Filename: d.16.b.M.aeruginosa.bpseq Organism: Microcystis aeruginosa Accession Number: U03402 Z28699 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 N 0 3 N 0 4 N 0 5 N 0 6 N 0 7 N 0 8 N 0 9 N 25 10 N 24 11 N 23 12 N 22 13 N 21 14 N 0 15 N 0 16 N 0 17 N 864 18 N 863 19 N 862 20 N 0 21 N 13 22 N 12 23 N 11 24 N 10 25 N 9 26 N 0 27 N 502 28 G 501 29 A 500 30 U 499 31 G 0 32 A 498 33 A 497 34 C 496 35 G 495 36 C 494 37 U 493 38 G 0 39 G 372 40 C 371 41 G 370 42 G 369 43 C 368 44 G 367 45 U 365 46 G 364 47 C 330 48 C 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 C 328 53 A 327 54 C 326 55 A 0 56 U 325 57 G 324 58 C 323 59 A 0 60 A 0 61 G 90 62 U 89 63 C 88 64 G 0 65 A 0 66 A 87 67 C 86 68 G 85 69 G 84 70 G 83 71 A 82 72 A 81 73 U 80 74 C 79 75 U 0 76 U 0 77 C 0 78 G 0 79 G 74 80 A 73 81 U 72 82 U 71 83 C 70 84 U 69 85 A 68 86 G 67 87 U 66 88 G 63 89 G 62 90 C 61 91 G 0 92 G 0 93 A 0 94 C 0 95 G 0 96 G 0 97 G 283 98 U 282 99 G 281 100 A 0 101 G 0 102 U 0 103 A 0 104 A 0 105 C 0 106 G 208 107 C 207 108 G 206 109 U 205 110 A 204 111 A 203 112 G 202 113 A 201 114 A 0 115 U 200 116 C 199 117 U 0 118 A 0 119 A 0 120 C 196 121 U 195 122 U 194 123 C 193 124 A 192 125 G 191 126 G 190 127 A 0 128 C 162 129 G 161 130 G 160 131 G 159 132 G 0 133 A 0 134 C 0 135 A 0 136 A 153 137 C 152 138 A 151 139 G 150 140 U 149 141 U 148 142 G 147 143 G 0 144 A 0 145 A 0 146 A 0 147 C 142 148 G 141 149 A 140 150 C 139 151 U 138 152 G 137 153 C 136 154 U 0 155 A 0 156 A 0 157 U 0 158 A 0 159 C 131 160 C 130 161 C 129 162 G 128 163 A 0 164 U 0 165 G 0 166 U 0 167 G 176 168 C 175 169 C 174 170 G 0 171 C 0 172 G 0 173 A 0 174 G 169 175 G 168 176 U 167 177 G 0 178 A 0 179 A 0 180 A 0 181 C 188 182 C 0 183 U 0 184 A 0 185 A 0 186 U 0 187 U 0 188 G 181 189 G 0 190 C 126 191 C 125 192 U 124 193 G 123 194 G 122 195 A 121 196 G 120 197 A 0 198 A 0 199 G 116 200 A 115 201 G 113 202 C 112 203 U 111 204 U 110 205 G 109 206 C 108 207 G 107 208 U 106 209 C 255 210 U 254 211 G 253 212 A 0 213 U 0 214 U 252 215 A 0 216 G 246 217 C 245 218 U 244 219 A 0 220 G 0 221 U 243 222 U 242 223 G 241 224 G 240 225 U 239 226 G 238 227 G 237 228 G 236 229 G 0 230 U 0 231 A 0 232 A 0 233 G 0 234 G 0 235 G 0 236 C 228 237 C 227 238 U 226 239 A 225 240 C 224 241 C 223 242 A 222 243 A 221 244 G 218 245 G 217 246 C 216 247 G 0 248 A 0 249 C 0 250 G 0 251 A 0 252 U 214 253 C 211 254 A 210 255 G 209 256 U 0 257 A 0 258 G 280 