Filename: d.23.m.P.paludiformis.bpseq
Organism: Paracrostoma paludiformis
Accession Number: AF101008
Citation and related information available at http://www.rna.icmb.utexas.edu
1 U 0
2 U 0
3 A 0
4 A 0
5 G 0
6 A 0
7 A 0
8 C 0
9 A 123
10 U 122
11 G 121
12 A 120
13 A 119
14 U 118
15 U 117
16 U 0
17 U 0
18 A 0
19 A 0
20 U 0
21 A 112
22 C 111
23 U 0
24 A 0
25 A 0
26 A 0
27 U 0
28 G 0
29 A 0
30 U 0
31 U 0
32 U 0
33 U 0
34 A 0
35 U 0
36 U 0
37 U 0
38 U 0
39 U 0
40 G 47
41 A 46
42 A 0
43 G 0
44 C 0
45 A 0
46 U 41
47 C 40
48 A 0
49 A 0
50 A 0
51 A 0
52 A 0
53 G 0
54 C 0
55 C 0
56 U 0
57 A 0
58 G 0
59 U 0
60 A 0
61 A 69
62 U 68
63 G 0
64 G 0
65 A 0
66 G 0
67 A 0
68 A 62
69 A 61
70 G 0
71 A 0
72 A 0
73 A 0
74 C 0
75 U 0
76 U 0
77 G 0
78 G 0
79 U 0
80 G 0
81 U 0
82 G 0
83 C 0
84 U 0
85 A 0
86 A 0
87 G 0
88 A 0
89 A 0
90 A 0
91 G 0
92 A 0
93 A 0
94 G 0
95 A 0
96 G 0
97 U 0
98 A 0
99 C 106
100 U 105
101 G 0
102 C 0
103 A 0
104 A 0
105 A 100
106 G 99
107 G 0
108 A 0
109 A 0
110 U 0
111 A 22
112 U 21
113 U 0
114 G 0
115 U 0
116 U 0
117 A 15
118 A 14
119 U 13
120 U 12
121 A 11
122 A 10
123 G 9
124 C 0
125 C 0
126 A 0
127 U 0
128 A 0
129 G 0
130 C 874
131 A 0
132 G 143
133 C 142
134 U 141
135 A 140
136 A 0
137 A 0
138 G 0
139 A 0
140 U 135
141 A 134
142 G 133
143 C 132
144 G 0
145 U 0
146 A 161
147 C 160
148 U 159
149 U 158
150 U 0
151 U 0
152 U 0
153 G 0
154 C 0
155 A 0
156 U 0
157 C 0
158 A 149
159 C 148
160 G 147
161 G 146
162 U 583
163 U 582
164 U 581
165 A 580
166 G 579
167 C 578
168 A 0
169 A 0
170 G 0
171 A 0
172 G 0
173 A 0
174 A 0
175 U 189
176 A 188
177 U 0
178 C 187
179 G 186
180 A 185
181 A 0
182 G 0
183 C 0
184 U 0
185 U 180
186 C 179
187 G 178
188 U 176
189 G 175
190 C 0
191 U 0
192 C 307
193 U 306
194 C 0
195 G 304
196 A 0
197 A 0
198 A 0
199 A 298
200 C 297
201 U 296
202 G 295
203 G 294
204 U 293
205 G 0
206 A 0
207 G 0
208 C 274
209 U 273
210 A 272
211 U 271
212 U 270
213 C 269
214 U 268
215 U 267
216 U 266
217 U 265
218 U 264
219 C 262
220 A 0
221 A 0
222 G 0
223 U 0
224 U 0
225 U 0
226 U 0
227 A 0
228 G 0
229 C 0
230 U 0
231 U 0
232 U 0
233 U 0
234 U 0
235 A 259
236 C 258
237 U 257
238 A 0
239 A 256
240 A 255
241 A 254
242 G 253
243 U 252
244 G 0
245 U 0
246 A 0
247 G 0
248 C 0
249 A 0
250 A 0
251 A 0
252 A 243
253 C 242
254 U 241
255 U 240
256 U 239
257 G 237
258 G 236
259 U 235
260 U 0
261 A 0
262 A 219
263 A 0
264 A 218
265 A 217
266 A 216
267 A 215
268 A 214
269 G 213
270 G 212
271 A 211
272 U 210
273 A 209
274 G 208
275 A 0
276 U 286
277 A 285
278 U 284
279 G 0
280 A 0
281 G 0
282 A 0
283 U 0
284 U 278
