Filename: d.16.b.P.Schlesner.bpseq Organism: Planctomycetaceae Schlesner 670 Accession Number: X81948 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 N 0 3 N 0 4 N 0 5 N 0 6 N 0 7 N 0 8 N 0 9 N 25 10 N 24 11 N 23 12 N 22 13 N 21 14 N 0 15 N 0 16 N 0 17 N 889 18 C 888 19 C 887 20 U 0 21 G 13 22 G 12 23 C 11 24 U 10 25 C 9 26 A 0 27 G 526 28 A 525 29 A 524 30 U 523 31 G 0 32 A 522 33 A 521 34 C 520 35 G 519 36 U 518 37 U 517 38 G 0 39 G 376 40 C 375 41 G 374 42 G 373 43 C 372 44 G 371 45 U 369 46 G 368 47 G 334 48 A 0 49 U 0 50 U 0 51 A 0 52 G 332 53 G 331 54 C 330 55 A 0 56 U 329 57 G 328 58 C 327 59 A 0 60 A 0 61 G 90 62 U 89 63 C 88 64 G 0 65 A 0 66 G 87 67 C 86 68 G 85 69 G 0 70 A 0 71 G 82 72 U 81 73 C 80 74 A 79 75 G 0 76 C 0 77 A 0 78 A 0 79 U 74 80 G 73 81 A 72 82 C 71 83 C 0 84 G 0 85 A 68 86 G 67 87 C 66 88 G 63 89 G 62 90 C 61 91 G 0 92 A 0 93 A 0 94 A 0 95 G 0 96 G 0 97 G 287 98 A 286 99 G 285 100 A 0 101 G 0 102 G 0 103 A 0 104 A 0 105 A 0 106 A 212 107 C 211 108 U 210 109 U 209 110 A 208 111 G 207 112 G 206 113 U 205 114 A 0 115 C 204 116 C 203 117 U 0 118 G 0 119 C 0 120 C 200 121 U 199 122 C 198 123 U 197 124 A 196 125 G 195 126 G 194 127 A 0 128 C 162 129 C 161 130 G 160 131 G 159 132 G 0 133 A 0 134 U 0 135 A 0 136 G 153 137 C 152 138 C 151 139 A 150 140 A 149 141 G 148 142 G 147 143 G 0 144 A 0 145 A 0 146 A 0 147 C 142 148 U 141 149 U 140 150 U 139 151 G 138 152 G 137 153 G 136 154 U 0 155 A 0 156 A 0 157 U 0 158 A 0 159 C 131 160 C 130 161 G 129 162 G 128 163 A 0 164 U 0 165 G 0 166 U 0 167 G 0 168 G 177 169 U 176 170 C 175 171 U 0 172 C 0 173 C 0 174 G 0 175 G 170 176 A 169 177 U 168 178 C 0 179 A 0 180 A 0 181 A 0 182 G 192 183 G 191 184 U 0 185 G 0 186 U 0 187 G 0 188 A 0 189 U 0 190 U 0 191 C 183 192 C 182 193 G 0 194 C 126 195 C 125 196 U 124 197 G 123 198 G 122 199 A 121 200 G 120 201 A 0 202 G 0 203 G 116 204 G 115 205 G 113 206 C 112 207 C 111 208 U 110 209 G 109 210 A 108 211 G 107 212 U 106 213 C 259 214 C 258 215 U 257 216 A 0 217 U 0 218 C 256 219 A 0 220 G 250 221 C 249 222 U 248 223 A 0 224 G 0 225 U 247 226 U 246 227 G 245 228 G 244 229 U 243 230 G 242 231 A 241 232 G 240 233 G 0 234 U 0 235 A 0 236 A 0 237 U 0 238 G 0 239 G 0 240 C 232 241 U 231 242 C 230 243 A 229 244 C 228 245 C 227 246 A 226 247 A 225 248 G 222 249 G 221 250 C 220 251 G 0 252 A 0 253 A 0 254 G 0 255 A 0 256 C 218 257 G 215 258 G 214 259 G 213 260 U 0 261 A 0 262 G 284 263 C 283 264 A 282 265 G 281 266 G 277 267 U 276 