259 C 279 260 U 278 261 G 277 262 G 273 263 U 272 264 C 271 265 U 270 266 G 0 267 A 0 268 G 0 269 A 0 270 G 265 271 G 264 272 A 263 273 U 262 274 G 0 275 A 0 276 G 0 277 C 261 278 A 260 279 G 259 280 C 258 281 C 99 282 A 98 283 C 97 284 A 0 285 C 306 286 U 305 287 G 304 288 G 303 289 G 302 290 A 301 291 C 0 292 U 0 293 G 0 294 A 0 295 G 0 296 A 0 297 C 0 298 A 0 299 C 0 300 G 0 301 G 290 302 C 289 303 C 288 304 C 287 305 A 286 306 G 285 307 A 0 308 C 319 309 U 318 310 C 317 311 C 316 312 U 0 313 A 0 314 C 0 315 G 0 316 G 311 317 G 310 318 A 309 319 G 308 320 G 0 321 C 0 322 A 0 323 G 58 324 C 57 325 A 56 326 G 54 327 U 53 328 G 52 329 G 0 330 G 47 331 G 0 332 A 0 333 A 0 334 U 0 335 U 0 336 U 362 337 U 0 338 C 361 339 C 360 340 G 359 341 C 0 342 A 0 343 A 0 344 U 357 345 G 356 346 G 355 347 G 354 348 C 353 349 G 0 350 A 0 351 A 0 352 A 0 353 G 348 354 C 347 355 C 346 356 U 345 357 G 344 358 A 0 359 C 340 360 G 339 361 G 338 362 A 336 363 G 0 364 C 46 365 A 45 366 A 0 367 C 44 368 G 43 369 C 42 370 C 41 371 G 40 372 C 39 373 G 0 374 U 0 375 G 405 376 A 404 377 G 403 378 G 402 379 G 0 380 A 0 381 G 0 382 G 0 383 A 0 384 A 0 385 G 396 386 G 395 387 U 394 388 C 393 389 U 0 390 U 0 391 U 0 392 G 0 393 G 388 394 A 387 395 U 386 396 U 385 397 G 0 398 U 0 399 A 0 400 A 0 401 A 0 402 C 378 403 C 377 404 U 376 405 C 375 406 U 0 407 U 442 408 U 0 409 U 0 410 C 439 411 U 438 412 C 437 413 A 436 414 A 435 415 G 434 416 G 0 417 A 0 418 A 0 419 G 429 420 A 0 421 A 0 422 G 0 423 U 0 424 U 0 425 C 0 426 U 0 427 G 0 428 A 0 429 C 419 430 G 0 431 G 0 432 U 0 433 A 0 434 C 415 435 U 414 436 U 413 437 G 412 438 A 411 439 G 410 440 G 0 441 A 0 442 A 407 443 U 0 444 C 0 445 A 0 446 G 491 447 C 490 448 C 489 449 U 488 450 C 487 451 G 472 452 G 471 453 C 470 454 U 0 455 A 0 456 A 0 457 C 486 458 U 485 459 C 484 460 C 483 461 G 482 462 U 0 463 G 0 464 C 0 465 C 0 466 A 0 467 G 474 468 C 473 469 A 0 470 G 453 471 C 452 472 C 451 473 G 468 474 C 467 475 G 0 476 G 0 477 U 0 478 A 0 479 A 0 480 U 0 481 A 0 482 C 461 483 G 460 484 G 459 485 G 458 486 G 457 487 G 450 488 A 449 489 G 448 490 G 447 491 C 446 492 A 0 493 A 37 494 G 36 495 C 35 496 G 34 497 U 33 498 U 32 499 A 30 500 U 29 501 C 28 502 C 27 503 G 0 504 G 0 505 A 0 506 A 0 507 U 0 508 U 0 509 A 0 510 U 0 511 U 0 512 G 0 513 G 829 514 G 828 515 C 827 516 G 812 517 U 811 518 A 0 519 A 0 520 A 0 521 G 0 522 C 0 523 G 709 524 U 708 525 C 707 526 C 706 