Filename: d.16.b.S.moniliformis.bpseq Organism: Streptobacillus moniliformis Accession Number: Z35305 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 N 0 3 N 0 4 N 0 5 N 0 6 N 0 7 N 0 8 A 0 9 G 25 10 A 24 11 G 23 12 U 22 13 U 21 14 U 0 15 G 0 16 A 0 17 U 895 18 C 894 19 C 893 20 U 0 21 G 13 22 G 12 23 C 11 24 U 10 25 C 9 26 A 0 27 G 535 28 G 534 29 A 533 30 U 532 31 G 0 32 A 531 33 A 530 34 C 529 35 G 528 36 C 527 37 U 526 38 G 0 39 A 404 40 C 403 41 A 402 42 G 401 43 A 400 44 A 399 45 U 397 46 G 396 47 C 362 48 U 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 C 360 53 A 359 54 C 358 55 A 0 56 U 357 57 G 356 58 C 355 59 A 0 60 A 0 61 A 103 62 U 102 63 C 101 64 U 0 65 A 100 66 U 99 67 G 98 68 U 97 69 A 96 70 U 0 71 G 0 72 A 0 73 A 0 74 A 91 75 U 90 76 G 89 77 U 88 78 A 87 79 A 86 80 G 85 81 C 0 82 U 0 83 U 0 84 G 0 85 C 80 86 U 79 87 U 78 88 A 77 89 C 76 90 A 75 91 U 74 92 A 0 93 G 0 94 A 0 95 C 0 96 U 69 97 A 68 98 C 67 99 A 66 100 U 65 101 G 63 102 G 62 103 U 61 104 G 0 105 G 0 106 A 0 107 C 0 108 U 0 109 G 0 110 G 315 111 U 314 112 G 313 113 A 0 114 G 0 115 U 0 116 A 0 117 A 0 118 C 0 119 G 241 120 U 240 121 G 239 122 U 238 123 A 237 124 A 236 125 A 235 126 G 234 127 A 0 128 A 0 129 C 233 130 U 232 131 U 0 132 A 0 133 C 0 134 C 229 135 U 228 136 C 227 137 U 226 138 U 225 139 A 224 140 G 223 141 A 0 142 C 177 143 U 176 144 G 175 145 G 174 146 G 0 147 A 0 148 U 0 149 A 0 150 A 168 151 C 167 152 C 166 153 A 165 154 U 164 155 U 163 156 A 162 157 G 0 158 G 0 159 A 0 160 A 0 161 A 0 162 U 156 163 G 155 164 A 154 165 U 153 166 G 152 167 G 151 168 A 150 169 U 0 170 A 0 171 A 0 172 U 0 173 A 0 174 C 145 175 U 144 176 A 143 177 G 142 178 A 0 179 U 0 180 A 0 181 U 0 182 U 0 183 A 208 184 U 207 185 U 206 186 A 205 187 G 204 188 U 203 189 A 202 190 G 201 191 U 200 192 A 199 193 G 198 194 G 0 195 C 0 196 A 0 197 U 0 198 C 193 199 U 192 200 A 191 201 C 190 202 U 189 203 A 188 204 U 187 205 U 186 206 A 185 207 A 184 208 U 183 209 G 0 210 A 0 211 A 0 212 A 0 213 G 221 214 G 220 215 A 0 216 G 0 217 A 0 218 G 0 219 A 0 220 U 214 221 U 213 222 G 0 223 C 140 224 U 139 225 A 138 226 A 137 227 G 136 228 A 135 229 G 134 230 A 0 231 G 0 232 A 130 233 G 129 234 C 126 235 U 125 236 U 124 237 U 123 238 G 122 239 C 121 240 A 120 241 U 119 242 C 288 243 C 287 244 U 286 245 A 0 246 U 0 247 U 285 248 A 0 249 G 279 250 C 278 251 U 277 252 A 0 253 G 0 254 U 276 255 U 275 256 G 274 257 G 273 258 U 272 259 G 271 260 G 270 261 G 269 262 G 0 263 U 0 264 A 