Filename: d.16.b.Streptomyces.sp.bpseq Organism: Streptomyces sp. Accession Number: D63866 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 C 0 2 A 0 3 U 0 4 U 0 5 C 0 6 A 0 7 C 0 8 G 0 9 G 0 10 A 0 11 G 27 12 A 26 13 G 25 14 U 24 15 U 23 16 U 0 17 G 0 18 A 0 19 U 894 20 C 893 21 C 892 22 U 0 23 G 15 24 G 14 25 C 13 26 U 12 27 C 11 28 A 0 29 G 530 30 G 529 31 A 528 32 C 527 33 G 0 34 A 526 35 A 525 36 C 524 37 G 523 38 C 522 39 U 521 40 G 0 41 G 397 42 C 396 43 G 395 44 G 394 45 C 393 46 G 392 47 U 390 48 G 389 49 C 355 50 U 0 51 U 0 52 A 0 53 A 0 54 C 353 55 A 352 56 C 351 57 A 0 58 U 350 59 G 349 60 C 348 61 A 0 62 A 0 63 G 98 64 U 97 65 C 96 66 G 0 67 A 0 68 A 95 69 C 94 70 G 93 71 A 91 72 U 90 73 G 0 74 A 0 75 A 0 76 G 87 77 C 86 78 C 85 79 U 84 80 U 0 81 U 0 82 C 0 83 G 0 84 G 79 85 G 78 86 G 77 87 U 76 88 G 0 89 G 0 90 A 72 91 U 71 92 U 0 93 A 70 94 G 69 95 U 68 96 G 65 97 G 64 98 C 63 99 G 0 100 A 0 101 A 0 102 C 0 103 G 0 104 G 0 105 G 308 106 U 307 107 G 306 108 A 0 109 G 0 110 U 0 111 A 0 112 A 0 113 C 0 114 A 233 115 C 232 116 G 231 117 U 230 118 G 229 119 G 228 120 G 227 121 C 226 122 A 0 123 A 0 124 U 225 125 C 224 126 U 0 127 G 0 128 C 0 129 C 221 130 C 220 131 U 219 132 G 218 133 C 217 134 A 216 135 C 215 136 U 0 137 C 171 138 U 170 139 G 169 140 G 168 141 G 0 142 A 0 143 C 0 144 A 0 145 A 162 146 G 161 147 C 160 148 C 159 149 C 158 150 U 157 151 G 156 152 G 0 153 A 0 154 A 0 155 A 0 156 C 151 157 G 150 158 G 149 159 G 148 160 G 147 161 U 146 162 C 145 163 U 0 164 A 0 165 A 0 166 U 0 167 A 0 168 C 140 169 C 139 170 G 138 171 G 137 172 A 0 173 U 0 174 A 0 175 A 0 176 U 0 177 A 200 178 C 199 179 C 198 180 U 197 181 U 196 182 C 195 183 C 194 184 C 193 185 U 192 186 C 191 187 G 0 188 C 0 189 A 0 190 U 0 191 G 186 192 G 185 193 G 184 194 G 183 195 G 182 196 U 181 197 G 180 198 G 179 199 G 178 200 U 177 201 U 0 202 C 0 203 A 0 204 A 0 205 A 0 206 G 213 207 C 212 208 U 0 209 C 0 210 C 0 211 G 0 212 G 207 213 C 206 214 G 0 215 G 135 216 U 134 217 G 133 218 C 132 219 A 131 220 G 130 221 G 129 222 A 0 223 U 0 224 G 125 225 A 124 226 G 121 227 C 120 228 C 119 229 C 118 230 G 117 231 C 116 232 G 115 233 G 114 234 C 280 235 C 279 236 U 278 237 A 0 238 U 0 239 C 277 240 A 0 241 G 271 242 C 270 243 U 269 244 U 0 245 G 0 246 U 268 247 U 267 248 G 266 249 G 265 250 U 264 251 G 263 252 A 262 253 G 261 254 G 0 255 U 0 256 A 0 257 G 0 258 U 0 259 G 0 260 G 0 261 C 253 262 U 252 263 C 251 264 A 250 265 C 249 266 C 248 267 A 247 268 A 246 269 G 243 