16S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 1065


 
Base Pair (1065 : 1191)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 93.0 -- -- 0.1 0.6 -- -- 5.6 -- -- 0.3 -- -- 0.1 0.3 6915
3 -- -- 97.5 -- -- 0.1 0.2 -- -- 1.8 -- -- 0.2 -- -- -- 0.1 5605
B -- -- 99.4 -- -- 0.1 0.2 -- -- 0.3 -- -- -- -- -- -- -- 4401
A -- -- 66.7* -- -- -- -- -- -- 32.8 -- 0.5* -- -- -- -- -- 198
C -- -- 98.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.6 0.6 163
E -- -- 95.6* -- -- -- 0.6 -- -- 2.1 0.2* -- 1.4 -- -- -- 0.1 1002
M 0.1 -- 70.0* 0.2 -- 0.2 2.3 0.2* -- 24.7 0.1 -- 0.5 -- -- 0.3 1.5 1152
 
Base Pair (1066 : 1190)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 66.6* 13.2* 0.5* -- 0.5 0.5 0.3 0.2 9.6 3.3 3.8 -- -- 0.1 0.9 0.4 6893
3 -- 78.2* 16.2* 0.1 -- 0.5 -- 0.1* 0.1 1.8 1.3 1.3 -- -- 0.1 0.1 0.1 5583
B -- 98.7 -- -- -- -- -- -- -- 0.1 0.3 0.8 -- -- -- -- 0.1 4378
A -- 18.3 -- -- -- -- -- -- -- 42.6 30.5 8.6 -- -- -- -- -- 197
C -- 90.8 -- -- -- -- -- -- -- 4.9 -- 3.7 -- -- -- -- 0.6 163
E -- 0.6 90.0* 0.7 -- 2.8 0.2 0.7* 0.6 0.9 0.3 2.3* -- -- 0.4 0.4 0.1 1004
M -- 6.8 0.5 2.5 -- 0.3 2.8 1.3* 0.5 48.4* 13.5 16.3 -- -- 0.2 5.1* 1.7 1152
 
Base Pair (1067 : 1189)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.3* -- 0.1* 54.0* 0.1 -- 12.2 30.3 2.4 -- -- -- 0.1 -- -- 0.2 0.3 6897
3 0.4* -- -- 62.4* -- -- 0.3 36.7 0.1 -- -- -- -- -- -- -- 0.1 5587
B -- -- -- 78.6 -- -- 0.1 21.1 0.1 -- -- -- -- -- -- -- -- 4406
A 0.6 -- -- -- -- -- -- 99.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 175
C -- -- -- 81.6 -- -- 5.5 11.7 0.6 -- -- -- -- -- -- -- 0.6 163
E 2.2 -- -- 2.0 -- -- 1.2 94.4 -- -- 0.1 -- -- -- -- -- 0.1 1002
M -- -- 0.7 9.2 0.3 0.1 71.7* 1.6 13.7 -- -- -- 0.8 0.2* 0.1 1.0* 0.8 1152


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