Filename: d.23.m.C.lacertina.bpseq Organism: Cacozeliana lacertina Accession Number: AF101007 Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu 1 A 0 2 U 0 3 A 0 4 U 0 5 G 120 6 G 119 7 C 0 8 U 0 9 G 0 10 A 0 11 A 0 12 U 0 13 U 0 14 A 110 15 C 109 16 U 0 17 U 0 18 G 0 19 U 0 20 U 0 21 A 0 22 A 0 23 A 0 24 A 0 25 A 0 26 U 0 27 U 0 28 C 0 29 U 0 30 A 0 31 G 0 32 A 0 33 U 0 34 A 0 35 G 0 36 A 0 37 U 0 38 A 0 39 U 0 40 U 0 41 U 0 42 G 49 43 A 48 44 A 0 45 A 0 46 C 0 47 A 0 48 U 43 49 C 42 50 U 0 51 A 0 52 U 0 53 U 80 54 G 79 55 U 78 56 C 77 57 U 76 58 U 0 59 A 0 60 G 0 61 U 0 62 A 0 63 A 71 64 A 70 65 G 0 66 G 0 67 C 0 68 G 0 69 A 0 70 A 64 71 A 63 72 G 0 73 A 0 74 A 0 75 A 0 76 G 57 77 G 56 78 A 55 79 A 54 80 A 53 81 A 0 82 U 0 83 U 0 84 A 0 85 A 0 86 U 0 87 A 0 88 U 0 89 U 0 90 A 0 91 A 0 92 A 0 93 G 0 94 U 0 95 A 0 96 C 103 97 C 102 98 G 0 99 A 0 100 G 0 101 A 0 102 G 97 103 G 96 104 G 0 105 A 0 106 A 0 107 C 0 108 A 0 109 A 15 110 U 14 111 A 0 112 A 0 113 A 0 114 A 0 115 G 0 116 C 0 117 U 0 118 U 0 119 C 6 120 U 5 121 A 0 122 A 0 123 A 0 124 A 0 125 A 0 126 A 0 127 C 872 128 A 0 129 A 138 130 C 137 131 U 136 132 A 0 133 A 0 134 A 0 135 U 0 136 A 131 137 G 130 138 U 129 139 G 0 140 U 0 141 A 156 142 C 155 143 U 154 144 U 153 145 U 0 146 U 0 147 C 0 148 G 0 149 C 0 150 A 0 151 U 0 152 C 0 153 A 144 154 C 143 155 G 142 156 G 141 157 C 579 158 C 578 159 U 577 160 A 576 161 G 575 162 C 574 163 A 0 164 A 0 165 G 0 166 A 0 167 G 183 168 U 182 169 A 181 170 A 180 171 A 179 172 A 0 173 U 0 174 U 0 175 U 0 176 G 0 177 A 0 178 A 0 179 U 171 180 U 170 181 A 169 182 A 168 183 C 167 184 U 0 185 U 0 186 U 0 187 C 309 188 U 308 189 C 0 190 G 306 191 A 0 192 A 0 193 A 0 194 G 300 195 C 299 196 C 298 197 G 297 198 G 296 199 C 295 200 G 0 201 A 0 202 G 0 203 C 276 204 U 275 205 A 274 206 U 273 207 C 272 208 U 271 209 U 270 210 U 269 211 U 268 212 U 267 213 C 266 214 U 264 215 G 0 216 G 0 217 U 0 218 U 0 219 U 0 220 U 0 221 U 0 222 U 0 223 A 0 224 G 0 225 A 0 226 A 0 227 C 0 228 A 0 229 U 0 230 U 0 231 U 0 232 A 0 233 U 0 234 G 0 235 C 0 236 U 0 237 A 261 238 U 260 239 U 259 240 A 0 241 A 258 242 A 257 243 A 256 244 A 255 245 U 254 246 G 0 247 U 0 248 G 0 249 G 0 250 C 0 251 A 0 252 A 0 253 A 0 254 A 245 255 U 244 256 U 243 257 U 242 258 U 241 259 A 239 260 A 238 261 U 237 262 A 0 263 A 0 264 A 214 265 A 0 266 G 213 267 G 212 268 A 211 269 A 210 270 A 209 271 A 208 272 G 207 273 A 206 274 U 205 275 A 204 276 G 203 277 C 0 278 U 288 279 G 287 280 U 286 281 A 0 282 A 0 283 U 0 284 A 0 