16S rRNA Lousy Base Pair Statistics for Helical Element 196

 
Base Pair (196 : 219)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 11 145 1 0.01 0.00 0.00 0.00 0.17 0.17 0.63 0.06 0.00 0.62 8513
3 6 126 1 0.01 0.00 0.00 0.00 0.16 0.16 0.98 0.36 0.00 0.71 7180
B 6 120 1 0.02 0.00 0.00 0.00 0.16 0.16 1.94 1.18 0.00 0.83 5859
A 0 6 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.15 0.15 1.88 1.15 0.00 0.83 264
C 2 19 0 0.00 0.02 0.00 0.02 0.27 0.27 1.69 0.48 0.02 0.89 182
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.01 0.00 0.00 1054
M 3 0 0 0.00 0.40 0.86 1.26 0.86 0.86 -0.20 -0.15 0.01 0.02 1160
 
Base Pair (197 : 218)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 9 191 0 0.00 0.01 0.00 0.01 0.47 0.47 0.61 -0.73 0.05 0.57 8513
3 5 179 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.47 0.47 0.97 -0.58 0.06 0.65 7180
B 4 162 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.49 0.49 1.93 -0.16 0.07 0.76 5859
A 1 17 0 0.00 0.01 0.00 0.01 0.13 0.13 1.87 0.22 0.02 0.80 264
C 2 11 0 0.00 0.04 0.00 0.04 0.29 0.29 1.73 0.70 0.02 0.89 182
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1054
M 2 1 0 0.00 0.40 0.71 1.11 0.71 0.71 -0.19 -0.17 0.00 0.02 1160
 
Base Pair (198 : 217)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 76 138 11 0.10 0.02 0.00 0.02 0.32 0.64 0.33 -0.94 0.30 0.32 8513
3 57 126 7 0.08 0.02 0.00 0.02 0.33 0.64 0.67 -0.96 0.35 0.36 7180
B 53 119 6 0.07 0.01 0.00 0.01 0.33 0.65 1.57 -0.96 0.41 0.42 5859
A 4 7 1 0.18 0.01 0.00 0.01 0.18 0.44 1.48 -0.92 0.43 0.40 264
C 17 10 4 0.30 0.17 0.00 0.17 0.17 0.73 0.64 0.17 0.12 0.79 182
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1054
M 2 2 0 0.00 0.46 0.71 1.17 0.00 0.05 -0.19 -0.17 0.00 0.02 1160
 
Base Pair (199 : 216)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 226 46 8 0.06 0.17 0.00 0.17 0.27 0.45 -0.79 -0.70 0.31 0.27 8513
3 215 42 7 0.05 0.17 0.00 0.17 0.27 0.45 -0.66 -0.70 0.34 0.31 7180
B 191 38 7 0.06 0.13 0.00 0.13 0.27 0.46 -0.25 -0.66 0.40 0.37 5859
A 24 4 0 0.00 0.17 0.00 0.17 0.21 0.27 0.03 -0.73 0.52 0.28 264
C 10 2 0 0.00 0.21 0.41 0.61 0.22 0.47 0.75 -0.68 0.73 0.18 182
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1054
M 1 2 1 0.67 0.40 0.68 1.08 0.16 0.21 -0.17 -0.17 0.00 0.02 1160
 
Base Pair (200 : 215)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 135 26 7 0.09 0.16 0.00 0.16 0.36 0.41 -0.94 -0.61 0.07 0.26 8513
3 121 23 5 0.07 0.15 0.00 0.15 0.36 0.41 -0.96 -0.59 0.06 0.30 7180
B 114 19 5 0.08 0.15 0.00 0.15 0.36 0.42 -0.96 -0.54 0.07 0.36 5859
A 7 4 0 0.00 0.28 0.41 0.69 0.25 0.31 -0.94 -0.77 0.17 0.23 264
C 12 3 2 0.27 0.27 0.53 0.80 0.41 0.47 0.08 -0.41 0.68 0.09 182
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1054
M 2 0 0 0.00 0.14 0.00 0.14 0.33 0.44 -0.19 -0.09 0.01 0.01 1160
 
Base Pair (201 : 214)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 48 33 2 0.05 0.10 0.00 0.10 0.56 0.60 -0.60 -0.66 0.05 0.22 8513
3 42 30 1 0.03 0.10 0.00 0.10 0.56 0.60 -0.58 -0.68 0.06 0.25 7180
B 38 26 0 0.00 0.09 0.00 0.09 0.57 0.60 -0.51 -0.68 0.07 0.30 5859
A 4 4 1 0.25 0.29 0.43 0.72 0.30 0.50 -0.77 -0.77 0.07 0.21 264
C 3 1 0 0.00 0.43 0.56 0.99 0.44 0.44 -0.62 -0.36 0.10 0.05 182
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1054
M 3 2 1 0.40 0.17 0.00 0.17 0.25 0.25 -0.18 -0.10 0.01 0.01 1160

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