268 G 275 269 U 274 270 G 0 271 A 0 272 G 0 273 A 0 274 G 269 275 C 268 276 A 267 277 C 266 278 G 0 279 A 0 280 C 0 281 C 265 282 U 264 283 G 263 284 C 262 285 C 99 286 U 98 287 C 97 288 A 0 289 C 310 290 U 309 291 G 308 292 G 307 293 G 306 294 A 305 295 C 0 296 U 0 297 G 0 298 A 0 299 G 0 300 A 0 301 U 0 302 A 0 303 C 0 304 U 0 305 G 294 306 C 293 307 C 292 308 C 291 309 A 290 310 G 289 311 A 0 312 C 323 313 A 322 314 C 321 315 C 320 316 U 0 317 A 0 318 C 0 319 G 0 320 G 315 321 G 314 322 U 313 323 G 312 324 G 0 325 C 0 326 U 0 327 G 58 328 C 57 329 A 56 330 G 54 331 U 53 332 C 52 333 G 0 334 A 47 335 G 0 336 A 0 337 A 0 338 U 0 339 C 0 340 U 366 341 U 0 342 U 365 343 G 364 344 G 363 345 C 0 346 A 0 347 A 0 348 U 361 349 G 360 350 G 359 351 G 358 352 G 357 353 G 0 354 C 0 355 A 0 356 A 0 357 C 352 358 C 351 359 C 350 360 U 349 361 G 348 362 A 0 363 C 344 364 C 343 365 A 342 366 A 340 367 G 0 368 C 46 369 G 45 370 A 0 371 C 44 372 G 43 373 C 42 374 C 41 375 G 40 376 C 39 377 G 0 378 U 0 379 G 409 380 C 408 381 G 407 382 G 406 383 G 0 384 A 0 385 U 0 386 G 0 387 A 0 388 A 0 389 G 400 390 G 399 391 C 398 392 C 397 393 U 0 394 U 0 395 C 0 396 G 0 397 G 392 398 G 391 399 U 390 400 U 389 401 G 0 402 U 0 403 A 0 404 A 0 405 A 0 406 C 382 407 C 381 408 G 380 409 C 379 410 U 0 411 U 466 412 U 0 413 U 467 414 C 463 415 U 462 416 A 461 417 G 0 418 G 460 419 G 459 420 G 0 421 A 0 422 U 0 423 G 454 424 A 0 425 A 0 426 G 0 427 U 0 428 G 449 429 C 448 430 C 447 431 A 446 432 G 445 433 G 444 434 G 443 435 G 442 436 G 441 437 U 0 438 U 0 439 C 0 440 U 0 441 C 436 442 C 435 443 C 434 444 C 433 445 U 432 446 U 431 447 G 430 448 G 429 449 U 428 450 U 0 451 U 0 452 G 0 453 A 0 454 C 423 455 A 0 456 G 0 457 A 0 458 U 0 459 C 419 460 U 418 461 U 416 462 A 415 463 G 414 464 G 0 465 A 0 466 A 411 467 U 413 468 A 0 469 A 0 470 G 515 471 C 514 472 U 513 473 C 512 474 G 511 475 G 496 476 G 495 477 C 494 478 U 0 479 A 0 480 A 0 481 G 510 482 U 509 483 U 508 484 C 507 485 G 506 486 U 0 487 G 0 488 C 0 489 C 0 490 A 0 491 G 498 492 C 497 493 A 0 494 G 477 495 C 476 496 C 475 497 G 492 498 C 491 499 G 0 500 G 0 501 U 0 502 A 0 503 A 0 504 G 0 505 A 0 506 C 485 507 G 484 508 A 483 509 A 482 510 C 481 511 C 474 512 G 473 513 A 472 514 G 471 515 C 470 516 G 0 517 A 37 518 A 36 519 C 35 520 G 34 521 U 33 522 U 32 523 A 30 524 U 29 525 U 28 526 C 27 527 G 0 528 G 0 529 A 0 530 A 0 531 U 0 532 U 0 533 A 0 534 C 0 535 U 0 536 G 0 537 G 854 538 G 853 539 C 852 540 