Filename: d.16.b.G.subterranea.bpseq
Organism: Geotoga subterranea
Accession Number: L10659
Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu
1 U 0
2 G 0
3 G 0
4 A 0
5 A 0
6 G 0
7 A 0
8 A 0
9 G 25
10 G 24
11 G 23
12 U 22
13 U 21
14 U 0
15 G 0
16 A 0
17 U 893
18 C 892
19 C 891
20 U 0
21 G 13
22 G 12
23 C 11
24 U 10
25 C 9
26 A 0
27 G 534
28 G 533
29 G 532
30 U 531
31 G 0
32 A 530
33 A 529
34 C 528
35 G 527
36 C 526
37 U 525
38 G 0
39 G 388
40 C 387
41 G 386
42 G 385
43 C 384
44 G 383
45 C 381
46 G 380
47 C 346
48 C 0
49 U 0
50 A 0
51 A 0
52 C 344
53 A 343
54 C 342
55 A 0
56 U 341
57 G 340
58 C 339
59 A 0
60 A 0
61 G 103
62 U 102
63 C 101
64 G 0
65 A 0
66 A 100
67 C 99
68 G 98
69 G 97
70 A 96
71 G 0
72 A 0
73 A 0
74 A 91
75 G 90
76 A 89
77 G 88
78 G 87
79 A 86
80 G 85
81 C 0
82 U 0
83 U 0
84 G 0
85 C 80
86 U 79
87 C 78
88 C 77
89 U 76
90 U 75
91 G 74
92 A 0
93 G 0
94 U 0
95 A 0
96 U 70
97 U 69
98 A 68
99 G 67
100 U 66
101 G 63
102 G 62
103 C 61
104 G 0
105 A 0
106 A 0
107 C 0
108 G 0
109 G 0
110 G 299
111 U 298
112 G 297
113 A 0
114 G 0
115 U 0
116 A 0
117 G 0
118 A 0
119 A 224
120 C 223
121 G 222
122 U 221
123 A 220
124 G 219
125 G 218
126 A 217
127 A 0
128 C 216
129 C 215
130 U 0
131 G 0
132 C 0
133 C 212
134 U 211
135 A 210
136 A 209
137 C 208
138 G 207
139 G 206
140 A 0
141 C 175
142 U 174
143 G 173
144 G 172
145 G 0
146 A 0
147 U 0
148 A 0
149 G 166
150 C 165
151 U 164
152 A 163
153 C 162
154 U 161
155 G 160
156 G 0
157 A 0
158 A 0
159 A 0
160 C 155
161 G 154
162 G 153
163 U 152
164 A 151
165 G 150
166 G 149
167 U 0
168 A 0
169 A 0
170 U 0
171 A 0
172 C 144
173 U 143
174 G 142
175 G 141
176 A 0
177 U 0
178 A 0
179 A 0
180 A 0
181 A 190
182 U 189
183 C 188
184 G 0
185 A 0
186 G 0
187 A 0
188 G 183
189 A 182
190 U 181
191 A 0
192 A 0
193 A 0
194 A 0
195 G 204
196 C 203
197 U 202
198 U 0
199 A 0
200 G 0
201 A 0
202 A 197
203 G 196
204 C 195
205 G 0
206 C 139
207 C 138
208 G 137
209 G 136
210 G 135
211 A 134
212 G 133
213 A 0
214 G 0
215 G 129
216 G 128
217 G 126
218 U 125
219 C 124
220 U 123
221 A 122
222 C 121
223 G 120
224 A 119
225 C 271
226 C 270
227 C 269
228 A 0
229 U 0
230 C 268
231 A 0
232 G 262
233 G 261
234 U 260
235 A 0
236 G 0
237 U 259
238 U 258
239 G 257
240 G 256
241 U 255
242 A 254
243 G 253
244 G 252
245 G 0
246 U 0
247 A 0
248 A 0
249 G 0
250 A 0
251 G 0
252 C 244
253 C 243
254 U 242
255 A 241
256 C 240
257 C 239
258 N 238
259 A 237
260 G 234
261 C 233
262 C 232
263 G 0
264 A 0
265 C 0
266 G 0
267 A 0
268 C 230
269 G 227