270 G 242 271 C 241 272 G 0 273 A 0 274 C 0 275 G 0 276 A 0 277 C 239 278 G 236 279 G 235 280 G 234 281 U 0 282 A 0 283 G 305 284 C 304 285 C 303 286 G 302 287 G 298 288 C 297 289 C 296 290 U 295 291 G 0 292 A 0 293 G 0 294 A 0 295 G 290 296 G 289 297 G 288 298 C 287 299 G 0 300 A 0 301 C 0 302 C 286 303 G 285 304 G 284 305 C 283 306 C 107 307 A 106 308 C 105 309 A 0 310 C 331 311 U 330 312 G 329 313 G 328 314 G 327 315 A 326 316 C 0 317 U 0 318 G 0 319 A 0 320 G 0 321 A 0 322 C 0 323 A 0 324 C 0 325 G 0 326 G 315 327 C 314 328 C 313 329 C 312 330 A 311 331 G 310 332 A 0 333 C 344 334 U 343 335 C 342 336 C 341 337 U 0 338 A 0 339 C 0 340 G 0 341 G 336 342 G 335 343 A 334 344 G 333 345 G 0 346 C 0 347 A 0 348 G 60 349 C 59 350 A 58 351 G 56 352 U 55 353 G 54 354 G 0 355 G 49 356 G 0 357 A 0 358 A 0 359 U 0 360 A 0 361 U 387 362 U 0 363 G 386 364 C 385 365 A 384 366 C 0 367 A 0 368 A 0 369 U 382 370 G 381 371 G 380 372 G 379 373 C 378 374 G 0 375 A 0 376 A 0 377 A 0 378 G 373 379 C 372 380 C 371 381 U 370 382 G 369 383 A 0 384 U 365 385 G 364 386 C 363 387 A 361 388 G 0 389 C 48 390 G 47 391 A 0 392 C 46 393 G 45 394 C 44 395 C 43 396 G 42 397 C 41 398 G 0 399 U 0 400 G 430 401 A 429 402 G 428 403 G 427 404 G 0 405 A 0 406 U 0 407 G 0 408 A 0 409 C 0 410 G 421 411 G 420 412 C 419 413 C 418 414 U 0 415 U 0 416 C 0 417 G 0 418 G 413 419 G 412 420 U 411 421 U 410 422 G 0 423 U 0 424 A 0 425 A 0 426 A 0 427 C 403 428 C 402 429 U 401 430 C 400 431 U 0 432 U 470 433 U 0 434 C 471 435 A 467 436 G 466 437 C 465 438 A 464 439 G 463 440 G 462 441 G 0 442 A 0 443 A 0 444 G 457 445 A 0 446 A 0 447 G 0 448 C 0 449 G 0 450 A 0 451 A 0 452 A 0 453 G 0 454 U 0 455 G 0 456 A 0 457 C 444 458 G 0 459 G 0 460 U 0 461 A 0 462 C 440 463 C 439 464 U 438 465 G 437 466 C 436 467 A 435 468 G 0 469 A 0 470 A 432 471 G 434 472 A 0 473 A 0 474 G 519 475 C 518 476 G 517 477 C 516 478 C 515 479 G 500 480 G 499 481 C 498 482 U 0 483 A 0 484 A 0 485 C 514 486 U 513 487 A 512 488 C 511 489 G 510 490 U 0 491 G 0 492 C 0 493 C 0 494 A 0 495 G 502 496 C 501 497 A 0 498 G 481 499 C 480 500 C 479 501 G 496 502 C 495 503 G 0 504 G 0 505 U 0 506 A 0 507 A 0 508 U 0 509 A 0 510 C 489 511 G 488 512 U 487 513 A 486 514 G 485 515 G 478 516 G 477 517 C 476 518 G 475 519 C 474 520 A 0 521 A 39 522 G 38 523 C 37 524 G 36 525 U 35 526 U 34 527 G 32 528 U 31 529 C 30 530 C 29 531 G 0 532 G 0 533 A 0 534 A 0 535 U 0 536 U 0 537 A 0 538 U 0 539 U 0 540 G 0 541 G 859 542 G 858 543 C 857 544 G 842 