Filename: d.16.b.P.miotherma.bpseq
Organism: Petrotoga miotherma
Accession Number: L10657
Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu
1 A 0
2 G 0
3 G 0
4 A 0
5 U 0
6 N 0
7 N 0
8 A 0
9 G 25
10 G 24
11 G 23
12 U 22
13 U 21
14 U 0
15 N 0
16 A 0
17 U 893
18 C 892
19 C 891
20 U 0
21 N 13
22 G 12
23 C 11
24 U 10
25 C 9
26 A 0
27 G 533
28 G 532
29 G 531
30 U 530
31 A 0
32 A 529
33 A 528
34 C 527
35 G 526
36 C 525
37 U 524
38 N 0
39 G 385
40 C 384
41 G 383
42 G 382
43 C 381
44 G 380
45 U 378
46 G 377
47 C 343
48 G 0
49 U 0
50 A 0
51 A 0
52 C 341
53 A 340
54 C 339
55 A 0
56 U 338
57 G 337
58 C 336
59 A 0
60 A 0
61 G 100
62 U 99
63 C 98
64 G 0
65 A 0
66 A 97
67 C 96
68 G 95
69 G 94
70 G 93
71 U 92
72 U 91
73 A 90
74 U 89
75 A 88
76 C 87
77 A 86
78 U 85
79 C 84
80 U 0
81 U 0
82 C 0
83 G 0
84 G 79
85 A 78
86 U 77
87 G 76
88 U 75
89 A 74
90 U 73
91 A 72
92 A 71
93 U 70
94 C 69
95 A 68
96 G 67
97 U 66
98 G 63
99 G 62
100 C 61
101 G 0
102 A 0
103 A 0
104 C 0
105 G 0
106 G 0
107 G 296
108 U 295
109 G 294
110 A 0
111 G 0
112 U 0
113 A 0
114 A 0
115 A 0
116 A 221
117 G 220
118 G 219
119 U 218
120 A 217
121 G 216
122 G 215
123 G 214
124 A 0
125 C 213
126 C 212
127 U 0
128 A 0
129 C 0
130 C 209
131 C 208
132 C 207
133 G 206
134 A 205
135 G 204
136 G 203
137 A 0
138 C 172
139 A 171
140 G 170
141 A 169
142 G 168
143 A 0
144 U 0
145 A 0
146 G 163
147 C 162
148 U 161
149 A 160
150 C 159
151 U 158
152 G 157
153 G 0
154 A 0
155 A 0
156 A 0
157 C 152
158 G 151
159 G 150
160 U 149
161 A 148
162 G 147
163 G 146
164 U 0
165 N 0
166 A 0
167 A 0
168 C 142
169 U 141
170 C 140
171 U 139
172 N 138
173 A 0
174 U 0
175 A 0
176 A 0
177 G 0
178 C 187
179 C 186
180 C 185
181 G 0
182 A 0
183 G 0
184 A 0
185 G 180
186 G 179
187 G 178
188 G 0
189 A 0
190 A 0
191 A 0
192 G 0
193 U 201
194 G 200
195 G 199
196 G 0
197 N 0
198 G 0
199 U 195
200 C 194
201 A 193
202 G 0
203 C 136
204 C 135
205 U 134
206 U 133
207 G 132
208 G 131
209 G 130
210 A 0
211 U 0
212 N 126
213 G 125
214 A 123
215 C 122
216 C 121
217 U 120
218 N 119
219 C 118
220 U 117
221 A 116
222 U 268
223 C 267
224 C 266
225 A 0
226 U 0
227 C 265
228 A 0
229 G 259
230 G 258
231 U 257
232 A 0
233 G 0
234 U 256
235 U 255
236 G 254
237 G 253
238 U 252
239 G 251
240 A 250
241 G 249
242 G 0
243 U 0
244 A 0
245 A 0
246 A 0
247 G 0
248 G 0
249 C 241
250 U 240
251 Y 239
252 A 238
253 C 237
254 C 236
255 N 235
256 A 234
257 G 231
258 C 230
259 C 229
260 G 0
261 A 0
262 U 0
263 G 0
264 A 0
265 C 227
266 G 224
267 G 223
268 A 222
