Filename: d.16.b.S.typhimurium.bpseq
Organism: Salmonella typhimurium
Accession Number: X80681
Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu
1 N 0
2 A 0
3 A 0
4 U 0
5 U 0
6 G 0
7 A 0
8 A 0
9 G 25
10 A 24
11 G 23
12 U 22
13 U 21
14 U 0
15 G 0
16 A 0
17 U 917
18 C 916
19 A 915
20 U 0
21 G 13
22 G 12
23 C 11
24 U 10
25 C 9
26 A 0
27 G 555
28 A 554
29 U 553
30 U 552
31 G 0
32 A 551
33 A 550
34 C 549
35 G 548
36 C 547
37 U 546
38 G 0
39 G 402
40 C 401
41 G 400
42 G 399
43 C 398
44 A 397
45 G 395
46 G 394
47 C 360
48 C 0
49 U 0
50 A 0
51 A 0
52 C 358
53 A 357
54 C 356
55 A 0
56 U 355
57 G 354
58 C 353
59 A 0
60 A 0
61 G 105
62 U 104
63 C 103
64 G 0
65 A 0
66 A 102
67 C 101
68 G 100
69 G 98
70 U 97
71 A 0
72 A 0
73 C 96
74 A 95
75 G 94
76 G 92
77 A 91
78 A 90
79 G 89
80 C 0
81 A 88
82 G 87
83 C 0
84 U 0
85 U 0
86 G 0
87 C 82
88 N 81
89 C 79
90 U 78
91 U 77
92 C 76
93 G 0
94 C 75
95 U 74
96 N 73
97 N 70
98 N 69
99 N 0
100 A 68
101 G 67
102 U 66
103 G 63
104 G 62
105 C 61
106 G 0
107 G 0
108 A 0
109 C 0
110 G 0
111 G 0
112 G 313
113 U 312
114 G 311
115 A 0
116 G 0
117 U 0
118 A 0
119 A 0
120 U 0
121 G 238
122 U 237
123 C 236
124 U 235
125 G 234
126 G 233
127 G 232
128 A 231
129 A 0
130 A 230
131 C 229
132 U 0
133 G 0
134 C 0
135 C 226
136 U 225
137 G 224
138 A 223
139 U 222
140 G 221
141 G 220
142 A 0
143 G 177
144 G 176
145 G 175
146 G 174
147 G 0
148 A 0
149 U 0
150 A 0
151 A 168
152 C 167
153 U 166
154 A 165
155 C 164
156 U 163
157 G 162
158 G 0
159 A 0
160 A 0
161 A 0
162 C 157
163 G 156
164 G 155
165 U 154
166 G 153
167 G 152
168 C 151
169 U 0
170 A 0
171 A 0
172 U 0
173 A 0
174 C 146
175 C 145
176 G 144
177 C 143
178 A 0
179 U 0
180 A 0
181 A 0
182 C 0
183 G 192
184 U 191
185 C 190
186 G 0
187 C 0
188 A 0
189 A 0
190 G 185
191 A 184
192 C 183
193 C 0
194 A 0
195 A 0
196 A 0
197 G 218
198 A 217
199 G 216
200 G 215
201 G 214
202 G 213
203 G 0
204 A 0
205 C 212
206 C 211
207 U 0
208 U 0
209 C 0
210 G 0
211 G 206
212 G 205
213 C 202
214 C 201
215 U 200
216 C 199
217 U 198
218 U 197
219 G 0
220 C 141
221 C 140
222 A 139
223 U 138
224 C 137
225 A 136
226 G 135
227 A 0
228 U 0
229 G 131
230 U 130
231 G 128
232 C 127
233 C 126
234 C 125
235 A 124
236 G 123
237 A 122
238 U 121
239 G 285
240 G 284
241 G 283
242 A 0
243 U 0
244 U 282
245 A 0
246 G 276
247 C 275
248 U 274
249 A 0
250 G 0
251 U 273
252 U 272
253 G 271
254 G 270
255 U 269
256 G 268
257 A 267
258 G 266
259 G 0
260 U 0
261 A 0
262 A 0
263 C 0
264 G 0
265 G 0
266 C 258
267 U 257
268 C 256
269 A 255
270 C 254