285 U 277
286 U 276
287 A 0
288 U 0
289 C 0
290 C 0
291 G 0
292 C 0
293 A 204
294 C 203
295 C 202
296 G 201
297 G 200
298 U 199
299 G 0
300 A 0
301 U 0
302 A 0
303 G 0
304 C 195
305 U 0
306 A 193
307 G 192
308 U 0
309 U 0
310 C 543
311 C 542
312 C 541
313 U 540
314 U 539
315 A 538
316 G 0
317 A 0
318 A 0
319 A 0
320 A 333
321 G 332
322 C 331
323 A 330
324 U 329
325 A 0
326 G 0
327 A 0
328 A 0
329 G 324
330 U 323
331 G 322
332 C 321
333 U 320
334 A 0
335 A 384
336 A 382
337 G 381
338 U 380
339 A 379
340 A 378
341 A 377
342 G 0
343 A 376
344 C 375
345 A 374
346 G 373
347 A 372
348 U 371
349 U 370
350 A 369
351 G 368
352 U 367
353 G 366
354 A 365
355 G 364
356 A 0
357 A 0
358 A 0
359 U 0
360 A 0
361 A 0
362 G 0
363 A 0
364 C 355
365 U 354
366 U 353
367 A 352
368 A 351
369 U 350
370 A 349
371 A 348
372 U 347
373 U 346
374 U 345
375 G 344
376 U 343
377 U 341
378 U 340
379 U 339
380 A 338
381 C 337
382 A 336
383 U 0
384 U 335
385 A 0
386 U 0
387 A 0
388 G 413
389 U 412
390 U 411
391 U 410
392 A 409
393 U 408
394 U 407
395 A 406
396 A 405
397 G 404
398 G 0
399 A 0
400 U 0
401 A 0
402 A 0
403 G 0
404 C 397
405 U 396
406 U 395
407 A 394
408 A 393
409 U 392
410 A 391
411 A 390
412 A 389
413 A 388
414 G 0
415 U 0
416 A 0
417 C 0
418 A 429
419 G 428
420 G 427
421 A 0
422 A 0
423 A 0
424 A 0
425 A 0
426 G 0
427 A 420
428 C 419
429 A 418
430 U 0
431 A 0
432 U 0
433 A 0
434 C 0
435 U 0
436 U 0
437 U 0
438 A 0
439 A 0
440 U 0
441 G 495
442 G 494
443 G 493
444 U 492
445 U 0
446 A 470
447 C 469
448 U 468
449 U 0
450 G 0
451 G 465
452 G 464
453 C 463
454 U 0
455 U 0
456 G 0
457 A 0
458 A 0
459 A 0
460 U 0
461 U 0
462 A 0
463 G 453
464 C 452
465 C 451
466 A 0
467 U 0
468 U 448
469 A 447
470 U 446
471 A 0
472 A 0
473 C 0
474 G 0
475 A 490
476 A 0
477 A 0
478 U 0
479 U 488
480 U 487
481 G 0
482 U 0
483 U 0
484 A 0
485 U 0
486 A 0
487 A 480
488 A 479
489 A 0
490 U 475
491 A 0
492 A 444
493 U 443
494 U 442
495 C 441
496 U 0
497 U 0
498 U 0
499 C 0
500 A 0
501 A 0
502 U 0
503 U 0
504 A 0
505 A 0
506 G 0
507 A 0
508 G 0
509 G 0
510 A 0
511 U 0
512 U 0
513 C 0
514 C 0
515 U 0
516 A 0
517 U 0
518 G 0
519 U 0
520 U 0
521 U 0
522 U 0
523 U 0
524 G 0
525 U 0
526 U 0
527 C 0
528 U 0
529 G 0
530 C 0
531 U 0
532 C 0
533 G 0
534 A 0
535 C 0
536 A 0
537 A 0
538 U 315
539 A 314
540 A 313
541 G 312
542 G 311
543 G 310
544 U 572
545 A 0
546 A 569
547 A 568
548 A 567
549 A 565
550 G 564
551 U 563
552 A 0
553 A 0
554 A 0
555 A 0
556 C 0
557 U 0
558 A 0
559 A 0
560 U 0
561 A 0
562 A 0
563 G 551
564 C 550
565 U 549
566 C 0
567 A 548
568 A 547
569 U 546
570 U 0
