16S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 196


 
Base Pair (196 : 219)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2 -- -- 12.3 -- -- 0.6 59.7 0.9 -- -- -- -- -- 0.1 -- 26.1 7135
3 0.2 -- -- 13.3 -- -- 0.7 67.7 0.9 -- -- -- -- -- -- -- 17.1 6142
B 0.2 -- -- 16.1 -- -- 0.8 81.3 1.0 -- -- -- -- -- -- -- 0.5 4895
A 0.5 -- -- 14.5 -- -- 0.9 80.9 1.8 -- 0.9 -- -- -- -- -- 0.5 220
C -- -- 0.6* 25.4 -- -- 1.2 60.9* 5.3 -- -- -- -- -- 1.8 0.6 4.1 169
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 1028
M -- -- 0.2* 1.9* -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- 0.1 97.5 832
 
Base Pair (197 : 218)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.1* -- 0.2* 31.7* -- -- 5.1 12.0 19.1 -- -- -- -- 0.1 0.1 -- 31.5 7126
3 0.1* -- -- 36.1* -- -- 5.9 12.1 22.1 -- -- -- -- 0.1 0.1 -- 23.4 6133
B 0.2* -- -- 44.7* -- -- 7.3 13.7 25.6 -- -- -- -- 0.1 0.1 -- 8.2 4888
A -- 0.5 -- 12.4 -- -- 3.2 32.1 48.6* -- -- -- 0.5* -- -- -- 2.8 218
C -- -- 0.6* 27.2 -- -- -- 65.7* 1.8 -- -- 0.6* -- -- -- -- 4.1 169
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 1028
M -- -- 1.3* 0.5 -- -- -- 0.5* -- -- -- -- -- -- 0.1 0.1 97.5 832
 
Base Pair (198 : 217)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 10.9 0.1 0.1* 1.2 12.4* 0.1 0.3 0.1 0.5* -- -- 0.1 6.5 6.2 -- 0.1 61.4 7093
3 12.6 0.1 -- 1.0 13.1* 0.1 0.1 -- 0.4* -- -- -- 7.2 7.1 -- -- 57.9 6100
B 15.5 0.2* 0.1 1.3 16.0* 0.1 0.2* 0.1 0.1 -- 0.1 -- 8.8 8.4 -- 0.1 49.2 4854
A 8.7 -- -- -- 12.3 0.5 -- -- 7.3 -- -- -- 5.5 13.7* 0.5* -- 51.6 219
C 1.8 -- 1.2 11.8 46.7* 0.6* 5.9* 1.2 0.6 -- -- 3.0 9.5 1.2 -- 1.8 14.8 169
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 1028
M -- -- -- -- 0.1 -- 0.1 -- 1.2* 0.1* -- -- 0.1 0.4 -- 0.5* 97.5 832
 
Base Pair (199 : 216)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 2.0 0.3 0.3* 6.0 5.5 0.3 0.3 1.6* 0.9 0.2 0.2 8.1* 1.3 2.1* 0.4 2.8 67.8 7137
3 2.3 0.4 0.3* 6.9 6.2 0.4 0.3 1.8* 0.9 0.2 0.1 9.4* 1.4 2.4* 0.4 3.2 63.4 6144
B 2.8* 0.3 0.4* 8.6 7.8 0.4 0.3 2.3 1.1* 0.1 0.2 11.7* 1.5 2.3 0.5 4.0 55.6 4898
A 2.3 5.0 -- -- 0.9 0.9 0.5 -- 0.5 2.7* -- -- 5.5 15.5* -- 0.5* 65.8 219
C 1.8 -- -- 2.4 4.7* -- 0.6 1.2 1.8* 0.6 1.2* -- 4.1 0.6 -- -- 81.1 169
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 1028
M -- -- -- 0.4 -- 0.1 0.1 -- 1.1* -- 0.2* -- 0.1* -- 0.1 0.1* 97.7 832
 
Base Pair (200 : 215)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 9.8* 1.0 0.2* -- 0.6 1.2 0.2 4.8 2.9* -- 2.9 0.2* 0.4 0.8 5.5 0.2 69.4 7142
3 11.3* 1.2 0.1* -- 0.6 1.4 0.1 5.5 3.3* -- 3.4 0.2* 0.4 1.0 6.4 0.2 64.8 6150
B 14.1* 1.3 0.1* -- 0.7 1.7 0.1 6.8 4.0* -- 4.2 0.1* 0.6 1.0 8.0 0.1 57.1 4902
A 0.9 5.0* 0.9 -- 1.4 0.5 0.5 2.7* 4.1 0.9 -- 3.6 -- 3.6 -- 3.6* 72.3 220
C 1.2* -- 2.4 0.6 -- 0.6* 3.6* -- -- -- 0.6 -- 1.2 -- -- -- 89.9 169
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 1028
M -- -- 0.2 0.1* 0.1 -- 0.1 -- -- -- -- -- 0.2* 0.1 -- 0.1 98.9 832
 
Base Pair (201 : 214)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 13.7* 0.3 0.2 0.1* 0.5 0.4* 0.1 0.1 0.3 0.7* 0.4 0.1 0.2 7.1 1.2 0.2 74.3 7162
3 15.9* 0.4 0.2 0.1* 0.6 0.5* -- 0.1 0.3 0.8* 0.4 -- 0.2 8.3 1.4 0.2 70.4 6170
B 19.8* 0.4 0.1 0.1* 0.7 0.5* 0.1 0.1 0.4 0.8* 0.4 -- 0.2 10.4 1.7 0.3 64.0 4921
A 1.8* 1.4 4.5 -- 0.9 4.1* -- 0.5 -- 5.0* 4.1 0.5 -- 0.9 1.8 -- 74.7 221
C 1.2* -- -- 1.2 -- -- 0.6 -- 1.2* -- -- -- 0.6 -- -- 0.6* 94.7 169
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 1028
M -- -- 0.2 -- -- -- 0.2* 0.1 -- 0.1 -- 0.1* -- -- -- 0.1 99.0 832


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