269 U 0
270 A 0
271 A 293
272 C 292
273 C 291
274 G 290
275 G 286
276 U 285
277 G 284
278 U 283
279 G 0
280 A 0
281 G 0
282 A 0
283 G 278
284 C 277
285 A 276
286 U 275
287 G 0
288 N 0
289 A 0
290 C 274
291 G 273
292 G 272
293 U 271
294 C 109
295 A 108
296 C 107
297 A 0
298 A 319
299 G 318
300 G 317
301 G 316
302 C 315
303 A 314
304 C 0
305 U 0
306 G 0
307 A 0
308 G 0
309 A 0
310 C 0
311 A 0
312 C 0
313 G 0
314 G 303
315 G 302
316 C 301
317 C 300
318 N 299
319 N 298
320 N 0
321 C 332
322 U 331
323 C 330
324 C 329
325 U 0
326 A 0
327 C 0
328 G 0
329 G 324
330 G 323
331 A 322
332 G 321
333 G 0
334 C 0
335 A 0
336 G 58
337 C 57
338 A 56
339 G 54
340 U 53
341 G 52
342 G 0
343 G 47
344 G 0
345 A 0
346 A 0
347 U 0
348 A 0
349 U 375
350 U 0
351 G 374
352 G 373
353 A 372
354 C 0
355 A 0
356 A 0
357 U 370
358 G 369
359 G 368
360 G 367
361 C 366
362 G 0
363 A 0
364 A 0
365 A 0
366 G 361
367 C 360
368 C 359
369 U 358
370 N 357
371 A 0
372 U 353
373 C 352
374 C 351
375 A 349
376 G 0
377 C 46
378 G 45
379 A 0
380 C 44
381 G 43
382 C 42
383 C 41
384 G 40
385 C 39
386 G 0
387 U 0
388 G 418
389 A 417
390 A 416
391 G 415
392 G 0
393 A 0
394 A 0
395 G 0
396 A 0
397 A 0
398 G 409
399 U 408
400 C 407
401 C 406
402 U 0
403 U 0
404 C 0
405 G 0
406 G 401
407 G 400
408 A 399
409 U 398
410 G 0
411 U 0
412 A 0
413 A 0
414 A 0
415 C 391
416 U 390
417 U 389
418 C 388
419 U 0
420 G 474
421 A 0
422 A 0
423 C 471
424 U 470
425 A 469
426 A 468
427 U 467
428 C 466
429 G 0
430 A 0
431 A 0
432 U 461
433 A 0
434 A 0
435 G 0
436 N 0
437 G 0
438 G 455
439 G 454
440 U 453
441 A 452
442 G 451
443 U 450
444 G 449
445 G 0
446 A 0
447 C 0
448 A 0
449 C 444
450 A 443
451 C 442
452 U 441
453 A 440
454 C 439
455 A 438
456 G 0
457 A 0
458 A 0
459 G 0
460 A 0
461 A 432
462 G 0
463 G 0
464 U 0
465 A 0
466 G 428
467 A 427
468 U 426
469 U 425
470 A 424
471 G 423
472 G 0
473 A 0
474 A 420
475 A 0
476 A 0
477 G 522
478 U 521
479 C 520
480 C 519
481 C 518
482 G 503
483 G 502
484 C 501
485 U 0
486 A 0
487 A 0
488 C 517
489 U 516
490 A 515
491 C 514
492 G 513
493 U 0
494 G 0
495 C 0
496 C 0
497 A 0
498 G 505
499 C 504
500 A 0
501 G 484
502 C 483
503 C 482
504 G 499
505 C 498
506 G 0
507 G 0
508 U 0
509 A 0
510 A 0
511 G 0
512 A 0
513 C 492
514 G 491
515 U 490
516 A 489
517 G 488
518 G 481
519 N 480
520 G 479
521 N 478
522 C 477
523 N 0
524 A 37
525 G 36
526 C 35
527 G 34
528 U 33
529 U 32
530 G 30
531 C 29
532 C 28
533 C 27
534 G 0
535 G 0
536 A 0
537 A 0
538 U 0
539 C 0
540 A 0
541 C 0
542 U 0
543 G 0