285 C 0 286 G 280 287 C 279 288 U 278 289 U 0 290 U 0 291 U 0 292 C 0 293 G 0 294 C 0 295 G 199 296 C 198 297 U 197 298 G 196 299 G 195 300 U 194 301 G 0 302 A 0 303 U 0 304 A 0 305 G 0 306 C 190 307 U 0 308 A 188 309 G 187 310 U 0 311 U 0 312 C 542 313 U 541 314 U 540 315 C 539 316 C 538 317 A 537 318 A 0 319 A 0 320 A 0 321 A 0 322 G 335 323 G 334 324 U 333 325 A 332 326 U 331 327 A 0 328 U 0 329 A 0 330 A 0 331 G 326 332 U 325 333 G 324 334 C 323 335 C 322 336 G 0 337 A 387 338 G 386 339 G 385 340 C 384 341 G 382 342 A 381 343 G 380 344 U 0 345 G 379 346 A 378 347 A 377 348 A 376 349 U 375 350 G 0 351 C 0 352 C 0 353 U 0 354 A 0 355 A 0 356 G 367 357 G 366 358 C 365 359 U 364 360 A 0 361 A 0 362 A 0 363 A 0 364 A 359 365 G 358 366 C 357 367 U 356 368 A 0 369 G 0 370 C 0 371 A 0 372 A 0 373 A 0 374 G 0 375 G 349 376 U 348 377 U 347 378 U 346 379 C 345 380 C 343 381 U 342 382 C 341 383 A 0 384 G 340 385 C 339 386 C 338 387 U 337 388 A 0 389 A 0 390 A 0 391 A 416 392 A 415 393 G 414 394 A 413 395 C 412 396 U 411 397 U 410 398 A 409 399 A 408 400 G 407 401 G 0 402 A 0 403 U 0 404 A 0 405 A 0 406 G 0 407 C 400 408 U 399 409 U 398 410 A 397 411 A 396 412 G 395 413 U 394 414 C 393 415 U 392 416 A 391 417 A 0 418 A 0 419 A 430 420 C 429 421 G 428 422 G 0 423 A 0 424 A 0 425 A 0 426 A 0 427 U 0 428 A 421 429 G 420 430 U 419 431 A 0 432 G 0 433 U 0 434 G 0 435 U 0 436 U 0 437 A 0 438 U 0 439 U 0 440 A 493 441 A 492 442 C 491 443 U 0 444 C 0 445 A 0 446 A 470 447 U 469 448 G 468 449 U 0 450 A 0 451 G 465 452 G 464 453 C 463 454 U 0 455 U 0 456 G 0 457 A 0 458 A 0 459 A 0 460 C 0 461 U 0 462 A 0 463 G 453 464 C 452 465 C 451 466 A 0 467 G 0 468 C 448 469 A 447 470 U 446 471 A 0 472 U 0 473 A 0 474 A 489 475 A 0 476 G 0 477 U 0 478 C 487 479 U 486 480 G 0 481 U 0 482 U 0 483 A 0 484 U 0 485 A 0 486 A 479 487 G 478 488 A 0 489 U 474 490 A 0 491 G 442 492 U 441 493 U 440 494 C 0 495 U 0 496 A 0 497 U 0 498 A 0 499 A 0 500 G 0 501 A 0 502 A 0 503 A 0 504 A 0 505 A 0 506 A 0 507 G 0 508 A 0 509 U 0 510 U 0 511 U 0 512 A 0 513 U 0 514 U 0 515 U 0 516 A 0 517 C 0 518 U 0 519 C 0 520 A 0 521 C 0 522 C 0 523 U 0 524 C 0 525 U 0 526 C 0 527 C 0 528 G 0 529 U 0 530 A 0 531 A 0 532 A 0 533 A 0 534 G 0 535 A 0 536 A 0 537 U 317 538 G 316 539 G 315 540 A 314 541 A 313 542 G 312 543 U 568 544 A 0 545 U 565 546 A 564 547 G 563 548 U 562 549 U 561 550 U 560 551 U 559 552 U 558 553 A 557 554 A 0 555 U 0 556 A 0 557 U 553 558 A 552 559 A 551 560 A 550 561 A 549 562 A 548 563 C 547 564 U 546 565 U 545 