U 837 541 U 836 542 A 0 543 A 0 544 A 0 545 G 851 546 G 0 547 G 734 548 U 733 549 G 732 550 C 731 551 G 0 552 U 728 553 A 0 554 G 727 555 G 726 556 C 725 557 G 0 558 G 621 559 C 620 560 G 619 561 U 618 562 G 617 563 G 616 564 U 615 565 A 0 566 A 614 567 G 613 568 U 610 569 G 609 570 G 608 571 G 607 572 G 606 573 U 605 574 G 604 575 U 603 576 G 602 577 A 0 578 A 0 579 A 0 580 G 0 581 C 599 582 C 598 583 C 597 584 U 596 585 C 595 586 A 594 587 G 593 588 C 0 589 U 0 590 C 0 591 A 0 592 A 0 593 C 587 594 U 586 595 G 585 596 A 584 597 G 583 598 G 582 599 A 581 600 A 0 601 C 0 602 A 576 603 G 575 604 C 574 605 G 573 606 C 572 607 U 571 608 C 570 609 C 569 610 A 568 611 A 0 612 A 0 613 C 567 614 U 566 615 A 564 616 C 563 617 C 562 618 A 561 619 C 560 620 G 559 621 C 558 622 U 0 623 C 0 624 G 0 625 A 721 626 G 720 627 G 719 628 G 718 629 A 716 630 G 715 631 A 714 632 C 713 633 A 712 634 G 0 635 A 0 636 G 710 637 G 709 638 U 708 639 C 707 640 A 706 641 G 705 642 U 704 643 G 687 644 G 686 645 A 0 646 A 0 647 C 683 648 U 682 649 U 681 650 C 680 651 G 679 652 G 678 653 G 677 654 U 676 655 G 0 656 G 0 657 A 0 658 G 669 659 C 668 660 G 667 661 G 0 662 U 0 663 G 0 664 A 0 665 A 0 666 A 0 667 U 660 668 G 659 669 U 658 670 G 0 671 U 0 672 U 0 673 G 0 674 A 0 675 U 0 676 A 654 677 U 653 678 C 652 679 C 651 680 G 650 681 A 649 682 A 648 683 G 647 684 G 0 685 A 0 686 A 644 687 C 643 688 A 0 689 C 0 690 C 0 691 G 0 692 G 703 693 U 0 694 G 0 695 G 702 696 C 701 697 G 0 698 A 0 699 A 0 700 A 0 701 G 696 702 C 695 703 G 692 704 A 642 705 C 641 706 U 640 707 G 639 708 A 638 709 C 637 710 U 636 711 G 0 712 G 633 713 G 632 714 U 631 715 C 630 716 U 629 717 C 0 718 U 628 719 U 627 720 C 626 721 U 625 722 G 0 723 A 0 724 C 0 725 G 556 726 C 555 727 U 554 728 G 552 729 A 0 730 G 0 731 G 550 732 C 549 733 A 548 734 C 547 735 G 0 736 A 0 737 A 0 738 A 0 739 G 780 740 C 779 741 U 778 742 A 777 743 G 776 744 G 775 745 G 0 746 U 0 747 A 0 748 G 774 749 C 773 750 G 0 751 A 0 752 A 0 753 C 769 754 G 768 755 G 767 756 G 766 757 A 0 758 U 0 759 U 0 760 A 0 761 G 0 762 A 0 763 U 0 764 A 0 765 C 0 766 C 756 767 C 755 768 C 754 769 G 753 770 G 0 771 U 0 772 A 0 773 G 749 774 U 748 775 C 744 776 C 743 777 U 742 778 A 741 779 G 740 780 C 739 781 C 0 782 U 0 783 U 0 784 A 0 785 A 0 786 A 0 787 C 0 788 G 0 789 A 0 790 U 0 791 G 850 792 A 849 793 G 848 794 C 847 795 A 846 796 C 845 797 U 0 798 G 0 799 G 828 800 A 827 801 U 826 802 C 825 803 G 824 804 A 823 805 A 822 806 G 