270 G 226
271 G 225
272 U 0
273 A 0
274 G 296
275 C 295
276 C 294
277 G 293
278 A 289
279 U 288
280 G 287
281 U 286
282 G 0
283 A 0
284 G 0
285 A 0
286 G 281
287 C 280
288 A 279
289 U 278
290 G 0
291 A 0
292 U 0
293 C 277
294 G 276
295 G 275
296 C 274
297 C 112
298 A 111
299 C 110
300 A 0
301 A 322
302 G 321
303 G 320
304 G 319
305 A 318
306 A 317
307 C 0
308 U 0
309 G 0
310 A 0
311 G 0
312 A 0
313 C 0
314 A 0
315 C 0
316 G 0
317 G 306
318 U 305
319 U 304
320 C 303
321 C 302
322 U 301
323 A 0
324 C 335
325 U 334
326 C 333
327 C 332
328 U 0
329 A 0
330 C 0
331 G 0
332 G 327
333 G 326
334 A 325
335 G 324
336 G 0
337 C 0
338 A 0
339 G 58
340 C 57
341 A 56
342 G 54
343 U 53
344 G 52
345 G 0
346 G 47
347 G 0
348 A 0
349 A 0
350 U 0
351 U 0
352 U 378
353 U 0
354 G 377
355 G 376
356 A 375
357 C 0
358 A 0
359 A 0
360 U 373
361 G 372
362 C 371
363 A 370
364 C 369
365 G 0
366 G 0
367 A 0
368 A 0
369 G 364
370 U 363
371 G 362
372 U 361
373 G 360
374 A 0
375 U 356
376 C 355
377 C 354
378 A 352
379 G 0
380 C 46
381 G 45
382 A 0
383 C 44
384 G 43
385 C 42
386 C 41
387 G 40
388 C 39
389 G 0
390 U 0
391 G 421
392 A 420
393 A 419
394 G 418
395 G 0
396 A 0
397 A 0
398 G 0
399 A 0
400 A 0
401 G 412
402 U 411
403 C 410
404 C 409
405 U 0
406 U 0
407 C 0
408 G 0
409 G 404
410 G 403
411 A 402
412 U 401
413 G 0
414 U 0
415 A 0
416 A 0
417 A 0
418 C 394
419 U 393
420 U 392
421 C 391
422 U 0
423 G 475
424 A 0
425 A 0
426 C 472
427 U 471
428 U 470
429 A 469
430 C 468
431 A 467
432 G 0
433 A 0
434 A 0
435 U 462
436 A 0
437 A 0
438 C 0
439 A 0
440 G 0
441 C 456
442 A 455
443 U 454
444 A 453
445 A 452
446 G 451
447 G 0
448 G 0
449 G 0
450 A 0
451 C 446
452 U 445
453 U 444
454 A 443
455 U 442
456 G 441
457 U 0
458 A 0
459 U 0
460 G 0
461 A 0
462 A 435
463 G 0
464 G 0
465 U 0
466 A 0
467 A 431
468 G 430
469 U 429
470 A 428
471 A 427
472 G 426
473 G 0
474 A 0
475 A 423
476 A 0
477 A 0
478 G 523
479 C 522
480 C 521
481 C 520
482 C 519
483 G 504
484 G 503
485 C 502
486 U 0
487 A 0
488 A 0
489 C 518
490 U 517
491 A 516
492 C 515
493 G 514
494 U 0
495 G 0
496 C 0
497 C 0
498 A 0
499 G 506
500 C 505
501 A 0
502 G 485
503 C 484
504 C 483
505 G 500
506 C 499
507 G 0
508 G 0
509 U 0
510 A 0
511 A 0
512 G 0
513 A 0
514 C 493
515 G 492
516 U 491
517 A 490
518 G 489
519 G 482
520 G 481
521 G 480
522 G 479
523 C 478
524 G 0
525 A 37
526 G 36
527 C 35
528 G 34
529 U 33
530 U 32
531 G 30
532 C 29
533 C 28
534 C 27
535 G 0
536 G 0
537 A 0
538 A 0
539 U 0
540 C 0
541 A 0
542 C 0
543 U 0
544 G 0