571 U 0
572 A 544
573 U 0
574 U 0
575 U 0
576 A 0
577 U 0
578 G 167
579 C 166
580 U 165
581 A 164
582 A 163
583 A 162
584 A 873
585 U 872
586 G 0
587 A 0
588 G 0
589 U 0
590 A 0
591 U 867
592 U 866
593 U 0
594 U 0
595 C 0
596 A 0
597 C 0
598 A 611
599 C 610
600 C 609
601 C 0
602 A 0
603 C 0
604 A 0
605 U 0
606 G 0
607 U 0
608 A 0
609 G 600
610 G 599
611 U 598
612 A 643
613 A 642
614 A 641
615 C 640
616 A 633
617 C 632
618 U 631
619 A 630
620 A 0
621 A 628
622 G 627
623 G 0
624 U 0
625 A 0
626 C 0
627 C 622
628 U 621
629 A 0
630 U 619
631 A 618
632 G 617
633 U 616
634 A 0
635 A 0
636 U 0
637 A 0
638 U 0
639 A 0
640 G 615
641 C 614
642 U 613
643 U 612
644 A 0
645 A 0
646 A 0
647 A 0
648 A 0
649 G 0
650 U 0
651 U 0
652 A 0
653 A 0
654 A 0
655 A 861
656 U 860
657 A 859
658 A 858
659 A 857
660 A 856
661 A 855
662 G 854
663 A 0
664 A 852
665 G 851
666 G 850
667 A 0
668 A 0
669 C 0
670 U 0
671 C 0
672 G 0
673 G 0
674 C 0
675 A 0
676 A 0
677 A 0
678 U 0
679 U 845
680 U 844
681 U 843
682 A 842
683 C 841
684 N 840
685 U 839
686 C 837
687 G 836
688 C 0
689 C 0
690 U 704
691 G 703
692 U 702
693 U 0
694 U 0
695 A 0
696 U 0
697 C 1230
698 A 0
699 A 0
700 A 0
701 A 0
702 A 692
703 C 691
704 A 690
705 U 0
706 G 0
707 G 733
708 C 732
709 U 731
710 C 730
711 U 729
712 U 728
713 U 727
714 G 726
715 U 723
716 U 722
717 G 0
718 U 0
719 U 0
720 U 0
721 U 0
722 A 716
723 A 715
724 U 0
725 A 0
726 U 714
727 A 713
728 A 712
729 A 711
730 G 710
731 A 709
732 G 708
733 U 707
734 C 0
735 A 0
736 G 832
737 G 831
738 C 830
739 C 829
740 U 0
741 G 763
742 C 762
743 C 761
744 C 0
745 A 0
746 G 760
747 U 759
748 G 756
749 A 755
750 A 754
751 A 0
752 A 0
753 C 0
754 U 750
755 U 749
756 U 748
757 U 0
758 A 0
759 A 747
760 C 746
761 G 743
762 G 742
763 C 741
764 C 781
765 G 780
766 C 779
767 G 778
768 G 777
769 U 776
770 A 0
771 C 0
772 C 0
773 C 0
774 U 0
775 G 0
776 A 769
777 C 768
778 C 767
779 G 766
780 U 765
781 G 764
782 C 786
783 A 0
784 A 0
785 A 0
786 G 782
787 G 0
788 U 0
789 A 0
790 G 0
791 C 0
792 A 819
793 U 0
794 A 0
795 A 0
796 U 0
797 C 0
798 A 0
799 U 0
800 U 0
801 U 0
802 G 818
803 C 817
804 C 816
805 U 815
806 U 814
807 A 813
808 U 0
809 A 0
810 A 0
811 U 0
812 U 0
813 G 807
814 A 806
815 A 805
816 G 804
817 G 803
818 C 802
819 U 792
820 U 0
821 G 0
822 U 0
823 A 0
824 U 0
825 G 0
826 A 0
827 A 0
828 U 0
829 G 739
830 G 738
831 U 737
832 U 736
833 C 0
834 A 0
835 A 0
836 C 687
837 G 686
838 A 0
839 A 685
840 A 684
841 G 683
842 C 682
843 A 681
844 C 680
845 U 679
846 G 0
847 C 0
848 U 0
849 G 0
850 U 666
851 C 665
852 U 664
853 C 0
