Filename: d.16.b.M.genitalium.bpseq Organism: Mycoplasma genitalium Accession Number: U39694 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 C 0 2 A 0 3 A 0 4 U 0 5 U 0 6 U 0 7 U 0 8 U 0 9 U 0 10 C 0 11 U 0 12 G 0 13 A 0 14 G 30 15 A 29 16 G 28 17 U 27 18 U 26 19 U 0 20 G 0 21 A 0 22 U 917 23 C 916 24 C 915 25 U 0 26 G 18 27 G 17 28 C 16 29 U 15 30 C 14 31 A 0 32 G 558 33 G 557 34 A 556 35 U 555 36 U 0 37 A 554 38 A 553 39 C 552 40 G 551 41 C 550 42 U 549 43 G 0 44 G 403 45 C 402 46 G 401 47 G 400 48 C 399 49 A 398 50 U 396 51 G 395 52 C 361 53 C 0 54 U 0 55 A 0 56 A 0 57 U 359 58 A 358 59 C 357 60 A 0 61 U 356 62 G 355 63 C 354 64 A 0 65 A 0 66 G 95 67 U 94 68 C 93 69 G 0 70 A 0 71 U 92 72 C 91 73 G 90 74 G 89 75 A 88 76 A 87 77 G 86 78 U 85 79 A 84 80 G 0 81 C 0 82 A 0 83 A 0 84 U 79 85 A 78 86 C 77 87 U 76 88 U 75 89 U 74 90 A 73 91 G 72 92 A 71 93 G 68 94 G 67 95 C 66 96 G 0 97 A 0 98 A 0 99 C 0 100 G 0 101 G 0 102 G 314 103 U 313 104 G 312 105 A 0 106 G 0 107 U 0 108 A 0 109 A 0 110 C 0 111 A 239 112 C 238 113 G 237 114 U 236 115 A 235 116 U 234 117 C 233 118 C 232 119 A 0 120 A 0 121 U 231 122 C 230 123 U 0 124 A 0 125 C 0 126 C 227 127 U 226 128 U 225 129 A 224 130 U 223 131 A 222 132 A 221 133 U 0 134 G 168 135 G 167 136 G 166 137 G 165 138 G 0 139 A 0 140 U 0 141 A 0 142 A 159 143 C 158 144 U 157 145 A 156 146 G 155 147 U 154 148 U 153 149 G 0 150 A 0 151 A 0 152 A 0 153 A 148 154 A 147 155 C 146 156 U 145 157 A 144 158 G 143 159 C 142 160 U 0 161 A 0 162 A 0 163 U 0 164 A 0 165 C 137 166 C 136 167 G 135 168 C 134 169 A 0 170 U 0 171 A 0 172 A 0 173 G 0 174 A 199 175 A 198 176 C 197 177 U 196 178 U 195 179 U 194 180 A 193 181 G 192 182 U 191 183 U 190 184 C 189 185 G 0 186 C 0 187 A 0 188 U 0 189 G 184 190 A 183 191 A 182 192 U 181 193 U 180 194 A 179 195 A 178 196 A 177 197 G 176 198 U 175 199 U 174 200 G 0 201 A 0 202 A 0 203 A 0 204 G 219 205 G 218 206 A 217 207 C 216 208 C 215 209 U 214 210 G 0 211 C 0 212 A 0 213 A 0 214 G 209 215 G 208 216 G 207 217 U 206 218 U 205 219 C 204 220 G 0 221 U 132 222 U 131 223 A 130 224 U 129 225 U 128 226 U 127 227 G 126 228 A 0 229 U 0 230 G 122 231 A 121 232 G 118 233 G 117 234 G 116 235 U 115 236 G 114 237 C 113 238 G 112 239 C 111 240 C 286 241 A 285 242 U 284 243 A 0 244 U 0 245 C 283 246 A 0 247 G 277 248 C 276 249 U 275 250 A 0 251 G 0 252 U 274 253 U 273 254 G 272 255 G 271 256 U 270 257 A 269 258 G 268 259 G 267 260 G 0 261 U 0 262 A 0 263 A 0 264 U 0 265 G 0 266 G 