527 G 0 528 C 703 529 A 0 530 G 702 531 G 701 532 U 700 533 G 0 534 G 597 535 U 596 536 C 595 537 A 594 538 G 593 539 C 592 540 C 591 541 A 0 542 A 590 543 G 589 544 U 586 545 C 585 546 U 584 547 G 583 548 C 582 549 C 581 550 G 580 551 U 579 552 C 578 553 A 0 554 A 0 555 A 0 556 U 0 557 C 575 558 A 574 559 G 573 560 G 572 561 U 571 562 U 570 563 G 569 564 C 0 565 U 0 566 U 0 567 A 0 568 A 0 569 C 563 570 G 562 571 A 561 572 C 560 573 C 559 574 U 558 575 A 557 576 A 0 577 A 0 578 G 552 579 G 551 580 C 550 581 G 549 582 G 548 583 U 547 584 G 546 585 G 545 586 A 544 587 A 0 588 A 0 589 C 543 590 U 542 591 G 540 592 G 539 593 C 538 594 A 537 595 G 536 596 A 535 597 C 534 598 U 0 599 A 0 600 G 0 601 A 696 602 G 695 603 A 694 604 G 692 605 C 691 606 A 690 607 G 689 608 U 688 609 A 687 610 G 0 611 G 0 612 G 685 613 G 684 614 U 683 615 A 682 616 G 681 617 C 680 618 A 679 619 G 662 620 G 661 621 A 0 622 A 0 623 U 658 624 U 657 625 C 656 626 C 655 627 C 654 628 A 653 629 G 652 630 U 651 631 G 0 632 U 0 633 A 0 634 G 644 635 C 643 636 G 642 637 U 0 638 G 0 639 A 0 640 A 0 641 A 0 642 U 636 643 G 635 644 C 634 645 G 0 646 U 0 647 A 0 648 G 0 649 A 0 650 G 0 651 A 630 652 U 629 653 U 628 654 G 627 655 G 626 656 G 625 657 A 624 658 A 623 659 G 0 660 A 0 661 A 620 662 C 619 663 A 0 664 U 0 665 C 0 666 G 0 667 G 678 668 U 0 669 G 0 670 G 677 671 C 676 672 G 0 673 A 0 674 A 0 675 A 0 676 G 671 677 C 670 678 G 667 679 U 618 680 G 617 681 C 616 682 U 615 683 A 614 684 C 613 685 U 612 686 G 0 687 G 609 688 G 608 689 C 607 690 U 606 691 G 605 692 U 604 693 A 0 694 U 603 695 C 602 696 U 601 697 G 0 698 A 0 699 C 0 700 A 532 701 C 531 702 U 530 703 C 528 704 A 0 705 G 0 706 G 526 707 G 525 708 A 524 709 C 523 710 G 0 711 A 0 712 A 0 713 A 0 714 G 755 715 C 754 716 U 753 717 A 752 718 G 751 719 G 750 720 G 0 721 G 0 722 A 0 723 G 749 724 C 748 725 G 0 726 A 0 727 A 0 728 A 744 729 G 743 730 G 742 731 G 741 732 A 0 733 U 0 734 U 0 735 A 0 736 G 0 737 A 0 738 U 0 739 A 0 740 C 0 741 C 731 742 C 730 743 C 729 744 U 728 745 G 0 746 U 0 747 A 0 748 G 724 749 U 723 750 C 719 751 C 718 752 U 717 753 A 716 754 G 715 755 C 714 756 C 0 757 G 0 758 U 0 759 A 0 760 A 0 761 A 0 762 C 0 763 G 0 764 A 0 765 U 0 766 G 825 767 G 824 768 A 823 769 U 822 770 A 821 771 C 820 772 U 0 773 A 0 774 G 803 775 G 802 776 C 801 777 G 800 778 U 799 779 G 798 780 G 797 781 C 796 782 U 795 783 U 794 784 G 793 785 U 792 786 A 0 