Filename: d.16.b.S.rutgersensis.bpseq Organism: Streptomyces rutgersensis Accession Number: Z76688 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 N 0 2 N 0 3 N 0 4 N 0 5 N 0 6 N 0 7 N 0 8 N 0 9 N 25 10 N 24 11 N 23 12 N 22 13 N 21 14 N 0 15 N 0 16 N 0 17 N 892 18 N 891 19 N 890 20 N 0 21 N 13 22 N 12 23 N 11 24 N 10 25 N 9 26 N 0 27 N 528 28 N 527 29 N 526 30 N 525 31 N 0 32 A 524 33 A 523 34 C 522 35 G 521 36 C 520 37 U 519 38 G 0 39 G 395 40 C 394 41 G 393 42 G 392 43 C 391 44 G 390 45 U 388 46 G 387 47 C 353 48 U 0 49 U 0 50 A 0 51 A 0 52 C 351 53 A 350 54 C 349 55 A 0 56 U 348 57 G 347 58 C 346 59 A 0 60 A 0 61 G 96 62 U 95 63 C 94 64 G 0 65 A 0 66 A 93 67 C 92 68 G 91 69 A 89 70 U 88 71 G 0 72 A 0 73 A 0 74 G 85 75 C 84 76 C 83 77 C 82 78 U 0 79 U 0 80 C 0 81 G 0 82 G 77 83 G 76 84 G 75 85 U 74 86 G 0 87 G 0 88 A 70 89 U 69 90 U 0 91 A 68 92 G 67 93 U 66 94 G 63 95 G 62 96 C 61 97 G 0 98 A 0 99 A 0 100 C 0 101 G 0 102 G 0 103 G 306 104 U 305 105 G 304 106 A 0 107 G 0 108 U 0 109 A 0 110 A 0 111 C 0 112 A 231 113 C 230 114 G 229 115 U 228 116 G 227 117 G 226 118 G 225 119 C 224 120 A 0 121 A 0 122 U 223 123 C 222 124 U 0 125 G 0 126 C 0 127 C 219 128 C 218 129 U 217 130 G 216 131 C 215 132 A 214 133 C 213 134 U 0 135 C 169 136 U 168 137 G 167 138 G 166 139 G 0 140 A 0 141 C 0 142 A 0 143 A 160 144 G 159 145 C 158 146 C 157 147 C 156 148 U 155 149 G 154 150 G 0 151 A 0 152 A 0 153 A 0 154 C 149 155 G 148 156 G 147 157 G 146 158 G 145 159 U 144 160 C 143 161 U 0 162 A 0 163 A 0 164 U 0 165 A 0 166 C 138 167 C 137 168 G 136 169 G 135 170 A 0 171 U 0 172 A 0 173 U 0 174 G 0 175 A 198 176 C 197 177 C 196 178 G 195 179 U 194 180 C 193 181 C 192 182 A 191 183 U 190 184 C 189 185 G 0 186 C 0 187 A 0 188 U 0 189 G 184 190 G 183 191 U 182 192 G 181 193 G 180 194 A 179 195 U 178 196 G 177 197 G 176 198 U 175 199 G 0 200 U 0 201 A 0 202 A 0 203 A 0 204 G 211 205 C 210 206 U 0 207 C 0 208 C 0 209 G 0 210 G 205 211 C 204 212 G 0 213 G 133 214 U 132 215 G 131 216 C 130 217 A 129 218 G 128 219 G 127 220 A 0 221 U 0 222 G 123 223 A 122 224 G 119 225 C 118 226 C 117 227 C 116 228 G 115 229 C 114 230 G 113 231 G 112 232 C 278 233 C 277 234 U 276 235 A 0 236 U 0 237 C 275 238 A 0 239 G 269 240 C 268 241 U 267 242 A 0 243 G 0 244 U 266 245 U 265 246 G 264 247 G 263 248 U 262 249 G 261 250 A 260 251 G 259 252 G 0 253 U 0 254 A 0 255 G 0 256 U 0 257 G 0 258 G 0 259 C 251 260 U 250 261 C 249 262 A 248 263 C 247 264 C 246 265 A 245 266 A 244 267 G 241 268 