Filename: d.16.b.V.cholerae.bpseq
Organism: Vibrio cholerae
Accession Number: X76337
Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu
1 N 0
2 N 0
3 N 0
4 N 0
5 N 0
6 N 0
7 A 0
8 G 24
9 A 23
10 G 22
11 U 21
12 U 20
13 U 0
14 G 0
15 A 0
16 U 917
17 N 916
18 N 915
19 U 0
20 G 12
21 G 11
22 C 10
23 U 9
24 C 8
25 A 0
26 G 555
27 A 554
28 U 553
29 U 552
30 G 0
31 A 551
32 A 550
33 C 549
34 G 548
35 C 547
36 U 546
37 G 0
38 G 402
39 C 401
40 G 400
41 G 399
42 C 398
43 A 397
44 G 395
45 G 394
46 C 360
47 C 0
48 U 0
49 A 0
50 A 0
51 C 358
52 A 357
53 C 356
54 A 0
55 U 355
56 G 354
57 C 353
58 A 0
59 A 0
60 G 105
61 U 104
62 C 103
63 G 0
64 A 0
65 G 102
66 C 101
67 G 100
68 G 98
69 C 97
70 A 0
71 G 0
72 C 96
73 A 95
74 C 94
75 A 92
76 G 91
77 A 90
78 G 89
79 G 88
80 A 87
81 A 86
82 C 0
83 U 0
84 U 0
85 G 0
86 U 81
87 U 80
88 C 79
89 C 78
90 U 77
91 U 76
92 G 75
93 G 0
94 G 74
95 U 73
96 G 72
97 G 69
98 C 68
99 G 0
100 A 67
101 G 66
102 C 65
103 G 62
104 G 61
105 C 60
106 G 0
107 G 0
108 A 0
109 C 0
110 G 0
111 G 0
112 G 313
113 U 312
114 G 311
115 A 0
116 G 0
117 U 0
118 A 0
119 A 0
120 U 0
121 G 238
122 C 237
123 C 236
124 U 235
125 G 234
126 G 233
127 G 232
128 A 231
129 A 0
130 A 230
131 U 229
132 U 0
133 G 0
134 C 0
135 C 226
136 C 225
137 G 224
138 G 223
139 U 222
140 A 221
141 G 220
142 A 0
143 G 177
144 G 176
145 G 175
146 G 174
147 G 0
148 A 0
149 U 0
150 A 0
151 A 168
152 C 167
153 C 166
154 A 165
155 U 164
156 U 163
157 G 162
158 G 0
159 A 0
160 A 0
161 A 0
162 C 157
163 G 156
164 A 155
165 U 154
166 G 153
167 G 152
168 C 151
169 U 0
170 A 0
171 A 0
172 U 0
173 A 0
174 C 146
175 C 145
176 G 144
177 C 143
178 A 0
179 U 0
180 A 0
181 A 0
182 C 0
183 C 192
184 U 191
185 C 190
186 G 0
187 C 0
188 A 0
189 A 0
190 G 185
191 A 184
192 G 183
193 C 0
194 A 0
195 A 0
196 A 0
197 G 218
198 C 217
199 A 216
200 G 215
201 G 214
202 G 213
203 G 0
204 A 0
205 C 212
206 C 211
207 U 0
208 U 0
209 C 0
210 G 0
211 G 206
212 G 205
213 C 202
214 C 201
215 U 200
216 U 199
217 G 198
218 C 197
219 G 0
220 C 141
221 U 140
222 A 139
223 C 138
224 C 137
225 G 136
226 G 135
227 A 0
228 U 0
229 A 131
230 U 130
231 G 128
232 C 127
233 C 126
234 C 125
235 A 124
236 G 123
237 G 122
238 U 121
239 G 285
240 G 284
241 G 283
242 A 0
243 U 0
244 U 282
245 A 0
246 G 276
247 C 275
248 U 274
249 A 0
250 G 0
251 U 273
252 U 272
253 G 271
254 G 270
255 U 269
256 G 268
257 A 267
258 G 266
259 G 0
260 U 0
261 A 0
262 A 0
263 G 0
264 G 0
265 G 0
266 C 258
267 U 257
268 C 256
269 A 255
270 C 254
271 C 253
