Filename: d.16.b.H.influenzae7.bpseq Organism: Haemophilus influenzae Accession Number: X87977 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 N 0 3 N 0 4 N 0 5 N 0 6 N 0 7 N 0 8 N 24 9 N 23 10 N 22 11 N 21 12 N 20 13 N 0 14 N 0 15 N 0 16 N 915 17 N 914 18 N 913 19 N 0 20 N 12 21 N 11 22 N 10 23 N 9 24 N 8 25 N 0 26 N 555 27 N 554 28 U 553 29 U 552 30 G 0 31 A 551 32 A 550 33 C 549 34 G 548 35 C 547 36 U 546 37 G 0 38 G 402 39 C 401 40 G 400 41 G 399 42 C 398 43 A 397 44 G 395 45 G 394 46 C 360 47 U 0 48 U 0 49 A 0 50 A 0 51 C 358 52 A 357 53 C 356 54 A 0 55 U 355 56 G 354 57 C 353 58 A 0 59 A 0 60 G 105 61 U 104 62 C 103 63 G 0 64 A 0 65 A 102 66 C 101 67 G 100 68 G 98 69 U 97 70 A 0 71 G 0 72 C 96 73 A 95 74 G 94 75 G 92 76 A 91 77 G 90 78 A 89 79 A 88 80 A 87 81 G 86 82 C 0 83 U 0 84 U 0 85 G 0 86 C 81 87 U 80 88 U 79 89 U 78 90 C 77 91 U 76 92 U 75 93 G 0 94 C 74 95 U 73 96 G 72 97 A 69 98 C 68 99 G 0 100 A 67 101 G 66 102 U 65 103 G 62 104 G 61 105 C 60 106 G 0 107 G 0 108 A 0 109 C 0 110 G 0 111 G 0 112 G 313 113 U 312 114 G 311 115 A 0 116 G 0 117 U 0 118 A 0 119 A 0 120 U 0 121 G 238 122 C 237 123 U 236 124 U 235 125 G 234 126 G 233 127 G 232 128 A 231 129 A 0 130 U 230 131 C 229 132 U 0 133 G 0 134 G 0 135 C 226 136 U 225 137 U 224 138 A 223 139 U 222 140 G 221 141 G 220 142 A 0 143 G 177 144 G 176 145 G 175 146 G 174 147 G 0 148 A 0 149 U 0 150 A 0 151 A 168 152 C 167 153 G 166 154 A 165 155 C 164 156 G 163 157 G 162 158 G 0 159 A 0 160 A 0 161 A 0 162 C 157 163 U 156 164 G 155 165 U 154 166 C 153 167 G 152 168 C 151 169 U 0 170 A 0 171 A 0 172 U 0 173 A 0 174 C 146 175 C 145 176 G 144 177 C 143 178 G 0 179 U 0 180 A 0 181 U 0 182 U 0 183 A 192 184 U 191 185 C 190 186 G 0 187 G 0 188 A 0 189 A 0 190 G 185 191 A 184 192 U 183 193 G 0 194 A 0 195 A 0 196 A 0 197 G 218 198 U 217 199 G 216 200 C 215 201 G 214 202 G 213 203 G 0 204 A 0 205 C 212 206 U 211 207 G 0 208 A 0 209 G 0 210 A 0 211 G 206 212 G 205 213 C 202 214 C 201 215 G 200 216 C 199 217 A 198 218 U 197 219 G 0 220 C 141 221 C 140 222 A 139 223 U 138 224 A 137 225 G 136 226 G 135 227 A 0 228 U 0 229 G 131 230 A 130 231 G 128 232 C 127 233 C 126 234 C 125 235 A 124 236 A 123 237 G 122 238 U 121 239 G 285 240 G 284 241 G 283 242 A 0 243 U 0 244 U 282 245 A 0 246 G 276 247 G 275 248 U 274 249 A 0 250 G 0 251 U 273 252 U 272 253 G 271 254 G 270 255 U 269 256 G 268 257 G 267 258 G 266 259 G 0 260 U 0 261 A 0 262 A 0 263 A 0 264 U 0 265 G 0 266 C 258 267 C 257 268 U 256 269 A 255 270 C 254 271 