G 240 269 C 239 270 G 0 271 A 0 272 C 0 273 G 0 274 A 0 275 C 237 276 G 234 277 G 233 278 G 232 279 U 0 280 A 0 281 G 303 282 C 302 283 C 301 284 G 300 285 G 296 286 C 295 287 C 294 288 U 293 289 G 0 290 A 0 291 G 0 292 A 0 293 G 288 294 G 287 295 G 286 296 C 285 297 G 0 298 A 0 299 C 0 300 C 284 301 G 283 302 G 282 303 C 281 304 C 105 305 A 104 306 C 103 307 A 0 308 C 329 309 U 328 310 G 327 311 G 326 312 G 325 313 A 324 314 C 0 315 U 0 316 G 0 317 A 0 318 G 0 319 A 0 320 C 0 321 A 0 322 C 0 323 G 0 324 G 313 325 C 312 326 C 311 327 C 310 328 A 309 329 G 308 330 A 0 331 C 342 332 U 341 333 C 340 334 C 339 335 U 0 336 A 0 337 C 0 338 G 0 339 G 334 340 G 333 341 A 332 342 G 331 343 G 0 344 C 0 345 A 0 346 G 58 347 C 57 348 A 56 349 G 54 350 U 53 351 G 52 352 G 0 353 G 47 354 G 0 355 A 0 356 A 0 357 U 0 358 A 0 359 U 385 360 U 0 361 G 384 362 C 383 363 A 382 364 C 0 365 A 0 366 A 0 367 U 380 368 G 379 369 G 378 370 G 377 371 C 376 372 G 0 373 A 0 374 A 0 375 A 0 376 G 371 377 C 370 378 C 369 379 U 368 380 G 367 381 A 0 382 U 363 383 G 362 384 C 361 385 A 359 386 G 0 387 C 46 388 G 45 389 A 0 390 C 44 391 G 43 392 C 42 393 C 41 394 G 40 395 C 39 396 G 0 397 U 0 398 G 428 399 A 427 400 G 426 401 G 425 402 G 0 403 A 0 404 U 0 405 G 0 406 A 0 407 C 0 408 G 419 409 G 418 410 C 417 411 C 416 412 U 0 413 U 0 414 C 0 415 G 0 416 G 411 417 G 410 418 U 409 419 U 408 420 G 0 421 U 0 422 A 0 423 A 0 424 A 0 425 C 401 426 C 400 427 U 399 428 C 398 429 U 0 430 U 468 431 U 0 432 C 469 433 A 465 434 G 464 435 C 463 436 A 462 437 G 461 438 G 460 439 G 0 440 A 0 441 A 0 442 G 455 443 A 0 444 A 0 445 G 0 446 C 0 447 G 0 448 A 0 449 A 0 450 A 0 451 G 0 452 U 0 453 G 0 454 A 0 455 C 442 456 G 0 457 G 0 458 U 0 459 A 0 460 C 438 461 C 437 462 U 436 463 G 435 464 C 434 465 A 433 466 G 0 467 A 0 468 A 430 469 G 432 470 A 0 471 A 0 472 G 517 473 C 516 474 G 515 475 C 514 476 C 513 477 G 498 478 G 497 479 C 496 480 U 0 481 A 0 482 A 0 483 C 512 484 U 511 485 A 510 486 C 509 487 G 508 488 U 0 489 G 0 490 C 0 491 C 0 492 A 0 493 G 500 494 C 499 495 A 0 496 G 479 497 C 478 498 C 477 499 G 494 500 C 493 501 G 0 502 G 0 503 U 0 504 A 0 505 A 0 506 U 0 507 A 0 508 C 487 509 G 486 510 U 485 511 A 484 512 G 483 513 G 476 514 G 475 515 C 474 516 G 473 517 C 472 518 A 0 519 A 37 520 G 36 521 C 35 522 G 34 523 U 33 524 U 32 525 G 30 526 U 29 527 C 28 528 C 27 529 G 0 530 G 0 531 A 0 532 A 0 533 U 0 534 U 0 535 A 0 536 U 0 537 U 0 538 G 0 539 G 857 540 G 856 541 C 855 542 G 840 543 