Filename: d.16.b.M.pneumoniae.bpseq Organism: Mycoplasma pneumoniae Accession Number: M29061 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 U 0 2 U 0 3 U 0 4 U 0 5 C 0 6 U 0 7 G 0 8 A 0 9 G 25 10 A 24 11 G 23 12 U 22 13 U 21 14 U 0 15 G 0 16 A 0 17 U 912 18 C 911 19 C 910 20 U 0 21 G 13 22 G 12 23 C 11 24 U 10 25 C 9 26 A 0 27 G 553 28 G 552 29 A 551 30 U 550 31 U 0 32 A 549 33 A 548 34 C 547 35 G 546 36 C 545 37 U 544 38 G 0 39 G 398 40 C 397 41 G 396 42 G 395 43 C 394 44 A 393 45 U 391 46 G 390 47 C 356 48 C 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 U 354 53 A 353 54 C 352 55 A 0 56 U 351 57 G 350 58 C 349 59 A 0 60 A 0 61 G 90 62 U 89 63 C 88 64 G 0 65 A 0 66 U 87 67 C 86 68 G 85 69 A 84 70 A 83 71 A 82 72 G 81 73 U 80 74 A 79 75 G 0 76 U 0 77 A 0 78 A 0 79 U 74 80 A 73 81 C 72 82 U 71 83 U 70 84 U 69 85 A 68 86 G 67 87 A 66 88 G 63 89 G 62 90 C 61 91 G 0 92 A 0 93 A 0 94 C 0 95 G 0 96 G 0 97 G 309 98 U 308 99 G 307 100 A 0 101 G 0 102 U 0 103 A 0 104 A 0 105 C 0 106 A 234 107 C 233 108 G 232 109 U 231 110 A 230 111 U 229 112 C 228 113 C 227 114 A 0 115 A 0 116 U 226 117 C 225 118 U 0 119 A 0 120 C 0 121 C 222 122 U 221 123 U 220 124 A 219 125 U 218 126 A 217 127 A 216 128 U 0 129 G 163 130 G 162 131 G 161 132 G 160 133 G 0 134 A 0 135 U 0 136 A 0 137 A 154 138 C 153 139 U 152 140 A 151 141 G 150 142 U 149 143 U 148 144 G 0 145 A 0 146 A 0 147 A 0 148 G 143 149 A 142 150 C 141 151 U 140 152 A 139 153 G 138 154 C 137 155 U 0 156 A 0 157 A 0 158 U 0 159 A 0 160 C 132 161 C 131 162 G 130 163 C 129 164 A 0 165 U 0 166 A 0 167 A 0 168 G 0 169 A 194 170 A 193 171 C 192 172 U 191 173 U 190 174 U 189 175 G 188 176 G 187 177 U 186 178 U 185 179 C 184 180 G 0 181 C 0 182 A 0 183 U 0 184 G 179 185 A 178 186 A 177 187 U 176 188 C 175 189 A 174 190 A 173 191 A 172 192 G 171 193 U 170 194 U 169 195 G 0 196 A 0 197 A 0 198 A 0 199 G 214 200 G 213 201 A 212 202 C 211 203 C 210 204 U 209 205 G 0 206 C 0 207 A 0 208 A 0 209 G 204 210 G 203 211 G 202 212 U 201 213 U 200 214 C 199 215 G 0 216 U 127 217 U 126 218 A 125 219 U 124 220 U 123 221 U 122 222 G 121 223 A 0 224 U 0 225 G 117 226 A 116 227 G 113 228 G 112 229 G 111 230 U 110 231 G 109 232 C 108 233 G 107 234 C 106 235 C 281 236 A 280 237 U 279 238 A 0 239 U 0 240 C 278 241 A 0 242 G 272 243 C 271 244 U 270 245 A 0 246 G 0 247 U 269 248 U 268 249 G 267 250 G 266 251 U 265 252 G 264 253 G 263 254 G 262 255 G 0 256 U 0 257 A 0 258 A 0 259 C 0 260 G 0 261 G 0 262 C 254 