272 A 252
273 A 251
274 G 248
275 G 247
276 C 246
277 G 0
278 A 0
279 C 0
280 G 0
281 A 0
282 U 244
283 C 241
284 C 240
285 C 239
286 U 0
287 A 0
288 G 310
289 C 309
290 U 308
291 G 307
292 G 303
293 U 302
294 C 301
295 U 300
296 G 0
297 A 0
298 G 0
299 A 0
300 G 295
301 G 294
302 A 293
303 U 292
304 G 0
305 A 0
306 U 0
307 C 291
308 A 290
309 G 289
310 C 288
311 C 114
312 A 113
313 C 112
314 A 0
315 C 336
316 U 335
317 G 334
318 G 333
319 A 332
320 A 331
321 C 0
322 U 0
323 G 0
324 A 0
325 G 0
326 A 0
327 C 0
328 A 0
329 C 0
330 G 0
331 G 320
332 U 319
333 C 318
334 C 317
335 A 316
336 G 315
337 A 0
338 C 349
339 U 348
340 C 347
341 C 346
342 U 0
343 A 0
344 C 0
345 G 0
346 G 341
347 G 340
348 A 339
349 G 338
350 G 0
351 C 0
352 A 0
353 G 57
354 C 56
355 A 55
356 G 53
357 U 52
358 G 51
359 G 0
360 G 46
361 G 0
362 A 0
363 A 0
364 U 0
365 A 0
366 U 392
367 U 0
368 G 391
369 C 390
370 A 389
371 C 0
372 A 0
373 A 0
374 U 387
375 G 386
376 G 385
377 G 384
378 C 383
379 G 0
380 C 0
381 A 0
382 A 0
383 G 378
384 C 377
385 C 376
386 U 375
387 G 374
388 A 0
389 U 370
390 G 369
391 C 368
392 A 366
393 G 0
394 C 45
395 C 44
396 A 0
397 U 43
398 G 42
399 C 41
400 C 40
401 G 39
402 C 38
403 G 0
404 U 0
405 G 435
406 U 434
407 A 433
408 U 432
409 G 0
410 A 0
411 A 0
412 G 0
413 A 0
414 A 0
415 G 426
416 G 425
417 C 424
418 C 423
419 U 0
420 U 0
421 C 0
422 G 0
423 G 418
424 G 417
425 U 416
426 U 415
427 G 0
428 U 0
429 A 0
430 A 0
431 A 0
432 G 408
433 U 407
434 A 406
435 C 405
436 U 0
437 U 495
438 U 0
439 C 0
440 A 492
441 G 491
442 U 490
443 A 489
444 G 488
445 G 487
446 G 0
447 A 0
448 G 0
449 G 482
450 A 0
451 A 0
452 G 0
453 G 0
454 U 476
455 G 475
456 G 474
457 U 473
458 U 472
459 A 471
460 A 470
461 G 469
462 U 0
463 U 0
464 A 0
465 A 0
466 U 0
467 A 0
468 C 0
469 C 461
470 U 460
471 U 459
472 A 458
473 A 457
474 U 456
475 C 455
476 A 454
477 U 0
478 U 0
479 U 0
480 G 0
481 A 0
482 C 449
483 G 0
484 U 0
485 U 0
486 A 0
487 C 445
488 C 444
489 U 443
490 A 442
491 C 441
492 A 440
493 G 0
494 A 0
495 A 437
496 G 0
497 A 0
498 A 0
499 G 544
500 C 543
501 A 542
502 C 541
503 C 540
504 G 0
505 G 0
506 C 0
507 U 0
508 A 0
509 A 0
510 C 539
511 U 538
512 C 537
513 C 536
514 G 535
515 U 0
516 G 0
517 C 0
518 C 0
519 A 0
520 G 527
521 C 526
522 A 0
523 G 0
524 C 0
525 C 0
526 G 521
527 C 520
528 G 0
529 G 0
530 U 0
531 A 0
532 A 0
533 U 0
534 A 0
535 C 514
536 G 513
537 G 512
538 A 511
539 G 510
540 G 503
541 G 502
542 U 501
543 G 500
544 C 499
545 A 0
546 A 36
547 G 35
548 C 34