566 A 0 567 U 0 568 G 543 569 C 0 570 U 0 571 A 0 572 A 0 573 U 0 574 G 162 575 C 161 576 U 160 577 A 159 578 G 158 579 G 157 580 A 871 581 U 870 582 G 0 583 A 0 584 G 0 585 U 0 586 A 0 587 U 865 588 U 864 589 U 0 590 U 0 591 A 600 592 C 599 593 C 598 594 A 0 595 G 0 596 U 0 597 U 0 598 G 593 599 G 592 600 U 591 601 A 640 602 U 639 603 C 638 604 G 637 605 C 0 606 G 629 607 G 628 608 G 627 609 C 626 610 U 624 611 A 623 612 A 622 613 U 621 614 A 0 615 C 0 616 A 0 617 U 0 618 U 0 619 A 0 620 A 0 621 A 613 622 U 612 623 U 611 624 A 610 625 U 0 626 G 609 627 C 608 628 C 607 629 C 606 630 U 0 631 A 0 632 U 0 633 U 0 634 U 0 635 U 0 636 U 0 637 C 604 638 U 603 639 A 602 640 U 601 641 A 0 642 A 0 643 A 0 644 A 0 645 A 0 646 C 0 647 U 863 648 U 862 649 U 0 650 U 0 651 A 0 652 A 0 653 A 0 654 U 859 655 U 858 656 A 857 657 G 856 658 G 855 659 A 854 660 A 853 661 G 852 662 A 0 663 A 850 664 G 849 665 G 848 666 A 0 667 A 0 668 C 0 669 U 0 670 C 0 671 G 0 672 G 0 673 C 0 674 A 0 675 A 0 676 C 0 677 A 0 678 A 0 679 U 843 680 A 842 681 U 841 682 G 840 683 C 839 684 C 838 685 U 837 686 C 835 687 G 834 688 C 0 689 C 0 690 U 704 691 G 703 692 U 702 693 U 0 694 U 0 695 A 0 696 G 0 697 C 1219 698 A 0 699 A 0 700 A 0 701 A 0 702 A 692 703 C 691 704 A 690 705 U 0 706 G 0 707 G 733 708 C 732 709 U 731 710 C 730 711 U 729 712 U 728 713 U 727 714 G 726 715 A 723 716 A 0 717 A 0 718 A 0 719 A 0 720 A 0 721 A 0 722 C 0 723 U 715 724 A 0 725 A 0 726 U 714 727 A 713 728 A 712 729 A 711 730 G 710 731 A 709 732 G 708 733 U 707 734 C 0 735 G 0 736 G 830 737 A 829 738 C 828 739 C 827 740 U 0 741 G 761 742 C 760 743 C 759 744 C 0 745 A 0 746 G 758 747 U 757 748 G 754 749 A 753 750 A 0 751 G 0 752 U 0 753 U 749 754 U 748 755 U 0 756 A 0 757 A 747 758 C 746 759 G 743 760 G 742 761 C 741 762 C 779 763 G 778 764 C 777 765 G 776 766 G 775 767 U 774 768 A 0 769 C 0 770 U 0 771 C 0 772 U 0 773 G 0 774 A 767 775 C 766 776 C 765 777 G 764 778 U 763 779 G 762 780 C 784 781 A 0 782 A 0 783 A 0 784 G 780 785 G 0 786 U 0 787 A 0 788 G 0 789 C 0 790 A 817 791 U 0 792 A 0 793 A 0 794 U 0 795 C 0 796 A 0 797 C 0 798 U 0 799 U 0 800 G 816 801 C 815 802 C 814 803 U 813 804 U 812 805 A 811 806 U 0 807 A 0 808 A 0 809 U 0 810 U 0 811 G 805 812 A 804 813 A 803 814 G 802 815 G 801 816 C 800 817 U 790 818 G 0 819 G 0 820 U 0 821 A 0 822 U 0 823 G 0 824 A 0 825 A 0 826 U 0 827 G 739 828 G 738 829 U 737 830 U 736 831 U 0 832 G 0 833 A 0 834 C 687 835 G 686 836 A 0 837 G 685 838 G 684 839 G 683 840 C 682 841 A 681 842 U 680 843 