Filename: d.16.c.E.gracilis.bpseq Organism: Euglena gracilis Accession Number: X12890 V00159 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 U 0 2 G 0 3 G 0 4 A 0 5 A 0 6 A 0 7 U 0 8 G 0 9 A 0 10 C 0 11 G 27 12 A 26 13 G 25 14 U 24 15 U 23 16 U 0 17 G 0 18 A 0 19 U 882 20 C 881 21 C 880 22 U 0 23 U 15 24 G 14 25 C 13 26 U 12 27 C 11 28 A 0 29 G 527 30 G 526 31 G 525 32 U 524 33 G 0 34 A 523 35 A 522 36 C 521 37 G 520 38 C 519 39 U 518 40 G 0 41 G 397 42 C 396 43 G 395 44 G 394 45 U 393 46 A 392 47 U 390 48 G 389 49 C 355 50 U 0 51 U 0 52 A 0 53 A 0 54 C 353 55 A 352 56 C 351 57 A 0 58 U 350 59 G 349 60 C 348 61 A 0 62 A 0 63 G 98 64 U 97 65 U 96 66 G 0 67 A 0 68 A 95 69 C 94 70 G 93 71 A 92 72 A 91 73 A 90 74 U 89 75 U 88 76 A 87 77 C 86 78 U 85 79 A 84 80 G 0 81 C 0 82 A 0 83 A 0 84 U 79 85 A 78 86 G 77 87 U 76 88 A 75 89 A 74 90 U 73 91 U 72 92 U 71 93 A 70 94 G 69 95 U 68 96 G 65 97 G 64 98 C 63 99 G 0 100 G 0 101 A 0 102 C 0 103 G 0 104 G 0 105 G 309 106 U 308 107 G 307 108 A 0 109 G 0 110 U 0 111 A 0 112 A 0 113 U 0 114 A 234 115 U 233 116 G 232 117 U 231 118 A 230 119 A 229 120 G 228 121 A 227 122 A 0 123 U 226 124 C 225 125 U 0 126 G 0 127 C 0 128 G 222 129 C 221 130 U 220 131 U 219 132 G 218 133 G 217 134 G 216 135 C 0 136 G 170 137 A 169 138 G 168 139 G 167 140 A 0 141 A 0 142 U 0 143 A 0 144 A 161 145 C 160 146 A 159 147 G 158 148 A 157 149 U 156 150 G 155 151 G 0 152 A 0 153 A 0 154 A 0 155 C 150 156 G 149 157 U 148 158 U 147 159 U 146 160 G 145 161 C 144 162 U 0 163 A 0 164 A 0 165 U 0 166 G 0 167 C 139 168 C 138 169 U 137 170 C 136 171 A 0 172 U 0 173 A 0 174 A 0 175 U 183 176 U 182 177 U 181 178 A 0 179 C 0 180 U 0 181 A 177 182 G 176 183 A 175 184 U 0 185 C 0 186 U 0 187 A 0 188 U 0 189 G 0 190 U 214 191 G 213 192 A 212 193 G 211 194 U 210 195 A 0 196 G 0 197 C 208 198 U 207 199 A 0 200 G 0 201 U 0 202 U 0 203 A 0 204 A 0 205 A 0 206 G 0 207 A 198 208 G 197 209 A 0 210 A 194 211 U 193 212 U 192 213 U 191 214 C 190 215 G 0 216 C 134 217 C 133 218 U 132 219 A 131 220 G 130 221 G 129 222 C 128 223 A 0 224 U 0 225 G 124 226 A 123 227 G 121 228 C 120 229 U 119 230 U 118 231 G 117 232 C 116 233 A 115 234 U 114 235 C 281 236 U 280 237 G 279 238 A 0 239 U 0 240 U 278 241 A 0 242 G 272 243 C 271 244 U 270 245 U 0 246 G 0 247 U 269 248 U 268 249 G 267 250 G 266 251 U 265 252 G 264 253 A 263 254 G 262 255 G 0 256 U 0 257 A 0 258 A 0 259 A 0 260 G 0 261 G 0 262 C 