C 253 272 A 252 273 A 251 274 G 248 275 C 247 276 C 246 277 U 0 278 G 0 279 C 0 280 G 0 281 A 0 282 U 244 283 C 241 284 U 240 285 C 239 286 U 0 287 A 0 288 G 310 289 C 309 290 U 308 291 G 307 292 G 303 293 U 302 294 C 301 295 U 300 296 G 0 297 A 0 298 G 0 299 A 0 300 G 295 301 G 294 302 A 293 303 U 292 304 G 0 305 A 0 306 C 0 307 C 291 308 A 290 309 G 289 310 C 288 311 C 114 312 A 113 313 C 112 314 A 0 315 C 336 316 U 335 317 G 334 318 G 333 319 A 332 320 A 331 321 C 0 322 U 0 323 G 0 324 A 0 325 G 0 326 A 0 327 C 0 328 A 0 329 C 0 330 G 0 331 G 320 332 U 319 333 C 318 334 C 317 335 A 316 336 G 315 337 A 0 338 C 349 339 U 348 340 C 347 341 C 346 342 U 0 343 A 0 344 C 0 345 G 0 346 G 341 347 G 340 348 A 339 349 G 338 350 G 0 351 C 0 352 A 0 353 G 57 354 C 56 355 A 55 356 G 53 357 U 52 358 G 51 359 G 0 360 G 46 361 G 0 362 A 0 363 A 0 364 U 0 365 A 0 366 U 392 367 U 0 368 G 391 369 C 390 370 G 389 371 C 0 372 A 0 373 A 0 374 U 387 375 G 386 376 G 385 377 G 384 378 G 383 379 G 0 380 G 0 381 A 0 382 A 0 383 C 378 384 C 377 385 C 376 386 U 375 387 G 374 388 A 0 389 C 370 390 G 369 391 C 368 392 A 366 393 G 0 394 C 45 395 C 44 396 A 0 397 U 43 398 G 42 399 C 41 400 C 40 401 G 39 402 C 38 403 G 0 404 U 0 405 G 435 406 A 434 407 A 433 408 U 432 409 G 0 410 A 0 411 A 0 412 G 0 413 A 0 414 A 0 415 G 426 416 G 425 417 C 424 418 C 423 419 U 0 420 U 0 421 C 0 422 G 0 423 G 418 424 G 417 425 U 416 426 U 415 427 G 0 428 U 0 429 A 0 430 A 0 431 A 0 432 G 408 433 U 407 434 U 406 435 C 405 436 U 0 437 U 495 438 U 0 439 C 0 440 G 492 441 G 491 442 U 490 443 A 489 444 U 488 445 U 487 446 G 0 447 A 0 448 G 0 449 G 482 450 A 0 451 A 0 452 G 0 453 G 0 454 U 476 455 U 475 456 G 474 457 A 473 458 U 472 459 G 471 460 U 470 461 G 469 462 U 0 463 U 0 464 A 0 465 A 0 466 U 0 467 A 0 468 G 0 469 U 461 470 A 460 471 C 459 472 A 458 473 U 457 474 C 456 475 A 455 476 A 454 477 A 0 478 U 0 479 U 0 480 G 0 481 A 0 482 C 449 483 G 0 484 U 0 485 U 0 486 A 0 487 A 445 488 A 444 489 U 443 490 A 442 491 C 441 492 A 440 493 G 0 494 A 0 495 A 437 496 G 0 497 A 0 498 A 0 499 G 544 500 C 543 501 A 542 502 C 541 503 C 540 504 G 0 505 G 0 506 C 0 507 U 0 508 A 0 509 A 0 510 C 539 511 U 538 512 C 537 513 C 536 514 G 535 515 U 0 516 G 0 517 C 0 518 C 0 519 A 0 520 G 527 521 C 526 522 A 0 523 G 0 524 C 0 525 C 0 526 G 521 527 C 520 528 G 0 529 G 0 530 U 0 531 A 0 532 A 0 533 U 0 534 A 0 535 C 514 536 G 513 537 G 512 538 A 511 539 G 510 540 G 503 541 G 502 542 U 501 543 G 500 544 C 499 545 G 0 546 A 36 547 G 