16S rRNA Lousy Base Pair Statistics for Helical Element 587A


 
Base Pair (587 : 652)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 64 6 1 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.95 0.89 0.58 0.13 0.60 8513
3 36 3 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.96 1.67 0.97 0.14 0.68 7180
B 16 3 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.96 1.70 1.96 0.00 0.80 5859
A 8 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.88 1.41 1.96 0.01 0.85 264
C 12 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.79 1.28 1.78 0.01 0.91 182
E 12 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.64 -0.01 0.99 0.00 1054
M 16 2 1 0.11 0.05 0.00 0.05 0.03 0.82 -0.54 -0.32 0.05 0.08 1160
 

 
Base Pair (595 : 644)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 89 46 13 0.19 0.61 0.90 1.52 0.77 0.77 -0.06 -0.03 0.00 0.62 8513
3 74 34 9 0.17 0.64 0.91 1.55 0.76 0.77 0.24 0.29 0.00 0.70 7180
B 71 28 9 0.18 0.66 0.92 1.58 0.76 0.76 1.08 1.14 0.00 0.81 5859
A 3 6 0 0.00 0.02 0.00 0.02 0.81 0.81 1.42 1.48 0.00 0.88 264
C 6 2 0 0.00 0.06 0.00 0.06 0.90 0.95 1.39 1.91 0.00 0.93 182
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1054
M 9 10 4 0.42 0.61 0.78 1.38 0.78 0.79 -0.37 -0.36 0.01 0.07 1160


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