254 263 U 253 264 U 252 265 A 251 266 C 250 267 C 249 268 A 248 269 A 247 270 G 244 271 G 243 272 C 242 273 G 0 274 A 0 275 C 0 276 G 0 277 A 0 278 U 240 279 C 237 280 A 236 281 G 235 282 U 0 283 A 0 284 G 306 285 C 305 286 U 304 287 G 303 288 A 299 289 U 298 290 U 297 291 U 296 292 G 0 293 A 0 294 G 0 295 A 0 296 G 291 297 G 290 298 A 289 299 U 288 300 G 0 301 A 0 302 U 0 303 C 287 304 A 286 305 G 285 306 C 284 307 C 107 308 A 106 309 C 105 310 A 0 311 C 331 312 U 330 313 G 329 314 G 328 315 G 327 316 A 326 317 U 0 318 U 0 319 G 0 320 A 0 321 G 0 322 A 0 323 A 0 324 C 0 325 G 0 326 G 316 327 A 315 328 A 314 329 C 313 330 A 312 331 G 311 332 A 0 333 C 344 334 U 343 335 U 342 336 C 341 337 U 0 338 A 0 339 C 0 340 G 0 341 G 336 342 A 335 343 A 334 344 G 333 345 G 0 346 C 0 347 A 0 348 G 60 349 C 59 350 A 58 351 G 56 352 U 55 353 G 54 354 A 0 355 G 49 356 G 0 357 A 0 358 A 0 359 U 0 360 U 0 361 U 387 362 U 0 363 C 386 364 C 385 365 G 384 366 C 0 367 A 0 368 A 0 369 U 382 370 G 381 371 G 380 372 G 379 373 C 378 374 G 0 375 C 0 376 A 0 377 A 0 378 G 373 379 C 372 380 C 371 381 U 370 382 G 369 383 A 0 384 C 365 385 G 364 386 G 363 387 A 361 388 G 0 389 C 48 390 A 47 391 A 0 392 U 46 393 A 45 394 C 44 395 C 43 396 G 42 397 C 41 398 G 0 399 U 0 400 G 430 401 A 429 402 A 428 403 G 427 404 G 0 405 A 0 406 A 0 407 G 0 408 A 0 409 C 0 410 G 421 411 G 420 412 C 419 413 C 418 414 U 0 415 U 0 416 U 0 417 G 0 418 G 413 419 G 412 420 U 411 421 U 410 422 G 0 423 A 0 424 A 0 425 A 0 426 A 0 427 C 403 428 C 402 429 U 401 430 C 400 431 U 0 432 U 467 433 U 0 434 U 0 435 C 464 436 U 463 437 C 462 438 A 461 439 A 460 440 A 459 441 G 0 442 A 0 443 A 0 444 G 454 445 A 0 446 A 0 447 G 0 448 A 0 449 A 0 450 A 0 451 U 0 452 G 0 453 A 0 454 C 444 455 G 0 456 G 0 457 U 0 458 A 0 459 U 440 460 U 439 461 U 438 462 G 437 463 A 436 464 G 435 465 G 0 466 A 0 467 A 432 468 U 0 469 A 0 470 A 0 471 G 516 472 C 515 473 A 514 474 U 513 475 C 512 476 G 497 477 G 496 478 C 495 479 U 0 480 A 0 481 A 0 482 U 511 483 U 510 484 C 509 485 C 508 486 G 507 487 U 0 488 G 0 489 C 0 490 C 0 491 A 0 492 G 499 493 C 498 494 A 0 495 G 478 496 C 477 497 C 476 498 G 493 499 C 492 500 G 0 501 G 0 502 U 0 503 A 0 504 A 0 505 U 0 506 A 0 507 C 486 508 G 485 509 G 484 510 G 483 511 A 482 512 G 475 513 A 474 514 U 473 515 G 472 516 C 471 517 G 0 518 A 39 519 G 38 520 C 37 521 G 36 522 U 35 523 U 34 524 A 32 525 U 31 526 C 30 527 C 29 528 