545 G 858
546 G 857
547 C 856
548 G 841
549 U 840
550 A 0
551 A 0
552 A 0
553 G 855
554 G 0
555 G 742
556 G 741
557 G 740
558 C 739
559 G 0
560 U 736
561 A 0
562 G 735
563 G 734
564 C 733
565 G 0
566 G 629
567 U 628
568 C 627
569 U 626
570 C 625
571 A 624
572 U 623
573 A 0
574 A 622
575 G 621
576 U 618
577 C 617
578 A 616
579 G 615
580 G 614
581 U 613
582 G 612
583 U 611
584 G 610
585 A 0
586 A 0
587 A 0
588 U 0
589 G 607
590 U 606
591 C 605
592 A 604
593 C 603
594 U 602
595 G 601
596 C 0
597 U 0
598 C 0
599 A 0
600 A 0
601 C 595
602 G 594
603 G 593
604 U 592
605 G 591
606 U 590
607 C 589
608 A 0
609 G 0
610 U 584
611 G 583
612 C 582
613 G 581
614 C 580
615 A 579
616 U 578
617 G 577
618 A 576
619 A 0
620 A 0
621 C 575
622 U 574
623 G 572
624 U 571
625 G 570
626 A 569
627 G 568
628 A 567
629 C 566
630 U 0
631 U 0
632 G 0
633 A 729
634 G 728
635 G 727
636 G 726
637 U 724
638 A 723
639 C 722
640 C 721
641 A 720
642 G 0
643 A 0
644 G 718
645 G 717
646 U 716
647 A 715
648 G 714
649 A 713
650 C 712
651 A 695
652 G 694
653 A 0
654 A 0
655 U 691
656 U 690
657 A 689
658 C 688
659 C 687
660 U 686
661 G 685
662 A 684
663 G 0
664 U 0
665 A 0
666 G 677
667 G 676
668 G 675
669 G 0
670 U 0
671 G 0
672 A 0
673 A 0
674 A 0
675 U 668
676 C 667
677 C 666
678 G 0
679 U 0
680 A 0
681 G 0
682 A 0
683 U 0
684 A 662
685 C 661
686 A 660
687 G 659
688 G 658
689 U 657
690 A 656
691 A 655
692 G 0
693 A 0
694 A 652
695 U 651
696 G 0
697 C 0
698 C 0
699 A 0
700 G 711
701 U 0
702 G 0
703 G 710
704 G 709
705 G 0
706 A 0
707 A 0
708 G 0
709 C 704
710 C 703
711 G 700
712 G 650
713 U 649
714 C 648
715 U 647
716 A 646
717 C 645
718 U 644
719 G 0
720 G 641
721 G 640
722 G 639
723 U 638
724 G 637
725 A 0
726 C 636
727 C 635
728 C 634
729 U 633
730 G 0
731 A 0
732 C 0
733 G 564
734 C 563
735 U 562
736 G 560
737 A 0
738 G 0
739 G 558
740 C 557
741 C 556
742 C 555
743 G 0
744 A 0
745 A 0
746 A 0
747 G 788
748 C 787
749 U 786
750 A 785
751 G 784
752 G 783
753 G 0
754 U 0
755 A 0
756 G 782
757 C 781
758 A 0
759 A 0
760 A 0
761 C 777
762 C 776
763 G 775
764 G 774
765 A 0
766 U 0
767 U 0
768 A 0
769 G 0
770 A 0
771 U 0
772 A 0
773 C 0
774 C 764
775 C 763
776 G 762
777 G 761
778 G 0
779 U 0
780 A 0
781 G 757
782 U 756
783 C 752
784 C 751
785 U 750
786 A 749
787 G 748
788 C 747
789 A 0
790 G 0
791 U 0
792 A 0
793 A 0
794 A 0
795 C 0
796 G 0
797 A 0
798 U 0
799 G 854
800 C 853
801 U 852
802 C 851
803 A 850
804 C 849
805 U 0
806 A 0
807 G 832
808 G 831
809 U 830
810 G 829
811 U 828
812 G 827
