Filename: d.16.b.F.nucleatum.bpseq
Organism: Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum
Accession Number: M58683
Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu
1 A 0
2 U 0
3 U 0
4 G 0
5 A 0
6 A 0
7 C 0
8 G 0
9 A 0
10 A 0
11 G 27
12 A 26
13 G 25
14 U 24
15 U 23
16 U 0
17 G 0
18 A 0
19 U 894
20 C 893
21 C 892
22 U 0
23 G 15
24 G 14
25 C 13
26 U 12
27 C 11
28 A 0
29 G 536
30 G 535
31 A 534
32 U 533
33 G 0
34 A 532
35 A 531
36 C 530
37 G 529
38 C 528
39 U 527
40 G 0
41 A 405
42 C 404
43 A 403
44 G 402
45 A 401
46 A 400
47 U 398
48 G 397
49 C 362
50 U 0
51 U 0
52 A 0
53 A 0
54 C 360
55 A 359
56 C 358
57 A 0
58 U 357
59 G 356
60 C 355
61 A 0
62 A 0
63 G 103
64 U 102
65 C 101
66 U 0
67 A 100
68 C 99
69 U 98
70 U 97
71 G 96
72 A 95
73 A 94
74 U 93
75 U 92
76 U 91
77 G 90
78 G 89
79 G 88
80 U 87
81 U 86
82 U 0
83 U 0
84 U 0
85 U 0
86 A 81
87 A 80
88 C 79
89 U 78
90 U 77
91 C 76
92 G 75
93 A 74
94 U 73
95 U 72
96 U 71
97 G 70
98 G 69
99 G 68
100 U 67
101 G 65
102 G 64
103 C 63
104 G 0
105 G 0
106 A 0
107 C 0
108 G 0
109 G 0
110 G 315
111 U 314
112 G 313
113 A 0
114 G 0
115 U 0
116 A 0
117 A 0
118 C 0
119 G 240
120 C 239
121 G 238
122 U 237
123 A 236
124 A 235
125 A 234
126 G 233
127 A 0
128 A 0
129 C 232
130 U 231
131 U 0
132 G 0
133 C 0
134 C 228
135 U 227
136 C 226
137 A 225
138 C 224
139 A 223
140 G 222
141 C 0
142 U 176
143 A 175
144 G 174
145 G 173
146 G 0
147 A 0
148 C 0
149 A 0
150 A 167
151 C 166
152 A 165
153 U 164
154 U 163
155 U 162
156 G 161
157 G 0
158 A 0
159 A 0
160 A 0
161 C 156
162 G 155
163 A 154
164 A 153
165 U 152
166 G 151
167 C 150
168 U 0
169 A 0
170 A 0
171 U 0
172 A 0
173 C 145
174 C 144
175 U 143
176 A 142
177 A 0
178 U 0
179 A 0
180 U 0
181 U 0
182 A 207
183 U 206
184 G 205
185 A 204
186 U 203
187 U 202
188 A 201
189 U 200
190 A 199
191 G 198
192 G 197
193 G 0
194 C 0
195 A 0
196 U 0
197 C 192
198 C 191
199 U 190
200 A 189
201 G 188
202 A 187
203 A 186
204 U 185
205 U 184
206 A 183
207 U 182
208 G 0
209 A 0
210 A 0
211 A 0
212 G 220
213 C 219
214 U 0
215 A 0
216 U 0
217 A 0
218 U 0
219 G 213
220 C 212
221 G 0
222 C 140
223 U 139
224 G 138
225 U 137
226 G 136
227 A 135
228 G 134
229 A 0
230 G 0
231 A 130
232 G 129
233 C 126
234 U 125
235 U 124
236 U 123
237 G 122
238 C 121
239 G 120
240 U 119
241 C 287
242 C 286
243 C 285
244 A 0
245 U 0
246 U 284
247 A 0
248 G 278
249 C 277
250 U 276
251 A 0
252 G 0
253 U 275
254 U 274
255 G 273
256 G 272
257 A 271
258 G 270
259 A 269
260 G 268
261 G 0
262 U 0
263 A 0