544 G 858
545 G 857
546 U 856
547 G 841
548 U 840
549 A 0
550 A 0
551 A 0
552 G 855
553 G 0
554 G 739
555 G 738
556 A 737
557 C 736
558 G 0
559 U 733
560 A 0
561 G 732
562 G 731
563 C 730
564 G 0
565 G 626
566 A 625
567 U 624
568 G 623
569 A 622
570 U 621
571 C 620
572 A 0
573 A 619
574 G 618
575 U 615
576 C 614
577 A 613
578 U 612
579 C 611
580 U 610
581 G 609
582 U 608
583 G 607
584 A 0
585 A 0
586 A 0
587 A 0
588 G 602
589 A 601
590 U 600
591 U 599
592 G 598
593 C 0
594 U 0
595 C 0
596 A 0
597 A 0
598 C 592
599 G 591
600 A 590
601 U 589
602 U 588
603 G 0
604 G 0
605 C 0
606 U 0
607 U 583
608 G 582
609 C 581
610 G 580
611 G 579
612 A 578
613 U 577
614 G 576
615 A 575
616 A 0
617 A 0
618 C 574
619 U 573
620 N 571
621 G 570
622 U 569
623 N 568
624 N 567
625 U 566
626 C 565
627 U 0
628 U 0
629 G 0
630 G 726
631 G 725
632 C 724
633 G 723
634 U 721
635 A 720
636 G 719
637 C 718
638 A 717
639 G 0
640 A 0
641 G 715
642 G 714
643 U 713
644 A 712
645 G 711
646 A 710
647 C 709
648 G 692
649 G 691
650 A 0
651 A 0
652 U 688
653 U 687
654 A 686
655 C 685
656 C 684
657 U 683
658 G 682
659 A 681
660 G 0
661 U 0
662 A 0
663 G 674
664 G 673
665 G 672
666 G 0
667 U 0
668 G 0
669 A 0
670 A 0
671 A 0
672 U 665
673 C 664
674 C 663
675 G 0
676 C 0
677 A 0
678 G 0
679 A 0
680 U 0
681 A 659
682 C 658
683 A 657
684 G 656
685 G 655
686 U 654
687 A 653
688 A 652
689 G 0
690 A 0
691 A 649
692 G 648
693 G 0
694 C 0
695 C 0
696 G 0
697 G 708
698 U 0
699 G 0
700 A 707
701 A 706
702 G 0
703 A 0
704 A 0
705 G 0
706 U 701
707 U 700
708 G 697
709 G 647
710 U 646
711 C 645
712 U 644
713 A 643
714 C 642
715 U 641
716 G 0
717 G 638
718 G 637
719 C 636
720 U 635
721 A 634
722 C 0
723 A 633
724 G 632
725 C 631
726 U 630
727 G 0
728 A 0
729 C 0
730 G 563
731 C 562
732 U 561
733 G 559
734 A 0
735 G 0
736 G 557
737 U 556
738 C 555
739 C 554
740 G 0
741 A 0
742 A 0
743 A 0
744 G 785
745 C 784
746 C 783
747 A 782
748 G 781
749 G 780
750 G 0
751 G 0
752 A 0
753 G 779
754 C 778
755 G 0
756 A 0
757 A 0
758 C 774
759 C 773
760 G 772
761 G 771
762 A 0
763 U 0
764 U 0
765 A 0
766 G 0
767 A 0
768 U 0
769 A 0
770 C 0
771 C 761
772 C 760
773 G 759
774 G 758
775 G 0
776 U 0
777 A 0
778 G 754
779 U 753
780 C 749
781 C 748
782 U 747
783 A 746
784 G 745
785 C 744
786 U 0
787 G 0
788 U 0
789 A 0
790 A 0
791 A 0
792 C 0
793 G 0
794 A 0
795 U 0
796 G 854
797 C 853
798 U 852
799 C 851
800 A 850
801 C 849
802 U 0
803 A 0
804 G 832
805 G 831
806 U 830
807 G 829
808 U 828
809 A 827
810 G 826
811 G 825