U 839 544 A 0 545 A 0 546 A 0 547 G 854 548 A 0 549 G 736 550 C 735 551 U 734 552 C 733 553 G 0 554 U 730 555 A 0 556 G 729 557 G 728 558 C 727 559 G 0 560 G 623 561 C 622 562 U 621 563 U 620 564 G 619 565 U 618 566 C 617 567 A 0 568 C 616 569 G 615 570 U 612 571 C 611 572 G 610 573 G 609 574 U 608 575 U 607 576 G 606 577 U 605 578 G 604 579 A 0 580 A 0 581 A 0 582 G 0 583 C 601 584 C 600 585 C 599 586 G 598 587 G 597 588 G 596 589 G 595 590 C 0 591 U 0 592 U 0 593 A 0 594 A 0 595 C 589 596 C 588 597 C 587 598 C 586 599 G 585 600 G 584 601 G 583 602 U 0 603 C 0 604 U 578 605 G 577 606 C 576 607 A 575 608 G 574 609 U 573 610 C 572 611 G 571 612 A 570 613 U 0 614 A 0 615 C 569 616 G 568 617 G 566 618 G 565 619 C 564 620 A 563 621 G 562 622 G 561 623 C 560 624 U 0 625 A 0 626 G 0 627 A 723 628 G 722 629 U 721 630 U 719 631 C 718 632 G 717 633 G 716 634 U 715 635 A 714 636 G 0 637 G 0 638 G 712 639 G 711 640 A 710 641 G 709 642 A 708 643 U 707 644 C 706 645 G 689 646 G 688 647 A 0 648 A 0 649 U 685 650 U 684 651 C 683 652 C 682 653 U 681 654 G 680 655 G 679 656 U 678 657 G 0 658 U 0 659 A 0 660 G 671 661 C 670 662 G 669 663 G 0 664 U 0 665 G 0 666 A 0 667 A 0 668 A 0 669 U 662 670 G 661 671 C 660 672 G 0 673 C 0 674 A 0 675 G 0 676 A 0 677 U 0 678 A 656 679 U 655 680 C 654 681 A 653 682 G 652 683 G 651 684 A 650 685 G 649 686 G 0 687 A 0 688 A 646 689 C 645 690 A 0 691 C 0 692 C 0 693 G 0 694 G 705 695 U 0 696 G 0 697 G 704 698 C 703 699 G 0 700 A 0 701 A 0 702 G 0 703 G 698 704 C 697 705 G 694 706 G 644 707 A 643 708 U 642 709 C 641 710 U 640 711 C 639 712 U 638 713 G 0 714 G 635 715 G 634 716 C 633 717 C 632 718 G 631 719 A 630 720 U 0 721 A 629 722 C 628 723 U 627 724 G 0 725 A 0 726 C 0 727 G 558 728 C 557 729 U 556 730 G 554 731 A 0 732 G 0 733 G 552 734 A 551 735 G 550 736 C 549 737 G 0 738 A 0 739 A 0 740 A 0 741 G 782 742 C 781 743 G 780 744 U 779 745 G 778 746 G 777 747 G 0 748 G 0 749 A 0 750 G 776 751 C 775 752 G 0 753 A 0 754 A 0 755 C 771 756 A 770 757 G 769 758 G 768 759 A 0 760 U 0 761 U 0 762 A 0 763 G 0 764 A 0 765 U 0 766 A 0 767 C 0 768 C 758 769 C 757 770 U 756 771 G 755 772 G 0 773 U 0 774 A 0 775 G 751 776 U 750 777 C 746 778 C 745 779 A 744 780 C 743 781 G 742 782 C 741 783 C 0 784 G 0 785 U 0 786 A 0 787 A 0 788 A 0 789 C 0 790 G 0 791 G 0 792 U 0 793 G 853 794 G 852 795 G 851 796 C 850 797 A 849 798 C 848 799 U 0 800 A 0 801 G 831 802 G 830 803 U 829 804 G 828 805 U 827 806 G 826 807 G 825 808 G 824 809 C 823 810 A 822 