263 C 253 264 U 252 265 A 251 266 C 250 267 C 249 268 A 248 269 A 247 270 G 244 271 G 243 272 C 242 273 A 0 274 A 0 275 U 0 276 G 0 277 A 0 278 C 240 279 G 237 280 U 236 281 G 235 282 U 0 283 A 0 284 G 306 285 C 305 286 U 304 287 A 303 288 U 299 289 G 298 290 C 297 291 U 296 292 G 0 293 A 0 294 G 0 295 A 0 296 A 291 297 G 290 298 U 289 299 A 288 300 G 0 301 A 0 302 A 0 303 U 287 304 A 286 305 G 285 306 C 284 307 C 99 308 A 98 309 C 97 310 A 0 311 A 332 312 U 331 313 G 330 314 G 329 315 G 328 316 A 327 317 C 0 318 U 0 319 G 0 320 A 0 321 G 0 322 A 0 323 C 0 324 A 0 325 C 0 326 G 0 327 G 316 328 C 315 329 C 314 330 C 313 331 A 312 332 U 311 333 A 0 334 C 345 335 U 344 336 C 343 337 C 342 338 U 0 339 A 0 340 C 0 341 G 0 342 G 337 343 G 336 344 A 335 345 G 334 346 N 0 347 C 0 348 A 0 349 G 58 350 C 57 351 A 56 352 G 54 353 U 53 354 A 52 355 G 0 356 G 47 357 G 0 358 A 0 359 A 0 360 U 0 361 U 0 362 U 388 363 U 0 364 U 387 365 C 386 366 A 385 367 C 0 368 A 0 369 A 0 370 U 383 371 G 382 372 A 381 373 G 380 374 C 379 375 G 0 376 A 0 377 A 0 378 A 0 379 G 374 380 C 373 381 U 372 382 U 371 383 G 370 384 A 0 385 U 366 386 G 365 387 G 364 388 A 362 389 G 0 390 C 46 391 A 45 392 A 0 393 U 44 394 G 43 395 C 42 396 C 41 397 G 40 398 C 39 399 G 0 400 U 0 401 G 432 402 A 431 403 A 430 404 C 429 405 G 0 406 A 0 407 U 0 408 G 0 409 A 0 410 A 0 411 G 423 412 G 422 413 U 421 414 C 420 415 U 0 416 U 0 417 U 0 418 A 0 419 A 0 420 G 414 421 A 413 422 U 412 423 U 411 424 G 0 425 U 0 426 A 0 427 A 0 428 A 0 429 G 404 430 U 403 431 U 402 432 C 401 433 A 0 434 U 493 435 U 0 436 U 494 437 A 490 438 U 0 439 U 0 440 U 486 441 G 485 442 G 484 443 G 0 444 A 0 445 A 0 446 G 479 447 A 0 448 A 0 449 U 0 450 G 0 451 A 0 452 C 473 453 U 472 454 U 471 455 U 470 456 A 469 457 G 468 458 C 467 459 A 0 460 G 0 461 G 0 462 U 0 463 A 0 464 A 0 465 U 0 466 G 0 467 G 458 468 C 457 469 U 456 470 A 455 471 G 454 472 A 453 473 G 452 474 U 0 475 U 0 476 U 0 477 G 0 478 A 0 479 C 446 480 U 0 481 G 0 482 U 0 483 A 0 484 C 442 485 C 441 486 A 440 487 U 0 488 U 0 489 U 0 490 U 437 491 G 0 492 A 0 493 A 434 494 U 436 495 A 0 496 A 0 497 G 542 498 U 541 499 G 540 500 A 539 501 C 538 502 G 523 503 A 522 504 C 521 505 U 0 506 A 0 507 A 0 508 C 537 509 U 536 510 A 535 511 U 534 512 G 533 513 U 0 514 G 0 515 C 0 516 C 0 517 A 0 518 G 525 519 C 524 520 A 0 521 G 504 522 U 503 523 C 502 524 G 519 525 C 518 526 G 0 527 G 0 528 U 0 529 A 0 530 A 0 531 U 0 532 A 0 533 C 512 534 A 511 535 U 