264 A 0
265 C 0
266 G 0
267 G 0
268 C 260
269 U 259
270 C 258
271 A 257
272 C 256
273 C 255
274 A 254
275 A 253
276 G 250
277 G 249
278 C 248
279 A 0
280 A 0
281 U 0
282 G 0
283 A 0
284 U 246
285 G 243
286 G 242
287 G 241
288 N 0
289 A 0
290 G 312
291 C 311
292 C 310
293 G 309
294 G 305
295 C 304
296 C 303
297 U 302
298 G 0
299 A 0
300 G 0
301 A 0
302 G 297
303 G 296
304 G 295
305 U 294
306 G 0
307 A 0
308 A 0
309 C 293
310 G 292
311 G 291
312 C 290
313 C 112
314 A 111
315 C 110
316 A 0
317 A 338
318 G 337
319 G 336
320 G 335
321 G 334
322 A 333
323 C 0
324 U 0
325 G 0
326 A 0
327 G 0
328 A 0
329 C 0
330 A 0
331 C 0
332 G 0
333 G 322
334 C 321
335 C 320
336 C 319
337 U 318
338 U 317
339 A 0
340 C 351
341 U 350
342 C 349
343 C 348
344 U 0
345 A 0
346 C 0
347 G 0
348 G 343
349 G 342
350 A 341
351 G 340
352 G 0
353 C 0
354 A 0
355 G 60
356 C 59
357 A 58
358 G 56
359 U 55
360 G 54
361 G 0
362 G 49
363 G 0
364 A 0
365 A 0
366 U 0
367 A 0
368 U 395
369 U 0
370 G 394
371 G 393
372 A 392
373 C 0
374 A 0
375 A 0
376 U 390
377 G 389
378 G 388
379 A 387
380 C 386
381 C 0
382 G 0
383 A 0
384 G 0
385 A 0
386 G 380
387 U 379
388 C 378
389 U 377
390 G 376
391 A 0
392 U 372
393 C 371
394 C 370
395 A 368
396 G 0
397 C 48
398 A 47
399 A 0
400 U 46
401 U 45
402 C 44
403 U 43
404 G 42
405 U 41
406 G 0
407 U 0
408 G 438
409 C 437
410 A 436
411 C 435
412 G 0
413 A 0
414 U 0
415 G 0
416 A 0
417 C 0
418 G 429
419 U 428
420 U 427
421 U 426
422 U 0
423 U 0
424 C 0
425 G 0
426 G 421
427 A 420
428 A 419
429 U 418
430 G 0
431 U 0
432 A 0
433 A 0
434 A 0
435 G 411
436 U 410
437 G 409
438 C 408
439 U 0
440 U 476
441 U 0
442 C 477
443 A 473
444 G 472
445 U 471
446 U 470
447 G 469
448 G 468
449 G 0
450 A 0
451 A 0
452 G 463
453 A 0
454 A 0
455 A 0
456 A 0
457 A 0
458 A 0
459 A 0
460 U 0
461 G 0
462 A 0
463 C 452
464 G 0
465 G 0
466 U 0
467 A 0
468 C 448
469 C 447
470 A 446
471 A 445
472 C 444
473 A 443
474 G 0
475 A 0
476 A 440
477 G 442
478 A 0
479 A 0
480 G 525
481 U 524
482 G 523
483 A 522
484 C 521
485 G 506
486 G 505
487 C 504
488 U 0
489 A 0
490 A 0
491 A 520
492 U 519
493 A 518
494 C 517
495 G 516
496 U 0
497 G 0
498 C 0
499 C 0
500 A 0
501 G 508
502 C 507
503 A 0
504 G 487
505 C 486
506 C 485
507 G 502
508 C 501
509 G 0
510 G 0
511 U 0
512 A 0
513 A 0
514 U 0
515 A 0
516 C 495
517 G 494
518 U 493
519 A 492
520 U 491
521 G 484
522 U 483
523 C 482
524 A 481
525 C 480
526 G 0
527 A 39
528 G 38
529 C 37
530 G 36
531 U 35
532 U 34
533 A 32
534 U 31
535 C 30
536 C 29
537 G 0