0 265 A 0 266 A 0 267 G 0 268 G 0 269 C 261 270 C 260 271 U 259 272 A 258 273 C 257 274 C 256 275 A 255 276 A 254 277 G 251 278 G 250 279 C 249 280 U 0 281 A 0 282 U 0 283 G 0 284 A 0 285 U 247 286 A 244 287 G 243 288 G 242 289 U 0 290 A 0 291 G 312 292 C 311 293 C 310 294 G 309 295 G 305 296 C 304 297 C 303 298 C 0 299 G 0 300 A 0 301 G 0 302 A 0 303 G 297 304 G 296 305 U 295 306 G 0 307 A 0 308 A 0 309 C 294 310 G 293 311 G 292 312 C 291 313 C 112 314 A 111 315 C 110 316 A 0 317 A 338 318 G 337 319 G 336 320 G 335 321 G 334 322 A 333 323 C 0 324 U 0 325 G 0 326 A 0 327 G 0 328 A 0 329 U 0 330 A 0 331 C 0 332 G 0 333 G 322 334 C 321 335 C 320 336 C 319 337 U 318 338 U 317 339 A 0 340 C 351 341 U 350 342 C 349 343 C 348 344 U 0 345 A 0 346 C 0 347 G 0 348 G 343 349 G 342 350 A 341 351 G 340 352 G 0 353 C 0 354 A 0 355 G 58 356 C 57 357 A 56 358 G 54 359 U 53 360 G 52 361 G 0 362 G 47 363 G 0 364 A 0 365 A 0 366 U 0 367 A 0 368 U 394 369 U 0 370 G 393 371 G 392 372 A 391 373 C 0 374 A 0 375 A 0 376 U 389 377 G 388 378 G 387 379 A 386 380 G 385 381 G 0 382 A 0 383 A 0 384 A 0 385 C 380 386 U 379 387 C 378 388 U 377 389 G 376 390 A 0 391 U 372 392 C 371 393 C 370 394 A 368 395 G 0 396 C 46 397 A 45 398 A 0 399 U 44 400 U 43 401 C 42 402 U 41 403 G 40 404 U 39 405 G 0 406 U 0 407 G 437 408 C 436 409 A 435 410 C 434 411 G 0 412 A 0 413 A 0 414 G 0 415 A 0 416 A 0 417 G 428 418 G 427 419 U 426 420 U 425 421 U 0 422 U 0 423 C 0 424 G 0 425 G 420 426 A 419 427 U 418 428 U 417 429 G 0 430 U 0 431 A 0 432 A 0 433 A 0 434 G 410 435 U 409 436 G 408 437 C 407 438 U 0 439 U 475 440 U 0 441 C 476 442 A 472 443 G 471 444 U 470 445 A 469 446 G 468 447 G 467 448 G 0 449 A 0 450 A 0 451 G 462 452 A 0 453 A 0 454 G 0 455 A 0 456 A 0 457 G 0 458 A 0 459 U 0 460 G 0 461 A 0 462 C 451 463 G 0 464 G 0 465 U 0 466 A 0 467 C 447 468 C 446 469 U 445 470 A 444 471 C 443 472 A 442 473 G 0 474 A 0 475 A 439 476 G 441 477 A 0 478 A 0 479 G 524 480 C 523 481 G 522 482 A 521 483 C 520 484 G 505 485 G 504 486 C 503 487 U 0 488 A 0 489 A 0 490 A 519 491 U 518 492 A 517 493 C 516 494 G 515 495 U 0 496 G 0 497 C 0 498 C 0 499 A 0 500 G 507 501 C 506 502 A 0 503 G 486 504 C 485 505 C 484 506 G 501 507 C 500 508 G 0 509 G 0 510 U 0 511 A 0 512 A 0 513 U 0 514 A 0 515 C 494 516 G 493 517 U 492 518 A 491 519 U 490 520 G 483 521 U 482 522 C 481 523 G 480 524 C 479 525 A 0 526 A 37 527 G 36 528 C 35 529 G 34 530 U 33 531 U 32 532 A 30 533 U 29 534 C 28 535 C 27 536 G 0 537 