16S rRNA Lousy Base Pair Statistics for Helical Element 1087

 
Base Pair (1087 : 1114)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 46 76 3 0.05 0.43 0.85 1.28 0.75 0.75 0.09 0.76 0.12 0.69 8513
3 29 18 2 0.09 0.45 0.86 1.30 0.75 0.75 0.84 1.38 0.00 0.79 7180
B 21 3 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.94 0.94 1.58 1.95 0.00 0.76 5859
A 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.94 1.92 0.00 0.74 264
C 9 2 1 0.18 0.08 0.00 0.08 0.85 0.85 1.19 1.85 0.00 0.90 182
E 8 14 2 0.18 0.05 0.00 0.05 0.08 0.10 1.48 1.00 0.00 0.97 1054
M 8 56 0 0.00 0.03 0.00 0.03 0.18 0.19 -0.28 0.16 0.93 0.05 1160
 
Base Pair (1088 : 1113)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 26 80 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.93 0.96 0.87 1.11 0.12 0.69 8513
3 13 11 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.93 0.96 1.75 1.75 0.00 0.79 7180
B 4 3 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.96 1.98 0.00 0.76 5859
A 6 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 0.19 1.00 2.00 0.00 0.75 264
C 7 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.91 0.92 1.50 1.95 0.00 0.90 182
E 3 8 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.79 0.98 1.84 1.24 0.00 0.97 1054
M 6 68 0 0.00 0.08 0.00 0.08 0.73 0.90 -0.29 -0.04 0.90 0.08 1160
 
Base Pair (1089 : 1112)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 21 118 2 0.03 0.03 0.00 0.03 0.94 0.96 0.85 1.19 0.12 0.69 8513
3 14 11 1 0.08 0.03 0.00 0.03 0.95 0.96 1.72 1.89 0.00 0.79 7180
B 5 3 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.86 1.97 0.00 0.75 5859
A 1 3 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.90 0.95 1.71 1.73 0.00 0.75 264
C 2 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.96 0.96 1.74 1.88 0.00 0.90 182
E 8 5 1 0.15 0.04 0.00 0.04 0.83 0.87 1.33 1.70 0.00 0.97 1054
M 5 106 1 0.02 0.04 0.00 0.04 0.41 0.45 -0.33 0.20 0.89 0.08 1160
 
Base Pair (1090 : 1111)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 102 24 1 0.02 0.01 0.00 0.01 0.88 0.88 1.22 1.89 0.01 0.81 8513
3 5 7 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.95 1.96 0.00 0.79 7180
B 3 6 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.97 1.96 0.00 0.75 5859
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.75 264
C 2 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.96 0.98 1.89 1.71 0.00 0.90 182
E 2 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.91 1.98 0.00 0.97 1054
M 95 16 1 0.02 0.02 0.00 0.02 0.25 0.26 -0.13 1.63 0.06 0.91 1160
 
Base Pair (1091 : 1110)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 128 65 5 0.05 0.02 0.00 0.02 0.69 0.87 1.16 1.19 0.01 0.80 8513
3 8 12 0 0.00 0.01 0.00 0.01 0.78 0.99 1.92 1.22 0.00 0.77 7180
B 8 6 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.92 1.97 0.00 0.74 5859
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.75 264
C 2 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.95 0.95 1.85 1.74 0.00 0.89 182
E 0 6 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 1.00 1.93 1.93 0.00 0.97 1054
M 118 52 5 0.06 0.04 0.00 0.04 0.21 0.24 -0.22 1.21 0.05 0.93 1160

Last generated: Tue Oct 12 14:20:59 1999