854 C 662
855 U 661
856 U 660
857 U 659
858 U 658
859 U 657
860 A 656
861 A 655
862 U 0
863 A 0
864 G 0
865 A 0
866 U 592
867 A 591
868 G 0
869 A 0
870 A 0
871 U 0
872 U 585
873 U 584
874 G 130
875 A 0
876 C 0
877 U 0
878 U 0
879 C 896
880 U 895
881 A 894
882 G 893
883 G 892
884 U 0
885 G 0
886 A 0
887 A 0
888 G 0
889 A 0
890 G 0
891 G 0
892 C 883
893 C 882
894 U 881
895 A 880
896 G 879
897 A 0
898 U 0
899 A 0
900 U 0
901 A 0
902 A 1266
903 U 1265
904 U 1264
905 G 1263
906 A 1262
907 A 0
908 A 1261
909 G 1260
910 A 1259
911 C 0
912 A 1256
913 A 1255
914 A 0
915 A 0
916 A 0
917 G 0
918 A 0
919 C 0
920 C 1090
921 C 1089
922 U 1088
923 G 1087
924 U 0
925 C 1086
926 G 1085
927 A 1082
928 G 1081
929 C 1080
930 U 1079
931 U 1078
932 U 0
933 A 0
934 A 989
935 A 988
936 A 987
937 G 986
938 U 985
939 C 984
940 A 983
941 A 982
942 G 981
943 U 980
944 U 979
945 A 978
946 G 977
947 A 0
948 A 0
949 A 0
950 U 0
951 A 0
952 C 0
953 U 0
954 U 0
955 A 0
956 U 0
957 A 0
958 A 0
959 A 0
960 A 0
961 U 0
962 A 0
963 A 0
964 U 0
965 U 0
966 U 0
967 A 0
968 G 0
969 A 0
970 U 0
971 C 0
972 U 0
973 A 0
974 G 0
975 C 0
976 A 0
977 C 946
978 U 945
979 A 944
980 A 943
981 C 942
982 U 941
983 G 940
984 U 939
985 U 938
986 C 937
987 U 936
988 U 935
989 U 934
990 U 0
991 U 0
992 G 1004
993 G 1003
994 U 1002
995 U 1001
996 G 0
997 G 0
998 G 0
999 G 0
1000 C 0
1001 G 995
1002 A 994
1003 C 993
1004 C 992
1005 A 1026
1006 A 1025
1007 G 1024
1008 G 1023
1009 A 1022
1010 A 1021
1011 C 0
1012 A 0
1013 A 0
1014 U 0
1015 A 0
1016 A 0
1017 A 0
1018 A 0
1019 G 0
1020 C 0
1021 U 1010
1022 U 1009
1023 C 1008
1024 C 1007
1025 U 1006
1026 U 1005
1027 U 1072
1028 U 0
1029 C 1044
1030 U 1043
1031 A 1042
1032 A 0
1033 U 0
1034 U 0
1035 U 0
1036 A 0
1037 A 0
1038 C 0
1039 U 0
1040 U 0
1041 A 0
1042 U 1031
1043 A 1030
1044 G 1029
1045 G 0
1046 U 0
1047 A 0
1048 C 0
1049 U 0
1050 G 0
1051 A 0
1052 U 0
1053 C 0
1054 C 1066
1055 A 1065
1056 G 1064
1057 C 1063
1058 A 0
1059 U 0
1060 A 0
1061 A 0
1062 A 0
1063 G 1057
1064 C 1056
1065 U 1055
1066 G 1054
1067 A 0
1068 U 0
1069 U 0
1070 G 0
1071 A 0
1072 A 1027
1073 A 0
1074 A 0
1075 A 0
1076 A 0
1077 U 0
1078 U 931
1079 A 930
1080 G 929
1081 U 928
1082 U 927
1083 A 0
1084 C 0
1085 C 926
1086 G 925
1087 C 923
1088 A 922
1089 G 921
1090 G 920
1091 G 0
1092 A 0
1093 U 0
1094 A 0
1095 A 0
1096 C 0
1097 A 0
1098 G 0
1099 C 1140
1100 A 1139
1101 U 1138
1102 A 0
1103 A 1137
1104 U 1134
1105 C 1133
1106 U 1132
1107 C 1131
1108 U 1130
1109 C 1129
1110 U 1128
1111 U 0
1112 G 0
1113 A 0
1114 G 1124
1115 A 1123
1116 G 0
1117 A 0