821 807 G 820 808 G 819 809 A 818 810 U 817 811 U 0 812 C 0 813 C 0 814 C 0 815 A 0 816 U 0 817 G 810 818 U 809 819 C 808 820 C 807 821 U 806 822 U 805 823 U 804 824 U 803 825 G 802 826 G 801 827 U 800 828 C 799 829 G 0 830 C 0 831 A 0 832 C 839 833 U 838 834 G 0 835 A 0 836 A 541 837 A 540 838 A 833 839 A 832 840 G 0 841 U 0 842 U 0 843 A 0 844 A 0 845 G 796 846 U 795 847 G 794 848 C 793 849 U 792 850 C 791 851 C 545 852 G 539 853 C 538 854 C 537 855 U 0 856 G 883 857 G 882 858 G 881 859 G 0 860 A 0 861 G 0 862 U 0 863 A 0 864 U 0 865 G 876 866 G 875 867 C 874 868 C 873 869 G 0 870 C 0 871 A 0 872 A 0 873 G 868 874 G 867 875 C 866 876 U 865 877 G 0 878 A 0 879 A 0 880 A 0 881 C 858 882 U 857 883 C 856 884 A 0 885 A 0 886 A 0 887 G 19 888 G 18 889 A 17 890 A 0 891 U 0 892 U 1373 893 G 1372 894 A 1370 895 C 1369 896 G 1368 897 G 0 898 G 1367 899 G 1366 900 G 1365 901 C 1364 902 U 1363 903 C 1362 904 A 1361 905 C 0 906 A 1357 907 C 1356 908 A 0 909 A 0 910 G 1321 911 C 1320 912 G 1319 913 G 1318 914 U 1317 915 G 1214 916 G 1213 917 A 1212 918 G 1211 919 G 1210 920 A 1209 921 U 1208 922 G 1207 923 U 1206 924 G 1205 925 G 1203 926 C 1202 927 U 0 928 U 0 929 A 0 930 A 0 931 U 946 932 U 945 933 C 944 934 G 943 935 A 0 936 G 0 937 G 0 938 C 0 939 U 0 940 A 0 941 C 0 942 G 0 943 C 934 944 G 933 945 A 932 946 A 931 947 G 0 948 A 0 949 A 0 950 C 0 951 C 0 952 U 0 953 U 0 954 A 0 955 U 0 956 C 1198 957 C 1197 958 U 1196 959 A 1195 960 G 1194 961 U 1193 962 C 1192 963 U 0 964 U 0 965 G 0 966 A 0 967 C 0 968 A 1023 969 U 1022 970 G 1021 971 U 1020 972 A 1019 973 C 1018 974 G 1017 975 G 1016 976 A 1015 977 U 0 978 U 0 979 A 0 980 A 997 981 C 996 982 U 995 983 U 994 984 G 993 985 G 992 986 U 991 987 G 0 988 A 0 989 A 0 990 A 0 991 G 986 992 C 985 993 C 984 994 A 983 995 G 982 996 G 981 997 C 980 998 C 0 999 A 0 1000 C 1013 1001 G 1012 1002 C 1011 1003 U 1010 1004 C 1009 1005 G 0 1006 C 0 1007 A 0 1008 A 0 1009 G 1004 1010 A 1003 1011 G 1002 1012 U 1001 1013 G 1000 1014 G 0 1015 A 976 1016 A 975 1017 C 974 1018 G 973 1019 U 972 1020 G 971 1021 C 970 1022 A 969 1023 C 968 1024 A 0 1025 G 1187 1026 G 1186 1027 U 0 1028 G 1185 1029 C 1184 1030 U 1183 1031 G 1182 1032 C 0 1033 A 0 1034 U 1181 1035 G 1180 1036 G 1176 1037 C 1175 1038 U 1174 1039 G 1172 1040 U 1171 1041 C 1170 1042 G 1169 1043 U 0 1044 C 0 1045 A 0 1046 G 1085 1047 C 1084 1048 U 1083 1049 C 1082 1050 G 1081 1051 U 1080 1052 G 1061 1053 U 1060 1054 C 1059 1055 G 0 1056 U 0 1057 G 0 