35 548 C 34 549 G 33 550 U 32 551 U 31 552 A 29 553 A 28 554 U 27 555 C 26 556 G 0 557 G 0 558 A 0 559 A 0 560 U 0 561 A 0 562 A 0 563 C 0 564 U 0 565 G 0 566 G 880 567 G 879 568 C 878 569 G 0 570 U 0 571 A 0 572 A 0 573 A 0 574 G 0 575 G 0 576 G 763 577 C 762 578 A 761 579 C 760 580 G 0 581 C 757 582 A 0 583 G 756 584 G 755 585 C 754 586 G 0 587 G 650 588 U 649 589 U 648 590 A 647 591 U 646 592 U 645 593 U 644 594 A 0 595 A 643 596 G 642 597 U 639 598 G 638 599 A 637 600 G 636 601 G 635 602 U 634 603 G 633 604 U 632 605 G 631 606 A 0 607 A 0 608 A 0 609 G 0 610 C 628 611 C 627 612 C 626 613 U 625 614 G 624 615 G 623 616 G 622 617 C 0 618 U 0 619 U 0 620 A 0 621 A 0 622 C 616 623 C 615 624 U 614 625 A 613 626 G 612 627 G 611 628 A 610 629 A 0 630 U 0 631 U 605 632 G 604 633 C 603 634 A 602 635 U 601 636 U 600 637 U 599 638 C 598 639 A 597 640 G 0 641 A 0 642 C 596 643 U 595 644 G 593 645 G 592 646 G 591 647 U 590 648 A 589 649 A 588 650 C 587 651 U 0 652 A 0 653 G 0 654 A 750 655 G 749 656 U 748 657 A 747 658 C 746 659 U 744 660 U 743 661 U 742 662 A 741 663 G 0 664 G 0 665 G 739 666 A 738 667 G 737 668 G 736 669 G 735 670 G 734 671 U 733 672 A 716 673 G 715 674 A 0 675 A 0 676 U 712 677 U 711 678 C 710 679 C 709 680 A 708 681 C 707 682 G 706 683 U 705 684 G 0 685 U 0 686 A 0 687 G 698 688 C 697 689 G 696 690 G 0 691 U 0 692 G 0 693 A 0 694 A 0 695 A 0 696 U 689 697 G 688 698 C 687 699 G 0 700 U 0 701 A 0 702 G 0 703 A 0 704 G 0 705 A 683 706 U 682 707 G 681 708 U 680 709 G 679 710 G 678 711 A 677 712 G 676 713 G 0 714 A 0 715 A 673 716 U 672 717 A 0 718 C 0 719 C 0 720 G 0 721 A 732 722 A 0 723 G 0 724 G 731 725 C 730 726 G 0 727 A 0 728 A 0 729 G 0 730 G 725 731 C 724 732 A 721 733 G 671 734 C 670 735 C 669 736 C 668 737 C 667 738 U 666 739 U 665 740 G 0 741 G 662 742 G 661 743 A 660 744 A 659 745 U 0 746 G 658 747 U 657 748 A 656 749 C 655 750 U 654 751 G 0 752 A 0 753 C 0 754 G 585 755 C 584 756 U 583 757 C 581 758 A 0 759 U 0 760 G 579 761 U 578 762 G 577 763 C 576 764 G 0 765 A 0 766 A 0 767 A 0 768 G 809 769 C 808 770 G 807 771 U 806 772 G 805 773 G 804 774 G 0 775 G 0 776 A 0 777 G 803 778 C 802 779 A 0 780 A 0 781 A 0 782 C 798 783 A 797 784 G 796 785 G 795 786 A 0 787 U 0 788 U 0 789 A 0 790 G 0 791 A 0 792 U 0 793 A 0 794 C 0 795 C 785 796 C 784 797 U 783 798 G 782 799 G 0 800 U 0 801 A 0 802 G 778 803 U 777 804 C 773 805 C 772 806 A 771 807 C 770 808 G 769 809 C 768 810 U 0 811 G 0 812 U 0 813 A 0 814 A 0 815 A 0 816 C 0 817 G 0 818 C 0 819 U 0 820 