545 U 841 546 A 0 547 A 0 548 A 0 549 G 856 550 A 0 551 G 738 552 C 737 553 U 736 554 C 735 555 G 0 556 U 732 557 A 0 558 G 731 559 G 730 560 C 729 561 G 0 562 G 625 563 U 624 564 C 623 565 U 622 566 G 621 567 U 620 568 C 619 569 G 0 570 C 618 571 G 617 572 U 614 573 C 613 574 G 612 575 G 611 576 A 610 577 U 609 578 G 608 579 U 607 580 G 606 581 A 0 582 A 0 583 A 0 584 G 0 585 C 603 586 C 602 587 C 601 588 G 600 589 G 599 590 G 598 591 G 597 592 C 0 593 U 0 594 U 0 595 A 0 596 A 0 597 C 591 598 C 590 599 C 589 600 C 588 601 G 587 602 G 586 603 G 585 604 U 0 605 C 0 606 U 580 607 G 579 608 C 578 609 A 577 610 U 576 611 U 575 612 C 574 613 G 573 614 A 572 615 U 0 616 A 0 617 C 571 618 G 570 619 G 568 620 G 567 621 C 566 622 A 565 623 G 564 624 A 563 625 C 562 626 U 0 627 A 0 628 G 0 629 A 725 630 G 724 631 U 723 632 G 721 633 U 720 634 G 719 635 G 718 636 U 717 637 A 716 638 G 0 639 G 0 640 G 714 641 G 713 642 A 712 643 G 711 644 A 710 645 U 709 646 C 708 647 G 691 648 G 690 649 A 0 650 A 0 651 U 687 652 U 686 653 C 685 654 C 684 655 U 683 656 G 682 657 G 681 658 U 680 659 G 0 660 U 0 661 A 0 662 G 673 663 C 672 664 G 671 665 G 0 666 U 0 667 G 0 668 A 0 669 A 0 670 A 0 671 U 664 672 G 663 673 C 662 674 G 0 675 C 0 676 A 0 677 G 0 678 A 0 679 U 0 680 A 658 681 U 657 682 C 656 683 A 655 684 G 654 685 G 653 686 A 652 687 G 651 688 G 0 689 A 0 690 A 648 691 C 647 692 A 0 693 C 0 694 C 0 695 G 0 696 G 707 697 U 0 698 G 0 699 G 706 700 C 705 701 G 0 702 A 0 703 A 0 704 G 0 705 G 700 706 C 699 707 G 696 708 G 646 709 A 645 710 U 644 711 C 643 712 U 642 713 C 641 714 U 640 715 G 0 716 G 637 717 G 636 718 C 635 719 C 634 720 A 633 721 U 632 722 U 0 723 A 631 724 C 630 725 U 629 726 G 0 727 A 0 728 C 0 729 G 560 730 C 559 731 U 558 732 G 556 733 A 0 734 G 0 735 G 554 736 A 553 737 G 552 738 C 551 739 G 0 740 A 0 741 A 0 742 A 0 743 G 784 744 C 783 745 G 782 746 U 781 747 G 780 748 G 779 749 G 0 750 G 0 751 A 0 752 G 778 753 C 777 754 G 0 755 A 0 756 A 0 757 C 773 758 A 772 759 G 771 760 G 770 761 A 0 762 U 0 763 U 0 764 A 0 765 G 0 766 A 0 767 U 0 768 A 0 769 C 0 770 C 760 771 C 759 772 U 758 773 G 757 774 G 0 775 U 0 776 A 0 777 G 753 778 U 752 779 C 748 780 C 747 781 A 746 782 C 745 783 G 744 784 C 743 785 C 0 786 G 0 787 U 0 788 A 0 789 A 0 790 A 0 791 C 0 792 G 0 793 G 0 794 U 0 795 G 855 796 G 854 797 G 853 798 A 852 799 A 851 800 C 850 801 U 0 802 A 0 803 G 833 804 G 832 805 U 831 806 G 830 807 U 829 808 U 828 809 G 827 810 G 826 811 C 825 812 G 824 813 