812 G 824
813 A 823
814 G 822
815 C 0
816 G 0
817 A 0
818 A 0
819 A 0
820 G 0
821 A 0
822 C 814
823 U 813
824 C 812
825 U 811
826 C 810
827 U 809
828 G 808
829 U 807
830 G 806
831 C 805
832 U 804
833 G 0
834 A 0
835 A 0
836 G 843
837 C 842
838 G 0
839 A 0
840 A 548
841 C 547
842 G 837
843 C 836
844 G 0
845 M 0
846 U 0
847 A 0
848 A 0
849 G 801
850 U 800
851 G 799
852 A 798
853 G 797
854 C 796
855 C 552
856 A 546
857 C 545
858 C 544
859 U 0
860 G 887
861 G 886
862 G 885
863 G 0
864 A 0
865 G 0
866 U 0
867 A 0
868 C 0
869 G 880
870 U 879
871 C 878
872 C 877
873 G 0
874 C 0
875 A 0
876 A 0
877 G 872
878 G 871
879 A 870
880 U 869
881 G 0
882 A 0
883 A 0
884 A 0
885 C 862
886 U 861
887 C 860
888 A 0
889 A 0
890 A 0
891 G 19
892 G 18
893 A 17
894 A 0
895 U 0
896 U 1377
897 G 1376
898 A 1374
899 C 1373
900 G 1372
901 G 0
902 G 1371
903 G 1370
904 G 1369
905 U 1368
906 C 1367
907 C 1366
908 G 1365
909 C 0
910 A 1361
911 C 1360
912 A 0
913 A 0
914 G 1324
915 C 1323
916 G 1322
917 G 1321
918 U 1320
919 G 1217
920 G 1216
921 A 1215
922 G 1214
923 C 1213
924 A 1212
925 U 1211
926 G 1210
927 U 1209
928 G 1208
929 G 1206
930 U 1205
931 U 0
932 U 0
933 A 0
934 A 0
935 U 950
936 U 949
937 C 948
938 G 947
939 A 0
940 A 0
941 G 0
942 C 0
943 U 0
944 A 0
945 A 0
946 C 0
947 C 938
948 G 937
949 A 936
950 A 935
951 G 0
952 A 0
953 A 0
954 C 0
955 C 0
956 U 0
957 U 0
958 A 0
959 C 1201
960 C 1200
961 A 1199
962 G 1198
963 G 1197
964 G 1196
965 A 1195
966 U 0
967 U 0
968 G 0
969 A 0
970 C 0
971 A 1024
972 U 1023
973 G 1022
974 U 1021
975 A 1020
976 A 1019
977 C 1018
978 U 1017
979 G 0
980 A 0
981 A 998
982 G 997
983 G 996
984 U 995
985 A 994
986 G 993
987 A 992
988 G 0
989 A 0
990 A 0
991 A 0
992 U 987
993 C 986
994 U 985
995 A 984
996 C 983
997 U 982
998 N 981
999 G 0
1000 C 1015
1001 C 1014
1002 U 1013
1003 G 1012
1004 C 1011
1005 C 1010
1006 G 0
1007 U 0
1008 A 0
1009 A 0
1010 G 1005
1011 G 1004
1012 U 1003
1013 N 1002
1014 G 1001
1015 G 1000
1016 A 0
1017 G 978
1018 G 977
1019 U 976
1020 U 975
1021 A 974
1022 C 973
1023 A 972
1024 C 971
1025 A 0
1026 G 1190
1027 G 1189
1028 U 0
1029 G 1188
1030 G 1187
1031 U 1186
1032 G 1185
1033 C 0
1034 A 0
1035 C 1184
1036 G 1183
1037 G 1179
1038 U 1178
1039 C 1177
1040 G 1175
1041 U 1174
1042 C 1173
1043 G 1172
1044 U 0
1045 C 0
1046 A 0
1047 G 1086
1048 C 1085
1049 U 1084
1050 C 1083
1051 G 1082
1052 U 1081
1053 G 1062
1054 C 1061
1055 C 1060
1056 G 0
1057 U 0
1058 G 0
1059 A 0
1060 G 1055
1061 G 1054
1062 U 1053
1063 G 0
1064 U 0