1058 A 0 1059 G 1054 1060 A 1053 1061 U 1052 1062 G 0 1063 U 0 1064 C 1077 1065 G 1076 1066 G 1075 1067 G 1074 1068 U 0 1069 U 0 1070 A 0 1071 A 0 1072 G 0 1073 U 0 1074 C 1067 1075 C 1066 1076 C 1065 1077 U 1064 1078 U 0 1079 A 0 1080 A 1051 1081 C 1050 1082 G 1049 1083 A 1048 1084 G 1047 1085 C 1046 1086 G 0 1087 A 0 1088 A 0 1089 A 0 1090 C 0 1091 C 1164 1092 C 1163 1093 U 1162 1094 U 1161 1095 G 0 1096 U 1132 1097 C 1131 1098 U 1130 1099 U 1129 1100 U 1128 1101 A 1127 1102 G 1126 1103 U 0 1104 U 0 1105 A 0 1106 C 1121 1107 C 1120 1108 A 0 1109 U 0 1110 C 1119 1111 A 1118 1112 U 0 1113 U 0 1114 C 0 1115 A 0 1116 G 0 1117 U 0 1118 U 1111 1119 G 1110 1120 G 1107 1121 G 1106 1122 G 0 1123 A 0 1124 C 0 1125 U 0 1126 C 1102 1127 U 1101 1128 A 1100 1129 A 1099 1130 A 1098 1131 G 1097 1132 A 1096 1133 G 0 1134 A 0 1135 C 1155 1136 U 1154 1137 G 1153 1138 C 1152 1139 C 1151 1140 G 1150 1141 G 1149 1142 C 1148 1143 G 0 1144 U 0 1145 U 0 1146 A 0 1147 A 0 1148 G 1142 1149 C 1141 1150 C 1140 1151 G 1139 1152 G 1138 1153 A 1137 1154 G 1136 1155 G 1135 1156 A 0 1157 A 0 1158 G 0 1159 G 0 1160 U 0 1161 G 1094 1162 G 1093 1163 G 1092 1164 G 1091 1165 A 0 1166 U 0 1167 G 0 1168 A 0 1169 C 1042 1170 G 1041 1171 U 1040 1172 C 1039 1173 A 0 1174 A 1038 1175 G 1037 1176 U 1036 1177 C 0 1178 C 0 1179 U 0 1180 C 1035 1181 A 1034 1182 U 1031 1183 G 1030 1184 G 1029 1185 C 1028 1186 C 1026 1187 U 1025 1188 U 0 1189 U 0 1190 A 0 1191 U 0 1192 G 962 1193 A 961 1194 C 960 1195 U 959 1196 A 958 1197 G 957 1198 G 956 1199 G 0 1200 C 0 1201 U 0 1202 G 926 1203 C 925 1204 A 0 1205 C 924 1206 A 923 1207 C 922 1208 G 921 1209 U 920 1210 C 919 1211 C 918 1212 U 917 1213 A 916 1214 C 915 1215 A 0 1216 A 0 1217 U 0 1218 G 1273 1219 G 1272 1220 U 1271 1221 U 1270 1222 U 1269 1223 G 1268 1224 U 1267 1225 A 0 1226 C 0 1227 A 0 1228 G 0 1229 A 0 1230 G 1261 1231 C 1260 1232 G 1259 1233 A 0 1234 C 0 1235 G 1254 1236 C 1253 1237 A 0 1238 A 0 1239 A 0 1240 C 1249 1241 U 1248 1242 C 1247 1243 G 0 1244 U 0 1245 G 0 1246 A 0 1247 G 1242 1248 A 1241 1249 G 1240 1250 C 0 1251 C 0 1252 A 0 1253 G 1236 1254 C 1235 1255 A 0 1256 A 0 1257 A 0 1258 U 0 1259 C 1232 1260 G 1231 1261 C 1230 1262 A 0 1263 A 0 1264 A 0 1265 A 0 1266 A 0 1267 G 1224 1268 C 1223 1269 A 1222 1270 A 1221 1271 A 1220 1272 C 1219 1273 C 1218 1274 U 0 1275 C 0 1276 A 0 1277 G 0 1278 U 0 1279 A 0 1280 C 1311 1281 G 0 1282 G 0 1283 A 0 1284 U 1307 1285 U 1306 1286 G 1305 1287 C 1304 1288 A 1303 1289 G 1302 