G 876 821 U 875 822 C 874 823 G 873 824 A 872 825 U 871 826 U 0 827 U 0 828 G 854 829 G 853 830 G 852 831 G 851 832 A 850 833 U 849 834 U 848 835 G 847 836 G 846 837 G 845 838 C 844 839 U 843 840 U 0 841 A 0 842 G 0 843 A 839 844 G 838 845 C 837 846 U 836 847 U 835 848 G 834 849 G 833 850 U 832 851 G 831 852 C 830 853 C 829 854 C 828 855 G 0 856 U 0 857 A 0 858 G 865 859 C 864 860 U 0 861 A 0 862 A 0 863 C 0 864 G 859 865 U 858 866 G 0 867 A 0 868 U 0 869 A 0 870 A 0 871 A 825 872 U 824 873 C 823 874 G 822 875 A 821 876 C 820 877 C 0 878 G 568 879 C 567 880 C 566 881 U 0 882 G 909 883 G 908 884 G 907 885 G 0 886 A 0 887 G 0 888 U 0 889 A 0 890 C 0 891 G 902 892 G 901 893 C 900 894 C 899 895 G 0 896 C 0 897 A 0 898 A 0 899 G 894 900 G 893 901 U 892 902 U 891 903 A 0 904 A 0 905 A 0 906 A 0 907 C 884 908 U 883 909 C 882 910 A 0 911 A 0 912 A 0 913 U 18 914 G 17 915 A 16 916 A 0 917 U 0 918 U 1393 919 G 1392 920 A 1390 921 C 1389 922 G 1388 923 G 0 924 G 1387 925 G 1386 926 G 1385 927 N 1384 928 C 1383 929 C 1382 930 G 1381 931 C 0 932 A 1377 933 C 1376 934 A 0 935 A 0 936 G 1341 937 C 1340 938 G 1339 939 G 1338 940 U 1337 941 G 1234 942 G 1233 943 A 1232 944 G 1231 945 C 1230 946 A 1229 947 U 1228 948 G 1227 949 U 1226 950 G 1225 951 G 1223 952 U 1222 953 U 0 954 U 0 955 A 0 956 A 0 957 U 972 958 U 971 959 C 970 960 G 969 961 A 0 962 U 0 963 G 0 964 C 0 965 A 0 966 A 0 967 C 0 968 G 0 969 C 960 970 G 959 971 A 958 972 A 957 973 G 0 974 A 0 975 A 0 976 C 0 977 C 0 978 U 0 979 U 0 980 A 0 981 C 1218 982 C 1217 983 U 1216 984 A 1215 985 C 1214 986 U 1213 987 C 1212 988 U 0 989 U 0 990 G 0 991 A 0 992 C 0 993 A 1042 994 U 1041 995 C 1040 996 C 1038 997 U 1037 998 A 1036 999 A 1035 1000 G 1034 1001 A 0 1002 A 0 1003 G 1020 1004 A 1019 1005 G 1018 1006 C 1017 1007 U 1016 1008 C 1015 1009 A 1014 1010 G 0 1011 A 0 1012 G 0 1013 A 0 1014 U 1009 1015 G 1008 1016 A 1007 1017 G 1006 1018 C 1005 1019 U 1004 1020 U 1003 1021 G 0 1022 U 1033 1023 G 1032 1024 C 1031 1025 C 1030 1026 U 0 1027 U 0 1028 C 0 1029 G 0 1030 G 1025 1031 G 1024 1032 A 1023 1033 A 1022 1034 C 1000 1035 U 999 1036 U 998 1037 A 997 1038 G 996 1039 A 0 1040 G 995 1041 A 994 1042 C 993 1043 A 0 1044 G 1207 1045 G 1206 1046 U 0 1047 G 1205 1048 C 1204 1049 U 1203 1050 G 1202 1051 C 0 1052 A 0 1053 U 1201 1054 G 1200 1055 G 1196 1056 C 1195 1057 U 1194 1058 G 1192 1059 U 1191 1060 C 1190 1061 G 1189 1062 U 0 1063 C 0 1064 A 0 1065 G 1104 1066 C 1103 1067 U 1102 1068 C 1101 1069 G 1100 1070 U 1099 1071 G 1080 