510 536 A 509 537 G 508 538 G 501 539 U 500 540 C 499 541 G 498 542 C 497 543 A 0 544 A 37 545 G 36 546 C 35 547 G 34 548 U 33 549 U 32 550 A 30 551 U 29 552 C 28 553 C 27 554 G 0 555 G 0 556 A 0 557 U 0 558 U 0 559 U 0 560 A 0 561 U 0 562 U 0 563 G 0 564 G 876 565 G 875 566 C 874 567 G 859 568 U 858 569 A 0 570 A 0 571 A 0 572 G 873 573 C 0 574 A 760 575 A 759 576 G 758 577 C 757 578 G 0 579 C 754 580 A 0 581 G 753 582 G 752 583 C 751 584 G 0 585 G 647 586 A 646 587 U 645 588 U 644 589 G 643 590 A 642 591 A 641 592 A 0 593 A 640 594 G 639 595 U 636 596 C 635 597 U 634 598 G 633 599 G 632 600 U 631 601 G 630 602 U 629 603 U 0 604 A 0 605 A 0 606 A 0 607 G 0 608 G 626 609 C 625 610 A 624 611 G 623 612 C 622 613 U 621 614 G 620 615 C 0 616 U 0 617 U 0 618 A 0 619 A 0 620 C 614 621 A 613 622 G 612 623 U 611 624 U 610 625 G 609 626 U 608 627 A 0 628 U 0 629 G 602 630 C 601 631 A 600 632 U 599 633 U 598 634 G 597 635 G 596 636 A 595 637 A 0 638 A 0 639 C 594 640 U 593 641 A 591 642 U 590 643 U 589 644 A 588 645 A 587 646 U 586 647 C 585 648 U 0 649 A 0 650 G 0 651 A 747 652 G 746 653 U 745 654 G 743 655 U 742 656 G 741 657 G 740 658 U 739 659 A 738 660 G 0 661 G 0 662 G 736 663 A 735 664 G 734 665 U 733 666 U 732 667 U 731 668 U 730 669 G 713 670 G 712 671 A 0 672 A 0 673 U 709 674 U 708 675 U 707 676 C 706 677 A 705 678 U 704 679 G 703 680 U 702 681 G 0 682 G 0 683 A 0 684 G 695 685 C 694 686 G 693 687 G 0 688 U 0 689 G 0 690 A 0 691 A 0 692 A 0 693 U 686 694 G 685 695 C 684 696 G 0 697 U 0 698 A 0 699 G 0 700 A 0 701 U 0 702 A 680 703 U 679 704 A 678 705 U 677 706 G 676 707 A 675 708 A 674 709 G 673 710 G 0 711 A 0 712 A 670 713 C 669 714 A 0 715 C 0 716 C 0 717 A 0 718 G 729 719 U 0 720 G 0 721 G 728 722 C 727 723 G 0 724 A 0 725 A 0 726 G 0 727 G 722 728 C 721 729 G 718 730 A 668 731 A 667 732 A 666 733 A 665 734 C 664 735 U 663 736 U 662 737 A 0 738 G 659 739 G 658 740 C 657 741 C 656 742 A 655 743 U 654 744 U 0 745 A 653 746 C 652 747 U 651 748 G 0 749 A 0 750 C 0 751 G 583 752 C 582 753 U 581 754 U 579 755 A 0 756 G 0 757 G 577 758 C 576 759 U 575 760 U 574 761 G 0 762 A 0 763 A 0 764 A 0 765 G 806 766 U 805 767 G 804 768 U 803 769 G 802 770 G 801 771 G 0 772 N 0 773 A 0 774 G 800 775 C 799 776 A 0 777 A 0 778 A 0 779 U 795 780 A 794 781 G 793 782 G 792 783 A 0 784 U 0 785 U 0 786 A 0 787 G 0 788 A 0 789 U 0 790 A 0 791 C 0 792 C 782 793 C 781 794 U 780 795 A 779 796 G 0 797 U 0 798 A 0 799 G 775 800 U 774 801 C 770 802 C 