16S rRNA Lousy Base Pair Statistics for Helical Element 1055A


 
Base Pair (1055 : 1202)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 11 46 1 0.04 0.00 0.00 0.00 0.63 0.63 1.96 0.67 0.00 0.81 8513
3 3 27 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.75 0.75 1.98 1.17 0.00 0.78 7180
B 2 26 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.95 0.95 1.98 1.69 0.00 0.75 5859
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.00 1.92 0.00 0.75 264
C 0 7 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.47 0.47 2.00 0.92 0.00 0.90 182
E 1 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.98 1.99 0.00 0.95 1054
M 8 12 1 0.10 0.01 0.00 0.01 0.07 0.07 1.92 1.43 0.01 0.99 1160
 
Base Pair (1056 : 1201)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 20 70 2 0.04 0.05 0.00 0.05 0.56 0.56 1.31 0.68 0.00 0.81 8513
3 6 38 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.63 0.63 1.79 0.71 0.00 0.78 7180
B 6 29 0 0.00 0.01 0.00 0.01 0.76 0.76 1.76 1.24 0.00 0.75 5859
A 0 3 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.80 2.00 1.25 0.00 0.74 264
C 1 3 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.92 0.93 1.95 1.53 0.00 0.90 182
E 0 6 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 1.99 1.65 0.00 0.95 1054
M 13 29 2 0.09 0.13 0.00 0.13 0.16 0.17 1.58 1.13 0.00 0.99 1160
 
Base Pair (1057 : 1200)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 11 12 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.84 0.84 1.32 1.94 0.00 0.80 8513
3 3 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.97 1.96 0.00 0.77 7180
B 2 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.98 1.97 0.00 0.74 5859
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.96 2.00 0.00 0.75 264
C 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 2.00 1.95 0.00 0.90 182
E 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.95 1.99 0.00 0.95 1054
M 8 9 0 0.00 0.06 0.00 0.06 0.07 0.07 1.38 1.85 0.00 0.99 1160


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