811 A 821 812 C 820 813 A 0 814 U 0 815 U 0 816 C 0 817 C 0 818 A 0 819 C 0 820 G 812 821 U 811 822 U 810 823 G 809 824 U 808 825 C 807 826 C 806 827 G 805 828 U 804 829 G 803 830 C 802 831 C 801 832 G 0 833 C 0 834 A 0 835 G 842 836 C 841 837 U 0 838 A 0 839 A 543 840 C 542 841 G 836 842 C 835 843 A 0 844 U 0 845 U 0 846 A 0 847 A 0 848 G 798 849 U 797 850 G 796 851 C 795 852 C 794 853 C 793 854 C 547 855 G 541 856 C 540 857 C 539 858 U 0 859 G 886 860 G 885 861 G 884 862 G 0 863 A 0 864 G 0 865 U 0 866 A 0 867 C 0 868 G 879 869 G 878 870 C 877 871 C 876 872 G 0 873 C 0 874 A 0 875 A 0 876 G 871 877 G 870 878 C 869 879 U 868 880 A 0 881 A 0 882 A 0 883 A 0 884 C 861 885 U 860 886 C 859 887 A 0 888 A 0 889 A 0 890 G 19 891 G 18 892 A 17 893 A 0 894 U 0 895 U 1376 896 G 1375 897 A 1373 898 C 1372 899 G 1371 900 G 0 901 G 1370 902 G 1369 903 G 1368 904 C 1367 905 C 1366 906 C 1365 907 G 1364 908 C 0 909 A 1360 910 C 1359 911 A 0 912 A 0 913 G 1323 914 C 1322 915 G 1321 916 G 1320 917 C 1319 918 G 1216 919 G 1215 920 A 1214 921 G 1213 922 C 1212 923 A 1211 924 U 1210 925 G 1209 926 U 1208 927 G 1207 928 G 1205 929 C 1204 930 U 0 931 U 0 932 A 0 933 A 0 934 U 949 935 U 948 936 C 947 937 G 946 938 A 0 939 C 0 940 G 0 941 C 0 942 A 0 943 A 0 944 C 0 945 G 0 946 C 937 947 G 936 948 A 935 949 A 934 950 G 0 951 A 0 952 A 0 953 C 0 954 C 0 955 U 0 956 U 0 957 A 0 958 C 1200 959 C 1199 960 A 1198 961 A 1197 962 G 1196 963 G 1195 964 C 1194 965 U 0 966 U 0 967 G 0 968 A 0 969 C 0 970 A 1017 971 U 1016 972 A 1015 973 C 1014 974 A 1013 975 C 1012 976 C 1011 977 G 1010 978 G 1009 979 A 0 980 A 0 981 A 998 982 G 997 983 C 996 984 A 995 985 U 994 986 C 993 987 A 992 988 G 0 989 A 0 990 G 0 991 A 0 992 U 987 993 G 986 994 G 985 995 U 984 996 G 983 997 C 982 998 C 981 999 C 0 1000 C 1008 1001 C 1007 1002 C 0 1003 U 0 1004 U 0 1005 G 0 1006 U 0 1007 G 1001 1008 G 1000 1009 U 978 1010 C 977 1011 G 976 1012 G 975 1013 U 974 1014 G 973 1015 U 972 1016 A 971 1017 C 970 1018 A 0 1019 G 1189 1020 G 1188 1021 U 0 1022 G 1187 1023 G 1186 1024 U 1185 1025 G 1184 1026 C 0 1027 A 0 1028 U 1183 1029 G 1182 1030 G 1178 1031 C 1177 1032 U 1176 1033 G 1174 1034 U 1173 1035 C 1172 1036 G 1171 1037 U 0 1038 C 0 1039 A 0 1040 G 1079 1041 C 1078 1042 U 1077 1043 C 1076 1044 G 1075 1045 U 1074 1046 G 1055 1047 U 1054 1048 C 1053 1049 G 0 1050 U 0 1051 G 0 1052 A 0 1053 G 1048 1054 A 1047 1055 U 1046 1056 G 0 1057 U 0 1058 U 1071 1059 G 1070 1060 G 1069 1061 G 1068 1062 U 0 1063 U 0 