769 803 A 768 804 C 767 805 A 766 806 C 765 807 C 0 808 G 0 809 U 0 810 A 0 811 A 0 812 A 0 813 C 0 814 G 0 815 A 0 816 U 0 817 A 872 818 G 871 819 A 870 820 U 869 821 A 868 822 C 867 823 U 0 824 A 0 825 G 850 826 C 849 827 U 848 828 G 847 829 U 846 830 C 845 831 G 844 832 G 843 833 G 842 834 G 841 835 C 0 836 G 0 837 A 0 838 U 0 839 C 0 840 C 0 841 C 834 842 C 833 843 U 832 844 C 831 845 G 830 846 G 829 847 U 828 848 A 827 849 G 826 850 U 825 851 G 0 852 A 0 853 A 0 854 G 861 855 U 860 856 U 0 857 A 0 858 A 568 859 C 567 860 A 855 861 C 854 862 A 0 863 U 0 864 U 0 865 A 0 866 A 0 867 G 822 868 U 821 869 A 820 870 U 819 871 C 818 872 U 817 873 C 572 874 G 566 875 C 565 876 C 564 877 U 0 878 G 905 879 G 904 880 G 903 881 U 0 882 A 0 883 G 0 884 U 0 885 A 0 886 C 0 887 A 898 888 U 897 889 U 896 890 C 895 891 G 0 892 C 0 893 A 0 894 A 0 895 G 890 896 A 889 897 A 888 898 U 887 899 G 0 900 A 0 901 A 0 902 A 0 903 C 880 904 U 879 905 C 878 906 A 0 907 A 0 908 A 0 909 C 0 910 G 19 911 G 18 912 A 17 913 A 0 914 U 0 915 U 1370 916 G 1369 917 A 1367 918 C 1366 919 G 1365 920 G 0 921 G 1364 922 G 1363 923 A 1362 924 C 1361 925 C 1360 926 C 1359 927 G 1358 928 C 0 929 A 1354 930 C 1353 931 A 0 932 A 0 933 G 1317 934 U 1316 935 G 1315 936 G 1314 937 U 1313 938 G 1211 939 G 1210 940 A 1209 941 G 1208 942 C 1207 943 A 1206 944 U 1205 945 G 1204 946 U 1203 947 U 1202 948 G 1200 949 C 1199 950 U 0 951 U 0 952 A 0 953 A 0 954 U 969 955 U 968 956 C 967 957 G 966 958 A 0 959 C 0 960 G 0 961 G 0 962 U 0 963 A 0 964 C 0 965 A 0 966 C 957 967 G 956 968 A 955 969 A 954 970 A 0 971 A 0 972 A 0 973 C 0 974 C 0 975 U 0 976 U 0 977 A 0 978 C 1195 979 C 1194 980 U 1193 981 A 1192 982 G 1191 983 A 1190 984 C 1189 985 U 0 986 U 0 987 G 0 988 A 0 989 C 0 990 A 1035 991 U 1034 992 C 1033 993 C 1031 994 U 1030 995 U 1029 996 G 1028 997 G 1027 998 C 0 999 A 0 1000 A 0 1001 A 1018 1002 G 1017 1003 U 1016 1004 U 1015 1005 A 1014 1006 U 1013 1007 G 1012 1008 G 0 1009 A 0 1010 A 0 1011 A 0 1012 C 1007 1013 A 1006 1014 U 1005 1015 A 1004 1016 A 1003 1017 U 1002 1018 G 1001 1019 G 0 1020 A 0 1021 G 0 1022 G 0 1023 U 0 1024 U 0 1025 A 0 1026 A 0 1027 C 997 1028 C 996 1029 G 995 1030 A 994 1031 G 993 1032 U 0 1033 G 992 1034 A 991 1035 C 990 1036 A 0 1037 G 1184 1038 G 1183 1039 U 0 1040 G 1182 1041 G 1181 1042 U 1180 1043 G 1179 1044 C 0 1045 A 0 1046 U 1178 1047 G 1177 1048 G 1173 1049 U 1172 1050 U 1171 1051 G 1169 1052 U 1168 1053 C 1167 1054 G 1166 1055 U 0 1056 