813 G 826
814 G 825
815 G 824
816 C 823
817 A 0
818 A 0
819 G 0
820 A 0
821 A 0
822 A 0
823 G 816
824 C 815
825 U 814
826 C 813
827 C 812
828 G 811
829 U 810
830 G 809
831 C 808
832 U 807
833 G 0
834 A 0
835 A 0
836 G 843
837 C 842
838 A 0
839 A 0
840 A 549
841 C 548
842 G 837
843 C 836
844 G 0
845 A 0
846 U 0
847 A 0
848 A 0
849 G 804
850 U 803
851 G 802
852 A 801
853 G 800
854 C 799
855 C 553
856 G 547
857 C 546
858 C 545
859 U 0
860 G 887
861 G 886
862 G 885
863 G 0
864 A 0
865 G 0
866 U 0
867 A 0
868 C 0
869 G 880
870 C 879
871 C 878
872 C 877
873 G 0
874 C 0
875 A 0
876 A 0
877 G 872
878 G 871
879 G 870
880 U 869
881 G 0
882 A 0
883 A 0
884 A 0
885 C 862
886 U 861
887 C 860
888 A 0
889 A 0
890 A 0
891 G 19
892 G 18
893 A 17
894 A 0
895 U 0
896 U 1380
897 G 1379
898 A 1377
899 C 1376
900 G 1375
901 G 0
902 G 1374
903 G 1373
904 G 1372
905 U 1371
906 C 1370
907 C 1369
908 G 1368
909 C 0
910 A 1364
911 C 1363
912 A 0
913 A 0
914 G 1327
915 C 1326
916 G 1325
917 G 1324
918 U 1323
919 G 1220
920 G 1219
921 A 1218
922 G 1217
923 C 1216
924 A 1215
925 U 1214
926 G 1213
927 U 1212
928 G 1211
929 G 1209
930 U 1208
931 U 0
932 U 0
933 A 0
934 A 0
935 U 950
936 U 949
937 C 948
938 G 947
939 A 0
940 A 0
941 G 0
942 C 0
943 A 0
944 A 0
945 A 0
946 C 0
947 C 938
948 G 937
949 A 936
950 A 935
951 G 0
952 A 0
953 A 0
954 C 0
955 C 0
956 U 0
957 U 0
958 A 0
959 C 1204
960 C 1203
961 A 1202
962 G 1201
963 G 1200
964 G 1199
965 C 1198
966 U 0
967 U 0
968 G 0
969 A 0
970 C 0
971 A 1028
972 U 1027
973 G 1026
974 G 1024
975 A 1023
976 G 1022
977 A 1021
978 U 1020
979 A 0
980 A 0
981 G 998
982 G 997
983 C 996
984 A 995
985 U 994
986 A 993
987 A 992
988 G 0
989 A 0
990 A 0
991 A 0
992 U 987
993 U 986
994 A 985
995 U 984
996 G 983
997 U 982
998 C 981
999 A 0
1000 A 0
1001 C 1018
1002 C 1017
1003 U 1016
1004 G 1015
1005 U 1014
1006 A 1013
1007 U 1012
1008 G 0
1009 U 0
1010 A 0
1011 A 0
1012 A 1007
1013 U 1006
1014 A 1005
1015 U 1004
1016 A 1003
1017 G 1002
1018 G 1001
1019 A 0
1020 G 978
1021 U 977
1022 C 976
1023 U 975
1024 C 974
1025 A 0
1026 C 973
1027 A 972
1028 C 971
1029 A 0
1030 G 1193
1031 G 1192
1032 U 0
1033 G 1191
1034 G 1190
1035 U 1189
1036 G 1188
1037 C 0
1038 A 0
1039 C 1187
1040 G 1186
1041 G 1182
1042 C 1181
1043 C 1180
1044 G 1178
1045 U 1177
1046 C 1176
1047 G 1175
1048 U 0
1049 C 0
1050 A 0
1051 G 1090
1052 C 1089
1053 U 1088
1054 C 1087
1055 G 1086
1056 U 1085
1057 G 1066
1058 C 1065
1059 C 1064
1060 G 0
1061 U 0
1062 G 0
1063 A 0
1064 G 1059