787 U 0 788 C 0 789 G 0 790 A 0 791 C 0 792 C 785 793 C 784 794 G 783 795 A 782 796 G 781 797 C 780 798 C 779 799 G 778 800 U 777 801 G 776 802 C 775 803 C 774 804 G 0 805 A 0 806 A 0 807 G 814 808 C 813 809 U 0 810 A 0 811 A 517 812 C 516 813 G 808 814 C 807 815 G 0 816 U 0 817 U 0 818 A 0 819 A 0 820 G 771 821 U 770 822 A 769 823 U 768 824 C 767 825 C 766 826 C 0 827 G 515 828 C 514 829 C 513 830 U 0 831 G 858 832 G 857 833 G 856 834 G 0 835 A 0 836 G 0 837 U 0 838 A 0 839 C 0 840 G 851 841 C 850 842 A 849 843 C 848 844 G 0 845 C 0 846 A 0 847 A 0 848 G 843 849 U 842 850 G 841 851 U 840 852 G 0 853 A 0 854 A 0 855 A 0 856 C 833 857 U 832 858 C 831 859 A 0 860 A 0 861 A 0 862 G 19 863 G 18 864 A 17 865 A 0 866 U 0 867 U 1342 868 G 1341 869 A 1339 870 C 1338 871 G 1337 872 G 0 873 G 1336 874 G 1335 875 G 1334 876 C 1333 877 C 1332 878 C 1331 879 G 1330 880 C 0 881 A 1326 882 C 1325 883 A 0 884 A 0 885 G 1290 886 C 1289 887 G 1288 888 G 1287 889 U 1286 890 G 1182 891 G 1181 892 A 1180 893 G 1179 894 U 1178 895 A 1177 896 U 1176 897 G 1175 898 U 1174 899 G 1173 900 G 1171 901 U 1170 902 U 0 903 U 0 904 A 0 905 A 0 906 U 921 907 U 920 908 C 919 909 G 918 910 A 0 911 U 0 912 G 0 913 C 0 914 A 0 915 A 0 916 C 0 917 G 0 918 C 909 919 G 908 920 A 907 921 A 906 922 G 0 923 A 0 924 A 0 925 C 0 926 C 0 927 U 0 928 U 0 929 A 0 930 C 1166 931 C 1165 932 A 1164 933 A 1163 934 G 1162 935 A 1161 936 C 1160 937 U 0 938 U 0 939 G 0 940 A 0 941 C 0 942 A 991 943 U 990 944 G 989 945 U 987 946 C 986 947 G 985 948 C 984 949 G 983 950 A 0 951 A 0 952 C 969 953 C 968 954 C 967 955 U 966 956 G 965 957 G 964 958 U 963 959 G 0 960 A 0 961 A 0 962 A 0 963 G 958 964 C 957 965 U 956 966 G 955 967 G 954 968 G 953 969 G 952 970 G 0 971 U 982 972 G 981 973 C 980 974 C 979 975 U 0 976 U 0 977 C 0 978 G 0 979 G 974 980 G 973 981 A 972 982 G 971 983 C 949 984 G 948 985 C 947 986 G 946 987 A 945 988 A 0 989 C 944 990 A 943 991 C 942 992 A 0 993 G 1155 994 G 1154 995 U 0 996 G 1153 997 G 1152 998 U 1151 999 G 1150 1000 C 0 1001 A 0 1002 U 1149 1003 G 1148 1004 G 1144 1005 C 1143 1006 U 1142 1007 G 1140 1008 U 1139 1009 C 1138 1010 G 1137 1011 U 0 1012 C 0 1013 A 0 1014 G 1053 1015 C 1052 1016 U 1051 1017 C 1050 1018 G 1049 1019 U 1048 1020 G 1029 1021 U 1028 1022 C 1027 1023 G 0 1024 U 0 1025 G 0 1026 A 0 1027 G 1022 1028 A 1021 1029 U 1020 1030 G 0 1031 U 0 1032 U 1045 1033 G 1044 1034 G 1043 1035 G 1042 1036 U 