1072 U 1079 1073 U 1078 1074 G 0 1075 U 0 1076 G 0 1077 A 0 1078 A 1073 1079 A 1072 1080 U 1071 1081 G 0 1082 U 0 1083 U 1096 1084 G 1095 1085 G 1094 1086 G 1093 1087 U 0 1088 U 0 1089 A 0 1090 A 0 1091 G 0 1092 U 0 1093 C 1086 1094 C 1085 1095 C 1084 1096 G 1083 1097 C 0 1098 A 0 1099 A 1070 1100 C 1069 1101 G 1068 1102 A 1067 1103 G 1066 1104 C 1065 1105 G 0 1106 C 0 1107 A 0 1108 A 0 1109 C 0 1110 C 1184 1111 C 1183 1112 U 1182 1113 U 1181 1114 A 0 1115 U 1152 1116 C 1151 1117 C 1150 1118 U 1149 1119 U 1148 1120 U 1147 1121 G 1146 1122 U 0 1123 U 0 1124 G 0 1125 C 1141 1126 C 1140 1127 A 0 1128 G 0 1129 C 1139 1130 G 1138 1131 A 1137 1132 C 0 1133 U 0 1134 U 0 1135 G 0 1136 G 0 1137 U 1131 1138 C 1130 1139 G 1129 1140 G 1126 1141 G 1125 1142 A 0 1143 A 0 1144 C 0 1145 U 0 1146 C 1121 1147 A 1120 1148 A 1119 1149 A 1118 1150 G 1117 1151 G 1116 1152 A 1115 1153 G 0 1154 A 0 1155 C 1175 1156 U 1174 1157 G 1173 1158 C 1172 1159 C 1171 1160 A 1170 1161 G 1169 1162 U 1168 1163 G 0 1164 A 0 1165 U 0 1166 A 0 1167 A 0 1168 A 1162 1169 C 1161 1170 U 1160 1171 G 1159 1172 G 1158 1173 A 1157 1174 G 1156 1175 G 1155 1176 A 0 1177 A 0 1178 G 0 1179 G 0 1180 U 0 1181 G 1113 1182 G 1112 1183 G 1111 1184 G 1110 1185 A 0 1186 U 0 1187 G 0 1188 A 0 1189 C 1061 1190 G 1060 1191 U 1059 1192 C 1058 1193 A 0 1194 A 1057 1195 G 1056 1196 U 1055 1197 C 0 1198 A 0 1199 U 0 1200 C 1054 1201 A 1053 1202 U 1050 1203 G 1049 1204 G 1048 1205 C 1047 1206 C 1045 1207 C 1044 1208 U 0 1209 U 0 1210 A 0 1211 C 0 1212 G 987 1213 A 986 1214 G 985 1215 U 984 1216 A 983 1217 G 982 1218 G 981 1219 G 0 1220 C 0 1221 U 0 1222 A 952 1223 C 951 1224 A 0 1225 C 950 1226 A 949 1227 C 948 1228 G 947 1229 U 946 1230 G 945 1231 C 944 1232 U 943 1233 A 942 1234 C 941 1235 A 0 1236 A 0 1237 U 0 1238 G 1293 1239 G 1292 1240 C 1291 1241 G 1290 1242 U 1289 1243 A 1288 1244 U 1287 1245 A 0 1246 C 0 1247 A 0 1248 G 0 1249 A 0 1250 G 1281 1251 G 1280 1252 G 1279 1253 A 0 1254 A 0 1255 G 1274 1256 C 1273 1257 G 0 1258 A 0 1259 A 0 1260 G 1269 1261 C 1268 1262 U 1267 1263 G 0 1264 C 0 1265 G 0 1266 A 0 1267 G 1262 1268 G 1261 1269 U 1260 1270 G 0 1271 G 0 1272 A 0 1273 G 1256 1274 C 1255 1275 G 0 1276 A 0 1277 A 0 1278 U 0 1279 C 1252 1280 U 1251 1281 C 1250 1282 A 0 1283 U 0 1284 A 0 1285 A 0 1286 A 0 1287 G 1244 1288 U 1243 1289 A 1242 1290 C 1241 1291 G 1240 1292 U 1239 1293 C 1238 1294 U 0 1295 A 0 1296 A 0 1297 G 0 1298 U 0 1299 C 0 1300 C 1331 1301 G 0 1302 G 0 1303 A 0 1304 U 1327 1305 U 1326 1306 G 1325 