1065 G 1058
1066 U 1057
1067 G 0
1068 U 0
1069 U 1082
1070 G 1081
1071 G 1080
1072 G 1079
1073 U 0
1074 U 0
1075 A 0
1076 A 0
1077 G 0
1078 U 0
1079 C 1072
1080 C 1071
1081 C 1070
1082 A 1069
1083 C 0
1084 A 0
1085 A 1056
1086 C 1055
1087 G 1054
1088 A 1053
1089 G 1052
1090 C 1051
1091 G 0
1092 C 0
1093 A 0
1094 A 0
1095 C 0
1096 C 1170
1097 C 1169
1098 C 1168
1099 U 1167
1100 A 0
1101 U 1138
1102 U 1137
1103 G 1136
1104 U 1135
1105 U 1134
1106 A 1133
1107 G 1132
1108 U 0
1109 U 0
1110 G 0
1111 C 1127
1112 C 1126
1113 A 0
1114 U 1125
1115 C 1124
1116 A 1123
1117 U 0
1118 U 0
1119 A 0
1120 A 0
1121 G 0
1122 U 0
1123 U 1116
1124 G 1115
1125 G 1114
1126 G 1112
1127 C 1111
1128 U 0
1129 A 0
1130 C 0
1131 U 0
1132 C 1107
1133 U 1106
1134 A 1105
1135 G 1104
1136 C 1103
1137 G 1102
1138 A 1101
1139 G 0
1140 A 0
1141 C 1161
1142 A 1160
1143 G 1159
1144 C 1158
1145 C 1157
1146 G 1156
1147 U 1155
1148 C 1154
1149 G 0
1150 A 0
1151 C 0
1152 G 0
1153 A 0
1154 G 1148
1155 A 1147
1156 C 1146
1157 G 1145
1158 G 1144
1159 A 1143
1160 G 1142
1161 G 1141
1162 A 0
1163 A 0
1164 G 0
1165 G 0
1166 A 0
1167 G 1099
1168 G 1098
1169 G 1097
1170 G 1096
1171 A 0
1172 U 0
1173 G 0
1174 A 0
1175 C 1047
1176 G 1046
1177 U 1045
1178 C 1044
1179 A 0
1180 G 1043
1181 G 1042
1182 U 1041
1183 A 0
1184 A 0
1185 G 0
1186 C 1040
1187 G 1039
1188 U 1036
1189 G 1035
1190 C 1034
1191 C 1033
1192 C 1031
1193 C 1030
1194 U 0
1195 U 0
1196 A 0
1197 U 0
1198 G 965
1199 C 964
1200 U 963
1201 C 962
1202 U 961
1203 G 960
1204 G 959
1205 G 0
1206 C 0
1207 G 0
1208 A 930
1209 C 929
1210 A 0
1211 C 928
1212 A 927
1213 C 926
1214 G 925
1215 U 924
1216 G 923
1217 C 922
1218 U 921
1219 A 920
1220 C 919
1221 A 0
1222 A 0
1223 U 0
1224 G 1279
1225 G 1278
1226 U 1277
1227 G 1276
1228 A 1275
1229 G 1274
1230 G 1273
1231 G 0
1232 C 0
1233 A 0
1234 A 0
1235 A 0
1236 A 1267
1237 G 1266
1238 G 1265
1239 C 0
1240 A 0
1241 G 1260
1242 C 1259
1243 G 0
1244 A 0
1245 A 0
1246 G 1255
1247 C 1254
1248 C 1253
1249 G 0
1250 C 0
1251 G 0
1252 A 0
1253 G 1248
1254 G 1247
1255 U 1246
1256 A 0
1257 G 0
1258 A 0
1259 G 1242
1260 C 1241
1261 G 0
1262 A 0
1263 A 0
1264 U 0
1265 C 1238
1266 C 1237
1267 U 1236
1268 A 0
1269 U 0
1270 A 0
1271 A 0
1272 A 0
1273 C 1230
1274 C 1229
1275 U 1228
1276 C 1227
1277 A 1226
1278 U 1225
1279 C 1224
1280 G 0
1281 U 0
1282 A 0
1283 A 0
1284 U 0
1285 U 0
1286 C 1317
1287 G 0
1288 G 0
1289 A 0
1290 U 1313
1291 U 1312
1292 G 1311
1293 C 1310
1294 A 1309
1295 G 1308
1296 G 1307
1297 C 1306
1298 U 0
