Base Pair (659 : 747) | Collective Score | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
T | 0.3 | 6.5 | 15.4* | 4.2 | 1.0 | 1.7 | 2.0 | 1.5* | 1.3 | 11.5 | 3.5 | 28.2* | 0.7 | 0.1* | 3.2 | 11.2 | 7.9 | 7055 |
3 | 0.3 | 7.6 | 16.0* | 4.7 | 1.1 | 1.7 | 1.5 | 1.3* | 1.1 | 11.8 | 3.9 | 32.9* | 0.7 | 0.1* | 3.3 | 11.9 | 0.2 | 5999 |
B | 0.3* | 7.0 | 20.2* | 5.2 | 1.4 | 2.0 | 1.8 | 1.1 | 1.3* | 14.3 | 2.6 | 27.4* | 0.9 | -- | 3.1 | 11.2 | 0.2 | 4749 |
A | -- | 54.3* | -- | -- | -- | 2.3 | -- | -- | 0.9 | 9.5 | 23.5 | -- | -- | -- | 9.5* | -- | -- | 221 |
C | -- | 0.6 | 12.6 | 3.6 | 1.2 | 2.4 | -- | 0.6* | 0.6 | 43.1* | 1.2 | 4.2 | -- | 0.6* | 0.6 | 28.1* | 0.6 | 167 |
E | -- | 0.2 | 0.4 | 2.9 | -- | -- | 0.7* | 2.5 | 0.1 | 1.2 | 5.4 | 65.3* | -- | 0.2* | 2.8* | 18.0 | 0.3 | 1029 |
M | 0.3 | 0.3 | 11.3* | 1.2 | 0.3 | 1.3 | 5.6 | 2.7* | 2.3 | 3.3 | 1.7 | 0.9* | 1.1 | 0.1* | 3.1 | 2.7 | 61.6 | 897 |
Base Pair (665 : 740) | Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
T | 0.4 | 0.5* | 1.3 | 50.0* | 22.8 | 0.2 | 1.7 | 2.2 | 2.4 | 1.2 | 0.2 | 0.3 | 13.0* | 0.6 | 0.1* | 0.5 | 2.7 | 7107 |
3 | 0.3 | -- | 0.1 | 56.7* | 24.4 | -- | 0.2 | 1.6 | 0.7 | -- | -- | 0.1 | 15.2* | 0.5 | -- | -- | -- | 6052 |
B | 0.3* | -- | -- | 68.5* | 29.9 | -- | 0.1 | 0.5 | 0.4 | -- | 0.1 | 0.1 | -- | 0.1 | -- | -- | 0.1 | 4802 |
A | -- | -- | -- | 49.1* | 1.4 | -- | 0.9 | 32.0 | 10.8 | -- | -- | -- | -- | 5.9* | -- | -- | -- | 222 |
C | -- | -- | -- | 32.3 | 67.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | 167 |
E | 0.8 | -- | 0.7 | 3.4* | 3.8 | -- | 0.6 | 0.3 | -- | 0.1 | -- | -- | 89.4* | 0.9 | -- | -- | 0.1 | 1028 |
M | 0.6* | 3.8 | 9.2 | 7.5 | 3.5 | 1.8 | 11.8 | 6.7 | 14.5* | 9.5* | 1.0 | 1.7 | 0.6 | 1.6 | 0.9 | 3.9* | 21.7 | 896 |
Base Pair (666 : 739) | Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
T | 82.1* | 0.3* | 0.6 | 0.2 | 2.4 | 0.2 | 5.6* | 2.8 | 0.1 | 4.1 | 0.5 | 0.1 | 0.1 | 0.1 | 0.2 | 0.2* | 0.5 | 7116 |
3 | 93.3* | 0.3* | -- | -- | 2.8 | -- | -- | 2.5 | -- | 0.2 | 0.5 | -- | -- | 0.1 | 0.1 | -- | 0.1 | 6058 |
B | 92.9 | -- | -- | -- | 3.5 | -- | -- | 2.8 | -- | -- | 0.5 | -- | -- | -- | 0.2 | -- | 0.1 | 4808 |
A | 81.5* | 7.2* | -- | -- | -- | 0.9 | -- | 0.9 | -- | 5.4 | 4.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 222 |
C | 92.8* | -- | -- | 0.6* | 1.2 | -- | -- | 4.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | 167 |
E | 97.8 | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | 0.2 | 0.5 | 0.1 | -- | 0.1 | 1028 |
M | 3.8* | 0.7* | 5.0 | 1.1 | 0.1 | 1.0 | 44.2* | 4.3 | 0.4 | 31.1 | 0.4 | 0.7 | 0.6 | -- | 0.8 | 1.7* | 4.1 | 899 |
Base Pair (667 : 738) | Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
T | 28.5 | 0.1 | 0.1 | 0.8 | 32.6* | 0.2* | 0.1 | 2.0* | -- | 0.2* | -- | 0.2 | 16.2 | 8.4 | 0.4 | 10.1 | 0.2 | 7116 |
3 | 33.4 | -- | -- | 0.5 | 37.0* | 0.2* | -- | 2.3* | -- | 0.1* | -- | 0.2 | 17.7 | 8.4 | -- | -- | -- | 6057 |
B | 23.4 | -- | -- | 0.7 | 44.5* | -- | -- | 2.9* | -- | -- | -- | -- | 20.1 | 8.3 | -- | -- | 0.1 | 4809 |
A | 0.9 | 0.9 | 0.5* | -- | 6.3 | 5.4 | -- | -- | -- | 3.2 | -- | 3.6* | 34.7 | 44.6* | -- | -- | -- | 222 |