538 G 0
539 A 0
540 U 0
541 U 0
542 U 0
543 A 0
544 U 0
545 U 0
546 G 0
547 G 859
548 G 858
549 C 857
550 G 842
551 U 841
552 A 0
553 A 0
554 A 0
555 G 856
556 C 0
557 G 743
558 C 742
559 G 741
560 U 740
561 C 0
562 U 737
563 A 0
564 G 736
565 G 735
566 U 734
567 G 0
568 G 630
569 U 629
570 U 628
571 A 627
572 U 626
573 G 625
574 U 624
575 A 0
576 A 623
577 G 622
578 U 619
579 C 618
580 U 617
581 G 616
582 A 615
583 U 614
584 G 613
585 U 612
586 G 611
587 A 0
588 A 0
589 A 0
590 A 0
591 U 609
592 G 608
593 C 607
594 A 606
595 G 605
596 G 604
597 G 603
598 C 0
599 U 0
600 C 0
601 A 0
602 A 0
603 C 597
604 U 596
605 C 595
606 U 594
607 G 593
608 U 592
609 A 591
610 U 0
611 U 586
612 G 585
613 C 584
614 G 583
615 U 582
616 U 581
617 G 580
618 G 579
619 A 578
620 A 0
621 A 0
622 C 577
623 U 576
624 G 574
625 U 573
626 G 572
627 U 571
628 A 570
629 A 569
630 C 568
631 U 0
632 A 0
633 G 0
634 A 730
635 G 729
636 U 728
637 N 727
638 C 725
639 U 724
640 G 723
641 G 722
642 A 721
643 A 0
644 A 0
645 G 719
646 G 718
647 U 717
648 A 716
649 A 715
650 G 714
651 C 713
652 G 696
653 G 695
654 A 0
655 A 0
656 C 692
657 U 691
658 A 690
659 C 689
660 A 688
661 A 687
662 G 686
663 U 685
664 G 0
665 U 0
666 A 0
667 G 678
668 A 677
669 G 676
670 G 0
671 U 0
672 G 0
673 A 0
674 A 0
675 A 0
676 U 669
677 U 668
678 C 667
679 G 0
680 U 0
681 A 0
682 G 0
683 A 0
684 U 0
685 A 663
686 U 662
687 U 661
688 U 660
689 G 659
690 U 658
691 A 657
692 G 656
693 G 0
694 A 0
695 A 653
696 U 652
697 G 0
698 C 0
699 C 0
700 G 0
701 A 712
702 U 0
703 G 0
704 G 711
705 G 710
706 G 0
707 A 0
708 A 0
709 G 0
710 C 705
711 C 704
712 A 701
713 G 651
714 C 650
715 U 649
716 U 648
717 A 647
718 C 646
719 U 645
720 G 0
721 G 642
722 A 641
723 C 640
724 A 639
725 G 638
726 A 0
727 U 637
728 A 636
729 C 635
730 U 634
731 G 0
732 A 0
733 C 0
734 G 566
735 C 565
736 U 564
737 G 562
738 A 0
739 A 0
740 G 560
741 C 559
742 G 558
743 C 557
744 N 0
745 N 0
746 N 0
747 A 0
748 G 789
749 C 788
750 G 787
751 U 786
752 G 785
753 G 784
754 G 0
755 U 0
756 A 0
757 G 783
758 C 782
759 A 0
760 A 0
761 A 0
762 C 778
763 A 777
764 G 776
765 G 775
766 A 0
767 U 0
768 U 0
769 A 0
770 G 0
771 A 0
772 U 0
773 A 0
774 C 0
775 C 765
776 C 764
777 U 763
778 G 762
779 G 0
780 U 0
781 A 0
782 G 758
783 U 757
784 C 753
785 C 752
786 A 751
787 C 750
788 G 749
789 C 748
790 C 0
791 G 0
792 U 0
793 A 0
794 A 0
795 A 0
796 C 0
797 G 0
798 A 0
799 U 0
800 G 855
801 A 854
802 U 853
803 U 852
804 A 851
805 C 850