A 679 844 A 0 845 C 0 846 U 0 847 G 0 848 U 665 849 C 664 850 U 663 851 C 0 852 C 661 853 U 660 854 U 659 855 C 658 856 C 657 857 U 656 858 A 655 859 A 654 860 U 0 861 U 0 862 A 648 863 U 647 864 U 588 865 A 587 866 G 0 867 A 0 868 A 0 869 U 0 870 U 581 871 U 580 872 G 127 873 A 0 874 C 0 875 C 0 876 U 0 877 G 894 878 U 893 879 G 892 880 G 891 881 G 890 882 U 0 883 G 0 884 A 0 885 A 0 886 G 0 887 A 0 888 G 0 889 G 0 890 C 881 891 C 880 892 C 879 893 A 878 894 U 877 895 A 0 896 U 0 897 A 0 898 A 0 899 A 0 900 A 1255 901 C 1254 902 U 1253 903 G 1252 904 A 1251 905 A 0 906 G 1250 907 G 1249 908 A 1248 909 C 0 910 G 1245 911 A 1244 912 G 0 913 A 0 914 A 0 915 G 0 916 A 0 917 C 0 918 C 1080 919 C 1079 920 U 1078 921 G 1077 922 U 0 923 C 1076 924 G 1075 925 A 1072 926 G 1071 927 C 1070 928 U 1069 929 U 1068 930 U 0 931 A 981 932 G 980 933 A 979 934 A 978 935 G 977 936 A 976 937 A 975 938 A 973 939 G 972 940 U 971 941 A 970 942 G 969 943 G 0 944 C 0 945 U 0 946 A 0 947 A 0 948 A 0 949 A 0 950 U 0 951 A 0 952 U 0 953 A 0 954 U 0 955 A 0 956 A 0 957 G 0 958 U 0 959 A 0 960 A 0 961 C 0 962 U 0 963 A 0 964 U 0 965 A 0 966 A 0 967 A 0 968 G 0 969 C 942 970 U 941 971 A 940 972 C 939 973 U 938 974 C 0 975 U 937 976 U 936 977 A 935 978 U 934 979 U 933 980 C 932 981 A 931 982 U 0 983 U 0 984 G 996 985 G 995 986 U 994 987 U 993 988 G 0 989 G 0 990 G 0 991 G 0 992 C 0 993 G 987 994 A 986 995 C 985 996 A 984 997 A 1018 998 G 1017 999 G 1016 1000 G 1015 1001 A 1014 1002 A 1013 1003 C 0 1004 A 0 1005 A 0 1006 U 0 1007 A 0 1008 G 0 1009 A 0 1010 A 0 1011 G 0 1012 C 0 1013 U 1002 1014 U 1001 1015 C 1000 1016 C 999 1017 C 998 1018 U 997 1019 U 1062 1020 A 0 1021 A 1036 1022 U 1035 1023 A 1034 1024 A 0 1025 A 1032 1026 U 1031 1027 A 0 1028 A 0 1029 A 0 1030 C 0 1031 A 1026 1032 U 1025 1033 A 0 1034 U 1023 1035 A 1022 1036 U 1021 1037 G 0 1038 U 0 1039 A 0 1040 A 0 1041 G 0 1042 G 0 1043 A 0 1044 U 0 1045 C 0 1046 C 1056 1047 A 1055 1048 G 1054 1049 G 1053 1050 A 0 1051 U 0 1052 U 0 1053 C 1049 1054 C 1048 1055 U 1047 1056 G 1046 1057 A 0 1058 U 0 1059 U 0 1060 A 0 1061 C 0 1062 A 1019 1063 A 0 1064 A 0 1065 A 0 1066 A 0 1067 U 0 1068 U 929 1069 A 928 1070 G 927 1071 U 926 1072 U 925 1073 A 0 1074 C 0 1075 C 924 1076 G 923 1077 C 921 1078 A 920 1079 G 919 1080 G 918 1081 G 0 1082 A 0 1083 U 0 1084 A 0 1085 A 0 1086 C 0 1087 A 0 1088 G 0 1089 C 1130 1090 A 1129 1091 U 1128 1092 A 0 1093 A 1127 1094 U 1124 1095 C 1123 1096 U 1122 1097 U 1121 1098 U 1120 1099 U 1119 1100 U 1118 1101 U 0 1102 G 0 