0 267 C 259 268 C 258 269 U 257 270 A 256 271 C 255 272 C 254 273 A 253 274 A 252 275 G 249 276 G 248 277 C 247 278 A 0 279 A 0 280 U 0 281 G 0 282 A 0 283 C 245 284 G 242 285 U 241 286 G 240 287 U 0 288 A 0 289 G 311 290 C 310 291 U 309 292 A 308 293 U 304 294 G 303 295 C 302 296 U 301 297 G 0 298 A 0 299 G 0 300 A 0 301 A 296 302 G 295 303 U 294 304 A 293 305 G 0 306 A 0 307 A 0 308 U 292 309 A 291 310 G 290 311 C 289 312 C 104 313 A 103 314 C 102 315 A 0 316 A 337 317 U 336 318 G 335 319 G 334 320 G 333 321 A 332 322 C 0 323 U 0 324 G 0 325 A 0 326 G 0 327 A 0 328 C 0 329 A 0 330 C 0 331 G 0 332 G 321 333 C 320 334 C 319 335 C 318 336 A 317 337 U 316 338 A 0 339 C 350 340 U 349 341 C 348 342 C 347 343 U 0 344 A 0 345 C 0 346 G 0 347 G 342 348 G 341 349 A 340 350 G 339 351 G 0 352 C 0 353 A 0 354 G 63 355 C 62 356 A 61 357 G 59 358 U 58 359 A 57 360 G 0 361 G 52 362 G 0 363 A 0 364 A 0 365 U 0 366 U 0 367 U 393 368 U 0 369 U 392 370 C 391 371 A 390 372 C 0 373 A 0 374 A 0 375 U 388 376 G 387 377 A 386 378 G 385 379 C 384 380 G 0 381 A 0 382 A 0 383 A 0 384 G 379 385 C 378 386 U 377 387 U 376 388 G 375 389 A 0 390 U 371 391 G 370 392 G 369 393 A 367 394 G 0 395 C 51 396 A 50 397 A 0 398 U 49 399 G 48 400 C 47 401 C 46 402 G 45 403 C 44 404 G 0 405 U 0 406 G 437 407 A 436 408 A 435 409 C 434 410 G 0 411 A 0 412 U 0 413 G 0 414 A 0 415 A 0 416 G 428 417 G 427 418 U 426 419 C 425 420 U 0 421 U 0 422 U 0 423 U 0 424 U 0 425 G 419 426 A 418 427 U 417 428 U 416 429 G 0 430 U 0 431 A 0 432 A 0 433 A 0 434 G 409 435 U 408 436 U 407 437 C 406 438 U 0 439 U 498 440 U 0 441 U 499 442 A 495 443 U 494 444 U 493 445 U 491 446 G 490 447 G 489 448 G 0 449 A 0 450 A 0 451 G 484 452 A 0 453 A 0 454 U 0 455 G 0 456 A 0 457 C 478 458 U 477 459 C 476 460 U 475 461 A 474 462 G 473 463 C 472 464 A 0 465 G 0 466 G 0 467 C 0 468 A 0 469 A 0 470 U 0 471 G 0 472 G 463 473 C 462 474 U 461 475 G 460 476 G 459 477 A 458 478 G 457 479 U 0 480 U 0 481 U 0 482 G 0 483 A 0 484 C 451 485 U 0 486 G 0 487 U 0 488 A 0 489 C 447 490 C 446 491 A 445 492 C 0 493 U 444 494 U 443 495 U 442 496 G 0 497 A 0 498 A 439 499 U 441 500 A 0 501 A 0 502 G 547 503 U 546 504 G 545 505 A 544 506 C 543 507 G 528 508 A 527 509 C 526 510 U 0 511 A 0 512 A 0 513 C 542 514 U 541 515 A 540 516 U 539 517 G 538 518 U 0 519 G 0 520 C 0 521 C 0 522 A 0 523 G 530 524 C 529 525 A 0 526 G 509 527 U 508 528 C 507 529 G 524 530 C 523 531 G 0 532 G 0 533 U 0 534 A 0 535 A 0 536 U 0 537 A 0 538 C 