A 823 814 C 822 815 A 0 816 U 0 817 U 0 818 C 0 819 C 0 820 A 0 821 C 0 822 G 814 823 U 813 824 C 812 825 G 811 826 U 810 827 C 809 828 G 808 829 G 807 830 U 806 831 G 805 832 C 804 833 C 803 834 G 0 835 C 0 836 A 0 837 G 844 838 C 843 839 U 0 840 A 0 841 A 545 842 C 544 843 G 838 844 C 837 845 A 0 846 U 0 847 U 0 848 A 0 849 A 0 850 G 800 851 U 799 852 U 798 853 C 797 854 C 796 855 C 795 856 C 549 857 G 543 858 C 542 859 C 541 860 U 0 861 G 888 862 G 887 863 G 886 864 G 0 865 A 0 866 G 0 867 U 0 868 A 0 869 C 0 870 G 881 871 G 880 872 C 879 873 C 878 874 G 0 875 C 0 876 A 0 877 A 0 878 G 873 879 G 872 880 C 871 881 U 870 882 A 0 883 A 0 884 A 0 885 A 0 886 C 863 887 U 862 888 C 861 889 A 0 890 A 0 891 A 0 892 G 21 893 G 20 894 A 19 895 A 0 896 U 0 897 U 1379 898 G 1378 899 A 1376 900 C 1375 901 G 1374 902 G 0 903 G 1373 904 G 1372 905 G 1371 906 C 1370 907 C 1369 908 C 1368 909 G 1367 910 C 0 911 A 1363 912 C 1362 913 A 0 914 A 0 915 G 1326 916 C 1325 917 A 1324 918 G 1323 919 C 1322 920 G 1219 921 G 1218 922 A 1217 923 G 1216 924 C 1215 925 A 1214 926 U 1213 927 G 1212 928 U 1211 929 G 1210 930 G 1208 931 C 1207 932 U 0 933 U 0 934 A 0 935 A 0 936 U 951 937 U 950 938 C 949 939 G 948 940 A 0 941 C 0 942 G 0 943 C 0 944 A 0 945 A 0 946 C 0 947 G 0 948 C 939 949 G 938 950 A 937 951 A 936 952 G 0 953 A 0 954 A 0 955 C 0 956 C 0 957 U 0 958 U 0 959 A 0 960 C 1203 961 C 1202 962 A 1201 963 A 1200 964 G 1199 965 G 1198 966 C 1197 967 U 0 968 U 0 969 G 0 970 A 0 971 C 0 972 A 1019 973 U 1018 974 A 1017 975 C 1016 976 A 1015 977 C 1014 978 C 1013 979 G 1012 980 G 1011 981 A 0 982 A 0 983 A 1000 984 C 999 985 A 998 986 U 997 987 C 996 988 C 995 989 A 994 990 G 0 991 A 0 992 G 0 993 A 0 994 U 989 995 G 988 996 G 987 997 G 986 998 U 985 999 G 984 1000 C 983 1001 C 0 1002 C 1010 1003 C 1009 1004 C 0 1005 U 0 1006 U 0 1007 G 0 1008 U 0 1009 G 1003 1010 G 1002 1011 U 980 1012 C 979 1013 G 978 1014 G 977 1015 U 976 1016 G 975 1017 U 974 1018 A 973 1019 C 972 1020 A 0 1021 G 1192 1022 G 1191 1023 U 0 1024 G 1190 1025 G 1189 1026 U 1188 1027 G 1187 1028 C 0 1029 A 0 1030 U 1186 1031 G 1185 1032 G 1181 1033 C 1180 1034 U 1179 1035 G 1177 1036 U 1176 1037 C 1175 1038 G 1174 1039 U 0 1040 C 0 1041 A 0 1042 G 1081 1043 C 1080 1044 U 1079 1045 C 1078 1046 G 1077 1047 U 1076 1048 G 1057 1049 U 1056 1050 C 1055 1051 G 0 1052 U 0 1053 G 0 1054 A 0 1055 G 1050 1056 A 1049 1057 U 1048 1058 G 0 1059 U 0 1060 U 1073 1061 G 1072 1062 G 1071 1063 G 1070 1064 U 0 1065 U 0 1066 