1065 U 1078
1066 G 1077
1067 G 1076
1068 G 1075
1069 U 0
1070 U 0
1071 A 0
1072 A 0
1073 G 0
1074 U 0
1075 C 1068
1076 C 1067
1077 C 1066
1078 A 1065
1079 C 0
1080 A 0
1081 A 1052
1082 C 1051
1083 G 1050
1084 A 1049
1085 G 1048
1086 C 1047
1087 G 0
1088 C 0
1089 A 0
1090 A 0
1091 C 0
1092 C 1167
1093 C 1166
1094 C 1165
1095 U 1164
1096 A 0
1097 C 1135
1098 A 1134
1099 A 1133
1100 U 1132
1101 U 1131
1102 A 1130
1103 G 1129
1104 U 0
1105 U 0
1106 A 0
1107 C 1124
1108 C 1123
1109 A 0
1110 G 0
1111 C 1122
1112 A 1121
1113 A 1120
1114 G 0
1115 U 0
1116 A 0
1117 A 0
1118 A 0
1119 G 0
1120 U 1113
1121 U 1112
1122 G 1111
1123 G 1108
1124 G 1107
1125 G 0
1126 A 0
1127 C 0
1128 A 0
1129 C 1103
1130 U 1102
1131 A 1101
1132 A 1100
1133 U 1099
1134 U 1098
1135 G 1097
1136 G 0
1137 A 0
1138 C 1158
1139 A 1157
1140 G 1156
1141 C 1155
1142 C 1154
1143 G 1153
1144 C 1152
1145 C 1151
1146 G 0
1147 A 0
1148 C 0
1149 G 0
1150 A 0
1151 G 1145
1152 G 1144
1153 C 1143
1154 G 1142
1155 G 1141
1156 A 1140
1157 G 1139
1158 G 1138
1159 A 0
1160 A 0
1161 G 0
1162 G 0
1163 A 0
1164 G 1095
1165 G 1094
1166 G 1093
1167 G 1092
1168 A 0
1169 U 0
1170 G 0
1171 A 0
1172 C 1043
1173 G 1042
1174 U 1041
1175 C 1040
1176 A 0
1177 G 1039
1178 A 1038
1179 U 1037
1180 A 0
1181 A 0
1182 G 0
1183 C 1036
1184 G 1035
1185 U 1032
1186 G 1031
1187 C 1030
1188 N 1029
1189 C 1027
1190 C 1026
1191 U 0
1192 U 0
1193 A 0
1194 U 0
1195 A 965
1196 C 964
1197 U 963
1198 C 962
1199 U 961
1200 G 960
1201 G 959
1202 G 0
1203 C 0
1204 G 0
1205 A 930
1206 C 929
1207 A 0
1208 C 928
1209 A 927
1210 C 926
1211 G 925
1212 U 924
1213 G 923
1214 C 922
1215 U 921
1216 A 920
1217 C 919
1218 A 0
1219 A 0
1220 U 0
1221 G 1276
1222 G 1275
1223 G 1274
1224 G 1273
1225 A 1272
1226 G 1271
1227 G 1270
1228 A 0
1229 C 0
1230 A 0
1231 A 0
1232 A 0
1233 G 1264
1234 G 1263
1235 G 1262
1236 A 0
1237 A 0
1238 G 1257
1239 C 1256
1240 G 0
1241 A 0
1242 A 0
1243 G 1252
1244 C 1251
1245 C 1250
1246 G 0
1247 U 0
1248 N 0
1249 A 0
1250 G 1245
1251 G 1244
1252 U 1243
1253 G 0
1254 G 0
1255 A 0
1256 G 1239
1257 C 1238
1258 G 0
1259 G 0
1260 A 0
1261 U 0
1262 C 1235
1263 C 1234
1264 G 1233
1265 G 0
1266 A 0
1267 A 0
1268 A 0
1269 A 0
1270 A 1227
1271 C 1226
1272 N 1225
1273 N 1224
1274 U 1223
1275 C 1222
1276 C 1221
1277 G 0
1278 U 0
1279 A 0
1280 A 0
1281 U 0
1282 A 0
1283 U 1314
1284 G 0
1285 G 0
1286 A 0
1287 U 1310
1288 U 1309
1289 G 1308
1290 U 1307
1291 A 1306
1292 G 1305
1293 G 1304
1294 C 1303
1295 U 0
1296 G 0
1297 A 0
1298 A 0