1064 A 0 1065 A 0 1066 G 0 1067 U 0 1068 C 1061 1069 C 1060 1070 C 1059 1071 G 1058 1072 C 0 1073 A 0 1074 A 1045 1075 C 1044 1076 G 1043 1077 A 1042 1078 G 1041 1079 C 1040 1080 G 0 1081 C 0 1082 A 0 1083 A 0 1084 C 0 1085 C 1166 1086 C 1165 1087 U 1164 1088 U 1163 1089 G 0 1090 U 1134 1091 C 1133 1092 C 1132 1093 C 1131 1094 G 1130 1095 U 1129 1096 G 1128 1097 U 0 1098 U 0 1099 G 0 1100 C 1123 1101 C 1122 1102 A 0 1103 G 0 1104 C 1121 1105 A 1120 1106 G 1119 1107 G 1117 1108 C 1116 1109 C 1115 1110 C 0 1111 U 0 1112 U 0 1113 G 0 1114 U 0 1115 G 1109 1116 G 1108 1117 U 1107 1118 G 0 1119 C 1106 1120 U 1105 1121 G 1104 1122 G 1101 1123 G 1100 1124 G 0 1125 A 0 1126 C 0 1127 U 0 1128 C 1096 1129 A 1095 1130 C 1094 1131 G 1093 1132 G 1092 1133 G 1091 1134 A 1090 1135 G 0 1136 A 0 1137 C 1157 1138 C 1156 1139 G 1155 1140 C 1154 1141 C 1153 1142 G 1152 1143 G 1151 1144 G 1150 1145 G 0 1146 U 0 1147 C 0 1148 A 0 1149 A 0 1150 C 1144 1151 U 1143 1152 C 1142 1153 G 1141 1154 G 1140 1155 A 1139 1156 G 1138 1157 G 1137 1158 A 0 1159 A 0 1160 G 0 1161 G 0 1162 U 0 1163 G 1088 1164 G 1087 1165 G 1086 1166 G 1085 1167 A 0 1168 C 0 1169 G 0 1170 A 0 1171 C 1036 1172 G 1035 1173 U 1034 1174 C 1033 1175 A 0 1176 A 1032 1177 G 1031 1178 U 1030 1179 C 0 1180 A 0 1181 U 0 1182 C 1029 1183 A 1028 1184 U 1025 1185 G 1024 1186 C 1023 1187 C 1022 1188 C 1020 1189 C 1019 1190 U 0 1191 U 0 1192 A 0 1193 U 0 1194 G 964 1195 U 963 1196 C 962 1197 U 961 1198 U 960 1199 G 959 1200 G 958 1201 G 0 1202 C 0 1203 U 0 1204 G 929 1205 C 928 1206 A 0 1207 C 927 1208 A 926 1209 C 925 1210 G 924 1211 U 923 1212 G 922 1213 C 921 1214 U 920 1215 A 919 1216 C 918 1217 A 0 1218 A 0 1219 U 0 1220 G 1275 1221 G 1274 1222 C 1273 1223 C 1272 1224 G 1271 1225 G 1270 1226 U 1269 1227 A 0 1228 C 0 1229 A 0 1230 A 0 1231 U 0 1232 G 1263 1233 A 1262 1234 G 1261 1235 C 0 1236 U 0 1237 G 1256 1238 C 1255 1239 G 0 1240 A 0 1241 U 0 1242 A 1251 1243 C 1250 1244 C 1249 1245 G 0 1246 U 0 1247 G 0 1248 A 0 1249 G 1244 1250 G 1243 1251 U 1242 1252 G 0 1253 G 0 1254 A 0 1255 G 1238 1256 C 1237 1257 G 0 1258 A 0 1259 A 0 1260 U 0 1261 C 1234 1262 U 1233 1263 C 1232 1264 A 0 1265 A 0 1266 A 0 1267 A 0 1268 A 0 1269 G 1226 1270 C 1225 1271 C 1224 1272 G 1223 1273 G 1222 1274 U 1221 1275 C 1220 1276 U 0 1277 C 0 1278 A 0 1279 G 0 1280 U 0 1281 U 0 1282 C 1313 1283 G 0 1284 G 0 1285 A 0 1286 U 1309 1287 U 1308 1288 G 1307 1289 G 1306 1290 G 1305 1291 G 1304 1292 U 1303 1293 C 1302 1294 U 0 1295 G 0 1296 C 