C 0 1057 A 0 1058 G 1097 1059 C 1096 1060 U 1095 1061 C 1094 1062 G 1093 1063 U 1092 1064 G 1073 1065 U 1072 1066 C 1071 1067 G 0 1068 U 0 1069 G 0 1070 A 0 1071 G 1066 1072 A 1065 1073 U 1064 1074 G 0 1075 U 0 1076 U 1089 1077 G 1088 1078 G 1087 1079 G 1086 1080 U 0 1081 U 0 1082 A 0 1083 A 0 1084 G 0 1085 U 0 1086 C 1079 1087 C 1078 1088 C 1077 1089 G 1076 1090 C 0 1091 A 0 1092 A 1063 1093 C 1062 1094 G 1061 1095 A 1060 1096 G 1059 1097 C 1058 1098 G 0 1099 C 0 1100 A 0 1101 A 0 1102 C 0 1103 C 1161 1104 C 1160 1105 U 1159 1106 U 1158 1107 A 0 1108 U 1130 1109 C 1129 1110 G 1128 1111 U 1127 1112 U 1126 1113 A 1125 1114 G 1124 1115 U 0 1116 U 0 1117 A 0 1118 C 0 1119 A 0 1120 U 0 1121 U 0 1122 G 0 1123 U 0 1124 C 1114 1125 U 1113 1126 A 1112 1127 G 1111 1128 C 1110 1129 G 1109 1130 A 1108 1131 G 0 1132 A 0 1133 C 1152 1134 U 1151 1135 G 1150 1136 C 1149 1137 U 1148 1138 A 1147 1139 A 1146 1140 U 1145 1141 G 0 1142 C 0 1143 A 0 1144 A 0 1145 A 1140 1146 U 1139 1147 U 1138 1148 G 1137 1149 G 1136 1150 A 1135 1151 G 1134 1152 G 1133 1153 A 0 1154 A 0 1155 G 0 1156 G 0 1157 A 0 1158 A 1106 1159 G 1105 1160 G 1104 1161 G 1103 1162 A 0 1163 U 0 1164 G 0 1165 A 0 1166 C 1054 1167 G 1053 1168 U 1052 1169 C 1051 1170 A 0 1171 A 1050 1172 A 1049 1173 U 1048 1174 C 0 1175 A 0 1176 U 0 1177 C 1047 1178 A 1046 1179 U 1043 1180 G 1042 1181 C 1041 1182 C 1040 1183 C 1038 1184 C 1037 1185 U 0 1186 U 0 1187 A 0 1188 U 0 1189 G 984 1190 U 983 1191 C 982 1192 U 981 1193 A 980 1194 G 979 1195 G 978 1196 G 0 1197 C 0 1198 U 0 1199 G 949 1200 C 948 1201 A 0 1202 A 947 1203 A 946 1204 C 945 1205 G 944 1206 U 943 1207 G 942 1208 C 941 1209 U 940 1210 A 939 1211 C 938 1212 A 0 1213 A 0 1214 U 0 1215 G 1269 1216 G 1268 1217 C 1267 1218 C 1266 1219 A 1265 1220 A 1264 1221 U 1263 1222 A 0 1223 C 0 1224 A 0 1225 A 0 1226 A 0 1227 C 1258 1228 A 1257 1229 G 1256 1230 U 0 1231 C 0 1232 G 1251 1233 C 1250 1234 C 0 1235 A 0 1236 G 0 1237 C 1246 1238 U 1245 1239 U 1244 1240 G 0 1241 U 0 1242 A 0 1243 A 0 1244 A 1239 1245 A 1238 1246 G 1237 1247 U 0 1248 G 0 1249 A 0 1250 G 1233 1251 C 1232 1252 A 0 1253 A 0 1254 A 0 1255 U 0 1256 C 1229 1257 U 1228 1258 G 1227 1259 U 0 1260 A 0 1261 A 0 1262 A 0 1263 G 1221 1264 U 1220 1265 U 1219 1266 G 1218 1267 G 1217 1268 U 1216 1269 C 1215 1270 U 0 1271 C 0 1272 A 0 1273 G 0 1274 U 0 1275 U 0 1276 C 1307 1277 G 0 1278 G 0 1279 A 0 1280 U 1303 1281 U 1302 1282 G 1301 1283 A 1300 1284 G 1299 1285 G 1298 1286 G 1297 1287 