16S rRNA Lousy Base Pair Statistics for Helical Element 1065


 
Base Pair (1065 : 1191)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 77 10 4 0.09 0.01 0.00 0.01 0.93 0.93 1.57 1.95 0.00 0.81 8513
3 16 2 1 0.11 0.01 0.00 0.01 0.98 0.98 1.81 1.97 0.00 0.78 7180
B 7 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 1.00 1.95 1.99 0.00 0.75 5859
A 2 0 0 0.00 0.01 0.00 0.01 0.67 0.67 1.09 1.95 0.00 0.75 264
C 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.93 1.95 0.00 0.89 182
E 7 1 1 0.25 0.05 0.00 0.05 0.96 0.96 1.66 1.98 0.00 0.95 1054
M 61 7 3 0.09 0.01 0.00 0.01 0.71 0.71 0.85 1.86 0.01 0.98 1160
 
Base Pair (1066 : 1190)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 34 116 12 0.16 0.42 0.81 1.22 0.81 0.81 1.25 0.73 0.00 0.81 8513
3 6 23 3 0.21 0.75 0.95 1.70 0.95 0.95 1.30 1.11 0.00 0.78 7180
B 1 3 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.98 1.89 0.00 0.75 5859
A 0 6 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.18 0.18 2.00 0.19 0.00 0.75 264
C 0 6 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.91 0.91 1.93 1.48 0.00 0.89 182
E 5 14 3 0.32 0.30 0.93 1.23 0.91 0.94 1.59 1.45 0.00 0.95 1054
M 28 87 9 0.16 0.13 0.00 0.13 0.10 0.10 1.16 0.27 0.01 0.98 1160
 
Base Pair (1067 : 1189)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 16 166 6 0.07 0.01 0.00 0.01 0.55 0.55 1.89 0.49 0.00 0.81 8513
3 3 87 1 0.02 0.01 0.00 0.01 0.63 0.63 1.94 1.01 0.00 0.78 7180
B 0 82 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.79 0.79 1.99 1.23 0.00 0.75 5859
A 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 1.95 1.95 0.00 0.66 264
C 0 8 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.82 0.82 1.93 1.13 0.00 0.89 182
E 2 5 1 0.29 0.00 0.00 0.00 0.04 0.04 1.83 1.77 0.00 0.95 1054
M 13 71 5 0.12 0.04 0.00 0.04 0.10 0.10 1.71 0.77 0.00 0.99 1160


Last generated: Tue Oct 12 14:20:59 1999