G 0 538 A 0 539 A 0 540 U 0 541 U 0 542 A 0 543 U 0 544 U 0 545 G 0 546 G 860 547 G 859 548 C 858 549 U 843 550 U 842 551 A 0 552 A 0 553 A 0 554 G 0 555 G 0 556 G 743 557 C 742 558 A 741 559 U 740 560 C 0 561 U 737 562 A 0 563 G 736 564 G 735 565 C 734 566 G 0 567 G 630 568 U 629 569 C 628 570 U 627 571 A 626 572 A 625 573 C 624 574 A 0 575 A 623 576 G 622 577 U 619 578 U 618 579 G 617 580 A 616 581 A 615 582 G 614 583 G 613 584 U 612 585 G 611 586 A 0 587 A 0 588 A 0 589 A 0 590 G 608 591 C 607 592 U 606 593 G 605 594 U 604 595 G 603 596 G 602 597 C 0 598 U 0 599 C 0 600 A 0 601 A 0 602 C 596 603 C 595 604 A 594 605 U 593 606 A 592 607 G 591 608 U 590 609 C 0 610 U 0 611 U 585 612 G 584 613 C 583 614 C 582 615 U 581 616 A 580 617 C 579 618 A 578 619 A 577 620 A 0 621 A 0 622 C 576 623 U 575 624 G 573 625 U 572 626 C 571 627 A 570 628 G 569 629 A 568 630 C 567 631 U 0 632 A 0 633 G 0 634 A 730 635 G 729 636 U 728 637 A 0 638 C 725 639 U 724 640 G 723 641 G 722 642 A 721 643 A 0 644 A 0 645 G 719 646 G 718 647 U 717 648 G 716 649 G 715 650 G 714 651 U 713 652 G 696 653 G 695 654 A 0 655 A 0 656 C 692 657 U 691 658 A 690 659 C 689 660 A 688 661 C 687 662 G 686 663 A 685 664 G 0 665 U 0 666 A 0 667 G 678 668 A 677 669 G 676 670 G 0 671 U 0 672 G 0 673 A 0 674 A 0 675 A 0 676 U 669 677 U 668 678 C 667 679 G 0 680 U 0 681 A 0 682 G 0 683 A 0 684 U 0 685 A 663 686 U 662 687 G 661 688 U 660 689 G 659 690 U 658 691 A 657 692 G 656 693 G 0 694 A 0 695 A 653 696 U 652 697 G 0 698 C 0 699 C 0 700 G 0 701 A 712 702 U 0 703 G 0 704 A 711 705 U 710 706 G 0 707 A 0 708 A 0 709 G 0 710 A 705 711 U 704 712 A 701 713 A 651 714 C 650 715 U 649 716 C 648 717 A 647 718 C 646 719 U 645 720 G 0 721 G 642 722 A 641 723 C 640 724 A 639 725 G 638 726 A 0 727 A 0 728 A 636 729 C 635 730 U 634 731 G 0 732 A 0 733 C 0 734 G 565 735 C 564 736 U 563 737 G 561 738 A 0 739 A 0 740 G 559 741 U 558 742 G 557 743 C 556 744 G 0 745 A 0 746 A 0 747 A 0 748 C 0 749 G 0 750 U 787 751 A 786 752 G 785 753 G 784 754 G 0 755 G 0 756 A 0 757 G 783 758 C 782 759 A 0 760 A 0 761 A 0 762 C 778 763 A 777 764 G 776 765 G 775 766 A 0 767 U 0 768 U 0 769 A 0 770 G 0 771 A 0 772 U 0 773 A 0 774 C 0 775 C 765 776 C 764 777 U 763 778 G 762 779 G 0 780 U 0 781 A 0 782 G 758 783 U 757 784 C 753 785 C 752 786 U 751 787 A 750 788 G 0 789 C 0 790 U 0 791 G 0 792 U 0 793 A 0 794 A 0 795 A 0 796 C 0 797 G 0 798 A 0 799 U 0 800 G 856 801 A 855 802 U 854 803 C 853 804 A 852 805 C 851 806 U 0 807 