806 U 0
807 A 0
808 G 833
809 G 832
810 U 831
811 G 830
812 U 829
813 U 828
814 G 827
815 G 826
816 G 825
817 G 824
818 G 823
819 U 0
820 C 0
821 G 0
822 A 0
823 A 818
824 C 817
825 C 816
826 U 815
827 C 814
828 A 813
829 G 812
830 C 811
831 G 810
832 C 809
833 C 808
834 C 0
835 A 0
836 A 0
837 G 844
838 C 843
839 A 0
840 A 0
841 A 551
842 C 550
843 G 838
844 C 837
845 G 0
846 A 0
847 U 0
848 A 0
849 A 0
850 G 805
851 U 804
852 A 803
853 A 802
854 U 801
855 C 800
856 C 555
857 G 549
858 C 548
859 C 547
860 U 0
861 G 888
862 G 887
863 G 886
864 G 0
865 A 0
866 G 0
867 U 0
868 A 0
869 C 0
870 G 881
871 U 880
872 A 879
873 C 878
874 G 0
875 C 0
876 A 0
877 A 0
878 G 873
879 U 872
880 A 871
881 U 870
882 G 0
883 A 0
884 A 0
885 A 0
886 C 863
887 U 862
888 C 861
889 A 0
890 A 0
891 A 0
892 G 21
893 G 20
894 A 19
895 A 0
896 U 0
897 U 1376
898 G 1375
899 A 1373
900 C 1372
901 G 1371
902 G 0
903 G 1370
904 G 1369
905 A 1368
906 C 1367
907 C 1366
908 C 1365
909 G 1364
910 C 0
911 A 1360
912 C 1359
913 A 0
914 A 0
915 G 1323
916 C 1322
917 G 1321
918 G 1320
919 U 1319
920 G 1216
921 G 1215
922 A 1214
923 G 1213
924 C 1212
925 A 1211
926 U 1210
927 G 1209
928 U 1208
929 G 1207
930 G 1205
931 U 1204
932 U 0
933 U 0
934 A 0
935 A 0
936 U 951
937 U 950
938 C 949
939 G 948
940 A 0
941 N 0
942 G 0
943 C 0
944 A 0
945 A 0
946 C 0
947 G 0
948 C 939
949 G 938
950 A 937
951 G 936
952 G 0
953 A 0
954 A 0
955 C 0
956 C 0
957 U 0
958 U 0
959 A 0
960 C 1200
961 C 1199
962 A 1198
963 G 1197
964 C 1196
965 G 1195
966 U 1194
967 U 0
968 U 0
969 G 0
970 A 0
971 C 0
972 A 1025
973 U 1024
974 C 1023
975 U 1021
976 U 1020
977 A 1019
978 G 1018
979 G 1017
980 A 0
981 A 0
982 U 999
983 G 998
984 A 997
985 G 996
986 A 995
987 C 994
988 A 993
989 G 0
990 A 0
991 G 0
992 A 0
993 U 988
994 G 987
995 U 986
996 U 985
997 U 984
998 C 983
999 A 982
1000 G 0
1001 U 1016
1002 G 1015
1003 U 1014
1004 C 1013
1005 C 1012
1006 C 1011
1007 U 0
1008 U 0
1009 C 0
1010 G 0
1011 G 1006
1012 G 1005
1013 G 1004
1014 A 1003
1015 A 1002
1016 A 1001
1017 C 979
1018 C 978
1019 U 977
1020 A 976
1021 A 975
1022 A 0
1023 G 974
1024 A 973
1025 C 972
1026 A 0
1027 G 1189
1028 G 1188
1029 U 0
1030 G 1187
1031 G 1186
1032 U 1185
1033 G 1184
1034 C 0
1035 A 0
1036 U 1183
1037 G 1182
1038 G 1178
1039 C 1177
1040 U 1176
1041 G 1174
1042 U 1173
1043 C 1172
1044 G 1171
1045 U 0
1046 C 0
1047 A 0
1048 G 1087
1049 C 1086
1050 U 1085
1051 C 1084
1052 G 1083
1053 U 1082
1054 G 1063
1055 U 1062
1056 C 1061
1057 G 0