1299 G 0
1300 A 0
1301 A 0
1302 A 0
1303 C 0
1304 C 0
1305 C 0
1306 G 1297
1307 C 1296
1308 C 1295
1309 U 1294
1310 G 1293
1311 C 1292
1312 A 1291
1313 U 1290
1314 G 0
1315 A 0
1316 A 0
1317 A 1286
1318 C 0
1319 C 0
1320 G 0
1321 G 0
1322 A 0
1323 A 918
1324 U 917
1325 C 916
1326 G 915
1327 C 914
1328 U 0
1329 A 0
1330 G 0
1331 U 0
1332 A 0
1333 A 1356
1334 U 1355
1335 C 1354
1336 G 1353
1337 C 1352
1338 A 1351
1339 G 1350
1340 G 1349
1341 U 0
1342 C 0
1343 A 0
1344 G 0
1345 C 0
1346 C 0
1347 A 0
1348 A 0
1349 A 1340
1350 C 1339
1351 U 1338
1352 G 1337
1353 C 1336
1354 G 1335
1355 G 1334
1356 U 1333
1357 G 0
1358 A 0
1359 A 0
1360 U 0
1361 A 0
1362 C 0
1363 G 911
1364 U 910
1365 U 0
1366 C 0
1367 C 0
1368 C 908
1369 G 907
1370 G 906
1371 G 905
1372 C 904
1373 C 903
1374 U 902
1375 U 900
1376 G 899
1377 U 898
1378 A 0
1379 C 897
1380 A 896
1381 C 0
1382 A 0
1383 C 1490
1384 C 0
1385 G 1487
1386 C 1486
1387 C 0
1388 C 1483
1389 G 1482
1390 U 0
1391 C 0
1392 A 0
1393 C 1477
1394 G 1476
1395 C 1475
1396 C 1474
1397 A 1473
1398 C 1472
1399 C 1471
1400 C 1470
1401 G 0
1402 A 0
1403 G 1467
1404 U 1466
1405 U 1465
1406 G 1464
1407 G 1463
1408 A 1462
1409 G 1461
1410 A 1460
1411 C 1459
1412 A 1458
1413 C 1457
1414 C 1456
1415 U 0
1416 G 0
1417 A 0
1418 A 0
1419 A 1452
1420 A 1451
1421 G 1450
1422 G 1449
1423 G 1448
1424 A 1447
1425 A 1446
1426 G 0
1427 A 1445
1428 A 1444
1429 G 1443
1430 U 1442
1431 A 0
1432 A 0
1433 C 1441
1434 C 1440
1435 G 0
1436 A 0
1437 A 0
1438 A 0
1439 N 0
1440 G 1434
1441 G 1433
1442 G 1430
1443 C 1429
1444 U 1428
1445 A 1427
1446 A 1425
1447 U 1424
1448 C 1423
1449 U 1422
1450 C 1421
1451 U 1420
1452 U 1419
1453 C 0
1454 A 0
1455 G 0
1456 G 1414
1457 G 1413
1458 U 1412
1459 G 1411
1460 G 1410
1461 A 1409
1462 G 1408
1463 C 1407
1464 U 1406
1465 A 1405
1466 G 1404
1467 C 1403
1468 G 0
1469 A 0
1470 G 1400
1471 G 1399
1472 G 1398
1473 G 1397
1474 G 1396
1475 G 1395
1476 C 1394
1477 G 1393
1478 A 0
1479 A 0
1480 G 0
1481 U 0
1482 C 1389
1483 G 1388
1484 U 0
1485 A 0
1486 A 1386
1487 C 1385
1488 A 0
1489 A 0
1490 G 1383
1491 G 0
1492 U 1515
1493 A 1514
1494 G 1513
1495 G 1512
1496 U 1511
1497 G 1510
1498 U 1509
1499 A 1508
1500 C 1507
1501 C 1506
1502 G 0
1503 G 0
1504 A 0
1505 A 0
1506 G 1501
1507 G 1500
1508 U 1499
1509 G 1498
1510 C 1497
1511 G 1496
1512 C 1495
1513 C 1494
1514 U 1493
1515 G 1492
1516 G 0
1517 A 0
1518 U 0
1519 C 0
1520 A 0
1521 C 0
1522 C 0
1523 U 0
1524 C 0
1525 C 0
1526 U 0
1527 U 0
1528 U 0
1529 C 0
1530 U 0