1307 G 1324 1308 A 1323 1309 G 1322 1310 U 1321 1311 C 1320 1312 U 0 1313 G 0 1314 C 0 1315 A 0 1316 A 0 1317 C 0 1318 U 0 1319 C 0 1320 G 1311 1321 A 1310 1322 C 1309 1323 U 1308 1324 C 1307 1325 C 1306 1326 A 1305 1327 U 1304 1328 G 0 1329 A 0 1330 A 0 1331 G 1300 1332 U 0 1333 C 0 1334 G 0 1335 G 0 1336 A 0 1337 A 940 1338 U 939 1339 C 938 1340 G 937 1341 C 936 1342 U 0 1343 A 0 1344 G 0 1345 U 0 1346 A 0 1347 A 1369 1348 U 1368 1349 C 1367 1350 G 1366 1351 C 1365 1352 G 1364 1353 A 1363 1354 A 1362 1355 U 0 1356 C 0 1357 A 0 1358 G 0 1359 A 0 1360 A 0 1361 U 0 1362 G 1354 1363 U 1353 1364 C 1352 1365 G 1351 1366 C 1350 1367 G 1349 1368 G 1348 1369 U 1347 1370 G 0 1371 A 0 1372 A 0 1373 U 0 1374 A 0 1375 C 0 1376 G 933 1377 U 932 1378 U 0 1379 C 0 1380 C 0 1381 C 930 1382 G 929 1383 G 928 1384 G 927 1385 C 926 1386 C 925 1387 U 924 1388 U 922 1389 G 921 1390 U 920 1391 A 0 1392 C 919 1393 A 918 1394 C 0 1395 A 0 1396 C 0 1397 C 0 1398 G 1498 1399 C 1497 1400 C 0 1401 C 1494 1402 G 1493 1403 U 0 1404 C 1491 1405 A 0 1406 C 1488 1407 A 1487 1408 C 1486 1409 C 1485 1410 A 1484 1411 U 1483 1412 G 1482 1413 G 1481 1414 G 0 1415 A 0 1416 G 1478 1417 U 1477 1418 G 1476 1419 G 1475 1420 G 1474 1421 U 1473 1422 U 1472 1423 G 1471 1424 U 1470 1425 A 1469 1426 C 1468 1427 C 1467 1428 A 0 1429 G 0 1430 A 0 1431 A 0 1432 G 1463 1433 U 1462 1434 A 1461 1435 G 1460 1436 A 1459 1437 U 1458 1438 A 0 1439 G 1457 1440 C 1456 1441 U 1455 1442 U 1454 1443 A 0 1444 A 0 1445 C 1452 1446 C 1451 1447 U 0 1448 U 0 1449 U 0 1450 U 0 1451 G 1446 1452 G 1445 1453 A 0 1454 G 1442 1455 G 1441 1456 G 1440 1457 C 1439 1458 G 1437 1459 U 1436 1460 U 1435 1461 U 1434 1462 A 1433 1463 C 1432 1464 C 0 1465 A 0 1466 C 0 1467 G 1427 1468 G 1426 1469 U 1425 1470 N 1424 1471 N 1423 1472 N 1422 1473 N 1421 1474 N 1420 1475 N 1419 1476 N 1418 1477 N 1417 1478 N 1416 1479 N 0 1480 N 0 1481 N 1413 1482 N 1412 1483 N 1411 1484 N 1410 1485 N 1409 1486 N 1408 1487 N 1407 1488 N 1406 1489 N 0 1490 N 0 1491 N 1404 1492 N 0 1493 N 1402 1494 N 1401 1495 N 0 1496 N 0 1497 N 1399 1498 N 1398 1499 N 0 1500 N 0 1501 N 0 1502 N 0 1503 N 1526 1504 N 1525 1505 N 1524 1506 N 1523 1507 N 1522 1508 N 1521 1509 N 1520 1510 N 1519 1511 N 1518 1512 N 1517 1513 N 0 1514 N 0 1515 N 0 1516 N 0 1517 N 1512 1518 N 1511 1519 N 1510 1520 N 1509 1521 N 1508 1522 N 1507 1523 N 1506 1524 N 1505 1525 N 1504 1526 N 1503 1527 N 0 1528 N 0 1529 N 0 1530 N 0 1531 N 0 1532 N 0 1533 N 0 1534 N 0 1535 N 0 1536 N 0 1537 N 0 1538 N 0 1539 N 0