1058 U 0
1059 G 0
1060 A 0
1061 G 1056
1062 A 1055
1063 U 1054
1064 G 0
1065 U 0
1066 U 1079
1067 G 1078
1068 G 1077
1069 G 1076
1070 U 0
1071 U 0
1072 A 0
1073 A 0
1074 G 0
1075 U 0
1076 C 1069
1077 C 1068
1078 C 1067
1079 G 1066
1080 C 0
1081 A 0
1082 A 1053
1083 C 1052
1084 G 1051
1085 A 1050
1086 G 1049
1087 C 1048
1088 G 0
1089 C 0
1090 A 0
1091 A 0
1092 C 0
1093 C 1166
1094 C 1165
1095 C 1164
1096 U 1163
1097 U 0
1098 U 1134
1099 C 1133
1100 G 1132
1101 U 1131
1102 A 1130
1103 U 1129
1104 G 1128
1105 U 0
1106 U 0
1107 A 0
1108 C 1123
1109 C 1122
1110 A 0
1111 U 0
1112 C 1121
1113 A 1120
1114 U 0
1115 U 0
1116 A 0
1117 A 0
1118 G 0
1119 U 0
1120 U 1113
1121 G 1112
1122 G 1109
1123 G 1108
1124 G 0
1125 A 0
1126 C 0
1127 U 0
1128 C 1104
1129 A 1103
1130 U 1102
1131 G 1101
1132 C 1100
1133 G 1099
1134 A 1098
1135 U 0
1136 A 0
1137 C 1157
1138 U 1156
1139 G 1155
1140 C 1154
1141 C 1153
1142 U 1152
1143 A 1151
1144 C 1150
1145 G 0
1146 A 0
1147 U 0
1148 G 0
1149 A 0
1150 G 1144
1151 U 1143
1152 A 1142
1153 G 1141
1154 G 1140
1155 A 1139
1156 G 1138
1157 G 1137
1158 A 0
1159 A 0
1160 G 0
1161 G 0
1162 U 0
1163 G 1096
1164 G 1095
1165 G 1094
1166 G 1093
1167 A 0
1168 U 0
1169 G 0
1170 A 0
1171 C 1044
1172 G 1043
1173 U 1042
1174 C 1041
1175 A 0
1176 A 1040
1177 G 1039
1178 U 1038
1179 C 0
1180 A 0
1181 U 0
1182 C 1037
1183 A 1036
1184 U 1033
1185 G 1032
1186 C 1031
1187 C 1030
1188 C 1028
1189 C 1027
1190 U 0
1191 U 0
1192 A 0
1193 U 0
1194 A 966
1195 C 965
1196 G 964
1197 C 963
1198 U 962
1199 G 961
1200 G 960
1201 G 0
1202 C 0
1203 U 0
1204 A 931
1205 C 930
1206 A 0
1207 C 929
1208 A 928
1209 C 927
1210 G 926
1211 U 925
1212 G 924
1213 C 923
1214 U 922
1215 A 921
1216 C 920
1217 A 0
1218 A 0
1219 U 0
1220 G 1275
1221 G 1274
1222 G 1273
1223 U 1272
1224 A 1271
1225 G 1270
1226 A 1269
1227 A 0
1228 C 0
1229 A 0
1230 G 0
1231 A 0
1232 G 1263
1233 A 1262
1234 G 1261
1235 U 0
1236 U 0
1237 G 1256
1238 C 1255
1239 A 0
1240 A 0
1241 A 0
1242 G 1251
1243 C 1250
1244 C 1249
1245 G 0
1246 U 0
1247 G 0
1248 A 0
1249 G 1244
1250 G 1243
1251 U 1242
1252 G 0
1253 G 0
1254 A 0
1255 G 1238
1256 C 1237
1257 U 0
1258 A 0
1259 A 0
1260 U 0
1261 C 1234
1262 U 1233
1263 C 1232
1264 A 0
1265 G 0
1266 A 0
1267 A 0
1268 A 0
1269 A 1226
1270 C 1225
1271 U 1224
1272 A 1223
1273 U 1222
1274 U 1221
1275 C 1220
1276 U 0
1277 U 0
1278 A 0
1279 G 0
1280 U 0
1281 U 0
1282 C 1313
1283 G 0
1284 G 0
1285 A 0
1286 U 1309
1287 U 1308
1288 G 1307
1289 U 1306
1290 A 1305
1291 C 1304