549 G 33
550 U 32
551 U 31
552 A 29
553 A 28
554 U 27
555 C 26
556 G 0
557 G 0
558 A 0
559 A 0
560 U 0
561 U 0
562 A 0
563 C 0
564 U 0
565 G 0
566 G 882
567 G 881
568 C 880
569 G 0
570 U 0
571 A 0
572 A 0
573 A 0
574 G 0
575 C 0
576 G 763
577 C 762
578 A 761
579 U 760
580 G 0
581 C 757
582 A 0
583 G 756
584 G 755
585 U 754
586 G 0
587 G 650
588 U 649
589 U 648
590 U 647
591 G 646
592 U 645
593 U 644
594 A 0
595 A 643
596 G 642
597 U 639
598 C 638
599 A 637
600 G 636
601 A 635
602 U 634
603 G 633
604 U 632
605 G 631
606 A 0
607 A 0
608 A 0
609 G 0
610 C 628
611 C 627
612 C 626
613 U 625
614 G 624
615 G 623
616 G 622
617 C 0
618 U 0
619 C 0
620 A 0
621 A 0
622 C 616
623 C 615
624 U 614
625 A 613
626 G 612
627 G 611
628 A 610
629 A 0
630 U 0
631 C 605
632 G 604
633 C 603
634 A 602
635 U 601
636 U 600
637 U 599
638 G 598
639 A 597
640 A 0
641 A 0
642 C 596
643 U 595
644 G 593
645 A 592
646 C 591
647 A 590
648 A 589
649 G 588
650 C 587
651 U 0
652 A 0
653 G 0
654 A 750
655 G 749
656 U 748
657 A 747
658 C 745
659 U 744
660 G 743
661 U 742
662 A 741
663 G 0
664 A 0
665 G 739
666 G 738
667 G 737
668 G 736
669 G 735
670 G 734
671 U 733
672 A 716
673 G 715
674 A 0
675 A 0
676 U 712
677 U 711
678 U 710
679 C 709
680 A 708
681 G 707
682 G 706
683 U 705
684 G 0
685 U 0
686 A 0
687 G 698
688 C 697
689 G 696
690 G 0
691 U 0
692 G 0
693 A 0
694 A 0
695 A 0
696 U 689
697 G 688
698 C 687
699 G 0
700 U 0
701 A 0
702 G 0
703 A 0
704 G 0
705 A 683
706 U 682
707 C 681
708 U 680
709 G 679
710 A 678
711 A 677
712 G 676
713 G 0
714 A 0
715 A 673
716 U 672
717 A 0
718 C 0
719 C 0
720 G 0
721 G 732
722 U 0
723 G 0
724 G 731
725 C 730
726 G 0
727 A 0
728 A 0
729 G 0
730 G 725
731 C 724
732 G 721
733 G 671
734 C 670
735 C 669
736 C 668
737 C 667
738 C 666
739 U 665
740 G 0
741 G 662
742 A 661
743 C 660
744 A 659
745 G 658
746 A 0
747 U 657
748 A 656
749 C 655
750 U 654
751 G 0
752 A 0
753 C 0
754 A 585
755 C 584
756 U 583
757 C 581
758 A 0
759 G 0
760 A 579
761 U 578
762 G 577
763 C 576
764 G 0
765 A 0
766 A 0
767 A 0
768 G 809
769 C 808
770 G 807
771 U 806
772 G 805
773 G 804
774 G 0
775 G 0
776 A 0
777 G 803
778 C 802
779 A 0
780 A 0
781 A 0
782 C 798
783 A 797
784 G 796
785 G 795
786 A 0
787 U 0
788 U 0
789 A 0
790 G 0
791 A 0
792 U 0
793 A 0
794 C 0
795 C 785
796 C 784
797 U 783
798 G 782
799 G 0
800 U 0
801 A 0
802 G 778
803 U 777
804 C 773
805 C 772
806 A 771
807 C 770
808 G 769
809 C 768
810 C 0
811 G 0
812 U 0
813 A 0
814 A 0
815 A 0
816 C 0
817 G 0
818 A 0
819 U 0
820 G 878
821 U 877