271 C 253
272 A 252
273 A 251
274 G 248
275 G 247
276 C 246
277 G 0
278 A 0
279 C 0
280 G 0
281 A 0
282 U 244
283 C 241
284 C 240
285 C 239
286 U 0
287 A 0
288 G 310
289 C 309
290 U 308
291 G 307
292 G 303
293 U 302
294 C 301
295 U 300
296 G 0
297 A 0
298 G 0
299 A 0
300 G 295
301 G 294
302 A 293
303 U 292
304 G 0
305 A 0
306 C 0
307 C 291
308 A 290
309 G 289
310 C 288
311 C 114
312 A 113
313 C 112
314 A 0
315 C 336
316 U 335
317 G 334
318 G 333
319 A 332
320 A 331
321 C 0
322 U 0
323 G 0
324 A 0
325 G 0
326 A 0
327 C 0
328 A 0
329 C 0
330 G 0
331 G 320
332 U 319
333 C 318
334 C 317
335 A 316
336 G 315
337 A 0
338 C 349
339 U 348
340 C 347
341 C 346
342 U 0
343 A 0
344 C 0
345 G 0
346 G 341
347 G 340
348 A 339
349 G 338
350 G 0
351 C 0
352 A 0
353 G 58
354 C 57
355 A 56
356 G 54
357 U 53
358 G 52
359 G 0
360 G 47
361 G 0
362 A 0
363 A 0
364 U 0
365 A 0
366 U 392
367 U 0
368 G 391
369 C 390
370 A 389
371 C 0
372 A 0
373 A 0
374 U 387
375 G 386
376 G 385
377 G 384
378 C 383
379 G 0
380 C 0
381 A 0
382 A 0
383 G 378
384 C 377
385 C 376
386 U 375
387 G 374
388 A 0
389 U 370
390 G 369
391 C 368
392 A 366
393 G 0
394 C 46
395 C 45
396 A 0
397 U 44
398 G 43
399 C 42
400 C 41
401 G 40
402 C 39
403 G 0
404 U 0
405 G 435
406 U 434
407 A 433
408 U 432
409 G 0
410 A 0
411 A 0
412 G 0
413 A 0
414 A 0
415 G 426
416 G 425
417 C 424
418 C 423
419 U 0
420 U 0
421 C 0
422 G 0
423 G 418
424 G 417
425 U 416
426 U 415
427 G 0
428 U 0
429 A 0
430 A 0
431 A 0
432 G 408
433 U 407
434 A 406
435 C 405
436 U 0
437 U 495
438 U 0
439 C 496
440 A 492
441 G 491
442 C 490
443 G 489
444 G 488
445 G 487
446 G 0
447 A 0
448 G 0
449 G 482
450 A 0
451 A 0
452 G 0
453 G 0
454 U 476
455 G 475
456 U 474
457 U 473
458 G 472
459 U 471
460 G 470
461 G 469
462 U 0
463 U 0
464 A 0
465 A 0
466 U 0
467 A 0
468 A 0
469 C 461
470 C 460
471 G 459
472 C 458
473 A 457
474 G 456
475 C 455
476 A 454
477 A 0
478 U 0
479 U 0
480 G 0
481 A 0
482 C 449
483 G 0
484 U 0
485 U 0
486 A 0
487 C 445
488 C 444
489 C 443
490 G 442
491 C 441
492 A 440
493 G 0
494 A 0
495 A 437
496 G 439
497 A 0
498 A 0
499 G 544
500 C 543
501 A 542
502 C 541
503 C 540
504 G 525
505 G 524
506 C 523
507 U 0
508 A 0
509 A 0
510 C 539
511 U 538
512 C 537
513 C 536
514 G 535
515 U 0
516 G 0
517 C 0
518 C 0
519 A 0
520 G 527
521 C 526
522 A 0
523 G 506
524 C 505
525 C 504
526 G 521
527 C 520
528 G 0
529 G 0
530 U 0
531 A 0
532 A 0
533 U 0
534 A 0
535 C 514
536 G 513
537 G 512
538 A 511
539 G 510
540 G 503
541 G 502
542 U 501
543 G 500
544 C 499
545 A 0