0 1297 A 0 1298 A 0 1299 C 0 1300 U 0 1301 C 0 1302 G 1293 1303 A 1292 1304 C 1291 1305 C 1290 1306 C 1289 1307 C 1288 1308 A 1287 1309 U 1286 1310 G 0 1311 A 0 1312 A 0 1313 G 1282 1314 U 0 1315 C 0 1316 G 0 1317 G 0 1318 A 0 1319 G 917 1320 U 916 1321 C 915 1322 G 914 1323 C 913 1324 U 0 1325 A 0 1326 G 0 1327 U 0 1328 A 0 1329 A 1352 1330 U 1351 1331 C 1350 1332 G 1349 1333 C 1348 1334 A 1347 1335 G 1346 1336 A 1345 1337 U 0 1338 C 0 1339 A 0 1340 G 0 1341 C 0 1342 A 0 1343 U 0 1344 U 0 1345 G 1336 1346 C 1335 1347 U 1334 1348 G 1333 1349 C 1332 1350 G 1331 1351 G 1330 1352 U 1329 1353 G 0 1354 A 0 1355 A 0 1356 U 0 1357 A 0 1358 C 0 1359 G 910 1360 U 909 1361 U 0 1362 C 0 1363 C 0 1364 C 907 1365 G 906 1366 G 905 1367 G 904 1368 C 903 1369 C 902 1370 U 901 1371 U 899 1372 G 898 1373 U 897 1374 A 0 1375 C 896 1376 A 895 1377 C 0 1378 A 0 1379 C 1489 1380 C 0 1381 G 1486 1382 C 1485 1383 C 0 1384 C 1482 1385 G 1481 1386 U 0 1387 C 0 1388 A 0 1389 C 1476 1390 G 1475 1391 U 1474 1392 C 1473 1393 A 1472 1394 C 1471 1395 G 1470 1396 A 1469 1397 A 0 1398 A 0 1399 G 1466 1400 U 1465 1401 C 1464 1402 G 1463 1403 G 1462 1404 U 1461 1405 A 1460 1406 A 1459 1407 C 1458 1408 A 1457 1409 C 1456 1410 C 1455 1411 C 0 1412 G 0 1413 A 0 1414 A 0 1415 G 1451 1416 C 1450 1417 C 1449 1418 G 1448 1419 G 1447 1420 U 1446 1421 G 0 1422 G 1445 1423 C 1444 1424 C 1443 1425 C 1442 1426 A 0 1427 A 0 1428 C 1440 1429 C 1439 1430 C 1438 1431 C 1437 1432 C 0 1433 U 0 1434 U 0 1435 G 0 1436 U 0 1437 G 1431 1438 G 1430 1439 G 1429 1440 G 1428 1441 A 0 1442 G 1425 1443 G 1424 1444 G 1423 1445 A 1422 1446 G 1420 1447 C 1419 1448 U 1418 1449 G 1417 1450 U 1416 1451 C 1415 1452 G 0 1453 A 0 1454 A 0 1455 G 1410 1456 G 1409 1457 U 1408 1458 G 1407 1459 G 1406 1460 G 1405 1461 A 1404 1462 C 1403 1463 U 1402 1464 G 1401 1465 G 1400 1466 C 1399 1467 G 0 1468 A 0 1469 U 1396 1470 U 1395 1471 G 1394 1472 G 1393 1473 G 1392 1474 A 1391 1475 C 1390 1476 G 1389 1477 A 0 1478 A 0 1479 G 0 1480 U 0 1481 C 1385 1482 G 1384 1483 U 0 1484 A 0 1485 A 1382 1486 C 1381 1487 A 0 1488 A 0 1489 G 1379 1490 G 0 1491 U 1514 1492 A 1513 1493 G 1512 1494 C 1511 1495 C 1510 1496 G 1509 1497 U 1508 1498 A 1507 1499 C 1506 1500 C 1505 1501 G 0 1502 G 0 1503 A 0 1504 A 0 1505 G 1500 1506 G 1499 1507 U 1498 1508 N 1497 1509 N 1496 1510 N 1495 1511 N 1494 1512 N 1493 1513 N 1492 1514 N 1491 1515 N 0 1516 N 0 1517 N 0 1518 N 0 1519 N 0 1520 N 0 1521 N 0 1522 N 0 1523 N 0 1524 N 0 1525 N 0 1526 N 0 1527 N 0