822 C 876
823 U 875
824 A 874
825 C 873
826 U 0
827 U 0
828 G 856
829 G 855
830 A 854
831 G 853
832 G 852
833 U 851
834 U 850
835 G 849
836 U 848
837 G 847
838 C 846
839 C 845
840 C 0
841 U 0
842 A 0
843 G 0
844 A 0
845 G 839
846 G 838
847 C 837
848 G 836
849 U 835
850 G 834
851 G 833
852 C 832
853 U 831
854 U 830
855 U 829
856 C 828
857 G 0
858 G 0
859 A 0
860 G 867
861 C 866
862 U 0
863 A 0
864 A 0
865 C 0
866 G 861
867 C 860
868 G 0
869 U 0
870 U 0
871 A 0
872 A 0
873 G 825
874 U 824
875 A 823
876 G 822
877 A 821
878 C 820
879 C 0
880 G 568
881 C 567
882 C 566
883 U 0
884 G 911
885 G 910
886 G 909
887 G 0
888 A 0
889 G 0
890 U 0
891 A 0
892 C 0
893 G 904
894 G 903
895 U 902
896 C 901
897 G 0
898 C 0
899 A 0
900 A 0
901 G 896
902 A 895
903 U 894
904 U 893
905 A 0
906 A 0
907 A 0
908 A 0
909 C 886
910 U 885
911 C 884
912 A 0
913 A 0
914 A 0
915 U 18
916 G 17
917 A 16
918 A 0
919 U 0
920 U 1398
921 G 1397
922 A 1395
923 C 1394
924 G 1393
925 G 0
926 G 1392
927 G 1391
928 G 1390
929 C 1389
930 C 1388
931 C 1387
932 G 1386
933 C 0
934 A 1382
935 C 1381
936 A 0
937 A 0
938 G 1346
939 C 1345
940 G 1344
941 G 1343
942 U 1342
943 G 1237
944 G 1236
945 A 1235
946 G 1234
947 C 1233
948 A 1232
949 U 1231
950 G 1230
951 U 1229
952 G 1228
953 G 1226
954 U 1225
955 U 0
956 U 0
957 A 0
958 A 0
959 U 974
960 U 973
961 C 972
962 G 971
963 A 0
964 U 0
965 G 0
966 C 0
967 A 0
968 A 0
969 C 0
970 G 0
971 C 962
972 G 961
973 A 960
974 A 959
975 G 0
976 A 0
977 A 0
978 C 0
979 C 0
980 U 0
981 U 0
982 A 0
983 C 1221
984 C 1220
985 U 1219
986 A 1218
987 C 1217
988 U 1216
989 C 1215
990 U 0
991 U 0
992 G 0
993 A 0
994 C 0
995 A 1044
996 U 1043
997 C 1042
998 C 1040
999 A 1039
1000 G 1038
1001 A 1037
1002 G 1036
1003 A 0
1004 A 0
1005 U 1022
1006 C 1021
1007 U 1020
1008 A 1019
1009 G 1018
1010 C 1017
1011 G 1016
1012 G 0
1013 A 0
1014 G 0
1015 A 0
1016 C 1011
1017 G 1010
1018 C 1009
1019 U 1008
1020 G 1007
1021 G 1006
1022 A 1005
1023 G 0
1024 U 1035
1025 G 1034
1026 C 1033
1027 C 1032
1028 U 0
1029 U 0
1030 C 0
1031 G 0
1032 G 1027
1033 G 1026
1034 A 1025
1035 G 1024
1036 C 1002
1037 U 1001
1038 C 1000
1039 U 999
1040 G 998
1041 A 0
1042 G 997
1043 A 996
1044 C 995
1045 A 0
1046 G 1210
1047 G 1209
1048 U 0
1049 G 1208
1050 C 1207
1051 U 1206
1052 G 1205
1053 C 0
1054 A 0
1055 U 1204
1056 G 1203
1057 G 1199
1058 C 1198
1059 U 1197
1060 G 1195
1061 U 1194
1062 C 1193
1063 G 1192
1064 U 0
1065 C 0
1066 A 0
1067 G 1106
1068 C 1105
1069 U 1104
1070 C 1103
1071 G 1102
1072 U 1101
1073 G 1082
1074 U 1081