546 A 37
547 G 36
548 C 35
549 G 34
550 U 33
551 U 32
552 A 30
553 A 29
554 U 28
555 C 27
556 G 0
557 G 0
558 A 0
559 A 0
560 U 0
561 U 0
562 A 0
563 C 0
564 U 0
565 G 0
566 G 882
567 G 881
568 C 880
569 G 865
570 U 864
571 A 0
572 A 0
573 A 0
574 G 879
575 C 0
576 G 763
577 C 762
578 A 761
579 C 760
580 G 0
581 C 757
582 A 0
583 G 756
584 G 755
585 C 754
586 G 0
587 G 650
588 U 649
589 C 648
590 U 647
591 G 646
592 U 645
593 C 644
594 A 0
595 A 643
596 G 642
597 U 639
598 C 638
599 G 637
600 G 636
601 A 635
602 U 634
603 G 633
604 U 632
605 G 631
606 A 0
607 A 0
608 A 0
609 U 0
610 C 628
611 C 627
612 C 626
613 C 625
614 G 624
615 G 623
616 G 622
617 C 0
618 U 0
619 C 0
620 A 0
621 A 0
622 C 616
623 C 615
624 U 614
625 G 613
626 G 612
627 G 611
628 A 610
629 A 0
630 C 0
631 U 605
632 G 604
633 C 603
634 A 602
635 U 601
636 U 600
637 C 599
638 G 598
639 A 597
640 A 0
641 A 0
642 C 596
643 U 595
644 G 593
645 G 592
646 C 591
647 A 590
648 G 589
649 G 588
650 C 587
651 U 0
652 U 0
653 G 0
654 A 750
655 G 749
656 U 748
657 C 747
658 U 745
659 U 744
660 G 743
661 U 742
662 A 741
663 G 0
664 A 0
665 G 739
666 G 738
667 G 737
668 G 736
669 G 735
670 G 734
671 U 733
672 A 716
673 G 715
674 A 0
675 A 0
676 U 712
677 U 711
678 C 710
679 C 709
680 A 708
681 G 707
682 G 706
683 U 705
684 G 0
685 U 0
686 A 0
687 G 698
688 C 697
689 G 696
690 G 0
691 U 0
692 G 0
693 A 0
694 A 0
695 A 0
696 U 689
697 G 688
698 C 687
699 G 0
700 U 0
701 A 0
702 G 0
703 A 0
704 G 0
705 A 683
706 U 682
707 C 681
708 U 680
709 G 679
710 G 678
711 A 677
712 G 676
713 G 0
714 A 0
715 A 673
716 U 672
717 A 0
718 C 0
719 C 0
720 G 0
721 G 732
722 U 0
723 G 0
724 G 731
725 C 730
726 G 0
727 A 0
728 A 0
729 G 0
730 G 725
731 C 724
732 G 721
733 G 671
734 C 670
735 C 669
736 C 668
737 C 667
738 C 666
739 U 665
740 G 0
741 G 662
742 A 661
743 C 660
744 A 659
745 A 658
746 A 0
747 G 657
748 A 656
749 C 655
750 U 654
751 G 0
752 A 0
753 C 0
754 G 585
755 C 584
756 U 583
757 C 581
758 A 0
759 G 0
760 G 579
761 U 578
762 G 577
763 C 576
764 G 0
765 A 0
766 A 0
767 A 0
768 G 809
769 C 808
770 G 807
771 U 806
772 G 805
773 G 804
774 G 0
775 G 0
776 A 0
777 G 803
778 C 802
779 A 0
780 A 0
781 A 0
782 C 798
783 A 797
784 G 796
785 G 795
786 A 0
787 U 0
788 U 0
789 A 0
790 G 0
791 A 0
792 U 0
793 A 0
794 C 0
795 C 785
796 C 784
797 U 783
798 G 782
799 G 0
800 U 0
801 A 0
802 G 778
803 U 777
804 C 773
805 C 772
806 A 771
807 C 770
808 G 769
809 C 768
810 C 0
811 G 0
812 U 0
813 A 0
814 A 0
815 A 0
816 C 0
817 G 0
818 A 0
