16S rRNA Lousy Base Pair Statistics for Helical Element 659

 
Base Pair (659 : 747)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 305 234 40 0.15 0.26 0.49 0.75 0.28 0.31 0.35 -0.09 0.05 0.76 8513
3 188 185 30 0.16 0.26 0.50 0.76 0.28 0.31 0.57 0.31 0.00 0.83 7180
B 159 170 26 0.16 0.30 0.49 0.79 0.33 0.36 0.50 0.32 0.00 0.81 5859
A 7 4 1 0.18 0.21 0.64 0.85 0.54 0.57 1.37 0.70 0.00 0.84 264
C 10 10 3 0.30 0.52 0.73 1.25 0.17 0.20 0.67 0.62 0.00 0.91 182
E 22 11 3 0.18 0.11 0.00 0.11 0.04 0.04 0.92 1.28 0.00 0.97 1054
M 107 39 7 0.10 0.14 0.00 0.14 0.34 0.39 -0.29 -0.83 0.34 0.30 1160
 
 
Base Pair (665 : 740)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 172 108 16 0.11 0.29 0.65 0.94 0.54 0.77 0.69 0.74 0.01 0.81 8513
3 62 32 5 0.11 0.35 0.72 1.07 0.57 0.82 1.00 1.15 0.00 0.84 7180
B 46 19 3 0.09 0.01 0.00 0.01 0.69 0.99 1.09 1.87 0.00 0.82 5859
A 4 6 0 0.00 0.12 0.00 0.12 0.49 0.50 1.64 0.48 0.00 0.84 264
C 17 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.32 1.00 1.09 1.93 0.00 0.91 182
E 12 7 2 0.21 0.32 0.93 1.25 0.05 0.09 1.68 1.46 0.00 0.97 1054
M 93 76 11 0.13 0.22 0.36 0.58 0.27 0.34 -0.01 -0.61 0.10 0.61 1160
 
Base Pair (666 : 739)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 74 39 8 0.14 0.35 0.89 1.24 0.84 0.86 1.16 1.26 0.00 0.83 8513
3 26 14 0 0.00 0.04 0.00 0.04 0.94 0.96 1.73 1.75 0.00 0.84 7180
B 23 8 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.93 0.96 1.74 1.77 0.00 0.82 5859
A 2 3 0 0.00 0.39 0.89 1.28 0.89 0.90 1.23 1.30 0.00 0.84 264
C 3 2 2 0.80 0.09 0.00 0.09 0.94 0.95 1.65 1.81 0.00 0.91 182
E 1 3 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.98 1.90 1.90 0.00 0.97 1054
M 45 23 6 0.18 0.12 0.00 0.12 0.11 0.12 0.24 1.01 0.01 0.74 1160
 
Base Pair (667 : 738)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 35 197 8 0.07 0.04 0.00 0.04 0.29 0.62 1.26 0.20 0.00 0.83 8513
3 12 153 2 0.02 0.04 0.00 0.04 0.34 0.71 1.75 0.19 0.00 0.84 7180
B 8 125 1 0.01 0.05 0.00 0.05 0.24 0.69 1.76 0.20 0.00 0.82 5859
A 2 11 1 0.15 0.07 0.00 0.07 0.02 0.14 1.32 0.59 0.00 0.84 264
C 2 13 1 0.13 0.01 0.00 0.01 0.01 0.07 1.91 0.62 0.00 0.91 182
E 2 17 0 0.00 0.02 0.00 0.02 0.87 0.96 1.94 1.32 0.00 0.97 1054
M 21 31 5 0.19 0.10 0.00 0.10 0.04 0.12 1.08 1.38 0.00 0.76 1160
 
Base Pair (668 : 737)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 189 212 29 0.14 0.28 0.43 0.71 0.27 0.32 0.20 0.11 0.00 0.83 8513
3 146 164 23 0.15 0.31 0.45 0.75 0.23 0.28 0.20 0.09 0.00 0.83 7180
B 122 136 18 0.14 0.27 0.46 0.73 0.28 0.33 0.22 0.34 0.00 0.81 5859
A 13 15 4 0.29 0.30 0.45 0.75 0.27 0.34 0.60 0.08 0.00 0.84 264
C 11 4 0 0.00 0.05 0.00 0.05 0.04 0.05 0.88 1.63 0.00 0.91 182
E 11 13 1 0.08 0.16 0.00 0.16 0.03 0.06 1.54 1.11 0.00 0.97 1054
M 32 44 6 0.16 0.05 0.00 0.05 0.59 0.60 1.38 0.70 0.00 0.76 1160
 
Base Pair (669 : 736)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 215 175 33 0.17 0.19 0.00 0.19 0.30 0.57 0.11 0.81 0.00 0.83 8513
3 158 116 25 0.18 0.15 0.00 0.15 0.28 0.56 0.09 0.86 0.00 0.83 7180
B 132 96 21 0.18 0.19 0.00 0.19 0.34 0.68 0.36 0.82 0.00 0.81 5859
A 15 10 3 0.24 0.28 0.47 0.76 0.19 0.39 0.06 0.80 0.00 0.86 264
C 6 10 1 0.12 0.19 0.00 0.19 0.20 0.24 1.57 0.81 0.00 0.91 182
E 11 10 1 0.09 0.23 0.85 1.07 0.01 0.02 1.10 1.31 0.00 0.97 1054
M 51 49 7 0.14 0.18 0.00 0.18 0.49 0.71 0.73 0.65 0.00 0.76 1160
 
Base Pair (670 : 735)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 167 153 25 0.16 0.16 0.00 0.16 0.33 0.43 0.81 0.52 0.00 0.83 8513
3 113 97 16 0.15 0.11 0.00 0.11 0.35 0.42 0.83 0.53 0.00 0.84 7180
B 91 76 12 0.14 0.11 0.00 0.11 0.30 0.36 0.80 0.65 0.00 0.81 5859
A 10 11 1 0.09 0.30 0.53 0.82 0.34 0.54 0.83 0.74 0.00 0.87 264
C 10 5 1 0.13 0.15 0.00 0.15 0.17 0.90 0.93 1.43 0.00 0.91 182
E 12 10 3 0.27 0.01 0.00 0.01 0.58 0.65 1.29 1.09 0.00 0.97 1054
M 44 51 8 0.17 0.38 0.69 1.07 0.26 0.44 0.79 0.73 0.00 0.76 1160

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