1075 U 1080
1076 G 0
1077 U 0
1078 G 0
1079 A 0
1080 A 1075
1081 A 1074
1082 U 1073
1083 G 0
1084 U 0
1085 U 1098
1086 G 1097
1087 G 1096
1088 G 1095
1089 U 0
1090 U 0
1091 A 0
1092 A 0
1093 G 0
1094 U 0
1095 C 1088
1096 C 1087
1097 C 1086
1098 G 1085
1099 C 0
1100 A 0
1101 A 1072
1102 C 1071
1103 G 1070
1104 A 1069
1105 G 1068
1106 C 1067
1107 G 0
1108 C 0
1109 A 0
1110 A 0
1111 C 0
1112 C 1187
1113 C 1186
1114 U 1185
1115 U 1184
1116 A 0
1117 U 1155
1118 C 1154
1119 C 1153
1120 U 1152
1121 U 1151
1122 G 1150
1123 U 1149
1124 U 0
1125 U 0
1126 G 0
1127 C 1144
1128 C 1143
1129 A 0
1130 G 0
1131 C 1142
1132 A 1141
1133 C 1140
1134 G 0
1135 U 0
1136 A 0
1137 A 0
1138 U 0
1139 G 0
1140 G 1133
1141 U 1132
1142 G 1131
1143 G 1128
1144 G 1127
1145 A 0
1146 A 0
1147 C 0
1148 U 0
1149 C 1123
1150 C 1122
1151 A 1121
1152 G 1120
1153 G 1119
1154 G 1118
1155 A 1117
1156 G 0
1157 A 0
1158 C 1178
1159 U 1177
1160 G 1176
1161 C 1175
1162 C 1174
1163 G 1173
1164 G 1172
1165 U 1171
1166 G 0
1167 A 0
1168 U 0
1169 A 0
1170 A 0
1171 A 1165
1172 C 1164
1173 C 1163
1174 G 1162
1175 G 1161
1176 A 1160
1177 G 1159
1178 G 1158
1179 A 0
1180 A 0
1181 G 0
1182 G 0
1183 U 0
1184 G 1115
1185 G 1114
1186 G 1113
1187 G 1112
1188 A 0
1189 C 0
1190 G 0
1191 A 0
1192 C 1063
1193 G 1062
1194 U 1061
1195 C 1060
1196 A 0
1197 A 1059
1198 G 1058
1199 U 1057
1200 C 0
1201 A 0
1202 U 0
1203 C 1056
1204 A 1055
1205 U 1052
1206 G 1051
1207 G 1050
1208 C 1049
1209 C 1047
1210 C 1046
1211 U 0
1212 U 0
1213 A 0
1214 C 0
1215 G 989
1216 A 988
1217 G 987
1218 U 986
1219 A 985
1220 G 984
1221 G 983
1222 G 0
1223 C 0
1224 U 0
1225 A 954
1226 C 953
1227 A 0
1228 C 952
1229 A 951
1230 C 950
1231 G 949
1232 U 948
1233 G 947
1234 C 946
1235 U 945
1236 A 944
1237 C 943
1238 A 0
1239 A 0
1240 U 0
1241 G 1298
1242 G 1297
1243 C 1296
1244 G 1295
1245 U 1294
1246 A 1293
1247 U 1292
1248 A 0
1249 C 0
1250 A 0
1251 G 0
1252 A 0
1253 G 1286
1254 G 1285
1255 G 1284
1256 C 0
1257 A 0
1258 G 1279
1259 C 1278
1260 G 0
1261 A 0
1262 A 0
1263 U 0
1264 A 1274
1265 C 1273
1266 C 1272
1267 G 0
1268 C 0
1269 G 0
1270 A 0
1271 A 0
1272 G 1266
1273 G 1265
1274 U 1264
1275 G 0
1276 G 0
1277 A 0
1278 G 1259
1279 C 1258
1280 G 0
1281 A 0
1282 A 0
1283 U 0
1284 C 1255
1285 U 1254
1286 C 1253
1287 A 0
1288 C 0
1289 A 0
1290 A 0
1291 A 0
1292 G 1247
1293 U 1246
1294 A 1245
1295 C 1244
1296 G 1243
1297 U 1242
1298 C 1241
1299 G 0
1300 U 0
1301 A 0
1302 G 0
1303 U 0
1304 C 0
1305 C 1336
1306 G 0
1307 G 0
1308 A 0
1309 U 1332
1310 U 1331