C 1296 1288 U 0 1289 G 0 1290 C 0 1291 A 0 1292 A 0 1293 U 0 1294 U 0 1295 C 0 1296 G 1287 1297 U 1286 1298 C 1285 1299 C 1284 1300 U 1283 1301 C 1282 1302 A 1281 1303 U 1280 1304 G 0 1305 A 0 1306 A 0 1307 G 1276 1308 U 0 1309 C 0 1310 G 0 1311 G 0 1312 A 0 1313 A 937 1314 U 936 1315 C 935 1316 A 934 1317 C 933 1318 U 0 1319 A 0 1320 G 0 1321 U 0 1322 A 0 1323 A 1346 1324 U 1345 1325 C 1344 1326 G 1343 1327 C 1342 1328 G 1341 1329 A 1340 1330 A 1339 1331 U 0 1332 C 0 1333 A 0 1334 G 0 1335 C 0 1336 U 0 1337 A 0 1338 U 0 1339 G 1330 1340 U 1329 1341 C 1328 1342 G 1327 1343 C 1326 1344 G 1325 1345 G 1324 1346 U 1323 1347 G 0 1348 A 0 1349 A 0 1350 U 0 1351 A 0 1352 C 0 1353 G 930 1354 U 929 1355 U 0 1356 C 0 1357 U 0 1358 C 927 1359 G 926 1360 G 925 1361 G 924 1362 U 923 1363 C 922 1364 U 921 1365 U 919 1366 G 918 1367 U 917 1368 A 0 1369 C 916 1370 A 915 1371 C 0 1372 A 0 1373 C 1478 1374 C 0 1375 G 1475 1376 C 1474 1377 C 0 1378 C 1471 1379 G 1470 1380 U 0 1381 C 1468 1382 A 0 1383 A 1465 1384 A 1464 1385 C 1463 1386 U 1462 1387 A 1461 1388 U 1460 1389 G 1459 1390 A 1458 1391 A 0 1392 A 0 1393 G 1455 1394 C 1454 1395 U 1453 1396 G 1452 1397 G 1451 1398 U 1450 1399 A 1449 1400 A 1448 1401 U 1447 1402 A 1446 1403 U 1445 1404 U 1444 1405 U 0 1406 A 0 1407 A 0 1408 A 0 1409 A 1440 1410 A 1439 1411 C 1438 1412 G 1437 1413 U 1436 1414 G 1435 1415 U 0 1416 U 1434 1417 G 1433 1418 C 1432 1419 U 1431 1420 A 0 1421 A 0 1422 C 1429 1423 C 1428 1424 A 0 1425 U 0 1426 U 0 1427 A 0 1428 G 1423 1429 G 1422 1430 A 0 1431 A 1419 1432 G 1418 1433 C 1417 1434 G 1416 1435 C 1414 1436 A 1413 1437 U 1412 1438 G 1411 1439 U 1410 1440 C 1409 1441 A 0 1442 A 0 1443 G 0 1444 G 1404 1445 A 1403 1446 U 1402 1447 A 1401 1448 G 1400 1449 C 1399 1450 A 1398 1451 C 1397 1452 C 1396 1453 G 1395 1454 G 1394 1455 U 1393 1456 G 0 1457 A 0 1458 U 1390 1459 U 1389 1460 G 1388 1461 G 1387 1462 A 1386 1463 G 1385 1464 N 1384 1465 N 1383 1466 N 0 1467 N 0 1468 N 1381 1469 N 0 1470 N 1379 1471 N 1378 1472 N 0 1473 N 0 1474 N 1376 1475 N 1375 1476 N 0 1477 N 0 1478 N 1373 1479 N 0 1480 N 1503 1481 N 1502 1482 N 1501 1483 N 1500 1484 N 1499 1485 N 1498 1486 N 1497 1487 N 1496 1488 N 1495 1489 N 1494 1490 N 0 1491 N 0 1492 N 0 1493 N 0 1494 N 1489 1495 N 1488 1496 N 1487 1497 N 1486 1498 N 1485 1499 N 1484 1500 N 1483 1501 N 1482 1502 N 1481 1503 N 1480 1504 N 0 1505 N 0 1506 N 0 1507 N 0 1508 N 0 1509 N 0 1510 N 0 1511 N 0 1512 N 0 1513 N 0 1514 N 0 1515 N 0 1516 N 0