G 0 808 G 834 809 G 833 810 U 832 811 G 831 812 U 830 813 G 829 814 G 828 815 G 827 816 G 826 817 G 825 818 U 824 819 G 0 820 U 0 821 G 0 822 A 0 823 A 0 824 G 818 825 C 817 826 C 816 827 U 815 828 C 814 829 U 813 830 G 812 831 U 811 832 G 810 833 C 809 834 C 808 835 G 0 836 A 0 837 A 0 838 G 845 839 C 844 840 A 0 841 A 0 842 A 550 843 A 549 844 G 839 845 C 838 846 G 0 847 A 0 848 U 0 849 A 0 850 A 0 851 G 805 852 U 804 853 G 803 854 A 802 855 U 801 856 C 800 857 C 0 858 G 548 859 C 547 860 C 546 861 U 0 862 G 889 863 G 888 864 G 887 865 G 0 866 A 0 867 G 0 868 U 0 869 A 0 870 C 0 871 G 882 872 U 881 873 A 880 874 C 879 875 G 0 876 C 0 877 A 0 878 A 0 879 G 874 880 U 873 881 A 872 882 U 871 883 G 0 884 A 0 885 A 0 886 A 0 887 C 864 888 U 863 889 C 862 890 A 0 891 A 0 892 A 0 893 G 19 894 G 18 895 A 17 896 A 0 897 U 0 898 U 1373 899 G 1372 900 A 1370 901 C 1369 902 G 1368 903 G 0 904 G 1367 905 G 1366 906 A 1365 907 C 1364 908 C 1363 909 C 1362 910 G 1361 911 C 0 912 A 1357 913 C 1356 914 A 0 915 A 0 916 G 1320 917 U 1319 918 G 1318 919 G 1317 920 U 1316 921 G 1213 922 G 1212 923 A 1211 924 G 1210 925 C 1209 926 A 1208 927 U 1207 928 G 1206 929 U 1205 930 G 1204 931 G 1202 932 U 1201 933 U 0 934 U 0 935 A 0 936 A 0 937 U 952 938 U 951 939 C 950 940 G 949 941 A 0 942 C 0 943 G 0 944 C 0 945 A 0 946 A 0 947 C 0 948 G 0 949 C 940 950 G 939 951 A 938 952 G 937 953 G 0 954 A 0 955 A 0 956 C 0 957 C 0 958 U 0 959 U 0 960 A 0 961 C 1197 962 C 1196 963 A 1195 964 G 1194 965 G 1193 966 U 1192 967 C 1191 968 U 0 969 U 0 970 G 0 971 A 0 972 C 0 973 A 1022 974 U 1021 975 A 1020 976 C 1018 977 U 1017 978 C 1016 979 G 1015 980 G 1014 981 A 0 982 A 0 983 U 1000 984 A 999 985 A 998 986 G 997 987 A 996 988 U 995 989 G 994 990 G 0 991 A 0 992 A 0 993 G 0 994 C 989 995 A 988 996 U 987 997 C 986 998 U 985 999 U 984 1000 A 983 1001 G 0 1002 U 1013 1003 G 1012 1004 C 1011 1005 C 1010 1006 U 0 1007 U 0 1008 U 0 1009 G 0 1010 G 1005 1011 G 1004 1012 A 1003 1013 A 1002 1014 C 980 1015 C 979 1016 G 978 1017 A 977 1018 G 976 1019 A 0 1020 U 975 1021 A 974 1022 C 973 1023 A 0 1024 G 1186 1025 G 1185 1026 U 0 1027 G 1184 1028 G 1183 1029 U 1182 1030 G 1181 1031 C 0 1032 A 0 1033 U 1180 1034 G 1179 1035 G 1175 1036 C 1174 1037 U 1173 1038 G 1171 1039 U 1170 1040 C 1169 1041 G 1168 1042 A 0 1043 C 0 1044 A 0 1045 G 1084 1046 C 1083 1047 U 1082 1048 C 1081 1049 G 1080 1050 U 1079 1051 G 1060 1052 U 1059 1053 C 1058 1054 G 0 1055 U 0 1056 G 0 1057 A 0 1058 G 1053 