1118 C 0
1119 C 0
1120 A 0
1121 A 0
1122 A 0
1123 U 1115
1124 C 1114
1125 G 0
1126 A 0
1127 A 0
1128 A 1110
1129 G 1109
1130 G 1108
1131 G 1107
1132 G 1106
1133 G 1105
1134 G 1104
1135 G 0
1136 U 0
1137 U 1103
1138 G 1101
1139 U 1100
1140 G 1099
1141 A 0
1142 C 0
1143 C 0
1144 U 0
1145 C 0
1146 G 0
1147 A 0
1148 U 0
1149 G 0
1150 U 0
1151 U 1226
1152 G 1224
1153 G 1223
1154 A 1222
1155 C 1221
1156 U 1218
1157 A 1215
1158 G 1214
1159 A 1213
1160 A 1212
1161 U 1211
1162 G 0
1163 U 0
1164 C 1189
1165 C 1188
1166 U 0
1167 A 1184
1168 A 1183
1169 A 1182
1170 G 1181
1171 A 1180
1172 U 1179
1173 G 0
1174 C 0
1175 A 0
1176 G 0
1177 A 0
1178 A 0
1179 G 1172
1180 U 1171
1181 C 1170
1182 U 1169
1183 U 1168
1184 U 1167
1185 A 0
1186 A 0
1187 A 0
1188 G 1165
1189 G 1164
1190 U 0
1191 U 1205
1192 G 1204
1193 G 1203
1194 U 1202
1195 C 1201
1196 U 0
1197 G 0
1198 U 0
1199 U 0
1200 C 0
1201 G 1195
1202 A 1194
1203 C 1193
1204 C 1192
1205 A 1191
1206 U 0
1207 U 0
1208 A 0
1209 A 0
1210 A 0
1211 A 1161
1212 U 1160
1213 U 1159
1214 C 1158
1215 U 1157
1216 A 0
1217 C 0
1218 A 1156
1219 U 0
1220 G 0
1221 A 1155
1222 U 1154
1223 C 1153
1224 U 1152
1225 G 0
1226 A 1151
1227 G 0
1228 U 0
1229 U 0
1230 C 697
1231 A 0
1232 G 1250
1233 A 1249
1234 C 1248
1235 C 1247
1236 G 1245
1237 G 1244
1238 C 1243
1239 G 0
1240 U 0
1241 G 0
1242 A 0
1243 G 1238
1244 C 1237
1245 C 1236
1246 A 0
1247 G 1235
1248 G 1234
1249 U 1233
1250 C 1232
1251 A 0
1252 G 0
1253 U 0
1254 U 0
1255 U 913
1256 C 912
1257 U 0
1258 A 0
1259 U 910
1260 C 909
1261 U 908
1262 U 906
1263 C 905
1264 A 904
1265 A 903
1266 U 902
1267 U 0
1268 A 0
1269 U 0
1270 U 0
1271 A 0
1272 G 0
1273 U 1303
1274 U 1302
1275 U 1301
1276 A 1300
1277 A 1299
1278 U 1298
1279 U 1297
1280 U 1296
1281 U 0
1282 A 0
1283 G 0
1284 U 0
1285 A 0
1286 C 0
1287 G 0
1288 A 0
1289 A 0
1290 A 0
1291 G 0
1292 G 0
1293 A 0
1294 U 0
1295 C 0
1296 G 1280
1297 G 1279
1298 A 1278
1299 U 1277
1300 U 1276
1301 A 1275
1302 A 1274
1303 A 1273
1304 G 1314
1305 A 1313
1306 A 1312
1307 A 1311
1308 U 0
1309 U 0
1310 A 0
1311 U 1307
1312 U 1306
1313 U 1305
1314 U 1304
1315 G 0
1316 A 0
1317 A 0
1318 U 1359
1319 U 1358
1320 G 1357
1321 A 1356
1322 G 1355
1323 A 1354
1324 A 1353
1325 A 1352
1326 A 1351
1327 A 0
1328 A 0
1329 U 0
1330 A 0
1331 U 0
1332 A 0
1333 A 0
1334 U 0
1335 A 0
1336 C 0
1337 A 0
1338 A 0
1339 A 0
1340 A 0
1341 A 0
1342 U 0
1343 A 0
1344 A 0
1345 A 0
1346 U 0
1347 C 0
1348 A 0
1349 C 0
1350 A 0
1351 U 1326
1352 U 1325
1353 U 1324
1354 U 1323
1355 C 1322
1356 U 1321
1357 U 1320
1358 A 1319
1359 A 1318
1360 A 0