1290 G 1301 1291 C 1300 1292 U 0 1293 G 0 1294 C 0 1295 A 0 1296 A 0 1297 C 0 1298 U 0 1299 C 0 1300 G 1291 1301 C 1290 1302 C 1289 1303 U 1288 1304 G 1287 1305 C 1286 1306 A 1285 1307 U 1284 1308 G 0 1309 A 0 1310 A 0 1311 G 1280 1312 C 0 1313 U 0 1314 G 0 1315 G 0 1316 A 0 1317 A 914 1318 U 913 1319 C 912 1320 G 911 1321 C 910 1322 U 0 1323 A 0 1324 G 0 1325 U 0 1326 A 0 1327 A 1349 1328 U 1348 1329 C 1347 1330 G 1346 1331 G 1345 1332 G 1344 1333 G 1343 1334 G 1342 1335 U 0 1336 C 0 1337 A 0 1338 G 0 1339 C 0 1340 A 0 1341 U 0 1342 A 1334 1343 C 1333 1344 C 1332 1345 C 1331 1346 C 1330 1347 G 1329 1348 G 1328 1349 U 1327 1350 G 0 1351 A 0 1352 A 0 1353 U 0 1354 G 0 1355 U 0 1356 G 907 1357 U 906 1358 U 0 1359 C 0 1360 C 0 1361 U 904 1362 G 903 1363 A 902 1364 G 901 1365 C 900 1366 C 899 1367 U 898 1368 U 896 1369 G 895 1370 U 894 1371 A 0 1372 C 893 1373 A 892 1374 C 0 1375 A 0 1376 C 1481 1377 C 0 1378 G 1478 1379 C 1477 1380 C 0 1381 C 1474 1382 G 1473 1383 U 0 1384 C 0 1385 A 0 1386 A 1468 1387 G 1467 1388 C 1466 1389 C 1465 1390 A 1464 1391 C 1463 1392 G 1462 1393 G 1461 1394 G 0 1395 A 0 1396 G 1458 1397 U 1457 1398 G 1456 1399 G 1455 1400 G 1454 1401 G 1453 1402 G 1452 1403 G 1451 1404 N 1450 1405 A 1449 1406 C 1448 1407 C 1447 1408 U 0 1409 A 0 1410 A 0 1411 A 0 1412 G 1443 1413 C 1442 1414 C 1441 1415 G 1440 1416 U 1439 1417 G 1438 1418 A 0 1419 U 1437 1420 G 1436 1421 C 1435 1422 C 1434 1423 A 0 1424 A 0 1425 C 1432 1426 C 1431 1427 U 0 1428 U 0 1429 C 0 1430 G 0 1431 G 1426 1432 G 1425 1433 A 0 1434 G 1422 1435 G 1421 1436 C 1420 1437 U 1419 1438 A 1417 1439 A 1416 1440 C 1415 1441 G 1414 1442 U 1413 1443 C 1412 1444 U 0 1445 A 0 1446 G 0 1447 G 1407 1448 G 1406 1449 U 1405 1450 G 1404 1451 A 1403 1452 A 1402 1453 C 1401 1454 U 1400 1455 C 1399 1456 C 1398 1457 G 1397 1458 C 1396 1459 G 0 1460 A 0 1461 C 1393 1462 U 1392 1463 G 1391 1464 G 1390 1465 G 1389 1466 A 1388 1467 C 1387 1468 U 1386 1469 A 0 1470 A 0 1471 G 0 1472 U 0 1473 C 1382 1474 G 1381 1475 U 0 1476 A 0 1477 A 1379 1478 C 1378 1479 A 0 1480 A 0 1481 G 1376 1482 G 0 1483 U 1506 1484 A 1505 1485 G 1504 1486 C 1503 1487 C 1502 1488 G 1501 1489 U 1500 1490 A 1499 1491 G 1498 1492 G 1497 1493 G 0 1494 G 0 1495 A 0 1496 A 0 1497 C 1492 1498 C 1491 1499 U 1490 1500 G 1489 1501 C 1488 1502 G 1487 1503 G 1486 1504 C 1485 1505 U 1484 1506 G 1483 1507 G 0 1508 A 0 1509 N 0 1510 N 0 1511 N 0 1512 N 0 1513 N 0 1514 N 0 1515 N 0 1516 N 0 1517 N 0 1518 N 0 1519 N 0