 1308 A 0 1309 A 907 1310 U 906 1311 C 905 1312 G 904 1313 C 903 1314 U 0 1315 A 0 1316 G 0 1317 U 0 1318 A 0 1319 A 1341 1320 U 1340 1321 C 1339 1322 G 1338 1323 C 1337 1324 A 1336 1325 G 1335 1326 A 1334 1327 U 0 1328 C 0 1329 A 0 1330 G 0 1331 A 0 1332 A 0 1333 U 0 1334 G 1326 1335 C 1325 1336 U 1324 1337 G 1323 1338 C 1322 1339 G 1321 1340 G 1320 1341 U 1319 1342 G 0 1343 A 0 1344 A 0 1345 U 0 1346 A 0 1347 C 0 1348 G 900 1349 U 899 1350 U 0 1351 C 0 1352 C 0 1353 C 897 1354 G 896 1355 G 895 1356 G 894 1357 U 893 1358 C 892 1359 U 891 1360 U 889 1361 G 888 1362 U 887 1363 A 0 1364 C 886 1365 A 885 1366 C 0 1367 A 0 1368 C 1473 1369 C 0 1370 G 1470 1371 C 1469 1372 C 0 1373 C 1466 1374 G 1465 1375 U 0 1376 C 0 1377 A 0 1378 C 1460 1379 A 1459 1380 C 1458 1381 C 1457 1382 A 1456 1383 U 1455 1384 G 1454 1385 G 1453 1386 A 0 1387 A 0 1388 G 1450 1389 U 1449 1390 U 1448 1391 G 1447 1392 G 1446 1393 G 1445 1394 G 1444 1395 G 1443 1396 G 1442 1397 G 1441 1398 C 1440 1399 C 1439 1400 C 0 1401 G 0 1402 A 0 1403 C 0 1404 A 1435 1405 U 1434 1406 C 1433 1407 A 1432 1408 G 1431 1409 U 1430 1410 G 0 1411 A 1429 1412 C 1428 1413 C 1427 1414 U 1426 1415 A 0 1416 A 0 1417 C 1424 1418 C 1423 1419 G 0 1420 C 0 1421 A 0 1422 A 0 1423 G 1418 1424 G 1417 1425 A 0 1426 G 1414 1427 G 1413 1428 G 1412 1429 A 1411 1430 G 1409 1431 C 1408 1432 U 1407 1433 G 1406 1434 C 1405 1435 C 1404 1436 U 0 1437 A 0 1438 A 0 1439 G 1399 1440 G 1398 1441 C 1397 1442 A 1396 1443 A 1395 1444 A 1394 1445 A 1393 1446 C 1392 1447 C 1391 1448 A 1390 1449 A 1389 1450 U 1388 1451 G 0 1452 A 0 1453 C 1385 1454 U 1384 1455 G 1383 1456 G 1382 1457 G 1381 1458 G 1380 1459 U 1379 1460 G 1378 1461 N 0 1462 N 0 1463 N 0 1464 N 0 1465 N 1374 1466 N 1373 1467 N 0 1468 N 0 1469 N 1371 1470 N 1370 1471 N 0 1472 N 0 1473 N 1368 1474 N 0 1475 N 1498 1476 N 1497 1477 N 1496 1478 N 1495 1479 N 1494 1480 N 1493 1481 N 1492 1482 N 1491 1483 N 1490 1484 N 1489 1485 N 0 1486 N 0 1487 N 0 1488 N 0 1489 N 1484 1490 N 1483 1491 N 1482 1492 N 1481 1493 N 1480 1494 N 1479 1495 N 1478 1496 N 1477 1497 N 1476 1498 N 1475 1499 N 0 1500 N 0 1501 N 0 1502 N 0 1503 N 0 1504 N 0 1505 N 0 1506 N 0 1507 N 0 1508 N 0 1509 N 0 1510 N 0 1511 N 0