G 0 529 G 0 530 A 0 531 A 0 532 U 0 533 U 0 534 A 0 535 U 0 536 U 0 537 G 0 538 G 847 539 G 846 540 C 845 541 G 830 542 U 829 543 A 0 544 A 0 545 A 0 546 G 0 547 A 0 548 G 735 549 U 734 550 U 733 551 U 732 552 G 0 553 U 729 554 A 0 555 G 728 556 G 727 557 C 726 558 G 0 559 G 622 560 U 621 561 C 620 562 A 619 563 A 618 564 G 617 565 U 616 566 G 0 567 U 615 568 G 614 569 U 611 570 U 610 571 U 609 572 A 608 573 A 607 574 U 606 575 G 605 576 U 604 577 U 603 578 A 0 579 A 0 580 A 0 581 A 0 582 G 600 583 U 599 584 C 598 585 A 597 586 A 596 587 A 595 588 G 594 589 C 0 590 U 0 591 U 0 592 A 0 593 A 0 594 C 588 595 U 587 596 U 586 597 U 585 598 G 584 599 G 583 600 A 582 601 A 0 602 G 0 603 G 577 604 G 576 605 C 575 606 A 574 607 U 573 608 U 572 609 A 571 610 A 570 611 A 569 612 A 0 613 A 0 614 C 568 615 U 567 616 G 565 617 C 564 618 U 563 619 A 562 620 G 561 621 A 560 622 C 559 623 U 0 624 U 0 625 G 0 626 A 722 627 G 721 628 U 720 629 A 719 630 U 717 631 G 716 632 G 715 633 U 714 634 A 713 635 G 0 636 G 0 637 G 711 638 G 710 639 U 709 640 G 708 641 A 707 642 A 706 643 G 705 644 G 688 645 G 687 646 A 0 647 A 0 648 U 684 649 U 683 650 U 682 651 C 681 652 C 680 653 A 679 654 G 678 655 U 677 656 G 0 657 U 0 658 A 0 659 G 670 660 C 669 661 G 668 662 G 0 663 U 0 664 G 0 665 A 0 666 A 0 667 A 0 668 U 661 669 G 660 670 C 659 671 G 0 672 U 0 673 A 0 674 G 0 675 A 0 676 G 0 677 A 655 678 U 654 679 U 653 680 G 652 681 G 651 682 A 650 683 A 649 684 A 648 685 G 0 686 A 0 687 A 645 688 C 644 689 A 0 690 C 0 691 C 0 692 A 0 693 A 704 694 U 0 695 G 0 696 G 703 697 C 702 698 G 0 699 A 0 700 A 0 701 G 0 702 G 697 703 C 696 704 A 693 705 C 643 706 U 642 707 U 641 708 U 640 709 U 639 710 C 638 711 U 637 712 A 0 713 G 634 714 G 633 715 C 632 716 C 631 717 A 630 718 A 0 719 U 629 720 A 628 721 C 627 722 U 626 723 G 0 724 A 0 725 C 0 726 G 557 727 C 556 728 U 555 729 G 553 730 A 0 731 G 0 732 A 551 733 A 550 734 A 549 735 C 548 736 G 0 737 A 0 738 A 0 739 A 0 740 G 780 741 C 779 742 U 778 743 G 777 744 A 776 745 G 775 746 G 0 747 G 0 748 A 0 749 G 774 750 C 773 751 A 0 752 A 0 753 A 0 754 C 770 755 A 769 756 G 768 757 G 767 758 A 0 759 U 0 760 U 0 761 A 0 762 G 0 763 A 0 764 U 0 765 A 0 766 C 0 767 C 757 768 C 756 769 U 755 770 G 754 771 U 0 772 A 0 773 G 750 774 U 749 775 C 745 776 U 744 777 U 743 778 G 742 779 G 741 780 C 740 781 C 0 782 G 0 783 U 0 784 A 0 785 A 0 786 A 0 787 C 0 788 U 0 789 A 0 790 U 