517 539 A 516 540 U 515 541 A 514 542 G 513 543 G 506 544 U 505 545 C 504 546 G 503 547 C 502 548 A 0 549 A 42 550 G 41 551 C 40 552 G 39 553 U 38 554 U 37 555 A 35 556 U 34 557 C 33 558 C 32 559 G 0 560 G 0 561 A 0 562 U 0 563 U 0 564 U 0 565 A 0 566 U 0 567 U 0 568 G 0 569 G 881 570 G 880 571 C 879 572 G 864 573 U 863 574 A 0 575 A 0 576 A 0 577 G 878 578 C 0 579 A 765 580 A 764 581 G 763 582 C 762 583 G 0 584 C 759 585 A 0 586 G 758 587 G 757 588 C 756 589 G 0 590 G 652 591 A 651 592 U 650 593 U 649 594 G 648 595 A 647 596 A 646 597 A 0 598 A 645 599 G 644 600 U 641 601 C 640 602 U 639 603 G 638 604 G 637 605 U 636 606 G 635 607 U 634 608 U 633 609 A 0 610 A 0 611 A 0 612 G 0 613 G 631 614 C 630 615 A 629 616 G 628 617 C 627 618 U 626 619 G 625 620 C 0 621 U 0 622 U 0 623 A 0 624 A 0 625 C 619 626 A 618 627 G 617 628 U 616 629 U 615 630 G 614 631 U 613 632 A 0 633 U 608 634 G 607 635 C 606 636 A 605 637 U 604 638 U 603 639 G 602 640 G 601 641 A 600 642 A 0 643 A 0 644 C 599 645 U 598 646 A 596 647 U 595 648 C 594 649 A 593 650 G 592 651 U 591 652 C 590 653 U 0 654 A 0 655 G 0 656 A 752 657 G 751 658 U 750 659 G 749 660 U 747 661 G 746 662 G 745 663 U 744 664 A 743 665 G 0 666 G 0 667 G 741 668 A 740 669 G 739 670 U 738 671 U 737 672 U 736 673 U 735 674 G 718 675 G 717 676 A 0 677 A 0 678 U 714 679 U 713 680 U 712 681 C 711 682 A 710 683 U 709 684 G 708 685 U 707 686 G 0 687 G 0 688 A 0 689 G 700 690 C 699 691 G 698 692 G 0 693 U 0 694 G 0 695 A 0 696 A 0 697 A 0 698 U 691 699 G 690 700 C 689 701 G 0 702 U 0 703 A 0 704 G 0 705 A 0 706 U 0 707 A 685 708 U 684 709 A 683 710 U 682 711 G 681 712 A 680 713 A 679 714 G 678 715 G 0 716 A 0 717 A 675 718 C 674 719 A 0 720 C 0 721 C 0 722 A 0 723 G 734 724 U 0 725 G 0 726 G 733 727 C 732 728 G 0 729 A 0 730 A 0 731 G 0 732 G 727 733 C 726 734 G 723 735 A 673 736 A 672 737 A 671 738 A 670 739 C 669 740 U 668 741 U 667 742 A 0 743 G 664 744 G 663 745 C 662 746 C 661 747 A 660 748 U 0 749 U 659 750 A 658 751 C 657 752 U 656 753 G 0 754 A 0 755 C 0 756 G 588 757 C 587 758 U 586 759 U 584 760 A 0 761 G 0 762 G 582 763 C 581 764 U 580 765 U 579 766 G 0 767 A 0 768 A 0 769 A 0 770 G 811 771 U 810 772 G 809 773 U 808 774 G 807 775 G 806 776 G 0 777 G 0 778 A 0 779 G 805 780 C 804 781 A 0 782 A 0 783 A 0 784 U 800 785 A 799 786 G 798 787 G 797 788 A 0 789 U 0 790 U 0 791 A 0 792 G 0 793 A 0 794 U 0 795 A 0 796 C 0 797 C 787 798 C 786 799 U 785 800 A 784 801 G 0 802 U 0 803 A 0 804 G 780 805 