1059 A 1052 1060 U 1051 1061 G 0 1062 U 0 1063 U 1076 1064 G 1075 1065 G 1074 1066 G 1073 1067 U 0 1068 U 0 1069 A 0 1070 A 0 1071 G 0 1072 U 0 1073 C 1066 1074 C 1065 1075 C 1064 1076 G 1063 1077 C 0 1078 A 0 1079 A 1050 1080 C 1049 1081 G 1048 1082 A 1047 1083 G 1046 1084 C 1045 1085 G 0 1086 A 0 1087 A 0 1088 A 0 1089 C 0 1090 C 1163 1091 C 1162 1092 C 1161 1093 U 1160 1094 A 0 1095 U 1131 1096 C 1130 1097 A 1129 1098 U 1128 1099 U 1127 1100 A 1126 1101 G 1125 1102 U 0 1103 U 0 1104 G 0 1105 C 1120 1106 C 1119 1107 A 0 1108 U 0 1109 C 1118 1110 A 1117 1111 U 0 1112 U 0 1113 A 0 1114 A 0 1115 G 0 1116 U 0 1117 U 1110 1118 G 1109 1119 G 1106 1120 G 1105 1121 G 0 1122 A 0 1123 C 0 1124 U 0 1125 C 1101 1126 U 1100 1127 A 1099 1128 A 1098 1129 U 1097 1130 G 1096 1131 A 1095 1132 A 0 1133 A 0 1134 C 1154 1135 U 1153 1136 G 1152 1137 C 1151 1138 C 1150 1139 C 1149 1140 G 1148 1141 C 1147 1142 G 0 1143 A 0 1144 C 0 1145 G 0 1146 A 0 1147 G 1141 1148 C 1140 1149 A 1139 1150 G 1138 1151 G 1137 1152 A 1136 1153 G 1135 1154 G 1134 1155 A 0 1156 A 0 1157 G 0 1158 G 0 1159 U 0 1160 G 1093 1161 G 1092 1162 G 1091 1163 G 1090 1164 A 0 1165 U 0 1166 G 0 1167 A 0 1168 C 1041 1169 G 1040 1170 U 1039 1171 C 1038 1172 A 0 1173 A 1037 1174 G 1036 1175 U 1035 1176 C 0 1177 A 0 1178 U 0 1179 U 1034 1180 C 1033 1181 U 1030 1182 G 1029 1183 C 1028 1184 C 1027 1185 C 1025 1186 C 1024 1187 U 0 1188 U 0 1189 A 0 1190 U 0 1191 G 967 1192 A 966 1193 U 965 1194 C 964 1195 U 963 1196 G 962 1197 G 961 1198 G 0 1199 C 0 1200 U 0 1201 A 932 1202 C 931 1203 A 0 1204 C 930 1205 A 929 1206 C 928 1207 G 927 1208 U 926 1209 G 925 1210 C 924 1211 U 923 1212 A 922 1213 C 921 1214 A 0 1215 A 0 1216 U 0 1217 G 1272 1218 G 1271 1219 G 1270 1220 U 1269 1221 A 1268 1222 G 1267 1223 U 1266 1224 A 0 1225 C 0 1226 A 0 1227 A 0 1228 A 0 1229 G 1260 1230 A 1259 1231 G 1258 1232 G 0 1233 A 0 1234 G 1253 1235 C 1252 1236 U 0 1237 A 0 1238 A 0 1239 G 1248 1240 C 1247 1241 A 1246 1242 G 0 1243 U 0 1244 G 0 1245 A 0 1246 U 1241 1247 G 1240 1248 U 1239 1249 G 0 1250 G 0 1251 A 0 1252 G 1235 1253 C 1234 1254 A 0 1255 A 0 1256 A 0 1257 U 0 1258 C 1231 1259 U 1230 1260 U 1229 1261 U 0 1262 C 0 1263 A 0 1264 A 0 1265 A 0 1266 G 1223 1267 C 1222 1268 U 1221 1269 A 1220 1270 C 1219 1271 U 1218 1272 C 1217 1273 U 0 1274 C 0 1275 A 0 1276 G 0 1277 U 0 1278 U 0 1279 C 1310 1280 G 0 1281 G 0 1282 A 0 1283 U 1306 1284 U 1305 1285 G 1304 1286 A 1303 1287 A 1302 1288 G 1301 1289 U 1300 1290 C 1299 1291 