0 791 G 843 792 G 842 793 A 841 794 U 840 795 A 839 796 C 838 797 U 0 798 A 0 799 A 821 800 G 820 801 U 819 802 G 818 803 G 817 804 U 816 805 G 815 806 C 814 807 U 0 808 G 0 809 A 0 810 A 0 811 A 0 812 G 0 813 U 0 814 G 806 815 C 805 816 A 804 817 C 803 818 U 802 819 G 801 820 C 800 821 U 799 822 G 0 823 U 0 824 A 0 825 G 832 826 U 831 827 U 0 828 A 0 829 A 542 830 C 541 831 A 826 832 C 825 833 G 0 834 U 0 835 U 0 836 A 0 837 A 0 838 G 796 839 U 795 840 A 794 841 U 793 842 C 792 843 C 791 844 C 0 845 G 540 846 C 539 847 C 538 848 U 0 849 G 876 850 G 875 851 G 874 852 G 0 853 A 0 854 G 0 855 U 0 856 A 0 857 C 0 858 G 869 859 C 868 860 U 867 861 U 866 862 G 0 863 C 0 864 A 0 865 C 0 866 A 861 867 A 860 868 G 859 869 U 858 870 G 0 871 A 0 872 A 0 873 A 0 874 C 851 875 U 850 876 C 849 877 A 0 878 A 0 879 A 0 880 G 21 881 G 20 882 A 19 883 A 0 884 U 0 885 U 1348 886 G 1347 887 A 1345 888 C 1344 889 G 1343 890 G 0 891 G 1342 892 G 1341 893 G 1340 894 C 1339 895 C 1338 896 C 1337 897 G 1336 898 C 0 899 A 1332 900 C 1331 901 A 0 902 A 0 903 G 1295 904 C 1294 905 G 1293 906 G 1292 907 U 1291 908 G 1189 909 G 1188 910 A 1187 911 G 1186 912 C 1185 913 A 1184 914 U 1183 915 G 1182 916 U 1181 917 G 1180 918 G 1178 919 U 1177 920 U 0 921 U 0 922 A 0 923 A 0 924 U 939 925 U 938 926 C 937 927 G 936 928 A 0 929 U 0 930 G 0 931 C 0 932 A 0 933 A 0 934 C 0 935 A 0 936 C 927 937 G 926 938 A 925 939 A 924 940 G 0 941 A 0 942 A 0 943 C 0 944 C 0 945 U 0 946 U 0 947 A 0 948 C 1173 949 C 1172 950 A 1171 951 G 1170 952 G 1169 953 A 1168 954 U 1167 955 U 0 956 U 0 957 G 0 958 A 0 959 C 0 960 A 1008 961 G 1007 962 G 1006 963 A 0 964 U 1005 965 C 1004 966 U 1003 967 A 1002 968 G 1001 969 G 1000 970 A 0 971 A 0 972 G 983 973 U 982 974 U 981 975 U 980 976 G 0 977 A 0 978 A 0 979 A 0 980 G 975 981 A 974 982 A 973 983 C 972 984 G 0 985 C 0 986 A 0 987 G 0 988 U 999 989 A 998 990 C 997 991 C 996 992 U 0 993 U 0 994 C 0 995 G 0 996 G 991 997 G 990 998 U 989 999 A 988 1000 U 969 1001 C 968 1002 U 967 1003 A 966 1004 G 965 1005 A 964 1006 C 962 1007 A 961 1008 C 960 1009 A 0 1010 G 1162 1011 G 1161 1012 U 0 1013 G 1160 1014 G 1159 1015 U 1158 1016 G 1157 1017 C 0 1018 A 0 1019 U 1156 1020 G 1155 1021 G 1151 1022 C 1150 1023 U 1149 1024 G 1147 1025 U 1146 1026 C 1145 1027 G 1144 1028 U 0 1029 C 0 1030 A 0 1031 G 1070 1032 C 1069 1033 U 1068 1034 C 1067 1035 G 1066 1036 U 1065 1037 G 1046 1038 U 1045 1039 C 1044 