U 779 806 C 775 807 C 774 808 A 773 809 C 772 810 A 771 811 C 770 812 C 0 813 G 0 814 U 0 815 A 0 816 A 0 817 A 0 818 C 0 819 G 0 820 A 0 821 U 0 822 A 877 823 G 876 824 A 875 825 U 874 826 A 873 827 C 872 828 U 0 829 A 0 830 G 855 831 C 854 832 U 853 833 G 852 834 U 851 835 C 850 836 G 849 837 G 848 838 A 847 839 G 846 840 C 0 841 G 0 842 A 0 843 U 0 844 C 0 845 C 0 846 C 839 847 U 838 848 U 837 849 C 836 850 G 835 851 G 834 852 U 833 853 A 832 854 G 831 855 U 830 856 G 0 857 A 0 858 A 0 859 G 866 860 U 865 861 U 0 862 A 0 863 A 573 864 C 572 865 A 860 866 C 859 867 A 0 868 U 0 869 U 0 870 A 0 871 A 0 872 G 827 873 U 826 874 A 825 875 U 824 876 C 823 877 U 822 878 C 577 879 G 571 880 C 570 881 C 569 882 U 0 883 G 910 884 G 909 885 G 908 886 U 0 887 A 0 888 G 0 889 U 0 890 A 0 891 C 0 892 A 903 893 U 902 894 U 901 895 C 900 896 G 0 897 C 0 898 A 0 899 A 0 900 G 895 901 A 894 902 A 893 903 U 892 904 G 0 905 A 0 906 A 0 907 A 0 908 C 885 909 U 884 910 C 883 911 A 0 912 A 0 913 A 0 914 C 0 915 G 24 916 G 23 917 A 22 918 A 0 919 U 0 920 U 1375 921 G 1374 922 A 1372 923 C 1371 924 G 1370 925 G 0 926 G 1369 927 G 1368 928 A 1367 929 C 1366 930 C 1365 931 C 1364 932 G 1363 933 C 0 934 A 1359 935 C 1358 936 A 0 937 A 1323 938 G 1322 939 U 1321 940 G 1320 941 G 1319 942 U 1318 943 G 1216 944 G 1215 945 A 1214 946 G 1213 947 C 1212 948 A 1211 949 U 1210 950 G 1209 951 U 1208 952 U 1207 953 G 1205 954 C 1204 955 U 0 956 U 0 957 A 0 958 A 0 959 U 974 960 U 973 961 C 972 962 G 971 963 A 0 964 C 0 965 G 0 966 G 0 967 U 0 968 A 0 969 C 0 970 A 0 971 C 962 972 G 961 973 A 960 974 A 959 975 A 0 976 A 0 977 A 0 978 C 0 979 C 0 980 U 0 981 U 0 982 A 0 983 C 1200 984 C 1199 985 U 1198 986 A 1197 987 G 1196 988 A 1195 989 C 1194 990 U 0 991 U 0 992 G 0 993 A 0 994 C 0 995 A 1040 996 U 1039 997 C 1038 998 C 1036 999 U 1035 1000 U 1034 1001 G 1033 1002 G 1032 1003 C 0 1004 A 0 1005 A 0 1006 A 0 1007 G 1022 1008 U 1021 1009 U 1020 1010 A 1019 1011 U 1018 1012 G 1017 1013 G 0 1014 A 0 1015 A 0 1016 A 0 1017 C 1012 1018 A 1011 1019 U 1010 1020 A 1009 1021 A 1008 1022 U 1007 1023 G 0 1024 G 0 1025 A 0 1026 G 0 1027 G 0 1028 U 0 1029 U 0 1030 A 0 1031 A 0 1032 C 1002 1033 C 1001 1034 G 1000 1035 A 999 1036 G 998 1037 U 0 1038 G 997 1039 A 996 1040 C 995 1041 A 0 1042 G 1189 1043 G 1188 1044 U 0 1045 G 1187 1046 G 1186 1047 U 1185 1048 G 1184 1049 C 0 1050 A 0 1051 U 1183 1052 G 1182 1053 G 1178 1054 U 1177 1055 U 1176 1056 G 1174 1057 U 1173 1058 C 1172 