16S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 587A


 
Base Pair (587 : 652)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.1 -- -- 0.1 68.5 -- -- -- -- -- -- 0.4 0.1 -- -- 3.1 27.7 7116
3 0.1 -- -- 0.1 78.7 -- -- -- -- -- -- 0.5 0.1 -- -- 2.8 17.7 5935
B 0.1 -- -- 0.1 95.7 -- -- -- -- -- -- 0.7 0.1 -- -- 3.1 0.4 4676
A 0.4 -- -- -- 87.9 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 11.6 -- 224
C 0.6 -- -- -- 77.4 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.6 -- 20.2 1.2 168
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.1 -- -- -- 99.9 1035
M -- -- 0.1 0.2 7.3* -- 0.1* -- 0.1 -- -- -- -- -- -- 1.5 90.7 1021
 

 
Base Pair (595 : 644)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.4 0.4 0.2 54.7* 0.3 0.1 0.1 0.9 2.1 0.2* -- 1.7 -- 10.7* -- 0.7 27.4 7234
3 0.1 0.4 0.1 62.4* 0.3 0.1 0.1 1.1 2.5 0.2* -- 2.0 -- 12.8* -- 0.7 17.3 6052
B 0.1 0.6 0.1 75.0* 0.3 0.1 0.1 1.1 3.1 0.3* -- 2.1 -- 16.1* -- 0.8 0.1 4778
A -- -- -- 81.0* 0.4 -- 0.4 5.6 2.2 -- -- 9.1 -- 0.4* -- 0.9 -- 232
C 0.6 -- -- 89.9* 4.7 -- -- -- -- -- 0.6* 1.2 -- -- -- 3.0 -- 169
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 1042
M 1.8* -- 0.8* 3.3* 0.1 -- 0.4 0.1 0.1 0.3 0.1 0.1 0.2 -- 0.1 0.2 92.5 1021


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