1311 G 1330
1312 G 1329
1313 A 1328
1314 G 1327
1315 U 1326
1316 C 1325
1317 U 0
1318 G 0
1319 C 0
1320 A 0
1321 A 0
1322 C 0
1323 U 0
1324 C 0
1325 G 1316
1326 A 1315
1327 C 1314
1328 U 1313
1329 C 1312
1330 C 1311
1331 A 1310
1332 U 1309
1333 G 0
1334 A 0
1335 A 0
1336 G 1305
1337 U 0
1338 C 0
1339 G 0
1340 G 0
1341 A 0
1342 A 942
1343 U 941
1344 C 940
1345 G 939
1346 C 938
1347 U 0
1348 A 0
1349 G 0
1350 U 0
1351 A 0
1352 A 1374
1353 U 1373
1354 C 1372
1355 G 1371
1356 C 1370
1357 A 1369
1358 A 1368
1359 A 1367
1360 U 0
1361 C 0
1362 A 0
1363 G 0
1364 A 0
1365 A 0
1366 U 0
1367 G 1359
1368 U 1358
1369 U 1357
1370 G 1356
1371 C 1355
1372 G 1354
1373 G 1353
1374 U 1352
1375 G 0
1376 A 0
1377 A 0
1378 U 0
1379 A 0
1380 C 0
1381 G 935
1382 U 934
1383 U 0
1384 C 0
1385 C 0
1386 C 932
1387 G 931
1388 G 930
1389 G 929
1390 C 928
1391 C 927
1392 U 926
1393 U 924
1394 G 923
1395 U 922
1396 A 0
1397 C 921
1398 A 920
1399 C 0
1400 A 0
1401 C 0
1402 C 0
1403 G 1503
1404 C 1502
1405 C 0
1406 C 1499
1407 G 1498
1408 U 0
1409 C 0
1410 A 0
1411 C 1493
1412 A 1492
1413 C 1491
1414 C 1490
1415 A 1489
1416 U 1488
1417 G 1487
1418 G 1486
1419 G 0
1420 A 0
1421 G 1483
1422 U 1482
1423 G 1481
1424 G 1480
1425 G 1479
1426 C 1478
1427 U 1477
1428 G 1476
1429 C 1475
1430 A 1474
1431 A 1473
1432 A 1472
1433 A 0
1434 G 0
1435 A 0
1436 A 0
1437 G 1468
1438 C 1467
1439 A 1466
1440 G 1465
1441 G 1464
1442 U 1463
1443 A 0
1444 G 1462
1445 U 1461
1446 U 1460
1447 U 1459
1448 A 0
1449 A 0
1450 C 1457
1451 C 1456
1452 U 0
1453 U 0
1454 C 0
1455 G 0
1456 G 1451
1457 G 1450
1458 A 0
1459 G 1447
1460 G 1446
1461 A 1445
1462 C 1444
1463 G 1442
1464 C 1441
1465 U 1440
1466 U 1439
1467 G 1438
1468 C 1437
1469 C 0
1470 A 0
1471 C 0
1472 U 1432
1473 U 1431
1474 U 1430
1475 G 1429
1476 U 1428
1477 G 1427
1478 G 1426
1479 U 1425
1480 U 1424
1481 C 1423
1482 A 1422
1483 U 1421
1484 G 0
1485 A 0
1486 C 1418
1487 U 1417
1488 G 1416
1489 G 1415
1490 G 1414
1491 G 1413
1492 U 1412
1493 G 1411
1494 A 0
1495 A 0
1496 G 0
1497 U 0
1498 C 1407
1499 G 1406
1500 U 0
1501 A 0
1502 A 1404
1503 C 1403
1504 A 0
1505 A 0
1506 G 0
1507 G 0
1508 U 1531
1509 A 1530
1510 G 1529
1511 C 1528
1512 G 1527
1513 C 1526
1514 U 1525
1515 A 1524
1516 G 1523
1517 G 1522
1518 G 0
1519 G 0
1520 A 0
1521 A 0
1522 C 1517
1523 C 1516
1524 U 1515
1525 G 1514
1526 G 1513
1527 C 1512
1528 G 1511
1529 C 1510
1530 U 1509
1531 G 1508
1532 G 0
1533 A 0
1534 U 0
1535 C 0
1536 A 0
1537 C 0
1538 C 0
1539 U 0
1540 C 0
1541 C 0
1542 U 0
1543 U 0
1544 U 0