1292 U 1303
1293 C 1302
1294 U 0
1295 G 0
1296 C 0
1297 A 0
1298 A 0
1299 C 0
1300 U 0
1301 C 0
1302 G 1293
1303 A 1292
1304 G 1291
1305 U 1290
1306 A 1289
1307 C 1288
1308 A 1287
1309 U 1286
1310 G 0
1311 A 0
1312 A 0
1313 G 1282
1314 U 0
1315 U 0
1316 G 0
1317 G 0
1318 A 0
1319 A 919
1320 U 918
1321 C 917
1322 G 916
1323 C 915
1324 U 0
1325 A 0
1326 G 0
1327 U 0
1328 A 0
1329 A 1352
1330 U 1351
1331 C 1350
1332 G 1349
1333 C 1348
1334 G 1347
1335 A 1346
1336 A 1345
1337 U 0
1338 C 0
1339 A 0
1340 G 0
1341 C 0
1342 A 0
1343 A 0
1344 U 0
1345 G 1336
1346 U 1335
1347 C 1334
1348 G 1333
1349 C 1332
1350 G 1331
1351 G 1330
1352 U 1329
1353 G 0
1354 A 0
1355 A 0
1356 U 0
1357 A 0
1358 C 0
1359 G 912
1360 U 911
1361 U 0
1362 C 0
1363 U 0
1364 C 909
1365 G 908
1366 G 907
1367 G 906
1368 U 905
1369 C 904
1370 U 903
1371 U 901
1372 G 900
1373 U 899
1374 A 0
1375 C 898
1376 A 897
1377 C 0
1378 A 0
1379 C 1484
1380 C 0
1381 G 1481
1382 C 1480
1383 C 0
1384 C 0
1385 G 1476
1386 U 0
1387 C 1474
1388 A 0
1389 C 1471
1390 A 1470
1391 C 1469
1392 C 1468
1393 A 1467
1394 C 1466
1395 G 1465
1396 A 1464
1397 G 0
1398 A 0
1399 G 1461
1400 U 1460
1401 U 1459
1402 G 1458
1403 G 1457
1404 U 1456
1405 U 1455
1406 G 1454
1407 C 1453
1408 A 1452
1409 C 1451
1410 C 1450
1411 U 0
1412 G 0
1413 A 0
1414 A 0
1415 G 1446
1416 U 1445
1417 A 1444
1418 G 1443
1419 C 1442
1420 A 1441
1421 G 0
1422 G 1440
1423 C 1439
1424 C 1438
1425 U 1437
1426 A 0
1427 A 0
1428 C 1435
1429 C 1434
1430 G 0
1431 U 0
1432 A 0
1433 A 0
1434 G 1429
1435 G 1428
1436 A 0
1437 G 1425
1438 G 1424
1439 G 1423
1440 A 1422
1441 U 1420
1442 G 1419
1443 U 1418
1444 U 1417
1445 C 1416
1446 C 1415
1447 G 0
1448 A 0
1449 G 0
1450 G 1410
1451 G 1409
1452 U 1408
1453 G 1407
1454 U 1406
1455 G 1405
1456 A 1404
1457 U 1403
1458 U 1402
1459 A 1401
1460 G 1400
1461 C 1399
1462 G 0
1463 A 0
1464 N 1396
1465 N 1395
1466 G 1394
1467 G 1393
1468 G 1392
1469 G 1391
1470 N 1390
1471 N 1389
1472 N 0
1473 N 0
1474 N 1387
1475 N 0
1476 N 1385
1477 G 0
1478 U 0
1479 A 0
1480 A 1382
1481 C 1381
1482 A 0
1483 A 0
1484 G 1379
1485 G 0
1486 U 1509
1487 A 1508
1488 U 1507
1489 C 1506
1490 C 1505
1491 G 1504
1492 N 1503
1493 N 1502
1494 N 1501
1495 N 1500
1496 N 0
1497 G 0
1498 A 0
1499 A 0
1500 C 1495
1501 G 1494
1502 N 1493
1503 N 1492
1504 N 1491
1505 N 1490
1506 N 1489
1507 N 1488
1508 N 1487
1509 N 1486
1510 G 0
1511 A 0
1512 U 0
1513 C 0
1514 A 0
1515 C 0
1516 C 0
1517 U 0
1518 C 0
1519 C 0
1520 U 0
1521 U 0
1522 U 0