1103 A 0 1104 G 1114 1105 A 1113 1106 G 0 1107 A 0 1108 C 0 1109 C 0 1110 U 0 1111 U 0 1112 A 0 1113 U 1105 1114 C 1104 1115 G 0 1116 A 0 1117 A 0 1118 A 1100 1119 A 1099 1120 G 1098 1121 G 1097 1122 G 1096 1123 G 1095 1124 G 1094 1125 G 0 1126 U 0 1127 U 1093 1128 G 1091 1129 U 1090 1130 G 1089 1131 A 0 1132 C 0 1133 C 0 1134 U 0 1135 C 0 1136 G 0 1137 A 0 1138 U 0 1139 G 0 1140 U 0 1141 U 1215 1142 G 1213 1143 G 1212 1144 A 1211 1145 C 1210 1146 U 1207 1147 A 1204 1148 G 1203 1149 G 1202 1150 A 1201 1151 U 1200 1152 A 0 1153 U 0 1154 C 1179 1155 C 1178 1156 C 0 1157 G 1174 1158 A 1173 1159 A 1172 1160 G 1171 1161 G 1170 1162 U 1169 1163 G 0 1164 C 0 1165 A 0 1166 G 0 1167 A 0 1168 A 0 1169 G 1162 1170 C 1161 1171 C 1160 1172 U 1159 1173 U 1158 1174 C 1157 1175 G 0 1176 A 0 1177 U 0 1178 G 1155 1179 G 1154 1180 U 0 1181 U 1194 1182 G 1193 1183 U 1191 1184 C 1190 1185 U 0 1186 G 0 1187 U 0 1188 U 0 1189 C 0 1190 G 1184 1191 A 1183 1192 C 0 1193 C 1182 1194 A 1181 1195 U 0 1196 U 0 1197 A 0 1198 A 0 1199 A 0 1200 A 1151 1201 U 1150 1202 C 1149 1203 C 1148 1204 U 1147 1205 A 0 1206 C 0 1207 A 1146 1208 U 0 1209 G 0 1210 A 1145 1211 U 1144 1212 C 1143 1213 U 1142 1214 G 0 1215 A 1141 1216 G 0 1217 U 0 1218 U 0 1219 C 697 1220 A 0 1221 G 1239 1222 A 1238 1223 C 1237 1224 C 1236 1225 G 1234 1226 G 1233 1227 C 1232 1228 G 0 1229 U 0 1230 G 0 1231 A 0 1232 G 1227 1233 C 1226 1234 C 1225 1235 A 0 1236 G 1224 1237 G 1223 1238 U 1222 1239 C 1221 1240 A 0 1241 G 0 1242 U 0 1243 U 0 1244 U 911 1245 C 910 1246 U 0 1247 A 0 1248 U 908 1249 C 907 1250 C 906 1251 U 904 1252 C 903 1253 A 902 1254 G 901 1255 U 900 1256 U 0 1257 U 0 1258 U 0 1259 U 0 1260 U 0 1261 A 0 1262 C 1292 1263 U 1291 1264 C 1290 1265 A 1289 1266 G 1288 1267 G 1287 1268 C 1286 1269 C 1285 1270 U 0 1271 A 0 1272 G 0 1273 U 0 1274 A 0 1275 C 0 1276 G 0 1277 A 0 1278 A 0 1279 A 0 1280 G 0 1281 G 0 1282 A 0 1283 U 0 1284 C 0 1285 G 1269 1286 G 1268 1287 G 1267 1288 C 1266 1289 U 1265 1290 G 1264 1291 G 1263 1292 G 1262 1293 G 1303 1294 A 1302 1295 A 1301 1296 A 1300 1297 A 0 1298 A 0 1299 A 0 1300 U 1296 1301 U 1295 1302 U 1294 1303 C 1293 1304 U 0 1305 A 0 1306 U 0 1307 A 1331 1308 G 1330 1309 U 1329 1310 A 0 1311 G 1327 1312 A 1326 1313 A 1325 1314 A 1324 1315 A 1323 1316 G 0 1317 A 0 1318 U 0 1319 A 0 1320 U 0 1321 A 0 1322 A 0 1323 U 1315 1324 U 1314 1325 U 1313 1326 U 1312 1327 U 1311 1328 A 0 1329 A 1309 1330 C 1308 1331 U 1307 1332 U 0 1333 A 0 1334 A 0 1335 G 0 1336 A 0 1337 U 0 1338 U 0 1339 A 0 1340 U 0 1341 U 0