C | 0.6 | -- | -- | 0.6 | 6.0 | -- | 0.6* | -- | -- | -- | -- | -- | 38.9 | 52.7* | -- | -- | 0.6 | 167 |
E | 87.2* | -- | -- | -- | 8.4 | -- | -- | -- | 0.2* | -- | 0.1 | 0.1* | 2.9 | 0.9 | 0.2 | -- | -- | 1026 |
M | 0.4 | 0.1* | 0.7 | 2.6 | 8.1 | 0.2 | 0.6 | 0.3* | 0.1 | 0.4 | 0.1 | 0.7 | 1.3* | 0.1 | 2.8 | 79.6* | 1.9 | 900 |
Base Pair (668 : 737) | Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
T | 9.5 | 1.0 | 1.8 | 14.9 | 3.5 | 1.0 | 4.0 | 21.2* | 1.5 | 0.3* | 0.9 | 5.2 | 7.1 | 12.2* | 5.9 | 9.5* | 0.3 | 7060 |
3 | 11.0 | 1.2 | 2.0 | 9.1 | 3.9 | 1.1 | 4.3 | 20.2* | 1.7 | 0.3* | 1.0 | 4.6 | 8.3 | 14.3* | 6.9 | 9.6* | 0.2 | 6002 |
B | 13.5 | 0.3* | 2.3 | 11.4 | 4.3 | 1.0 | 5.3 | 25.3* | 1.7 | 0.1 | 0.8 | 5.6 | 8.9* | 0.6 | 7.6 | 11.0* | 0.2 | 4754 |
A | -- | 21.2* | 5.0 | 0.9 | -- | 7.2 | -- | 3.6* | 5.0 | 7.7 | 9.9 | 5.0 | -- | 0.9 | 13.5 | 20.3* | -- | 222 |
C | -- | 0.6 | 2.4* | 1.2 | 0.6 | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 50.6* | -- | -- | -- | 42.8 | 0.6 | 166 |
E | 1.7 | 1.1 | -- | 0.2 | 3.1 | 0.4 | 0.8* | 0.4 | 1.4 | -- | -- | -- | 7.2 | 80.9* | 2.2* | 0.5 | 0.2 | 1026 |
M | 1.2* | 0.1* | 0.6* | 56.0* | 1.4 | -- | 2.9 | 31.6 | 0.1 | 0.1 | -- | 0.3 | 0.3 | 0.2 | 0.4 | 2.9 | 1.8 | 900 |
Base Pair (669 : 736) | Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
T | 9.7 | 0.2* | 1.0* | 19.1 | 26.4* | 0.5 | 0.7 | 12.8* | 0.4 | -- | 1.7 | 13.2 | 1.0 | 0.6 | 6.5 | 6.0 | 0.2 | 7058 |
3 | 10.1 | 0.2* | 0.8* | 16.5 | 27.6* | 0.5 | 0.6 | 9.9* | 0.4 | -- | 2.0 | 15.5 | 0.9 | 0.6 | 7.6 | 6.8 | 0.1 | 5999 |
B | 12.5 | 0.1* | 1.0* | 20.1 | 33.8* | 0.6 | 0.7 | 11.3* | 0.4 | -- | 0.7 | 2.0 | 0.6 | 0.4 | 8.9 | 6.7 | 0.1 | 4749 |
A | 4.0 | -- | -- | 14.6 | 20.4* | -- | 0.4* | 11.9 | 0.4 | -- | 26.5* | 6.6 | 2.7 | -- | 8.4 | 4.0 | -- | 226 |
C | 0.6 | -- | 1.8* | 18.0 | 3.6* | -- | 1.2 | 70.7* | 3.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | 0.6 | 167 |
E | 0.4 | 0.8 | -- | -- | 0.6 | 0.1* | 0.4 | 2.6* | 0.2 | -- | 2.8 | 79.8* | 1.9* | 1.7 | 1.1 | 7.6 | 0.1 | 1024 |
M | 8.9* | -- | 2.2* | 36.6* | 22.2 | 0.2 | 1.4 | 21.6 | 0.1 | -- | -- | 0.2 | 2.0 | 0.2 | 0.6 | 1.9 | 1.9 | 900 |
Base Pair (670 : 735) | Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
T | 20.1 | 0.2 | 0.2 | 12.7 | 9.7* | 0.2* | 2.0 | 38.5* | 9.8 | -- | 0.4 | 0.7 | 1.7 | 1.3 | 1.5 | 0.6 | 0.2 | 7089 |
3 | 21.9 | 0.2 | 0.2 | 12.6 | 6.8* | 0.3* | 2.2 | 37.8* | 11.5 | -- | 0.5 | 0.7 | 1.9 | 1.4 | 1.7 | 0.4 | -- | 6030 |
B | 26.3 | 0.3 | 0.2 | 3.1 | 6.2* | 0.3* | 2.7 | 39.8* | 14.2 | -- | 0.6 | 0.3 | 2.3 | 1.6 | 2.0 | 0.1 | -- | 4777 |
A | 26.5 | -- | -- | 7.4 | 20.0* | -- | -- | 32.6* | 7.0 | -- | -- | -- | -- | 3.5 | 2.6 | 0.4 | -- | 230 |
C | 1.2 | -- | 1.2* | 15.0 | 71.9* | -- | -- | 3.0* | 0.6 | -- | -- | 3.0 | -- | 1.8 | -- | 1.8 | 0.6 | 167 |
E | 0.3* | 0.1* | -- | 58.1* | 6.8 | -- | 0.1 | 29.4 | -- | -- | -- | 2.9 | -- | -- | 0.2 | 2.1 | -- | 1023 |
M | 11.4 | 0.1 | 0.3 | 13.2 | 17.9* | 0.4* | 1.2 | 49.3* | 0.2 | -- | 0.1 | -- | 0.6 | 0.4 | 0.8 | 2.0 | 1.9 | 900 |
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