819 U 0
820 G 878
821 U 877
822 C 876
823 U 875
824 A 874
825 C 873
826 U 0
827 U 0
828 G 856
829 G 855
830 A 854
831 G 853
832 G 852
833 U 851
834 U 850
835 G 849
836 U 848
837 G 847
838 C 846
839 C 845
840 C 0
841 U 0
842 U 0
843 G 0
844 A 0
845 G 839
846 G 838
847 C 837
848 G 836
849 U 835
850 G 834
851 G 833
852 C 832
853 U 831
854 U 830
855 C 829
856 C 828
857 G 0
858 G 0
859 A 0
860 C 0
861 G 0
862 U 0
863 A 0
864 A 570
865 C 569
866 G 0
867 C 0
868 G 0
869 U 0
870 U 0
871 A 0
872 A 0
873 G 825
874 U 824
875 A 823
876 G 822
877 A 821
878 C 820
879 C 574
880 G 568
881 C 567
882 C 566
883 U 0
884 G 911
885 G 910
886 G 909
887 G 0
888 A 0
889 G 0
890 U 0
891 A 0
892 C 0
893 G 904
894 G 903
895 C 902
896 C 901
897 G 0
898 C 0
899 A 0
900 A 0
901 G 896
902 G 895
903 U 894
904 U 893
905 A 0
906 A 0
907 A 0
908 A 0
909 C 886
910 U 885
911 C 884
912 A 0
913 A 0
914 A 0
915 U 19
916 G 18
917 A 17
918 A 0
919 U 0
920 U 1394
921 G 1393
922 A 1391
923 C 1390
924 G 1389
925 G 0
926 G 1388
927 G 1387
928 G 1386
929 C 1385
930 C 1384
931 G 1382
932 C 0
933 A 1378
934 C 1377
935 A 0
936 A 0
937 G 1342
938 C 1341
939 G 1340
940 G 1339
941 U 1338
942 G 1235
943 G 1234
944 A 1233
945 G 1232
946 C 1231
947 A 1230
948 U 1229
949 G 1228
950 U 1227
951 G 1226
952 G 1224
953 U 1223
954 U 0
955 U 0
956 A 0
957 A 0
958 U 973
959 U 972
960 C 971
961 G 970
962 A 0
963 U 0
964 G 0
965 C 0
966 A 0
967 A 0
968 C 0
969 G 0
970 C 961
971 G 960
972 A 959
973 A 958
974 G 0
975 A 0
976 A 0
977 C 0
978 C 0
979 U 0
980 U 0
981 A 0
982 C 1219
983 C 1218
984 U 1217
985 G 1216
986 G 1215
987 U 1214
988 C 1213
989 U 0
990 U 0
991 G 0
992 A 0
993 C 0
994 A 1043
995 U 1042
996 C 1041
997 C 1039
998 A 1038
999 C 1037
1000 A 1036
1001 G 1035
1002 A 0
1003 A 0
1004 G 1021
1005 A 1020
1006 A 1019
1007 U 1018
1008 C 1017
1009 C 1016
1010 A 1015
1011 G 0
1012 A 0
1013 G 0
1014 A 0
1015 U 1010
1016 G 1009
1017 G 1008
1018 A 1007
1019 U 1006
1020 U 1005
1021 G 1004
1022 G 0
1023 U 1034
1024 G 1033
1025 C 1032
1026 C 1031
1027 U 0
1028 U 0
1029 C 0
1030 G 0
1031 G 1026
1032 G 1025
1033 A 1024
1034 A 1023
1035 C 1001
1036 U 1000
1037 G 999
1038 U 998
1039 G 997
1040 A 0
1041 G 996
1042 A 995
1043 C 994
1044 A 0
1045 G 1208
1046 G 1207
1047 U 0
1048 G 1206
1049 C 1205
1050 U 1204
1051 G 1203
1052 C 0
1053 A 0
1054 U 1202
1055 G 1201
1056 G 1197
1057 C 1196
1058 U 1195
1059 G 1193
1060 U 1192
1061 C 1191
1062 G 1190
1063 U 0
1064 C 0
1065 A 0
1066 G 1105
1067 C 1104
1068 U 1103
1069 C 1102
1070 G 1101
1071 U 1100