U 0 1292 G 0 1293 C 0 1294 A 0 1295 A 0 1296 C 0 1297 U 0 1298 C 0 1299 G 1290 1300 A 1289 1301 C 1288 1302 U 1287 1303 U 1286 1304 C 1285 1305 A 1284 1306 U 1283 1307 G 0 1308 A 0 1309 A 0 1310 G 1279 1311 U 0 1312 U 0 1313 G 0 1314 G 0 1315 A 0 1316 A 920 1317 U 919 1318 C 918 1319 A 917 1320 C 916 1321 U 0 1322 A 0 1323 G 0 1324 U 0 1325 A 0 1326 A 1349 1327 U 1348 1328 C 1347 1329 G 1346 1330 C 1345 1331 A 1344 1332 A 1343 1333 A 1342 1334 U 0 1335 C 0 1336 A 0 1337 G 0 1338 C 0 1339 A 0 1340 A 0 1341 U 0 1342 G 1333 1343 U 1332 1344 U 1331 1345 G 1330 1346 C 1329 1347 G 1328 1348 G 1327 1349 U 1326 1350 G 0 1351 A 0 1352 A 0 1353 U 0 1354 A 0 1355 C 0 1356 G 913 1357 U 912 1358 U 0 1359 C 0 1360 U 0 1361 C 910 1362 G 909 1363 G 908 1364 G 907 1365 U 906 1366 C 905 1367 U 904 1368 U 902 1369 G 901 1370 U 900 1371 A 0 1372 C 899 1373 A 898 1374 C 0 1375 A 0 1376 C 1483 1377 C 0 1378 G 1480 1379 C 1479 1380 C 0 1381 C 1476 1382 G 1475 1383 U 0 1384 C 0 1385 A 0 1386 C 1470 1387 A 1469 1388 C 1468 1389 C 1467 1390 A 1466 1391 C 1465 1392 G 1464 1393 A 1463 1394 G 0 1395 A 0 1396 G 1460 1397 U 1459 1398 U 1458 1399 A 1457 1400 G 1456 1401 U 1455 1402 U 1454 1403 G 1453 1404 C 1452 1405 A 1451 1406 C 1450 1407 C 1449 1408 U 0 1409 G 0 1410 A 0 1411 A 0 1412 G 1445 1413 U 1444 1414 U 1443 1415 A 1442 1416 C 1441 1417 U 1440 1418 G 0 1419 G 1439 1420 C 1438 1421 C 1437 1422 U 1436 1423 A 0 1424 A 0 1425 C 1434 1426 C 1433 1427 C 1432 1428 G 0 1429 U 0 1430 A 0 1431 A 0 1432 G 1427 1433 G 1426 1434 G 1425 1435 A 0 1436 G 1422 1437 G 1421 1438 G 1420 1439 A 1419 1440 A 1417 1441 G 1416 1442 U 1415 1443 A 1414 1444 C 1413 1445 C 1412 1446 U 0 1447 A 0 1448 A 0 1449 G 1407 1450 G 1406 1451 U 1405 1452 G 1404 1453 U 1403 1454 G 1402 1455 A 1401 1456 U 1400 1457 U 1399 1458 A 1398 1459 G 1397 1460 U 1396 1461 G 0 1462 A 0 1463 U 1393 1464 U 1392 1465 G 1391 1466 G 1390 1467 G 1389 1468 G 1388 1469 U 1387 1470 G 1386 1471 A 0 1472 A 0 1473 G 0 1474 U 0 1475 C 1382 1476 G 1381 1477 U 0 1478 A 0 1479 A 1379 1480 C 1378 1481 A 0 1482 A 0 1483 G 1376 1484 G 0 1485 U 1508 1486 A 1507 1487 G 1506 1488 C 1505 1489 C 1504 1490 G 1503 1491 U 1502 1492 A 1501 1493 N 1500 1494 N 1499 1495 N 0 1496 N 0 1497 N 0 1498 N 0 1499 N 1494 1500 N 1493 1501 N 1492 1502 N 1491 1503 N 1490 1504 N 1489 1505 N 1488 1506 N 1487 1507 N 1486 1508 N 1485 1509 N 0 1510 N 0 1511 N 0 1512 N 0 1513 N 0 1514 N 0 1515 N 0 1516 N 0 1517 N 0 1518 N 0 1519 N 0 1520 N 0 1521 N 0