A 0 1067 A 0 1068 G 0 1069 U 0 1070 C 1063 1071 C 1062 1072 C 1061 1073 G 1060 1074 C 0 1075 A 0 1076 A 1047 1077 C 1046 1078 G 1045 1079 A 1044 1080 G 1043 1081 C 1042 1082 G 0 1083 C 0 1084 A 0 1085 A 0 1086 C 0 1087 C 1169 1088 C 1168 1089 U 1167 1090 U 1166 1091 G 0 1092 U 1137 1093 U 1136 1094 C 1135 1095 U 1134 1096 G 1133 1097 U 1132 1098 G 1131 1099 U 0 1100 U 0 1101 G 0 1102 C 1126 1103 C 1125 1104 A 0 1105 G 0 1106 C 1124 1107 A 1123 1108 U 1122 1109 G 1120 1110 C 1119 1111 C 1118 1112 C 1117 1113 U 0 1114 U 0 1115 C 0 1116 G 0 1117 G 1112 1118 G 1111 1119 G 1110 1120 U 1109 1121 G 0 1122 A 1108 1123 U 1107 1124 G 1106 1125 G 1103 1126 G 1102 1127 G 0 1128 A 0 1129 C 0 1130 U 0 1131 C 1098 1132 A 1097 1133 C 1096 1134 A 1095 1135 G 1094 1136 G 1093 1137 A 1092 1138 G 0 1139 A 0 1140 C 1160 1141 U 1159 1142 G 1158 1143 C 1157 1144 C 1156 1145 G 1155 1146 G 1154 1147 G 1153 1148 G 0 1149 U 0 1150 C 0 1151 A 0 1152 A 0 1153 C 1147 1154 U 1146 1155 C 1145 1156 G 1144 1157 G 1143 1158 A 1142 1159 G 1141 1160 G 1140 1161 A 0 1162 A 0 1163 G 0 1164 G 0 1165 U 0 1166 G 1090 1167 G 1089 1168 G 1088 1169 G 1087 1170 A 0 1171 C 0 1172 G 0 1173 A 0 1174 C 1038 1175 G 1037 1176 U 1036 1177 C 1035 1178 A 0 1179 A 1034 1180 G 1033 1181 U 1032 1182 C 0 1183 A 0 1184 U 0 1185 C 1031 1186 A 1030 1187 U 1027 1188 G 1026 1189 C 1025 1190 C 1024 1191 C 1022 1192 C 1021 1193 U 0 1194 U 0 1195 A 0 1196 U 0 1197 G 966 1198 U 965 1199 C 964 1200 U 963 1201 U 962 1202 G 961 1203 G 960 1204 G 0 1205 C 0 1206 U 0 1207 G 931 1208 C 930 1209 A 0 1210 C 929 1211 A 928 1212 C 927 1213 G 926 1214 U 925 1215 G 924 1216 C 923 1217 U 922 1218 A 921 1219 C 920 1220 A 0 1221 A 0 1222 U 0 1223 G 1278 1224 G 1277 1225 C 1276 1226 C 1275 1227 G 1274 1228 G 1273 1229 U 1272 1230 A 0 1231 C 0 1232 A 0 1233 A 0 1234 U 0 1235 G 1266 1236 A 1265 1237 G 1264 1238 C 0 1239 U 0 1240 G 1259 1241 C 1258 1242 G 0 1243 A 0 1244 U 0 1245 G 1254 1246 C 1253 1247 C 1252 1248 G 0 1249 U 0 1250 G 0 1251 A 0 1252 G 1247 1253 G 1246 1254 C 1245 1255 G 0 1256 G 0 1257 A 0 1258 G 1241 1259 C 1240 1260 G 0 1261 A 0 1262 A 0 1263 U 0 1264 C 1237 1265 U 1236 1266 C 1235 1267 A 0 1268 A 0 1269 A 0 1270 A 0 1271 A 0 1272 G 1229 1273 C 1228 1274 C 1227 1275 G 1226 1276 G 1225 1277 U 1224 1278 C 1223 1279 U 0 1280 C 0 1281 A 0 1282 G 0 1283 U 0 1284 U 0 1285 C 1316 1286 G 0 1287 G 0 1288 A 0 1289 U 1312 1290 U 1311 1291 G 1310 1292 G 1309 1293 G 1308 1294 G 1307 1295 U 1306 1296 C 1305 1297 U 0 1298 G 