1299 A 0
1300 C 0
1301 C 0
1302 C 0
1303 G 1294
1304 C 1293
1305 C 1292
1306 U 1291
1307 A 1290
1308 C 1289
1309 A 1288
1310 U 1287
1311 G 0
1312 A 0
1313 A 0
1314 G 1283
1315 C 0
1316 U 0
1317 G 0
1318 G 0
1319 A 0
1320 A 918
1321 U 917
1322 C 916
1323 G 915
1324 C 914
1325 U 0
1326 A 0
1327 G 0
1328 U 0
1329 A 0
1330 A 1353
1331 U 1352
1332 C 1351
1333 G 1350
1334 C 1349
1335 A 1348
1336 G 1347
1337 G 1346
1338 U 0
1339 C 0
1340 A 0
1341 G 0
1342 C 0
1343 C 0
1344 A 0
1345 A 0
1346 A 1337
1347 C 1336
1348 U 1335
1349 G 1334
1350 C 1333
1351 G 1332
1352 G 1331
1353 U 1330
1354 G 0
1355 A 0
1356 A 0
1357 U 0
1358 A 0
1359 N 0
1360 N 911
1361 N 910
1362 N 0
1363 N 0
1364 N 0
1365 N 908
1366 N 907
1367 N 906
1368 N 905
1369 N 904
1370 N 903
1371 N 902
1372 N 900
1373 N 899
1374 N 898
1375 N 0
1376 N 897
1377 N 896
1378 N 0
1379 N 0
1380 N 1489
1381 N 0
1382 N 1486
1383 N 1485
1384 N 0
1385 N 1482
1386 N 1481
1387 N 0
1388 N 0
1389 N 0
1390 N 1476
1391 N 1475
1392 N 1474
1393 N 1473
1394 N 1472
1395 N 1471
1396 N 1470
1397 N 1469
1398 N 0
1399 N 0
1400 N 1466
1401 N 1465
1402 N 1464
1403 N 1463
1404 N 1462
1405 N 1461
1406 N 1460
1407 N 1459
1408 N 1458
1409 N 1457
1410 N 1456
1411 N 1455
1412 N 0
1413 N 0
1414 N 0
1415 N 0
1416 N 1451
1417 N 1450
1418 N 1449
1419 N 1448
1420 N 1447
1421 N 1446
1422 N 1445
1423 N 0
1424 N 1444
1425 N 1443
1426 N 1442
1427 N 1441
1428 N 0
1429 N 0
1430 N 1439
1431 N 1438
1432 N 1437
1433 N 0
1434 N 0
1435 N 0
1436 N 0
1437 N 1432
1438 N 1431
1439 N 1430
1440 N 0
1441 N 1427
1442 N 1426
1443 N 1425
1444 N 1424
1445 N 1422
1446 N 1421
1447 N 1420
1448 N 1419
1449 N 1418
1450 N 1417
1451 N 1416
1452 N 0
1453 N 0
1454 N 0
1455 N 1411
1456 N 1410
1457 N 1409
1458 N 1408
1459 N 1407
1460 N 1406
1461 N 1405
1462 N 1404
1463 N 1403
1464 N 1402
1465 N 1401
1466 N 1400
1467 N 0
1468 N 0
1469 N 1397
1470 N 1396
1471 N 1395
1472 N 1394
1473 N 1393
1474 N 1392
1475 N 1391
1476 N 1390
1477 N 0
1478 N 0
1479 N 0
1480 N 0
1481 N 1386
1482 N 1385
1483 N 0
1484 N 0
1485 N 1383
1486 N 1382
1487 N 0
1488 N 0
1489 N 1380
1490 N 0
1491 N 1514
1492 N 1513
1493 N 1512
1494 N 1511
1495 N 1510
1496 N 1509
1497 N 1508
1498 N 1507
1499 N 1506
1500 N 1505
1501 N 0
1502 N 0
1503 N 0
1504 N 0
1505 N 1500
1506 N 1499
1507 N 1498
1508 N 1497
1509 N 1496
1510 N 1495
1511 N 1494
1512 N 1493
1513 N 1492
1514 N 1491
1515 N 0
1516 N 0
1517 N 0
1518 N 0
1519 N 0
1520 N 0
1521 N 0
1522 N 0
1523 N 0
1524 N 0
1525 N 0
1526 N 0
1527 N 0
1528 N 0
1529 N 0