1059 G 1171 1060 U 0 1061 C 0 1062 A 0 1063 G 1102 1064 C 1101 1065 U 1100 1066 C 1099 1067 G 1098 1068 U 1097 1069 G 1078 1070 U 1077 1071 C 1076 1072 G 0 1073 U 0 1074 G 0 1075 A 0 1076 G 1071 1077 A 1070 1078 U 1069 1079 G 0 1080 U 0 1081 U 1094 1082 G 1093 1083 G 1092 1084 G 1091 1085 U 0 1086 U 0 1087 A 0 1088 A 0 1089 G 0 1090 U 0 1091 C 1084 1092 C 1083 1093 C 1082 1094 G 1081 1095 C 0 1096 A 0 1097 A 1068 1098 C 1067 1099 G 1066 1100 A 1065 1101 G 1064 1102 C 1063 1103 G 0 1104 C 0 1105 A 0 1106 A 0 1107 C 0 1108 C 1166 1109 C 1165 1110 U 1164 1111 U 1163 1112 A 0 1113 U 1135 1114 C 1134 1115 G 1133 1116 U 1132 1117 U 1131 1118 A 1130 1119 G 1129 1120 U 0 1121 U 0 1122 A 0 1123 C 0 1124 A 0 1125 U 0 1126 U 0 1127 G 0 1128 U 0 1129 U 1119 1130 U 1118 1131 A 1117 1132 A 1116 1133 C 1115 1134 G 1114 1135 A 1113 1136 G 0 1137 A 0 1138 C 1157 1139 U 1156 1140 G 1155 1141 C 1154 1142 U 1153 1143 A 1152 1144 A 1151 1145 U 1150 1146 G 0 1147 U 0 1148 A 0 1149 A 0 1150 A 1145 1151 U 1144 1152 U 1143 1153 G 1142 1154 G 1141 1155 A 1140 1156 G 1139 1157 G 1138 1158 A 0 1159 A 0 1160 G 0 1161 G 0 1162 A 0 1163 A 1111 1164 G 1110 1165 G 1109 1166 G 1108 1167 A 0 1168 U 0 1169 G 0 1170 A 0 1171 C 1059 1172 G 1058 1173 U 1057 1174 C 1056 1175 A 0 1176 A 1055 1177 A 1054 1178 U 1053 1179 C 0 1180 A 0 1181 U 0 1182 C 1052 1183 A 1051 1184 U 1048 1185 G 1047 1186 C 1046 1187 C 1045 1188 C 1043 1189 C 1042 1190 U 0 1191 U 0 1192 A 0 1193 U 0 1194 G 989 1195 U 988 1196 C 987 1197 U 986 1198 A 985 1199 G 984 1200 G 983 1201 G 0 1202 C 0 1203 U 0 1204 G 954 1205 C 953 1206 A 0 1207 A 952 1208 A 951 1209 C 950 1210 G 949 1211 U 948 1212 G 947 1213 C 946 1214 U 945 1215 A 944 1216 C 943 1217 A 0 1218 A 0 1219 U 0 1220 G 1274 1221 G 1273 1222 C 1272 1223 C 1271 1224 A 1270 1225 A 1269 1226 U 1268 1227 A 0 1228 C 0 1229 A 0 1230 A 0 1231 A 0 1232 C 1263 1233 A 1262 1234 G 1261 1235 U 0 1236 A 0 1237 G 1256 1238 C 1255 1239 C 0 1240 A 0 1241 A 0 1242 C 1251 1243 U 1250 1244 U 1249 1245 G 0 1246 U 0 1247 A 0 1248 A 0 1249 A 1244 1250 A 1243 1251 G 1242 1252 U 0 1253 G 0 1254 A 0 1255 G 1238 1256 C 1237 1257 A 0 1258 A 0 1259 A 0 1260 U 0 1261 C 1234 1262 U 1233 1263 G 1232 1264 A 0 1265 A 0 1266 A 0 1267 A 0 1268 G 1226 1269 U 1225 1270 U 1224 1271 G 1223 1272 G 1222 1273 U 1221 1274 C 1220 1275 U 0 1276 C 0 1277 A 0 1278 G 0 1279 U 0 1280 U 0 1281 C 1312 1282 G 0 1283 G 0 1284 A 0 1285 U 1308 1286 U 1307 1287 G 1306 1288 A 1305 1289 G 1304 1290 