0 1299 C 0 1300 A 0 1301 A 0 1302 C 0 1303 U 0 1304 C 0 1305 G 1296 1306 A 1295 1307 C 1294 1308 C 1293 1309 C 1292 1310 C 1291 1311 A 1290 1312 U 1289 1313 G 0 1314 A 0 1315 A 0 1316 G 1285 1317 U 0 1318 C 0 1319 G 0 1320 G 0 1321 A 0 1322 G 919 1323 U 918 1324 U 917 1325 G 916 1326 C 915 1327 U 0 1328 A 0 1329 G 0 1330 U 0 1331 A 0 1332 A 1355 1333 U 1354 1334 C 1353 1335 G 1352 1336 C 1351 1337 A 1350 1338 G 1349 1339 A 1348 1340 U 0 1341 C 0 1342 A 0 1343 G 0 1344 C 0 1345 A 0 1346 U 0 1347 U 0 1348 G 1339 1349 C 1338 1350 U 1337 1351 G 1336 1352 C 1335 1353 G 1334 1354 G 1333 1355 U 1332 1356 G 0 1357 A 0 1358 A 0 1359 U 0 1360 A 0 1361 C 0 1362 G 912 1363 U 911 1364 U 0 1365 C 0 1366 C 0 1367 C 909 1368 G 908 1369 G 907 1370 G 906 1371 C 905 1372 C 904 1373 U 903 1374 U 901 1375 G 900 1376 U 899 1377 A 0 1378 C 898 1379 A 897 1380 C 0 1381 A 0 1382 C 1490 1383 C 0 1384 G 1487 1385 C 1486 1386 C 0 1387 C 1483 1388 G 1482 1389 U 0 1390 C 0 1391 A 0 1392 C 1477 1393 G 1476 1394 U 1475 1395 C 1474 1396 A 1473 1397 C 1472 1398 G 1471 1399 A 1470 1400 A 0 1401 A 0 1402 G 1467 1403 U 1466 1404 C 1465 1405 G 1464 1406 G 1463 1407 U 1462 1408 A 1461 1409 A 1460 1410 C 1459 1411 A 1458 1412 C 1457 1413 C 1456 1414 C 0 1415 G 0 1416 A 0 1417 A 0 1418 G 1452 1419 C 1451 1420 C 1450 1421 G 1449 1422 G 1448 1423 U 1447 1424 G 0 1425 G 1446 1426 C 1445 1427 C 1444 1428 C 1443 1429 A 0 1430 A 0 1431 C 1441 1432 C 1440 1433 C 1439 1434 U 0 1435 U 0 1436 A 0 1437 C 0 1438 G 0 1439 G 1433 1440 G 1432 1441 G 1431 1442 A 0 1443 G 1428 1444 G 1427 1445 G 1426 1446 A 1425 1447 G 1423 1448 C 1422 1449 U 1421 1450 G 1420 1451 U 1419 1452 C 1418 1453 G 0 1454 A 0 1455 A 0 1456 G 1413 1457 G 1412 1458 U 1411 1459 G 1410 1460 G 1409 1461 G 1408 1462 A 1407 1463 C 1406 1464 U 1405 1465 G 1404 1466 G 1403 1467 C 1402 1468 G 0 1469 A 0 1470 U 1399 1471 U 1398 1472 G 1397 1473 G 1396 1474 G 1395 1475 A 1394 1476 C 1393 1477 G 1392 1478 A 0 1479 A 0 1480 G 0 1481 U 0 1482 C 1388 1483 G 1387 1484 U 0 1485 A 0 1486 A 1385 1487 C 1384 1488 A 0 1489 A 0 1490 G 1382 1491 G 0 1492 U 1515 1493 A 1514 1494 G 1513 1495 C 1512 1496 C 1511 1497 G 1510 1498 U 1509 1499 A 1508 1500 C 1507 1501 C 1506 1502 G 0 1503 G 0 1504 A 0 1505 A 0 1506 G 1501 1507 G 1500 1508 U 1499 1509 G 1498 1510 C 1497 1511 G 1496 1512 G 1495 1513 C 1494 1514 U 1493 1515 G 1492 1516 G 0 1517 A 0 1518 U 0 1519 C 0 1520 A 0 1521 C 0 1522 C 0 1523 U 0 1524 C 0 1525 C 0 1526 U 0 1527 U 0 1528 U 0 1529 C 0 1530 U 0