0 1037 U 0 1038 A 0 1039 A 0 1040 G 0 1041 U 0 1042 C 1035 1043 C 1034 1044 C 1033 1045 G 1032 1046 C 0 1047 A 0 1048 A 1019 1049 C 1018 1050 G 1017 1051 A 1016 1052 G 1015 1053 C 1014 1054 G 0 1055 C 0 1056 A 0 1057 A 0 1058 C 0 1059 C 1132 1060 C 1131 1061 U 1130 1062 C 1129 1063 G 0 1064 U 1100 1065 U 1099 1066 C 1098 1067 U 1097 1068 U 1096 1069 A 1095 1070 G 1094 1071 U 0 1072 U 0 1073 G 0 1074 C 1089 1075 C 1088 1076 A 0 1077 G 0 1078 C 1087 1079 A 1086 1080 U 0 1081 U 0 1082 A 0 1083 A 0 1084 G 0 1085 U 0 1086 U 1079 1087 G 1078 1088 G 1075 1089 G 1074 1090 G 0 1091 A 0 1092 C 0 1093 U 0 1094 C 1070 1095 U 1069 1096 A 1068 1097 A 1067 1098 G 1066 1099 G 1065 1100 A 1064 1101 G 0 1102 A 0 1103 C 1123 1104 U 1122 1105 G 1121 1106 C 1120 1107 C 1119 1108 G 1118 1109 G 1117 1110 U 1116 1111 G 0 1112 A 0 1113 C 0 1114 A 0 1115 A 0 1116 A 1110 1117 C 1109 1118 C 1108 1119 G 1107 1120 G 1106 1121 A 1105 1122 G 1104 1123 G 1103 1124 A 0 1125 A 0 1126 G 0 1127 G 0 1128 U 0 1129 G 1062 1130 G 1061 1131 G 1060 1132 G 1059 1133 A 0 1134 U 0 1135 G 0 1136 A 0 1137 C 1010 1138 G 1009 1139 U 1008 1140 C 1007 1141 A 0 1142 A 1006 1143 G 1005 1144 U 1004 1145 C 0 1146 A 0 1147 G 0 1148 C 1003 1149 A 1002 1150 U 999 1151 G 998 1152 C 997 1153 C 996 1154 C 994 1155 C 993 1156 U 0 1157 U 0 1158 A 0 1159 C 0 1160 G 936 1161 U 935 1162 C 934 1163 U 933 1164 U 932 1165 G 931 1166 G 930 1167 G 0 1168 C 0 1169 G 0 1170 A 901 1171 C 900 1172 A 0 1173 C 899 1174 A 898 1175 C 897 1176 G 896 1177 U 895 1178 A 894 1179 C 893 1180 U 892 1181 A 891 1182 C 890 1183 A 0 1184 A 0 1185 U 0 1186 G 1242 1187 G 1241 1188 U 1240 1189 C 1239 1190 G 1238 1191 G 1237 1192 G 1236 1193 A 0 1194 C 0 1195 A 0 1196 A 0 1197 A 0 1198 G 1229 1199 G 1228 1200 G 1227 1201 C 0 1202 A 0 1203 G 1222 1204 C 1221 1205 G 0 1206 A 0 1207 A 0 1208 C 1217 1209 U 1216 1210 C 1215 1211 G 0 1212 C 0 1213 G 0 1214 A 0 1215 G 1210 1216 A 1209 1217 G 1208 1218 C 0 1219 C 0 1220 A 0 1221 G 1204 1222 C 1203 1223 G 0 1224 A 0 1225 A 0 1226 U 0 1227 C 1200 1228 C 1199 1229 C 1198 1230 A 0 1231 G 0 1232 C 0 1233 A 0 1234 A 0 1235 A 0 1236 C 1192 1237 C 1191 1238 C 1190 1239 G 1189 1240 G 1188 1241 C 1187 1242 C 1186 1243 U 0 1244 C 0 1245 A 0 1246 G 0 1247 U 0 1248 U 0 1249 C 1280 1250 A 0 1251 G 0 1252 A 0 1253 U 1276 1254 U 1275 1255 G 1274 1256 C 1273 1257 A 1272 1258 G 1271 1259 G 1270 1260 C 1269 1261 U 0 1262 G 0 1263 C 0 1264 A 0 