1072 G 1081
1073 U 1080
1074 U 1079
1075 G 0
1076 U 0
1077 G 0
1078 A 0
1079 A 1074
1080 A 1073
1081 U 1072
1082 G 0
1083 U 0
1084 U 1097
1085 G 1096
1086 G 1095
1087 G 1094
1088 U 0
1089 U 0
1090 A 0
1091 A 0
1092 G 0
1093 U 0
1094 C 1087
1095 C 1086
1096 C 1085
1097 G 1084
1098 C 0
1099 A 0
1100 A 1071
1101 C 1070
1102 G 1069
1103 A 1068
1104 G 1067
1105 C 1066
1106 G 0
1107 C 0
1108 A 0
1109 A 0
1110 C 0
1111 C 1185
1112 C 1184
1113 U 1183
1114 U 1182
1115 A 0
1116 U 1153
1117 C 1152
1118 C 1151
1119 U 1150
1120 U 1149
1121 U 1148
1122 G 1147
1123 U 0
1124 U 0
1125 G 0
1126 C 1142
1127 C 1141
1128 A 0
1129 G 0
1130 C 1140
1131 G 1139
1132 A 1138
1133 U 0
1134 U 0
1135 A 0
1136 G 0
1137 G 0
1138 U 1132
1139 C 1131
1140 G 1130
1141 G 1127
1142 G 1126
1143 A 0
1144 A 0
1145 C 0
1146 U 0
1147 C 1122
1148 A 1121
1149 A 1120
1150 A 1119
1151 G 1118
1152 G 1117
1153 A 1116
1154 G 0
1155 A 0
1156 C 1176
1157 U 1175
1158 G 1174
1159 C 1173
1160 C 1172
1161 A 1171
1162 G 1170
1163 U 1169
1164 G 0
1165 A 0
1166 U 0
1167 A 0
1168 A 0
1169 A 1163
1170 C 1162
1171 U 1161
1172 G 1160
1173 G 1159
1174 A 1158
1175 G 1157
1176 G 1156
1177 A 0
1178 A 0
1179 G 0
1180 G 0
1181 U 0
1182 G 1114
1183 G 1113
1184 G 1112
1185 G 1111
1186 A 0
1187 U 0
1188 G 0
1189 A 0
1190 C 1062
1191 G 1061
1192 U 1060
1193 C 1059
1194 A 0
1195 A 1058
1196 G 1057
1197 U 1056
1198 C 0
1199 A 0
1200 U 0
1201 C 1055
1202 A 1054
1203 U 1051
1204 G 1050
1205 G 1049
1206 C 1048
1207 C 1046
1208 C 1045
1209 U 0
1210 U 0
1211 A 0
1212 C 0
1213 G 988
1214 A 987
1215 C 986
1216 C 985
1217 A 984
1218 G 983
1219 G 982
1220 G 0
1221 C 0
1222 U 0
1223 A 953
1224 C 952
1225 A 0
1226 C 951
1227 A 950
1228 C 949
1229 G 948
1230 U 947
1231 G 946
1232 C 945
1233 U 944
1234 A 943
1235 C 942
1236 A 0
1237 A 0
1238 U 0
1239 G 1294
1240 G 1293
1241 C 1292
1242 G 1291
1243 C 1290
1244 A 1289
1245 U 1288
1246 A 0
1247 C 0
1248 A 0
1249 A 0
1250 A 0
1251 G 1282
1252 A 1281
1253 G 1280
1254 A 0
1255 A 0
1256 G 1275
1257 C 1274
1258 G 0
1259 A 0
1260 C 0
1261 C 1270
1262 U 1269
1263 C 1268
1264 G 0
1265 C 0
1266 G 0
1267 A 0
1268 G 1263
1269 A 1262
1270 G 1261
1271 C 0
1272 A 0
1273 A 0
1274 G 1257
1275 C 1256
1276 G 0
1277 G 0
1278 A 0
1279 C 0
1280 C 1253
1281 U 1252
1282 C 1251
1283 A 0
1284 U 0
1285 A 0
1286 A 0
1287 A 0
1288 G 1245
1289 U 1244
1290 G 1243
1291 C 1242
1292 G 1241
1293 U 1240
1294 C 1239
1295 G 0
1296 U 0
1297 A 0
1298 G 0
1299 U 0
1300 C 0
1301 C 1332
1302 G 0
1303 G 0
1304 A 0
1305 U 1328
1306 U 1327
1307 G 1326