G 1303 1291 G 1302 1292 C 1301 1293 U 0 1294 G 0 1295 C 0 1296 A 0 1297 A 0 1298 U 0 1299 U 0 1300 C 0 1301 G 1292 1302 U 1291 1303 C 1290 1304 C 1289 1305 U 1288 1306 C 1287 1307 A 1286 1308 U 1285 1309 G 0 1310 A 0 1311 A 0 1312 G 1281 1313 C 0 1314 U 0 1315 G 0 1316 G 0 1317 A 0 1318 A 942 1319 U 941 1320 C 940 1321 A 939 1322 C 938 1323 U 937 1324 A 0 1325 G 0 1326 U 0 1327 A 0 1328 A 1351 1329 U 1350 1330 C 1349 1331 G 1348 1332 C 1347 1333 G 1346 1334 A 1345 1335 A 1344 1336 U 0 1337 C 0 1338 A 0 1339 G 0 1340 C 0 1341 U 0 1342 A 0 1343 U 0 1344 G 1335 1345 U 1334 1346 C 1333 1347 G 1332 1348 C 1331 1349 G 1330 1350 G 1329 1351 U 1328 1352 G 0 1353 A 0 1354 A 0 1355 U 0 1356 A 0 1357 C 0 1358 G 935 1359 U 934 1360 U 0 1361 C 0 1362 U 0 1363 C 932 1364 G 931 1365 G 930 1366 G 929 1367 U 928 1368 C 927 1369 U 926 1370 U 924 1371 G 923 1372 U 922 1373 A 0 1374 C 921 1375 A 920 1376 C 0 1377 A 0 1378 C 1485 1379 C 0 1380 G 1482 1381 C 1481 1382 C 0 1383 C 1478 1384 G 1477 1385 U 0 1386 C 0 1387 A 0 1388 A 1472 1389 A 1471 1390 C 1470 1391 U 1469 1392 A 1468 1393 U 1467 1394 G 1466 1395 A 1465 1396 A 0 1397 A 0 1398 G 1462 1399 C 1461 1400 U 1460 1401 G 1459 1402 G 1458 1403 U 1457 1404 A 1456 1405 A 1455 1406 U 1454 1407 A 1453 1408 U 1452 1409 U 1451 1410 U 0 1411 A 0 1412 A 0 1413 A 0 1414 A 1447 1415 A 1446 1416 C 1445 1417 G 1444 1418 U 1443 1419 G 1442 1420 U 0 1421 U 1441 1422 G 1440 1423 C 1439 1424 U 1438 1425 A 0 1426 A 0 1427 C 1436 1428 C 1435 1429 U 0 1430 U 0 1431 U 0 1432 A 0 1433 U 0 1434 U 0 1435 G 1428 1436 G 1427 1437 A 0 1438 A 1424 1439 G 1423 1440 C 1422 1441 G 1421 1442 C 1419 1443 A 1418 1444 U 1417 1445 G 1416 1446 U 1415 1447 C 1414 1448 A 0 1449 A 0 1450 G 0 1451 G 1409 1452 A 1408 1453 U 1407 1454 A 1406 1455 G 1405 1456 C 1404 1457 A 1403 1458 C 1402 1459 C 1401 1460 G 1400 1461 G 1399 1462 U 1398 1463 G 0 1464 A 0 1465 U 1395 1466 U 1394 1467 G 1393 1468 G 1392 1469 A 1391 1470 G 1390 1471 U 1389 1472 U 1388 1473 A 0 1474 A 0 1475 G 0 1476 U 0 1477 C 1384 1478 G 1383 1479 U 0 1480 A 0 1481 A 1381 1482 C 1380 1483 A 0 1484 A 0 1485 G 1378 1486 G 0 1487 U 1510 1488 A 1509 1489 C 1508 1490 C 1507 1491 C 1506 1492 C 1505 1493 U 1504 1494 A 1503 1495 C 1502 1496 G 1501 1497 A 0 1498 G 0 1499 A 0 1500 A 0 1501 C 1496 1502 G 1495 1503 U 1494 1504 G 1493 1505 G 1492 1506 G 1491 1507 G 1490 1508 G 1489 1509 U 1488 1510 G 1487 1511 G 0 1512 A 0 1513 U 0 1514 C 0 1515 A 0 1516 C 0 1517 C 0 1518 U 0 1519 C 0