1040 G 0 1041 U 0 1042 G 0 1043 A 0 1044 G 1039 1045 A 1038 1046 U 1037 1047 G 0 1048 U 0 1049 U 1062 1050 G 1061 1051 G 1060 1052 G 1059 1053 U 0 1054 U 0 1055 A 0 1056 A 0 1057 G 0 1058 U 0 1059 C 1052 1060 C 1051 1061 C 1050 1062 G 1049 1063 C 0 1064 A 0 1065 A 1036 1066 C 1035 1067 G 1034 1068 A 1033 1069 G 1032 1070 C 1031 1071 G 0 1072 C 0 1073 A 0 1074 A 0 1075 C 0 1076 C 1139 1077 C 1138 1078 U 1137 1079 U 1136 1080 U 0 1081 U 1108 1082 U 1107 1083 U 1106 1084 U 1105 1085 U 1104 1086 A 1103 1087 A 1102 1088 U 0 1089 U 0 1090 A 0 1091 A 1098 1092 C 1097 1093 G 0 1094 C 0 1095 U 0 1096 U 0 1097 G 1092 1098 U 1091 1099 C 0 1100 A 0 1101 U 0 1102 U 1087 1103 U 1086 1104 A 1085 1105 G 1084 1106 A 1083 1107 A 1082 1108 A 1081 1109 U 0 1110 A 0 1111 C 1130 1112 U 1129 1113 G 1128 1114 C 1127 1115 U 1126 1116 G 1125 1117 G 1124 1118 U 1123 1119 U 0 1120 A 0 1121 U 0 1122 U 0 1123 A 1118 1124 C 1117 1125 C 1116 1126 G 1115 1127 G 1114 1128 A 1113 1129 G 1112 1130 G 1111 1131 A 0 1132 A 0 1133 G 0 1134 G 0 1135 U 0 1136 G 1079 1137 A 1078 1138 G 1077 1139 G 1076 1140 A 0 1141 C 0 1142 G 0 1143 A 0 1144 C 1027 1145 G 1026 1146 U 1025 1147 C 1024 1148 A 0 1149 A 1023 1150 G 1022 1151 U 1021 1152 C 0 1153 A 0 1154 U 0 1155 C 1020 1156 A 1019 1157 U 1016 1158 G 1015 1159 C 1014 1160 C 1013 1161 C 1011 1162 C 1010 1163 U 0 1164 U 0 1165 A 0 1166 U 0 1167 A 954 1168 U 953 1169 C 952 1170 C 951 1171 U 950 1172 G 949 1173 G 948 1174 G 0 1175 C 0 1176 U 0 1177 A 919 1178 C 918 1179 A 0 1180 C 917 1181 A 916 1182 C 915 1183 G 914 1184 U 913 1185 G 912 1186 C 911 1187 U 910 1188 A 909 1189 C 908 1190 A 0 1191 A 0 1192 U 0 1193 G 1247 1194 G 1246 1195 U 1245 1196 U 1244 1197 A 1243 1198 A 1242 1199 G 1241 1200 A 0 1201 C 0 1202 A 0 1203 A 0 1204 U 0 1205 A 1236 1206 A 1235 1207 G 1234 1208 U 0 1209 U 0 1210 G 1229 1211 C 1228 1212 A 0 1213 A 0 1214 U 0 1215 U 1224 1216 U 1223 1217 U 1222 1218 G 0 1219 U 0 1220 G 0 1221 A 0 1222 A 1217 1223 A 1216 1224 A 1215 1225 U 0 1226 G 0 1227 A 0 1228 G 1211 1229 C 1210 1230 U 0 1231 A 0 1232 A 0 1233 U 0 1234 C 1207 1235 U 1206 1236 U 1205 1237 A 0 1238 A 0 1239 A 0 1240 A 0 1241 C 1199 1242 U 1198 1243 U 1197 1244 A 1196 1245 G 1195 1246 C 1194 1247 C 1193 1248 U 0 1249 A 0 1250 A 0 1251 G 0 1252 U 0 1253 U 0 1254 C 1285 1255 G 0 1256 G 0 1257 A 0 1258 U 1281 1259 U 1280 1260 G 1279 1261 U 1278 1262 A 1277 1263 G 1276 1264 G 1275 1265 C 1274 1266 