1308 G 1325
1309 A 1324
1310 G 1323
1311 U 1322
1312 C 1321
1313 U 0
1314 G 0
1315 C 0
1316 A 0
1317 A 0
1318 C 0
1319 U 0
1320 C 0
1321 G 1312
1322 A 1311
1323 C 1310
1324 U 1309
1325 C 1308
1326 C 1307
1327 A 1306
1328 U 1305
1329 G 0
1330 A 0
1331 A 0
1332 G 1301
1333 U 0
1334 C 0
1335 G 0
1336 G 0
1337 A 0
1338 A 941
1339 U 940
1340 C 939
1341 G 938
1342 C 937
1343 U 0
1344 A 0
1345 G 0
1346 U 0
1347 A 0
1348 A 1370
1349 U 1369
1350 C 1368
1351 G 1367
1352 U 1366
1353 G 1365
1354 G 1364
1355 A 1363
1356 U 0
1357 C 0
1358 A 0
1359 G 0
1360 A 0
1361 A 0
1362 U 0
1363 G 1355
1364 C 1354
1365 C 1353
1366 A 1352
1367 C 1351
1368 G 1350
1369 G 1349
1370 U 1348
1371 G 0
1372 A 0
1373 A 0
1374 U 0
1375 A 0
1376 C 0
1377 G 934
1378 U 933
1379 U 0
1380 C 0
1381 C 0
1382 C 931
1383 G 0
1384 G 930
1385 G 929
1386 C 928
1387 C 927
1388 U 926
1389 U 924
1390 G 923
1391 U 922
1392 A 0
1393 C 921
1394 A 920
1395 C 0
1396 A 0
1397 C 1502
1398 C 0
1399 G 1499
1400 C 1498
1401 C 0
1402 C 1495
1403 G 1494
1404 U 0
1405 C 0
1406 A 0
1407 C 1489
1408 A 1488
1409 C 1487
1410 C 1486
1411 A 1485
1412 U 1484
1413 G 1483
1414 G 1482
1415 G 0
1416 A 0
1417 G 1479
1418 U 1478
1419 G 1477
1420 G 1476
1421 G 1475
1422 U 1474
1423 U 1473
1424 G 1472
1425 C 1471
1426 A 1470
1427 A 1469
1428 A 1468
1429 A 0
1430 G 0
1431 A 0
1432 A 0
1433 G 1464
1434 U 1463
1435 A 1462
1436 G 1461
1437 G 1460
1438 U 1459
1439 A 0
1440 G 1458
1441 C 1457
1442 U 1456
1443 U 1455
1444 A 0
1445 A 0
1446 C 1453
1447 C 1452
1448 U 0
1449 U 0
1450 C 0
1451 G 0
1452 G 1447
1453 G 1446
1454 A 0
1455 G 1443
1456 G 1442
1457 G 1441
1458 C 1440
1459 G 1438
1460 C 1437
1461 U 1436
1462 U 1435
1463 A 1434
1464 C 1433
1465 C 0
1466 A 0
1467 C 0
1468 U 1428
1469 U 1427
1470 U 1426
1471 G 1425
1472 U 1424
1473 G 1423
1474 A 1422
1475 U 1421
1476 U 1420
1477 C 1419
1478 A 1418
1479 U 1417
1480 G 0
1481 A 0
1482 C 1414
1483 U 1413
1484 G 1412
1485 G 1411
1486 G 1410
1487 G 1409
1488 U 1408
1489 G 1407
1490 A 0
1491 A 0
1492 G 0
1493 U 0
1494 C 1403
1495 G 1402
1496 U 0
1497 A 0
1498 A 1400
1499 C 1399
1500 A 0
1501 A 0
1502 G 1397
1503 G 0
1504 U 1527
1505 A 1526
1506 A 1525
1507 C 1524
1508 C 1523
1509 G 1522
1510 U 1521
1511 A 1520
1512 G 1519
1513 G 1518
1514 G 0
1515 N 0
1516 A 0
1517 A 0
1518 C 1513
1519 C 1512
1520 U 1511
1521 G 1510
1522 C 1509
1523 G 1508
1524 G 1507
1525 U 1506
1526 U 1505
1527 G 1504
1528 G 0
1529 A 0
1530 U 0
1531 C 0
1532 A 0
1533 C 0
1534 C 0
1535 U 0
1536 C 0
1537 C 0
1538 U 0
1539 U 0
1540 A 0