1265 A 0 1266 C 0 1267 U 0 1268 C 0 1269 G 1260 1270 C 1259 1271 C 1258 1272 U 1257 1273 G 1256 1274 C 1255 1275 A 1254 1276 U 1253 1277 G 0 1278 A 0 1279 A 0 1280 G 1249 1281 G 0 1282 A 0 1283 G 0 1284 G 0 1285 A 0 1286 A 889 1287 U 888 1288 C 887 1289 G 886 1290 C 885 1291 U 0 1292 A 0 1293 G 0 1294 U 0 1295 A 0 1296 A 1318 1297 U 1317 1298 C 1316 1299 G 1315 1300 C 1314 1301 C 1313 1302 G 1312 1303 G 1311 1304 U 0 1305 C 0 1306 A 0 1307 G 0 1308 C 0 1309 A 0 1310 U 0 1311 A 1303 1312 C 1302 1313 G 1301 1314 G 1300 1315 C 1299 1316 G 1298 1317 G 1297 1318 U 1296 1319 G 0 1320 A 0 1321 A 0 1322 U 0 1323 U 0 1324 C 0 1325 G 882 1326 U 881 1327 U 0 1328 C 0 1329 C 0 1330 C 879 1331 G 878 1332 G 877 1333 G 876 1334 C 875 1335 C 874 1336 U 873 1337 U 871 1338 G 870 1339 U 869 1340 A 0 1341 C 868 1342 A 867 1343 C 0 1344 A 0 1345 C 0 1346 C 0 1347 G 1448 1348 C 1447 1349 C 0 1350 C 1444 1351 G 1443 1352 U 0 1353 C 0 1354 A 0 1355 C 1438 1356 A 1437 1357 C 1436 1358 C 1435 1359 A 1434 1360 U 1433 1361 G 1432 1362 G 1431 1363 A 0 1364 A 0 1365 G 1428 1366 C 1427 1367 U 1426 1368 G 1425 1369 G 1424 1370 U 1423 1371 C 1422 1372 A 1421 1373 C 1420 1374 G 1419 1375 C 1418 1376 C 1417 1377 C 0 1378 G 0 1379 A 0 1380 A 0 1381 G 1413 1382 U 1412 1383 C 1411 1384 A 1410 1385 U 1409 1386 U 1408 1387 A 1407 1388 C 1406 1389 C 1405 1390 U 1404 1391 C 1403 1392 A 0 1393 A 0 1394 C 1401 1395 C 1400 1396 G 0 1397 C 0 1398 A 0 1399 A 0 1400 G 1395 1401 G 1394 1402 A 0 1403 G 1391 1404 G 1390 1405 G 1389 1406 G 1388 1407 G 1387 1408 G 1386 1409 A 1385 1410 U 1384 1411 G 1383 1412 C 1382 1413 C 1381 1414 U 0 1415 A 0 1416 A 0 1417 G 1376 1418 G 1375 1419 C 1374 1420 A 1373 1421 G 1372 1422 G 1371 1423 G 1370 1424 C 1369 1425 U 1368 1426 A 1367 1427 G 1366 1428 U 1365 1429 G 0 1430 A 0 1431 C 1362 1432 U 1361 1433 G 1360 1434 G 1359 1435 G 1358 1436 G 1357 1437 U 1356 1438 G 1355 1439 N 0 1440 N 0 1441 N 0 1442 N 0 1443 N 1351 1444 N 1350 1445 N 0 1446 N 0 1447 N 1348 1448 N 1347 1449 N 0 1450 N 0 1451 N 0 1452 N 0 1453 N 1476 1454 N 1475 1455 N 1474 1456 N 1473 1457 N 1472 1458 N 1471 1459 N 1470 1460 N 1469 1461 N 1468 1462 N 1467 1463 N 0 1464 N 0 1465 N 0 1466 N 0 1467 N 1462 1468 N 1461 1469 N 1460 1470 N 1459 1471 N 1458 1472 N 1457 1473 N 1456 1474 N 1455 1475 N 1454 1476 N 1453 1477 N 0 1478 N 0 1479 N 0 1480 N 0 1481 N 0 1482 N 0 1483 N 0 1484 N 0 1485 N 0 1486 N 0 1487 N 0 1488 N 0 1489 N 0