U 0 1267 G 0 1268 A 0 1269 A 0 1270 A 0 1271 C 0 1272 U 0 1273 C 0 1274 G 1265 1275 C 1264 1276 C 1263 1277 U 1262 1278 A 1261 1279 C 1260 1280 A 1259 1281 U 1258 1282 G 0 1283 A 0 1284 A 0 1285 G 1254 1286 C 0 1287 C 0 1288 G 0 1289 G 0 1290 A 0 1291 A 907 1292 U 906 1293 C 905 1294 G 904 1295 C 903 1296 U 0 1297 A 0 1298 G 0 1299 U 0 1300 A 0 1301 A 1324 1302 U 1323 1303 C 1322 1304 G 1321 1305 C 1320 1306 C 1319 1307 G 1318 1308 G 1317 1309 U 0 1310 C 0 1311 A 0 1312 G 0 1313 C 0 1314 U 0 1315 A 0 1316 U 0 1317 A 1308 1318 C 1307 1319 G 1306 1320 G 1305 1321 C 1304 1322 G 1303 1323 G 1302 1324 U 1301 1325 G 0 1326 A 0 1327 A 0 1328 U 0 1329 A 0 1330 C 0 1331 G 900 1332 U 899 1333 U 0 1334 C 0 1335 U 0 1336 C 897 1337 G 896 1338 G 895 1339 G 894 1340 C 893 1341 C 892 1342 U 891 1343 U 889 1344 G 888 1345 U 887 1346 A 0 1347 C 886 1348 A 885 1349 C 0 1350 A 0 1351 C 0 1352 C 0 1353 G 1453 1354 C 1452 1355 C 0 1356 C 1449 1357 G 1448 1358 U 0 1359 C 0 1360 A 0 1361 C 1443 1362 A 1442 1363 C 1441 1364 C 1440 1365 A 1439 1366 U 1438 1367 G 1437 1368 G 1436 1369 A 0 1370 A 0 1371 G 1433 1372 U 1432 1373 C 1431 1374 G 1430 1375 G 1429 1376 C 1428 1377 U 1427 1378 G 1426 1379 U 1425 1380 G 1424 1381 C 1423 1382 C 1422 1383 C 0 1384 G 0 1385 A 0 1386 A 0 1387 G 1418 1388 U 1417 1389 U 1416 1390 A 1415 1391 U 1414 1392 U 1413 1393 A 0 1394 U 1412 1395 C 1411 1396 U 1410 1397 U 1409 1398 G 0 1399 C 0 1400 C 1407 1401 U 1406 1402 G 0 1403 A 0 1404 A 0 1405 A 0 1406 A 1401 1407 G 1400 1408 A 0 1409 G 1397 1410 G 1396 1411 G 1395 1412 A 1394 1413 A 1392 1414 A 1391 1415 U 1390 1416 A 1389 1417 C 1388 1418 C 1387 1419 U 0 1420 A 0 1421 A 0 1422 G 1382 1423 G 1381 1424 C 1380 1425 C 1379 1426 U 1378 1427 G 1377 1428 G 1376 1429 C 1375 1430 U 1374 1431 G 1373 1432 G 1372 1433 U 1371 1434 G 0 1435 A 0 1436 C 1368 1437 U 1367 1438 G 1366 1439 G 1365 1440 G 1364 1441 G 1363 1442 U 1362 1443 G 1361 1444 A 0 1445 A 0 1446 G 0 1447 U 0 1448 C 1357 1449 G 1356 1450 U 0 1451 A 0 1452 A 1354 1453 C 1353 1454 A 0 1455 A 0 1456 G 0 1457 G 0 1458 U 1481 1459 A 1480 1460 G 1479 1461 C 1478 1462 C 1477 1463 G 1476 1464 U 1475 1465 A 1474 1466 C 1473 1467 U 1472 1468 G 0 1469 G 0 1470 A 0 1471 A 0 1472 G 1467 1473 G 1466 1474 U 1465 1475 G 1464 1476 U 1463 1477 G 1462 1478 G 1461 1479 C 1460 1480 U 1459 1481 G 1458 1482 G 0 1483 A 0 1484 A 0 1485 C 0 1486 A 0 1487 A 0 1488 C 0 1489 U 0 1490 C 0 1491 C 0